治疗癌症的方法

本申请是申请日为2015年10月16日、申请号为201580055480.4且发明名称为“治疗癌症的方法”发明专利申请的分案申请。

相关申请

本申请要求于2014年10月16日提交的美国专利申请号62/064,948和2014年10月17日提交的美国专利申请号62/065,590的权益和优先权，将其各自的内容通过引用以其全文结合在此。

技术领域

本申请涉及癌症治疗领域。

背景技术

疾病相关的染色质修饰酶(例如，EZH2)在如增生性病症、代谢性病症以及血液病症的疾病中发挥作用。因此，存在对开发能够调节EZH2的活性的小分子的需要。

发明内容

本发明提供了在有需要的细胞或受试者中通过使该细胞接触或向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂来治疗或减轻表征为异常、误调或增加的Zeste同源物增强子2(EZH2)活性和/或表达的病症的症状的方法，该病症例如免疫逃逸、癌细胞诱导的免疫功能障碍、降低的免疫应答、减弱的炎症、减少的主要组织相容性复合物(MHC)的表达、或癌症。

在某一方面中，该方法涉及在癌细胞中抑制免疫逃逸，该方法包括使细胞与治疗有效量的EZH2抑制剂接触的步骤。

在某一方面中，该方法涉及在有需要的受试者中治疗和/或矫正癌细胞诱导的免疫功能障碍，该方法包括向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂的步骤。

在某一方面中，该方法涉及在有需要的受试者中加强、增加或诱导免疫应答，该方法包括向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂的步骤。

在某一方面中，该方法涉及在癌细胞中增加主要组织相容性复合物(MHC)的表达，该方法包括使该癌细胞与治疗有效量的EZH2抑制剂接触的步骤。

在某一方面中，该方法涉及在有需要的受试者中增强炎症，该方法包括向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂的步骤。

在某一方面中，该方法涉及在有需要的受试者中治疗癌症或细胞增殖性病症，该方法包括向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂的步骤。

在某一方面中，该方法涉及在有需要的受试者中测定包括EZH2抑制剂的治疗的有效性的可能性，该方法包括以下步骤：(1)从该受试者获得生物学样品；和(2)分析与对照样品相比时该生物学样品中主要组织相容性复合物(MHC)的表达的降低。在生物学样品与对照样品相比具有降低的MHC表达时，包括EZH2抑制剂的治疗更可能在受试者中是有效的。

在某一方面中，该方法涉及在有需要的受试者中测定包括EZH2抑制剂的治疗的有效性的可能性，该方法包括分析与对照样品相比时从受试者获得的生物学样品在样品中主要组织相容性复合物(MHC)的表达的降低。如果生物学样品与对照样品相比时具有降低的MHC表达，那么包括EZH2抑制剂的治疗更可能在受试者中是有效的。

在某一方面中，该方法涉及在有需要的受试者中筛选包括EZH2抑制剂的治疗的有效性，该方法包括(1)从受试者获得第一生物学样品和第二生物学样品；(2)使第二生物学样品与EZH2抑制剂接触；(3)分析第一生物学样品和第二生物学样品中主要组织相容性复合物(MHC)的表达；并且(4)比较第一生物学样品中的MHC表达与第二生物学样品中的MHC表达。如果与第一生物学样品中的表达相比时，第二生物学样品具有增加的MHC表达，那么包括EZH2抑制剂的治疗更可能在受试者中是有效的。

