组合技术

  • 蛋白质支架
    蛋白质支架

    本发明提供一种蛋白质支架和制备、筛选、工程化和使用所述蛋白质支架的方法。

    2024-03-18
  • 一种高通量微生物16S rRNA扩增子文库半自动化构建方法
    一种高通量微生物16S rRNA扩增子文库半自动化构建方法

    本发明涉及高通量测序技术领域,且公开了一种高通量微生物16SrRNA扩增子文库半自动化构建方法,包括以下步骤:S1、将一定量的样品使用核酸提取试剂盒提取DNA,使用Qubit3.0荧光定量仪检测基因组DNA总量,利用琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA完整性,选择高质量的DNA进一步实验。本发明通过设计随机不等碱基差异序列组合和i5‑index和i7‑index最优index组合,实现phix碱基平衡文库添加比例由30%减少到10%,MiseqPE300测序有效数据产量由8~10G提升到12~14G,整体Q30%>80%,Read1(I)即i7‑index的Q30%由75%提升到90%以上;Read2(I)即i5‑index的Q30%由60%提升到80%以上。

    2024-03-17
  • 一种DNA条形码二代测序文库的构建方法及其应用
    一种DNA条形码二代测序文库的构建方法及其应用

    本发明公开了一种DNA条形码二代测序文库的构建方法及其应用。该方法通过两轮PCR完成对条形码DNA的测序文库的制备,方法简单快速,易于组装全长DNA条形码,可以准确的鉴定物种并确定混合比例,尤其适用于混合样本的分析。该测序文库可直接用于二代测序,尤其适用于混合样本的鉴定,操作简单快速,成本低廉。本发明具有重要的应用价值。

    2024-03-11
  • 用于在多维空间中映射单分子的位置的方法、组合物和系统
    用于在多维空间中映射单分子的位置的方法、组合物和系统

    本发明涵盖一种组合物,其中组合物的单元被配置为彼此相互作用(例如,作为邻居),以便能够解码所捕获的靶标材料相对于组合物的相邻单元的位置。在实施方案中,组合物包括:主体;和偶联到主体的分子集,该分子集包括第一子集和第二子集,其中第一子集被构造用于靶标分析物捕获,并且其中第二子集被构造用于与一个或多个相邻对象相互作用。本发明还涵盖并入一个或多个组合物单元的系统以及实现组合物单元的方法。

    2024-03-11
  • 一种半合成纳米抗体库构建方法和纳米抗体库
    一种半合成纳米抗体库构建方法和纳米抗体库

    本申请涉及抗体库构建技术领域,尤其涉及一种半合成纳米抗体库构建方法和纳米抗体库,所述方法包括:以CDR1、CDR2和CDR3的cDNA为模板,进行第一扩增,分别得到CDR1、CDR2和CDR3的碱基序列;将FR1、FR2、FR3和FR4的核苷酸序列与所述CDR1、所述CDR2和所述CDR3的碱基序列连接,并进行第二扩增,得到目的基因片段;将目的基因片段与第一载体连接,得到第二载体;将所述第二载体进行培养后筛选,得到含有纳米抗体库的目标载体,其中,所述目的基因片段的碱基序列连接关系包括:FR1‑CDR1‑FR2‑CDR2‑FR3‑CDR3‑FR4。通过FR1、FR2、FR3和FR4的抗体骨架与合成部分CDR区域,构建半合成的纳米抗体库,避免了现有纳米抗体需要通过抗原免疫接种获得,可用抗原直接筛选,快速获得人源纳米抗体,节省了成本和时间。

    2024-02-26
  • 进出仓组件及单细胞文库制备系统
    进出仓组件及单细胞文库制备系统

    本发明公开一种进出仓组件及单细胞文库制备系统,进出仓组件包括进出仓和温控机构,进出仓限定出用于供微流体芯片安装的安装区域;温控机构设于进出仓,且至少对安装区域处的微流体芯片作用,以控制微流体芯片处的温度维持在目标温度区间内。本发明中,进出仓可供微流体芯片固定安装,且带动微流体芯片进出单细胞制备文库的机壳内腔;温控机构设于进出仓,且至少能够调节微流体芯片处的温度,使得无论进出仓和/或单细胞文库制备系统应用在温度较高或者温度较低的场景内,微流体芯片始终维持在目标温度范围内,确保良好的制备环境,提高整机的适用性。

    2024-01-09
  • 构建新冠病毒测序文库的方法、确定新冠病毒核酸序列的方法、测序文库和试剂盒
    构建新冠病毒测序文库的方法、确定新冠病毒核酸序列的方法、测序文库和试剂盒

