具有作为ALK2抑制剂的活性的咪唑并哒嗪化合物

相关申请的交叉引用

本申请要求2020年6月12日提交的名称为“IMIDAZOPYRIDA ZINE COMPOUNDS ANDUSES THEREOF”的临时申请号63/038,410的优先权和利益，所述临时申请的全部内容以引用方式并入本文。

发明领域

本公开提供咪唑并哒嗪化合物以及其组合物和使用方法。这些化合物调节激活素受体样激酶2(ALK2)活性，并且可用于治疗包括癌症在内的各种疾病。

发明背景

骨形态发生蛋白(BMP)信号传导属于转化生长因子β(TGF-β)超家族，并且TGF-β信号传导配体包括超过25种不同的配体：TGF-β生长和分化因子、BMP和激活素。BMP配体的结合导致由两个组成型活性II型受体丝氨酸/苏氨酸激酶(BMPRII、ACTRIIA或ACTRIIB)构成的四聚体受体复合物的组装并激活两种I型受体丝氨酸/苏氨酸激酶(ALK1、ALK2、ALK3或ALK6)。此外，激活的I型受体使BMP受体反应性SMAD蛋白1/5/8磷酸化并且激活的与co-SMAD4相关的SMAD1/5/8易位到细胞核以调节基因转录。(Ross,S.L.等人Cell Metabolism2012,15,905-917；Blobe,G.C.等人New England Journal of Medicine 2000,342,1350-1358)。

BMPR激酶激活素A受体I型(ACVR1)也称为激活素受体样激酶2(ALK2)。它由配体结合胞外结构域和具有丝氨酸/苏氨酸特异性的胞质结构域构成。据报道，ALK2介导多种人类疾病(Massague,J.等人Cell 2000,103,295-309；Taylor,K.R.等人Cancer Research2014,74,4565-4570)。ALK2和ALK3已显示在调节铁调素水平和影响慢性病性贫血方面发挥重要作用(Andriopoulos,B.等人Nature Genetics 200941,482-487；Steinbicker,A.U.等人Blood 2011,118,4224-4230；Steinbicker,A.U.等人Blood 2011,117,4915-4923)。铁调素是主要在肝细胞中合成的小肽激素，并且通过与铁输出蛋白铁转运蛋白(FPN1)结合并诱导其内化和降解来减少十二指肠铁吸收和铁从单核细胞/巨噬细胞的输出(Theurl,I.等人Haematologica 2011,96,1761-1769；Zhao,N.等人Journal of Clinical Investigation2013,123,2337-2343)。血清铁调素水平升高增强了铁在网状内皮系统内的储存，并导致铁可用性降低和铁限制性红细胞生成。不适当增加的铁调素表达会导致人类严重功能性缺铁性贫血，并且是慢性病性贫血(ACD)的病理生理学核心(Weiss,G.等人New EnglandJournal of Medicine 2005,352,1011-1023)。因此，需要调节ALK2活性的新化合物。

发明内容

本公开尤其提供一种式(I)化合物：

或其药学上可接受的盐，其中所有变量如本文所定义。

本公开还提供一种化合物，其选自：2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1R,5S)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶；2-(4-(3-(7-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶-4-基)-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷；2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1S,5R)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶；和2-(4-(6-甲基-3-(7-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶-4-基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷；或其药学上可接受的盐。

本公开还提供了一种药物组合物，其包含本公开的化合物或其药学上可接受的盐以及至少一种药学上可接受的载体或赋形剂。

本公开还提供了一种抑制ALK2活性的方法，其包括使ALK2与本公开的化合物或其药学上可接受的盐接触。

本公开还提供了一种治疗患者的癌症的方法，其包括向所述患者施用治疗有效量的本公开的化合物或其药学上可接受的盐。

本公开还提供了一种治疗患者的癌症的方法，其中所述方法包括向所述患者施用治疗有效量的本公开的化合物或其药学上可接受的盐与另外的治疗剂的组合。

本公开还提供了一种本公开的化合物或其药学上可接受的盐，其用于疗法中。

本公开还提供了本公开的化合物或其药学上可接受的盐用于制备用于本文所述的任何治疗方法的药物的用途。

具体实施方式

化合物

本公开提供一种式(I)化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R

R

在一些实施方案中，其中当R

在一些实施方案中，式(I)化合物选自：

2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1R,5S)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶；

2-(4-(3-(7-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶-4-基)-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷；和

2-(4-(6-甲基-3-(7-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶-4-基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷。

在一些实施方案中，式(I)化合物选自：

2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1R,5S)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶；

2-(4-(3-(7-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶-4-基)-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷；

2-(4-(6-甲基-3-(7-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶-4-基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷；和

2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1S,5R)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶。

在一些实施方案中，本公开提供一种化合物，其为2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1S,5R)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶或其药学上可接受的盐。

应进一步了解，为了清楚起见而在单独实施方案的上下文中描述的本公开的某些特征也可在单个实施方案中组合地提供(虽然实施方案意图如同以多个独立形式书写一般来组合)。相反，为了简明起见而在单个实施方案的上下文中描述的本公开的各种特征也可单独地提供或以任何合适的子组合提供。因此，预期作为式(I)化合物的实施方案描述的特征可以任何合适的组合来进行组合。

本文所述的化合物可以是不对称的(例如，具有一个或多个立体中心)。除非另有说明，否则意指所有立体异构体，诸如对映异构体和非对映异构体。本发明的含有不对称取代碳原子的化合物可以光学活性形式或外消旋形式分离。如何由无光学活性的起始材料制备光学活性形式的方法是本领域已知的，例如通过拆分外消旋混合物或通过立体选择性合成。烯烃的许多几何异构体、C＝N双键等也可存在于本文所述的化合物中，并且所有这些稳定的异构体均在本发明中考虑。描述了本发明化合物的顺式和反式几何异构体，并且这些几何异构体可以作为异构体的混合物或作为分离的异构体形式分离。

化合物的外消旋混合物的拆分可以通过本领域已知的多种方法中的任一种来进行。一种方法包括使用手性拆分酸进行分步重结晶，所述手性拆分酸是光学活性的成盐有机酸。用于分步重结晶方法的合适拆分剂是例如光学活性酸，诸如D和L形式的酒石酸、二乙酰基酒石酸、二苯甲酰基酒石酸、扁桃酸、苹果酸、乳酸或各种光学活性樟脑磺酸，诸如β-樟脑磺酸。适用于分步结晶方法的其他拆分剂包括α-甲基苄胺的立体异构纯形式(例如，S和R形式，或非对映异构纯形式)、2-苯基甘氨醇、去甲麻黄碱、麻黄碱、N-甲基麻黄碱、环己基乙胺、1,2-二氨基环己烷等。

外消旋混合物的拆分也可以通过在装有光学活性拆分剂(例如二硝基苯甲酰基苯基甘氨酸)的柱上进行洗脱来进行。合适的洗脱溶剂组成可以由本领域技术人员确定。

在一些实施方案中，本公开的化合物具有(R)-构型。在其他实施方案中，化合物具有(S)-构型。在具有多于一个手性中心的化合物中，除非另有说明，否则化合物中的每个手性中心可以独立地为(R)或(S)。具有两个手性中心的化合物可以例如具有(R,R)、(R,S)、(S,R)或(S,S)构型。

本公开的化合物还包括互变异构形式。互变异构形式由单键与相邻双键的交换以及质子的伴随迁移引起。互变异构形式包括质子转移互变异构体，其为具有相同经验式和总电荷的异构质子化状态。质子转移互变异构体的实例包括酮-烯醇对、酰胺-亚氨酸对、内酰胺-内酰亚胺对、烯胺-亚胺对以及环状形式，其中质子可占据杂环体系的两个或更多个位置，例如1H-咪唑和3H-咪唑，1H-1,2,4-三唑、2H-1,2,4-三唑和4H-1,2,4-三唑，1H-异吲哚和2H-异吲哚，以及1H-吡唑和2H-吡唑。互变异构形式可以处于平衡或通过适当的取代而空间锁定成一种形式。

本公开的化合物还可以包括存在于中间体或最终化合物中的所有原子同位素。同位素包括原子序数相同但质量数不同的那些原子。例如，氢的同位素包括氚和氘。本公开的化合物的一个或多个组成原子可以被天然或非天然丰度的原子同位素替代或取代。在一些实施方案中，化合物包含至少一个氘原子。例如，本公开化合物中的一个或多个氢原子可被氘替代或取代。在一些实施方案中，化合物包含两个或更多个氘原子。在一些实施方案中，化合物包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氘原子。用于将同位素包含到有机化合物中的合成方法是本领域已知的(Alan F.Thomas的Deuterium Labeling in OrganicChemistry(New York,N.Y.,Appleton-Century-Crofts,1971；Jens Atzrodt,VolkerDerdau,Thorsten Fey和Jochen Zimmermann的The Renaissance of H/D Exchange,Angew.Chem.Int.Ed.2007,7744-7765)。同位素标记的化合物可用于各种研究，诸如NMR光谱、代谢实验和/或测定。

用较重同位素诸如氘进行的取代可提供源自于较大代谢稳定性、例如增加的体内半衰期或减小的剂量要求的某些治疗优势，并且因此在一些情况下可为优选的。(A.Kerekes等人J.Med.Chem.2011,54,201-210；R.Xu等人J.LabelCompd.Radiopharm.2015,58,308-312)。

如本文所用，术语“化合物”意在包括所描绘结构的所有立体异构体、几何异构体、互变异构体和同位素。所述术语还意在指代本公开的化合物，不管它们是如何制备的，例如合成地制备、通过生物过程(例如，代谢或酶转化)制备或其组合。

所有化合物及其药学上可接受的盐可与其他物质诸如水和溶剂(例如水合物和溶剂合物)一起发现或可以分离。当处于固态时，本文描述的化合物及其盐可以以各种形式存在，并且可以例如采取包括水合物在内的溶剂合物的形式。化合物可以是任何固态形式，诸如多晶型物或溶剂合物，因此，除非另有明确说明，否则说明书中对化合物及其盐的引用应理解为涵盖化合物的任何固态形式。

