组合技术

  • 同时结合多个生物靶标的DNA编码化合物库筛选方法
    同时结合多个生物靶标的DNA编码化合物库筛选方法

    本发明公开了一种通过DNA编码化合物库筛选同时结合多个生物靶标的化合物的方法。本发明还公开了一种通过DNA编码化合物库筛选同时结合E3泛素连接酶和靶标蛋白的化合物的方法。本发明方法进一步拓宽了DNA编码化合物库的应用范围,适用于各类生物靶标的筛选。

    2023-08-21
  • 一种On-DNA Aldol反应方法
    一种On-DNA Aldol反应方法

    本发明涉及一种On‑DNA Aldol反应方法,该方法以On‑DNA醛基化合物和α氢醛基或酮基化合物为原料,在催化剂存在下得到On‑DNA产物。该方法能够在有机溶剂/水相的混合水相中进行,操作简单,不引入金属类试剂,环境友好,适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

    2023-08-21
  • 一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒
    一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒

    本发明提供了一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒,包括以下步骤:步骤A:总RNA提取与质量控制,进行RNA标记,反转录成cDNA;步骤B:对cDNA进行片段化文库的构建,从而得到简化转录组测序文库。本发明与传统的转录组测序文库构建方法的不同在于:在文库准备过程中,将单个“条形码”序列添加到每个DNA片段中,以便在分析最终数据之前对每个片段进行识别和分类,从而显著提高转录组测序文库的产量,保证数据产出的稳定性。

    2023-08-21
  • 一种合成On-DNA 2-氨基嘧啶化合物的方法
    一种合成On-DNA 2-氨基嘧啶化合物的方法

    本发明涉及一种合成On‑DNA 2‑氨基嘧啶化合物的方法,该方法以On‑DNAα,β‑不饱和羰基化合物与胍基化合物为原料,在碱和氧化剂的存在下反应得到On‑DNA 2‑氨基嘧啶化合物。该反应方法能够在有机溶剂/水相的混合水相中进行,操作简单,不引入金属类试剂,环境友好,适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

    2023-08-21
  • 一种合成On-DNA吡唑并[1.5-A]嘧啶化合物的方法
    一种合成On-DNA吡唑并[1.5-A]嘧啶化合物的方法

    本发明涉及一种合成On‑DNA吡唑并[1.5‑A]嘧啶化合物的方法,该方法以On‑DNA α,β‑不饱和羰基化合物为原料,与3‑氨基吡唑化合物反应得到On‑DNA产物。该反应方法能够在有机溶剂/水相的混合水相中进行,操作简单,不引入金属类试剂,环境友好,适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

    2023-08-21
  • 小鼠表观遗传基因敲除筛选文库及其构建方法
    小鼠表观遗传基因敲除筛选文库及其构建方法

    本发明涉及小鼠表观遗传基因敲除筛选文库及其构建方法,小鼠表观遗传基因敲除筛选文库包括靶向表观遗传相关基因的SgRNA表达质粒,靶向表观遗传相关基因包括赖氨酸乙酰转移酶基因、组蛋白去乙酰酶基因、组蛋白赖氨酸甲基转移酶基因、组蛋白赖氨酸去甲基化酶基因、蛋白质精氨酸甲基转移酶基因、组蛋白识别、DNA甲基化相关基因、RNA甲基化相关基因、染色质重塑复合物基因、染色质组装及组蛋白伴侣基因。本发明构建的基因文库,为双质粒表达系统,质粒相对较小,构建比较容易操作;同时筛选文库仅仅针对表观遗传基因,文库相对较小,进行单细胞测序相对容易进行数据分析。

    2023-08-21
  • 用于纳米孔测序的单细胞或微量样本全长转录组文库构建 方法
    用于纳米孔测序的单细胞或微量样本全长转录组文库构建
方法

    本发明涉及单细胞测序技术领域,具体涉及用于纳米孔测序的单细胞或微量样本全长转录组文库构建方法。本发明提供的文库构建方法包括:将单细胞或微量样本裂解后,采用Smart‑seq2方法将mRNA反转录制备cDNA,以所述cDNA为模板进行PCR扩增,将PCR扩增产物进行FFPE和末端修复,再连接纳米孔测序接头。该方法可以实现真正的单细胞测序,且兼具转录本覆盖度高、分辨率高、灵活性强的优点,可应用于单细胞的差异基因表达分析、转录本结构分析、全长isoform鉴定等。

    2023-08-21
  • 一种一锅法On-DNA铃木反应方法
    一种一锅法On-DNA铃木反应方法

    本发明涉及一种一锅法On‑DNA铃木反应的方法,该方法在硼酸酯、亚硝酸酯和自由基引发剂存在下,将胺基化合物转换成硼酸酯化合物,然后与On‑DNA芳基卤代化合物在钯催化剂下“一锅法”得到On‑DNA产物。本发明方法收率高,反应条件温和,能够通过胺基化合物大规模引入硼酸合成模块,特别是不易分离纯化的硼酸模块,适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