    本发明涉及构建新冠病毒测序文库的方法、确定新冠病毒核酸序列的方法、测序文库和试剂盒。根据本发明的实施例,构建新冠病毒测序文库的方法包括:获取生物样本的RNA样本;对所述RNA样本进行反转录;利用扩增引物组,对所述cDNA样本进行扩增;对所述扩增产物进行打断处理,以便获得打断产物;以及基于所述打断产物构建测序文库,以便获得所述新冠病毒测序文库。根据本发明的实施例,本发明针对新型冠状病毒基因组设计特异性引物,通过多重PCR的方法对病毒全基因组进行富集扩增,并通过二代测序的方法对序列进行测定,实现病毒全基因组层面的分析,为疫情防控以及检测提供重要的检测方法。

    2024-01-05
  • 一种低起始量快速甲基化建库试剂盒及其应用
    一种低起始量快速甲基化建库试剂盒及其应用

    本发明公开了一种低起始量快速甲基化建库试剂盒,所述试剂盒包含:单链预处理组分、修饰性接头、连接组分、扩增组分以及DNA片段化酶。本发明所述甲基化建库试剂盒适用于样本类型为低起始量的人类gDNA、FFPEDNA以及cfDNA等样本的文库构建,满足测序上机需求。通过一步法将双端接头加在文库两端,并对接头和扩增引物添加修饰以及优选修饰接头引物的浓度,缩短建库时间并提高建库效率。

    2023-12-29
  • 一种DNA编码化合物库的RNA靶标筛选方法
    一种DNA编码化合物库的RNA靶标筛选方法

    本发明提供了一种针对RNA靶标进行DNA编码化合物库筛选的方法。本发明的方法通过在DNA编码化合物库中加入RNA靶标对应的封闭片段,封闭可能与RNA靶标结合的DNA序列,从而降低DNA编码化合物库筛选的假阳性率。

    2023-12-29
  • 一种基因突变文库的构建方法
    一种基因突变文库的构建方法

    提供了一种大库容基因突变文库的构建方法,能通过合成较少的寡聚物序列然后组装而构建成大库容的基因突变文库。

    2023-12-24
  • 一种DNA文库构建试剂盒、文库构建方法和应用
    一种DNA文库构建试剂盒、文库构建方法和应用

    本发明公开了一种DNA文库构建试剂盒、文库构建方法和应用。所述试剂盒包括P7接头和P5接头,所述P7接头由反向互补的第一链和第二链组成,所述第一链5’端具有修饰基团,所述修饰基团包括磷酸基团、羟基或腺苷,所述第一链3’端经封闭修饰,所述封闭修饰包括C6氨基修饰、C12氨基修饰、双脱氧修饰或spacer修饰,所述第二链的3’端经封闭修饰,所述封闭修饰包括双脱氧修饰。本发明对P7接头和P5接头进行设计及特殊修饰,并组合使用,能够使其实现全新的连接模式,从而显著提高连接效率及试剂盒的灵敏性,进而提高建库效率。

    2023-12-05
  • 一种纳米抗体合成库及其构建方法
    一种纳米抗体合成库及其构建方法

    本发明公开了一种纳米抗体合成库及其构建方法。本发明的构建方法是选择一种高表达量及高热稳定性纳米抗体骨架区作为合成库的基础抗体框架,再通过纳米抗体序列收集,数据统计分析,确定了随机化区域,随机化策略采用NNK简并密码子引入序列多样性,通过Klenow酶扩增合成片段,以及多次重叠延伸拼接后得到完整的含随机化位点的纳米抗体序列,用于构建高容量、高多样性的纳米抗体合成库。其中,所述框架的表达量大于20mg/L,热稳定性指在50~90℃下加热5~60min仍可维持同室温相近的活性;设计三种长度的CDR3区,并对三个CDR区都进行随机化,最终构建了三种长度不同的纳米抗体合成库,增加文库的序列多样性和结构多样性。

    2023-11-22
  • 顺序编码方法和相关试剂盒
    顺序编码方法和相关试剂盒

    本公开涉及用于分析大分子的方法和试剂盒。在一些实施方式中,本公开涉及采用对分子识别事件的条形编码和核酸编码的大分子分析方法。本文中还提供了用于使用多种酶传递信息,包含用于对与供分析的大分子缔合的核酸分子进行连接、延伸和切割反应的方法和相关试剂盒。在一些实施方式中,所述供分析的大分子包括肽、多肽或蛋白质。