在上文多个方面的实施例中，细胞或受试者包括异常、误调或增加的EZH2活性。

在上文多个方面的实施例中，细胞或受试者包括染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)。

在上文多个方面的实施例中，易位导致SS18-SSX融合基因。

在上文多个方面的实施例中，细胞或受试者具有降低的INI1(本文中也称为BAF47、SNF5或SMARCB1)的功能或表达。

在上文多个方面的实施例中，细胞或受试者具有降低的INI1的功能和表达。

在上文多个方面的实施例中，EZH2抑制剂是具有以下化学式的化合物A(本文中也称为E7438或EPZ-6438或他折司他(tazemetostat))：

在上文多个方面的实施例中，EZH2抑制剂是以下项中的一个或多个：

在上文多个方面的实施例中，该方法进一步包括给予化学治疗化合物，例如PD-1抑制剂、PD-L1抑制剂或CTLA-4抑制剂。

在上文多个方面的实施例中，癌细胞在受试者(例如人类)体内。

在上文多个方面的实施例中，免疫逃逸、癌细胞诱导的免疫功能障碍、需要加强的免疫应答、炎症或癌症表征为与非癌细胞相比时癌细胞中降低的以下项中的一个或多个的表达：MHC、β2微球蛋白、肿瘤坏死因子(TNF)受体、低分子质量多肽2(LMP2)、低分子质量多肽7(LMP7)、抗原加工相关转运蛋白(TAP)和TAP相关糖蛋白(泰帕森(tapasin))。MHC可为人类白细胞抗原(HLA)，例如HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DMα、HLA-DMβ、HLA-DOα、HLA-DOβ1、HLA-DPα1、HLA-DPβ1、HLA-DRα、HLA-DRβ1、HLA-DRβ3.、HLA-DRβ4、HLA-E、HLA-F、HLA-G、HLA-K或HLA-L。

除非另有定义，否则本文中使用的所有技术和科学术语都具有与本发明所属领域的普通技术人员一般所理解的相同的含义。在说明书中，除非上下文明确指示其他情况，否则单数形式也包含复数含义。除非上下文明确陈述或显而易见，否则如本文中所用术语“一(a)”、“一个(an)”和“该(the)”应理解为单数或复数。除非上下文明确陈述或显而易见，否则如本文所用术语“或”应理解为是包含性的。

除非上下文明确陈述或显而易见，否则如本文所用术语“约”应理解为在本领域的普通公差的范围内，例如在均值的2个标准偏差内。约可理解为在所述值的10％、9％、8％、7％、6％、5％、4％、3％、2％、1％、0.5％、0.1％、0.05％或0.01％内。除非上下文另外阐明，否则本文中提供的所有数值都由术语“约”修饰。

尽管在本发明的实践或测试中可使用与本文所述的方法和材料相似或等效的方法和材料，但下文阐述适宜的方法和材料。本文中所提到的所有公开案、专利申请、专利和其他参考文献都是通过引用结合在此。不承认本文中引用的参考文献构成所要求保护的发明的现有技术。如果出现冲突，将以包含定义在内的本说明书为准。另外，材料、方法和实例仅具有说明性，且不意在是限制性的。

上文多个方面和实施例中的任一者可与任何其他方面或实施例组合。

本发明的其他特征和优点从以下详细说明和权利要求书将是清楚的。

附图说明

图1是细胞裂解产物的蛋白质印迹(western blot)，其证明HS-SY-II细胞系中的SS18-SSX1表达和INI1(本文中也称为BAF47、SNF5或SMARCB1)下调。

图2A是经分离组蛋白的蛋白质印迹，其显示多种细胞系中的H3K27三甲基化(H3K27me3)和H3K27二甲基化(H3K27me2)水平。图2B至2D是一系列图式，其显示多种细胞系中的H3K27me3/总H3(B)、H3K27me2/总H3(C)或H3K27me3/H3K27me2(D)定量比率。这些定量数据来源于通过蛋白质印迹分析获得的蛋白质条带的计算。

图3A至3D是一系列图式，其显示HS-SY-II细胞对EZH2抑制剂是高度敏感的，而SW982细胞并非如此。用化合物E处理图3A中所示的细胞系HS-SY-II和图3B中所示的细胞系SW982。用化合物A(本文中也称为E7438或EPZ-6438)处理图3C中所示的细胞系HS-SY-II和图3D中所示的细胞系SW982。用化合物(化合物E或化合物A)以指示浓度将每一类型的细胞预处理7天，并将所述细胞重新铺板并再处理7天。通过CellTiter-

图4A至4F证明，INI1水平的降低在软组织肉瘤细胞系中赋予对EZH2抑制剂(EZH2i)的敏感性。(A)是细胞裂解产物的蛋白质印迹，其显示不同肿瘤细胞系中的INI1表达。软骨肉瘤的肿瘤细胞系显示INI1的下调(例如在细胞系b和c中)。(B)和(C)是证明细胞系b(图表B)和细胞系c(图表C)对EZH2抑制剂敏感的图表。(D)是细胞裂解产物的蛋白质印迹，其显示不同细胞系中的INI1和SS18表达。(E)是显示SSX-SS18阳性细胞对EZH2抑制剂敏感的图表。(F)是显示SSX-SS18阴性细胞对EZH2抑制剂不敏感的图表。