    2023-08-21
  • 一种抗原抗体共展示方法用于膜抗原的抗体文库筛选
    一种抗原抗体共展示方法用于膜抗原的抗体文库筛选

    本发明公开了一种抗原抗体共展示方法用于膜抗原的抗体文库筛选。本发明所要针对目标抗原为膜蛋白,将目标抗原表达在细胞膜上,并将该目标抗原与细胞膜内侧的效应蛋白结构域偶联。同时将针对目标抗原的特异性抗体文库通过跨膜肽表达在细胞膜表面,并且通过跨膜肽与胞内效应蛋白结构域偶联。如果细胞表面抗体和抗原双方能够发生作用,与双方所融合表达的效应蛋白结构域会重新组装成为有功能的效应蛋白,通过转录报告基因报告所述抗体与抗原的成功结合。采用本发明的技术方案可以快速有效的筛选出针对目标抗原的特异性抗体。

    2023-08-21
  • 微滴式数字聚合酶链式反应芯片
    微滴式数字聚合酶链式反应芯片

    本发明公开一种微滴式数字聚合酶链式反应芯片,其中,微滴式数字聚合酶链式反应芯片包括微滴结构、微滴收集结构以及流道结构,微滴结构形成有间隔的样品腔和储油腔,微滴收集结构包括安装于微滴结构下方的微滴收集管,微滴收集管内形成有收集腔,流道结构设于微滴结构,流道结构的出口连通收集腔,流道结构的入口包括第一入口和第二入口,第一入口连通储油腔的下端,第二入口连通样品腔的下端,流道结构的入口分别连通样品腔的下端和储油腔的下端,有助于样品和油品在重力的作用下进入流道结构,以在流道结构的作用下形成包裹有样品的微滴,流道结构的出口连通的收集腔,以使微滴通过流道结构流入收集腔,整个过程无需移液。

    2023-08-21
  • 用于检测和分析自由硫醇的系统和方法
    用于检测和分析自由硫醇的系统和方法

    本文所描述的实施例涉及用于对含有蛋白质或蛋白质同种型的混合物的样品中的硫醇内含物进行定量的装置和方法。所述方法包含:将所述样品的一部分与自由硫醇检测结合剂缀合;将所述样品的所述部分中的内含物分离成分离的蛋白质同种型;检测与每种分离的蛋白质同种型相关的荧光信号;以及基于所述荧光信号对与每种分离的蛋白质同种型相关的自由硫醇的相对量进行定量。在一些情况下,所述方法包含基于与每种分离的蛋白质同种型相关的吸光度信号对每种分离的蛋白质同种型的量进行定量。在一些情况下,可以将和与检测结合剂缀合的蛋白质同种型相关的荧光和/或吸光度信号与和未缀合的蛋白质同种型相关的对应信号进行比较。在一些情况下,所述方法进一步包含施加还原剂并且对所述样品中的总硫醇内含物进行定量。

    2023-08-21
  • 一种灵活多变的降低污染及PCR偏倚的多标签二代测序文库 接头
    一种灵活多变的降低污染及PCR偏倚的多标签二代测序文库
接头

    本发明公开了一种灵活多变的降低污染及PCR偏倚的多标签二代测序文库接头。本发明提供了接头,由DNA单链A(5’端到3’端依次为前导区、随机标签、固定区、标签1和引物1结合区)和DNA单链B(5’端到3’端依次为固定区1、引物2结合区、固定区2、标签2和前导区)退火形成。本发明能为二代测序的DNA文库加入多个标签序列,大大提高样本间的分辨率。同时能为每个插入片段加入唯一序列,可识别原始插入片段及PCR复制子。因此本发明能解决病原微生物筛查中由于单标签污染导致的假阳性以及突变检测中的由于PCR扩增导致的突变比例偏移。所有本发明在病原微生物检测、肿瘤基因检测、单基因病检测等领域均具有较大的应用价值。

    2023-08-21
  • 一种On-DNA曼尼希反应的方法
    一种On-DNA曼尼希反应的方法

    本发明涉及一种On‑DNA曼尼希反应的方法,该方法以On‑DNA醛基化合物为底物,与活泼氢化合物和胺基化合物反应得到On‑DNA产物。该方法能够在有机溶剂/水相的混合溶剂中进行,环境友好;且能够大规模的引入醛、胺和含有活泼氢的化合物作为合成模块,适合使用多孔板的DNA编码化合物的合成。