在一些实施方案中，本公开的化合物或其盐是基本上分离的。“基本上分离”意指化合物与形成或检测到化合物的环境至少部分或基本上分离。部分分离可以包括例如富含本公开的化合物的组合物。基本上分离可包括含有至少约50重量％、至少约60重量％、至少约70重量％、至少约80重量％、至少约90重量％、至少约95重量％、至少约97重量％或至少约99重量％本公开的化合物或其盐的组合物。

如本文所用，短语“药学上可接受的”是指在合理的医学判断范围内适于与人和动物的组织接触使用而没有过量毒性、刺激性、过敏反应或其他问题或并发症、与合理的利益/风险比相称的那些化合物、材料、组合物和/或剂型。

如本文所用，表述“环境温度”和“室温”是本领域中理解的，并且通常是指约进行反应的房间内的温度的温度，例如反应温度，例如从约20℃到约30℃的温度。

本发明还包括本文所述化合物的药学上可接受的盐。术语“药学上可接受的盐”是指所公开化合物的衍生物，其中母体化合物通过将现有的酸或碱部分转化为其盐形式而被修饰。药学上可接受的盐的实例包括但不限于碱性残基诸如胺的无机或有机酸盐；酸性残基诸如羧酸的碱金属或有机盐；等等。本发明的药学上可接受的盐包括例如由无毒的无机或有机酸形成的母体化合物的无毒的盐。本发明的药学上可接受的盐可由含有碱性或酸性部分的母体化合物通过常规化学方法合成。通常，此类盐可通过将这些化合物的游离酸或碱形式在水中或有机溶剂中或者二者的混合物中与化学计算量的适当碱或酸反应来制备；通常优选非水介质如醚、乙酸乙酯、醇(例如甲醇、乙醇、异丙醇或丁醇)或乙腈(MeCN)。合适的盐的清单可见于Remington'sPharmaceutical Sciences,第17版,(Mack PublishingCompany,Easton,1985),第1418页,Berge等人,J.Pharm.Sci.,1977,66(1),1-19，以及Stahl等人,Handbook of Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use(Wiley,2002)。在一些实施方案中，本文所述的化合物包括N-氧化物形式。

合成

本公开的化合物(包括其盐)可以使用已知的有机合成技术制备并且可以根据多种可能的合成路线中的任一种合成，诸如以下方案中的那些。

用于制备本文所提供的化合物的反应可在合适的溶剂中进行，所述溶剂可很容易由有机合成领域的技术人员选择。合适的溶剂可以基本上不与起始材料(反应物)、中间体或产物在进行反应的温度(例如温度范围可从溶剂凝固温度到溶剂沸腾温度)下反应。给定的反应可以在一种溶剂或多于一种溶剂的混合物中进行。根据具体反应步骤，技术人员可选择适用于具体反应步骤的溶剂。

本文所提供的化合物的制备可涉及各种化学基团的保护和去保护。保护和去保护的需要及适当的保护基的选择可很容易由本领域的技术人员确定。保护基的化学可见于例如T.W.Greene和P.G.M.Wuts,Protective Groups in Organic Synthesis,第3版,Wiley&Sons,Inc.,New York(1999)，所述参考文献以引用的方式整体并入本文。

反应可根据本领域已知的任何合适方法监测。例如，产物形成可通过光谱手段，诸如核磁共振光谱法(如，

如本文所公开的化合物可由本领域技术人员根据文献中已知的制备路线并根据各种可能的合成路线来制备。以下方案中提供了用于制备本申请的化合物的示例性合成方法。

一系列咪唑并[1,2-b]哒嗪衍生物7可以根据方案1中概述的程序制备。氨基哒嗪3可以通过使二氯哒嗪1与二苯基甲酮亚胺发生钯催化胺化(Tetrahedron Lett.1997,38,6367-6370)，随后在酸性条件下水解来获得。氨基哒嗪3与2-氯乙醛发生环化加成，得到咪唑并[1,2-b]哒嗪4，通过用NIS处理可以将其转化为对应的咪唑并[1,2-b]哒嗪碘化物5。与硼酸或硼酸酯R

方案1

一系列咪唑并[1,2-b]哒嗪-6-甲酰胺衍生物12可以根据方案2中概述的程序来制备。根据方案1中概述的程序制备的咪唑并[1,2-b]哒嗪-6-甲酸甲酯10可以通过水解转化为对应的酸11。所述酸11可以随后通过使用酰胺化偶联试剂与适当的胺偶联来转化为所需咪唑并[1,2-b]哒嗪-6-甲酰胺衍生物12，所述酰胺化偶联试剂诸如但不限于(苯并三唑-1-基氧基)三(二甲基氨基)鏻六氟磷酸盐(BOP)、(苯并三唑-1-基氧基)三吡咯烷基鏻六氟磷酸盐(PyBOP)、1-[双(二甲基氨基)亚甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓3-氧化物六氟磷酸盐(HATU)或N,N,N',N'-四甲基-O-(1H-苯并三唑-1-基)脲鎓六氟磷酸盐(HBTU)。

方案2

一系列咪唑并[1,2-b]哒嗪-6-甲腈衍生物18可以根据方案3中概述的程序制备。根据方案1中概述的程序制备的咪唑并[1,2-b]哒嗪-6-甲酸甲酯13可以通过水解转化为对应的酸14。酸14可以随后通过使用酰胺化偶联试剂诸如HATU与氯化铵偶联来转化为咪唑并[1,2-b]哒嗪-6-甲酰胺15。在三乙胺和三苯基氧化膦存在下用草酰氯处理化合物15，可以得到化合物16，然后可以通过用NIS处理来将所述化合物转化为对应的碘化物17。与合适的硼酸或硼酸酯R

方案3

一系列咪唑并[1,2-b]哒嗪衍生物23可以根据方案4中概述的程序来制备。根据方案1中概述的程序制备的7-氯咪唑并[1,2-b]哒嗪-6-甲酸甲酯19可以通过还原来转化为对应的醇20。醇20可以随后通过与硼酸或硼酸酯R

方案4

将通过具体实施例更详细地描述本发明。以下实施例出于说明目的而提供，并且不旨在以任何方式限制本发明。本领域的技术人员将很容易认识到多种非关键性参数，所述参数可被改变或修改以产生基本上相同的结果。实施例的化合物描述如下。

使用方法

本公开提供了一种调节(例如，抑制)ALK2活性的方法，其通过使本发明的化合物(或其盐)与ALK2接触来进行。接触可以在体内或体外进行。在一些实施方案中，抑制ALK2活性的方法包括例如向患者施用本文提供的化合物或其药学上可接受的盐。本公开的化合物可以单独使用，与其他剂或疗法组合使用或作为佐剂或新佐剂使用，用于治疗疾病或病症(包括癌症)。对于本文所述的用途，可以使用本公开的任何化合物，包括其任何实施方案。

在骨髓纤维化(MF)中，很大一部分患者会出现贫血并依赖于频繁的红细胞(RBC)输血(Tefferi,A.等人Mayo Clinic Proceedings 2012 87,25-33)。已证实患有MF的患者的血清铁调素水平升高与血红蛋白(Hb)水平、RBC输血需求增加和存活率降低相关(Pardanani,A.等人American Journal of Hematology 2013,88,312-316)。BMP信号传导通过激活SMAD信号传导在驱动铁调素转录诱导中起核心作用。在贫血小鼠模型中，ALK2或ALK3的肝脏特异性缺失可阻断铁调素产生和铁过载的诱导(Steinbicker,A.U.等人Blood2011,118,4224-4230)。因此，ALK2抑制可与鲁索替尼(ruxolitinib)组合用于治疗MF患者，因为铁调素介导的FPN1内化和降解可能不需要JAK2的作用(Ross,S.L.等人CellMetabolism 2012,15,905-917)。ALK2抑制可能会阻断铁调素对铁代谢的负面影响并改善MF患者的贫血(Asshoff,M.等人Blood 2017,129,1823-1830)。

进行性骨化性纤维发育不良(FOP)是一种人类罕见的遗传性骨病，并且患者的特征在于通过软骨内骨化形成骨骼外骨(Yu,P.B.等人Nature Medicine 2008,14,1363-1369；Fukuda,T.等人Journal of Biological Chemistry 2009 284,7149-7156)。95％FOP患者存在ACVR1/ALK2的点突变并且对经典FOP的反应性突变是在ALK2的富含甘氨酸和丝氨酸(GS)细胞内结构域中617G>A(R206H)(Shen,Q.等人Journal of ClinicalInvestigation 2009,119,3462-3472)。非典型FOP患者的ALK2突变也可见于GS结构域或蛋白激酶结构域的其他氨基酸中(Fukuda,T.等人Biochemical and BiophysicalResearchCommunications 2008,377,905-909)。已证实不同的ALK2突变体在没有外源性BMP配体的情况下组成性地激活BMP信号传导，并且这些ALK2突变体可以在配体刺激时传递更强的BMP信号传导(Van Dinther,M.等人Journal of Bone and Mineral Research 2010,25,1208-1215)。

在弥漫性内生型桥脑胶质瘤(DIPG)中也鉴定出了ALK2的激活性突变，所述DIPG是儿科人群桥脑腹侧的高侵袭性胶质瘤。据报道，ALK2是DIPG中最常发生突变的基因之一。在195例病例中的46例(24％)中发现了ALK2在五个特定残基处携带非同义杂合体细胞突变。具有ALK2突变的患者主要是女性(大约2:1)并且与野生型IDPG相比，发病年龄更小(约5岁)，总存活时间更长(约15个月)。这些ALK2突变体对DIPG具有高特异性，并且ALK2抑制剂LDN-19318917导致那些ALK2突变体DIPG细胞活力受到显著抑制(Taylor,K.R.等人NatureGenetics 2014,46,457-461；Buczkowicz,P.等人Nature Genetics2014,46,451-456)。

