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酪氨酸激酶抑制剂组合物、其制备方法和使用方法

文献发布时间:2023-06-19 11:57:35



本申请案要求2019年9月20日提交的美国申请案第62/903,598号和2018年9月25日提交的第62/736,291号的优先权和权益,其中每一个的全部内容以引用的方式并入本文中。

技术领域

本公开涉及新颖化合物,其作为受体酪氨酸激酶(RTK),尤其ErbB受体的致癌突变体的抑制剂。本公开还涉及用于制备所公开的化合物的方法、包含所述化合物的组合物以及使用其治疗哺乳动物(例如人类)中的异常细胞生长的方法。

背景技术

影响ErbB受体的细胞内催化域或细胞外配体结合域的突变可以产生致癌活性(ErbB蛋白质家族由4个成员组成,所述成员包括ErbB-1,也称为表皮生长因子受体(EGFR),和Erb-2,在人类中也称为HER2)。ErbB抑制剂是已知的用于多种癌症的治疗。然而,并非每位患者都对这种治疗有令人满意的反应。因此,所属领域中持续需要能够解决癌症患者对已知疗法的可变反应性的新颖疗法。本公开提供用于治疗具有这些致癌突变的患者中的癌症的组合物和方法,其中在使用现有护理标准治疗具有这些ErbB突变体的患者时未观察到可变反应性。

发明内容

在一些方面中,本公开涉及式I化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4;

Y

Z是-(NR

R

X是式(i)a的基团

其中Ar是6元芳基或N-杂芳基,其未被取代或被一个或多个选自卤素、C

L

在一些实施例中,式(i)a化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体的Ar是式(i)b的基团

其中X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,基团X是式(ii)a的基团,

其中X

R

L

在一些实施例中,X具有以下式(ii)b(例如(ii)c或(ii)c'):

其中X

在一些实施例中,X

在一些实施例中,X具有以下式(ii)d、(ii)e、(ii)f:

其中X

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,基团X具有下式

其中R

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,式I化合物不是满足以下条件的化合物:X是式(i)a,其中L

在一些实施例中,本公开涉及式II或III的化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如共价键、直链或分支链C

Y

Z是-(NR

R

其中X

L

R

在一些实施例中,式II化合物不是满足以下条件的化合物:X是式(i)a,其中L

在一些实施例中,本公开涉及式IV化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L

X

R

R

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,本公开涉及式VII化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L

X

R

R

L是共价键、直链或分支链C

其中m1、m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,式VII化合物不是满足以下条件的化合物:L

在一些实施例中,本公开涉及式X化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L

X

R

R

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些方面中,本公开涉及式XIII化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L

X

R

R

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,本公开提供一种组合物,其包含本公开的化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施例中,组合物进一步包含医药学上可接受的载剂。在一些实施例中,组合物进一步包含第二治疗活性剂。在一些实施例中,第二治疗活性剂包含非I型抑制剂。在一些实施例中,非I型抑制剂包含小分子II型抑制剂。

在一些实施例中,本公开提供本公开的组合物,其用于治疗癌症。

在一些实施例中,本公开提供本公开的组合物用于治疗癌症的用途,其包含向个体给予治疗有效量的组合物。

在一些实施例中,本公开提供用于治疗个体中的癌症的方法,其包含向个体给予治疗有效量的本公开的组合物。

在一些实施例中,本公开提供一种用于治疗个体中的癌症的方法,其包含向个体给予治疗有效量的本公开的组合物,其中所述癌症的特征在于表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体的表达。在一些实施例中,癌症、肿瘤或其细胞表达EGFR的致癌变体。在一些实施例中,EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于致癌变体的表达和EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,EGFR的致癌变体包含EGFR变体III(EGFR-Viii)突变。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于致癌变体的表达和EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,EGFR的致癌变体包含SEQ IDNO:1的位置289处的缬氨酸(V)对丙氨酸(A)的取代。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于致癌变体的表达和EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,EGFR的致癌变体包含EGFR的结构的修饰,其中EGFR的致癌变体能够形成共价连接的二聚体,其中共价连接的二聚体具有组成活性且其中共价连接的二聚体在与I型ErbB抑制剂接触时增强EGFR的活性。在一些实施例中,EGFR的结构的修饰包含核酸序列、氨基酸序列、二级结构、三级结构和四级结构中的一个或多个的修饰。在一些实施例中,致癌变体包含突变、剪接事件、翻译后过程、构象变化或其任何组合。在一些实施例中,EGFR的结构的修饰在EGFR的第一富含半胱氨酸(CR1)和/或第二富含半胱氨酸(CR2)的区域内进行。在一些实施例中,EGFR的第一富含半胱氨酸(CR1)和/或第二富含半胱氨酸(CR2)的区域分别包含SEQ ID NO:1的氨基酸残基T211-R334和/或C526-S645。在一些实施例中,EGFR的致癌变体产生在CR1和/或CR2区域内形成二硫键的物理屏障。在一些实施例中,EGFR的致癌变体去除在CR1和/或CR2区域内形成二硫键的物理屏障。在一些实施例中,EGFR的致癌变体包含位于EGFR的二聚体界面处的一个或多个游离或不成对的半胱氨酸(C)残基。EGFR的致癌变体包含选自由以下组成的组的位点处的一个或多个游离或不成对的半胱氨酸(C)残基:根据SEQ ID NO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636。在一些实施例中,修饰是在选自由以下组成的组的位点处的10埃或更少的分子内二硫键内进行:根据SEQ ID NO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于致癌变体的表达和EGFR的致癌变体是EGFR的突变的实施例,编码EGFR的致癌变体的核苷酸序列包含编码外显子19或其一部分的序列的缺失或取代。在一些实施例中,缺失或取代包含一个或多个编码三磷酸腺苷(ATP)结合位点的氨基酸。在一些实施例中,ATP结合位点包含SEQID NO:1的氨基酸E746至A750。在一些实施例中,ATP结合位点或其缺失或取代包含SEQ IDNO:1的K858。在一些实施例中,缺失包含SEQ ID NO:1的K858。在一些实施例中,在SEQ IDNO:1的位置858(K858R)处赖氨酸(K)取代精氨酸(R)。在一些实施例中,在SEQ ID NO:1的位置858(L858R)处白氨酸(L)取代精氨酸(R)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于致癌变体的表达和EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,编码EGFR的致癌变体的核苷酸序列包含编码外显子20或其一部分的序列内的插入。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码KEILDEAYVMASVDNPHVCAR(SEQ ID NO:7)的序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码C-螺旋、C-螺旋的末端或C-螺旋后的环的序列。在一些实施例中,插入包含ASV、SVD、NPH或FQEA的氨基酸序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含以下中的一个或多个:(a)SEQ ID NO:1的位置V769与D770之间的氨基酸序列ASV的插入;(b)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸序列SVD的插入;(c)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列NPH的插入;(d)SEQ ID NO:1的位置A763与Y764之间的氨基酸序列FQEA的插入;(e)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列PH的插入;(f)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸G的插入;(g)SEQ IDNO:1的位置H773与V774之间的氨基酸H的插入;(h)SEQ ID NO:1的位置V774与C775之间的氨基酸序列HV的插入;(i)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列AH的插入;(j)SEQ ID NO:1的位置A767与S768之间的氨基酸序列SVA的插入;(k)SEQ ID NO:1的位置770与771之间的氨基酸序列GYN取代DN;(l)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸H的插入;(m)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸Y的插入;(n)SEQ ID NO:1的位置C775与R776之间的氨基酸序列PHVC的插入;(o)SEQ ID NO:1的位置773处的氨基酸序列YNPY取代H;(p)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列DNP的插入;(q)SEQ IDNO:1的位置S768与V769之间的氨基酸序列VDS的插入;(r)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸H的插入;(s)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸N的插入;(t)SEQID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列PNP的插入;(u)SEQ ID NO:1的位置770与771之间的氨基酸序列GSVDN取代DN;(v)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列GYP取代NP;(w)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸G的插入;(x)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列GNP的插入;(y)SEQ ID NO:1的位置V769与D770之间的氨基酸序列GSV的插入;(z)SEQ ID NO:1的位置774与775之间的氨基酸序列GNPHVC取代VC;(aa)SEQ ID NO:1的位置A763与Y764之间的氨基酸序列LQEA的插入;(bb)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸序列GL的插入;(cc)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸Y的插入;(dd)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列NPY的插入;(ee)SEQ IDNO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列TH的插入;(ff)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列KGP取代NP;(gg)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列SVDNP取代NP;(hh)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸序列NN的插入;(ii)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸T的插入;和(jj)SEQ ID NO:1的位置768与769之间的氨基酸序列STLASV取代SV。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于致癌变体的表达和EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,EGFR的致癌变体包含EGFR-Vii、EGFR-Vvi、EGFR-R222C、EGFR-R252C、EGFR-R252P、EGFR-R256Y、EGFR-T263P、EGFR-Y270C、EGFR-A289T、EGFR-A289V、EGFR-A289D、EGFR-H304Y、EGFR-G331R、EGFR-P596S、EGFR-P596L、EGFR-P596R、EGFR-G598V、EGFR-G598A、EGFR-G614D、EGFR-C620Y、EGFR-C614W、EGFR-C628F、EGFR-C628Y、EGFR-C636Y、EGFR-G645C、EGFR-Δ660、EGFR-Δ768或其任何组合。

在一些实施例中,本公开提供用于治疗个体中的癌症的方法,其包含向个体给予治疗有效量的本公开的组合物,其中癌症的特征在于以下中的一个或多个的表达:(a)野生型人类表皮生长因子受体2(HER2)受体或(b)HER-2受体的致癌变体。在一些实施例中,癌症、肿瘤或其细胞表达以下中的一个或多个:(a)野生型人类表皮生长因子受体2(HER2)受体或(b)HER-2受体的致癌变体。在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于野生型HER2受体的表达的实施例,野生型HER2受体包含SEQ ID NO:2、3、4、5或6的氨基酸序列。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达的实施例,HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置310处的苯丙氨酸(F)取代丝氨酸(S)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置310处的酪氨酸(Y)取代丝氨酸(S)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置678处的谷氨酰胺(Q)取代精氨酸(R)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置777处的白氨酸(L)取代缬氨酸(V)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置777处的甲硫氨酸(M)取代缬氨酸(V)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置842处的异白氨酸(I)取代缬氨酸(V)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处的丙氨酸(A)取代白氨酸(L)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处的脯氨酸(P)取代白氨酸(L)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处的丝氨酸(S)取代白氨酸(L)。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,编码HER2受体的致癌变体的核苷酸序列包含编码外显子20或其一部分的序列内的插入。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码KEILDEAYVMAGVGSPYVSR(SEQ ID NO:8)的序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码C-螺旋、C-螺旋的末端或C-螺旋后的环的序列。在一些实施例中,插入包含GSP或YVMA的氨基酸序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含以下中的一个或多个:(a)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YVMA的插入;(b)SEQ ID NO:2的位置P780与Y781之间的氨基酸序列GSP的插入;(c)SEQ ID NO:2的位置A771与Y772之间的氨基酸序列YVMA的插入;(d)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YVMA的插入;(e)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸V的插入;(f)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸V的插入;(g)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVGCV取代GV;(h)SEQ ID NO:2的位置776之间的氨基酸序列LC取代G;(i)SEQ ID NO:2的位置776之间的氨基酸序列LCV取代G;SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列GSP的插入;(k)SEQ ID NO:2的位置755与757之间的氨基酸序列PS取代LRE;(l)SEQ ID NO:2的位置779与780之间的氨基酸序列CPGSP取代SP;(m)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸C的插入;(n)SEQ ID NO:2的位置与775776之间的氨基酸序列VVMA取代AG;(o)SEQ ID NO:2的位置776处的氨基酸序列VV取代G;(p)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVCV取代GV;(q)SEQ IDNO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VCV取代GV;(r)SEQ ID NO:2的位置G778与S779之间的氨基酸G的插入;(s)SEQ ID NO:2的位置755与757之间的氨基酸序列PK取代LRE;(t)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸V的插入;(u)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YAMA的插入;(v)SEQ ID NO:2的位置776处的氨基酸序列CV取代G;(w)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列AVCGG取代GVG;(x)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列CVCG取代GVG;(y)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列VVVG取代GVG;(z)SEQ ID NO:2的位置776与779之间的氨基酸序列SVGG取代GVGS;(aa)SEQID NO:2的位置776与779之间的氨基酸序列VVGES取代GVGS;(bb)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVGSGV取代GV;(cc)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列CVC取代GV;(dd)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列HVC取代GV;(ee)SEQ IDNO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VAAGV取代GV;(ff)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VAGV取代GV;(gg)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VVV取代GV;(hh)SEQ ID NO:2的位置G778与S779之间的氨基酸序列FPG的插入;(ii)SEQ ID NO:2的位置S779与P780之间的氨基酸序列GS的插入;(jj)SEQ ID NO:2的位置754与757之间的氨基酸序列VPS取代VLRE;(kk)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸E的插入;(ll)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列MAGV的插入;(mm)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸S的插入;(nn)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列SCV的插入;和(oo)SEQ ID NO:2的位置Y772与V773之间的氨基酸序列LMAY的插入。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,包括其中癌症的特征在于HER2受体的致癌变体的表达和其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含HER2-Δ16(即,不具有外显子16的HER2变体)、HER2-C311R、HER2-S310F、p95-HER2-M611(即,其中编码蛋白质的氨基酸在野生型HER2序列(包括SEQ ID NO:2)的M611处开始的HER2变体)或其任何组合。

在一些实施例中,本公开提供一种用于治疗个体中的癌症的方法,其包含向个体给予治疗有效量的本公开的组合物,其中所述癌症的特征在于HER-4受体的致癌变体的表达。在一些实施例中,HER-4受体的致癌变体是HER4受体的变构变体。在一些实施例中,HER4受体的致癌变体包含外显子16(HER4-Δ16)的缺失。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,给药是全身性的。在一些实施例中,给药是口服的。在一些实施例中,给药是静脉内的。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,给药是局部的。在一些实施例中,给药是瘤内、眼内、骨内、脊椎内或脑室内的。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,个体或癌症对用以下中的一种或多种进行的治疗不敏感或具有抗性:吉非替尼(gefinitinib)、埃罗替尼(erlotinib)、阿法替尼(afatinib)、奥希替尼(osimertinib)、尼图单抗(necitunumab)、克卓替尼(crizotinib)、阿来替尼(alectinib)、色瑞替尼(ceritinib)、达拉非尼(dabrafenib)、曲美替尼(trametinib)、阿法替尼(afatinib)、沙皮替尼(sapitinib)、达可替尼(dacomitinib)、卡奈替尼(canertinib)、培利替尼(pelitinib)、WZ4002、WZ8040、WZ3146、CO-1686和AZD9291。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,个体或癌症对用以下中的一种或多种进行的治疗具有不良反应:吉非替尼、埃罗替尼、阿法替尼、奥希替尼、尼图单抗、克卓替尼、阿来替尼、色瑞替尼、达拉非尼、曲美替尼、阿法替尼、沙皮替尼、达可替尼、卡奈替尼、培利替尼、WZ4002、WZ8040、WZ3146、CO-1686和AZD9291。在一些实施例中,不良反应是EGFR的致癌变体的活化和其中致癌变体包含受体的胞外域中的突变。在一些实施例中,不良反应是HER-2受体的致癌变体的活化和其中致癌变体包含受体的胞外域中的突变。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,癌症、肿瘤或其细胞表达EGFR的致癌变体,其中编码EGFR的致癌变体的序列包含外显子20或其一部分的缺失且其中癌症、肿瘤或其细胞不包含除EGFR的外显子20以外的序列中的第二致癌变异。在一些实施例中,第二致癌变异包含编码EGFR激酶域(KD)、BRAF、NTRK和KRAS中的一个或多个的序列。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,癌症、肿瘤或其细胞表达EGFR的致癌变体,其中编码EGFR的致癌变体的序列包含外显子20或其一部分的缺失且其中癌症、肿瘤或其细胞不包含指示对免疫疗法的反应性的标记物。

在本公开用于治疗癌症的方法的一些实施例中,癌症包含实体肿瘤。在一些实施例中,癌症是膀胱癌、乳癌、子宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、胃癌、神经胶母细胞瘤(GBM)、头颈癌、肺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)或其任何亚型。在一些实施例中,癌症是神经胶母细胞瘤(GBM)或其任何亚型。在一些实施例中,癌症是乳癌或其任何亚型。在一些实施例中,癌症是肺癌或其任何亚型。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,治疗有效量降低癌症的病征或症状的严重程度。在一些实施例中,癌症的病征包含肿瘤等级且其中病征的严重程度的降低包含肿瘤等级的降低。在一些实施例中,癌症的病征包含肿瘤转移且其中病征的严重程度的降低包含消除转移或转移的速率或程度的降低。在一些实施例中,癌症的病征包含肿瘤体积且其中病征的严重程度的降低包含消除肿瘤或体积降低。在一些实施例中,癌症的症状包含疼痛且其中病征的严重程度的降低包含消除或减少疼痛。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,治疗有效量诱导缓解期。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,治疗有效量改善个体的预后。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,个体是临床试验或其方案的参与者或候选参与者。在一些实施例中,将个体从用I型抑制剂进行的治疗排除。在一些实施例中,I型抑制剂包含吉非替尼、埃罗替尼、阿法替尼、奥希替尼、尼图单抗、克卓替尼、阿来替尼、色瑞替尼、达拉非尼、曲美替尼、阿法替尼、沙皮替尼、达可替尼、卡奈替尼、培利替尼、WZ4002、WZ8040、WZ3146、CO-1686或AZD9291。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,所述方法进一步包含用非I型抑制剂治疗个体。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,组合物进一步包含非I型抑制剂。

在本公开的用于治疗癌症的方法的一些实施例中,非I型抑制剂包含II型小分子抑制剂。在一些实施例中,II型小分子抑制剂包含来那替尼(neratinib)、AST-1306、HKI-357或拉帕替尼(lapatinib)。

在一些实施例中,本公开提供一种用于治疗个体中的癌症的方法,其包含向个体给予非I型抑制剂或强效I型抑制剂,其中所述个体包含EGFR的变构变体或HER2受体的变构变体。在一些实施例中,非I型ErbB抑制剂包含II型小分子抑制剂。在一些实施例中,非I型ErbB抑制剂或强效I型抑制剂包含AMG-595、瑞多匹特(rindopepimut)、沙皮替尼、阿法替尼、来那替尼、AST-1306、HKI-357或拉帕替尼。在一些实施例中,癌症包含实体癌症。在一些实施例中,癌症包含膀胱癌、乳癌、子宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、胃癌、神经胶母细胞瘤(GBM)、头颈癌、肺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)或其任何亚型。在一些实施例中,癌症包含神经胶母细胞瘤(GBM)或其任何亚型。在一些实施例中,癌症包含乳癌或其任何亚型。在一些实施例中,癌症包含肺癌或其任何亚型。

附图说明

本专利案或申请案文件含有至少一幅彩色图。具有彩色图式的本专利案或专利申请公开案的复本将在请求和支付必需费用之后由专利局提供。

图1是EGFR的结构以及影响EGFR的CR1或CR2且在GBM肿瘤中表达的20种基因组突变的组的说明。在EGFR的胞外域的晶体结构(1IVO)内突出显示突变。突变标注为洋红色球。EGF配体以绿色展示且EGFR原体以灰色和橙色展示。还参见表2。

图2是164种GBM肿瘤的组的CR1和CR2区域中的EGFR剪接事件和突变的表达模式的示意图。注意到一种肿瘤,TCGA.878,表达四种变体(EGFR-Viii、EGR-A289T、EGFR-A289V和EGFR-A289D)。超过65%的GBM肿瘤表达影响CR1/2区域的EGFR胞外域变体。

图3是描绘正在转化的ErbB受体的例示性胞外域变体的图。在不存在IL-3的情况下培养的表达EGFR-Viii、EGFR-Vii或EGFR-A289V的BaF3细胞或单独的载体(亲本)的增殖。展示在存在IL-3的情况下培养的亲本BaF3细胞的增殖作为对照。

图4是EGFR的结构以及作为癌症中的基因组突变和替代性剪接事件的结果的在EGFR的细胞外二聚体界面处形成的例示性游离半胱氨酸的说明。箭头指示预测作为事件EGFR-A289V、EGFR-Viii、EGFR-Vii和EGFR-Vvi的结果产生的游离半胱氨酸的位置。位置映射至EGFR的胞外域的晶体结构(1IVO)上。EGF配体以绿色展示且EGFR原体以灰色和橙色展示。

图5A是蛋白质印迹的一系列照片,其描绘通过在非还原条件下解析蛋白质而检测的针对EGFR-Viii、EGFR-Vii、EGFR-Vvi和EGFR-A289V的全部和磷酸化单体EGFR对比共价EGFR二聚体的表达。数据表明EGFR-Viii、EGFR-Vii、EGFR-Vvi和EGFR-A289V以共价活化二聚体形式存在。

图5B是描绘来自图5A的结果的定量以及针对全部受体对比磷酸化受体,以共价二聚体形式存在的受体百分比的定量的图。

图6是蛋白质印迹的一对照片,其描绘对于EGFR-Vii和EGFR-Vvi,EGF处理对单体和二聚磷酸化EGFR的水平的作用。与EGFR-Viii不同,EGF进一步增强EGFR-Vii和EGFR-Vvi的活性共价二聚体的形成。

图7A是蛋白质印迹的一系列照片,其描绘在表达EGFR-Viii、EGFR-Vii、EGFR-Vvi或EGFR-A289V的细胞中,100nM埃罗替尼处理对单体和二聚EGFR水平的作用。单体和二聚EGFR水平是通过在非还原条件下解析蛋白质来检测。数据表明对于所有共价活化EGFR变体,I型抑制剂增强共价二聚体的形成。

图7B是蛋白质印迹的一对照片,其描绘在表达EGFR-Vii的细胞中,不同浓度的埃罗替尼对单体和二聚EGFR水平的作用。单体和二聚EGFR水平是通过在非还原条件下解析蛋白质来检测。

图7C是定量图7B中呈现的数据的图。所述数据表明埃罗替尼诱导共价二聚化受体的剂量依赖性增加。

图8是蛋白质印迹的一系列照片,其描绘在表达EGFR-Vii和EGFR-A289V的细胞中,一组I型和II型抑制剂对二聚和单体EGFR水平的作用。单体和二聚EGFR水平是通过在非还原条件下解析蛋白质来检测。数据表明对于共价活化EGFR变体,I型但非II型ErbB抑制剂增强共价二聚体的形成。

图9是蛋白质印迹的一系列照片,其描绘100nM埃罗替尼处理对两种EGFR变体的单体和二聚EGFR水平的作用。单体和二聚EGFR水平是通过在非还原条件下解析蛋白质来检测。数据表明EGFR-Δ660和EGFR-Δ768都可以共价二聚体形式存在且共价二聚体在用埃罗替尼处理后得到增强。

图10A是蛋白质印迹的一系列照片,其描绘在表达EGFR-Viii、EGFR-Vii和EGFR-A289V的细胞中,不同浓度的埃罗替尼对磷酸化EGFR的单体和二聚水平的作用。单体和二聚EGFR水平是通过在非还原条件下解析蛋白质来检测。数据表明亚饱和浓度的埃罗替尼刺激共价二聚化剪接活化EGFR同功异型物的磷酸化。

图10B是蛋白质印迹的一系列照片,其描绘在表达EGFR-Vii或EGFR-Vvi的细胞中,不同浓度的埃罗替尼处理,接着进行30分钟清洗对全部和磷酸化EGFR水平的作用。在非还原条件下解析蛋白质。数据表明埃罗替尼反常地增强EGFR-Vii和EGFR-Vvi的共价二聚体的磷酸化。