    2023-08-21
  • 一种DNA单双链可控转化的DNA编码化合物库合成方法
    一种DNA单双链可控转化的DNA编码化合物库合成方法

    本发明属于DNA编码化合物库合成技术领域,主要涉及一种DNA单双链可控转化的DNA编码化合物库合成方法,包括如下步骤:通过构建可逆共价的起始片段用于DNA编码化合物库的合成,实现双链DNA编码化合物库与单链DNA编码化合物库的可控转化;将DNA编码化合物库与多种筛选体系兼容扩大编码化合物库的靶标筛选范围;将单链DNA编码化合物库进行动态组合化合物库的构建,并利用可逆交联基团将动态结构进行平衡锁定;将单链DNA编码化合物库与其它单链化合物库进行组合,进行自组装多药效团库的构建;通过DNA杂交与共价交联将单链DNA编码化合物库与功能化合物DNA偶合物进行结合。本发明方法可实现DNA编码化合物库单双链多次转化,提高了化合物库合成、筛选、应用的灵活性。

    2023-08-21
  • 使用分子混合物存储信息
    使用分子混合物存储信息

    公开了一种机器可读介质及其阅读和书写方法。该机器可读介质包括在其上具有可寻址位置阵列的基质,每个可寻址位置适应于与非聚合物分子的集合物理关联。每个集合中的分子选自可明确识别的分子的集,每个分子唯一地与数值中的预定位置相关联,其中集合中分子的存在指示相关联位置处的预定数字,且集合中所述分子的不存在指示所述相关联位置处的零。

    2023-08-21
  • 用于选择新表位的方法
    用于选择新表位的方法

    本发明涉及一种通过选择结合MHC I和/或MHC II的新表位并对它们的临床实用性进行排名来为个体选择新表位的方法。本发明还提供了通过本文所述方法获得的癌症疫苗。

    2023-08-21
  • 一种非天然核苷酸构成的核酸编码化合物库
    一种非天然核苷酸构成的核酸编码化合物库

    本发明公开了一种非天然核苷酸构成的核酸编码化合物和化合物库。本发明的核酸编码化合物和化合物库通过引入Z、P、S、B、S’五种人工碱基,克服了使用天然碱基的核酸编码化合物库的应用局限。

    2023-08-21
  • 半衰期延长的药物及其文库、以及制备方法和应用
    半衰期延长的药物及其文库、以及制备方法和应用

    本发明提供了半衰期延长的药物及其文库、以及制备方法和应用。具体地,本发明提供一种药物文库,所述药物文库包括:(a)药物单元;和(b)n个半衰期延长单元;其中,所述的药物单元包括药物元件部分以及与所述药物元件部分相连的第一核酸元件部分;所述的半衰期延长单元包括半衰期延长元件部分以及与所述的半衰期延长元件部分相连的第二核酸元件部分;并且所述药物单元的一个所述的第一核酸元件部分与至少一个半衰期延长单元的第二核酸元件部分可通过形成碱基互补的配对结构,从而构成“药物单元‑半衰期延长单元”复合物;其中,n为≥1的正整数。可根据需要,快速、高效、低成本、高得率地组装半衰期延长的药物。

    2023-08-21
  • 一种数字微流控文库构建系统
    一种数字微流控文库构建系统

    本发明通过全流程全自动数字微流控文库构建芯片,在单个芯片上包含一个样本的全流程文库构建,所述芯片包含低温区,用于试剂在等待过程中保持有效性;包含变温区,用于提供文库构建中各个反应所需温度条件;包含多个储液及分配区2可以分别分配洗涤液、磁珠溶液和洗脱液液滴。用户仅需要向芯片加载样品即可实现全流程DNA或RNA文库构建。

    2023-08-21
  • 有机化合物功能性独立的标记
    有机化合物功能性独立的标记

    本文公开了不依赖于化合物的任何官能团来标记有机化合物的方法。在一些实施方案中,提供了可用于所述方法的双官能连接子。

    2023-08-21
  • 由人白细胞抗原呈现的随机肽文库
    由人白细胞抗原呈现的随机肽文库

    本文描述了一种抗原筛选文库,其包含多个人白细胞抗原(HLA)‑抗原多肽复合物,所述HLA‑抗原多肽复合物包含:(a)HLA多肽;(b)随机抗原多肽,其包含SEQ ID NO:1至209中的任何一个所示的氨基酸序列,其中选择所述随机抗原多肽以特异性结合至HLA多肽的肽结合裂口;和(c)β2微球蛋白多肽。这些文库可用于确定能够与所选T细胞受体(TCR)相互作用和刺激所选TCR的抗原性多肽。