图5A和5B是一系列图式，其显示HS-SY-II细胞对化合物A是高度敏感的(图5A)，而SW982细胞并非如此(图5B)。用化合物A以指示浓度处理每个细胞类型。在第7天将细胞重新铺板并再处理7天。通过CellTiter-

图6A显示在HS-SY-II和SW982细胞中在用化合物A处理后，降低的H3K27me3/总H3的比率(相对于对照的比率)。用化合物A将细胞处理96小时并提取组蛋白。通过酶联免疫吸附分析(ELISA)分析组蛋白标记变化。组蛋白标记变化在HS-SY-II与SW982之间相当，表明这些变化与SS18-SSX融合蛋白的存在无关。图6B显示将H3K27me3/总H3的比率抑制50％所需的化合物浓度(IC

图7A和7B分别显示HS-SY-II异种移植模型中的药代动力学(PK)值和药效动力学(PD)变化。图7A显示化合物A的血浆浓度。此处，化合物A是每天两次经口给予小鼠7天。在最后一次剂量之前大约5分钟和之后3小时从用化合物A处理的小鼠收集外周血样品。对化合物A的血浆浓度进行分析。将这些浓度绘图(n＝5)。每个条形代表每组中血浆浓度的均值。图7B显示在小鼠中化合物A对HS-SY-II异种移植物中的H3K27me3的抑制性效应。此处，化合物A是每天两次经口给予小鼠7天。将肿瘤中的H3K27me3绘图(n＝5)。每个条形代表每组中的三甲基化水平的均值±SEM。下表2和3提供关于图7B中所示数据的统计学分析。这些统计学分析的结果证实了剂量依赖性变化。

图8显示在体外实验中，在HS-SY-II和SW982中，在化合物A处理后，推定PD标记物的表达变化。此处，用化合物A或EPZ-011989(其也是EZH2抑制剂并且在本文中还称为化合物C)处理每个细胞类型；显示浓度和时期(天数)。通过RT-PCR分析基因表达变化。将基因表达水平标准化为GAPDH水平。显示作为相对于0μM处理对照的比率的条形。下表4提供关于图8中所示数据的统计学分析。星号意指与0μM处理组的水平相比的显著变化。

图9显示在体内实验中，在HS-SY-II中，在化合物A处理后，推定PD标记物的表达变化。此处，化合物A是每天两次经口给予小鼠7天。在最后一次剂量后大约3小时收集肿瘤样品。通过RT-PCR分析基因表达变化。将基因表达水平标准化为GAPDH水平。显示作为相对于运载体组数据的比率的条形。

图10A至10C显示负载HS-SY-II异种移植物的无胸腺裸鼠的肿瘤体积均值，所述裸鼠已被以指示剂量给予运载体(经口或iv(静脉内))、化合物A(经口)、多柔比星(iv)或化合物A/多柔比星组合，持续28天。一周两次测量肿瘤体积。进行两次独立研究。图10A和10B显示第一次研究的结果，图10C显示第二次研究的结果。来自第二次研究的动物的肿瘤是在第28天(最后一次剂量之后3h)收获，并经历通过ELISA进行的H3K27me3分析(图10D)或针对增殖标记物Ki67的免疫组织化学(IHC)分析(图10E)。

图11A至11D显示负载滑膜肉瘤肿瘤的两种不同患者来源异种移植物(PDX)的无胸腺裸鼠的肿瘤体积均值和存活百分比，并且所述裸鼠被以指示剂量给予运载体(经口)、化合物A(经口)或多柔比星(iv)，持续35天。图11A和11B显示来自负载来自患有高级纺锤体细胞肉瘤的57岁男性的PDX的小鼠的数据(CTG-0771)。图11C和11D显示来自负载来自16岁女性的PDX的小鼠的数据(CTG-0331)。一周两次测量肿瘤体积。在第35天停止给药并一周两次通过肿瘤测量观察动物直到第60天为止。在给定动物的肿瘤体积超过2000mm

图12A和12B显示来自多个小鼠亚组的滑膜肉瘤PDX肿瘤的阵列数据，所述肿瘤是在第35天收获并通过RNA-seq分析加以分析。图12A是来自负载来自57岁男性的PDX的小鼠的数据；图12B是来自负载来自16岁女性的PDX的小鼠的数据。显示在来自经运载体或400mg/kg化合物A BID处理的小鼠的肿瘤中HLA基因的表达。在该图中，蓝色是低表达并且红色是高表达。