图11A是描绘DMSO、37nM埃罗替尼或100nM埃罗替尼对表达EGFR-Viii的BaF3细胞的增殖的作用的图。在三天周期内的多个时间点收集增殖数据。数据表明亚饱和浓度的埃罗替尼引起表达剪接活化的EGFR的细胞的增殖的反常刺激。

图11B是描绘不同浓度的埃罗替尼对表达EGFR-Viii、EGFR-Vii或EGFR-A289V的BaF3细胞的增殖的作用的图。在埃罗替尼给药之后72小时评估增殖。数据表明亚饱和浓度的埃罗替尼反常地刺激由EGFR-Viii、EGFR-Vii和EGFR-A289V驱动的BaF3细胞的生长。

图12是描绘12.5nM或1μM WZ8040、WZ3146或WZ4002对表达EGFR-Viii的BaF3细胞的增殖的作用的一系列图形。在三天周期内的多个时间点收集增殖数据。数据表明亚饱和浓度的WZ8040、WZ3146或WZ4002引起表达EGFR-Viii的细胞的增殖的反常刺激。

图13A是EGFR的结构以及作为癌症中的基因组突变和替代性剪接事件的结果的在HER2受体的细胞外二聚体界面处形成的例示性游离半胱氨酸的说明。箭头指向由Δ16剪接事件或C311R或S310F突变产生的游离半胱氨酸的位置。

图13B是说明HER2和HER4剪接变体正在转化的一对图。在不存在IL-3的情况下培养的表达HER4-WT(JMA)、HER4Δ16(JMC)和HER2Δ16的BaF3细胞或单独的载体(亲本)的增殖。展示在存在IL-3的情况下培养的亲本BaF3细胞的增殖作为对照。

图14是蛋白质印迹的一系列照片,其描绘表达每种变体的细胞中的磷酸化HER2或HER4受体的二聚和单体水平的表达。单体和二聚EGFR水平是通过在非还原条件下解析蛋白质来检测。数据表明CR1和CR2区域中的多个HER2和HER4剪接事件和突变引起共价活性二聚体。

图15A是蛋白质印迹的一系列照片,其描绘对于表达HER2-Δ16、HER2-C311R、HER2-S310F或HER4Δ16的细胞,I型HER2抑制剂沙皮替尼或I型HER4抑制剂阿法替尼对二聚化受体的水平的作用。通过在非还原条件下解析蛋白质来检测单体和二聚HER2和HER4水平。数据表明I型抑制剂诱导共价活化HER2和HER4同功异型物的共价二聚体的形成。

图15B是蛋白质印迹的一系列照片和相应图形,其描绘不同浓度的沙皮替尼或阿法替尼对表达HER2-Δ16或HER4-Δ16的细胞中的二聚化HER2或HER2的水平的作用。通过在非还原条件下解析蛋白质来检测单体和二聚HER2和HER4水平。数据表明I型抑制剂诱导HER2和HER4变体的共价二聚化受体的剂量依赖性增加。

图16是描绘不同浓度的沙皮替尼对BaF3-HER2-Δ16细胞的增殖的作用的图。数据表明亚饱和浓度的I型抑制剂沙皮替尼反常地刺激BaF3-HER2Δ16细胞的增殖。

图17A-C是说明ErbB剪接变体的表达水平可以通过同功异型物选择性PCR来测量的一系列图。被工程改造以表达相应剪接变体的细胞中的EGFR-Viii(A)、EGFR-Vii(B)和EGFR-Vvi(C)的表达水平与不表达相应剪接变体的细胞的比较。列举用于检测每种变体的引物和探针。用于检测EGFRVIII的引物和探针鉴别为SEQ ID NO:9(正向)、SEQ ID NO:10(探针)和SEQ ID NO:11(反向)。用于检测EGFRVii的引物和探针鉴别为SEQ ID NO:12(正向)、SEQ ID NO:13(探针)和SEQ ID NO:14(反向)。用于检测EGFRVvi的引物和探针鉴别为SEQ ID NO:15(正向)、SEQ ID NO:16(探针)和SEQ ID NO:17(反向)。

图18是展示具有例如EGFR-Vii突变的细胞的最大增殖分数的图,所述EGFR-Vii突变具有NT-113(一种强效I型共价抑制剂)。NT-113诱导共价活化的ErbB受体的二聚作用。与可逆的I型抑制剂和其它共价I型抑制剂不同,不存在关于响应于NT-113而细胞增殖增加的证据。因此,与可逆的I型抑制剂和其它共价I型抑制剂不同,NT-113代表可以用于治疗由共价活化的ErbB受体驱动的肿瘤的强效I型共价分子。

图19是提供针对EGFR和HER2受体变体的代表性市售ErbB抑制剂的效能值的表。数据表明这些化合物不具有针对异体HER2突变的效能和选择性。这些化合物也不具有针对ErbB外显子20ins突变体和ErbB外显子20缺失突变体的效能和选择性。效能值反映细胞抗增殖活性(IC50,nM)。EGFR-WT=A431(+H292);HER2-WT=BT474;H4006=EGFR19del;所有突变体都是BaF3转化体。绿色框描绘与WT-EGFR相比,大于10倍的致癌突变体的选择性抑制且红色框描绘与WT-EGFR相比,小于10倍的致癌突变体的选择性抑制。

图20是提供针对EGFR和HER2受体变体的代表性市售ErbB抑制剂的效能值的表。数据表明这些化合物不具有针对ErbB外显子20ins突变体和ErbB外显子20缺失突变体的效能和选择性。效能值反映细胞抗增殖活性(IC50,nM)。EGFR-WT=A431(+H292);HER2-WT=BT474;H4006=EGFR19del;所有突变体都是BaF3转化体。绿色框描绘与WT-EGFR相比,大于10倍的致癌突变体的选择性抑制且红色框描绘与WT-EGFR相比,小于10倍的致癌突变体的选择性抑制。

图21是展示第3号化合物在活体内对具有HER突变信号传导的肿瘤的作用和相应的第3号化合物血浆水平的图。

具体实施方式

本公开涉及新颖化合物,其适用作受体酪氨酸激酶(RTK),尤其ErbB受体的致癌突变体的抑制剂。在本公开的一些实施例中,ErbB受体的致癌突变体也是ErbB受体的变构突变体。在本公开的一些实施例中,变构突变体可以包含ErbB受体变体或由ErbB受体变体组成,所述ErbB受体变体在ATP结合位点的外部的序列中具有突变。在本公开的一些实施例中,变构突变体可以包含ErbB受体变体或由ErbB受体变体组成,所述ErbB受体变体在外显子19、外显子20或C1-C2细胞外二聚作用界面中的一个或多个内的序列中具有突变。

影响ErbB受体的细胞内催化域或细胞外配体结合域的突变可以产生致癌活性(ErbB蛋白质家族由4个成员组成,所述成员包括ErbB-1,也称为表皮生长因子受体(EGFR),和Erb-2,在人类中也称为HER2)。癌症中的ErbB受体的细胞外突变体,包括EGFR-Viii(也称为EGFR-V3)和HER2-S310F,在不存在配体的情况下组成性活化,呈现对下调具有抗性的持续信号传导,且都是转化和致瘤的(Nishikawa,Ji等人,1994,2013,Francis,Zhang等人,2014)。其表达与转移和不良的长期总存活率相关联。

在神经胶母细胞瘤(也称为多形性神经胶母细胞瘤或GBM)中,20%的肿瘤表达EGFR-Viii(Sugawa,Ekstrand等人,1990,Brennan,Verhaak等人,2013)。GBM中的EGFR-Viii的表达倾向于与其它RTK致癌基因的表达相互排斥,所述其它RTK致癌基因在仅7%的GBM肿瘤中与EGFR变体共同表达(Furnari,Cloughesy等人,2015)。这些数据说明与其它致癌驱动因素相比,GBM中的EGFR-Viii如何具有显性和相互排斥的表达模式。EGFR-Viii还由约30%的SCCHN肿瘤(Sok,Coppelli等人,2006,Keller,Shroyer等人,2010,Wheeler,Suzuki等人,2010,Tinhofer,Klinghammer等人,2011,Wheeler,Egloff等人,2015)和10%的鳞状NSCLC(Ji,Zhao等人,2006,Sasaki,Kawano等人,2007)表达,且与对当前治疗剂(包括抗EGFR抗体西妥昔单抗(cetuximab))的抗性相关联(Sok,Coppelli等人,2006,Tinhofer,Klinghammer等人,2011)。正常组织不表达这种致癌受体变体。

HER2-S310F是在人类肿瘤中表达的HER2的最常见突变,由约0.5%的所有肿瘤表达。HER2-S310F表达与HER2扩增的表达相互排斥。HER2-S310F具有高度致癌性、将BaF3细胞(鼠类白细胞介素-3(IL-3)依赖性原B细胞系)转化成IL-3非依赖性且促进活体内肿瘤生长。

EGFR和HER2的外显子20内的短插入由肺腺癌肿瘤和其它肿瘤组表达。ErbB外显子20插入突变体由4-5%的肺腺癌肿瘤表达。实例包括HER2-YVMA、EGFR-SVD和EGFR-NPH。这些ErbB外显子20插入突变体具有高度致癌性、将BaF3细胞转化成IL-3非依赖性且促进活体内肿瘤生长。

ErbB抑制剂是已知的用于多种癌症的治疗。然而,并非每位患者都对这种治疗有令人满意的反应。因此,所属领域中持续需要能够解决癌症患者对已知疗法的可变反应性的新颖疗法。本公开能够克服在本文中所公开的组合物和方法的开发之前存在的护理标准的一些这类缺陷。

定义

除非另外规定,否则以下一般定义适用于根据本说明书的本公开的所有化合物。

如本文中所使用,术语“本公开的化合物”是指由式I至XV表示的化合物和本文中所公开的任何实例。

应理解,“彼此独立”意指当一个基团在任何化合物中出现超过一次时,其在每次出现时的定义与在任何其它出现时的定义无关。

还应理解,虚线(或与键呈横向的波浪)描绘残基(即,一部分化学式)的连接点。

还应理解,定义为“共价键”的基团是指其两个相邻基团之间的直接键联。

以下关于基团Z的定义适用于下文列举的每个实施例:术语“3至6元杂环烷基”与-(NR

“部分芳族”环系统是具有一个或多个不饱和度的环系统,其在整个环系统上未完全结合。

术语“3至6元杂芳基”与-(NR

术语“3至9元杂环烷基”与-(NR

关于3至9元杂环烷基的术语“稠合双环”是指选自C、N、O或S的3至9个环原子,其形成共有两个相邻原子(即,一个键)的两个或三个环(例如两个环)且稠合环系统中的至少一个环含有一个或多个杂原子(例如1、2或3个选自N、O和S的杂原子)。稠合杂双环基团的一些非限制性实例包括3-氮杂双环[3.1.0]己烷、3-氮杂双环[3.3.0]辛基、3,7-二氮杂双环[3.3.0]辛基、3-氮杂-7-氧杂双环[3.3.0]辛基、2,6-二氮杂双环[3.3.0]辛基、2,7-二氮杂双环[3.3.0]辛基、2,8-二氮杂双环[4.3.0]壬基、3-氧杂-8-氮杂双环[4.3.0]壬基、2-氧杂-8-氮杂双环[4.3.0]壬基、2,8-二氮-5-氧杂双环[4.3.0]壬基、4,9-二氮杂双环[4.3.0]壬基、2,9-二氮杂双环[4.3.0]壬基、3,8-二氮杂双环[4.3.0]壬基、3,7-二氮杂双环[4.3.0]壬基、3,9-二氮杂双环[4.3.0]壬基、3-氧杂-8-氮杂双环[4.3.0]壬基、3-硫杂-8-氮杂双环[4.3.0]壬基等。

关于3至9元杂环烷基的术语“桥联双环”是指形成具有碳环基或杂环基的环系统的3至9个环原子,其中环的两个非相邻原子通过至少一个(例如一个或两个)选自C、N、O或S的原子(例如C、N或O)连接(桥联),限制条件为存在至少一个杂原子。这类桥联环系统的实例包括双环[3.3.1]壬烷基、双环[3.2.1]辛烷基、双环[2.2.2]辛烷基、双环[3.1.1]庚烷基、双环[2.2.1]庚烷基(例如双环[3.2.1]辛烷基、双环[2.2.1]庚烷基,其具有一个或两个选自N和O的杂原子)。

关于3至9元杂环烷基的术语“螺双环”是指形成具有两个环的环系统的3至9个环原子,所述两个环中的每一个是独立地选自碳环基或杂环基,其中两个环共有一个原子。这类螺环系统的实例包括具有一个或两个选自N和O的杂原子的螺戊烷基、螺[2.3]己烷基、螺[3.3]庚烷基、螺[3.4]辛烷基、螺[4.4]壬烷基、螺[3.5]壬烷基、螺[4.5]癸烷基(例如螺[3.3]庚烷基、螺[4.4]壬烷基)。在一些实施例中,实例包括二氮杂螺[3.3]庚烷基、氧杂氮杂螺[3.3]庚烷基、二氮杂螺[4.4]壬烷基、氧杂氮杂螺[4.4]壬烷基。

如本文中所使用,术语“卤素”或“hal”可以是氟、氯、溴或碘(例如氟或氯)。

如本文中所使用,术语“烷基”是指完全饱和的支链或非支链烃部分。术语“C

根据本公开的方法,例示性个体是哺乳动物。在一些实施例中,例示性个体是人类。例示性个体可以是男性或女性。例示性个体可以是任何年龄(胎儿、新生儿、儿童、青年或成年人)。在一些实施例中,个体是成年人。例示性个体可以是健康的,举例来说,本公开的健康个体可以参与其中进行本公开的方法的一个或多个步骤的临床试验。在某些实施例中,例示性个体可能具有至少一种良性或恶性肿瘤。在一些实施例中,例示性个体患有至少一种形式或类型的癌症。本公开的方法的个体可以是被诊断患有癌症的患者、正在经历癌症治疗的患者、研究和/或临床研究的潜在参与者,和/或被选择入选研究和/或临床研究或从研究和/或临床研究排除的参与者。

根据本公开的方法,术语“哺乳动物”是指任何哺乳动物,包括人、家畜和农场动物,以及动物园、运动或宠物动物,如犬、猫、牛、马、绵羊、猪、山羊、兔等(例如人类)。

术语“预防(prevention/preventing)”是指减少或消除疾病(例如,癌症)的症状或并发症的发作。在一些实施例中,这类预防包含向有需要的个体(例如哺乳动物(例如人类))给予治疗有效量的本文中所公开的化合物(例如式I化合物或其医药学上可接受的盐)或本文中所公开的医药组合物(例如含有式I化合物或其医药学上可接受的盐的医药组合物)的步骤。

术语“治疗(treatment/treating)”意图涵盖疗法和治愈。在一些实施例中,这类治疗包含向有需要的个体(例如哺乳动物(例如人类))给予治疗有效量的本文中所公开的化合物(例如式I化合物或其医药学上可接受的盐)或本文中所公开的医药组合物(例如含有式I化合物或其医药学上可接受的盐的医药组合物)的步骤。在一些实施例中,术语“治疗”是指治疗性治疗措施;其中目标是延缓(减轻)目标病理学病状或病症。需要治疗的个体包括已患有病症以及易于罹患病症的个体。举例来说,当根据本公开的方法治疗癌症时,如果在根据本公开的方法接受治疗量的ErbB抑制剂之后,患者展示以下中的一种或多种的可观察的和/或可测量的降低或不存在以下中的一种或多种,那么成功地“治疗”个体或哺乳动物的癌症:癌细胞数目减少或不存在癌细胞;癌细胞的增殖或存活率降低;和/或在某种程度上缓解与特定感染相关的一种或多种症状;发病率和死亡率降低,和生活质量颁发得到改善。以上用于评估疾病的成功治疗和改善的参数可以由医生熟悉的常规程序容易地测量。

根据本公开的方法,可以通过给予治疗有效量的本公开组合物、II型ErbB抑制剂、EGFR-Viii选择性药剂/抑制剂或NT-113I型抑制剂来治疗具有本公开的突变的个体的癌症。术语“治疗有效量”是指可有效地“治疗”个体或哺乳动物中的疾病或病症(例如癌症)的本公开的组合物、II型ErbB抑制剂、EGFR-Viii选择性药剂/抑制剂或NT-113I型抑制剂的量。参见前述“治疗”的定义。

根据本公开的方法,II型ErbB抑制剂可以包括小分子。“小分子”在本文中定义为具有小于约1500道尔顿(Dalton)的分子量。

根据本公开的方法,可以通过分析来自个体的核酸或氨基酸序列来检测突变。可以在序列分析之前分离核酸和/或氨基酸序列。

术语“核酸”和“聚核苷酸”在本文中可以互换地用于指单链或双链RNA、DNA或混合聚合物。聚核苷酸可以包括基因组序列、基因组外和质体序列以及表达或可适于表达多肽的较小的被工程改造的基因区段。

“被分离的核酸”是基本上与其它基因组DNA序列以及天然伴有原生序列的蛋白质或复合物(如核糖体和聚合酶)分离的核酸。所述术语涵盖已从其天然存在的环境移出的核酸序列,且包括重组或克隆的DNA分离物以及以化学方式合成的类似物或由异源系统以生物学方式合成的类似物。基本上纯的核酸包括核酸的分离形式。这是指最初分离的核酸且不排除随后添加到被分离的核酸中的基因或序列。

术语“多肽”以其常规含义使用,即,作为氨基酸的序列。多肽不受产物的特定长度的限制。肽、寡肽和蛋白质包括于多肽的定义内且除非另外规定,否则这类术语在本文中可以互换地使用。此术语也不指或排除多肽的表达后修饰,例如糖基化、乙酰化、磷酸化等,以及所属领域中已知的天然存在的和非天然存在的其它修饰。多肽可以是整个蛋白质或其子序列。

“被分离的多肽”是已鉴别且从其自然环境的组分分离和/或回收的多肽。在一些实施例中,被分离的多肽将被纯化至(1)大于95重量%多肽,如通过劳里法(Lowry method)确定(例如,超过99重量%),(2)足以通过使用旋转杯式测序仪获得至少15个N端残基或内部氨基酸序列的程度,或(3)均质,通过使用考马斯(Coomassie)蓝或银染剂在还原或非还原条件下进行SDS-PAGE。被分离的多肽包括在重组细胞内的原位多肽,因为多肽的自然环境的至少一种组分将不存在。在一些实施例中,将通过至少一个纯化步骤来制备被分离的多肽。

“原生序列”聚核苷酸是与来源于自然的聚核苷酸具有相同核苷酸序列的聚核苷酸。“原生序列”多肽是与来源于自然界(例如,来自任何物种)的多肽(例如EGFR)具有相同氨基酸序列的多肽。这类原生序列聚核苷酸和多肽可以从自然界分离或通过重组或合成手段来产生。

如本文中所使用,术语聚核苷酸“变体”是在一个或多个取代、缺失、添加和/或插入方面与本文中所公开的聚核苷酸不同的聚核苷酸。

如本文中所使用,术语多肽“变体”是在一个或多个取代、缺失、添加和/或插入或倒位方面与本文中所公开的多肽不同的多肽。这类变体可能是天然存在的、非天然存在的或可能是以合成方式产生的。

本公开的EGFR突变(或变体)可以包含氨基酸序列的一个或多个取代、缺失、添加和/或插入或倒位,其改变所得蛋白质的功能。举例来说,可以通过将核或氨基酸序列与野生型序列进行比较或比对来检测突变。

当比较聚核苷酸与多肽序列时,如果两个序列中的核苷酸或氨基酸的序列当经比对以获得最大对应性时相同,那么两个序列被称为“一致的”,如下文所描述。两个序列之间的比较是通过在比较窗口比较序列以鉴别和比较序列的局部区域相似性来进行。如本文中所使用,“比较窗口”是指至少约20个(例如30至约75个或40至约50个)相邻位置的区段,其中在两个序列经最佳比对之后,序列可以与具有相同数目的相邻位置的参考序列相比较。

用于比较的序列的最佳比对可以使用默认参数,使用生物信息学软件的Lasergene套件中的Megalign程序(DNASTAR,Inc.,Madison,WI)来进行。此程序体现了以下参考文献中描述的若干比对方案:Dayhoff,M.O.(1978)《蛋白质的进化变化模型-用于检测远缘关系的矩阵(A model of evolutionary change in proteins-Matrices fordetecting distant relationships.)》,Dayhoff,M.O.(编)《蛋白质序列和结构图谱集(Atlas of Protein Sequence and Structure)》,National Biomedical ResearchFoundation,Washington DC,第5卷,增刊3,第345-358页;Hein J.(1990)《比对和系统发生的统一方法(Unified Approach to Alignment and Phylogenes)》第626-645页《酶学方法(Methods inEnzymology)》第183卷,Academic Press,Inc.,San Diego,CA;Higgins,D.G.和Sharp,P.M.(1989)CABIOS5:151-153;Myers,E.W.和Muller W.(1988)CABIOS 4:11-17;Robinson,E.D.(1971)《组合理论(Comb.Theor)》11:105;Santou,N.Nes,M.(1987)《分子生物进化(Mol.Biol.Evol)》.4:406-425;Sneath,P.H.A.和Sokal,R.R.(1973)《数值分类学-数值分类学的原理和实践(Numerical Taxonomy-the Principles and PracticeofNumerical Taxonomy)》,Freeman Press,San Francisco,CA;Wilbur,W.J.和Lipman,D.J.(1983)《美国国家科学院院刊(Proc.Natl.Acad.,Sci.USA)》80:726-730。

用于比较的序列的最佳比对可以通过以下进行:Smith和Waterman(1981)《应用数学(Add.APL.Math)》2:482的局部一致性算法、Needleman和Wunsch(1970)《分子生物学杂志(J.Mol.Biol)》.48:443的一致性比对算法、Pearson和Lipman(1988)《美国国家科学院院刊》85:2444的搜寻相似性方法、这些算法的计算机化实施方案(威斯康星遗传学软件包(Wisconsin Genetics Software Package),遗传学计算机组(Genetics ComputerGroup),575《科学(Science)》Dr.,Madison,WI中的GAP、BESTFIT、BLAST、FASTA和TFASTA),或检查。

适用于确定序列一致性百分比和序列相似性的算法的一个实例是BLAST和BLAST2.0算法,其分别描述于Altschul等人,(1977)《核酸研究(Nucl.AcidsRes)》.25:3389-3402和Altschul等人,(1990)《分子生物学杂志》.215:403-410中。BLAST和BLAST 2.0可以与例如本文中所描述的参数一起使用,以确定本公开的聚核苷酸和多肽的序列一致性百分比。用于进行BLAST分析的软件可以通过美国国家生物技术信息中心(National Center forBiotechnology Information)公开获得。

在一些实施例中,对于核苷酸序列,累积得分可以使用参数M(一对匹配残基的奖励得分;始终>0)和N(错配残基的惩罚得分;始终<0)计算。当累积比对得分从其达到的最大值降低量X;累积得分因一次或多次负分残基比对的累积而变成零或低于零;或到达任一序列的末端时,中断字命中点在各方向上的延伸。BLAST算法参数W、T和X确定比对的灵敏度和速度。BLASTN程序(对于核苷酸序列)使用如下默认参数:字长(W)是11,并且期望值(E)是10,并且BLOSUM62计分矩阵(参见Henikoff和Henikoff,(1989)《美国国家科学院院刊》89:10915)比对,(B)是50,预期值(E)是10,M=5,N=-4,并且比较两条链。

对于氨基酸序列,计分矩阵可以用于计算累积得分。当累积比对得分从其达到的最大值降低量X;累积得分因一次或多次负分残基比对的累积而变成零或低于零;或到达任一序列的末端时,中断字命中点在各方向上的延伸。BLAST算法参数W、T和X确定比对的灵敏度和速度。