    2023-08-21
  • 构建DNA文库的试剂盒及方法
    构建DNA文库的试剂盒及方法

    本公开提供了一种构建DNA文库的试剂盒及方法,其中试剂盒包括混合酶液、混合缓冲液、连接酶和连接缓冲液,混合酶液包含核酸内切酶、T4 DNA聚合酶、Klenow片段、Taq DNA聚合酶和T4多聚核苷酸激酶,混合缓冲液和连接缓冲液包含DTT和PEG 8000,混合酶液和混合缓冲液用于形成第一反应体系,连接酶和连接缓冲液用于形成第二反应体系,在第一反应体系中,核酸内切酶的工作浓度为0.01至0.05U/μL,T4DNA聚合酶的工作浓度为0.04至0.1U/μL,Klenow片段的工作浓度为0.005至0.02U/μL,Taq DNA聚合酶的工作浓度为0.025至0.075U/μL,T4多聚核苷酸激酶的工作浓度为0.1至0.5U/μL,DTT的工作浓度为5至10mM,PEG 8000的工作浓度为1至10%。根据本公开,能够提供一种提高建库效率的构建DNA文库的试剂盒及方法。

    2023-08-21
  • 一种去除高丰度RNA的测序文库及其构建方法
    一种去除高丰度RNA的测序文库及其构建方法

    本发明属于高通量测序技术领域,公开了一种去除高丰度RNA的测序文库及其构建方法。所述构建方法包括以下步骤:(1)提取样品中的总RNA,将所有RNA连接3’接头;(2)RNA片段化处理;(3)RNA连接5’接头;(4)设计DNA探针,并与高丰度RNA进行杂交,形成DNA:RNA杂交链;(5)切割DNA:RNA杂交链,使高丰度RNA断开与3’接头的连接;(6)经反转录和PCR扩增,得到去除高丰度RNA的测序文库。该构建方法能够去除高通量测序文库中高丰度RNA,大大降低高丰度RNA的比例,并具有实验步骤简单、成本低、效果好的优势,可提升大规模RNA平行测序文库的质量,节约成本。

    2023-08-21
  • 一种靶标基因富集建库方法
    一种靶标基因富集建库方法

    一种靶标基因富集建库方法,包括:磷酸化步骤,包括在模板分子的5’端修饰磷酸基团;延伸步骤,包括加入第一引物,第一引物的5’端修饰有标记分子,在模板分子的靶标区域退火并延伸,获得双链靶核苷酸,双链靶核苷酸含有由5’端修饰有标记分子的第一引物延伸得到的延伸链;第一测序接头连接步骤,包括将第一测序接头连接至双链靶核苷酸序列;解链步骤,包括将前一步骤所得产物解链处理,去除5’端修饰有标记分子的第一引物延伸链,得到连接有第一测序接头的模板分子,即为单链靶核苷酸分子;第二测序接头连接步骤;扩增步骤,包括加入第二引物、第三引物,PCR反应,得到完整文库。将建库和靶标基因富集整合为一体,显著缩短流程。

    2023-08-21
  • 一种mNGS法检测病原微生物的DNA文库构建方法
    一种mNGS法检测病原微生物的DNA文库构建方法

    本发明公开了一种mNGS法检测病原微生物的DNA文库构建方法,1)Tn5转座打断和产物纯化,2)PCR文库富集,3)扩增产物片段大小分选,4)文库选择测序,本发明有利于文库扩增,得到高产量的文库,避免样本导致转座酶加入时间不同,引起打断片段大小有差异,精确度高,准确信强,并且提高了文库的保存时间。

    2023-08-21
  • 一种应用于NGS平台的超微量核酸样本建库方法
    一种应用于NGS平台的超微量核酸样本建库方法

    本申请公开了一种应用于NGS平台的超微量核酸样本建库方法。本申请的超微量核酸样本建库方法包括,在对超微量核酸样本进行DNA提取前,向超微量核酸样本中加入核酸修复酶,进行核酸修复;然后对含有核酸修复酶的超微量核酸样本进行DNA提取;对提取的DNA进行文库构建,获得超微量核酸样本的测序文库。本申请的超微量核酸样本建库方法,在进行DNA提取之前,对样本DNA进行核酸酶修复;并且,在DNA提取的过程中添加核酸修复酶;能有效修复DNA损伤,降低反应假阳性,提高DNA提取质量,使得构建的文库能更好适用于NGS测序。本申请的建库方法解决了FFPE样本提取的DNA质量差总量低,无法有效建库的问题。

