一种多功能的医学影像数据标注系统

技术领域

本发明涉及数据标注技术领域，尤其是涉及一种多功能的医学影像数据标注系统。

背景技术

现有的标注平台虽然能够对图片进行分类，并进行目标识别、文本识别等，但是现有的标注平台无法读取多种格式的医学图像，且对医学图像的标注功能十分有限，无法对医学影像数据进行有效整理。

发明内容

本发明旨在提供一种多功能的医学影像数据标注系统，以解决上述技术问题，从而能够对医学影像数据进行有效整理。

为了解决上述技术问题，本发明实施例提供了一种多功能的医学影像数据标注系统，包括图像读取模块、数据标注模块和标注数据导出模块；所述数据标注模块包括影像分类标签模块和影像感兴趣区域标注模块；

所述图像读取模块，用于对医学影像进行读取；其中，所述医学影像包括MRI图像、CT图像、超声图像、RGB图像中的一种或多种；

所述影像分类标签模块，用于对所述医学影像添加影像所属的属性类别信息；

所述影像感兴趣区域标注模块，其用于对所述医学影像中的感兴趣区域进行圈定，并对该圈定区域添加区域所属的属性类别信息；

所述标注数据导出模块，用于将添加标注信息后形成的标注文件进行导出。

进一步地，所述数据标注模块还包括影像语义信息分割标注模块，其用于对所述医学影像中的语义信息区域进行多边形区域的圈定，并对该圈定区域添加其所属的属性类别信息。

进一步地，所述影像分类标签模块，具体用于识别所述医学影像的属性类别，并根据识别到的属性类别对该医学影像添加属性类别信息。

进一步地，所述影像感兴趣区域标注模块，具体用于响应用户的圈定指令圈定出所述医学影像中的感兴趣区域，并根据用户的第一标注指令对该感兴趣区域添加区域所属的属性类别信息。

进一步地，所述影像语义信息分割标注模块，具体用于响应用户的选定指令对所述语义信息区域进行多边形区域的圈定，并根据用户的第二标注指令对该语义信息区域添加其所属的属性类别信息。

进一步地，所述感兴趣区域的圈定图形为矩形或圆形。

进一步地，还包括编码模块，其用于对所有标注信息及所标注的位置信息进行编码以生成标注文件。

进一步地，所述标注文件的格式为采用xml格式或json格式。

与现有技术相比，本发明具有如下有益效果：

本发明提供了一种多功能的医学影像数据标注系统，包括图像读取模块、数据标注模块和标注数据导出模块；所述数据标注模块包括影像分类标签模块、影像感兴趣区域标注模块和影像语义信息分割标注模块；所述图像读取模块用于对医学影像进行读取；所述数据标注模块用于对医学影像进行分类信息标注以及对感兴趣区域以及语义信息区域进行标注；所述标注数据导出模块用于将添加标注信息后形成的标注文件进行导出。本发明系统能够对读取的医学影像进行多功能的信息标注，包括影像分类标注和影像感兴趣区域标注等，从而有效提高了系统对医学影像数据的整理能力。

附图说明

图1是本发明一实施例提供的多功能的医学影像数据标注系统的结构示意图。

具体实施方式

下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整的描述，显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本发明保护的范围。

请参见图1，本发明实施例提供了一种多功能的医学影像数据标注系统，包括图像读取模块、数据标注模块和标注数据导出模块；所述数据标注模块包括影像分类标签模块和影像感兴趣区域标注模块；

所述图像读取模块，用于对医学影像进行读取；其中，所述医学影像包括MRI图像、CT图像、超声图像、RGB图像中的一种或多种；具体体现能够同时对一般图像格式(jpg、png、bmp)、医学影像格式(tif、tiff、dcm)进行解码读取；

所述影像分类标签模块，用于对所述医学影像添加影像所属的属性类别信息；

所述影像感兴趣区域标注模块，其用于对所述医学影像中的感兴趣区域进行圈定，并对该圈定区域添加区域所属的属性类别信息；进一步地，所述感兴趣区域的框选图形包括为矩形或圆形；