在一种方法中,“序列一致性百分比”是通过在至少20个位置的比较窗口内比较两个经最佳比对的序列来确定,其中出于两个序列的最佳比对,相比于参考序列(其不包含添加或缺失),比较窗口中聚核苷酸或多肽序列的部分可以包含20%或更小(例如5至15%或10至12%)的添加或缺失(即,空位)。百分比是通过确定两个序列中都出现的相同核酸碱基或氨基酸残基所处的位置的数目以得到匹配位置数,将所述匹配位置数除以参考序列的位置的总数(即,窗口大小)且将结果乘以100以得到序列一致性百分比来计算。

序列

本公开的野生型EGFR序列可以包含以下的氨基酸序列或由其组成:

本公开的野生型HER2受体序列可以包含以下的氨基酸序列或由其组成:

(SEQ ID NO:2,对应于受体酪氨酸-蛋白质激酶erbB-2同功异型物a前体[智人]和GenBank寄存编号NP_004439)。

本公开的野生型HER2受体序列可以包含以下的氨基酸序列或由其组成:

本公开的野生型HER2受体序列可以包含以下的氨基酸序列或由其组成:

本公开的野生型HER2受体序列可以包含以下的氨基酸序列或由其组成:

本公开的野生型HER2受体序列可以包含以下的氨基酸序列或由其组成:

基于整个本申请案给出的定义,所属领域的技术人员知道哪些组合在合成上是可行的且现实的,例如不涵盖引起杂原子彼此直接连接的基团的组合。

本公开的化合物

在一些方面中,本公开涉及式I化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4;

Y

Z是-(NR

R

X是式(i)a的基团

其中Ar是6元芳基或N-杂芳基,其未被取代或被一个或多个选自卤素、C

L

在一些实施例中,式I化合物不是满足以下条件的化合物:X是式(i)a,其中L

在一些实施例中,式(i)a化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体的Ar是式(i)b的基团

其中X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,X

在一些实施例中,式(i)b的Ar是苯基(例如a1)。

在一些实施例中,式Ia'的Ar是基团b或c中的一个(例如b1或c1),其中吡啶在邻位或间位连接至环氮

在一些实施例中,式(i)b的Ar是基团d或e中的一个(例如d1或e1),其中嘧啶在邻位或间位连接至环氮

在一些实施例中,式(i)b的Ar是基团f(例如f1)。在一些实施例中,式(i)b的Ar是吡嗪基g(例如g1)

在一些实施例中,X

在式I化合物的一些实施例中,L

在一些实施例中,R

在一些实施例中,基团Z是如上文所定义。在式I化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式I化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式I化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在式I化合物的一些实施例中,包括基团R

在一些实施例中,基团L和Y

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0、1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,本公开涉及式I化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4;

Y

Z是-(NR

R

X是式(ii)a的基团,

其中X

R

L

在式I化合物的一些实施例中,包括基团R

在一些实施例中,X具有以下式(ii)b(例如(ii)c或(ii)c'):

其中X

在一些实施例中,X

在一些实施例中,X

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,X具有以下式(ii)d、(ii)e、(ii)f:

其中X

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在本公开的化合物的一些实施例中,基团X是

其中R

在一些实施例中,R

在式I化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基是指具有3、4、5或6个环原子(例如5个环原子)的(完全)芳族环系统,所述环原子是选自C、N、O和S(例如C、N和O,或C和N),其中N原子的数目是0、1、2或3(例如,0或1)且O和S原子的数目各自是0、1或2。“杂芳基”的实例包括呋喃基、咪唑基、异噁唑基、噁唑基、吡嗪基、吡唑基(pyrazolyl/pyrazyl)、哒嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡咯基、噻唑基、噻吩基等。在一些实施例中,“杂芳基”的实例包括吡咯基、咪唑基。

在式I化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基是指具有3至9个(例如5至7个)独立地选自C、N、O和S的环原子(例如C、N或O)的非芳族或部分芳族环系统,N原子的数目是0、1、2或3(例如,0或1)且O和S原子的数目各自是0、1或2。3至8元杂环烷基的实例包括单环和桥联双环。单环包括环氧乙烷基、硫杂环丙烷基、氮杂环丙烷基、氧杂环丁烷基、硫杂环丁烷基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、四氢呋喃基、四氢硫吡喃基、二氢吡喃基、四氢吡喃基、1,3-二氧戊环基、1,4-二氧杂环己烷基、1,4-氧硫杂环己烷基、1,4-二噻烷基、1,3-二噁烷、1,3-二噻烷基、哌嗪基、硫吗啉基、哌啶基、吗啉基、氧杂环庚烷基、硫杂环庚基、氮杂环庚烷基、二氮杂环庚烷基、氧氮杂环庚烷基(例如氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、哌嗪基、吗啉基);具有一个或两个选自N和O的杂原子桥联环系统,如双环[3.3.1]壬烷基、双环[3.2.1]辛烷基、双环[2.2.2]辛烷基、双环[3.1.1]庚烷基、双环[2.2.1]庚烷基(例如双环[3.2.1]辛烷基、双环[2.2.1]庚烷基)。

在一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,Y

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0、1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,本公开涉及式II或III的化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体

其中L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如共价键、直链或分支链C

Y

Z是-(NR

R

其中X

L

R

在一些实施例中,L

在一些实施例中,式II化合物不是满足以下条件的化合物:X是式(i)a,其中L

其中X

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,X具有以下式(ii)d、(ii)e、(ii)f:

其中X

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在式II或III的化合物的一些实施例中,基团X具有以下式(ii)g、(ii)h、(ii)i

(例如

其中R

在式II或III的化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式II或III的化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式II或III的化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,式II或III的化合物的基团Z是-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,Y

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

在一些实施例中,式II化合物具有式IIa

其中L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如共价键、直链或分支链C

m3是1或2(例如1);

Y

Z是-(NR

R

在式IIa化合物的一些实施例中,L是直链或分支链C

在式IIa化合物的一些实施例中,Y

在式IIa化合物的一些实施例中,Z是-(NR

其中R

其中X

在一些实施例中,式II或IIa的化合物具有式IIb

其中L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如共价键、直链或分支链C

Y

Z是-(NR

R

在式IIb化合物的一些实施例中,L是直链或分支链C

在式IIb化合物的一些实施例中,Y

在式IIb化合物的一些实施例中,R

在式IIb化合物的一些实施例中,Z是-(NR

其中R

其中X

在一些实施例中,式II、IIa或IIb的化合物具有式IIc、IId或IIe

其中L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如共价键、直链或分支链C

R”'是H或Me;

Z是-(NR

R

在式IIc、IId或IIe的化合物的一些实施例中,L是直链或分支链C

在式IIc、IId或IIe的化合物的一些实施例中,R

在式IIc、IId或IIe的化合物的一些实施例中,Z是-(NR

其中R

其中X

在一些实施例中,本公开涉及其中Y

其中L

X

R

R

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,L

在一些实施例中,化合物IV具有以下式IV-1

(例如,以下式IV-1a或IV-1b中的一个)

其中X

R

R

n是0、1、2、3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,化合物IV具有以下式中的一个

其中X

R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,化合物IV具有以下式中的一个

(例如,

其中R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0、1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在式IV、IV-1和IV-1a至IV-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式IV、IV-1和IV-1a至IV-1l的每种化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式IV、IV-1和IV-1a至IV-1l的化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在式IV、IV-1和IV-1a至IV-1l的每种化合物的一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,式IV化合物具有式V或VI

其中X

L

R

R

在一些实施例中,L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式V或VI的化合物具有式V-1或VI-1(例如V-1a、V-1b或VI-1a、VI-1b)

其中X

R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式V-1和VI-1的化合物具有式V-1c、V-1d、V-1e和VI-1c、VI-1d、VI-1e

其中X

R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式V-1和VI-1的化合物具有式V-1f、V-1g、V-1h和VI-1f、VI-1g、VI-1h

其中R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式V-1和VI-1的化合物具有式V-1i、V-1k、V-1l和VI-1i、VI-1k、VI-1l

其中R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在式V、V-1、V-1a至V-1l和VI、VI-1、VI-1a至VI-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式V、V-1、V-1a至V-1l和VI、VI-1、VI-1a至VI-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式V、V-1、V-1a至V-1l和VI、VI-1、VI-1a至VI-1l的化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在式V、V-1、V-1a至V-1l和VI、VI-1、VI-1a至VI-1l的每种化合物的一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,本公开涉及其中Y

其中L

X

R

R

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

限制条件为当R

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,L

在一些实施例中,式VII的化合物不是满足以下条件的化合物:X为式(i)a,且L

在一些实施例中,化合物VII具有以下式VII-1

(例如,以下式VII-1a或VII-1b中的一个

其中X

R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,化合物是式VII-1或VII-1a的化合物,限制条件为当R

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,化合物VII具有以下式中的一个

其中X

R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,化合物VII具有以下式中的一个

(例如,

其中R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,所述化合物是式VII-1f或VII-1i的化合物,限制条件为当R

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地为0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在式VII、VII-1和VII-1a至VII-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式VII、VII-1和VII-1a至VII-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式VII、VII-1和VII-1a至VII-1l的化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在式VII、VII-1和VII-1a至VII-1l的每种化合物的一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,式VII化合物具有式VIII或IX

其中X

L

R

R

在一些实施例中,L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式VIII或IX的化合物具有式VIII-1或IX-1(例如,VIII-1a、VIII-1b或IX-1a、IX-1b)

其中X

R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,化合物是式VIII-1或VIII-1a的化合物,限制条件为当R

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式VIII-1和IX-1的化合物具有式VIII-1c、VIII-1d、VIII-1e和IX-1c、IX-1d、IX-1e

其中X

R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,化合物是式VIII-1c、VIII-1d或VIII-1e的化合物,限制条件为当R

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式VIII-1和IX-1的化合物具有式VIII-1f、VIII-1g、VIII-1h和IX-1f、IX-1g、IX-1h

其中R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,化合物是式VIII-1f的化合物,限制条件为当R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式VIII-1和IX-1的化合物具有式VIII-1i、VIII-1k、VIII-1l和IX-1i、IX-1k、IX-1l

其中R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,化合物是式VIII-1i化合物,限制条件为当R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在式VIII、VIII-1、VIII-1a至VIII-1l和IX、IX-1、IX-1a至IX-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式VIII、VIII-1、VIII-1a至VIII-1l和IX、IX-1、IX-1a至IX-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式VIII、VIII-1、VIII-1a至VIII-1l和IX、IX-1、IX-1a至IX-1l的化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在式VIII、VIII-1、VIII-1a至VIII-1l和IX、IX-1、IX-1a至IX-1l的每种化合物的一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,本公开涉及其中Y

其中L

X

R

R

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

在一些实施例中,L是

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,L

在一些实施例中,化合物X具有以下式X-1

(例如,以下式X-1a或X-1b中的一个

其中X

R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式X化合物具有以下式中的一个:

其中X

R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式X化合物具有以下式中的一个:

(例如,

其中R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在式X、X-1和X-1a至X-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式X、X-1和X-1a至X-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式X、X-1和X-1a至X-1l的化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在式X、X-1和X-1a至X-1l的每种化合物的一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,式X化合物具有式XI或XII

其中X

L

R

R

在一些实施例中,L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式XI或XII的化合物具有式XI-1或XII-1(XI-1a、XI-1b或XII-1a、XII-1b)

其中X

R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2,在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式XI-1和XII-1的化合物具有式XI-1c、XI-1d、XI-1e和XII-1c、XII-1d、XII-1e

其中X

R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式XI-1和XII-1的化合物具有式XI-1f、XI-1g、XI-1h和XII-1f、XII-1g、XII-1h

其中R

在一些实施例中,R

N是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式XI-1和XII-1的化合物具有式XI-1i、XI-1k、XI-1l和XII-1i、XII-1k、XII-1l

其中R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

R”'是H或-CH

Z是-(NR

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2,在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在式XI、XI-1、XI-1a至XI-1l和XII、XII-1、XII-1a至XII-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式XI、XI-1、XI-1a至XI-1l和XII、XII-1、XII-1a至XII-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式XI、XI-1、XI-1a至XI-1l和XII、XII-1、XII-1a至XII-1l的化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在式XI、XI-1、XI-1a至XI-1l和XII、XII-1、XII-1a至XII-1l的每种化合物的一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,本公开涉及其中Y

其中L

X

R

R

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,L

在一些实施例中,化合物XIII具有以下式XIII-1

(例如,以下式XIII-1a或XIII-1b中的一个

其中X

R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,化合物XIII具有以下式中的一个

其中X

R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1或m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,化合物XIII具有以下式中的一个

(例如,

其中R

R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在式XIII、XIII-1和XIII-1a至XIII-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式XIII、XIII-1和XIII-1a至XIII-1l的化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式XIII、XIII-1和XIII-1a至XIII-1l的化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在式XIII、XIII-1和XIII-1a至XIII-1l的每种化合物的一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,式XIII化合物具有式XIV或XV

其中X

L

R

R

在一些实施例中,L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式XIV或XV的化合物具有式XIV-1或XV-1(例如,XIV-1a、XIV-1b或XV-1a、XV-1b)

其中X

R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式XIV-1和XV-1的化合物具有式XIV-1c、XIV-1d、XIV-1e和XV-1c、XV-1d、XV-1e

其中X

R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,X

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式XIV-1和XV-1的化合物具有式XIV-1f、XIV-1g、XIV-1h和XV-1f、XV-1g、XV-1h

其中R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在一些实施例中,式XIV-1和XV-1的化合物具有式XIV-1i、XIV-1k、XIV-1l和XV-1i、XV-1k、XV-1l

其中R

在一些实施例中,R

n是0、1、2或3(例如,1或2);

L是共价键、直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如,L是共价键、直链或分支链C

Z是-(NR

在一些实施例中,R

在一些实施例中,L是共价键。在一些实施例中,L是直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

其中m1和m2彼此独立地是0、1、2、3或4(例如0、1或2)。在一些实施例中,m2是0且m1是0或1或2。在一些实施例中,m1和m2是1。在一些实施例中,m1和m2是2。

在一些实施例中,L是共价键或直链或分支链C

在式XIV、XIV-1、XIV-1a至XIV-1l和XV、XV-1、XV-1a至XV-1l的每种化合物的一些实施例中,3至6元杂环烷基(与-(NR

在式XIV、XIV-1、XIV-1a至XIV-1l和XV、XV-1、XV-1a至XV-1l的每种化合物的一些实施例中,3至6元杂芳基(与-(NR

在式XIV、XIV-1、XIV-1a至XIV-1l和XV、XV-1、XV-1a至XV-1l的每种化合物的一些实施例中,3至9元杂环烷基(与-(NR

在一些实施例中,-(NR

其中R

在一些实施例中,-(CHR

其中R

在式XIV、XIV-1、XIV-1a至XIV-1l和XV、XV-1、XV-1a至XV-1l的每种化合物的一些实施例中,Z是-(NR

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,基团Z的环系统包括

其中R

在一些实施例中,化合物是选自表I中描述的化合物、其医药学上可接受的盐和其立体异构体。

在一些实施例中,化合物是选自表I中描述的化合物和其医药学上可接受的盐。

在一些实施例中,化合物是选自表I中描述的化合物。

表I

本公开的化合物可以在分子中含有一个或多个不对称中心。应理解,未指定立体化学的化合物包括呈纯或基本上纯形式的所有光学异构体(例如非对映异构体、对映异构体等),以及其混合物(例如外消旋混合物或对映异构性增浓混合物)。所属领域中众所周知如何制备这类光学活性形式(例如,通过再结晶技术来分解外消旋形式、由光学活性起始物质合成、手性合成、使用手性固定相的色谱分离和其它方法)。

化合物可以是被同位素标记的化合物,例如包括氢、碳、氮、氧、磷、氟、碘或氯的各种同位素的化合物。所公开的化合物可以互变异构形式存在且涵盖混合物和单独的各个互变异构体。此外,一些化合物可能呈现多态现象。

本公开的化合物包括游离形式以及其医药学上可接受的盐和立体异构体。医药学上可接受的盐包括所有典型的医药学上可接受的盐。本发明化合物的医药学上可接受的盐可以通过常规化学方法由含有碱性或酸性部分的本公开的化合物合成,参见例如Berge等人,《医药盐(Pharmaceutical Salts)》,《医药科学杂志(J.Pharm.Sci)》,1977:66:1-19。

举例来说,碱性化合物的常规的医药学上可接受的盐包括来源于无机酸的盐,所述无机酸如盐酸、氢溴酸、硫酸、氨基磺酸、磷酸、硝酸等,以及由有机酸制备的盐,所述有机酸如乙酸、丙酸、丁二酸、乙醇酸、硬脂酸、乳酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、抗坏血酸、双羟萘酸、顺丁烯二酸、羟基马来酸、苯乙酸、谷氨酸、苯甲酸、水杨酸、对氨基苯磺酸、2-乙酰氧基-苯甲酸、反丁烯二酸、甲苯磺酸、甲烷磺酸、乙烷二磺酸、草酸、羟乙基磺酸、三氟乙酸等。酸性化合物的常规的医药学上可接受的盐包括来源于无机碱的盐,包括铝、铵、钙、铜、铁、二价铁、锂、镁、锰盐、二价锰、钾、钠、锌等。来源于医药学上可接受的有机碱的盐包括以下的盐:伯胺、仲胺和叔胺、被取代的胺(包括天然存在的被取代的胺)、环胺和碱性离子交换树脂,如精氨酸、甜菜碱、咖啡碱、胆碱、N,N-二苯甲基乙二胺、二乙胺、2-二乙基氨基乙醇、2-二甲基氨基乙醇、乙醇胺、乙二胺、N-乙基吗啉、N-乙基哌啶、还原葡糖胺、葡糖胺、组氨酸、海卓胺(hydrabamine)、异丙胺、赖氨酸、甲基葡糖胺、吗啉、哌嗪、哌啶、聚胺树脂、普鲁卡因(procaine)、嘌呤、可可豆碱、三乙胺、三甲胺、三丙胺、缓血酸胺等。

本公开的化合物可以固体(即,结晶或非晶形式(任选地呈溶剂合物形式))或液体形式存在。在固体状态中,其可以存在于混合物中或以混合物形式存在。在结晶溶剂合物中,溶剂分子在结晶期间并入结晶晶格中。溶剂合物的形成可以包括非水性溶剂,如(但不限于)乙醇、异丙醇、DMSO、乙酸、乙醇胺或乙酸乙酯,或水性溶剂,如水(也称为“水合物”)。众所周知,结晶形式(和其溶剂合物)可以呈现多态现象,即,以称为“多晶型物”的不同结晶结构形式存在,其具有相同的化学组成,但在包装、几何布置和结晶固体状态的其它描述性特性方面不同。因此,多晶型物可以具有不同的物理性质,如形状、密度、硬度、变形性、稳定性和溶解特性,且可以显示不同的熔点、IR谱图和X射线粉末衍射图,其可以用于鉴定。可以例如通过在制备本公开的化合物期间改变或调节反应条件或试剂来产生这类不同的多晶型物。

化合物的合成

在一些实施例中,本公开提供用于制备本公开的化合物的方法。在一些实施例中,根据下文中的方案A至D中展示的合成法来制备化合物。

在一些实施例中,本公开提供用于制备本公开的化合物的方法。

在一些实施例中,本公开提供一种化合物的方法,其包含如本文中所描述的一个或多个步骤。

在一些实施例中,本公开提供可以通过如本文中所描述的用于制备化合物的方法获得、通过所述方法获得或直接通过所述方法获得的化合物。

在一些实施例中,本公开提供如本文中所描述的中间物,其适用于用以制备如本文中所描述的化合物的方法。

本公开的化合物可以由所属领域中已知的任何合适的技术制备。用于制备这些化合物的方法描述于随附实例中。

在本文中所描述的合成方法和用于制备起始物质的任何参考合成方法的描述中,应理解,可以由所属领域的技术人员选择所有所提出的反应条件,包括溶剂的选择、反应气氛、反应温度、实验持续时间和处理程序。

有机合成领域的技术人员应理解,存在于分子的各部分上的官能团必须与所使用的试剂和反应条件相容。

应了解,在本文中所定义的方法中的本公开的化合物的合成期间或在某些起始物质的合成期间,可能需要保护某些取代基以防止其不合需要的反应物。熟练的化学工作者将知晓何时需要这类保护,以及如何可以在适当位置置放这类保护基且随后去除。关于保护基的实例,参见关于主题的许多通用教材中的一种,例如《有机合成中的保护基(Protective Groups in Organic Synthesis)》,Theodora Green(出版商:John Wiley&Sons)。可以视需要通过文献中描述的或熟练的化学工作者已知的用于去除所讨论的保护基的任何便利的方法来去除保护基,选择这类方法以在对分子中的其它地方的基团造成的干扰最小的情况下实现保护基的去除。因此,如果反应物包括如氨基、羧基或羟基等基团,那么可能需要在本文中提及的一些反应中保护所述基团。

如有机合成领域的技术人员将理解,可以由各种合成途径容易地获得本公开的化合物,一些合成途径例示于随附实例中。所属领域的技术人员将易于识别应使用何种类别的试剂和反应条件以及在需要或适用时,在任何具体实例中如何应用和调适,以获得本公开的化合物。在一些实施例中,本公开的一些化合物可以通过使本公开的其它化合物在合适的条件下反应来容易地合成,例如通过应用标准合成方法(如还原、氧化、加成或取代反应)将存在于本公开的化合物中的一个具体官能团或其合适的前体分子转化成另一个官能团;这些方法是所属领域的技术人员众所周知的。类似地,所属领域的技术人员将在需要或适用时应用合成保护(或保护性)基团;合适的保护基以及将其引入和去除的方法是化学合成领域的技术人员众所周知的且更详细地描述于例如P.G.M.Wuts,T.W.Greene,《有机合成中的格林保护基(Greene's Protective Groups in Organic Synthesis)》,第4版(2006)(John Wiley&Sons)。

用于制备本申请案的化合物的一般途径描述于一般程序A-D中:

一般程序A:

步骤A.1:

向7-氟-6-硝基-喹唑啉-4-醇(5.00g,23.9mmol,1.00当量)于亚硫酰氯(20.0mL)中的溶液中添加二甲基甲酰胺(174mg,2.39mmol,183μL,0.10当量)。在80℃下搅拌反应物10小时。在减压下浓缩反应混合物,得到呈灰白色固体状的4-氯-7-氟-6-硝基喹唑啉(6.00g,粗物质)。产物未经纯化即用于下一步骤。

步骤A.2:

在80℃下加热4-氯-7-氟-6-硝基喹唑啉(2.4g,10.55mmol,1当量)和游离胺H

步骤A.3:

向胺III(1当量)和NH或OH亲核试剂Z-(CH

步骤A.4:

步骤A.5:

步骤A.6:

向V(1.0当量)、1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳化二亚胺盐酸盐(5.00当量)和吡啶(5.00当量)于N,N-二甲基甲酰胺中的溶液中添加丁-2-炔酸(10.0当量)。在50℃下搅拌混合物2小时且接着在真空中浓缩。通过制备型HPLC来纯化混合物,得到炔酰胺VII。

通用程序B:

步骤B.1:

在20℃下,向在步骤A.2中获得的III(1.00当量)和叔丁醇钾(4.00当量)于二甲亚砜(10.0mL)中的溶液中逐滴添加氨基醇的相应二醇(6.00当量)。在20℃下搅拌混合物12小时。混合物用水稀释且用乙酸乙酯萃取。合并的有机层用盐水洗涤且经硫酸钠脱水,过滤且浓缩,得到粗产物。通过硅胶色谱来纯化粗产物,得到醇VIII。

步骤B.2:

步骤B.3:

在20℃下,向IX(1.0当量)和碳酸钾(4.00当量)于二甲亚砜中的溶液中一次性添加相应的N-H亲核试剂(2.0当量)。在50℃下搅拌混合物12小时。混合物用水稀释且用乙酸乙酯萃取。合并的有机层用盐水洗涤且经硫酸钠脱水,过滤且浓缩,得到粗产物。通过制备型HPLC来纯化粗产物,得到X。

步骤B.4:

步骤B.5:

通用程序C:

步骤C.1:

在25℃下,将钠(3.0当量)添加到相应的二醇(18.7当量)中。在25℃下搅拌悬浮液0.5小时。向以上悬浮液中添加醇I(1.0当量)。将混合物加热到70℃且在70℃下搅拌1.5小时。将混合物冷却至25℃且接着用盐酸(3M)调节至pH=7。在过滤之后,滤饼在减压下脱水,得到二醇XIII。

步骤C.2:

向二醇XIII(1.00当量)于亚硫酰氯(10.0mL)中的溶液中添加N,N-二甲基甲酰胺(0.1当量)。在90℃下搅拌混合物3小时。将混合物冷却至25℃且接着在真空中浓缩。将混合物分配于水与乙酸乙酯之间。有机相用盐水洗涤,经无水硫酸钠脱水,过滤且在真空中浓缩。通过硅胶色谱来纯化残余物,得到二氯化物XIV。

步骤C.3:

在90℃下搅拌二氯化物XIV(1.0当量)和H

步骤C.4:

向XV(1.0当量)、碘化钾(0.1当量)和碘化四丁基铵(0.1当量)于甲苯中的溶液中添加HNR'R”(3.00当量)。在110℃下搅拌混合物12小时。将混合物冷却至25℃且接着在真空中浓缩。残余物用水湿磨且过滤,滤饼在真空中脱水,得到XVI。

步骤C.5:

步骤C.6:

步骤C.7:

向XVII(1.0当量)、1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳化二亚胺盐酸盐(5.00当量)和吡啶(5.00当量)于N,N-二甲基甲酰胺中的溶液中添加丁-2-炔酸(10.0当量)。在50℃下搅拌混合物2小时且接着在真空中浓缩。通过制备型HPLC来纯化混合物,得到炔酰胺XIX。

通用程序D:

步骤D.1:

在20℃下,向溴化物或三氟甲磺酸酯XX(1.00当量)于二甲亚砜中的溶液中添加相应的炔烃(1.50当量)、三乙胺(3.00当量)、碘化铜(I)(0.5当量)、四(三苯基膦)钯(0.05当量)。混合物用氮气脱气且在氮气下,在20℃下搅拌12小时。向混合物中添加甲醇且过滤,浓缩滤饼,得到炔烃XXI。

步骤D.2:

在20℃下,向炔烃XXI(1.00当量)于亚硫酰氯中的悬浮液中添加N,N-二甲基甲酰胺(2.0当量)。在90℃下搅拌混合物0.5小时,直到悬浮液变成均匀溶液。浓缩溶液,得到氯化物XXII。

步骤D.3:

在80℃下搅拌氯化物XXII(1.0当量)和H

步骤D.4:

步骤D.5:

医药组合物

在一些实施例中,本公开还提供一种医药组合物,其包含治疗有效量的一种或多种本公开的化合物或其医药学上可接受的盐和一种或多种医药学上可接受的载剂和/或赋形剂(也称为稀释剂)。赋形剂在与配制物的其它成分相容的意义上是可接受的且对其受体(即,患者)无害。如本文中所使用,术语“治疗有效量”是指可以有效地产生一些所需治疗作用的本公开的化合物(按原样或呈医药组合物形式)的量。

医药组合物可以呈每单位剂量含有预定量的本公开的化合物的单位剂型形式。这类单元可以含有治疗有效剂量的本公开的化合物或其盐或治疗有效剂量的一部分,使得可以在既定时间给予多个单位剂型以实现所需治疗有效剂量。在一些实施例中,单位剂量配制物是含有本公开的化合物或其盐的日剂量或子剂量或其适当部分的配制物。

本公开的化合物可以通过任何可接受的手段以固体或液体形式给予,包括(1)口服给药,例如灌药(水性或非水性溶液或悬浮液)、片剂(例如,旨在颊内、舌下和全身性吸收的片剂)、团注、粉末、颗粒剂、应用于舌头的糊剂;(2)肠胃外给药,例如,以例如无菌溶液或悬浮液或持续释放型配制物形式通过皮下、肌肉内、静脉内或硬膜外注射;(3)局部施用,例如,以施用于皮肤的乳膏、软膏或控制释放型贴剂或喷雾形式;(4)阴道内或直肠内,例如以子宫托、乳膏或泡沫形式;(5)舌下;(6)眼部;(7)经皮;(8)经鼻;(9)经肺;或(10)鞘内。

如本文所使用,短语“药学上可接受的载剂”意指如液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂、制造助剂(例如,润滑剂、滑石镁、硬脂酸钙或硬脂酸锌,或硬脂酸)或溶剂包囊材料等涉及将主题化合物从一个器官或身体的一部分承载或运输到另一个器官或身体的另一部分的医药学上可接受的材料、组合物或媒剂。每种载剂必须在与配制物的其它成分相容并且对患者无害的意义上是“可接受的”。可以充当医药学上可接受的载剂的材料的一些实例包括:(1)糖,如乳糖、葡萄糖和蔗糖;(2)淀粉,如玉米淀粉和马铃薯淀粉;(3)纤维素和其衍生物,如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素和乙酸纤维素;(4)粉末状黄蓍胶;(5)麦芽;(6)明胶;(7)滑石;(8)赋形剂,如可可脂和栓剂蜡;(9)油,如花生油、棉籽油、红花油、芝麻油、橄榄油、玉米油以及大豆油;(10)二醇,如丙二醇;(11)多元醇,如甘油、山梨糖醇、甘露糖醇以及聚乙二醇;(12)酯,如油酸乙酯和月桂酸乙酯;(13)琼脂;(14)缓冲剂,如氢氧化镁和氢氧化铝;(15)海藻酸;(16)无热原水;(17)等渗生理盐水;(18)林格氏溶液(Ringer'ssolution);(19)乙醇;(20)pH值缓冲溶液;(21)聚酯、聚碳酸酯和/或聚酸酐;以及(22)医药组合物中使用的其它无毒性相容物质。

这类组合物还可以含有药物制剂中常规的组分,例如湿润剂、乳化剂和润滑剂,如月桂基硫酸钠和硬脂酸镁,以及着色剂、脱模剂、包衣剂、甜味剂、调味剂和芳香剂、防腐剂和抗氧化剂、pH值调节剂、增量剂和其它活性剂。医药学上可接受的抗氧化剂的实例包括:(1)水溶性抗氧化剂,如抗坏血酸、半胱氨酸盐酸盐、硫酸氢钠、偏亚硫酸氢钠、亚硫酸钠等;(2)油溶性抗氧化剂,如抗坏血酸棕榈酸酯、丁基化羟基苯甲醚(BHA)、丁基化羟基甲苯(BHT)、卵磷脂、没食子酸丙酯、α-生育酚等;以及(3)金属螯合剂,如柠檬酸、乙二胺四乙酸(EDTA)、山梨糖醇、酒石酸、磷酸等。

这类组合物可以通过所属领域中已知的任何方法制备,例如通过使活性成分与一种或多种载剂和/或赋形剂缔合。载剂和/或赋形剂的不同组合物和实例是所属领域的技术人员众所周知的且详细描述于例如《雷明顿:医药学科学与实践(Remington:The Scienceand Practice of Pharmacy)》.Pharmaceutical Press,2013;Rowe,Sheskey,《奎恩:药用辅料手册(Quinn:Handbook of Pharmaceutical Excipients)》.Pharmaceutical Press,2009中。可以用于制备医药组合物的赋形剂可以包括以下中的一种或多种:缓冲液、稳定剂、表面活性剂、湿润剂、润滑剂、乳化剂、悬浮剂、防腐剂、抗氧化剂、遮光剂、助滑剂、处理助剂、着色剂、甜味剂、芳香剂、调味剂、稀释剂和其它已知的提供适用于所选给药的组合物的添加剂。

在一些实施例中,本公开的化合物可以呈固体或液体形式且通过各种途径以任何便利的给药形式给予,例如片剂、粉末、胶囊、溶液、分散液、悬浮液、糖浆、喷雾剂、栓剂、凝胶、乳液、贴片等。

在本公开的用于口服给药的固体剂型(胶囊、片剂、丸剂、糖衣药丸、粉末、颗粒剂、小丸剂等)中,化合物与一种或多种医药学上可接受的载剂混合,如柠檬酸钠或磷酸二钙和/或以下中的任一种:(1)填充剂或增量剂,如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露糖醇和/或硅酸;(2)粘合剂,如羧甲基纤维素、海藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和/或阿拉伯胶;(3)保湿剂,如甘油;(4)崩解剂,如琼脂、碳酸钙、马铃薯或木薯淀粉、海藻酸、某些硅酸盐和碳酸钠;(5)溶液阻滞剂,如石蜡;(6)吸收促进剂,如季铵化合物和表面活性剂,如泊洛沙姆(poloxamer)和月桂基硫酸钠;(7)湿润剂,如鲸蜡醇、单硬脂酸甘油酯和非离子表面活性剂;(8)吸收剂,如高岭土和膨润土;(9)润滑剂,如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、月桂基硫酸钠、硬脂酸锌、硬脂酸钠、硬脂酸和其混合物;(10)着色剂;以及(11)控制释放剂,如交联聚维酮或乙基纤维素。在胶囊、片剂和丸剂的情况下,医药组合物还可以包含缓冲剂。类似类型的固体组合物也可以使用如乳糖或奶糖以及高分子量聚乙二醇等赋形剂作为软壳明胶胶囊和硬壳明胶胶囊中的填充剂。片剂可以通过压缩或模塑制备,任选地含有一种或多种辅助成分。可以使用粘合剂(例如,明胶或羟丙基甲基纤维素)、润滑剂、惰性稀释剂、防腐剂、崩解剂(例如,羟基乙酸淀粉钠或交联羧甲基纤维素钠)、表面活性剂或分散剂来制备压缩片剂。可以通过在合适的机器中模制用惰性液体稀释剂湿润的粉末状化合物的混合物来制造模制片剂。本公开的医药组合物的片剂和其它固体剂型,如糖衣药丸、胶囊、丸剂和颗粒剂,可以任选地用包衣和外壳,如肠溶包衣和其它医药配制技术中众所周知的包衣刻痕或制备。其也可以使用例如不同比例的羟丙基甲基纤维素以提供所需的释放特征、其它聚合物基质、脂质体和/或微球配制,以提供其中的活性成分的缓慢或控制释放。其可以被配制成用于快速释放,例如冷冻干燥。其可以例如在即将使用之前通过细菌截留过滤器进行过滤或者通过并入可以溶于无菌水或一些其它无菌可注射介质中的呈无菌固体组合物形式的灭菌剂来灭菌。这些组合物还可以任选地含有乳浊剂并且其组成可以使得其仅在胃肠道中或在胃肠道的某一部分中任选地以延迟的方式释放一种或多种活性成分。可以使用的包埋组合物的实例包括聚合物质和蜡。如果合适,活性成分也可以与一种或多种上述赋形剂一起呈微囊封形式。

用于本公开的化合物的口服给药的液体剂型包括医药学上可接受的乳液、微乳液、溶液、悬浮液、糖浆和酏剂。除活性成分以外,液体剂型可以含有所属领域中常用的惰性稀释剂,例如水或其它溶剂、增溶剂和乳化剂,如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苯甲酯、丙二醇、1,3-丁二醇、油(具体地说,棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄榄油、蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氢呋喃醇、聚乙二醇和脱水山梨糖醇的脂肪酸酯以及其混合物。口服组合物还可以包括佐剂,如湿润剂、乳化剂和悬浮剂、甜味剂、调味剂、着色剂、芳香剂和防腐剂。

在悬浮液形式中,化合物可以含有悬浮剂,例如乙氧基化异硬脂醇、聚氧乙烯山梨糖醇和脱水山梨糖醇酯、微晶纤维素、偏氢氧化铝、膨润土、琼脂和黄蓍胶以及其混合物。

用于本公开的化合物的直肠或阴道给药的剂型包括栓剂,所述栓剂可以通过将一种或多种本公开的化合物与一种或多种合适的无刺激性赋形剂或载剂(包含例如可可脂、聚乙二醇、栓剂蜡或水杨酸盐)混合来制备并且其在室温下是固体,但在体温下是液体且因此会在直肠或阴道腔内融化且释放活性化合物。其它合适的形式包括所属领域中已知合适的含有这类载剂的阴道栓剂、棉塞、乳膏、凝胶、糊剂、泡沫或喷雾剂配制物。

用于本公开的化合物的局部或经皮给药的剂型包括粉末、喷雾剂、软膏、糊剂、乳膏、洗剂、凝胶、溶液、贴片和吸入剂。活性化合物可以在无菌条件下与医药学上可接受的载剂和可能需要的任何防腐剂、缓冲液或推进剂混合。除本公开的活性化合物以外,这类软膏、糊剂、乳膏和凝胶可以含有赋形剂,如动物和植物脂肪、油、蜡、石蜡、淀粉、黄蓍胶、纤维素衍生物、聚乙二醇、硅酮、膨润土、硅酸、滑石和氧化锌或其混合物。

用于本公开的化合物的给药的剂型(如粉末和喷雾剂)可以含有赋形剂,如乳糖、滑石、硅酸、氢氧化铝、硅酸钙和聚酰胺粉末,或这些物质的混合物。喷雾剂可以额外含有常规推进剂,如氯氟烃和挥发性未被取代的烃,如丁烷和丙烷。

用于本公开的化合物的给药的剂型(如经皮贴片)可以包括用于增加或减少穿透皮肤的化合物的通量的吸收增强剂或迟延剂。这类通量的速率可以通过提供速率控制膜或将所述化合物分散于聚合物基质或凝胶中来控制。涵盖的其它剂型包括眼用配制物、眼膏、粉末、溶液等。应理解,所有所涵盖的组合物必须在制造和储存条件下稳定,且被保藏以避免微生物(如细菌和真菌)的污染作用。

可以调节本公开的医药组合物中的本公开的化合物的剂量水平,以获得可以有效实现具体患者、组合物和给药模式的所需治疗反应而对患者无害的本公开的化合物的量。所选剂量将取决于多种因素,包括所使用的本公开的具体化合物的性质;给药途径;给药时间;所使用的具体化合物的排泄或代谢速率;吸收速率和程度;治疗持续时间;与具体化合物组合使用的其它药物、化合物和/或材料;所治疗的患者的年龄、性别、体重、病状、一般健康状况和先前病史;以及医学领域中众所周知的类似因素。具有所属领域的一般技术的医学从业者可以容易地确定和指定所需医药组合物的有效量。

在一些实施例中,本公开的化合物的合适的日剂量将是可以有效产生治疗作用的最低剂量的化合物的量。这类有效剂量通常将取决于上文所描述的因素。在一些实施例中,当用于所指示的镇痛作用时,用于患者的本公开的化合物的口服、静脉内、脑室内和皮下剂量将在每天每千克受体(患者、哺乳动物)体重约0.0001至约100mg,更通常0.1至100mg/kg范围内。可接受的日剂量可以是约1至约1000毫克/天且例如约1至约100毫克/天。

本公开的化合物的有效剂量可以两个、三个、四个、五个、六个或更多个单独给予的子剂量形式,在指定周期内以适当间隔(每天或每周或每个月)给予(任选地,以单位剂型形式)。在一些实施例中,剂量还视如上文所指示的因素(例如,给药)而定且可以由医学或药剂学领域的技术人员容易地实现。

本公开的化合物抑制或调节受体酪氨酸激酶,尤其ErbB受体的细胞外突变体(如(但不限于)EGFR-Viii(也称为EGFR-V3)和HER2-S310F)的活性。因此,本公开的化合物和组合物适用作药剂,即用作疗法中的药剂(例如,用于治疗癌症)。因此,在另一方面中,本公开提供用于治疗罹患癌症的哺乳动物,例如人类的方法。术语“治疗”意图涵盖预防、疗法和治愈。这类治疗包含向所述哺乳动物,例如人类给予治疗有效量的式I化合物或其盐(或含有式I化合物或其盐的医药组合物)的步骤。

在一些实施例中,本公开涉及本公开的化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体或其医药组合物的用途,其是用于治疗哺乳动物,例如人类中的癌症。

个体的这类使用(或治疗方法)包含通过靶向EGFR和HER-2受体的变构和/或致癌变体来向需要这类治疗的个体给予治疗有效量的本公开的化合物或其医药学上可接受的盐或其医药组合物。

本公开涵盖本公开的化合物(单独或与一种或多种其它治疗剂,如其它酪氨酸激酶抑制剂组合)的给药:盐酸埃罗替尼(Erlotinib hydrochloride)(例如特罗凯(Tarceva(R)),Genentech/Roche)、利尼法尼(Linifanib)(或ABT 869,Genentech)、苹果酸舒尼替尼(sunitinib malate)(例如舒癌特(Sutent(R)),Pfizer)、伯舒替尼(bosutinib)(或SKI-606,描述于US 6,780,996中)、达沙替尼(dasatinib)(例如斯普塞尔(Sprycel(R)),Bristol-Myers Squibb)、阿玛拉(armala)(例如帕唑帕尼(pazopanib),例如维曲特(Votrient(R)),GlaxoSmithKline)、伊马替尼(imatinib)和甲磺酸伊马替尼(例如吉列卫(Gilvec(R))和格列卫(Gleevec(R)),Novartis);血管内皮生长因子(VEG)受体抑制剂(贝伐珠单抗(Bevacizumab),或阿瓦斯汀(Avastin(R)),Genentech/Roche)、阿西替尼(axitinib)(或AG013736,描述于WO01/002369中)、丙氨酸布立尼布(Brivanib Alaninate)(或BMS-582664)、莫替沙尼(motesanib)(或AMG-706,描述于PCT WO 02/066470中)、帕瑞肽(pasireotide)(例如SOM230,描述于WO 02/010192中)、索拉非尼(sorafenib)(例如多吉美(Nexavar(R)));HER2受体抑制剂:曲妥珠单抗(Trastuzumab)(例如赫赛汀(Herceptin(R)),Genentech/Roche)、来那替尼(neratinib)(或HKI-272,描述于WO 05/028443中)、拉帕替尼(lapatinib)或二甲苯磺酸拉帕替尼(例如泰克泊(Tykerb(R)),GlaxoSmithKline);CD20抗体:利妥昔单抗(Rituximab)(例如瑞可安(Riuxan(R))和玛瑟拉(MabThera(R)),Genentech/Roche)、托西莫单抗(tositumomab)(例如百克沙(Bexxar(R)),GlaxoSmithKline)、阿图木单抗(atumumab)(例如阿瑞拉(阿瑞拉(R)),GlaxoSmithKline);Bcr/Abl激酶抑制剂:盐酸尼罗替尼(nilotinib hydrochloride)(例如塔西纳(Tasigna(R)),Novartis);DNA合成抑制剂:卡培他滨(Capecitabine)(例如希罗达(Xeloda(R)),Roche)、盐酸吉西他滨(gemcitabine hydrochloride)(例如健择(Gemzar(R)),Eli Lillyand Company)、奈拉滨(nelarabine)(或阿拉隆(Arranon(R))和阿特斯(Atriance(R)),GlaxoSmithKline);抗肿瘤剂:奥沙利铂(oxaliplatin)(例如艾洛汀(Eloxatin(R)),aySanofi-Aventis,描述于US 4,169,846中);表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂:吉非替尼(Gefitinib)(或易瑞沙(Iressa(R)))、阿法替尼(Afatinib)(或托沃克(Tovok(R)),Boehringer Ingelheim)、西妥昔单抗(cetuximab)(例如爱必妥(Erbitux(R)),Bristol-Myers Squibb)、帕尼单抗(panitumumab)(例如,维克替比(Vectibix(R)),Amgen);HER二聚抑制剂:帕妥珠单抗(Pertuzumab)(例如奥密塔克(Omnitarg(R)),Genentech);人类粒细胞集落刺激因子(G-CSF)调节剂:非格司亭(Filgrastim)(例如雷普根(Neupogen(R)),Amgen);免疫调节剂:阿夫土珠(Afutuzumab)(罗奇(Roche(R))、乙二醇化非格司亭(pegfilgrastim)(例如尼拉斯塔(Neulasta(R)),Amgen)、来那度胺(lenalidomide)(例如CC-5013,例如雷利米得(Revlimid(R)))、沙力度胺(thalidomide)(例如撒利多迈(Thalomid(R)));(m)CD40抑制剂:达西珠单抗(Dacetuzumab)(例如SGN-40或huS2C6,Seattle Genetics,Inc);促凋亡受体促效剂(PARA):杜拉明(Dulanermin)(例如AMG-951,Amgen/Genentech);刺猬拮抗剂(Hedgehog antagonist):维莫德吉(Vismodegib)(或GDC-0449,描述于WO 06/028958中);PI3K抑制剂:匹替利司(Pictilisib)(或GDC-0941,描述于WO 09/036082和WO 09/055730中)、达妥昔布(Dactolisib)(或BEZ 235或NVP-BEZ 235,描述于WO06/122806中);磷脂酶A2抑制剂:阿那格雷(Anagrelide)(例如阿格林(Agrylin(R)));BCL-2抑制剂:那维克拉(Navitoclax)(或ABT-263,描述于WO 09/155386中);丝裂原活化蛋白质激酶激酶(MEK)抑制剂:XL-518(Cas第1029872-29-4号,ACC Corp.);芳香酶抑制剂:依西美坦(Exemestane)(例如阿诺新(Aromasin(R)),Pfizer)、来曲唑(letrozole)(例如富马乐(Femara(R)),Novartis)、阿那曲唑(anastrozole)(例如阿纳托唑(Arimidex(R)));拓扑异构酶I抑制剂:伊立替康(Irinotecan)(例如坎普土沙(Camptosar(R)),Pfizer)、盐酸拓扑替康(topotecan hydrochloride)(例如和美新(Hycamtin(R)),GlaxoSmithKline);拓扑异构酶II抑制剂:依托泊苷(etoposide)(例如VP-16和磷酸依托泊苷,例如托泊沙(Toposar(R))、维派德(VePesid(R))和艾托普斯(Etopophos(R)))、替尼泊苷(teniposide)(例如VM-26,例如沃莫恩(Vumon(R)));mTOR抑制剂:坦罗莫司(Temsirolimus)(例如托瑞斯(Torisel(R)),Pfizer)、地磷莫司(ridaforolimus)(正式称为迪佛利斯(deferolimus)(或AP23573和MK8669,描述于WO 03/064383中)、依维莫司(everolimus)(例如阿飞尼妥(Afinitor(R)),Novartis);破骨细胞骨骼再吸收抑制剂:唑来膦酸(zoledronic acid)(或唑米他(Zometa(R)),Novartis);CD33抗体药物结合物:吉妥珠单抗奥唑米星(Gemtuzumab ozogamicin)(例如麦罗塔(Mylotarg(R)),Pfizer/Wyeth);CD22抗体药物结合物:伊珠单抗奥唑米星(Inotuzumab ozogamicin)(也称为CMC-544和WAY-207294,Hangzhou Sage Chemical Co.,Ltd.);CD20抗体药物结合物:替伊莫单抗替歇坦(Ibritumomab tiuxetan)(例如泽瓦林(Zevalin(R));索马托司汀(Somatostain)类似物:奥曲肽(octreotide)(例如乙酸奥曲肽,例如桑多司汀(Sandostatin(R))和桑多司汀LAR(R));合成白细胞介素-11(IL-11):奥普瑞白介素(oprelvekin)(例如纽美加(Neumega(R),Pfizer/Wyeth);合成红细胞生成素:达贝泊汀α(Darbepoetin alfa)(例如阿尼斯普(Aranesp(R)),Amgen);核因子κB受体活化因子(RANK)抑制剂:地诺单抗(Denosumab)(例如保骼丽(Prolia(R)),Amgen);血小板生成素模拟肽体:罗米司亭(Romiplostim)(例如奈普雷特(Nplate(R)),Amgen);细胞生长刺激剂:帕利夫明(Palifermin)(例如凯匹斯(Kepivance(R)),Amgen);抗胰岛素样生长因子-1受体(IGF-1R)抗体:非吉单抗(Figitumumab)(例如CP-751,871,ACC Corp)、罗妥木单抗(robatumumab)(CAS第934235-44-6号);抗CS1抗体:埃罗妥珠单抗(Elotuzumab)(HuLuc63,CAS第915296-00-3号;CD52抗体:阿仑单抗(Alemtuzumab)(例如坎帕斯(Campath(R)));CTLA-4抑制剂:曲美木单抗(Tremelimumab)(IgG2单克隆抗体,Pfizer,原名为替西木单抗(ticilimumab),CP-675,206)、伊派利单抗(ipilimumab)(CTLA-4抗体,例如MDX-010,CAS第477202-00-9号);组蛋白脱乙酰基酶抑制剂(HDI):沃尼斯塔(Voninostat)(例如佐林扎(Zolinza(R)),Merck);烷基化剂:替莫唑胺(Temozolomide)(例如特莫多(Temodar(R))和特莫达尔(Temodal(R)),Schering-Plough/Merck)、放线菌素D(例如放射菌素-D和例如科斯金(Cosmegen(R)))、美法仑(melphalan)(例如L-PAM、L-溶肉瘤素和苯丙氨酸氮芥(phenylalanine mustard),例如爱克兰(Alkeran(R)))、六甲蜜胺(altretamine)(例如六甲三聚氰胺(hexamethylmelamine)(HMM),例如海克伦(Hexalen(R)))、卡莫司汀(carmustine)(例如BiCNU(R))、苯达莫司汀(bendamustine)(例如特瑞达(Treanda(R)))、白消安(busulfan)(例如布非克斯(Busulfex(R))和马利兰(Myleran(R)))、卡铂(carboplatin)(例如铂尔定(Paraplatin(R))、洛莫司汀(lomustine)(例如CCNU,例如CeeNU(R))、顺铂(cisplatin)(例如CDDP,例如普拉迪诺(Platinol(R))和普拉迪诺(R)-AQ)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)(例如瘤可宁(Leukeran(R)))、环磷酰胺(例如环磷氮介(Cytoxan(R))和尼欧萨(Neosar(R)))、达卡巴嗪(dacarbazine)(例如DTIC、DIC和咪唑甲酰胺,例如DTIC-Dome(R))、六甲蜜胺(例如六甲三聚氰胺(HMM),例如海克伦)、异环磷酰胺(例如艾菲克斯(Ifex(R)))、丙卡巴肼(procarbazine)(例如甲苯肼(Matulane(R))、二氯甲基二乙胺(例如氮芥(nitrogenmustard)、氮芥(mustine)和盐酸二氯甲基二乙胺,例如木斯塔根(Mustargen(R)))、链脲霉素(streptozocin)(例如扎诺沙(Zanosar(R)))、噻替派(thiotepa)(例如硫代磷酰胺、TESPA和TSPA,例如噻利斯(Thioplex(R));生物反应调节剂:卡介苗(bacillus calmette-guerin)(例如theraCys(R)和TICE(R)BCG)地尼介白素迪夫托斯(denileukin diftitox)(例如恩塔克(Ontak(R)));抗肿瘤抗生素:小红莓(doxorubicin)(例如阿德力霉素(Adriamycin(R))和鲁贝克斯(Rubex(R))、博莱霉素(bleomycin)(例如利洛安(lenoxane(R)))、道诺霉素(daunorubicin)(例如盐酸道诺霉素、柔红霉素(daunomycin)和盐酸红比霉素(rubidomycin hydrochloride),例如柔红霉素(Cerubidine(R))、道诺霉素脂质(柠檬酸道诺霉素脂质体,例如道诺米(DaunoXome(R)))、米托蒽醌(mitoxantrone)(例如DHAD,例如诺安托(Novantrone(R)))、表柔比星(epirubicin)(例如Ellence