    2023-09-18
  • DNA末端修复、连接接头试剂、试剂盒及DNA文库构建方法
    DNA末端修复、连接接头试剂、试剂盒及DNA文库构建方法

    一种DNA末端修复试剂,包括:DNA末端修复组合酶;以及SSB。

    2023-08-21
  • 一种筛选pH响应自组装多肽的方法
    一种筛选pH响应自组装多肽的方法

    本发明公开了一种筛选pH响应自组装多肽的方法。所述方法包括:合成多肽库,将所述多肽库与荧光分子混合进行共孵育,筛选发荧光的多肽与荧光分子混合进行再次孵育,筛选荧光淬灭的多肽,得到pH响应自组装多肽;所述共孵育的体系的pH为7.5~8;所述再次孵育的体系的pH为3~6.5。本发明的筛选方法具有通量高、筛选效率高、筛选过程简单等优势,容易实现自动化,有利于发现具有理想性能的新型纳米材料,在为生物医学和材料应用领域研发新型纳米结构方面具有重要意义。

    2023-08-21
  • 一种筛选小鼠精子发生相关互作蛋白的方法及应用
    一种筛选小鼠精子发生相关互作蛋白的方法及应用

    本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种筛选小鼠精子发生相关互作蛋白的方法及应用,通过提取小鼠单倍体生精细胞RNA反转录、扩增合成双链cDNA,并与pGADT7‑Rec共转化至Y187中构建酵母双杂交cDNA文库;扩增目的蛋白编码基因序列并构建诱饵质粒,与cDNA文库共培养后接种于营养缺失型培养基上,经多次铺板排除假阳性后挑取蓝色单克隆菌落进行PCR鉴定及测序,确认相互作用蛋白;构建的文库可应用于不同目的蛋白大批量、多次筛选小鼠精子发生相关蛋白;提供的筛选方法,可以同时大量获取目的蛋白的互作蛋白及其编码基因序列,为深入研究精子发生相关蛋白的功能及分子机制提供可能。

    2023-08-21
  • 一种快速多时间生物素修饰核酸转录连缀测序文库的构建方法及其应用
    一种快速多时间生物素修饰核酸转录连缀测序文库的构建方法及其应用

    本发明公开了一种快速多时间生物素修饰核酸转录连缀测序文库的构建方法及其应用。本发明通过优化磁珠上酶反应体系简化了TV‑PRO‑seq实验步骤,将三次磁珠富集简化为一次;且使用了链霉亲和素磁珠C1取代原方法中的链霉亲和素磁珠M280,并使用了新的缓冲液洗脱体系;提高了被标记分子的富集比例的同时缩短了实验流程;建库时间从26小时减少为14小时,也提高了实验的成功率(从60%达到90%以上),减少了实验所需起始细胞的用量(从一千万减少到一百万),也使实验中材料的损耗大幅降低,从而扩宽了多时间生物素修饰核酸转录连缀测序的应用场景。

    2023-08-21
  • 一种多重PCR建库防止污染的方法
    一种多重PCR建库防止污染的方法

    本发明公开了一种多重PCR建库防止污染的方法,涉及分子生物学技术领域,具体技术方案为:在拿到样本后第一时间加入一种或多种的人工合成的防错标签序列,该标签必须能够被引物池中的至少一对引物扩增,而后随样本一起进行后续的PCR扩增、测序,最后通过对下机数据的生物信息学分析,区分出每个样本中所检测出的标签是否和建库时加入的标签一致,从而确定样本没有发生混淆和检测结果的准确性,同时分析每个样本中的标签组成来防止精确判断样本是否发生污染,以及污染程度。该方法,能够防止在建库的过程中出现难以避免的因素而导致的样本污染,且在后续的生物信息分析中可以通过不同的标签来对样本进行区分。

    2023-08-21
  • 一种T细胞CRISPER文库筛选方法
    一种T细胞CRISPER文库筛选方法

    本发明公开了小鼠T细胞CRISPER文库筛选方法,包括如下步骤:a)小鼠免疫相关基因的sgRNA质粒文库的构建;b)质粒文库的包装、转染;c)体内开展CRISPR‑Cas9文库高通量筛选,获得调节T细胞功能的重要基因。通过本发明的方法可以筛选出调节T细胞功能的重要基因,为揭示其在肿瘤免疫治疗中的作用机制,改善过继性细胞免疫治疗奠定了实验基础。