治疗与ALK2的表达或活性相关的疾病或病症的方法可以包括向有需要的患者施用治疗有效量的本文提供的化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中，所述疾病或病症为癌症。可使用本公开的化合物治疗的癌症的实例包括但不限于骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头颈癌、皮肤或眼内恶性黑素瘤、子宫癌、卵巢癌、直肠癌、肛区癌、胃癌、睾丸癌、子宫癌、输卵管癌、子宫内膜癌(carcinoma of the endometrium)、子宫内膜癌(endometrialcancer)、子宫颈癌、阴道癌、外阴癌、霍奇金氏病、非霍奇金氏淋巴瘤、食道癌、小肠癌、内分泌系统癌症、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、软组织肉瘤、尿道癌、阴茎癌、慢性或急性白血病(包括急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病、急性淋巴母细胞性白血病、慢性淋巴细胞性白血病)、儿童实体瘤、淋巴细胞性淋巴瘤、膀胱癌、肾或尿道癌、肾盂癌、中枢神经系统肿瘤(CNS)、原发性CNS淋巴瘤、肿瘤血管生成、脊轴肿瘤、脑干胶质瘤、垂体腺瘤、卡波西氏肉瘤、表皮样癌、鳞状细胞癌、T细胞淋巴瘤、环境诱导的癌症(包括由石棉诱导的那些)以及所述癌症的组合。

在一些实施方案中，可用本公开的化合物治疗的癌症包括黑素瘤(例如，转移性恶性黑素瘤)、肾癌(例如透明细胞癌)、前列腺癌(例如激素难治性前列腺腺癌)、乳腺癌、三阴性乳腺癌、结肠癌和肺癌(例如非小细胞肺癌和小细胞肺癌)。此外，本公开包括可使用本公开的化合物抑制其生长的难治性或复发性恶性肿瘤。

在一些实施方案中，可使用本公开的化合物治疗的癌症包括但不限于实体瘤(例如，前列腺癌、结肠癌、食道癌、子宫内膜癌、卵巢癌、子宫癌、肾癌、肝癌、胰腺癌、胃癌、乳腺癌、肺癌、头颈癌、甲状腺癌、胶质母细胞瘤、肉瘤、膀胱癌等)、血液系统癌症(例如淋巴瘤、白血病如急性淋巴母细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、慢性髓细胞性白血病(CML)、DLBCL、套细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤(包括复发性或难治性NHL和复发性滤泡性淋巴瘤)、霍奇金淋巴瘤或多发性骨髓瘤)和所述癌症的组合。

在一些实施方案中，可使用本公开的化合物治疗的疾病和适应症包括但不限于血液系统癌症、肉瘤、肺癌、胃肠道癌症、泌尿生殖道癌症、肝癌、骨癌、神经系统癌症、妇科癌症和皮肤癌。

示例性血液系统癌症包括淋巴瘤和白血病，诸如急性淋巴母细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、急性早幼粒细胞白血病(APL)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、慢性髓细胞性白血病(CML)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、套细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤(包括复发性或难治性NHL和复发性滤泡性淋巴瘤)、霍奇金淋巴瘤、骨髓增生性疾病(例如，原发性骨髓纤维化(PMF)、真性红细胞增多症(PV)、原发性血小板增多症(ET))、骨髓增生异常综合征(MDS)、T细胞急性淋巴母细胞性淋巴瘤(T-ALL)、多发性骨髓瘤、皮肤T细胞淋巴瘤、华氏巨球蛋白血症(Waldenstrom's Macroglubulinemia)、毛细胞淋巴瘤、慢性骨髓性淋巴瘤和伯基特淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)。

示例性肉瘤包括软骨肉瘤、尤文氏肉瘤(Ewing’s sarcoma)、骨肉瘤、横纹肌肉瘤、血管肉瘤、纤维肉瘤、脂肪肉瘤、粘液瘤、横纹肌瘤、横纹肉瘤、纤维瘤、脂肪瘤、错构瘤和畸胎瘤。示例性肉瘤还包括淋巴肉瘤和平滑肌肉瘤。

示例性肺癌包括非小细胞肺癌(NSCLC)、小细胞肺癌、支气管癌(鳞状细胞、未分化小细胞、未分化大细胞、腺癌)、肺泡(细支气管)癌、支气管腺瘤、软骨瘤样错构瘤和间皮瘤。示例性肺癌还包括小细胞(pavicellular)癌和非小细胞癌、支气管腺瘤和胸膜肺母细胞瘤。

示例性胃肠道癌症包括食道癌(鳞状细胞癌、腺癌、平滑肌肉瘤、淋巴瘤)、胃癌(癌、淋巴瘤、平滑肌肉瘤)、胰腺癌(外分泌胰腺癌、导管腺癌、胰岛瘤、胰高血糖素瘤、胃泌素瘤、类癌瘤、血管活性肠肽瘤)、小肠癌(腺癌、淋巴瘤、类癌瘤、卡波西氏肉瘤、平滑肌瘤、血管瘤、脂肪瘤、神经纤维瘤、纤维瘤)、大肠癌(腺癌、管状腺瘤、绒毛状腺瘤、错构瘤、平滑肌瘤)和结肠直肠癌。示例性胃肠道癌症还包括胆囊癌和肛门癌。

示例性泌尿生殖道癌症包括肾癌(腺癌、维尔姆斯氏肿瘤[肾母细胞瘤])、膀胱和尿道癌(鳞状细胞癌、移行细胞癌、腺癌)、前列腺癌(腺癌、肉瘤)和睾丸癌(精原细胞瘤、畸胎瘤、胚胎癌、畸胎癌、绒毛膜癌、肉瘤、间质细胞癌、纤维瘤、纤维腺瘤、腺瘤样肿瘤、脂肪瘤)。示例性泌尿生殖道癌症还包括肾细胞癌和尿路上皮癌。

示例性肝癌包括肝细胞癌(hepatoma)(肝细胞癌(hepatocellular carcinoma))、胆管癌、肝母细胞瘤、血管肉瘤、肝细胞腺瘤和血管瘤。

示例性骨癌包括例如骨肉瘤(osteogenic sarcoma)(骨肉瘤(osteosarcoma))、纤维肉瘤、恶性纤维组织细胞瘤、软骨肉瘤、尤文氏肉瘤、恶性淋巴瘤(网状细胞肉瘤)、多发性骨髓瘤、恶性巨细胞瘤、脊索瘤、骨软骨瘤(骨软骨性外生骨疣)、良性软骨瘤、软骨母细胞瘤、软骨粘液纤维瘤、骨样骨瘤和巨细胞瘤。

示例性神经系统癌症包括颅骨癌(骨瘤、血管瘤、肉芽肿瘤、黄色瘤、畸形性骨炎)、脑膜癌(脑膜瘤、脑膜肉瘤、胶质瘤病)、脑癌(星形细胞瘤、髓母细胞瘤、胶质瘤、室管膜瘤、生殖细胞瘤(松果体瘤)、胶质母细胞瘤、多形性胶质母细胞瘤、少突胶质细胞瘤、神经鞘瘤、视网膜母细胞瘤、先天性肿瘤)和脊髓癌(神经纤维瘤、脑膜瘤、胶质瘤、肉瘤)以及神经母细胞瘤和Lhermitte-Duclos病。示例性神经系统癌症还包括神经外胚层肿瘤和松果体肿瘤。

示例性妇科癌症包括子宫癌(子宫内膜癌)、子宫颈癌(宫颈癌、瘤前宫颈发育不良)、卵巢癌(卵巢癌(浆液性囊腺癌、粘液性囊腺癌、未分类癌)、粒层-卵泡膜细胞瘤、塞莱二氏(Sertoli-Leydig)细胞瘤、无性细胞瘤、恶性畸胎瘤)、外阴癌(鳞状细胞癌、上皮内癌、腺癌、纤维肉瘤、黑素瘤)、阴道癌(透明细胞癌、鳞状细胞癌、葡萄状肉瘤(胚胎性横纹肌肉瘤)和输卵管癌(癌)。示例性神经系统癌症还包括神经外胚层肿瘤和松果体肿瘤。

示例性皮肤癌包括黑素瘤、基底细胞癌、鳞状细胞癌、卡波西氏肉瘤、梅克尔细胞皮肤癌(Merkel cell skin cancer)、痣发育不良痣、脂肪瘤、血管瘤、皮肤纤维瘤和瘢痕疙瘩。在一些实施方案中，可使用本公开的化合物治疗的疾病和适应症包括但不限于镰状细胞病(例如，镰状细胞性贫血)、三阴性乳腺癌(TNBC)、骨髓增生异常综合征、睾丸癌、胆管癌、食道癌和尿路上皮癌。

示例性头颈癌包括胶质母细胞瘤、黑素瘤、横纹肉瘤、淋巴肉瘤、骨肉瘤、鳞状细胞癌、腺癌、口腔癌、喉癌、鼻咽癌、鼻癌和鼻旁癌、甲状腺癌和甲状旁腺癌。示例性头颈癌还包括眼部肿瘤、唇部和嘴部肿瘤以及鳞状头颈癌。

本公开的化合物还可用于抑制肿瘤转移。在一些实施方案中，本文提供的化合物可用于治疗产生PGE2(例如过表达Cox-2的肿瘤)和/或腺苷(过表达CD73和CD39的肿瘤)的肿瘤。已在许多肿瘤中检测到Cox-2的过表达，所述肿瘤诸如结肠直肠癌、乳腺癌、胰腺癌和肺癌，在所述肿瘤中它与不良预后相关。Cox-2的过表达已在血液癌症模型诸如RAJI(伯基特淋巴瘤)和U937(急性原单核细胞白血病)以及患者的胚细胞中被报道。CD73在各种人类癌症中上调，所述癌症包括结肠癌、肺癌、胰腺癌和卵巢癌。重要的是，CD73的较高表达水平与肿瘤新血管形成、侵袭性和转移以及较短的乳腺癌患者存活时间相关。

术语“个体”或“患者”可互换使用，是指任何动物，包括哺乳动物，优选地小鼠、大鼠、其他啮齿类动物、兔、狗、猫、猪、牛、羊、马或灵长类动物，且最优选地为人。

短语“治疗有效量”是指引起组织、系统、动物、个体或人的由研究员、兽医、医学博士或其他临床医师寻求的生物或医学反应的活性化合物或药剂的量。

如本文所用，术语“治疗(treating/treatment)”是指以下的一种或多种：(1)抑制疾病；例如，抑制正在经历或表现出疾病、病状或病症的病理或症状的个体的疾病、病状或病症(即，阻止病理和/或症状的进一步发展)；和(2)减轻疾病；例如，减轻正在经历或表现出疾病、病状或病症的病理或症状的个体的疾病、病状或病症(即，逆转病理和/或症状)，诸如降低疾病的严重性。