生物学分析法

在产生通过上文所描述的方法设计、选择和/或优化的化合物后,就可以使用所属领域的技术人员已知用于确定化合物是否具有生物活性的各种分析法来表征。举例来说,可以通过用于测定分子是否具有所预测的活性、结合活性和/或结合特异性的常规分析法来表征分子,所述分析法包括(但不限于)下文所描述的分析法。

在一些实施例中,高通量筛检可以用于提高使用这类分析法的分析的速度。因此,可能可以使用所属领域中已知的技术针对活性来快速地筛选本文中所描述的分子。用于进行高通量筛检的一般方法描述于例如Devlin(1998)《高通量筛检(High ThroughputScreening)》,Marcel Dekker;和美国专利案第5,763,263号中。高通量分析法可以使用一种或多种不同的分析法技术,包括(但不限于)下文所描述的技术。

各种活体外或活体内生物学分析法可以适用于检测本公开的化合物的作用。这些活体外或活体内生物学分析法可以包括(但不限于)酶活性分析法、电泳迁移率偏移分析法、报告基因分析法、活体外细胞活力分析法和本文中所描述的分析法。

强效抑制

本公开的化合物和组合物是EGFR的一种或多种致癌变体的强效抑制剂。或者或另外,本公开的化合物和组合物是野生型HER-2受体或HER-2受体的致癌变体中的一种或多种的强效抑制剂。在一些实施例中,HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体。

表A和B指定各种化合物A的效能代码:A、B、C、D、E、F、G、H、I、J或K。根据所述代码,A表示IC50值≤5nM。B表示IC50值>5nM且≤10nM。C表示IC50值>10nM且≤20nM。D表示IC50值>20nM和≤30nM。E表示IC50值>30nM且≤50nM。F表示IC50值>50nM且≤100nM。G表示IC50值>100nM且≤200nM。H表示IC50>200nM且≤300nM。I表示IC50值>300nM且≤500nM。J表示IC50值>500nM且≤1000nM。K表示IC50值>1000nM。

表A:用于抑制EGFR的活性

表B:用于抑制HER2的活性

在一些实施例中,化合物能够抑制突变型EGFR(例如EGFR-Viii、EGFR-NPH或EGFR-SVD)。

在一些实施例中,对于抑制突变型EGFR(例如EGFR-Viii、EGFR-NPH或EGFR-SVD),化合物呈现以下IC

在一些实施例中,对于抑制EGFR-Viii,化合物呈现约100nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制EGFR-Viii,化合物呈现约50nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制EGFR-Viii,化合物呈现约30nM或更低的IC

在一些实施例中,与野生型EGFR相比,化合物对突变型EGFR(例如EGFR-Viii、EGFR-NPH或EGFR-SVD)呈现更大的抑制。

在一些实施例中,与野生型EGFR相比,化合物对突变型EGFR(例如EGFR-Viii、EGFR-NPH或EGFR-SVD)呈现至少约2倍、约3倍、约5倍、约10倍、约20倍、约30倍、约50倍或约100倍更大的抑制。

在一些实施例中,与野生型EGFR相比,化合物对EGFR-Viii呈现至少约5倍更大的抑制。在一些实施例中,化合物是选自由以下组成的组:1、2、3、4、8、9和10,或其医药学上可接受的盐和立体异构体。

在一些实施例中,与野生型EGFR相比,化合物对EGFR-Viii呈现至少约10倍更大的抑制。在一些实施例中,化合物是选自由以下组成的组:1、2、3、4和9,或其医药学上可接受的盐和立体异构体。

在一些实施例中,与野生型EGFR相比,化合物对EGFR-Viii呈现至少约20倍更大的抑制。在一些实施例中,化合物是选自由以下组成的组:2和4,或其医药学上可接受的盐和立体异构体。

在一些实施例中,化合物能够抑制野生型HER2或突变型HER2(例如HER2-S310F或HER2-YVMA)。

在一些实施例中,对于抑制野生型HER2或突变型HER2(例如HER2-S310F或HER2-YVMA),化合物呈现约100nM或更低、约80nM或更低、约60nM或更低、约50nM或更低、约40nM或更低、约30nM或更低、约20nM或更低、约10nM或更低或约5nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制野生型HER2,化合物呈现约100nM或更低、约80nM或更低、约60nM或更低、约50nM或更低、约40nM或更低、约30nM或更低、约20nM或更低、约10nM或更低或约5nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制野生型HER2,化合物呈现约20nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制野生型HER2,化合物呈现约10nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制野生型HER2,化合物呈现约6nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制突变型HER2(例如HER2-S310F或HER2-YVMA),化合物呈现约100nM或更低、约80nM或更低、约60nM或更低、约50nM或更低、约40nM或更低、约30nM或更低、约20nM或更低、约10nM或更低或约5nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制HER2-S310F,化合物呈现约50nM或更低的IC

在一些实施例中,对于抑制HER2-S310F,化合物呈现约20nM或更低的IC

矛盾ErbB受体活化

提供神经胶母细胞瘤(GBM)中EGFR变体的发生率作为实例,但本文中所描述的机制适用于表达本公开的这些EGFR变体的任何形式的癌症。其它表达本公开的EGFR变体的癌症包括(但不限于)实体癌症、上皮癌和/或上皮源性癌症、膀胱癌、乳癌、子宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、胃癌、神经胶母细胞瘤(GBM)、头颈癌、肺癌和非小细胞肺癌(NSCLC)。

在GBM肿瘤中,EGFR通常是基因组突变和引起细胞外二聚体界面变化的替代性剪接事件的目标。许多肿瘤表达超过一种异常同功异型物。本公开提供用于最常存在的变体的活化机制,所述变体是EGFR-Viii、EGFR-Vii、EGFR-Vvi和EGFR-A289V。尽管每种同功异型物是不同胞外域变化的结果,但全部是由涉及非共价配体依赖性二聚作用的通用机制活化。

AMG-595(Amgen)是EGFR-Viii同功异型物选择性抗体,其不具有针对野生型EGFR或其它剪接活化变体的活性。瑞多匹特(Celldex)是一种疫苗,其产生选择性地针对表达EGFR-Viii但非野生型EGFR或其它剪接活化同功异型物的肿瘤细胞的免疫反应。GBM肿瘤中表达的其它EGFR同功异型物(EGFR-Vii和EGFR-Vvi)是组成性活性共价受体且其表达可能限制仅对EGFR-Viii具有选择性的ErbB抑制剂的治疗益处的广度和持续时间。因此,其可能适用于将具有表达EGFR-Vii、EGFR-Vvi或EGFR胞外域点突变体的肿瘤的患者从用EGFR-Viii选择性疗法进行的治疗排除。

肿瘤中ErbB受体的多个胞外域变体的异源表达模式表明抑制所有变体的小分子抑制剂是优选的。与在NSCLC中观察到的EGFR催化域突变相比,共价活化EGFR同功异型物家族对小分子ErbB抑制剂的反应相差极大。重要的是,I型抑制剂,包括埃罗替尼,都诱导共价EGFR二聚体的形成且在亚饱和浓度下增加EGFR磷酸化,一种在洗去ErbB抑制剂时进一步增强的活性。这表现在亚饱和浓度下增殖的矛盾活化中。

对于在多种癌症(包括乳房和膀胱)中流行的HER2的一系列细胞外变体,进一步证明对亚饱和浓度的I型抑制剂下的增殖的矛盾活化的研究。所有变体都是以共价活化受体形式存在,且共价二聚体的水平在用I型抑制剂(包括沙皮替尼和阿法替尼)进行的治疗后增加。与共价活化EGFR变体相同,亚饱和剂量的I型抑制剂矛盾地增加HER2变体的磷酸化,增加表达其的细胞的增殖。

与I型抑制剂不同,本公开证明非I型(例如II型)抑制剂,包括来那替尼,不引起表达ErbB胞外域变体的细胞的矛盾活化。发现来那替尼可以作为与野生型EGFR相比,对共价活化EGFR家族中的每个成员都具有效能和选择性的分子的实例。

在一些实施例中,本公开提供一种结构/功能关系,其用于预测影响活性位点远端的受体区域的结构变化如何赋予对小分子活性位点抑制剂的引人注目的不同反应。本文中所描述的由I型抑制剂引起的共价活化ErbB受体变体的矛盾活化的公开内容具有重要的临床意义。本公开的数据提供在出现共价活化ErbB受体的表达的肿瘤类型中,不合格的I型抑制剂的临床研究的机制说明。这包括GBM肿瘤中的埃罗替尼和吉非替尼、SCCHN肿瘤中的埃罗替尼以及乳房肿瘤中的沙皮替尼。在一些实施例中,本公开提供使用共价活化ErbB受体的肿瘤表达水平作为用I型ErbB受体抑制剂治疗剂治疗患者的排除准则的方法。

神经胶母细胞瘤

神经胶母细胞瘤(GBM),IV级星形细胞瘤,是最常见的脑癌形式。这种疾病的结果不太乐观。在手术之后进行放射和替莫唑胺的治疗方案是护理标准,但是这产生仅14.6个月的中值总存活率(OS)且极少有患者存活达到五年。在过去十年中,在延长GBM患者的存活期方面极少有进展。尽管贝伐珠单抗在复发性环境中展示改善的无进展存活率益处,但在一线环境中,在护理标准疗法中增加贝伐珠单抗并未产生OS益处。

EGFR是GBM中最常改变的致癌基因。除EGFR基因扩增以外,许多肿瘤表达由异常剪接或基因组突变产生的变体。首先发现的变体是EGFR-Viii,由外显子2-7的截短产生且由约30%的GBM肿瘤表达。EGFR-Viii是致癌的。EGFR-Viii在不存在EGF配体的情况下组成性活化,呈现对下调具有抗性的持续信号传导。因此,EGFR-Viii是转化和致瘤的。EGFR-Viii的表达与GBM中的不良的长期总存活率相关联。

RNA测序数据表明EGFR-Viii仅是GBM肿瘤中表达的EGFR的若干异常剪接变体中的一种。另外两种引起外显子12-13和14-15(EGFR-Vii)的截短。与EGFR-Viii类似,EGFR-Vii是转化和致瘤的。除剪接变体以外,GBM肿瘤还表达EGFR点突变的集合,包括C620Y和A289V,其是转化和致瘤的。GBM中EGFR变化的复杂格局由于许多肿瘤表达超过一种受体变体的观察结果而进一步复杂化。

因为GBM中许多EGFR变体的表达引起转化和致瘤活性且因为EGFR是GBM肿瘤中最常改变的致癌基因,EGFR是小分子ErbB抑制剂的尤其有吸引力的目标。在针对具有EGFR中的活化突变的NSCLC肿瘤的小分子EGFR治疗剂(埃罗替尼、吉非替尼和阿法替尼)取得成功之后,在GBM中测试这些药物。尽管在GBM中对这一组ErbB抑制剂进行了密集的临床研究,涉及>30项临床试验和>1500名患者,但都未能产生任何益处,即使对于表达EGFR-Viii的肿瘤也是如此。一些证据表明埃罗替尼促进疾病进展。与接受单独的放射和替莫唑胺的患者的6.9个月和14.6个月相比,评估埃罗替尼与放射和替莫唑胺的组合的2期研究展示2.8个月和8.6个月的中值PFS(mPFS)和中值OS(mOS)。另一项用埃罗替尼进行的随机化II期试验证实与接受护理标准疗法的患者相比,接受埃罗替尼的患者(包括肿瘤表达EGFR-Viii的患者)在多种参数方面表现得更差。GBM肿瘤中ErbB抑制剂(如埃罗替尼)的临床不合格使人怀疑EGFR作为GBM中的肿瘤生长的驱动因素的作用,且引起探寻为何在治疗肺癌中的EGFR突变方面如此有效的ErbB抑制剂在治疗GBM中的EGFR变体方面如此无效。

GBM中表达的EGFR变体的区别性特征是其在胞外域内的位置。这与在肺癌中发现的通常存在于细胞内催化域中的EGFR的活化突变不同。EGFR由四个胞外域(两个配体结合域和两个富含半胱氨酸的区域)、一个跨膜域和一个胞内催化域构成。配体结合促进胞外富含半胱氨酸的结构域(CR1和CR2)的二聚作用,一种引起胞内域的二聚作用和受体催化活性的活化的事件。几乎所有EGFR剪接事件和GBM中的突变都会影响胞外区(例如,形成胞外二聚体界面的两个富含半胱氨酸的区域(CR1和CR2))。CR区域含有>40个半胱氨酸残基,其都形成分子内二硫键。在EGFR-Viii中,外显子2-7的截短引起编码CR1区域的序列的部分损失。结果是损失Cys295-Cys307对中的一个半胱氨酸,留下呈游离的不成对的半胱氨酸形式的Cys307。对于EGFR-Viii,此半胱氨酸可以与另一EGFR单体形成分子间二硫键,以驱动共价二聚化和组成性活化受体。半胱氨酸307突变成丝氨酸(C307S)可以防止形成共价二聚化EGFR-Viii且是非活性的。

尽管若干当前的临床前研究提出EGFR激酶抑制剂(如埃罗替尼)在抑制EGFR-Viii方面完全无效,但未提出此作用的机制。当前还缺乏对负责GBM中的其它胞外域变体(包括EGFR-Vii和EGFR-A289V)的活化的机制的理解。本公开提供GBM中四种最常见的胞外域变体(EGFR-Viii、EGFR-Vii、EGFR-δ12-13和EGFR-A289V)的群组的受体活化机制和对ErbB抑制剂活性的影响。

本公开证明,与EGFR-Viii类似,GBM中的另一组共同存在的EGFR变体(EGFR-Vii、EGFR-Vvi和EGFR-A289V)都以组成性活性共价二聚体形式存在且共同形成由此通用机制活化的EGFR同功异型物家族。此外,本公开证实这些变体的共价二聚合的倾向与胞内催化位点的构象相关,赋予结合于此远端位点的类别的小分子抑制剂不同的活性。对于所有共价活化EGFR同功异型物,使激酶的活性构象稳定的抑制剂(I型抑制剂,包括埃罗替尼)诱导共价二聚体的形成。这与I型抑制剂在亚饱和浓度下增加EGFR磷酸化且矛盾地刺激表达共价活化EGFR同功异型物的细胞的增殖的倾向相关联。

在使非活性激酶构象稳定的小分子抑制剂(II型抑制剂,包括拉帕替尼和来那替尼)情况下未发现EGFR的增强的二聚作用或矛盾活化。鉴别II型抑制剂的实例,其是共价活化EGFR同功异型物的强效抑制剂且与WT-EGFR相比,其对此家族具有选择性。

与关于EGFR鉴别的突变类似,本公开鉴别影响HER2和HER4的CR域的一组剪接事件和突变。本公开证明影响HER2和HER4的CR域的此组剪接事件和突变是以共价二聚体形式存在且由具有I型结合模式的试剂矛盾活化。这些数据提供多项涉及I型抑制剂的临床试验(包括GBM中I型ErbB抑制剂的>30项临床试验)的不合格的机制说明。总之,这些数据表明,由于矛盾活化,应从用I型ErbB抑制剂(如埃罗替尼)进行的治疗排除表达共价活化EGFR同功异型物的肿瘤。这些数据进一步证明针对共价活化ErbB家族优化II型ErbB抑制剂的效用。

使用I型ErbB抑制剂的临床试验

在一些实施例中,本公开的方法鉴别在个体的一种或多种癌细胞或癌细胞类型中表达ErbB家族受体变体的个体。鉴定个体具有本公开的变体可以用作用于评估现有或新颖的癌症治疗的功效的临床试验或认可的治疗方案的纳入或排除准则。

在一些实施例中,本公开的方法可以用于从评估本公开的I型抑制剂的安全性和/或功效的临床试验排除表达一种或多种本公开的ErbB变体的患者。本公开的ErbB变体在与I型抑制剂接触时矛盾地活化,引起癌细胞的增殖增加。在过去和正在进行的临床试验中,用于这些研究的患者群体未针对本公开的ErbB变体的表达进行筛选。因此,由于与用于治疗癌症的标准治疗或安慰剂相比未能展示增加的功效而在临床试验中“不合格”的本公开的I型抑制剂可能实际上是有效的,但是结果可能由于纳入表达本公开的ErbB变体的患者而被混淆。因为当用I型抑制剂治疗时,表达本公开的ErbB变体的患者可能显示增加的癌细胞增殖且因此,显示缺乏癌症的改善或甚至显示癌症的进一步进展,这些患者可能阻止批准可以挽救不表达本公开的ErbB受体变体的患者的癌症治疗剂。在一些实施例中,本公开的方法包括鉴别表达本公开的ErbB受体变体的个体且将此患者从用I型抑制剂进行的治疗排除。在一些实施例中,可以用包括II型抑制剂的非I型抑制剂来成功地治疗表达本公开的ErbB受体变体的患者。

在一些实施例中,当鉴别表达本公开的ErbB受体变体的患者仅表达EGFR-Viii剪接变体时,患者可以用EGFR-Viii选择性抑制剂来治疗且可以包括在EGFR-Viii选择性抑制剂的临床试验中。在本公开的方法的一些实施例中,患者应仅表达由EGFR-Viii选择性抑制剂治疗的EGFR-Viii剪接变体。在一些实施例中,如果患者表达多种变体,包括EGFR-Viii变体,引起所表达的变体的组合,那么应将患者从用EGFR-Viii选择性抑制剂进行的治疗排除,然而,可以用非I型选择性抑制剂(例如II型抑制剂)成功地治疗此患者。

在一些实施例中,如果选择性抑制剂靶向本公开的ErbB受体变体中的任一种或多种,那么鉴别患者中剪接变体的表达可以用作提供所述选择性抑制剂的临床研究或治疗方案的纳入准则。

表1提供研究中包括的当在表达共价活化ErbB受体的肿瘤类型中“不合格”的I型抑制剂的例示性临床试验的列表。在一些实施例中,本公开提供针对一种或多种本公开的共价活化ErbB受体变体来筛检或再筛检临床试验的参与者的方法。在一些实施例中,本公开的方法包括用I型抑制剂治疗不表达本公开的一种或多种共价活化ErbB受体变体的患者作为首次或后续尝试,以确定I型抑制剂在不表达本公开的一种或多种共价活化ErbB受体变体的肿瘤类型或患者中的功效。在一些实施例中,可以用本公开的非I型抑制剂(包括II型抑制剂)来治疗从用I型抑制剂进行的首次或后续治疗排除的患者。

表1:在出现共价活化ErbB受体的表达水平的肿瘤类型中不合格的I型抑制剂的临床试验的列表。

表2提供本公开的例示性ErbB抑制剂的列表。在一些实施例中,本公开的方法可以包括鉴别或确定本公开的ErbB受体的表达以作为给予I型抑制剂的治疗或临床试验的排除准则,或作为给予非I型(例如II型)抑制剂或NT-113I型抑制剂的治疗或临床试验的纳入准则。

表2:例示性ErbB抑制剂

*本公开的I型抑制剂的特征在于其激酶抑制模式,所述模式由抑制剂靶向活性构象中的ATP结合位点以竞争性抑制ATP结合的能力描述。已经描述关键结构元件,包括特定疏水性残基的比对。

**非活性激酶的抑制剂以破坏活性构象的关键结构元件(包括特定疏水性残基)的方式结合于目标。这些非I型抑制剂与I型抑制剂的差别在于其以防止目标采用活性ATP结合构象的方式来与目标相互作用。本公开的非I型抑制剂包括(但不限于)II型抑制剂。此表中不是I型抑制剂的抑制剂是II型抑制剂。