    2023-08-21
  • 一种乳腺癌多维度免疫压力CRISPR文库筛选方法
    一种乳腺癌多维度免疫压力CRISPR文库筛选方法

    本发明公开了两套CRISPR文库(MiTCL‑L,2796基因;MiTCL‑S,273基因),采用多种不同免疫缺陷小鼠进行高通量筛选,发现三阴性乳腺癌(TNBC)微环境中发挥免疫逃逸的关键基因,为发现新型免疫治疗靶标奠定了重要的理论和实验基础,有利于三阴性乳腺癌免疫治疗上的突破。本发明筛选发现的候选基因中包括了已经证实的免疫异质性明星基因LAG3和CD38,证实了筛选平台的可靠性。

    2023-08-21
  • 一种羧基改性蛋白质芯片的制备方法
    一种羧基改性蛋白质芯片的制备方法

    本发明公开了一种羧基改性蛋白质芯片的制备方法,包括将载玻片置于平面上,用预先配制的刻蚀液在载玻片上进行刻蚀,刻蚀完成后用去离子水将刻蚀液冲洗干净,再将载玻片放入真空干燥箱干燥;将载玻片放入不饱和脂肪酰氧基丙基三甲氧基硅烷溶液中,在高温条件下反应,降至常温后,用乙酸乙酯冲洗并烘干,再将酯化载玻片放入不饱和脂肪酸溶液中,掺杂吸附,并在一定的吸收剂量的高能射线下进行辐照交联,再将蛋白质芯片基质置于点样仪上对待吸附的蛋白液进行点样,点样完成后置于恒温孵育箱中反应洗涤、吹干,再加入BSA溶液浸泡并于恒温水浴箱中封闭,再吹干得到蛋白质芯片。本发明能有效避免负载物质从基质上剥离,提高基质与蛋白质的吸附力。

    2023-08-21
  • 一种低密度醛基基片以及低密度生物芯片的制备方法
    一种低密度醛基基片以及低密度生物芯片的制备方法

    本申请涉及一种低密度醛基基片以及低密度生物芯片的制备方法,一种低密度醛基基片,包括:醛基修饰基片,和多孔膜板,所述多孔膜板由疏水材料制成且带有通孔阵列,所述多孔膜板附接于所述醛基修饰基片的醛基修饰表面。本申请的低密度醛基基片通过醛基基片上附接疏水材料制成的多孔膜板,在利用该低密度醛基基片制备生物芯片时可以利用疏水性将点样液聚集在疏水通孔内,完成芯片制备,方法简便易行;并且可以用移液枪进行芯片制备,适用性广泛。

    2023-08-21
  • 低频引入突变的酶切打断建库方法和试剂盒
    低频引入突变的酶切打断建库方法和试剂盒

    本发明公开了一种低频引入突变的酶切打断建库方法和试剂盒。其中,该酶切打断建库方法包括DNA酶切片段化和补平加A、接头连接、PCR扩增和文库纯化的步骤,其中,DNA酶切片段化和补平加A步骤中,通过控制常温DNA聚合酶的用量控制反复切割和链置换。应用本申请的技术方案,除了保证打断的效率和稳定性,同时也避免了由于打断引入大量的突变导致影响酶切打断在NGS测序过程中的应用,做到打断水平和超声相当的水平,使本申请的酶切打断能够在临床检测过程中得到很好的应用。

    2023-08-21
  • 一种临床级人脐带间充质干细胞资源库多级库的构建方法
    一种临床级人脐带间充质干细胞资源库多级库的构建方法

    本发明涉及一种临床级人脐带间充质干细胞资源库多级库的构建方法,属于细胞培养技术领域。本发明所述构建方法进行原料预处理、干细胞分离和扩增培养获得种子库,然后通过接种密度、培养时间等条件的设置实现主库、工作库和产品库的构建。本发明所述构建方法细胞活率高、质量可控,能够成功构建临床级四级干细胞资源库,即为种子库、主库、工作库和产品库。

    2023-08-21
  • 肝脏疾病的疾病分层及相关方法
    肝脏疾病的疾病分层及相关方法

    提供了评估或确定肝脏的疾病阶段的方法。该方法可包括从受试者获得样品。该方法还可包括测量来自受试者的样品中的基因表达产物,以确定肝脏的疾病阶段。

    2023-08-21
  • 将核酸固定于固相基质表面的方法以及从液相组合物中分离 物质的方法
    将核酸固定于固相基质表面的方法以及从液相组合物中分离
物质的方法

    本发明涉及生物检测技术领域,具体而言,涉及一种将核酸固定于固相基质表面的方法以及从液相组合物中分离物质的方法。该方法包括:a)将含有待固定核酸的溶液附着在所述固相基质的表面;b)对所述固相基质的表面进行照射以使得所述待固定核酸与所述固相基质的表面发生光交联;其中,所述溶液中含有3M~4M的异硫氰酸胍。高浓度的异硫氰酸胍能够有利于核酸分子在光交联过程中分散更加均匀,从而可以有效提高固定后核酸的生物学活性。