如本文所用，术语“接触”是指在体外系统或体内系统中将指定的化合物置于一起，使得它们在物理上足够接近以进行相互作用。

在一些实施方案中，本公开的化合物可用于预防发展本文提及的任何疾病或降低其风险；例如，预防可能易患疾病、病状或病症但尚未经历或未表现出疾病的病理或症状的个体发展疾病、病状或病症或降低其风险。

组合疗法

一种或多种其他药剂或治疗方法，例如像抗病毒剂、化学治疗剂或其他抗癌剂、免疫增强剂、免疫抑制剂、辐射、抗肿瘤和抗病毒疫苗、细胞因子疗法(例如，IL2、GM-CSF等)和/或酪氨酸激酶抑制剂，可以与本文所述的化合物组合用于治疗ALK2相关疾病、病症或病状或本文所述的疾病或病状。所述剂可以与本发明化合物组合于单一剂型中，或者所述剂可以作为单独剂型同时或依序施用。

I.免疫检查点疗法

在一些实施方案中，本文提供的化合物可与一种或多种免疫检查点抑制剂组合使用，用于治疗如本文所述的癌症。本公开的化合物可以与一种或多种免疫检查点抑制剂组合使用。示例性免疫检查点抑制剂包括针对免疫检查点分子诸如CD20、CD28、CD39、CD40、CD122、CD96、CD73、CD47、GITR、CSF1R、JAK、PI3Kδ、PI3Kγ、TAM、精氨酸酶、CD137(也称为4-1BB)、ICOS、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、LAG3、TIM3、VISTA、TIGIT、PD-1、PD-L1和PD-L2的抑制剂。在一些实施方案中，免疫检查点分子是选自CD27、CD28、CD40、ICOS、OX40、GITR和CD137的刺激性检查点分子。在一些实施方案中，免疫检查点分子是选自A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、IDO、KIR、LAG3、PD-1、TIM3、TIGIT和VISTA的抑制性检查点分子。在一些实施方案中，本文提供的本公开的化合物可与选自KIR抑制剂、TIGIT抑制剂、LAIR1抑制剂、CD160抑制剂、2B4抑制剂和TGFRβ抑制剂的一种或多种剂组合使用。

在一些实施方案中，本文提供的化合物可以与免疫检查点分子，例如OX40、CD27、GITR和CD137(也称为4-1BB)的一种或多种激动剂组合使用。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是抗PD1抗体、抗PD-L1抗体或抗CTLA-4抗体。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是PD-1的抑制剂，例如抗PD-1单克隆抗体。在一些实施方案中，抗PD-1单克隆抗体是纳武单抗(nivolumab)、派姆单抗(pembrolizumab，也称为MK-3475)、德瓦鲁单抗(durvalumab,

在一些实施方案中，本公开的化合物可以与INCB086550组合使用。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是抗PD1抗体、抗小分子PD-L1抗体或抗CTLA-4抗体抑制剂。在一些实施方案中，小分子PD-L1抑制剂在美国专利公布号US20170107216、US20170145025、US 20170174671、US 20170174679、US 20170320875、US20170342060、US 20170362253、US 20180016260、US 20180057486、US 20180177784、US20180177870、US 20180179179、US 20180179197、US 20180179201和US 20180179202中描述的PD-L1测定中具有小于1μM、小于100nM、小于10nM或小于1nM的IC

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是PD-L1的抑制剂，例如抗PD-L1单克隆抗体。在一些实施方案中，抗PD-L1单克隆抗体是BMS-935559、MEDI4736、MPDL3280A(也称为RG7446)或MSB0010718C。在一些实施方案中，抗PD-L1单克隆抗体是MPDL3280A或MEDI4736。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是PD-1和PD-L1的抑制剂，例如抗PD-1/PD-L1单克隆抗体。在一些实施方案中，抗PD-1/PD-L1是MCLA-136。

在一些实施方案中，抑制剂是MCLA-145。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是CTLA-4的抑制剂，例如抗CTLA-4抗体。在一些实施方案中，抗CTLA-4抗体是伊匹单抗、曲美木单抗(tremelimumab)、AGEN1884或CP-675,206。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是CSF1R的抑制剂，例如抗CSF1R抗体。在一些实施方案中，抗CSF1R抗体是IMC-CS4或RG7155。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是LAG3的抑制剂，例如抗LAG3抗体。在一些实施方案中，抗LAG3抗体是BMS-986016、LAG525、IMP321、GSK2831781或INCAGN2385。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是TIM3的抑制剂，例如抗TIM3抗体。在一些实施方案中，抗TIM3抗体是INCAGN2390、MBG453或TSR-022。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是GITR的抑制剂，例如抗GITR抗体。在一些实施方案中，抗GITR抗体是TRX518、MK-4166、INCAGN1876、MK-1248、AMG228、BMS-986156、GWN323或MEDI1873。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是OX40的激动剂，例如OX40激动剂抗体或OX40L融合蛋白。在一些实施方案中，抗OX40抗体是MEDI0562、MEDI6469、MOXR-0916、PF-04518600、GSK3174998或BMS-986178。在一些实施方案中，OX40L融合蛋白是MEDI6383。

在一些实施方案中，免疫检查点分子的抑制剂是CD20的抑制剂，例如抗CD20抗体。在一些实施方案中，抗CD20抗体是奥比妥珠单抗(obinutuzumab)或利妥昔单抗(rituximab)。

本公开的化合物可以与双特异性抗体组合使用。在一些实施方案中，双特异性抗体的结构域之一靶向PD-1、PD-L1、CTLA-4、GITR、OX40、TIM3、LAG3、CD137、ICOS、CD3或TGFβ受体。

在一些实施方案中，本公开的化合物可与一种或多种代谢酶抑制剂组合使用。在一些实施方案中，代谢酶抑制剂是IDO1、TDO或精氨酸酶的抑制剂。IDO1抑制剂的实例包括艾卡哚司他(epacadostat)、NLG919、BMS-986205、PF-06840003、IOM2983、RG-70099和LY338196。精氨酸酶抑制剂的实例是CB-1158。

如通篇所提供的，另外的化合物、抑制剂、剂等可与本发明化合物组合于单一剂型或连续剂型中，或者它们可作为单独剂型同时或依序施用。

II.癌症疗法

癌细胞生长和存活可能受到多种信号传导通路的影响。因此，有用的是将不同的酶/蛋白质/受体抑制剂组合以治疗此类病状，所述抑制剂在它们调节酶/蛋白质/受体活性的靶标中表现出不同的偏好。可与本公开的化合物组合的剂的实例包括PI3K-AKT-mTOR通路的抑制剂、Raf-MAPK通路的抑制剂、JAK-STAT通路的抑制剂、β连环蛋白通路的抑制剂、notch通路的抑制剂、hedgehog通路的抑制剂、Pim激酶的抑制剂以及蛋白伴侣和细胞周期进程的抑制剂。靶向多于一个信号传导通路(或给定的信号传导通路中涉及的多于一个生物分子)可以降低细胞群中产生耐药性的可能性，和/或降低治疗的毒性。

本公开的化合物可与一种或多种其他酶/蛋白质/受体抑制剂组合使用，用于治疗疾病，诸如癌症。癌症的实例包括实体瘤和液体瘤，诸如血癌。例如，本公开的化合物可与以下激酶的一种或多种抑制剂组合用于治疗癌症：Akt1、Akt2、Akt3、TGF-βR、Pim、PKA、PKG、PKC、CaM激酶、磷酸化酶激酶、MEKK、ERK、MAPK、mTOR、EGFR、HER2、HER3、HER4、INS-R、IGF-1R、IR-R、PDGFαR、PDGFβR、CSFIR、KIT、FLK-II、KDR/FLK-1、FLK-4、flt-1、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、HPK、c-Met、Ron、Sea、TRKA、TRKB、TRKC、FLT3、VEGFR/Flt2、Flt4、EphA1、EphA2、EphA3、EphB2、EphB4、Tie2、Src、Fyn、Lck、Fgr、Btk、Fak、SYK、FRK、JAK、ABL和B-Raf。在一些实施方案中，本公开的化合物可以与一种或多种以下抑制剂组合用于治疗癌症。可与本公开的化合物组合用于治疗癌症的抑制剂的非限制性实例包括FGFR抑制剂(FGFR1、FGFR2、FGFR3或FGFR4，例如AZD4547、BAY1187982、ARQ087、BGJ398、BIBF1120、TKI258、德立替尼(lucitanib)、多韦替尼(dovitinib)、TAS-120、JNJ-42756493、Debio1347、INCB54828、INCB62079和INCB63904)、JAK抑制剂或Janus激酶抑制剂(JAK1和/或JAK2，例如鲁索替尼、巴瑞替尼(baricitinib)、托法替尼(tofacitinib)、INCB39110、CYT387、GLPG0634、来他替尼(lestaurtinib)、帕西替尼(pacritinib)、TG101348或JAK1选择性抑制剂)、IDO抑制剂(例如艾卡哚司他和NLG919)、LSD1抑制剂(例如GSK2979552、INCB59872和INCB60003)、TDO抑制剂、PI3K-δ抑制剂(例如，INCB50797和INCB50465)、PI3K-γ抑制剂诸如PI3K-γ选择性抑制剂、CSF1R抑制剂(例如，PLX3397和LY3022855)、TAM受体酪氨酸激酶(Tyro-3、Axl和Mer)、血管生成抑制剂、白介素受体抑制剂、溴和额外末端家族成员抑制剂(例如溴结构域抑制剂或BET抑制剂，诸如OTX015、CPI-0610、INCB54329和INCB57643)和腺苷受体拮抗剂或其组合。HDAC抑制剂，诸如帕比司他(panobinostat)和伏立诺他(vorinostat)。c-Met抑制剂，诸如奥那妥组单抗(onartumzumab)、替凡替尼(tivantnib)和INC-280。BTK抑制剂，诸如依鲁替尼(ibrutinib)。mTOR抑制剂，诸如雷帕霉素(rapamycin)、西罗莫司(sirolimus)、替西罗莫司(temsirolimus)和依维莫司(everolimus)。Raf抑制剂，诸如威罗非尼(vemurafenib)和达拉非尼(dabrafenib)。MEK抑制剂，诸如曲美替尼(trametinib)、司美替尼(selumetinib)和GDC-0973。Hsp90(例如，替拉替尼(tanespimycin))、细胞周期蛋白依赖性激酶(例如，帕博西尼(palbociclib))、PARP(例如，奥拉帕尼(olaparib))和Pim激酶(LGH447、INCB053914和SGI-1776)的抑制剂也可以与本公开的化合物组合。