    2023-08-21
  • 一种新冠肺炎防治干细胞库的构建方法
    一种新冠肺炎防治干细胞库的构建方法

    一种新冠肺炎防治干细胞库的构建方法,包括采集产前诊断后剩余羊水细胞、新生儿脐血、脐带和胎盘组织,以干细胞诱导、永生化基因转染、新冠病毒靶向干扰基因装配、新冠病毒易感基因敲除或敲入、新冠病毒抗体产生基因装配的方法,制备防治新冠肺炎的永生化干细胞、DNA重组干细胞、RNA干扰干细胞、基因沉默干细胞及各种干细胞载体疫苗,将所制干细胞产品按供者姓名、ABO血型或HLA分型集中收藏于‑196℃液氮,建立可再生利用的专用干细胞库,当新冠病毒流行时可从干细胞库中提取各分型干细胞或其疫苗进行培养扩增,以患者自身或同型干细胞进行个体化治疗,以减少传统干细胞或疫苗防治的免疫排斥等副作用,并解决COVID‑19特效药物及干细胞缺乏问题。

    2023-08-21
  • 评价基因组改变的组合物和方法
    评价基因组改变的组合物和方法

    本发明公开了通过靶标捕获和测序来评估cfDNA或ctDNA患者样品中的基因组改变的组合物和方法。

    2023-08-21
  • 鉴定靶蛋白染色质结合图谱的快速建库方法
    鉴定靶蛋白染色质结合图谱的快速建库方法

    本发明公开了一种鉴定靶蛋白染色质结合图谱的快速建库方法,其步骤包括:收集样本细胞,将活化的磁珠加入细胞中孵育,将磁珠与一抗进行孵育;二抗与重组融合转座酶预结合;磁珠与预结合的二抗和重组融合转座酶进行孵育磁珠中加入转座酶激活剂以及细胞穿孔剂,孵育;终止转座酶反应,进行文库扩增。本发明显著简化了传统方法的流程,缩短了建库时间,提高了建库效率,损失小,对建库材料要求更低。同时,通过将三条不同浓度的DNA标准品掺入到建库过程中,可以达到对文库中DNA拷贝数精确定量的效果。本方法非常适合用于对少量、珍贵样本或者不同处理状态样本的研究。

    2023-08-21
  • 一种脑脊液基因测序建库、检测方法及其应用
    一种脑脊液基因测序建库、检测方法及其应用

    一种脑脊液基因测序建库、检测方法及其应用,该建库方法具体是通过对脑脊液的待测样本进行cfDNA提取,并采用Labchip GX Touch对其进行片段浓度检测,从而确定构建文库的PCR循环数,以满足扩增的需求;再采用浓度至少为20μmol/L的PCR扩增引物浓度进行富集扩增,以提高建库成功率。

    2023-08-21
  • 一种人脐带间充质干细胞库的构建方法
    一种人脐带间充质干细胞库的构建方法

    本发明公开一种人脐带间充质干细胞库的构建方法,属于间充质干细胞的制备技术领域。本发明所述方法使用组织块法贴壁分离脐带间充质干细胞,并使用无血清培养基培养,使用差速贴壁法纯化细胞,建立脐带间充质干细胞的数据库,并使该数据库与冻存细胞进行关联;本发明所述方法生产成本低,效率高,为快速高效获得脐带间充质干细胞提供方法;此外,通过人脐带间充质干细胞库为新生胎儿建库,为其本人及家庭成员或许可第三方在需要脐带间充质干细胞移植治疗各种疾病时,提供临床适用的脐带间充质干细胞和干细胞制剂。

    2023-08-21
  • 一种RNA测序文库的构建方法
    一种RNA测序文库的构建方法

    本发明公开了一种RNA测序文库的构建方法,包括在文库构建前通过标签对靶标RNA序列进行标记步骤,所述标签命名为Rx,由两部分组成:5'端为特定的标签序列Tx;3'端为随机序列Nx;标签Rx中的x为数字,用户可根据需求进行命名,如R1、R2、R3;标签序列Tx为一段固定的核酸序列,由5‑18个碱基组成,用户可根据需要进行选取,但应避免与靶标序列相同;随机序列Nx由一段随机的碱基序列组成,N可为A、T、C、G中的任一个,x表示含有N的个数,其碱基数量可为5‑15个。本发明公开的RNA测序文库的构建方法可有效减少试剂中核酸的污染,降低背景噪音,简化生物信息学分析流程。

    2023-08-21
  • 根本上多样的人类抗体文库
    根本上多样的人类抗体文库

    公开了包含多种抗体的抗体文库,所述抗体具有来自人类中天然存在的记忆和初始B细胞的互补决定区的非天然存在的组合,并且其中所述抗体文库包含大量功能性和非冗余抗体。还公开了制备具有高水平的功能多样性的抗体文库的方法。