    2023-08-21
  • 捕获建库装置
    捕获建库装置

    本发明提供了一种捕获建库装置,包括:装置本体,具有安装位;试剂盒,安装于所述安装位;所述试剂盒包括第一试剂盒本体和可拆卸连接于所述第一试剂盒本体上的第二试剂盒本体,所述第一试剂盒本体上设有安装孔;移液机构,包括旋转组件、移液组件及驱动组件;所述移液组件的一端位于所述第一中通孔内且连通移液器,所述移液组件的另一端悬空位于所述第一试剂盒本体或所述第二试剂盒本体;所述驱动组件用于驱动所述旋转组件绕所述安装孔360°旋转、以及所述驱动组件用于驱动所述移液组件伸入或者抽出所述第一试剂盒本体或所述第二试剂盒本体。本发明通过优化设置捕获建库装置的具体结构,解决了传统捕获建库装置效率低的技术问题。

    2023-08-21
  • RNA快速建库方法及其应用
    RNA快速建库方法及其应用

    本发明提供一种RNA快速建库方法(Easy‑seq),其步骤包括:提取样本中的total RNA,采用逆转录阻碍探针法去除rRNA,同时逆转录获得一端带有P7序列的cDNA;对多余的随机引物进行消解处理;对cDNA进行多聚腺苷酸化,在cDNA的3’端加上polyA,采用带有3’突出末端的双链DNA接头,在cDNA的另一端接上P5序列;文库扩增及回收。Easy‑seq具有耗时短、操作简单和损失小等优点,因此可以应用于单细胞转录组测序(scEasy‑seq)。相较于已有的scRNA‑seq技术,scEasy‑seq具有基因检出率高、RNA信息完整和建库产量高等优点,是一种高效灵敏的单细胞转录组测序技术,可以广泛应用于科学研究和疾病诊断等领域。

    2023-08-21
  • 生成双链衔接物的方法
    生成双链衔接物的方法

    本申请涉及样品制备方法。本公开内容提供了制备用于测序的核酸样品的单扩增法和双扩增法。

    2023-08-21
  • 对DNA片段进行标记的单分子标签
    对DNA片段进行标记的单分子标签

    本发明提供了一种对DNA片段进行标记的单分子标签,单分子标签为一条oligo退火形成的茎环结构、两条oligo退火形成两端互补配对的结构或两条oligo退火形成一端互补配对的结构中的任意一种;oligo从5’端到3’端依次由第一核苷酸序列、尿嘧啶、poly dNTP、第二核苷酸序列、3’端突出的碱基组成,第一序列和第二序列互补配对,其中,在未互补配对的环状结构上,靠近5’端的第一个不配对的碱基有尿嘧啶修饰。本发明通过选择特定结构和修饰后的标签,结合简洁高效的引入方法,实现对DNA双端单分子编码标记,更为有效的定位测序读长的最初来源,节省人力物力,具有推广应用的前景和价值。

    2023-08-21
  • 一种基于高通量测序的胃癌靶向治疗基因组文库的构建方法 及引物
    一种基于高通量测序的胃癌靶向治疗基因组文库的构建方法
及引物

    一种基于高通量测序的胃癌靶向治疗基因组文库的构建方法及引物,所述引物的序列为SEQ ID No.1~SEQ ID No.94。本发明的检测方法安全快速,基于高通量测序的肿瘤样本数据分析速度可在24小时内完成;并且检测通量高。

    2023-08-21
  • 感染性疾病的检测和预测
    感染性疾病的检测和预测

    本文提供了核酸文库的片段长度谱、生成核酸文库的片段长度谱的方法以及使用片段长度谱进行诊断和/或预后的方法。本申请进一步提供了用于确定受试者的感染阶段或定位位点的方法、组合物和试剂盒。

    2023-08-21
  • 一种RNA文库的构建方法及试剂盒
    一种RNA文库的构建方法及试剂盒

    本申请属于基因检测技术领域,具体公开一种RNA文库的构建方法,包括如下步骤:采用第一引物逆转录RNA,得到第一链cDNA,所述第一引物包括第一接头序列和随机序列;纯化所述第一链cDNA;采用第二引物扩增所述第一链cDNA,生成二链DNA,所述第二引物包括第二接头序列和随机序列;采用第三引物扩增所述二链DNA得到RNA文库。本申请至少具有以下有益效果之一:本申请提供的RNA文库的构建方法,以完整的RNA链为模板进行逆转录,无需将RNA进行片段化,引物上直接连接有接头序列,无需后期再进行双端接头连接,而且该方法仅需要带有双端接头的单链,因此无论是扩增效率还是建库速度都大幅提升。