在一些实施方案中，Janus激酶抑制剂可以包括鲁索替尼、托法替尼、巴瑞替尼、CYT387、GLPG0634、来他替尼、帕西替尼、TG101348或JAK1选择性抑制剂。

在一些实施方案中，Janus激酶抑制剂可以包括托法替尼、巴瑞替尼、CYT387、GLPG0634、来他替尼、帕西替尼、TG101348或JAK1选择性抑制剂。

在一些实施方案中，本公开的化合物可以与一种或多种Janus激酶(JAK)抑制剂(JAK1和/或JAK2，例如鲁索替尼、巴瑞替尼或伊他替尼(itacitinib))组合。在一些实施方案中，本公开的化合物可以与一种或多种JAK抑制剂(JAK1和/或JAK2，例如鲁索替尼、巴瑞替尼或伊他替尼)组合，用于治疗癌症，诸如骨髓增生性疾病。例如，骨髓增生性疾病是骨髓纤维化。在一些实施方案中，本公开的化合物可以与鲁索替尼或其药学上可接受的盐组合。在一些实施方案中，本公开的化合物可以与鲁索替尼或其药学上可接受的盐组合，用于治疗骨髓增生性疾病，诸如骨髓纤维化。

本公开的化合物可以与一种或多种剂组合用于治疗诸如癌症的疾病。在一些实施方案中，所述剂是烷化剂、蛋白酶体抑制剂、皮质类固醇或免疫调节剂。烷化剂的实例包括苯达莫司汀(bendamustine)、氮芥(nitrogen mustard)、乙烯亚胺衍生物、烷基磺酸盐、亚硝基脲和三氮烯、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)、氮芥(chlormethine)、环磷酰胺(CytoxanTM)、异环磷酰胺、美法仑、苯丁酸氮芥、哌泊溴烷(pipobroman)、三乙烯-三聚氰胺、三亚乙基硫代磷酰胺、白消安、卡莫司汀(carmustine)、洛莫司汀(lomustine)、链脲佐菌素、达卡巴嗪和替莫唑胺。在一些实施方案中，蛋白酶体抑制剂是卡非佐米(carfilzomib)。在一些实施方案中，皮质类固醇是地塞米松(DEX)。在一些实施方案中，免疫调节剂是来那度胺(lenalidomide，LEN)或泊马度胺(pomalidomide，POM)。

本公开的化合物可进一步与治疗癌症的其他方法组合使用，例如通过化学疗法、放射疗法、肿瘤靶向疗法、辅助疗法、免疫疗法或手术。免疫疗法的实例包括细胞因子治疗(例如，干扰素、GM-CSF、G-CSF、IL-2)、CRS-207免疫疗法、癌症疫苗、单克隆抗体、过继性T细胞转移、作为T细胞激活强化剂的CAR(嵌合抗原受体)T细胞治疗、溶瘤病毒疗法和免疫调节小分子，包括沙利度胺(thalidomide)或JAK1/2抑制剂等。化合物可以与一种或多种抗癌药物诸如化学治疗剂组合施用。化学治疗剂的实例包括以下中的任一者：阿巴瑞克(abarelix)、阿比特龙(abiraterone)、阿法替尼、阿柏西普(aflibercept)、阿地白介素、阿仑单抗(alemtuzumab)、阿利维A酸、别嘌呤醇、六甲密胺、安吖啶、阿那曲唑、阿非科林(aphidicolon)、三氧化二砷、天冬酰胺酶、阿西替尼(axitinib)、阿扎胞苷、贝伐单抗、贝沙罗汀、巴瑞替尼、比卡鲁胺、博来霉素、硼替佐米(bortezombi)、硼替佐米(bortezomib)、布立尼布(brivanib)、布帕拉里斯(buparlisib)、静脉内注射白消安、口服白消安、卡普睾酮、伊立替康(camptosar)、卡培他滨、卡铂、卡莫司汀、西地尼布(cediranib)、西妥昔单抗、苯丁酸氮芥、顺铂、克拉屈滨、氯法拉滨、克唑替尼(crizotinib)、环磷酰胺、阿糖胞苷、达卡巴嗪、达克替尼(dacomitinib)、更生霉素、达肝素钠、达沙替尼、放线菌素、柔红霉素、地西他滨、地加瑞克(degarelix)、地尼白介素、地尼白介素-毒素连接物(denileukin diftitox)、脱氧助间型霉素(deoxycoformycin)、右雷佐生、多西他赛、多柔比星、卓洛昔芬(droloxafine)、丙酸屈他雄酮、依库丽单抗(eculizumab)、恩杂鲁胺(enzalutamide)、表鬼臼毒素(epidophyllotoxin)、表柔比星、埃博霉素(epothilones)、埃罗替尼、雌莫司汀、磷酸依托泊苷、依托泊苷、依西美坦、柠檬酸芬太尼、非格司亭、氟尿苷、氟达拉滨、氟尿嘧啶、氟他胺、氟维司群、吉非替尼、吉西他滨、吉妥珠单抗奥唑米星、醋酸戈舍瑞林、醋酸组氨瑞林、替伊莫单抗、伊达比星、艾代拉里斯(idelalisib)、异环磷酰胺、甲磺酸伊马替尼、干扰素α2a、伊立替康、二苯磺酸拉帕替尼、来那度胺、来曲唑、甲酰四氢叶酸、醋酸亮丙瑞林、左旋咪唑、洛莫司汀、氮芥、醋酸甲地孕酮、美法仑、巯嘌呤、甲氨蝶呤、甲氧沙林、光神霉素、丝裂霉素C、米托坦、米托蒽醌、苯丙酸诺龙、长春瑞滨、耐昔妥珠单抗(necitumumab)、奈拉滨、诺拉替尼(neratinib)、尼罗替尼(nilotinib)、尼鲁米特(nilutamide)、若莫单抗(nofetumomab)、戈舍瑞林(oserelin)、奥沙利铂、紫杉醇、帕米膦酸盐、帕尼单抗(panitumumab)、帕唑帕尼(pazopanib)、培门冬酶、非格司亭、培美曲塞二钠、喷司他丁、皮拉利司(pilaralisib)、哌泊溴烷、普卡霉素、帕纳替尼(ponatinib)、卟吩姆钠(porfimer)、强的松、丙卡巴肼、喹吖因、兰尼单抗(ranibizumab)、拉布立酶、瑞戈非尼(regorafenib)、雷洛昔芬(reloxafine)、来那度胺(revlimid)、利妥昔单抗、鲁索替尼、索拉非尼、链佐星、舒尼替尼、马来酸舒尼替尼、他莫昔芬、替加氟、替莫唑胺、替尼泊苷、睾内酯、沙利度胺、硫鸟嘌呤、塞替派、托泊替康、托瑞米芬、托西莫单抗、曲妥珠单抗、维甲酸、曲普瑞林(triptorelin)、尿嘧啶氮芥、戊柔比星、凡德他尼(vandetanib)、长春碱、长春新碱、长春地辛、长春瑞滨、伏立诺他和唑来膦酸盐。

其他抗癌剂包括抗体治疗剂(诸如曲妥珠单抗(赫赛汀))、共刺激分子(诸如CTLA-4)的抗体(例如，伊匹单抗或曲美木单抗)、4-1BB、PD-1和PD-L1的抗体或细胞因子(IL-10、TGF-β等)的抗体。可与本公开的化合物组合用于治疗癌症或感染诸如病毒、细菌、真菌和寄生虫感染的PD-1和/或PD-L1的抗体的实例包括但不限于纳武单抗、派姆单抗、MPDL3280A、MEDI-4736和SHR-1210。

其他抗癌剂包括与细胞增殖性疾病相关的激酶的抑制剂。这些激酶包括但不限于Aurora-A、CDK1、CDK2、CDK3、CDK5、CDK7、CDK8、CDK9、肝配蛋白(ephrin)受体激酶、CHK1、CHK2、SRC、Yes、Fyn、Lck、Fer、Fes、Syk、Itk、Bmx、GSK3、JNK、PAK1、PAK2、PAK3、PAK4、PDK1、PKA、PKC、Rsk和SGK。

其他抗癌剂还包括阻断免疫细胞迁移的那些，诸如趋化因子受体(包括CCR2和CCR4)的拮抗剂。

本公开的化合物可以进一步与一种或多种抗炎剂、类固醇、免疫抑制剂或治疗性抗体组合使用。类固醇包括但不限于17α-炔雌醇、己烯雌酚、睾酮、强的松、氟甲睾酮、甲基强的松龙、甲基睾酮、强的松龙、曲安西龙、氯烯雌醚、羟孕酮、氨鲁米特和醋酸甲羟孕酮。

本公开的化合物还可以与洛那法尼(lonafarnib,SCH6636)、替比法尼(tipifarnib,R115777)、L778123、BMS 214662、替扎他滨(tezacitabine,MDL 101731)、SmL1、triapine、didox、三米多斯(trimidox)和阿米达斯(amidox)组合使用。

本文所述的化合物可以与另一种免疫原性剂，诸如癌细胞、纯化的肿瘤抗原(包括重组蛋白、肽和碳水化合物分子)、细胞和用编码免疫刺激细胞因子的基因转染的细胞组合。可使用的肿瘤疫苗的非限制性实例包括黑素瘤抗原的肽，诸如gp100、MAGE抗原、Trp-2、MARTI和/或酪氨酸酶的肽，或经转染以表达细胞因子GM-CSF的肿瘤细胞。

本文所述的化合物可以与疫苗接种方案组合使用，用于治疗癌症。在一些实施方案中，肿瘤细胞被转导以表达GM-CSF。在一些实施方案中，肿瘤疫苗包括来自与人类癌症有关的病毒的蛋白质，所述病毒诸如人乳头状瘤病毒(HPV)、肝炎病毒(HBV和HCV)和卡波西氏疱疹肉瘤病毒(KHSV)。在一些实施方案中，本公开的化合物可与肿瘤特异性抗原诸如从肿瘤组织本身分离的热休克蛋白组合使用。在一些实施方案中，本文所述的化合物可与树突细胞免疫组合以激活有效的抗肿瘤反应。

