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一种利用磁珠法提取血液基因组DNA的试剂盒及其应用

文献发布时间:2023-06-19 10:27:30


一种利用磁珠法提取血液基因组DNA的试剂盒及其应用

技术领域

本发明属于分子生物学领域,具体涉及一种利用磁珠法提取血液基因组DNA的试剂盒及其应用。

背景技术

目前传统的提取血液DNA的方法源自于《分子克隆实验指南》的“新鲜抽取或冻存血细胞的裂解”,该方法主要利用酚/氯仿对DNA进行抽提,但此方法提取DNA的纯度低,容易受到血浆蛋白的污染,实验操作时间长,此外,使用到的试剂对人体和环境均有毒害作用;离心柱法虽然能提高DNA的纯度,但是由于亲和柱的亲和力问题,离心法只能吸附大的DNA片段。

发明内容

本发明的的目的是为了提供一种安全快速从血液中提取基因组DNA的方法,克服了现在常用方法中有害溶剂对人体危害的影响,省时省力,节约成本,且提取的基因组DNA纯度高的问题。本发明提供了一种利用磁珠技术提取血液DNA的试剂盒,所述试剂盒的成分由红细胞裂解液、磁珠漂洗液、DNA洗脱液、结合液和磁珠组成,所述结合液由SDS、Tris-HCl和EDTA组成,所述磁珠漂洗液为乙醇水溶液,所述DNA洗脱液为Tris-HCl和EDTA,所述红细胞裂解液由Tris-HCl、NaCl和MgCl

进一步地限定,所述红细胞裂解液中Tris-HCl浓度为0.01mol/L,PH=7.6,NaCl浓度为0.01mol/L,MgCl

进一步地限定,所述磁珠漂洗液中乙醇溶液的体积分数为70%。

进一步地限定,所述DNA洗脱液中Tris-HCl浓度为10mM,PH=7.5,EDTA浓度为0.1mM。

进一步地限定,所述磁珠的浓度为300nM。

进一步地限定,所述结合液中Tris-HCl的浓度为10mM,PH=8,EDTA浓度为14mM,SDS质量分数为0.4%。

本发明还提供了上述的利用磁珠技术提取血液DNA试剂盒在提取血液DNA中的应用。

进一步地限定,所述应用的具体步骤如下:

(1)取全血100μL-400μL加入到1.5mL的离心管中,加入20μL蛋白酶K,然后加入300μL结合液,混匀后65℃静置15分钟,每隔1分钟-3分钟进行一次混匀,总共进行5次;

(2)向步骤(1)得到的溶液中加入350μL异丙醇,混匀后加入50μL磁珠溶液,混匀后在室温静止7分钟,每隔1分钟进行一次混匀,总共进行5次;

(3)将步骤(2)得到的溶液进行瞬时离心,收集管底液体,然后将收集的液体放置在磁力架上静止2分钟,吸弃所有溶液,然后加入700μL磁珠漂洗液,重悬磁珠,洗涤磁珠2次后,吸弃所有溶液;

(4)将磁珠放置在空气中干燥10分钟-15分钟,待磁珠表面无明显水珠光泽且没有残留液体后,加入50~100μLDNA洗脱液,重悬磁珠后,置于58℃条件下孵育5分钟,然后放置在磁力架上静止1分钟-2分钟,将上清液至新的离心管中,完成提取全血中的DNA。

有益效果:1.操作简单快速,无需对全血进行预处理,1h即可快速完成提取操作,大大缩短了全血基因组DNA提取时间。

2.本试剂盒不使用氯仿、苯酚等有机溶剂,可大幅降低对实验人员的身体伤害。

3.本试剂盒的提取方法可有效减少提取过程中核酸的损失,大大增加提取效率,基因组DNA产物纯度高,片段更完整。

4.样本适用性广:可从新鲜或冻存的抗凝血(EDTA、肝素等)、白膜层、血凝块、唾液、口腔拭子等样品中直接提取基因组DNA。

附图说明

图1为本发明提取的人类全血基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳条带,其中,M是Marker,100uL为提取100uL人全血DNA的样本,200uL为提取200uL人全血DNA的样本,300uL为提取300uL人全血DNA的样本,400uL为提取400uL人全血DNA的样本;

图2为本发明提取白膜层、血凝块、唾液和口腔拭子基因组DNA的结果图,其中,横坐标是循环数,纵坐标是荧光强度。

具体实施例

实施例1.