    2023-08-21
  • 双特异性和多特异性生物制剂的区室化测定法
    双特异性和多特异性生物制剂的区室化测定法

    本公开的实施方案通常涉及在以微流体液滴和微室为代表的区室化纳米体积中进行测定法。在一些实施方案中,提供了用于在区室化纳米体积中筛选双特异性或多特异性生物制剂的方法,对所述区室化纳米体积基本上提供至少两种不同细胞类型中每一种的一个细胞,其中工程化改造第一细胞以表达所述生物制剂的单一变体,其中第二细胞产生在表达和分泌功能性生物制剂时被触发的报告物信号,从而允许检测和回收与阳性报告物信号相对应的细胞,用于所述生物制剂的相应功能性变体的随后遗传鉴定。

    2023-08-21
  • 新型免疫检查点抑制剂
    新型免疫检查点抑制剂

    本发明涉及将纤维蛋白原样蛋白1(FGL1)鉴定为癌症患者对免疫检查点抑制剂的反应性的预后生物标志物。更具体地,本发明涉及在人类患者中治疗癌症的方法,所述方法包括给予特异性抑制纤维蛋白原样蛋白1(FGL1)与淋巴细胞激活基因3蛋白(LAG3)的相互作用的免疫检查点抑制性抗体,其中所述癌症为表达FGL1的癌症。此外,本发明涉及用于在癌症患者中评估对用特异性抑制FGL1与LAG3的相互作用的免疫检查点抑制性抗体的治疗的敏感性或预测对所述治疗的反应性的方法,所述方法包括检测来自所述患者的样本中的FGL1表达;并且涉及用于选择将从特异性抑制FGL1与LAG3的相互作用的免疫检查点抑制性抗体中受益的癌症患者的试剂盒。特异性抑制FGL1与LAG3之间的相互作用的所述免疫检查点抑制性抗体可以是针对人FGL1的抗体或针对人LAG3的抗体,所述抗体任选地与其他免疫检查点抑制性抗体诸如抗PD1或抗PD‑L1抗体组合。

    2023-08-21
  • 一种On-DNA二胺化合物关环反应的合成方法
    一种On-DNA二胺化合物关环反应的合成方法

    本发明涉及一种On‑DNA二胺化合物关环反应的合成方法,该方法以On‑DNA二胺化合物为底物,与溴化氰进行关环反应,得到On‑DNA氮杂环化合物的方法,该方法底物适用范围广,能够在有机溶剂/水相的混合水相中进行,操作简单,条件温和,适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

    2023-08-21
  • 离子浓度依赖性结合分子文库
    离子浓度依赖性结合分子文库

    本发明公开了主要由互相之间序列不同的多个抗原结合分子构成的文库,所述抗原结合分子的抗原结合结构域中包含至少一个下述氨基酸残基,所述氨基酸残基使得抗原结合分子针对抗原的结合活性根据离子浓度的条件而变化。此外,本发明还公开了包含多个编码所述抗原结合分子的多核苷酸分子的组合物、包含多个含有所述多核苷酸分子的载体的组合物、所述抗原结合分子的选择方法、所述多核苷酸分子的分离方法、所述抗原结合分子的制造方法、包含所述抗原结合分子的医药组合物。

    2023-08-21
  • 检测慢病毒插入位点的测序文库构建方法和慢病毒插入位点 检测方法
    检测慢病毒插入位点的测序文库构建方法和慢病毒插入位点
检测方法

    一种检测慢病毒插入位点的测序文库构建方法和慢病毒插入位点检测方法,其中测序文库构建方法包括:从慢病毒感染的细胞中提取基因组DNA;对基因组DNA进行片段化并处理成适于接头连接的形式;在片段化基因组DNA的两端连接上不对称双链接头,其包括长链序列和短链序列;对接头连接产物进行第一轮PCR扩增;对第一轮PCR扩增的产物进行第二轮PCR扩增;对第二轮PCR扩增的产物进行环化,得到适于上机测序的环化测序文库。本发明具有操作简单、实验时间短、成本低、起始量少、通量高、可分析方面多等特点,可以更好地进行基因治疗中病毒插入位点的准确分析与评估。