具体实施方式

本发明提供了在有需要的细胞或受试者中通过使该细胞接触或向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂来治疗或减轻表征为异常、误调或增加的Zeste同源物增强子2(EZH2)活性或表达的病症的症状的方法，该病症例如免疫逃逸、癌细胞诱导的免疫功能障碍、降低的免疫应答、减弱的炎症、减少的主要组织相容性复合物(MHC)的表达、或癌症。EZH2是多梳抑制复合体2(PRC2)的酶亚单元，该复合体催化组蛋白3赖氨酸27(H3K27)的甲基化。组蛋白3赖氨酸27(H3K27)甲基化是有原因地与多种血液学和一种或多种实体人类癌症相关的转录抑制表观遗传标记。在人类癌症中已报道若干种导致H3K27的超三甲基化状态的分子机制。

本发明部分基于以下发现：EZH2抑制剂可有效治疗免疫逃逸、或表征为或由以下诱导的病症：癌细胞诱导的免疫功能障碍、降低的免疫应答、减弱的炎症、降低的MHC表达。

在某些实施例中，具有异常、误调或增加的EZH2活性的细胞、受试者、肿瘤或肿瘤细胞对本发明的EZH2抑制剂是敏感的。

人类滑膜肉瘤占所有软组织恶性肿瘤的8％-10％并且最常发生于年轻成人的四肢。复发性染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)将18号染色体上的SS18基因与X染色体上的三个密切相关基因SSX1、SSX2和极少地SSX4中的一个融合，得到框内融合蛋白，其中SS18的八个C-末端氨基酸被来自SSX C末端的78个氨基酸替代。这导致致癌的SS18-SSX融合蛋白的表达，该融合蛋白结合到SWI/SNF复合体，该复合体逐出野生型SS18和肿瘤抑制物INI1二者，该二者随后被降解。这导致异常基因表达并最终导致癌症的发展。

本发明提供在癌细胞中抑制免疫逃逸的方法，该方法包括使细胞与治疗有效量的EZH2抑制剂接触的步骤。

本发明还可提供在有需要的受试者中治疗或矫正癌细胞诱导的免疫功能障碍的方法，该方法包括向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂的步骤。

本发明还可提供在有需要的受试者中加强、增加或诱导免疫应答的方法，该方法包括向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂的步骤。

本发明还可提供在癌细胞中增加主要组织相容性复合物(MHC)的表达或活性的方法，该方法包括使该癌细胞与治疗有效量的EZH2抑制剂接触的步骤。

本发明还可提供在有需要的受试者中增强炎症的方法，该方法包括向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂的步骤。

本发明还可提供在有需要的受试者中治疗癌症或细胞增殖性病症的方法，该方法包括向该受试者给予治疗有效量的EZH2抑制剂的步骤。

本发明还可提供在有需要的受试者中测定包括EZH2抑制剂的治疗的有效性的可能性的方法，该方法包括以下步骤：(1)从该受试者获得生物学样品；和(2)分析与对照样品相比时该生物学样品中主要组织相容性复合物(MHC)的表达的降低。在生物学样品与对照样品相比具有降低的MHC表达时，包括EZH2抑制剂的治疗更可能在受试者中是有效的。

本发明还可提供在有需要的受试者中测定包括EZH2抑制剂的治疗的有效性的可能性的方法，该方法包括分析与对照样品相比时从受试者获得的生物学样品在样品中主要组织相容性复合物(MHC)表达的降低。如果生物学样品与对照样品相比时具有降低的MHC表达，那么包括EZH2抑制剂的治疗更可能在受试者中是有效的。

本发明还可提供在有需要的受试者中筛选包括EZH2抑制剂的治疗的有效性的方法，该方法包括(1)从受试者获得第一生物学样品和第二生物学样品；(2)使第二生物学样品与EZH2抑制剂接触；(3)分析第一生物学样品和第二生物学样品中主要组织相容性复合物(MHC)的表达；并且(4)比较第一生物学样品中的MHC表达与第二生物学样品中的MHC表达。如果与第一生物学样品中的表达相比时，第二生物学样品具有增加的MHC表达，那么包括EZH2抑制剂的治疗更可能在受试者中是有效的。