    2023-08-21
  • 一种从乙肝病毒肽库中快速确定阳性反应单肽的方法及其 应用
    一种从乙肝病毒肽库中快速确定阳性反应单肽的方法及其
应用

    本发明公开了一种病毒阳性反应单肽多重筛选肽库的构建方法。该病毒阳性反应单肽多重筛选肽库包括T细胞阳性1D肽库和T细胞阳性2D肽库,其中,每两个T细胞阳性2D肽库中至少存在1个相同的病毒S蛋白、C蛋白、P蛋白和X蛋白中的单肽。本发明中的病毒阳性反应单肽多重筛选肽库能以较少的样本和实验工作量预测患者的阳性反应单肽,筛选效果好,试验操作难度低,能有效提高预测工作的效率,节约预测成本。

    2023-08-21
  • 一种用于均衡文库浓度的文库构建方法
    一种用于均衡文库浓度的文库构建方法

    本发明公开了一种用于均衡文库浓度的文库构建方法,包括核酸片段化及加接头;通过文库扩增达到均衡各样本文库的浓度;主要通过文库扩增环节达到均衡各样本文库的浓度。本发明还公开了所述用于均衡文库浓度的文库构建方法的应用,包括扩增文库纯化及回收和上机测序。本发明公开的用于均衡文库浓度的文库构建方法简单快捷,输出文库质量高,浓度水平一致,简化了后续文库定量流程和混样流程,适用于各平台测序领域。

    2023-08-21
  • 用于捕获DNA分子的DNA桥方法
    用于捕获DNA分子的DNA桥方法

    本发明涉及在表面特征上悬浮拉伸核酸的方法。这些方法可以用于制备在酶促反应和其他反应中比在平坦表面上沉积的核酸更具活性的拉伸核酸。这些方法可以通过下述实现:在基底上使用光致抗蚀剂层、在基底表面上拉伸核酸,然后去除部分光致抗蚀剂以形成表面特征,使拉伸的核酸悬浮。此外,在拉伸核酸和表面特征上形成水凝胶层可将拉伸的核酸转移至水凝胶中进行进一步的反应,包括酶促反应。

    2023-08-21
  • RNA、DNA共建库测序方法及建库仪器
    RNA、DNA共建库测序方法及建库仪器

    本发明提供一种RNA、DNA共建库测序方法,所述方法包括:将待测DNA/RNA总核酸样本中的RNA进行打断处理,得到RNA片段;使用随机引物对所述RNA片断进行逆转录以获得cDNA片段,优选的使用含分子标签UMI R的随机引物序列以区分所述cDNA片断和总核酸中存在的第一DNA片断;加入磁珠进行第一纯化后去除磁珠以获得上清DNA并转移至新试管;对经所述第一纯化的上清DNA经机械打断法或酶打断法打断至测序需要的第二DNA片段;进行第一接头连接和第二接头连接并进行纯化处理,以获得第一产物;对所述第一产物进行PCR扩增反应,并进行第四纯化处理,完成建库。本发明提供的技术方案,实现同时对DNA、RNA进行建库,提高了样本使用效率以及建库效率。

    2023-08-21
  • 一种利用单细胞转录组测序技术检测不同疾病的方法
    一种利用单细胞转录组测序技术检测不同疾病的方法

    本发明属于医疗诊断技术领域,尤其是涉及一种利用单细胞转录组测序技术检测不同疾病的方法。本发明首先一种单细胞转录组文库的制备方法,包括:采用自动化单细胞处理系统处理、金属浴中反应后进行PCR扩增、加入纯化磁珠后离心进行扩增后利用XNovaNGS测序平台进行测序,得到单细胞转录组文库等步骤。本发明提供了一种利用单细胞转录组测序技术诊断不同疾病的方法。该方法利用了单细胞转录组测序技术通量大、灵敏度高、耗时短的特点,同时结合生物信息学技术,可以在短时间内对大量病理指标进行深入筛查,从而对疾病预测、诊断起到决定性的作用。

    2023-08-21
  • 一种核酸文库的制备方法及测序方法
    一种核酸文库的制备方法及测序方法

    本发明涉及一种核酸文库的制备方法及测序方法。本发明公开了一种核酸文库的制备方法,包括连接第一核酸片段和第二核酸片段,以获得核酸文库;所述第一核酸片段和所述第二核酸片段均为双链DNA,所述第一核酸片段为已知序列,所述第一核酸片段包括互补的第一链和第二链,所述第一核酸片段具有单链末端;所述单链末端位于所述第一链的3'端,并且,80℃≥(Tm1‑Tm2)≥10℃,90℃≥Tm1≥50℃,Tm1为所述第一链的溶解温度,Tm2为所述第二链的溶解温度为Tm2。利用此方法构建的文库可提高探针捕获核酸文库的效率,进一步地,对该文库进行测序,能够获得高比例的有效数据。