由共价活化ErbB肿瘤蛋白驱动的细胞中由1型抑制剂进行的增殖的矛盾刺激

尽管由神经胶母细胞瘤的诊断和治疗中的EGFR变体的实例说明,但本公开的方法可以包括任何表达这些变体的癌症中的ErbB受体变体(例如EGFR和HER2变体)。这些变体的例示性集合提供于表3中。

表3:例示性共价ErbB肿瘤蛋白

关于EGFR和神经胶母细胞瘤,164个GBM肿瘤的RNA测序揭示EGFR的多个胞外域变体的异源表达。异常剪接(单独或与基因组重排一致)产生EGFR-Viii(外显子2-7的损失)、EGFR-Vii(外显子14-15的损失)和EGFR-Vvi(外显子12-13的损失),表4。

表4

发生率是基于表达水平>1%,如由TCGA数据集报告(Brennan等人(2013)《细胞(Cell)》155(2):462-477)。

所有三种胞外域变体都影响CR1或CR2区域且引起编码胞外二聚体界面处的序列的外显子的损失。还在GBM肿瘤中发现一系列大于20个基因组突变,其还映射到二聚体界面处的CR1和CR2区域(参见例如图1和表5)。

表5

其中最常见的影响A289,其中A289V最普遍。EGFR-Viii被20%的肿瘤表达,Vii被3%的肿瘤表达且Vvi被32%的肿瘤表达。在40%的肿瘤中观察到胞外区内的突变,且在16%的肿瘤的位置A289处观察到突变。在65%的GBM肿瘤中观察到至少一种变体的表达(图2)。许多肿瘤表达多种变体。这由TCGA.878例示,一种表达EGFR-Viii、A289T、A289V和A289D的GBM肿瘤(图2)。69%的表达EGFR-Viii的肿瘤还共同表达EGFR的至少一种其它胞外域变体,且若干肿瘤共同表达所有三种胞外域变体。仅6%的GBM肿瘤单独地表达EGFR-Viii。GBM中EGFR的表达倾向于与其它RTK致癌基因的表达相互排斥,所述其它RTK致癌基因在仅7%的GBM肿瘤与EGFR变体共同表达。总之,这些数据说明与其它致癌驱动基因相比,GBM中的EGFR变化如何具有显性和相互排斥的表达模式。

已证实影响胞外配体结合域的剪接事件和突变是转化的和致瘤的。本公开的数据证实EGFR-Viii、EGFR-Vii和EGFR-A289V的转化特性。当在BaF3细胞中表达时,所有被转化的细胞在不存在IL-3的情况下增殖(图3)。

野生型EGFR的胞外域的x射线结构揭示CR1和CR2区域处的二聚体界面内的21个分子内二硫键。CR1和CR2区域处的二聚体界面内的例示性二硫键可以存在于根据SEQ ID NO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636的一个或多个区域处。HER-2受体的CR1和CR2区域处的二聚体界面内的例示性二硫键可以存在于以下的一个或多个区域处:C199-C212、C220-C227、C224-C235、C236-C244、C240-C252、C255-C264、C268-C295、C299-C311、C315-C331、C334-C338、C342-C367、C511-C520、C531-C540、C544-C560、C563-C576、C567-C584、C587-C596、C600-C623、C626-C634和C630-C642。

这是所有ErbB受体的共同特征。EGFR的CR1区域中的11个分子内二硫键中的一个是由Cys295-Cys307形成,其在EGFR-Viii中断裂。编码一部分CR1区域的序列的损失消除Cys295,留下游离Cys307以与另一个EGFR-Viii单体形成分子间二硫键(图4)。突变Cys307-Ser阻止形成共价EGFR-Viii二聚体且呈现降低的活体内致肿瘤性。

EGFR-Vvi和EGFR-Vii的由截短引起的序列损失的检验揭示CR2胞外域二聚体界面处的分子内二硫键将断裂。EGFR-Vvi中的外显子14-15的损失将引起Cys539-Cys555键的断裂,留下呈游离半胱氨酸形式的Cys555,且EGFR-Vii中的外显子14-15的损失将引起Cys539-Cys555、Cys620-Cys628和Cys624-Cys636键的断裂,留下呈游离半胱氨酸形式的Cys555、Cys628和Cys636。Cys555、Cys628和Cys636都在二聚界面的CR2区域中,图4。在这些位点处产生的游离半胱氨酸可以赋予受体形成共价二聚体的潜力,如关于EGFR-Viii所证明。

大部分点突变可以在富含半胱氨酸的区域CR1和CR2中且还可以影响胞外域二聚体界面处的二硫键(图1)。一些点突变将新的半胱氨酸引入CR1区域(例如,R252C)。其它突变直接影响形成野生型EGFR的CR2区域中的分子内二硫键的半胱氨酸(例如,C624F),且已证实其中一些在存在EGF配体的情况下促进共价二聚化受体。许多其它突变不直接影响胞外域内的半胱氨酸组成,但定位于紧邻二聚体界面处的原生分子内二硫键,且提供破坏这些结构的潜力。已证实与FGFR2的第三Ig样域中的二硫键相邻的突变会破坏此键且提供共价二聚化和活化受体。A289,GBM中最常见的突变位点,从Cys-295-Cys307键计小于10埃,且此位点处的变化可能破坏此二硫键,引起CR1二聚体界面区域处存在游离半胱氨酸。

EGFR-Vvi、EGFR-Vii和EGFR-A289V的胞外域二聚体界面处存在游离半胱氨酸可能产生共价和组成性活性二聚体,如已关于EGFR-Viii证明。为了测试此假设,在仅内源性表达极低水平的野生型EGFR的U87-MG肿瘤细胞中表达每种受体同功异型物,且在非还原条件下评估EGFR的磷酸化以实现共价二聚化对比单体受体的检测。EGFR-Viii、EGFR-Vii、EGFR-Vvi和EGFR-A289V都以共价和活性受体形式存在(图5)。尽管共价二聚体仅代表总受体水平的较小部分,但大部分磷酸化和活化受体是以共价二聚体形式存在。因此,由基因组变化和异常剪接产生的胞外域内的不同重排都产生由涉及与配体无关的共价二聚作用的通用机制活化的受体。

评估EGF配体调节剪接活化EGFR家族中的每个成员的活性的能力。在EGFR-Viii中,由于由外显子2-7编码的序列的损失,配体结合域已大部分被截短。一致地,添加EGF不会影响U87-MG细胞中表达的单体或共价二聚化EGFR-Viii的磷酸化(图6)。EGFR-Vii和EGFR-Vvi的胞外域截短都在下游发生且影响更靠近跨膜域的CR2区域内的序列。对于这些变体的EGF来说,结合位点都是完整的。与EGFR-Viii不同,EGFR-Vii和EGFR-Vvi都具有针对共价二聚体的组成性基础活性,其可以由EGF进一步增强(图6)。

GBM中EGFR的多重畸变驱动组成性活化的能力指示EGFR是重要的治疗目标。然而,被批准用于治疗NSCLC中的EGFR催化位点突变的ErbB抑制剂都未被证明在治疗GBM方面有效。本公开的实验寻求证实,具有确定的针对NSCLC中表达的致癌性催化突变的临床活性的小分子ErbB抑制剂是否对共价活化EGFR同功异型物中的每一种具有不同的活性。在本文中,数据表明对于所有三种剪接活化EGFR同功异型物和EGFR-A289V,埃罗替尼增强共价二聚体的形成(图7A)。这些作用是剂量依赖性的(图7B)。对于所有I型ErbB抑制剂但非II型抑制剂,观察到埃罗替尼的此诱导共价活化EGFR变体的共价二聚体的能力,且包括具有可逆或共价结合模式的分子(图8和表6)。

表6

此研究扩展到在神经胶母细胞瘤和头颈癌中发现的两种其它剪接变体,EGFR-Δ768和EGFR-Δ660(图9和表7)。两种受体同功异型物都可以共价活化受体形式存在且埃罗替尼诱导两者的共价二聚作用。

表7

关于EGFR-Vii、EGFR-Viii和EGFR-A289V证实,用亚饱和浓度的I型ErbB抑制剂埃罗替尼进行治疗还引起增强的共价活化EGFR变体的磷酸化(图10A)。此外,当用埃罗替尼处理表达EGFR-Vii或EGFR-Vvi的细胞且接着洗涤,接着收集溶解物时,与未被处理的对照细胞相比都展示明显增强的磷酸化,与响应于I型抑制剂的二聚体形成增加一致(图10B)。

为了评估由亚饱和浓度的埃罗替尼引起的增强的EGFR活性对细胞增殖的影响,在BaF3细胞中表达EGFR-Viii、EGFR-Vii和EGFR-A289V以将其转化为非IL-3依赖性。尽管高饱和浓度的埃罗替尼(1μM)抑制BaF3-EGFR-Viii细胞的增殖,但较低的亚饱和浓度(37nM)刺激增殖(图11A)。也在表达EGFR-Vii或EGFR-A2989V的BaF3细胞中发现埃罗替尼对表达共价活化EGFR的细胞的增殖的两相作用,但未在表达致癌性EGFR催化域突变E746-A750的同基因BaF3细胞中发现(图11B),因此表明矛盾活化对共价活化EGFR同功异型物具有特异性。还在共价抑制剂WZ8040、WZ4002和WZ3146情况下发现对表达EGFR-Viii的细胞的增殖的两相作用,表明对具有可逆和共价结合模式的小分子具有此性质(图12)。I型抑制剂在亚饱和药物浓度下矛盾地增强细胞增殖的能力与具有此类型的机制的分子促进共价活化二聚体的形成的能力完全一致。

还在癌症中观察到影响HER2和HER4胞外域的CR1和CR2区域的突变和剪接事件(表8)。其中最常见的是HER2Δ16,在约50%的乳癌中表达,但未在任何正常组织中检测到。HER2Δ16由替代性剪接和外显子16的损失产生,编码胞外近膜区域,产生位于CR2区域中的二聚体界面处的两个游离半胱氨酸残基,Cys626和Cys630(表8)。与HER2-WT相比,HER2Δ16是高度致瘤的。在乳癌患者中,HER2Δ16的表达与更高的淋巴结受累和转移性疾病发生率相关联。

表8

如在EGFR情况下所观察到的,点突变还存在于HER2 CR1区域的二聚体界面处(表8和图13)。一些突变引入新颖的半胱氨酸或去除与分子内二硫键配位的一对半胱氨酸中的一个成员。其它突变(包括HER2-S310F/Y)位于二硫键附近且可以变构方式将其破坏,如在EGFR-A289V情况下所发现。HER2-S310F/Y突变是癌症中最常发生的HER2突变,由>15%的膀胱癌表达。

选择HER2的胞外变体,包括HER2-C311R和HER2Δ16,以共价活化二聚体形式存在。本公开的数据表明,其它共同存在的胞外变体(包括HER2-S310F)也以共价活化受体形式存在(图14)。

与共价活化EGFR变体的观察结果类似,I型抑制剂(沙皮替尼和阿法替尼)诱导HER2胞外变体的共价二聚体的表达(图15A)。这些作用是剂量依赖性的(图15B)。最终,沙皮替尼可以矛盾地刺激由HER2-Δ16驱动的BaF3细胞的增殖(图16)。这些数据可以提供用于治疗表达共价活化ErbB受体的肿瘤的启发性指导,包括I型抑制剂的排除准则和在表达这些变体受体的肿瘤中的II型药效团的治疗方法。

方法

反转录病毒产生:将EGFR突变体亚克隆到pMXs-IRES-杀稻瘟菌素(Blasticidin)(RTV-016,Cell Biolabs,San Diego,CA)中。通过用反转录病毒EGFR突变体表达载体pMXs-IRES-杀稻瘟菌素(RTV-016,Cell Biolabs)、pCMV-Gag-Pol载体和pCMV-VSV-G-包膜载体进行HEK 293T细胞的瞬时转染来产生反转录病毒表达载体反转录病毒。将HEK 293T/17细胞涂布于涂有100mm胶原蛋白的盘(354450,Corning Life Sciences,Tewksbury,MA)中(每盘4×10

EGFR突变体稳定细胞系的产生:通过在1000rpm下离心30分钟,用补充有8μg/mL的聚凝胺的1ml病毒性上清液感染BaF3细胞(1.5E5个细胞)。将细胞置放于37℃培育箱中过夜。接着,将细胞旋转5分钟以使细胞集结。去除上清液且通过在1000rpm下离心30分钟,用补充有8μg/mL的聚凝胺的新鲜的1ml病毒性上清液再感染细胞。将细胞置放于37℃培育箱中过夜。接着,将细胞保持在RPMI中,所述RPMI含有10%的热灭活FBS、2%的含有10ng/ml的IL-3的L-谷氨酰胺。在48小时之后,选择细胞在10μg/mL的杀稻瘟菌素中进行反转录病毒感染保持一周。杀稻瘟菌素抗性群体在磷酸盐缓冲生理盐水中洗涤两次,接着涂布于不含IL-3的培养基中以针对非IL-3依赖性生长进行选择。

细胞增殖分析法:将BaF3细胞系以1.3E5 c/ml再悬浮于RPMI中且一式三份地分配(17.5E4 c/孔)至96孔盘中,所述RPMI含有10%的热灭活FBS、2%的L-谷氨酰胺和1%的Pen/Strep。为了确定药物对细胞增殖的作用,细胞在不同浓度下,在存在媒剂对照物或测试药物的情况下培育3天。使用CellTiterGlo(Promega),根据制造商提供的方案通过胞内ATP含量的发光定量来确定细胞生长的抑制。使用第0天与药物处理后72小时的细胞数量的比较来标绘剂量反应曲线。确定活细胞的数目且针对用媒剂处理的对照物标准化。与用媒剂处理的对照物相比,增殖的抑制表示为1的分数且使用

细胞蛋白质分析:由含有10mM碘乙酰胺(786-228,G-Biosciences,St,Louis,MO)、蛋白酶抑制剂(P8340,Sigma,St.Louis,MO)和磷酸酶抑制剂(P5726,P0044,Sigma,St.Louis,MO)混合物的清洁剂溶解(RIPA,R0278,Sigma,St Louis,MO)来制备细胞提取物。通过微BSA分析法(Pierce,Rockford IL)来确定可溶性蛋白质浓度。通过SDS-PAGE分离的蛋白质到硝化纤维的电泳转移、与抗体一起培育和化学发光第二步骤检测来进行蛋白质免疫检测。用含5%非脂肪乳粉的TBS封阻硝化纤维膜且与一级抗体一起在5%牛血清白蛋白中培育过夜。以下来自Cell Signaling Technology的一级抗体是以1:1000稀释度使用:磷酸-EGFR[Y1173]和总EGFR。用作蛋白质负载的对照物的β-肌动蛋白抗体是购自SigmaChemicals。辣根过氧化酶结合的二级抗体是从Cell Signaling Technology获得且以1:5000稀释度使用。辣根过氧化酶结合的二级抗体在非脂肪中培育1小时。根据制造商指导使用SuperSignal化学发光试剂(Pierce Biotechnology)且使用Alpha Innotech影像分析仪和AlphaEaseFC软件(Alpha Innotech,San Leandro CA)将印迹成像。

化合物和组合物的用途

在一些方面中,本公开涉及用于抑制ErbB受体的致癌变体(例如,EGFR的致癌变体)的方法,其包含向有需要的个体给予治疗有效量的本文中所描述的化合物。

在一些方面中,本公开涉及用于抑制ErbB受体的致癌变体(例如,EGFR的致癌变体)的方法,其包含向有需要的个体给予本文中所描述的组合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含向有需要的个体给予治疗有效量的本文中所描述的化合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含向有需要的个体给予本文中所描述的组合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含:i)当候选个体中存在本文中所描述的ErbB受体的所述至少一种致癌变体时,将所述个体鉴别为需要治疗的个体;和ii)向需要治疗的个体给予治疗有效量的本文中所描述的化合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含:i)当候选个体中存在本文中所描述的ErbB受体的所述至少一种致癌变体时,将所述个体鉴别为需要治疗的个体;和ii)向需要治疗的个体给予本文中所描述的组合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含:i)当来自候选个体的生物样品中存在本文中所描述的ErbB受体的所述至少一种致癌变体时,将所述个体鉴别为需要治疗的个体;和ii)向需要治疗的个体给予治疗有效量的本文中所描述的化合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含:i)当来自候选个体的生物样品中存在本文中所描述的ErbB受体的所述至少一种致癌变体时,将所述个体鉴别为需要治疗的个体;和ii)向需要治疗的个体给予本文中所描述的组合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含当鉴别到个体中存在本文中所描述的ErbB受体的所述至少一种致癌变体时,向有需要的个体给予治疗有效量的本文中所描述的化合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含当鉴别到个体中存在本文中所描述的ErbB受体的所述至少一种致癌变体时,向有需要的个体给予本文中所描述的化合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含当鉴别到来自个体的生物样品中存在本文中所描述的ErbB受体的所述至少一种致癌变体时,向有需要的个体给予治疗有效量的本文中所描述的化合物。

在一些方面中,本公开涉及用于预防或治疗癌症的方法,其包含当鉴别到来自个体的生物样品中存在本文中所描述的ErbB受体的所述至少一种致癌变体时,向有需要的个体给予本文中所描述的组合物。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的化合物,其用于抑制ErbB受体的致癌变体(例如,EGFR的致癌变体)。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的化合物,其用于预防或治疗癌症。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的组合物,其用于抑制ErbB受体的致癌变体(例如,EGFR的致癌变体)。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的组合物,其用于预防或治疗癌症。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的化合物,其用于预防或治疗个体中的癌症,其中所述个体中存在本文中所描述的ErbB受体的至少一种致癌变体。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的组合物,其用于预防或治疗个体中的癌症,其中所述个体中存在本文中所描述的ErbB受体的至少一种致癌变体。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的化合物,其用于预防或治疗个体中的癌症,其中来自所述个体的生物样品中存在本文中所描述的ErbB受体的至少一种致癌变体。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的组合物,其用于预防或治疗个体中的癌症,其中来自所述个体的生物样品中存在本文中所描述的ErbB受体的至少一种致癌变体。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的化合物的用途,其用于制造用以抑制ErbB受体的致癌变体(例如,EGFR的致癌变体)的药剂。

在一些方面中,本公开涉及本文中所描述的化合物的用途,其用于制造用以预防或治疗癌症的药剂。

在一些实施例中,化合物是选自表1中描述的化合物、其医药学上可接受的盐和其立体异构体。

在一些实施例中,化合物是选自表1中描述的化合物和其医药学上可接受的盐。

在一些实施例中,化合物是选自表1中描述的化合物。

在一些实施例中,癌症是实体肿瘤。

在一些实施例中,癌症是膀胱癌、乳癌、子宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、胃癌、神经胶母细胞瘤(GBM)、头颈癌、肺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)或其任何亚型。

在一些实施例中,癌症是神经胶母细胞瘤(GBM)或其任何亚型。

在一些实施例中,癌症是神经胶母细胞瘤。

本公开提供一种组合物,其包含本公开的化合物或其医药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施例中,组合物包含医药学上可接受的载剂。在一些实施例中,组合物包含第二治疗活性剂。在一些实施例中,第二治疗活性剂包含本公开的第二化合物。在一些实施例中,第二治疗活性剂包含非I型抑制剂。在一些实施例中,非I型抑制剂包含II型抑制剂。在一些实施例中,II型抑制剂包含小分子抑制剂。

本公开提供本公开的组合物,其用于治疗癌症,其中所述癌症或其肿瘤或细胞表达表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体的实施例,EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,癌症或其肿瘤或细胞表达表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体,EGFR的致癌变体包含EGFR变体III(EGFR-Viii)突变。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,癌症或其肿瘤或细胞表达表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体,1.

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,癌症或其肿瘤或细胞表达表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体,EGFR的致癌变体包含EGFR的结构的修饰,其中EGFR的致癌变体能够形成共价连接的二聚体,其中共价连接的二聚体具有组成活性且其中共价连接的二聚体在与I型ErbB抑制剂接触时增强EGFR的活性。在一些实施例中,EGFR的结构的修饰包含核酸序列、氨基酸序列、二级结构、三级结构和四级结构中的一个或多个的修饰。在一些实施例中,致癌变体包含突变、剪接事件、翻译后过程、构象变化或其任何组合。在一些实施例中,EGFR的结构的修饰在EGFR的第一富含半胱氨酸(CR1)和/或第二富含半胱氨酸(CR2)的区域内进行。在一些实施例中,EGFR的第一富含半胱氨酸(CR1)和/或第二富含半胱氨酸(CR2)的区域分别包含SEQ ID NO:1的氨基酸残基T211-R334和/或C526-S645。在一些实施例中,EGFR的致癌变体产生在CR1和/或CR2区域内形成二硫键的物理屏障。在一些实施例中,EGFR的致癌变体去除在CR1和/或CR2区域内形成二硫键的物理屏障。在一些实施例中,EGFR的致癌变体包含位于EGFR的二聚体界面处的一个或多个游离或不成对的半胱氨酸(C)残基。在一些实施例中,EGFR的致癌变体包含选自由以下组成的组的位点处的一个或多个游离或不成对的半胱氨酸(C)残基:根据SEQ IDNO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636。在一些实施例中,修饰在选自由以下组成的组的位点处的10埃或更少的分子内二硫键内进行:根据SEQID NO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,癌症或其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体且EGFR的致癌变体是EGFR的突变,编码EGFR的致癌变体的核苷酸序列包含编码外显子19或其一部分的序列的缺失或取代。在一些实施例中,缺失或取代包含一个或多个编码三磷酸腺苷(ATP)结合位点的氨基酸。在一些实施例中,ATP结合位点包含SEQ IDNO:1的氨基酸E746至A750。在一些实施例中,ATP结合位点或其缺失或取代包含SEQ ID NO:1的K858。在一些实施例中,缺失包含SEQ ID NO:1的K858。在一些实施例中,在SEQ ID NO:1的位置858(K858R)处赖氨酸(K)取代精氨酸(R)。在一些实施例中,在SEQ ID NO:1的位置858(L858R)处白氨酸(L)取代精氨酸(R)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,癌症或其肿瘤或细胞表达表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体,编码EGFR的致癌变体的核苷酸序列包含编码外显子20或其一部分的序列内的插入。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码KEILDEAYVMASVDNPHVCAR(SEQ ID NO:7)的序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码C-螺旋、C-螺旋的末端或C-螺旋后的环的序列。在一些实施例中,插入包含ASV、SVD、NPH或FQEA的氨基酸序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含以下中的一个或多个:(a)SEQ ID NO:1的位置V769与D770之间的氨基酸序列ASV的插入;(b)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸序列SVD的插入;(c)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列NPH的插入;(d)SEQ ID NO:1的位置A763与Y764之间的氨基酸序列FQEA的插入;(e)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列PH的插入;(f)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸G的插入;(g)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸H的插入;(h)SEQ ID NO:1的位置V774与C775之间的氨基酸序列HV的插入;(i)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列AH的插入;(j)SEQ ID NO:1的位置A767与S768之间的氨基酸序列SVA的插入;(k)SEQID NO:1的位置770与771之间的氨基酸序列GYN取代DN;(l)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸H的插入;(m)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸Y的插入;(n)SEQID NO:1的位置C775与R776之间的氨基酸序列PHVC的插入;(o)SEQ ID NO:1的位置773处的氨基酸序列YNPY取代H;(p)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列DNP的插入;(q)SEQ ID NO:1的位置S768与V769之间的氨基酸序列VDS的插入;(r)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸H的插入;(s)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸N的插入;(t)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列PNP的插入;(u)SEQ ID NO:1的位置770与771之间的氨基酸序列GSVDN取代DN;(v)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列GYP取代NP;(w)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸G的插入;(x)SEQ IDNO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列GNP的插入;(y)SEQ ID NO:1的位置V769与D770之间的氨基酸序列GSV的插入;(z)SEQ ID NO:1的位置774与775之间的氨基酸序列GNPHVC取代VC;(aa)SEQ ID NO:1的位置A763与Y764之间的氨基酸序列LQEA的插入;(bb)SEQ IDNO:1的位置D770与N771之间的氨基酸序列GL的插入;(cc)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸Y的插入;(dd)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列NPY的插入;(ee)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列TH的插入;(ff)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列KGP取代NP;(gg)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列SVDNP取代NP;(hh)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸序列NN的插入;(ii)SEQID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸T的插入;和(jj)SEQ ID NO:1的位置768与769之间的氨基酸序列STLASV取代SV。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,癌症或其肿瘤或细胞表达表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体,EGFR的致癌变体包含EGFR-Vii、EGFR-Vvi、EGFR-R222C、EGFR-R252C、EGFR-R252P、EGFR-R256Y、EGFR-T263P、EGFR-Y270C、EGFR-A289T、EGFR-A289V、EGFR-A289D、EGFR-H304Y、EGFR-G331R、EGFR-P596S、EGFR-P596L、EGFR-P596R、EGFR-G598V、EGFR-G598A、EGFR-G614D、EGFR-C620Y、EGFR-C614W、EGFR-C628F、EGFR-C628Y、EGFR-C636Y、EGFR-G645C、EGFR-Δ660、EGFR-Δ768或其任何组合。