在本发明的实施例中，细胞或受试者包括异常、误调或增加的EZH2活性。

在本发明的实施例中，细胞或受试者包括染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)。

在本发明的实施例中，易位导致SS18-SSX融合基因。

在本发明的实施例中，细胞或受试者具有降低的INI1(本文中也称为BAF47、SNF5或SMARCB1)的功能或表达。在本发明的实施例中，细胞或受试者具有降低的INI1的功能和表达。在某些实施例中，细胞或受试者被视为或确定为INI1阴性或INI1缺陷。

在本发明的实施例中，EZH2抑制剂是具有以下化学式的化合物A：

在本发明的实施例中，EZH2抑制剂是以下项中的一个或多个：

在本发明的实施例中，该方法进一步包括给予化学治疗化合物，例如PD-1抑制剂、PD-L1抑制剂或CTLA-4抑制剂。

在本发明的实施例中，癌细胞在受试者(例如人类)体内。

在本发明的实施例中，免疫逃逸、癌细胞诱导的免疫功能障碍、需要加强的免疫应答、炎症或癌症表征为与非癌细胞相比时癌细胞中降低的以下项中的一个或多个的表达：MHC、β2微球蛋白、肿瘤坏死因子(TNF)受体、低分子质量多肽2(LMP2)、低分子质量多肽7(LMP7)、抗原加工相关转运蛋白(TAP)和TAP相关糖蛋白(泰帕森)。MHC可为人类白细胞抗原(HLA)，例如HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DMα、HLA-DMβ、HLA-DOα、HLA-DOβ1、HLA-DPα1、HLA-DPβ1、HLA-DRα、HLA-DRβ1、HLA-DRβ3.、HLA-DRβ4、HLA-E、HLA-F、HLA-G、HLA-K或HLA-L。

因此，本发明可提供在有需要的细胞或受试者中通过使细胞接触或向受试者给予治疗有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物，来治疗免疫逃逸、癌细胞诱导的免疫功能障碍、降低的免疫应答、减弱的炎症、降低的MHC表达的方法。本发明还可进一步提供本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物的用途，其用于制备可用于治疗免疫逃逸、癌细胞诱导的免疫功能障碍、降低的免疫应答、减弱的炎症、降低的MHC表达的药剂。

在实施例中，病症表征为异常、误调或增加的EZH2活性或表达。本文中所用的“异常的EZH2活性”是指细胞中EZH2的错误定位或EZH2与蛋白质复合体/在蛋白质复合体内的错误缔合。在实施例中，异常的EZH2活性是由于INI1的调节功能丧失所致，所述调节功能丧失又可因多种遗传变化而发生，一些所述遗传变化的实例在本文中加以更详细地讨论。在某些实施例中，异常、误调或增加的EZH2活性或表达与增加的H3K27三甲基化相关或导致增加的H3K27三甲基化。

在实施例中，病症表征为染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)。这种易位导致SS18-SSX融合基因。

在实施例中，需要治疗的受试者具有异常、误调或增加的EZH2活性。

在实施例中，需要治疗的受试者具有降低的INI1的功能或表达或功能和表达二者。在实施例中，受试者不具有可检测的INI1的功能或表达或功能和表达二者。

在本发明的实施例中，滑膜肉瘤表征为SSX1融合。在另一实施例中，滑膜肉瘤表征为SSX2融合。在实施例中，滑膜肉瘤表征为SSX4融合。在实施例中，需要治疗的受试者、治疗方案、给药的剂量和频率是根据所检测到的SSX融合的类型来选择。在实施例中，待给予的EZH2抑制剂还根据与癌症相关的SSX融合来选择。

本发明还可提供在有需要的受试者中通过向受试者给予治疗有效量的本文所述化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物治疗癌症的方法，其中需要治疗的受试者具有染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)或SS18-SSX融合基因。本发明进一步提供本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物的用途，其用于制备可用于治疗癌症的药剂。

在实施例中，该方法包括在给药步骤之前测定来自受试者的样品中染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)或SS18-SSX融合基因的存在的步骤。