    2023-08-21
  • 基于鲨鱼抗体可变区V-NAR的噬菌体文库及其构建方法
    基于鲨鱼抗体可变区V-NAR的噬菌体文库及其构建方法

    本发明提供基于鲨鱼抗体可变区V‑NAR噬菌体的合成肽库及其构建方法,设计V‑NAR框架序列,包括FR区、CDR1区、HV2区以及HV4区和随机化的CDR3区氨基酸序列,利用重叠延伸PCR获得上述完整的V‑NAR基因片段,并将其克隆至噬菌粒载体,转化至大肠杆菌,构建合成噬菌体文库。本发明提供一种新型V‑NAR框架序列,可作为鲨鱼V‑NAR抗体库的通用骨架,为抗体库的构建提供新的理论基础;利用构建的噬菌体库所筛选的Anti‑PD‑L1纳米抗体,具有潜在应用价值,可为新型抗肿瘤药物研发与获得提供新品种;所构建的基于鲨鱼抗体IgNAR的V‑NAR噬菌体库,可作为不同抗原的筛选平台,具有极高的生物医学应用价值。

    2023-08-21
  • 一种构建全基因组高通量测序的文库的方法和试剂盒
    一种构建全基因组高通量测序的文库的方法和试剂盒

    本发明公开了一种构建全基因组高通量测序文库的方法,包括以下步骤:1)提取样本gDNA;2)将所述样本gDNA酶切片段化、末端补平、加A,获得加A后的gDNA;3)将所述加A后的gDNA与接头组合连接,获得连接产物,所述接头组合包含两个部分:Y型反向接头和高GC夹板接头;4)纯化所述连接产物,获得纯化产物;和5)对所述纯化产物进行片段筛选,获得测序文库。本发明还公开了一种构建全基因组高通量测序文库的试剂盒。

    2023-08-21
  • 一种建库方法及应用
    一种建库方法及应用

    本发明公开了一种建库方法及应用。本发明提供了一种用于检测待测样本目的基因待检区域的变异情况的扩增子文库构建方法,包括如下步骤:1)根据目标区域设计合成上游外引物F1、上游内引物F2和下游引物R;2)用所述上游外引物F1、所述上游内引物F2和所述下游内引物R对待测样本进行一步PCR扩增,得到扩增产物,即为目标区域的扩增子文库。该一步法建库技术可以应用于包括IonTorrent、illumina和BGI/MGI在内的所有二代平台,以此建库方法为基础,本发明开发出了针对DNA的SNP、Ins/Del、CNV、甲基化的检测,以及针对RNA样本的基因融合和表达的检测产品。

    2023-08-21
  • VEGFR-2抑制剂的筛选方法、VEGFR-2抑制剂和抗肿瘤药物
    VEGFR-2抑制剂的筛选方法、VEGFR-2抑制剂和抗肿瘤药物

    本发明公开了一种VEGFR‑2抑制剂的筛选方法、VEGFR‑2抑制剂和抗肿瘤药物,涉及药物筛选技术领域。本发明公开的筛选方法包括对原始化合物的拆分步骤和对拆分得到的片段进行组合的步骤;该筛选方法通过对原始化合物的拆分和重新组合以形成虚拟化合物库;再对该虚拟化合物库进行筛选,进而筛选对VEGFR‑2具有抑制活性的新化合物。该筛选方法是一种全新的筛选方法,实现“无到有”的筛选和现,丰富了现有的药物技术,也以VEGFR‑2为靶点的药物开发提供更多的候选VEGFR‑2抑制剂分子。

    2023-08-21
  • 一种快速高效的构建二代测序文库的试剂盒
    一种快速高效的构建二代测序文库的试剂盒

    本发明公开了一种快速高效的构建二代测序文库的试剂盒,包括R1、R2和R3,R1包括DNA片段化末端修复加尾缓冲液、DNA片段化酶和末端修复加尾酶,R2包括连接缓冲液、连接酶和接头,R3包括扩增酶、USER酶、通用引物和index引物。该试剂盒采用序列非特异性的核酸酶,可以在DNA上随机打断;在片段化、末端修复和加尾中添加非离子型去污剂做为增强剂,促进加尾酶的活性,使更多的末端修复片段加上A碱基,提高了片段的利用率;接头使用U型接头,减少了接头二聚体的产生,使更多的接头用于连接DNA片段,提高了文库的转化率。

    2023-08-21
  • 一种核酸适配体文库的高通量测序文库构建方法
    一种核酸适配体文库的高通量测序文库构建方法

    本发明涉及核酸适配体筛选技术领域,具体涉及一种核酸适配体文库的高通量测序文库构建方法。本发明的测序文库构建方法包括将靶向筛选得到的核酸适配体文库去除引物残留后再构建PCR‑Free测序文库。本发明的测序文库构建方法中,利用硅胶柱膜纯化技术降低了核酸适配体文库本身存在的引物残留,从而增加了后续有效数据的产出和分析,实现了核酸适配体文库信息的完整、准确保留;利用PCR‑Free建库技术避免了PCR扩增过程中气溶胶的污染以及PCR扩增偏好性和扩增酶性能差异导致的碱基偏好,保证了测序数据分析的有效性,同时保证了测序文库的构建效率和质量。