    2023-08-21
  • 缓冲液组合物及其应用
    缓冲液组合物及其应用

    本发明公开了缓冲液组合物及其应用,其中,该缓冲液组合物包括:通用缓冲液,所述通用缓冲液包括5‑25mMol通用Tris缓冲液、5‑20mMol通用二价阳离子、75‑150mMol通用一价阳离子、0.05‑2质量%表面活性剂和0.5‑2mMol二硫苏糖醇(DTT),pH8‑10;以及连接缓冲液,所述连接缓冲液包括33‑66mM连接Tris缓冲液,0.5‑5mM连接二价阳离子、0.5‑10mM二硫苏糖醇(DTT)、5‑15%PEG4000‑8000和0.5‑2mM ATP,pH值为7‑9。由此,该缓冲液组合物能用于多样本的文库构建,并且,反应时间短,转化率高,错配率低。

    2023-08-21
  • 缓冲液及其应用
    缓冲液及其应用

    本发明公开了缓冲液及其应用,其中,该缓冲液包括:5‑25mM Tris缓冲液、5‑20mM二价阳离子、75‑150mM一价阳离子、0.05‑2质量%表面活性剂和0.5‑2mM二硫苏糖醇,pH8‑10。该缓冲液的兼容性好,稳定性高,适用于文库构建过程中的多步反应,使文库构建过程中的多步反应可以连续进行,无需纯化,显著降低了反应时间,并且,有利于提高构建DNA文库的方法的效率和稳定性,同时,对T4DNA连接酶无明显的抑制作用。

    2023-08-21
  • 高通量单细胞转录组测序方法及试剂盒
    高通量单细胞转录组测序方法及试剂盒

    本发明公开了一种高通量单细胞转录组测序方法,包括利用微流控芯片进行单细胞捕获和包装的步骤、RAN反转录、cDNA预扩增、一次扩增、二次扩增、片段化、建库、测序及分析等步骤。本发明的测序方法具有细胞捕获效率高、通量高(可达到1万个细胞)、灵活性高(可同时做1‑8个样本)、低交叉污染,双包率低、操作简单及成本低等诸多优点,在环境、感染性疾病、器官移植后排斥、免疫治疗等众多领域中有广泛应用前景。

    2023-08-21
  • 用于构建人单细胞TCR测序文库的试剂盒及其应用
    用于构建人单细胞TCR测序文库的试剂盒及其应用

    本发明公开了一种用于构建人单细胞TCR测序文库的试剂盒及其应用。其中,一种基于所述试剂盒的人单细胞TCR测序文库构建方法包括:利用微流控芯片进行单细胞捕获和包装的步骤;以及,RNA反转录、cDNA预扩增、一次扩增、二次扩增、片段化、扩增、纯化等步骤。本发明的试剂盒和人源单细胞TCR测序文库在应用于免疫细胞的免疫组库测序时,单次实验可以分离500‑30000个细胞,从根本上解决了单细胞免疫组库的通量问题,在肿瘤微环境、感染性疾病、器官移植后排斥、免疫治疗等领域中有着广泛的应用前景。

    2023-08-21
  • 用于构建人单细胞BCR测序文库的试剂盒及其应用
    用于构建人单细胞BCR测序文库的试剂盒及其应用

    本发明公开了一种用于构建人单细胞BCR测序文库的试剂盒及其应用。其中,一种基于所述试剂盒的人单细胞BCR测序文库构建方法包括:利用微流控芯片进行单细胞捕获和包装的步骤;以及,RNA反转录、cDNA预扩增、一次扩增、二次扩增、片段化、扩增、纯化等步骤。本发明的试剂盒和人源单细胞BCR测序文库在应用于免疫细胞的免疫组库测序时,单次实验可以分离500‑30000个细胞,从根本上解决了单细胞免疫组库的通量问题,在肿瘤微环境、感染性疾病、器官移植后排斥、免疫治疗等领域中有着广泛的应用前景。

    2023-08-21
  • FFPE样本建库的方法及其应用
    FFPE样本建库的方法及其应用

    本发明提供了一种FFPE建库的方法及其应用。该方法包括:通过利用内切酶进行酶切片段化,对片段化DNA依次进行末端修复加A及接头连接,对连上接头的DNA片段进行PCR扩增,得到测序文库,其中内切酶具有如下功能:a)在DNA缺口处切割;b)保留双链末端突出碱基部分。由于FFPE在固定的过程中和固定之前都有带来降级和部分碱基的脱落,该方法充分利用FFPE的本身的缺口问题,能够在缺口处断裂DNA片段的酶打断DNA后结合正常的补平加A、连接接头和PCR扩增的方式进行建库,解决了由于FFPE本身的损伤和打断损伤不兼容导致的建库效率低的问题,从而解决了降解比较严重的样本难以建库的问题。