所述标注数据导出模块，用于将添加标注信息后形成的标注文件进行导出。

需要说明的是，所述的影像分类标签模块，其功能用于对目标影像的内容属性进行赋予标签信息(影像所属的属性类别信息)。所述影像感兴趣区域标注模块，其功能用于对影像中目标所占的某片区域(例如矩形区域)进行赋予标注信息(区域所属的属性类别信息)。

在本发明实施例中，进一步地，所述数据标注模块还包括影像语义信息分割标注模块，其用于对所述医学影像中的语义信息区域进行多边形区域的圈定，并对该圈定区域添加其所属的属性类别信息。

在本发明实施例中进一步地，所述影像分类标签模块，具体用于识别所述医学影像的属性，并根据识别到的属性对该医学影像添加标签信息。具体地，所述影像分类标签模块用于对同一类影像的内容、属性作分类标签，为基于监督学习的医学影像数据疾病诊断分类、治疗分类与预后分类任务提供数据集。通过所述影像分类标签模块用户可对所读取的医学影像添加该影像所属的分类信息标注。

在本发明实施例中，进一步地，所述影像感兴趣区域标注模块，具体用于响应用户的圈定指令圈定出所述医学影像中的感兴趣区域，并根据用户的第一标注指令对该感兴趣区域添加区域所属的属性类别信息。具体地，所述影像感兴趣区域标注模块，用于同一类影像中对病灶利用矩形框圈出并赋予所圈病灶或区域的内容、属性标签，为基于监督学习的医学影像识别任务提供数据集。通过所述影像感兴趣区域标注模块用户可对感兴趣区域进行矩形或圆形圈定，并对该区域进行添加相应的区域标签。

在本发明实施例中，进一步地，所述影像语义信息分割标注模块，具体用于响应用户的选定指令对所述语义信息区域进行多边形区域的圈定，并根据用户的第二标注指令对该语义信息区域添加其所属的属性类别信息。具体地，所述影像语义信息分割标注模块，用于同一类影像中对病灶等区域，利用多边形对其进行像素级别的选定并赋予内容、属性标签，为基于监督学习的医学影像语义分割任务提供数据集。通过所述影像语义信息分割标注模块，用户可对语义信息区域进行多边形圈定，并对该区域进行添加相应的区域标签。

需要说明的是，用户能够在同一医学影像同时进行多次数据标注，并且能够使用多种标签类别。

在本发明实施例中，进一步地，所述系统还包括编码模块，其用于对所有标注信息及所标注的位置信息进行编码以生成标注文件。进一步地，所述标注文件的格式为采用xml格式或json格式。

需要说明的是，本发明系统能够对图像做不同级别的标注信息进行信息化处理与维护，包含医学影像整体标签、医学影像中感兴趣区域的标注以及医学影像中进行语义信息的标注，这三种标注必要时可同时应用于同一影像。通过对医学影像不同的标注，系统通过编码模块将各个标注集成编码，将所有标注信息存于同一.xml或.json格式文件中，可供医学影像的监督学习任务中提供数据信息。

需要说明的是，本发明系统可以供临床医生使用，应用于深度学习任务中的数据集标注环节，可针对深度学习中任务的不同需求，对目标影像的不同信息进行标注，有利于基于深度学习的医学影像算法开发，系统同时能对数据与标注信息进行系统化维护与管理，从而实现深度学习执行任务的可持续性与可维护性。

基于上述方案，以下对本发明系统的应用流程进行举例说明：

1、对各种医学影像的读取；

2、对各种医学影像数据的标注选择；

3、按照各个标注功能对图像进行标注；

4、集中编码得到影像标注文件。

与现有技术相比，本发明具有如下有益效果：

1、拥有够读取多种医学影像信息的功能，如MRI图像，CT图像，超声图像，RGB图像。体现了本系统的应用广泛性。

2、拥有多功能的标注功能模块，包括影像分类标签模块、影像感兴趣区域标注模块、影像语义信息分割标注模块。体现了系统的多功能性。

3、并将以上三种标注集合编码于一个文件中。体现数据可持续性与可维护性。

以上所述是本发明的优选实施方式，应当指出，对于本技术领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明原理的前提下，还可以做出若干改进和润饰，这些改进和润饰也视为本发明的保护范围。