    2023-08-21
  • 一种基于双链环化的MGI测序平台测序文库的构建方法
    一种基于双链环化的MGI测序平台测序文库的构建方法

    本发明公开了一种基于双链环化的MGI测序平台测序文库的构建方法,包括以下步骤:构建双链结构的接头骨架,接头骨架具有MGI测序平台要求的接头序列,且可供TA连接,在中间部分保留有一段单链结构;样本DNA片段化以及末端修复加A;以构建好的所述双链结构的接头骨架和末端修复加A的DNA片段为底物,利用TA连接成环,生成双链连接产物;使用外切酶对所述双链连接产物进行消化,只保留成环的那条单链结构,然后对消化产物进行纯化,从而获得兼容MGI测序平台的最终文库。本发明,在环化过程中利用TA连接原理在双链基础上进行环化,然后获得可以直接上机的单链环状测序文库,构建过程简单、快捷,并且杜绝了由于扩增产生的信息改变。

    2023-08-21
  • 利用单管添加方案的加标签的核酸的文库制备
    利用单管添加方案的加标签的核酸的文库制备

    本申请涉及利用单管添加方案的加标签的核酸的文库制备。本申请提供了一种制备加标签的核酸片段的文库的方法,所述方法包括:使细胞群体与具有一种或更多种蛋白酶的裂解试剂直接接触,以生成细胞裂解物;使蛋白酶失活,以生成失活的细胞裂解物,和在其中靶核酸和转座子末端成分经历转座反应的条件下,将转座酶和包含转移链的转座子末端成分应用至失活的细胞裂解物。本申请还提供了一种用于制备加标签的核酸片段的文库的试剂盒,所述试剂盒包括:(a)裂解试剂,所述裂解试剂具有一种或更多种蛋白酶,和(b)转座反应组合物,所述转座反应组合物具有至少一种转座酶和包含转移链的至少一种转座子末端成分。

    2023-08-21
  • 一种基于转座酶的DNA/RNA共建库方法、试剂盒及应用
    一种基于转座酶的DNA/RNA共建库方法、试剂盒及应用

    本发明公开了一种基于转座酶的DNA/RNA共建库方法及其试剂盒,该方法包括步骤:1)从样本中共提取DNA和RNA;2)以RNA为模板,通过逆转录生成cDNA第一链,最终形成RNA/cDNA杂交双链和原始DNA的混合液;3)使用包含转座子序列的转座酶复合体对步骤2)中的RNA/cDNA杂交双链和原始DNA进行片段化,并同时加上接头序列;4)使用逆转录酶和具有链置换活性的DNA聚合酶对产物进行缺口补齐;5)用文库扩增引物对产物进行扩增;6)产物经纯化回收后,得到混合的RNA/DNA文库;7)对步骤6)所得的混合RNA/DNA文库进行质检。该方法具有建库时间短、操作简单、成本低的优点。本发明还公开了上述方法和试剂盒在鉴定微生物种类以及在检测癌症组织样本的基因突变和基因融合方面的应用。

    2023-08-21
  • 用于制造DNA测序阵列的方法和系统
    用于制造DNA测序阵列的方法和系统

    本公开内容涉及在原位合成阵列中反转寡核苷酸探针的方法。这些方法可用于逆转探针相对于基底的朝向从与一种基底3’结合到与另一种基底5’结合。这些方法也可用于减少或消除原位合成阵列中截短的探针序列的存在。这些方法可以在反转后保留合成寡核苷酸的最初图案。这些方法可以通过形成水凝胶层的聚合反应在供体基底和受体基底之间形成水凝胶层来实现。

    2023-08-21
  • 一种RNA建库的方法
    一种RNA建库的方法

    本发明公开了一种RNA建库的方法及试剂盒,涉及基因测序领域。所述方法,包括以下步骤:1)合成First cDNA,形成DNA/RNA杂交链;2)用固定有Tn5转座酶复合体的链霉亲和素磁珠对First cDNA杂交链打断并连接接头;3)片段化的杂交链缺口补齐及PCR扩增富集完整的文库。本发明提供的方法不仅建库过程操作简单,最快可以实现2小时完成RNA建库过程;而且,起始RNA的投入量比较灵活,打破了传统的一种Tn5转座酶量只针对特定的RNA的投入量进行建库的约束,降低转座酶对模板投入的依赖性,可以根据自己需求投入10ng到1ug不同量的RNA。

    2023-08-21
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