    2023-08-21
  • 一种具有阿尔法螺旋结构的拟抗体筛选库、其构建方法及 应用
    一种具有阿尔法螺旋结构的拟抗体筛选库、其构建方法及
应用

    本发明涉及蛋白质类药物筛选系统,具体涉及一种具有阿尔法螺旋结构的拟抗体筛选库、其构建方法及应用。本发明提供用于拟抗体筛选的DNA库,由多个DNA分子组成,所述多个DNA分子具有如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;所述核苷酸序列中的N为A,T,G或C,K为G或T。还提供一种RNA库,是由所述DNA库经转录反应获得。还提供一种拟抗体筛选库,是由所述RNA库经体外无细胞表达获得的RNA‑拟抗体库,或者由所述RNA‑拟抗体库经反转录获得的cDNA‑拟抗体库。还提供一种筛选针对靶蛋白质的拟抗体的方法,该方法使用本发明的拟抗体筛选库进行筛选,可得到高效及特异结合靶蛋白质的拟抗体。

    2023-08-21
  • 一种sgRNA文库构建方法
    一种sgRNA文库构建方法

    本发明公开了一种sgRNA文库构建方法,包括以下步骤:第一步、sgRNA设计;第二步、上下游引物合成;第三步、构建sgRNA文库;所述的sgRNA由PCR扩增得到,涉及n条特异性引物Fn1,Fn2,Fn3,—Fnn,一条通用引物R;其中,特异性引物Fn1与载体5’端有20‑50bp同源,通用引物R与载体3’端有20‑50bp同源,且二者之间有15‑50bp的同源,与传统的退火连接方法相比,本发明通过PCR的方法得到混合sgRNA库,大大节省引物合成成本,提高合成产量。本发明提供了一种高通量、高效率的sgRNA基因文库构建方法。

    2023-08-21
  • 一种提高文库转化率的二代测序建库试剂盒及其方法
    一种提高文库转化率的二代测序建库试剂盒及其方法

    本发明涉及生物技术领域的方法及试剂盒,具体而言,具体为一种提高文库转化率的二代测序建库试剂盒及其方法,特别适用于微量样本的二代测序应用;所述试剂盒包括:酶混液,包括第一酶混液、第二酶液和第三酶混液;所述第一酶混液由T4多聚核苷酸激酶、T4DNA聚合酶、Klenow片段和Taq酶按照3:1:2:1的比例混合而成;所述第二酶液为T4 DNA连接酶;所述第三酶混液为2X QuarTaq HiFi HotStart混合液;缓冲液,所述缓冲液包括第一酶混液所对应的第一缓冲液和所述第二酶液所对应的第二缓冲液,所述第二缓冲液由浓度为0.1‑0.6M的Tris‑HCl、浓度为0.05‑0.1M的MgCl2、浓度为0.01‑0.05M的DTT、浓度为1‑10mM的ATP、浓度为30%‑50%的PEG6000和浓度为10‑20%的1,2丙二醇混合而成;接头、index序列和通用引物。

    2023-08-21
  • 同时结合多个生物靶标的DNA编码化合物库筛选方法
    同时结合多个生物靶标的DNA编码化合物库筛选方法

    本发明公开了一种通过DNA编码化合物库筛选同时结合多个生物靶标的化合物的方法。本发明还公开了一种通过DNA编码化合物库筛选同时结合E3泛素连接酶和靶标蛋白的化合物的方法。本发明方法进一步拓宽了DNA编码化合物库的应用范围,适用于各类生物靶标的筛选。

    2023-08-21
  • 一种On-DNA Aldol反应方法
    一种On-DNA Aldol反应方法

    本发明涉及一种On‑DNA Aldol反应方法,该方法以On‑DNA醛基化合物和α氢醛基或酮基化合物为原料,在催化剂存在下得到On‑DNA产物。该方法能够在有机溶剂/水相的混合水相中进行,操作简单,不引入金属类试剂,环境友好,适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

    2023-08-21
  • 一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒
    一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒

    本发明提供了一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒,包括以下步骤:步骤A:总RNA提取与质量控制,进行RNA标记,反转录成cDNA;步骤B:对cDNA进行片段化文库的构建,从而得到简化转录组测序文库。本发明与传统的转录组测序文库构建方法的不同在于:在文库准备过程中,将单个“条形码”序列添加到每个DNA片段中,以便在分析最终数据之前对每个片段进行识别和分类,从而显著提高转录组测序文库的产量,保证数据产出的稳定性。

    2023-08-21
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