本公开的化合物可与使表达Feα或Feγ受体的效应细胞靶向肿瘤细胞的双特异性大环肽组合使用。本公开的化合物也可与激活宿主免疫反应性的大环肽组合。

本公开的化合物可与骨髓移植组合使用，用于治疗多种造血来源的肿瘤。

考虑与本公开的化合物组合使用的合适的抗病毒剂可包括核苷和核苷酸逆转录酶抑制剂(NRTI)、非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、蛋白酶抑制剂和其他抗病毒药物。

合适的NRTI的实例包括齐多夫定(zidovudine,AZT)；去羟肌苷(didanosine,ddl)；扎西他滨(zalcitabine,ddC)；司他夫定(stavudine,d4T)；拉米夫定(lamivudine,3TC)；阿巴卡韦(abacavir,1592U89)；阿德福韦酯(adefovir dipivoxil)[双(POM)-PMEA]；洛布卡韦(lobucavir,BMS-180194)；BCH-10652；恩曲他滨(emitricitabine)[(-)-FTC]；β-L-FD4(也称为β-L-D4C并命名为β-L-2',3'-二脱氧-5-氟-胞苷)；DAPD((-)-β-D-2,6,-二氨基-嘌呤二氧戊环)；和洛地苷(lodenosine,FddA)。典型的合适的NNRTI包括奈韦拉平(nevirapine,BI-RG-587)；地拉韦定(delaviradine,BHAP,U-90152)；依法韦仑(efavirenz,DMP-266)；PNU-142721；AG-1549；MKC-442(1-(乙氧基-甲基)-5-(1-甲基乙基)-6-(苯基甲基)-(2,4(1H,3H)-嘧啶二酮)；和(+)-胡桐内酯A(NSC-675451)和B。典型的合适的蛋白酶抑制剂包括沙奎那韦(saquinavir,Ro 31-8959)；利托那韦(ritonavir,ABT-538)；茚地那韦(indinavir,MK-639)；奈非那韦(nelfnavir,AG-1343)；安普那韦(amprenavir,141W94)；拉西那韦(lasinavir,BMS-234475)；DMP-450；BMS-2322623；ABT-378；和AG-1 549。其他抗病毒剂包括羟基脲、利巴韦林、IL-2、IL-12、喷他夫西(pentafuside)和Yissum Project No.11607。

本文所述的化合物可以与针对膜受体激酶的其他剂组合或依次与所述其他剂组合，尤其是用于对靶向治疗产生原发性或获得性抗性的患者。这些治疗剂包括针对EGFR、Her2、VEGFR、c-Met、Ret、IGFR1或Flt-3以及针对癌症相关融合蛋白激酶诸如Bcr-Abl和EML4-Alk的抑制剂或抗体。针对EGFR的抑制剂包括吉非替尼和厄洛替尼，并且针对EGFR/Her2的抑制剂包括但不限于达克替尼(dacomitinib)、阿法替尼、拉帕替尼(lapitinib)和来那替尼。针对EGFR的抗体包括但不限于西妥昔单抗、帕尼单抗和耐昔妥珠单抗。c-Met抑制剂可以与本文公开的化合物组合使用。这些抑制剂包括奥那妥组单抗、替凡替尼和卡马替尼(capmatinib)。针对Abl(或Bcr-Abl)的剂包括伊马替尼、达沙替尼、尼罗替尼和帕纳替尼，并且针对Alk(或EML4-ALK)的剂包括克唑替尼。

血管生成抑制剂与本文公开的化合物组合在一些肿瘤中可能是有效的。这些抑制剂包括针对VEGF或VEGFR的抗体或VEGFR的激酶抑制剂。针对VEGF的抗体或其他治疗性蛋白质包括贝伐单抗和阿柏西普。VEGFR激酶抑制剂和其他抗血管生成抑制剂包括但不限于舒尼替尼、索拉非尼、阿西替尼、西地尼布、帕唑帕尼、瑞戈非尼、布立尼布和凡德他尼。

细胞内信号传导通路的激活在癌症中很常见，并且靶向这些通路的组分的剂已与受体靶向剂组合来增强疗效并降低抗性。可与本文所述的化合物组合的剂的实例包括PI3K-AKT-mTOR通路的抑制剂、Raf-MAPK通路的抑制剂、JAK-STAT通路的抑制剂以及蛋白质伴侣和细胞周期进程的抑制剂。

针对PI3激酶的剂包括但不限于托普拉里斯(topilaralisib)、艾代拉里斯、布帕拉里斯。mTOR抑制剂诸如雷帕霉素、西罗莫司、替西罗莫司和依维莫司可以与本发明的化合物组合。其他合适的实例包括但不限于威罗非尼和达拉非尼(Raf抑制剂)以及曲美替尼、司美替尼和GDC-0973(MEK抑制剂)。一种或多种JAK(例如，鲁索替尼、巴瑞替尼、托法替尼)、Hsp90(例如，替拉替尼)、细胞周期蛋白依赖性激酶(例如，帕博西尼)、HDAC(例如，帕比司他)、PARP(例如，奥拉帕尼)和蛋白酶体(例如，硼替佐米、卡非佐米)的抑制剂也可以与本文所述的化合物组合。在一些实施方案中，JAK抑制剂对JAK1的选择性高于对JAK2和JAK3的选择性。

与本文所述的化合物组合使用的其他合适的剂包括化学疗法组合，诸如用于肺癌和其他实体瘤的基于铂的双药(顺铂或卡铂加吉西他滨；顺铂或卡铂加多西他赛；顺铂或卡铂加紫杉醇；顺铂或卡铂加培美曲塞)或吉西他滨加紫杉醇结合颗粒

合适的化学治疗剂或其他抗癌剂包括例如烷化剂(包括但不限于氮芥、乙烯亚胺衍生物、烷基磺酸盐、亚硝基脲和三氮烯)，诸如尿嘧啶氮芥、氮芥、环磷酰胺(Cytoxan

与本文所述的化合物组合使用的其他合适的剂包括类固醇，包括17α-炔雌醇、己烯雌酚、睾酮、强的松、氟甲睾酮、甲基强的松龙、甲基睾酮、强的松龙、曲安西龙、氯烯雌醚、羟孕酮、氨鲁米特和醋酸甲羟孕酮。

与本文所述的化合物组合使用的其他合适的剂包括：达卡巴嗪(DTIC)，任选地连同其他化学治疗药物诸如卡莫司汀(BCNU)和顺铂一起；“达特茅斯方案(Dartmouthregimen)”，由DTIC、BCNU、顺铂和他莫昔芬组成；顺铂、长春碱和DTIC的组合；或替莫唑胺。本文所述的化合物还可与免疫治疗药物组合，所述免疫治疗药物包括细胞因子诸如干扰素α、白介素2和肿瘤坏死因子(TNF)抑制剂。

合适的化学治疗剂或其他抗癌剂包括例如抗代谢物(包括但不限于叶酸拮抗剂、嘧啶类似物、嘌呤类似物和腺苷脱氨酶抑制剂)，诸如甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶、氟尿苷、阿糖胞苷、6-巯基嘌呤、6-硫鸟嘌呤、磷酸氟达拉滨、喷司他汀和吉西他滨。

合适的化学治疗剂或其他抗癌剂还包括例如某些天然产物及其衍生物(例如，长春花生物碱、抗肿瘤抗生素、酶、淋巴因子和表鬼臼毒素)，诸如长春碱、长春新碱、长春地辛、博来霉素、放线菌素、柔红霉素、阿霉素、表柔比星、伊达比星、ara-C、紫杉醇(TAXOL

其他细胞毒性剂包括长春瑞滨、CPT-11、阿那曲唑(anastrazole)、来曲唑(letrazole)、卡培他滨、雷洛昔芬、环磷酰胺、异环磷酰胺和卓洛昔芬。

同样合适的是如下细胞毒性剂，诸如表鬼臼毒素；抗肿瘤酶；拓扑异构酶抑制剂；丙卡巴肼；米托蒽醌；铂配位络合物，诸如顺铂和卡铂；生物反应调节剂；生长抑制剂；抗激素治疗剂；亚叶酸；替加氟；和造血生长因子。

其他抗癌剂包括抗体治疗剂诸如曲妥珠单抗(赫赛汀)、共刺激分子(诸如CTLA-4)的抗体、4-1BB、PD-1和PD-L1抗体或细胞因子(IL-10、TGF-β等)的抗体。

其他抗癌剂还包括阻断免疫细胞迁移的那些，诸如趋化因子受体(包括CCR2和CCR4)的拮抗剂。

其他抗癌剂还包括增强免疫系统的那些，诸如佐剂或过继性T细胞转移。

抗癌疫苗包括树突状细胞、合成肽、DNA疫苗和重组病毒。在一些实施方案中，肿瘤疫苗包括来自与人类癌症有关的病毒的蛋白质，所述病毒诸如人乳头状瘤病毒(HPV)、肝炎病毒(HBV和HCV)和卡波西氏疱疹肉瘤病毒(KHSV)。可使用的肿瘤疫苗的非限制性实例包括黑素瘤抗原的肽，诸如gp100、MAGE抗原、Trp-2、MARTI和/或酪氨酸酶的肽，或经转染以表达细胞因子GM-CSF的肿瘤细胞。

本公开的化合物可与骨髓移植组合使用，用于治疗多种造血来源的肿瘤。

大多数这些化学治疗剂的安全和有效施用的方法是本领域技术人员已知的。此外，标准文献中描述了它们的施用。例如，许多化学治疗剂的施用描述于“Physicians'DeskReference”(PDR，例如，1996年版，Medical Economics Company,Montvale,NJ)中，其公开内容以引用的方式并入本文，如同以其整体列出一样。