测定样品中染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)的存在可用任何本领域已知方法来进行。例如，其可通过用于SS18-SSX转录物的核型分析和RT-PCR；或通过FISH(荧光原位杂交)来测定。SS18-SSX融合基因可通过任何本领域已知方法来检测。例如，其可通过RT-PCT、免疫组织染色分析或荧光原位杂交(FISH)来检测。

待治疗的癌症可以通过DNA细胞计量术、流式细胞术或图像细胞仪来评估。待治疗的癌症可分型为具有10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、或90％的在细胞分裂的合成阶段(如在细胞分裂的S期)的细胞。待治疗的癌症可以分型为具有低S期分数或高S期分数。

在本发明的方面中，滑膜肉瘤是单相滑膜肉瘤。在本发明的其他方面中，滑膜肉瘤是双相滑膜肉瘤。

本发明还提供包括以下步骤的方法：在来自受试者的样品中检测染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)或SS18-SSX融合基因的存在，以及通过给予治疗有效量的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物来治疗受试者。

本发明进一步提供包括选择治疗方案的方法，所述治疗方案包括向候选受试者给予治疗有效量的化合物或其药学上可接受的盐或溶剂合物。治疗方案还可包括手术、化学疗法、放射疗法、免疫疗法或其任何组合。

在实施例中，本发明的方法包括将治疗有效量的EZH2抑制剂给予受试者、手术、化学疗法、放射疗法、针刺、免疫疗法或其任何组合。可在滑膜肉瘤、尤其在晚期或转移疾病的治疗中推荐化学疗法(通常是多柔比星和/或异环磷酰胺)。

本发明进一步提供在有需要的受试者中通过向受试者给予治疗有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物来治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的癌症或细胞增殖性病症的方法。例如，癌症是滑膜肉瘤。例如，癌症是上皮样肉瘤、骨外粘液样软骨肉瘤、恶性横纹肌样瘤或非典型脊索瘤。

例如，本文中可使用的EZH2抑制剂包括化合物A、B、C、D或E。化合物A在本文中还称为E7438或EPZ-6438。

如本文所用的“有需要的受试者”是患有与异常、误调或增加的EZH2活性相关的癌症的受试者或患有由染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)介导的癌症的受试者。例如，有需要的受试者患有滑膜肉瘤。

在实施例中，有需要的受试者具有至少一次用于治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的病症的先前治疗。

在实施例中，受试者患有在最近期治疗时难治性癌症。“难治性癌症”意指对治疗无反应的本文所述的任何癌症，包括滑膜肉瘤。该癌症可以在治疗开始时就有抗性，或在治疗期间变得有抗性。难治性癌症也称为抗性癌症。在实施例中，有需要的受试者具有在最近期治疗缓解后的癌症复发。在实施例中，受试者接受用于该受试者所患滑膜肉瘤的所有已知有效疗法并且无效。

在实施例中，受试者同时使用用于治疗由染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)介导的癌症(例如滑膜肉瘤)的另一种疗法治疗。

“受试者”包括哺乳动物。哺乳动物可为例如任何哺乳动物，例如人类、灵长类、小鼠、大鼠、犬、猫、牛、马、山羊、骆驼、绵羊或猪。优选地，该哺乳动物是人类。

在实施例中，受试者具有增加的组蛋白H3的Lys27的三甲基化水平(H3-K27me3)。在实施例中，异常、误调或增加的EZH2活性或染色体易位t(x；18)(p11.2；q11.2)与增加的H3-K27me的三甲基化水平相关。

如本文所用“来自受试者的样品”是指从受试者获得或衍生的任何含有细胞或细胞组分的适宜样品。例如，在实施例中，样品包括癌细胞。在实施例中，样品是从例如软组织(例如关节)获得的活检样品。在实施例中，样品是从并非软组织或除了软组织以外的组织获得的活检样品。例如，在实施例中，样品是来自癌症、例如由癌细胞组成的肿瘤的活检物。可根据本领域的技术人员熟悉的方法将样品中的细胞与样品中的其他组分分离。例如，在实施例中，样品是组织、器官或体液，例如全血、血浆、血清、尿液、唾液、生殖道分泌物、脑脊液、汗液或排泄物。

如本文所用“单一疗法”是指向有需要的受试者给予单一活性或治疗性化合物。优选地，单一疗法将涉及给予治疗有效量的单一活性化合物。例如，使用一种本发明化合物或其药学上可接受的盐或溶剂合物的癌症单一疗法用于需要治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的癌症的受试者。在一个方面中，单一活性化合物是本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物。在某一实施例中，单一活性化合物是他折司他。