在一些实施例中,本公开提供本公开的组合物,其用于治疗癌症,其中癌症、其肿瘤或细胞表达以下中的一个或多个:(a)野生型人类表皮生长因子受体2(HER2)受体或(b)HER-2受体的致癌变体。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达野生型HER-2受体的实施例,野生型HER2受体包含SEQ ID NO:2、3、4、5或6的氨基酸序列。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体的实施例,HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置310处苯丙氨酸(F)取代丝氨酸(S)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置310处酪氨酸(Y)取代丝氨酸(S)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置678处谷氨酰胺(Q)取代精氨酸(R)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置777处白氨酸(L)取代缬氨酸(V)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置777处甲硫氨酸(M)取代缬氨酸(V)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置842处异白氨酸(I)取代缬氨酸(V)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处丙氨酸(A)取代白氨酸(L)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处脯氨酸(P)取代白氨酸(L)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处丝氨酸(S)取代白氨酸(L)。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,编码HER2受体的致癌变体的核苷酸序列包含编码外显子20或其一部分的序列内的插入。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码KEILDEAYVMAGVGSPYVSR(SEQ ID NO:8)的序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码C-螺旋、C-螺旋的末端或C-螺旋后的环的序列。在一些实施例中,插入包含GSP或YVMA的氨基酸序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含以下中的一个或多个:(a)SEQID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YVMA的插入;(b)SEQ ID NO:2的位置P780与Y781之间的氨基酸序列GSP的插入;(c)SEQ ID NO:2的位置A771与Y772之间的氨基酸序列YVMA的插入;(d)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YVMA的插入;(e)SEQ IDNO:2的位置V777与G778之间的氨基酸V的插入;(f)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸V的插入;(g)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVGCV取代GV;(h)SEQID NO:2的位置776之间的氨基酸序列LC取代G;(i)SEQ ID NO:2的位置776之间的氨基酸序列LCV取代G;SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列GSP的插入;(k)SEQ ID NO:2的位置755与757之间的氨基酸序列PS取代LRE;(l)SEQ ID NO:2的位置779与780之间的氨基酸序列CPGSP取代SP;(m)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸C的插入;(n)SEQID NO:2的位置与775776之间的氨基酸序列VVMA取代AG;(o)SEQ ID NO:2的位置776处的氨基酸序列VV取代G;(p)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVCV取代GV;(q)SEQID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VCV取代GV;(r)SEQ ID NO:2的位置G778与S779之间的氨基酸G的插入;(s)SEQ ID NO:2的位置755与757之间的氨基酸序列PK取代LRE;(t)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸V的插入;(u)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YAMA的插入;(v)SEQ ID NO:2的位置776处的氨基酸序列CV取代G;(w)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列AVCGG取代GVG;(x)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列CVCG取代GVG;(y)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列VVVG取代GVG;(z)SEQ ID NO:2的位置776与779之间的氨基酸序列SVGG取代GVGS;(aa)SEQID NO:2的位置776与779之间的氨基酸序列VVGES取代GVGS;(bb)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVGSGV取代GV;(cc)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列CVC取代GV;(dd)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列HVC取代GV;(ee)SEQ IDNO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VAAGV取代GV;(ff)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VAGV取代GV;(gg)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VVV取代GV;(hh)SEQ ID NO:2的位置G778与S779之间的氨基酸序列FPG的插入;(ii)SEQ ID NO:2的位置S779与P780之间的氨基酸序列GS的插入;(jj)SEQ ID NO:2的位置754与757之间的氨基酸序列VPS取代VLRE;(kk)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸E的插入;(ll)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列MAGV的插入;(mm)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸S的插入;(nn)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列SCV的插入;和(oo)SEQ ID NO:2的位置Y772与V773之间的氨基酸序列LMAY的插入。

在本公开的用于治疗癌症的组合物的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含HER2-Δ16、HER2-C311R、HER2-S310F、p95-HER2-M611或其任何组合。

在一些实施例中,本公开提供本公开的组合物用于治疗癌症的用途,包含向个体给予治疗有效量的所述组合物,其中癌症、其肿瘤或细胞表达表皮生长因子受体(EGFR)的致癌变体。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体的实施例,EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,EGFR的致癌变体包含EGFR变体III(EGFR-Viii)突变。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,EGFR的致癌变体包含SEQ ID NO:1的位置289处的缬氨酸(V)对丙氨酸(A)的取代。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,EGFR的致癌变体包含EGFR的结构的修饰,其中EGFR的致癌变体能够形成共价连接的二聚体,其中共价连接的二聚体具有组成活性且其中共价连接的二聚体在与I型ErbB抑制剂接触时增强EGFR的活性。在一些实施例中,EGFR的结构的修饰包含核酸序列、氨基酸序列、二级结构、三级结构和四级结构中的一个或多个的修饰。在一些实施例中,致癌变体包含突变、剪接事件、翻译后过程、构象变化或其任何组合。在一些实施例中,EGFR的结构的修饰在EGFR的第一富含半胱氨酸(CR1)和/或第二富含半胱氨酸(CR2)的区域内进行。在一些实施例中,EGFR的第一富含半胱氨酸(CR1)和/或第二富含半胱氨酸(CR2)的区域分别包含SEQ ID NO:1的氨基酸残基T211-R334和/或C526-S645。在一些实施例中,EGFR的致癌变体产生在CR1和/或CR2区域内形成二硫键的物理屏障。在一些实施例中,EGFR的致癌变体去除在CR1和/或CR2区域内形成二硫键的物理屏障。在一些实施例中,EGFR的致癌变体包含位于EGFR的二聚体界面处的一个或多个游离或不成对的半胱氨酸(C)残基。在一些实施例中,EGFR的致癌变体包含选自由以下组成的组的位点处的一个或多个游离或不成对的半胱氨酸(C)残基:根据SEQ ID NO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636。在一些实施例中,修饰在选自由以下组成的组的位点处的10埃或更少的分子内二硫键内进行:根据SEQ ID NO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体且EGFR的致癌变体是EGFR的突变的实施例,编码EGFR的致癌变体的核苷酸序列包含缺失或取代包含编码三磷酸腺苷(ATP)结合位点的一个或多个氨基酸。在一些实施例中,ATP结合位点包含SEQ ID NO:1的氨基酸E746至A750。在一些实施例中,ATP结合位点或其缺失或取代包含SEQ ID NO:1的K858。在一些实施例中,缺失包含SEQID NO:1的K858。在一些实施例中,在SEQ ID NO:1的位置858(K858R)处赖氨酸(K)取代精氨酸(R)。在一些实施例中,在SEQ ID NO:1的位置858(L858R)处白氨酸(L)取代精氨酸(R)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,编码EGFR的致癌变体的核苷酸序列包含编码外显子20或其一部分的序列内的插入。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码KEILDEAYVMASVDNPHVCAR(SEQ ID NO:7)的序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码C-螺旋、C-螺旋的末端或C-螺旋后的环的序列。在一些实施例中,插入包含ASV、SVD、NPH或FQEA的氨基酸序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含以下中的一个或多个:(a)SEQ ID NO:1的位置V769与D770之间的氨基酸序列ASV的插入;(b)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸序列SVD的插入;(c)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列NPH的插入;(d)SEQ ID NO:1的位置A763与Y764之间的氨基酸序列FQEA的插入;(e)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列PH的插入;(f)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸G的插入;(g)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸H的插入;(h)SEQ ID NO:1的位置V774与C775之间的氨基酸序列HV的插入;(i)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列AH的插入;(j)SEQ ID NO:1的位置A767与S768之间的氨基酸序列SVA的插入;(k)SEQID NO:1的位置770与771之间的氨基酸序列GYN取代DN;(l)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸H的插入;(m)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸Y的插入;(n)SEQID NO:1的位置C775与R776之间的氨基酸序列PHVC的插入;(o)SEQ ID NO:1的位置773处的氨基酸序列YNPY取代H;(p)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列DNP的插入;(q)SEQ ID NO:1的位置S768与V769之间的氨基酸序列VDS的插入;(r)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸H的插入;(s)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸N的插入;(t)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列PNP的插入;(u)SEQ ID NO:1的位置770与771之间的氨基酸序列GSVDN取代DN;(v)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列GYP取代NP;(w)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸G的插入;(x)SEQ IDNO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列GNP的插入;(y)SEQ ID NO:1的位置V769与D770之间的氨基酸序列GSV的插入;(z)SEQ ID NO:1的位置774与775之间的氨基酸序列GNPHVC取代VC;(aa)SEQ ID NO:1的位置A763与Y764之间的氨基酸序列LQEA的插入;(bb)SEQ IDNO:1的位置D770与N771之间的氨基酸序列GL的插入;(cc)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸Y的插入;(dd)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列NPY的插入;(ee)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列TH的插入;(ff)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列KGP取代NP;(gg)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列SVDNP取代NP;(hh)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸序列NN的插入;(ii)SEQID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸T的插入;和(jj)SEQ ID NO:1的位置768与769之间的氨基酸序列STLASV取代SV。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症或其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体且其中EGFR的致癌变体是EGFR的变构变体的实施例,EGFR的致癌变体包含EGFR-Vii、EGFR-Vvi、EGFR-R222C、EGFR-R252C、EGFR-R252P、EGFR-R256Y、EGFR-T263P、EGFR-Y270C、EGFR-A289T、EGFR-A289V、EGFR-A289D、EGFR-H304Y、EGFR-G331R、EGFR-P596S、EGFR-P596L、EGFR-P596R、EGFR-G598V、EGFR-G598A、EGFR-G614D、EGFR-C620Y、EGFR-C614W、EGFR-C628F、EGFR-C628Y、EGFR-C636Y、EGFR-G645C、EGFR-Δ660、EGFR-Δ768或其任何组合。

在一些实施例中,本公开提供本公开的组合物用于治疗癌症的用途,包含向个体给予治疗有效量的组合物,其中所述癌症、其肿瘤或细胞表达以下中的一个或多个:(a)野生型人类表皮生长因子受体2(HER2)受体或HER-2受体的致癌变体。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达野生型HER-2受体的实施例,野生型HER2受体包含SEQ ID NO:2、3、4、5或6的氨基酸序列。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体的实施例,HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置310处苯丙氨酸(F)取代丝氨酸(S)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置310处酪氨酸(Y)取代丝氨酸(S)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置678处谷氨酰胺(Q)取代精氨酸(R)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置777处白氨酸(L)取代缬氨酸(V)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置777处甲硫氨酸(M)取代缬氨酸(V)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置842处异白氨酸(I)取代缬氨酸(V)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处丙氨酸(A)取代白氨酸(L)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处脯氨酸(P)取代白氨酸(L)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含SEQ ID NO:2或5的位置755处丝氨酸(S)取代白氨酸(L)。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER2受体的致癌变体是HER2受体的变构变体的实施例,编码HER2受体的致癌变体的核苷酸序列包含编码外显子20或其一部分的序列内的插入。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码KEILDEAYVMAGVGSPYVSR(SEQ ID NO:8)的序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码C-螺旋、C-螺旋的末端或C-螺旋后的环的序列。在一些实施例中,插入包含GSP或YVMA的氨基酸序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含以下中的一个或多个:(a)SEQID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YVMA的插入;(b)SEQ ID NO:2的位置P780与Y781之间的氨基酸序列GSP的插入;(c)SEQ ID NO:2的位置A771与Y772之间的氨基酸序列YVMA的插入;(d)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YVMA的插入;(e)SEQ IDNO:2的位置V777与G778之间的氨基酸V的插入;(f)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸V的插入;(g)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVGCV取代GV;(h)SEQID NO:2的位置776之间的氨基酸序列LC取代G;(i)SEQ ID NO:2的位置776之间的氨基酸序列LCV取代G;SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列GSP的插入;(k)SEQ ID NO:2的位置755与757之间的氨基酸序列PS取代LRE;(l)SEQ ID NO:2的位置779与780之间的氨基酸序列CPGSP取代SP;(m)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸C的插入;(n)SEQID NO:2的位置与775776之间的氨基酸序列VVMA取代AG;(o)SEQ ID NO:2的位置776处的氨基酸序列VV取代G;(p)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVCV取代GV;(q)SEQID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VCV取代GV;(r)SEQ ID NO:2的位置G778与S779之间的氨基酸G的插入;(s)SEQ ID NO:2的位置755与757之间的氨基酸序列PK取代LRE;(t)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸V的插入;(u)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YAMA的插入;(v)SEQ ID NO:2的位置776处的氨基酸序列CV取代G;(w)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列AVCGG取代GVG;(x)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列CVCG取代GVG;(y)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列VVVG取代GVG;(z)SEQ ID NO:2的位置776与779之间的氨基酸序列SVGG取代GVGS;(aa)SEQID NO:2的位置776与779之间的氨基酸序列VVGES取代GVGS;(bb)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVGSGV取代GV;(cc)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列CVC取代GV;(dd)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列HVC取代GV;(ee)SEQ IDNO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VAAGV取代GV;(ff)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VAGV取代GV;(gg)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VVV取代GV;(hh)SEQ ID NO:2的位置G778与S779之间的氨基酸序列FPG的插入;(ii)SEQ ID NO:2的位置S779与P780之间的氨基酸序列GS的插入;(jj)SEQ ID NO:2的位置754与757之间的氨基酸序列VPS取代VLRE;(kk)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸E的插入;(ll)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列MAGV的插入;(mm)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸S的插入;(nn)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列SCV的插入;和(oo)SEQ ID NO:2的位置Y772与V773之间的氨基酸序列LMAY的插入。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-2受体的致癌变体且其中HER-2受体的致癌变体是HER-2受体的变构变体的实施例,HER2受体的致癌变体包含HER2-Δ16、HER2-C311R、HER2-S310F、p95-HER2-M611或其任何组合。

在一些实施例中,本公开提供本公开的组合物用于治疗癌症的用途,包括其中癌症、其肿瘤或细胞表达HER-4受体的致癌变体的情况。在一些实施例中,HER-4受体的致癌变体是HER4受体的变构变体。在一些实施例中,HER4受体的致癌变体包含外显子16(HER4-Δ16)的缺失。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,组合物适用于全身给药。在一些实施例中,组合物适用于口服给药。在一些实施例中,组合物适用于静脉内给药。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,组合物适用于局部给药。在一些实施例中,组合物适用于瘤内、眼内、骨内、脊椎内或脑室内给药。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,个体或癌症对用吉非替尼、埃罗替尼、阿法替尼、奥希替尼和尼图单抗中的一种或多种进行的治疗不敏感或具有抗性。在一些实施例中,个体或癌症对用克瑞替尼(crixotinib)、阿来替尼和色瑞替尼中的一种或多种进行的治疗不敏感或具有抗性。在一些实施例中,个体或癌症对用达拉非尼和曲美替尼中的一种或多种进行的治疗不敏感或具有抗性。在一些实施例中,个体或癌症对用克卓替尼进行的治疗不敏感或具有抗性。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,癌症、其肿瘤或细胞表达EGFR的致癌变体,其中编码EGFR的致癌变体的序列包含外显子20或其一部分的缺失且其中癌症、其肿瘤或细胞不包含编码EGFR激酶域(KD)、BRAF、NTRK和KRAS中的一个或多个的序列中或EGFR激酶域、BRAF、NTRK和KRAS中的致癌变异。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,癌症、其肿瘤或细胞包含EGFR的致癌变体,其中编码EGFR的致癌变体的序列包含外显子20或其一部分的缺失且其中癌症、其肿瘤或细胞不包含指示对免疫疗法的反应性的标记物。

在一些实施例中,致癌变体(例如变构变体)或致癌突变(例如变构突变)是由食品和药物管理局(Food and Drug Aministration;FDA)认可诊断来检测。

在一些实施例中,个体对用与本公开的化合物不同的治疗剂进行的治疗具有不良反应。在一些实施例中,个体对用I型抑制剂进行的治疗具有不良反应。在一些实施例中,个体对用以下中的一种或多种进行的治疗具有不良反应:吉非替尼、埃罗替尼、阿法替尼、奥希替尼、尼图单抗、克卓替尼、阿来替尼、色瑞替尼、达拉非尼、曲美替尼、阿法替尼、沙皮替尼、达可替尼、卡奈替尼、培利替尼、WZ4002、WZ8040、WZ3146、CO-1686和AZD9291。在一些实施例中,不良反应是EGFR的致癌变体的活化和其中致癌变体包含受体的胞外域中的突变。在一些实施例中,不良反应是HER-2受体的致癌变体的活化和其中致癌变体包含受体的胞外域中的突变。

在一些实施例中,方法包含向有需要的个体给予治疗有效量的非I型抑制剂。在一些实施例中,非I型抑制剂包含小分子II型抑制剂。

在一些实施例中,方法包含向有需要的个体给予治疗有效量的非I型抑制剂。在一些实施例中,非I型抑制剂包含小分子II型抑制剂。

在一些实施例中,化合物与治疗有效量的非I型抑制剂组合使用。在一些实施例中,非I型抑制剂包含小分子II型抑制剂。

在一些实施例中,组合物包含非I型抑制剂。在一些实施例中,非I型抑制剂包含小分子II型抑制剂。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,癌症包含实体肿瘤。在一些实施例中,癌症包含膀胱癌、乳癌、子宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、胃癌、神经胶母细胞瘤(GBM)、头颈癌、肺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)或其任何亚型。在一些实施例中,癌症包含神经胶母细胞瘤(GBM)。在一些实施例中,癌症包含乳癌。在一些实施例中,癌症包含肺癌。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,治疗有效量降低癌症的病征或症状的严重程度。在一些实施例中,癌症的病征包含肿瘤等级且其中病征的严重程度的降低包含肿瘤等级的降低。在一些实施例中,癌症的病征包含肿瘤转移且其中病征的严重程度的降低包含消除转移或转移的速率或程度的降低。在一些实施例中,癌症的病征包含肿瘤体积且其中病征的严重程度的降低包含消除肿瘤或体积降低。在一些实施例中,癌症的症状包含疼痛且其中病征的严重程度的降低包含消除或减少疼痛。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,治疗有效量诱导缓解期。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,治疗有效量改善个体的预后。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,个体是临床试验或其方案的参与者或候选参与者。在一些实施例中,将个体从用I型抑制剂进行的治疗排除。在一些实施例中,I型抑制剂包含吉非替尼、埃罗替尼、阿法替尼、奥希替尼、尼图单抗、克卓替尼、阿来替尼、色瑞替尼、达拉非尼、曲美替尼、阿法替尼、沙皮替尼、达可替尼、卡奈替尼、培利替尼、WZ4002、WZ8040、WZ3146、CO-1686或AZD9291。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,用途包含用非I型抑制剂治疗个体。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,组合物包含非I型抑制剂。

在本公开的组合物用于治疗癌症的用途的一些实施例中,非I型抑制剂包含II型小分子抑制剂。在一些实施例中,II型小分子抑制剂包含来那替尼、AST-1306、HKI-357或拉帕替尼。

在一些实施例中,致癌变体是ErbB受体中的致癌变体。

在一些实施例中,ErbB受体中的致癌变体是变构变体。

在一些实施例中,ErbB受体是表皮生长因子受体(EGFR)或人类表皮生长因子受体2(HER2)受体。

在一些实施例中,ErbB受体是表皮生长因子受体(EGFR)。

在一些实施例中,ErbB受体是HER2受体。

在一些实施例中,致癌变体是表皮生长因子受体(EGFR)中的致癌变体。

在一些实施例中,EGFR中的致癌变体是变构变体。

在一些实施例中,致癌变体是HER2受体的致癌变体。

在一些实施例中,HER2受体中的致癌变体是变构变体。

在一些实施例中,EGFR中的致癌变体是EGFR变体III(EGFR-Viii)变体。

在一些实施例中,EGFR中的致癌变体是SEQ ID NO:1的位置289处缬氨酸(V)取代丙氨酸(A)。

在一些实施例中,致癌变体是EGFR中的致癌变体且其中EGFR中的致癌变体是EGFR中的变构变体,EGFR中的致癌变体是EGFR的结构的修饰,其中EGFR中的致癌变体能够形成共价连接二聚体,其中共价连接二聚体具有组成活性且其中共价连接二聚体在与I型ErbB抑制剂接触时增强EGFR的活性。在一些实施例中,EGFR的结构的修饰包含核酸序列、氨基酸序列、二级结构、三级结构和四级结构中的一个或多个的修饰。在一些实施例中,EGFR的结构的修饰在EGFR的第一富含半胱氨酸(CR1)和/或第二富含半胱氨酸(CR2)的区域内进行。在一些实施例中,EGFR的第一富含半胱氨酸(CR1)和/或第二富含半胱氨酸(CR2)的区域分别包含SEQ ID NO:1的氨基酸残基T211-R334和/或C526-S645。在一些实施例中,EGFR中的致癌变体产生在CR1和/或CR2区域内形成二硫键的物理屏障。在一些实施例中,EGFR中的致癌变体去除在CR1和/或CR2区域内形成二硫键的物理屏障。在一些实施例中,EGFR中的致癌变体引起位于EGFR的二聚体界面处的一个或多个游离或不成对的半胱氨酸(C)残基。在一些实施例中,EGFR中的致癌变体引起选自由以下组成的组的位点处的一个或多个游离或不成对的半胱氨酸(C)残基:根据SEQ ID NO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636。在一些实施例中,修饰在选自由以下组成的组的位点处的10埃或更少的分子内二硫键内进行:根据SEQ ID NO:1的C190-C199、C194-C207、C215-C223、C219-C231、C232-C240、C236-C248、C251-C260、C264-C291、C295-C307、C311-C326、C329-C333、C506-C515、C510-C523、C526-C535、C539-C555、C558-C571、C562-C579、C582-C591、C595-C617、C620-C628和C624-C636。

在一些实施例中,致癌变体是EGFR中的致癌变体且其中EGFR中的致癌变体是EGFR中的变构变体,其中编码具有致癌变体的EGFR的核苷酸序列包含缺失或取代包含编码三磷酸腺苷(ATP)结合位点的一个或多个氨基酸。在一些实施例中,ATP结合位点包含SEQ IDNO:1的氨基酸E746至A750。在一些实施例中,ATP结合位点或其缺失或取代包含SEQ ID NO:1的K858。在一些实施例中,缺失包含SEQ ID NO:1的K858。在一些实施例中,在SEQ ID NO:1的位置858(K858R)处赖氨酸(K)取代精氨酸(R)。在一些实施例中,在SEQ ID NO:1的位置858(L858R)处白氨酸(L)取代精氨酸(R)。