当向患者施用多于一种药剂时，它们可以同时、单独、依序或组合施用(例如，对于多于两种剂)。

制剂、剂型和施用

当用作药物时，本公开的化合物可以药物组合物的形式施用。因此，本公开提供了一种组合物，其包含式(I)或本文所述的任何式的化合物、如权利要求中任一项所述和本文所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或其任何实施方案，以及至少一种药学上可接受的载体或赋形剂。药物组合物可以包含本文所述的化合物和一种或多种如本文所述的第二治疗剂。例如，第二治疗剂是JAK抑制剂，诸如鲁索替尼。所述组合物可以以药学领域众所周知的方式制备，并且可以通过多种途径施用，这取决于是否指示局部或全身治疗以及要治疗的区域。施用可以是局部的(包括透皮、表皮、眼部和粘膜，包括鼻内、阴道和直肠递送)、肺部的(例如，通过吸入或吹入粉末或气雾剂，包括通过雾化器；气管内或鼻内)、口服或肠胃外的。肠胃外施用包括静脉内、动脉内、皮下、腹膜内或肌内注射或输注；或颅内施用，例如鞘内或脑室内施用。肠胃外施用可以是单次推注剂量的形式，或者可以是例如通过连续的灌注泵。用于局部施用的药物组合物和制剂可以包括透皮贴剂、软膏、洗剂、乳膏、凝胶、滴剂、栓剂、喷雾剂、液体和粉剂。常规药物载体、水性、粉末或油性基质、增稠剂等可能是必需的或期望的。

本发明还包括如下药物组合物，其含有作为活性成分的本公开的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种药学上可接受的载体或赋形剂的组合。在一些实施方案中，组合物适合于局部施用。在制备本公开的组合物时，通常将活性成分与赋形剂混合，用赋形剂稀释或以例如胶囊、小药囊、纸或其他容器的形式封装在这种载体中。当赋形剂用作稀释剂时，它可以是固体、半固体或液体材料，它们充当活性成分的媒介物、载体或介质。因此，组合物可以是片剂、丸剂、粉剂、锭剂、囊剂、扁囊剂、酏剂、悬浮液、乳剂、溶液、糖浆剂、气雾剂(呈固体或在液体介质中)、含有例如至多10重量％的活性化合物的软膏、软明胶胶囊和硬明胶胶囊、栓剂、无菌注射液和无菌包装粉末的形式。

在制备制剂时，活性化合物可以在与其他成分合并之前进行研磨以提供合适的粒度。如果活性化合物是基本上不溶的，则可以将其研磨至小于200目的粒度。如果活性化合物基本上是水溶性的，则可以通过研磨来调整粒度以提供在制剂中基本上均匀的分布，例如约40目。

可以使用已知的研磨程序诸如湿式研磨来研磨本公开的化合物，以获得适于片剂形成和其他制剂类型的粒度。可以通过本领域已知的方法(参见例如WO 2002/000196)制备本公开的化合物的精细(纳米颗粒)制剂。

在一些实施方案中，所述组合物是包含至少一种本文所述的化合物或其药学上可接受的盐以及至少一种药学上可接受的载体或赋形剂的持续释放组合物。

在一些实施方案中，使用湿法制粒工艺来产生所述组合物。在一些实施方案中，使用干法制粒工艺来产生所述组合物。

组合物可以配制成单位剂型。术语“单位剂型”是指适合用作人受试者和其他哺乳动物的单位剂量的物理离散单位，各单位均含有经计算结合适合的药物赋形剂可产生所需治疗作用的预定量的活性物质。

用于配制药物组合物的组分具有高纯度并且基本上不含潜在有害的污染物(例如，至少国家食品级、通常至少分析级并且更通常至少药物级)。特别是对于人类消费，组合物优选根据美国食品和药物管理局的适用法规中定义的良好制造规范标准来制造或配制。例如，合适的制剂可以是无菌的和/或基本上等渗的和/或完全符合美国食品和药物管理局的所有良好生产规范法规。

活性化合物可以在很宽的剂量范围内有效，并且通常以治疗有效量施用。然而，应理解，通常将由医师根据相关情况确定实际施用的化合物的量，所述相关情况包括要治疗的病状、选择的施用途径、施用的实际化合物、个体患者的年龄、体重和反应、患者症状的严重性等。

为了制备固体组合物诸如片剂，将主要活性成分与药物赋形剂混合以形成包含本发明化合物的均匀混合物的固体预制剂组合物。当提及这些预制剂组合物为均匀时，活性成分通常均匀地分散于整个组合物以使得组合物可以很容易细分成同样有效的单位剂型诸如片剂、丸剂和胶囊。然后将此固体预制剂细分为含有例如约0.1mg至约1000mg的本发明活性成分的上述类型的单位剂型。

本发明的片剂或丸剂可以被包衣或以其他方式复合以提供具有延长作用的优点的剂型。例如，片剂或丸剂可包含内部剂量组分和外部剂量组分，后者为前者上的包封的形式。这两种组分可以由肠溶层分开，所述肠溶层用于抵抗胃中的崩解并允许内部组分完整地进入十二指肠或延迟释放。多种材料可用于此类肠溶层或包衣，此类材料包括多种聚合酸以及聚合酸与诸如虫胶、鲸蜡醇和乙酸纤维素的材料的混合物。

可以掺入本发明的化合物和组合物以口服或通过注射施用的液体形式包括水溶液、适当调味的糖浆、水性或油性悬浮液，以及具有食用油如棉籽油、芝麻油、椰子油或花生油的调味乳剂，以及酏剂和类似的药物媒介物。

用于吸入或吹入的组合物包括药学上可接受的水性或有机溶剂或其混合物中的溶液和悬浮液、以及粉末。液体或固体组合物可含有如上文所述的合适的药学上可接受的赋形剂。在一些实施方案中，所述组合物可通过口服或经鼻呼吸道途径施用以获得局部或全身作用。组合物可以通过使用惰性气体进行雾化。雾化溶液可以从喷雾装置直接呼吸，或者可将喷雾装置连接到面罩(face mask)、面幕目(tent)或间歇式正压呼吸器。溶液、悬浮液或粉末组合物可以从以适当方式递送制剂的装置经口或经鼻施用。

局部制剂可以含有一种或多种常规载体。在一些实施方案中，软膏可以含有水和一种或多种选自例如液体石蜡、聚氧乙烯烷基醚、丙二醇、白凡士林等的疏水性载体。乳膏的载体组合物可以基于水与甘油和一种或多种其他组分，例如单硬脂酸甘油酯、PEG-单硬脂酸甘油酯和鲸蜡基硬脂醇的组合。凝胶可以使用异丙醇和水，适当地与其他组分例如像甘油、羟乙基纤维素等组合来配制。

施用于患者的化合物或组合物的量将根据施用的物质、施用目的(诸如预防或治疗)、患者的状态、施用方式等而变化。在治疗应用中，可以以足以治愈或至少部分遏制疾病及其并发症的症状的量向已经患有疾病的患者施用组合物。有效剂量将取决于所治疗的疾病状况以及主治医生根据诸如疾病的严重性、患者的年龄、体重和一般状况等因素的判断。

向患者施用的组合物可以是上述药物组合物的形式。这些组合物可以通过常规的灭菌技术灭菌，或者可以无菌过滤。水溶液可按原样包装使用或冻干，冻干制剂在施用之前与无菌水性载体组合。

本发明化合物的治疗剂量可以根据例如治疗的特定用途、化合物的施用方式、患者的健康和状况以及处方医生的判断而变化。本公开的化合物在药物组合物中的比例或浓度可以根据许多因素而变化，所述因素包括剂量、化学特性(例如疏水性)和施用途径。剂量可能取决于诸如疾病或病症的类型和进展程度、特定患者的整体健康状况、所选化合物的相对生物学功效、赋形剂的配制及其施用途径等变量。可由来源于体外或动物模型测试系统的剂量-反应曲线来外推有效剂量。

标记化合物和测定方法

本公开的化合物可进一步用于研究正常组织和异常组织中的生物过程。因此，本发明的另一方面涉及本文提供的荧光染料、自旋标记、重金属或放射性标记的化合物，它们不仅可用于成像技术，而且可用于体外和体内测定，用于定位和定量包括人在内的组织样品中的ALK2蛋白，并且用于通过抑制标记化合物的结合来鉴定ALK2配体。因此，本发明包括含有此类标记的化合物的ALK2结合测定。

本发明进一步包括本公开的同位素取代的化合物。“同位素取代的”化合物是本公开的化合物，其中一个或多个原子被具有相同原子序数但不同原子质量或质量数的原子替代或取代。本公开的化合物可以含有在自然界中发现的天然丰度的同位素。本公开的化合物还可以具有比在自然界中发现的量更大的同位素，例如，将低天然丰度同位素合成地掺入到本公开的化合物中，因此它们富含特别有用的同位素(例如

本文呈现的化合物的一个或多个组成原子可被天然或非天然丰度的原子同位素替代或取代。在一些实施方案中，化合物包含至少一个氘原子。在一些实施方案中，化合物包含两个或更多个氘原子。在一些实施方案中，化合物包含1-2、1-3、1-4、1-5或1-6个氘原子。在一些实施方案中，化合物中的所有氢原子都可被氘原子替代或取代。

用于将同位素包含到有机化合物中的合成方法是本领域已知的(Alan F.Thomas的Deuterium Labeling in Organic Chemistry(New York,N.Y.,Appleton-Century-Crofts,1971；Jens Atzrodt,Volker Derdau,Thorsten Fey和Jochen Zimmermann的TheRenaissance of H/DExchange,Angew.Chem.Int.Ed.2007,7744-7765；James R.Hanson的The Organic Chemistry of Isotopic Labelling,Royal Society of Chemistry,2011)。同位素标记的化合物可用于各种研究，诸如NMR光谱、代谢实验和/或测定。

用较重同位素诸如氘进行的取代可提供源自于较大代谢稳定性、例如增加的体内半衰期或减小的剂量要求的某些治疗优势，并且因此在一些情况下可为优选的。(参见例如A.Kerekes等人J.Med.Chem.2011,54,201-210；R.Xu等人J.LabelCompd.Radiopharm.2015,58,308-312)。特别地，在一个或多个代谢位点处的取代可提供一种或多种治疗优势。具体地，本公开的标记的化合物可在筛选测定中用于鉴定和/或评估化合物。例如，被标记的新合成或鉴定的化合物(即，测试化合物)可以通过跟踪标记以监测在与ALK2接触时其浓度变化来评估其结合ALK2蛋白的能力。例如，可以评估测试化合物(标记的)降低与已知结合ALK2蛋白的另一种化合物(即标准化合物)的结合的能力。因此，测试化合物与标准化合物竞争结合ALK2蛋白的能力与其结合亲和力直接相关。相反，在一些其他筛选测定中，标准化合物是标记的，而测试化合物是未标记的。因此，监测标记的标准化合物的浓度以评估标准化合物与测试化合物之间的竞争，并因此确定测试化合物的相对结合亲和力。