如本文所用“治疗”(“treating”或“treat”)描述出于对抗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的疾病、病状或病症的目的对患者的管理和护理，并且包括给予本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物，以减轻该疾病、病状或病症的症状或并发症或消除该疾病、病状或病症。

本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物还可用于预防与异常、误调或增加的EZH2活性相关的疾病、病状或病症。本文使用的“预防”(“preventing”或“prevent”)描述了减少或消除疾病、病症或失调的症状或并发症的发作。

本文使用的“减轻”一词是指用来描述一个过程，其中疾病的体征或症状的严重性降低。重要的是，体征或症状可以减轻而不被消除。在一个优选的实施例中，给予本发明的药物组合物导致体征或症状的消除，然而，不需要消除。有效剂量预期降低体征或症状的严重性。例如，可能发生在多个位置的病症如癌症的体征或症状得以减轻的条件是该癌症的严重性在多个位置中的至少一个内下降了。

本文使用的“症状”一词被定义为疾病、病、损伤或某些在体内不正常的指示。症状被经历该症状的个人感觉到或注意到，但可能不容易被其他人注意。其他人被定义为非医护人员。

本文所用的“体征”一词也被定义为某些在体内不正常的指示。但体征被定义为可以由医生、护士和其他卫生保健专业人士可以看出的事物。

用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致肿瘤的尺寸或体积减小、或肿瘤生长或再生长的降低、或上述的任一组合。肿瘤尺寸或体积的减小也可称为“肿瘤消退”。优选地，在治疗后，肿瘤尺寸相对于治疗前的肿瘤尺寸减小5％或更多；更优选地，肿瘤尺寸减小10％或更多；更优选地，减小20％或更多；更优选地，减小30％或更多；更优选地，减小40％或更多；甚至更优选地，减小50％或更多；并且最优选地，减小多于75％或更多。肿瘤的尺寸或体积可以通过任何可重复的测量方式来测量。肿瘤的尺寸或体积可作为肿瘤的直径来测量。

用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性或表达相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致肿瘤数减少。优选地，在治疗后，肿瘤数相对于治疗前的数目减小5％或更多；更优选地，肿瘤数减少10％或更多；更优选地，减少20％或更多；更优选地，减少30％或更多；更优选地，减少40％或更多；甚至更优选地，减小50％或更多；并且最优选地，减少多于75％。肿瘤数可通过任何可重复测量方式来测量。肿瘤数可以通过计数肉眼或在指定的放大率下可见的肿瘤来测量。

用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致与未经治疗受试者或仅接受载体的受试者的群体相比，接受治疗的受试者群体的平均存活时间延长或死亡率降低或两种情况都发生。在某一实施例中，接受治疗的受试者群体接受使用并非本发明化合物的药物或药物组合的疗法。优选地，平均存活时间延长超过10天、20天或30天；更优选地，延长超过60天；更优选地，延长超过90天；并且最优选地，延长超过120天。群体的平均存活时间的延长可以通过任何可重复的方式来测量。群体的平均存活时间的延长可以例如通过使用活性化合物治疗开始后计算群体的平均存活长度来测量。群体的平均存活时间的延长可以例如通过使用活性化合物治疗第一轮完成后计算群体的平均存活长度来测量。

用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致与仅接受载体的群体相比，接受治疗的受试者群体的死亡率降低。用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致与未经治疗的群体相比，接受治疗的受试者群体的死亡率降低。用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致与接受使用并非本发明化合物或其药学上可接受的盐或溶剂合物的药物的单一疗法的群体相比，接受治疗的受试者群体的死亡率降低。优选地，死亡率降低超过2％；更优选地，降低超过5％；更优选地，降低超过10％；并且最优选地，降低超过25％。接受治疗的受试者群体的死亡率的降低可以通过任何可重复的方式来测量。群体的死亡率的降低可以例如通过使用活性化合物治疗开始后计算每个单位时间内群体的疾病相关死亡的平均数量来测量。群体的死亡率的降低可以例如通过使用活性化合物治疗第一轮完成后计算每个单位时间内群体的疾病相关死亡的平均数量来测量。