在一些实施例中,致癌变体是EGFR中的致癌变体且其中EGFR中的致癌变体是EGFR中的变构变体,其中编码具有致癌变体的EGFR的核苷酸序列包含编码外显子20或其一部分的序列内的插入。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码KEILDEAYVMASVDNPHVCAR(SEQ ID NO:7)的序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码C-螺旋、C-螺旋的末端或C-螺旋后的环的序列。在一些实施例中,插入包含ASV、SVD、NPH或FQEA的氨基酸序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含以下中的一个或多个:(a)SEQ ID NO:1的位置V769与D770之间的氨基酸序列ASV的插入;(b)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸序列SVD的插入;(c)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列NPH的插入;(d)SEQ ID NO:1的位置A763与Y764之间的氨基酸序列FQEA的插入;(e)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列PH的插入;(f)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸G的插入;(g)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸H的插入;(h)SEQ ID NO:1的位置V774与C775之间的氨基酸序列HV的插入;(i)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列AH的插入;(j)SEQ ID NO:1的位置A767与S768之间的氨基酸序列SVA的插入;(k)SEQ ID NO:1的位置770与771之间的氨基酸序列GYN取代DN;(l)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸H的插入;(m)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸Y的插入;(n)SEQ ID NO:1的位置C775与R776之间的氨基酸序列PHVC的插入;(o)SEQ ID NO:1的位置773处的氨基酸序列YNPY取代H;(p)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列DNP的插入;(q)SEQ ID NO:1的位置S768与V769之间的氨基酸序列VDS的插入;(r)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸H的插入;(s)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸N的插入;(t)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列PNP的插入;(u)SEQ ID NO:1的位置770与771之间的氨基酸序列GSVDN取代DN;(v)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列GYP取代NP;(w)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸G的插入;(x)SEQ ID NO:1的位置P772与H773之间的氨基酸序列GNP的插入;(y)SEQ ID NO:1的位置V769与D770之间的氨基酸序列GSV的插入;(z)SEQ IDNO:1的位置774与775之间的氨基酸序列GNPHVC取代VC;(aa)SEQ ID NO:1的位置A763与Y764之间的氨基酸序列LQEA的插入;(bb)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸序列GL的插入;(cc)SEQ ID NO:1的位置D770与N771之间的氨基酸Y的插入;(dd)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列NPY的插入;(ee)SEQ ID NO:1的位置H773与V774之间的氨基酸序列TH的插入;(ff)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列KGP取代NP;(gg)SEQ ID NO:1的位置771与772之间的氨基酸序列SVDNP取代NP;(hh)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸序列NN的插入;(ii)SEQ ID NO:1的位置N771与P772之间的氨基酸T的插入;和(jj)SEQ ID NO:1的位置768与769之间的氨基酸序列STLASV取代SV。

在一些实施例中,致癌变体是EGFR中的致癌变体且其中EGFR中的致癌变体是EGFR中的变构变体,具有致癌变体的EGFR包含EGFR-Vii、EGFR-Vvi、EGFR-R222C、EGFR-R252C、EGFR-R252P、EGFR-R256Y、EGFR-T263P、EGFR-Y270C、EGFR-A289T、EGFR-A289V、EGFR-A289D、EGFR-H304Y、EGFR-G331R、EGFR-P596S、EGFR-P596L、EGFR-P596R、EGFR-G598V、EGFR-G598A、EGFR-G614D、EGFR-C620Y、EGFR-C614W、EGFR-C628F、EGFR-C628Y、EGFR-C636Y、EGFR-G645C、EGFR-Δ660、EGFR-Δ768或其任何组合。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体,HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置310处苯丙氨酸(F)取代丝氨酸(S)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置310处酪氨酸(Y)取代丝氨酸(S)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置678处谷氨酰胺(Q)取代精氨酸(R)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置777处白氨酸(L)取代缬氨酸(V)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置777处甲硫氨酸(M)取代缬氨酸(V)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置842处异白氨酸(I)取代缬氨酸(V)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置755处丙氨酸(A)取代白氨酸(L)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置755处脯氨酸(P)取代白氨酸(L)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,HER2受体中的致癌突变包含SEQ ID NO:2或5的位置755处丝氨酸(S)取代白氨酸(L)。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,其中编码具有致癌变体的HER2受体的核苷酸序列包含编码外显子20或其一部分的序列内的插入。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码KEILDEAYVMAGVGSPYVSR(SEQ ID NO:8)的序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含编码C-螺旋、C-螺旋的末端或C-螺旋后的环的序列。在一些实施例中,插入包含GSP或YVMA的氨基酸序列。在一些实施例中,编码外显子20或其一部分的序列包含以下中的一个或多个:(a)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YVMA的插入;(b)SEQ ID NO:2的位置P780与Y781之间的氨基酸序列GSP的插入;(c)SEQ ID NO:2的位置A771与Y772之间的氨基酸序列YVMA的插入;(d)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YVMA的插入;(e)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸V的插入;(f)SEQ IDNO:2的位置V777与G778之间的氨基酸V的插入;(g)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVGCV取代GV;(h)SEQ ID NO:2的位置776之间的氨基酸序列LC取代G;(i)SEQ IDNO:2的位置776之间的氨基酸序列LCV取代G;SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列GSP的插入;(k)SEQ ID NO:2的位置755与757之间的氨基酸序列PS取代LRE;(l)SEQ IDNO:2的位置779与780之间的氨基酸序列CPGSP取代SP;(m)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸C的插入;(n)SEQ ID NO:2的位置与775776之间的氨基酸序列VVMA取代AG;(o)SEQ ID NO:2的位置776处的氨基酸序列VV取代G;(p)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVCV取代GV;(q)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VCV取代GV;(r)SEQ ID NO:2的位置G778与S779之间的氨基酸G的插入;(s)SEQ ID NO:2的位置755与757之间的氨基酸序列PK取代LRE;(t)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸V的插入;(u)SEQ ID NO:2的位置A775与G776之间的氨基酸序列YAMA的插入;(v)SEQ ID NO:2的位置776处的氨基酸序列CV取代G;(w)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列AVCGG取代GVG;(x)SEQ ID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列CVCG取代GVG;(y)SEQID NO:2的位置776与778之间的氨基酸序列VVVG取代GVG;(z)SEQ ID NO:2的位置776与779之间的氨基酸序列SVGG取代GVGS;(aa)SEQ ID NO:2的位置776与779之间的氨基酸序列VVGES取代GVGS;(bb)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列AVGSGV取代GV;(cc)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列CVC取代GV;(dd)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列HVC取代GV;(ee)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VAAGV取代GV;(ff)SEQ ID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VAGV取代GV;(gg)SEQID NO:2的位置776与777之间的氨基酸序列VVV取代GV;(hh)SEQ ID NO:2的位置G778与S779之间的氨基酸序列FPG的插入;(ii)SEQ ID NO:2的位置S779与P780之间的氨基酸序列GS的插入;(jj)SEQ ID NO:2的位置754与757之间的氨基酸序列VPS取代VLRE;(kk)SEQ IDNO:2的位置V777与G778之间的氨基酸E的插入;(ll)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列MAGV的插入;(mm)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸S的插入;(nn)SEQ ID NO:2的位置V777与G778之间的氨基酸序列SCV的插入;和(oo)SEQ ID NO:2的位置Y772与V773之间的氨基酸序列LMAY的插入。

在一些实施例中,致癌变体是HER-2受体中的致癌变体且其中HER2受体中的致癌变体是HER2受体中的变构变体,具有致癌变体的HER2受体包含HER2-Δ16、HER2-C311R、HER2-S310F、p95-HER2-M611或其任何组合。

在一些实施例中,致癌变体是HER-4受体中的致癌变体。在一些实施例中,HER-4受体中的致癌变体是HER4受体中的变构变体。在一些实施例中,HER4受体中的致癌变体引起外显子16(HER4-Δ16)的缺失。

在一些实施例中,致癌变体是EGFR中的致癌变体,其中编码具有致癌变体的EGFR的序列包含外显子20或其一部分的缺失且其中癌症、其肿瘤或细胞不包含除EGFR的外显子20以外的序列中的第二致癌变体。在一些实施例中,第二致癌变异包含编码EGFR激酶域(KD)、BRAF、NTRK和KRAS中的一个或多个的序列。

在一些实施例中,致癌变体是EGFR中的致癌变体,其中编码具有致癌变体的EGFR的序列包含外显子20或其一部分的缺失且其中癌症、其肿瘤或细胞不包含指示对免疫疗法的反应性的标记物。

实例

实例1.本公开的例示性化合物的合成

通用程序A:

步骤A.1:

向7-氟-6-硝基-喹唑啉-4-醇(5.00g,23.9mmol,1.00当量)于亚硫酰氯(20.0mL)中的溶液中添加二甲基甲酰胺(174mg,2.39mmol,183μL,0.10当量)。在80℃下搅拌反应物10小时。在减压下浓缩反应混合物,得到呈灰白色固体状的4-氯-7-氟-6-硝基喹唑啉(6.00g,粗物质)。产物未经纯化即用于下一步骤。

步骤A.2:

在80℃下加热4-氯-7-氟-6-硝基喹唑啉(2.4g,10.55mmol,1当量)和游离胺H

步骤A.3:

向胺III(1当量)和NH或OH亲核试剂Z-(CH

步骤A.4:

步骤A.5:

步骤A.6:

向V(1.0当量)、1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳化二亚胺盐酸盐(5.00当量)和吡啶(5.00当量)于N,N-二甲基甲酰胺中的溶液中添加丁-2-炔酸(10.0当量)。在50℃下搅拌混合物2小时且接着在真空中浓缩。通过制备型HPLC来纯化混合物,得到炔酰胺VII。

通用程序B:

步骤B.1:

在20℃下,向在步骤A.2中获得的III(1.00当量)和叔丁醇钾(4.00当量)于二甲亚砜(10.0mL)中的溶液中逐滴添加氨基醇的相应二醇(6.00当量)。在20℃下搅拌混合物12小时。混合物用水稀释且用乙酸乙酯萃取。合并的有机层用盐水洗涤且经硫酸钠脱水,过滤且浓缩,得到粗产物。通过硅胶色谱来纯化粗产物,得到醇VIII。

步骤B.2:

步骤B.3:

在20℃下,向IX(1.0当量)和碳酸钾(4.00当量)于二甲亚砜中的溶液中一次性添加相应的N-H亲核试剂(2.0当量)。在50℃下搅拌混合物12小时。混合物用水稀释且用乙酸乙酯萃取。合并的有机层用盐水洗涤且经硫酸钠脱水,过滤且浓缩,得到粗产物。通过制备型HPLC来纯化粗产物,得到X。

步骤B.4:

步骤B.5:

通用程序C:

步骤C.1:

在25℃下,将钠(3.0当量)添加到相应的二醇(18.7当量)中。在25℃下搅拌悬浮液0.5小时。向以上悬浮液中添加醇I(1.0当量)。将混合物加热到70℃且在70℃下搅拌1.5小时。将混合物冷却至25℃且接着用盐酸(3M)调节至pH=7。在过滤之后,滤饼在减压下脱水,得到二醇XIII。

步骤C.2:

向二醇XIII(1.00当量)于亚硫酰氯(10.0mL)中的溶液中添加N,N-二甲基甲酰胺(0.1当量)。在90℃下搅拌混合物3小时。将混合物冷却至25℃且接着在真空中浓缩。将混合物分配于水与乙酸乙酯之间。有机相用盐水洗涤,经无水硫酸钠脱水,过滤且在真空中浓缩。通过硅胶色谱来纯化残余物,得到二氯化物XIV。

步骤C.3:

在90℃下搅拌二氯化物XIV(1.0当量)和H

步骤C.4:

向XV(1.0当量)、碘化钾(0.1当量)和碘化四丁基铵(0.1当量)于甲苯中的溶液中添加HNR'R”(3.00当量)。在110℃下搅拌混合物12小时。将混合物冷却至25℃且接着在真空中浓缩。残余物用水湿磨且过滤,滤饼在真空中脱水,得到XVI。

步骤C.5:

步骤C.6:

步骤C.7:

向XVII(1.0当量)、1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳化二亚胺盐酸盐(5.00当量)和吡啶(5.00当量)于N,N-二甲基甲酰胺中的溶液中添加丁-2-炔酸(10.0当量)。在50℃下搅拌混合物2小时且接着在真空中浓缩。通过制备型HPLC来纯化混合物,得到炔酰胺XIX。

通用程序D:

步骤D.1:

在20℃下,向溴化物或三氟甲磺酸酯XX(1.00当量)于二甲亚砜中的溶液中添加相应的炔烃(1.50当量)、三乙胺(3.00当量)、碘化铜(I)(0.5当量)、四(三苯基膦)钯(0.05当量)。混合物用氮气脱气且在氮气下,在20℃下搅拌12小时。向混合物中添加甲醇且过滤,浓缩滤饼,得到炔烃XXI。

步骤D.2:

在20℃下,向炔烃XXI(1.00当量)于亚硫酰氯中的悬浮液中添加N,N-二甲基甲酰胺(2.0当量)。在90℃下搅拌混合物0.5小时,直到悬浮液变成均匀溶液。浓缩溶液,得到氯化物XXII。

步骤D.3:

在80℃下搅拌氯化物XXII(1.0当量)和H

步骤D.4:

步骤D.5:

1:根据通用程序A合成,其中在步骤A.2中,H

2:以在1中获得的中间物III(600mg,1.4mmol)为起始物质,根据通用程序A合成,其中在步骤A.3中,NH亲核试剂是N-甲基-2-(N-吗啉基)乙胺(400.24mg,2.78mmol);在步骤A.4中使用变体i);且在步骤A.5中使用变体ii);且由III实现40%总产率。

3:以在1中获得的中间物III(600mg,1.4mmol)为起始物质,根据通用程序A合成,其中在步骤A.3中,OH亲核试剂是2-(N-吗啉基)乙醇(218mg,1.67mmol,204μL);在步骤A.4中使用变体i);且在步骤A.5中使用变体i);且由III实现11%总产率。

4:以在1中获得的中间物III(600mg,1.39mmol)为起始物质,根据通用程序A合成,其中在步骤A.3中,NH亲核试剂是N-甲基-3-(N-吗啉基)丙-1-胺(439mg,2.78mmol);在步骤A.4中使用变体i);且在步骤A.5中使用变体ii);且由III实现8%总产率。

5:以在1中获得的中间物III(600mg,1.39mmol)为起始物质,根据通用程序A合成,其中在步骤A.3中,NH亲核试剂是2-(N-吗啉基)乙胺(541mg,4.16mmol);在步骤A.4中使用变体i);且在步骤A.5中使用变体i);且由III实现16%总产率。

6:根据通用程序B合成,其中在步骤B.1中,使用丙-1,3-二醇(2.11g,27.8mmol);在步骤B.2中,使用变体i),在步骤B.3中,亲核试剂是盐酸2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷(622mg,4.59mmol),在步骤B.4中,使用变体i)且在步骤B.5中使用变体i);且由III实现4%总产率。

7:根据通用程序B合成,其中在步骤B.1中,使用3-(甲基氨基)丙-1-醇(928mg,10.4mmol);在步骤B.2中,使用变体i),在步骤B.3中,亲核试剂是盐酸2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷(947mg,6.99mmol),在步骤B.4中,使用变体i)且在步骤B.5中使用变体ii);且由III实现0.5%总产率。

8:以在1中获得的中间物III(600mg,1.39mmol)为起始物质,根据通用程序A合成,其中在步骤A.3中,NH亲核试剂是2-(1-哌啶基)乙醇(537mg,4.16mmol);在步骤A.4中使用变体i);且在步骤A.5中使用变体i);且由III实现14%总产率。

9:根据一般程序D合成,其中在步骤D.1中,炔烃是1-甲基-4-(2-甲基丁-3-炔-2-基)哌嗪(5.00g,30.1mmol);且在步骤D.3中,H

10:以在1中获得的中间物III(1.00g,2.31mmol)为起始物质,根据通用程序A合成,其中在步骤A.3中,OH亲核试剂是2-(二甲基氨基)乙醇(247mg,2.78mmol);在步骤A.4中使用变体i);且在步骤A.5中使用变体i);且由III实现7%总产率。

实例2.本公开的例示性化合物的抑制活性

反转录病毒产生:将EGFR突变体亚克隆到pMXs-IRES-杀稻瘟菌素(Blasticidin)(RTV-016,Cell Biolabs,San Diego,CA)中。通过用反转录病毒EGFR突变体表达载体pMXs-IRES-杀稻瘟菌素(RTV-016,Cell Biolabs)、pCMV-Gag-Pol载体和pCMV-VSV-G-包膜载体进行HEK293T细胞的瞬时转染来产生反转录病毒表达载体反转录病毒。将HEK293T/17细胞涂布于涂有100mm胶原蛋白的盘(354450,Corning Life Sciences,Tewksbury,MA)中(每盘4×10

EGFR突变体稳定细胞系的产生:通过在1000rpm下离心30分钟,用补充有8μg/mL的聚凝胺的1ml病毒性上清液感染BaF3细胞(1.5E5个细胞)。将细胞置放于37℃培育箱中过夜。接着,将细胞旋转5分钟以使细胞集结。去除上清液且通过在1000rpm下离心30分钟,用补充有8μg/mL的聚凝胺的新鲜的1ml病毒性上清液再感染细胞。将细胞置放于37℃培育箱中过夜。接着,将细胞保持在RPMI中,所述RPMI含有10%的热灭活FBS、2%的含有10ng/ml的IL-3的L-谷氨酰胺。在48小时之后,选择细胞在10μg/mL的杀稻瘟菌素中进行反转录病毒感染保持一周。杀稻瘟菌素抗性群体在磷酸盐缓冲生理盐水中洗涤两次,接着涂布于不含IL-3的培养基中以针对非IL-3依赖性生长进行选择。

细胞增殖分析法:将BaF3细胞系以1.3E5 c/ml再悬浮于RPMI中且一式三份地分配(17.5E4 c/孔)至96孔盘中,所述RPMI含有10%的热灭活FBS、2%的L-谷氨酰胺和1%的Pen/Strep。为了确定药物对细胞增殖的作用,细胞在不同浓度下,在存在媒剂对照物或测试药物的情况下培育3天。使用CellTiterGlo(Promega),根据制造商提供的方案通过胞内ATP含量的发光定量来确定细胞生长的抑制。使用第0天与药物处理后72小时的细胞数量的比较来标绘剂量反应曲线。确定活细胞的数目且针对用媒剂处理的对照物标准化。与用媒剂处理的对照物相比,增殖的抑制表示为1的分数且使用

细胞蛋白质分析:由含有10mM碘乙酰胺(786-228,G-Biosciences,St,Louis,MO)、蛋白酶抑制剂(P8340,Sigma,St.Louis,MO)和磷酸酶抑制剂(P5726,P0044,Sigma,St.Louis,MO)混合物的清洁剂溶解(RIPA,R0278,Sigma,St Louis,MO)来制备细胞提取物。通过微BSA分析法(Pierce,Rockford IL)来确定可溶性蛋白质浓度。通过SDS-PAGE分离的蛋白质到硝化纤维的电泳转移、与抗体一起培育和化学发光第二步骤检测来进行蛋白质免疫检测。用含5%非脂肪乳粉的TBS封阻硝化纤维膜且与一级抗体一起在5%牛血清白蛋白中培育过夜。以下来自Cell Signaling Technology的一级抗体是以1:1000稀释度使用:磷酸-EGFR[Y1173]和总EGFR。用作蛋白质负载的对照物的β-肌动蛋白抗体是购自SigmaChemicals。辣根过氧化酶结合的二级抗体是从Cell Signaling Technology获得且以1:5000稀释度使用。辣根过氧化酶结合的二级抗体在非脂肪中培育1小时。根据制造商指导使用SuperSignal化学发光试剂(Pierce Biotechnology)且使用Alpha Innotech影像分析仪和AlphaEaseFC软件(Alpha Innotech,San Leandro CA)将印迹成像。

表A和B指定各种化合物A的效能代码:A、B、C、D、E、F、G、H、I、J或K。根据所述代码,A表示IC50值≤5nM。B表示IC50值>5nM且≤10nM。C表示IC50值>10nM且≤20nM。D表示IC50值>20nM和≤30nM。E表示IC50值>30nM且≤50nM。F表示IC50值>50nM且≤100nM。G表示IC50值>100nM且≤200nM。H表示IC50>200nM且≤300nM。I表示IC50值>300nM且≤500nM。J表示IC50值>500nM且≤1000nM。K表示IC50值>1000nM。

表A:用于抑制EGFR的活性

表B:用于抑制HER2的活性

实例3.携带HER2突变型肿瘤的小鼠的处理

使用含有HER2 S310F突变的小鼠肿瘤模型,确定第3号化合物活体内抑制肿瘤生长和诱导肿瘤消退的能力。用15mg/kg的第3号化合物的两天急性口服给药来处理来自Charles River Labs的携带HER2S310F BaF3肿瘤的无胸腺裸鼠。在第二次给药后,在第2小时、第5小时、第12小时和第24小时收集肿瘤且通过AlphaLisa来分析pHER2活性和pERK活性。还在这些时间点收集血浆且分析是否存在第3号化合物以确定药物动力学概况。切割肿瘤组织且使用补充有蛋白酶抑制剂(Sigma P8340)和磷酸酶抑制剂II和III(Sigma P5726和P0044)的含有T-PER组织蛋白质提取剂(Thermo Scientific#78510)的Precellys SoftTissue均质化试剂盒(KT03961-1-00.3.2)均质化。组织样品在Precellys机器中通过旋转两次,每次一分钟来均质化。样品管在4℃下,在15,000rpm下离心5分钟。将上清液转移到新的微管中且再在4℃下,在15,000rpm下旋转5分钟。接着,将上清液转移到新的微管中且置放于冰上。使用BCA试剂盒(Thermo Scientific#23225)测量上清液的蛋白质浓度。借助于AlphaLisa,分别通过pHER2(Tyr1221/1222)或pERK(Thr202/Tyr204)磷酸的检测来分析肿瘤组织衍生的溶解物的HER2活性或EGFR活性。简单来说,将肿瘤溶解物在补充有蛋白酶抑制剂(Sigma P8340)和磷酸酶抑制剂II和III(Sigma P5726和P0044)的1X稀释的SureFireUltra Kit溶解缓冲液(5X供应的储备液)中稀释到0.5μg/μl。向384孔Opti盘(PerkinElmer#6007290)中每个孔一式三份地添加总共10μl肿瘤溶解物。活化缓冲液在组合的反应缓冲液1和反应缓冲液2中稀释25倍,且受体珠粒在组合的反应缓冲液中稀释50倍。向每个孔中添加5微升/孔的受体珠粒:反应缓冲液混合物。将盘封盖且在盘振荡器上振荡5分钟,且接着在黑暗中,在室温下培育90分钟,接着进行读取。在对照物和第3号化合物处理的肿瘤样品中,使用pHer2 AlphaLisa(Perkin Elmer#ALSU-PEB2-A10K)将Her2(Tyr1221/1222)的磷酸化定量,或使用pERK AlphLisA(Perkin Elmer#ALSUPERK-A10K)将ERK1/2(Thr202/Tyr204)的磷酸化定量。如图21中所示,第3号化合物的给药在峰值血浆水平下诱导pHER2和pERK1/2的降低,表明第3号化合物抑制目标HER2 S310F突变型激酶活性。

等效物

本公开的一个或多个实施例的细节阐述于以上随附说明中。现描述优选的方法和材料,但在本公开的实践或测试中还可以使用与本文所描述的方法和材料类似或等效的任何方法和材料。本公开的其它特征、目的和优点将从本说明书和权利要求书显而易见。除非上下文另有明确规定,否则在说明书和所附权利要求书中,单数形式包括多个指示物。除非另外定义,否则本文中所使用的所有技术和科学术语都具有与本公开所属领域的一般技术人员通常所理解相同的含义。本说明书中列举的所有专利案和公开案都以引用的方式并入。

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相关技术
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