药盒

本公开还包括可用于例如治疗或预防与ALK2活性相关的疾病或病症诸如癌症或感染的药物药盒，其包括一个或多个含有药物组合物的容器，所述药物组合物包含治疗有效量的式I化合物或其任何实施方案。如对于本领域技术人员而言是显而易见的，此类药盒可以还包括一种或多种各种常规药物药盒部件，诸如例如装有一种或多种药学上可接受的载体的容器、另外的容器等。药盒中还可以包括指示要施用的组分的量、施用指南和/或用于混合组分的指南的说明书(插页的形式或标签的形式)。

将通过具体实施例更详细地描述本发明。以下实施例出于说明目的而提供，并且不旨在以任何方式限制本发明。本领域的技术人员将很容易认识到多种非关键性参数，所述参数可被改变或修改以产生基本上相同的结果。根据本文所述的至少一种测定，已发现实施例的化合物抑制ALK2的活性。

实施例

下文提供了本公开的化合物的实验程序。一些制备的化合物的制备型LC-MS纯化是在Waters质量定向分级分离系统上进行的。文献中已详细描述了用于操作这些系统的基本设备设置、方案和控制软件。参见例如“Two-Pump At Column Dilution Configurationfor Preparative LC-MS”,K.Blom,J.Combi.Chem.,4,295(2002)；“OptimizingPreparative LC-MS Configurations and Methods for Parallel SynthesisPurification”,K.Blom,R.Sparks,J.Doughty,G.Everlof,T.Haque,A.Combs,J.Combi.Chem.,5,670(2003)；以及"Preparative LC-MS Purification:ImprovedCompound Specific Method Optimization",K.Blom,B.Glass,R.Sparks,A.Combs,J.Combi.Chem.,6,874-883(2004)。所分离的化合物通常在以下条件下经历分析型液相色谱质谱(LCMS)以进行纯度检查：仪器；Agilent 1100系列，LC/MSD，柱：Waters Sunfire

如实施例中所示，还通过使用MS检测器的反相高效液相色谱法(RP-HPLC)或快速色谱法(硅胶)在制备规模上分离一些制备的化合物。典型的制备型反相高效液相色谱(RP-HPLC)柱条件如下：

pH＝2，纯化：Waters Sunfire

pH＝10，纯化：Waters XBridge C

实施例1.2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1R,5S)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶

步骤1：5-氯-2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶

向装备有磁性搅拌棒的螺旋盖小瓶中添加2,5-二氯-1,8-萘啶(956.8mg,4.81mmol)、1-乙基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)-1H-咪唑(1048mg,4.72mmol)、四(三苯基膦)钯(0)(1117mg,0.966mmol)和碳酸铯(4788mg,14.70mmol)。将小瓶用特氟龙内衬的隔膜密封，抽真空并用氮气回填(此过程重复总计三次)。通过注射器添加1,4-二噁烷(20.0mL)，随后添加水(3.0mL)。将混合物在70℃下搅拌6h。在室温下冷却后，浓缩混合物。在硅胶上(40g，于CH

步骤2：2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)-1,8-萘啶

向装备有磁性搅拌棒的螺旋盖小瓶中添加4,4,5,5,4',4',5',5'-八甲基-[2,2']二[[1,3,2]二氧环戊硼烷基](515.0mg,2.028mmol)、乙酸钾(496.8mg,5.06mmol)、5-氯-2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶(394.2mg,1.524mmol)和二氯[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]钯(II)二氯甲烷加合物(258mg,0.315mmol)。将小瓶用特氟龙内衬的隔膜密封，抽真空并用氮气回填(此过程重复总计三次)。通过注射器添加1,4-二噁烷(12.0mL)。将混合物在105℃下搅拌16h。在室温下冷却后，过滤混合物。将滤液不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS C

步骤3：5-(7-氯-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶

向装备有磁性搅拌棒的螺旋盖小瓶中添加7-氯-3-碘-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪(497.4mg,1.695mmol)、二氯[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]钯(II)二氯甲烷加合物(253mg,0.310mmol)和碳酸铯(1987mg,6.10mmol)。将小瓶用特氟龙内衬的隔膜密封，抽真空并用氮气回填(此过程重复总计三次)。通过注射器添加2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)-1,8-萘啶(534mg,1.525mmol，参见以上步骤2)于1,4-二噁烷(12.0mL)中的溶液，随后添加水(3.0mL)。将混合物在80℃下搅拌16h。在冷却至室温后，浓缩反应混合物。在硅胶上(40g，于CH

步骤4：(1R,5S)-1-(4-溴苯基)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷

向(1R,5S)-1-(4-溴苯基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷(354.4mg,1.488mmol,Affinity Research Chemicals)于二氯乙烷(20.0mL)中的溶液中添加三乙酰氧基硼氢化钠(534.7mg,2.52mmol)和乙酸(330μL,5.76mmol)，随后添加四氢-4H-吡喃-4-酮(318.6mg,3.18mmol)。将混合物在室温下搅拌16h。将反应混合物用2M K

步骤5：(1R,5S)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)苯基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷

向装备有磁性搅拌棒的螺旋盖小瓶中添加4,4,5,5,4',4',5',5'-八甲基-[2,2']二[[1,3,2]二氧环戊硼烷基](318.8mg,1.255mmol)、乙酸钾(316.6mg,3.23mmol)、(1R,5S)-1-(4-溴苯基)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷(298.7mg,0.927mmol)和二氯[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]钯(II)二氯甲烷加合物(115.1mg,0.141mmol)。将小瓶用特氟龙内衬的隔膜密封，抽真空并用氮气回填(此过程重复总计三次)。通过注射器添加1,4-二噁烷(12.0mL)。将混合物在105℃下搅拌16h。在室温下冷却后，过滤混合物。将滤液不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS C

步骤6：2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1R,5S)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶

向装备有磁性搅拌棒的螺旋盖小瓶中添加5-(7-氯-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶(277.2mg,0.711mmol)、(1R,5S)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)苯基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷(342mg,0.926mmol)、二环己基(2',4',6'-三异丙基联苯-2-基)膦-(2'-氨基联苯-2-基)(氯)钯(1:1)(XPhos Pd G2,84mg,0.107mmol)和碳酸铯(846.7mg,2.60mmol)。将小瓶用特氟龙内衬的隔膜密封，抽真空并用氮气回填(此过程重复总计三次)。通过注射器添加1,4-二噁烷(20.0mL)，随后添加水(2.0mL)。将混合物在80℃下加热6h。冷却至室温后，将反应物用MeOH稀释并使用制备型LCMS(XBridge C18柱，用乙腈/含有0.1％ TFA的水的梯度洗脱，流速为60mL/min)纯化，得到呈其TFA盐形式的所需产物。LCMS C

实施例2.2-(4-(3-(7-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶-4-基)-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷

步骤1：2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷

向2-(4-(溴甲基)苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷(304.1mg,1.024mmol)、Cs

步骤2：2-(4-(3-(7-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶-4-基)-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷

向装备有磁性搅拌棒的螺旋盖小瓶中添加5-(7-氯-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶(257.9mg,0.662mmol)、二环己基(2',4',6'-三异丙基联苯-2-基)膦-(2'-氨基联苯-2-基)(氯)钯(1:1)(XPhos Pd G2,78.1mg,0.099mmol)和碳酸铯(780.0mg,2.394mmol)。将小瓶用特氟龙内衬的隔膜密封，抽真空并用氮气回填(此过程重复总计三次)。添加2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷(335mg,1.024mmol)于1,4-二噁烷(20.0mL)中的溶液，随后添加脱气水(2.0mL,111mmol)。将混合物在80℃下加热6h。冷却至室温后，将反应物用MeOH稀释并使用制备型LCMS(XBridge C18柱，用乙腈/含有0.1％ TFA的水的梯度洗脱，流速为60mL/min)纯化，得到呈其TFA盐形式的所需产物。LCMS C

实施例3.2-(4-(6-甲基-3-(7-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶-4-基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷

步骤1：5-氯-2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶

向装备有磁性搅拌棒的100mL圆底烧瓶中装入4-甲基-2H-1,2,3-三唑(烯胺,1g,12.03mmol)、Cs

步骤2：2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)-1,8-萘啶

向100mL圆底烧瓶中装入5-氯-2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶(1.61g,6.55mmol)、乙酸钾(1.286g,13.11mmol)、双(频哪醇)二硼(2.496g,9.83mmol)和Pd(dppf)Cl

步骤3：5-(7-氯-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶

向装备有磁性搅拌棒的100mL圆底烧瓶中装入2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧环戊硼烷-2-基)-1,8-萘啶(1.608g,4.77mmol)、7-氯-3-碘-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪(1g,3.41mmol)、Pd(dppf)Cl

步骤4：2-(4-(6-甲基-3-(7-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶-4-基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)苄基)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷

此化合物根据实施例2步骤6中所述的程序，使用5-(7-氯-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶代替5-(7-氯-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶作为起始材料来制备。LCMS C

实施例4.2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-5-(6-甲基-7-(4-((1S,5R)-3-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3-氮杂双环[3.1.0]己烷-1-基)苯基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-1,8-萘啶

此化合物根据实施例1(步骤6)中所述的程序，使用5-(7-氯-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-2-(4-甲基-2H-1,2,3-三唑-2-基)-1,8-萘啶代替5-(7-氯-6-甲基咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基)-2-(1-乙基-1H-咪唑-4-基)-1,8-萘啶作为起始材料来制备。LCMSC

实施例A.ALK2 HTRF测定

ALK2(aa 147-end)从BPS biosciences获得。在白色384孔聚苯乙烯板中以8μL最终体积进行酶促测定。以DMSO连续稀释抑制剂并将其添加到板孔中，之后添加其他反应组分。在25℃下在含有50nM LANCE Ultra ULight

如实施例中举例说明，本公开的化合物显示以下范围内的IC

表1

根据前述描述，除本文所述的内容之外，本公开的各种修改对于本领域技术人员而言将是显而易见的。这些修改也旨在落入所附权利要求的范围内。本申请中引用的每个参考文献，包括但不限于所有专利、专利申请和出版物，均以引用方式整体并入本文。