利用磁珠技术提取血液DNA的试剂盒,所述试剂盒的成分由红细胞裂解液、磁珠漂洗液、DNA洗脱液、结合液和磁珠组成。

(1)结合液:0.4%SDS,10mMTris-HCl(pH8.0),14mM的EDTA(pH8.0)。

(2)红细胞裂解液:0.01mol/LTris-HCLpH7.6;0.01mol/LNaCl;0.005mol/LMgCl2。

(3)磁珠漂洗液:体积分数为70%的乙醇溶液。

(4)DNA洗脱液:10mMTrisHCL和0.1mMEDTA配制,最终PH是7.5。

(5)磁珠的规格:300nM的羟基磁珠。

实施例2.利用磁珠法提取血液基因组DNA的方法

使用实施例1中的试剂盒提取3份人类冷冻抗凝血液基因组DNA。

1.准备干净的1.5mL离心管,按顺序加入20μL蛋白酶K(20mg/mL),100μL人全血样本,最后加入300μL裂解/结合液GAL,涡旋震荡30s以混匀;65℃放置15min,每隔1~3min上下颠倒5次混匀。

2.将上一步溶液从水浴锅取出,室温放置约3min,加入350μL异丙醇,涡旋混匀约10s;再加入50μLDNA结合磁珠,涡旋或上下颠倒混匀20s,室温静置7min,上下颠倒5次混匀。

3.瞬时离心2s,收集管底液体。

4.将离心管转移至磁力架上,放置2min吸附磁珠,小心吸弃所有溶液。

5.加入700μL洗涤液(已加入无水乙醇),涡旋混匀,将管壁磁珠完全悬浮于溶液中,瞬时离心2s收集管壁液体,转移至磁力架上静置1min,或待溶液完全澄清时,小心吸弃所有溶液。

6.重复步骤5一次。

7.加入700μL漂洗液(已加入无水乙醇),涡旋混匀,将管壁磁珠完全悬浮于溶液中,瞬时离心2s收集管壁液体,转移至磁力架上静置1min,或待溶液完全澄清时,小心吸弃所有溶液。

8.重复步骤7一次。

9.将离心管从磁力架上取下,瞬时离心3s收集管壁残留液体,置于磁力架上十几秒吸附磁珠,用200μL移液器吸头移去所有残留液体,保持离心管盖打开状态,于空气中干燥10~15min。注意:干燥时间与磁珠加入量、空气湿度和环境温度有关,实际干燥时间应灵活增减,以磁珠表面无明显水珠光泽,离心管无残留液体为宜,磁珠过度干燥会造成DNA难以洗脱而影响得率。

10.加入50~100μL洗脱液,涡旋1min重悬磁珠,将离心管置于58℃水浴锅中孵育5min,期间可每隔2~3min摇动离心管加速DNA溶解。

11.瞬时离心2s收集管壁磁珠及液体,将离心管转移至磁力架上,静置1~2min,小心转移DNA溶液至新的1.5mL离心管中。DNA溶液可于2~8℃中暂时保存1~2天,长时间保存请将DNA溶液置于-20℃。

实施例3.利用磁珠法提取血液基因组DNA的方法

使用实施例1中的试剂盒提取3份人类冷冻抗凝血液基因组DNA:方法参照实施例2,200μL人全血样本。

实施例4.利用磁珠法提取血液基因组DNA的方法

使用实施例1中的试剂盒提取3份人类冷冻抗凝血液基因组DNA:方法参照实施例2,300μL人全血样本。

实施例5.利用磁珠法提取血液基因组DNA的方法

使用实施例1中的试剂盒提取3份人类冷冻抗凝血液基因组DNA:方法参照实施例2,400μL人全血样本。

利用以下实验验证实验效果:

提取不同人全血血液体积(100μL、200μL、300μL、400μL)基因组实验结果。琼脂糖凝胶浓度为1%,样本上样3.0μL,M为15KbDNAMarker,上样5μL,电压130V,电泳时间20min。结果如图1所示,所获得全基因组DNA产物平行性好,条带清晰,无拖尾和杂带,表明提取的基因组DNA完整性好,且无其它DNA污染,DNA产物含量高且纯度良好。

分别提取人的细胞,白膜层、血凝块、唾液、口腔拭子的总DNA,稀释适当稀释后扩增内参基因ACTB,细胞样本:10^6293T细胞,血凝块:1g血凝块,抗凝血:1mL,唾液稀释液:5mL,咽拭子浸出液:1mL可得到有效扩增条带,结果如图2所示。

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