用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致肿瘤生长速率降低。优选地，在治疗后，肿瘤生长速率相对于治疗之前的数值降低至少5％；更优选地，肿瘤生长速率降低至少10％；更优选地，降低至少20％；更优选地，降低至少30％；更优选地，降低至少40％；更优选地，降低至少50％；甚至更优选地，降低至少50％；并且最优选地，降低至少75％。肿瘤生长率可通过任何可重复测量方式来测量。肿瘤生长率可以根据每个单位时间内肿瘤直径的变化来测量。

用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致肿瘤再生长的降低。优选地，在治疗后，肿瘤再生长低于5％；更优选地，肿瘤再生长低于10％；更优选地，低于20％；更优选地，低于30％；更优选地，低于40％；更优选地，低于50％；甚至更优选地，低于50％；并且最优选地，低于75％。肿瘤再生长可通过任何可重复测量方式来测量。肿瘤再生长例如是通过测量治疗后的居前肿瘤收缩后肿瘤直径的增加来测量。治疗停止后肿瘤复发的失败表示肿瘤再生长的降低。

用本文所述方法治疗或预防与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症可导致具有异常外观或形态的细胞的数目或比例下降。优选地，在治疗后，具有异常形态的细胞数相对于其在治疗之前的数目减少至少5％；更优选地，减少至少10％；更优选地，减少至少20％；更优选地，减少至少30％；更优选地，减少至少40％；更优选地，减少至少50％；甚至更优选地，减少至少50％；并且最优选地，减少至少75％。异常细胞的外观或形态可通过任何可重复测量方式来测量。异常细胞形态可通过显微镜检查，例如使用倒置的组织培养显微镜来测量。异常细胞形态可以采取核多形性的形式。

用本文所述化合物治疗与异常、误调或增加的EZH2活性相关的一种或多种癌症或一种或多种细胞增殖性病症可导致细胞死亡，并且优选地，细胞死亡导致群体中的细胞数减少至少10％。更优选地，细胞死亡意指减少至少20％；更优选地，减少至少30％；更优选地，减少至少40％；更优选地，减少至少50％；最优选地，减少至少75％。群体中细胞数可以通过任何可重复的方式来测量。群体中细胞数可以通过荧光激活细胞分选(FACS)、免疫荧光显微镜和光学显微镜来测量。测量细胞死亡的方法示于李(Li)等人，美国国家科学院院刊(Proc Natl Acad Sci U S A.)100(5):2674-8,2003中。在某一方面中，细胞死亡是通过细胞凋亡来进行。

如本文所用术语“选择性地”意味着倾向于在一个群体中的发生频率高于在另一个群体中。所比较群体可为细胞群体。优选地，本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物选择性地作用于癌症或癌前细胞，但不作用于正常细胞。优选地，本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物选择性地作用以调节一个分子靶(例如，靶蛋白甲基转移酶)，但不显著调节另一分子靶(例如，非靶蛋白甲基转移酶)。本发明还提供选择性的抑制酶例如EZH2的活性的方法。优选地，如果事件在群体A中的发生频率大于在群体B中发生频率的两倍，那么相对于群体B，该事件选择性地发生于群体A中。如果事件在群体A中的发生频率大于5倍，那么该事件选择性地发生。如果事件在群体A中的发生频率大于群体B的10倍；更优选地，大于50倍；甚至更优选地，大于100倍；并且最优选地，在群体A中的频率大于1000倍，那么该事件选择性地发生。例如，如果细胞死亡在癌细胞中的发生频率大于正常细胞的两倍，那么将认为细胞死亡在癌细胞中选择性地发生。

将本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物给予有需要的细胞或受试者可导致对EZH2活性的调节(即抑制)。

将本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物给予有需要的细胞或受试者导致对EZH2的调节(即抑制)。

激活是指放置物质组合物(例如蛋白质或核酸)进入适合执行期望的生物学功能的状态。能被激活的物质组合物也有非激活的状态。激活的物质组合物可以具有抑制或刺激的生物学功能或两者。

提高是指物质组合物(例如蛋白质或核酸)的期望的生物学活性的增加。提高可以通过物质组合物的浓度增加而发生。

可用于本文所述任何方法中的化合物(即EZH2抑制剂)可具有以下化学式I：

R

R

R

R

R

n

例如，R

例如，R

例如，化合物具有以下化学式II：

例如，R

例如，R

例如，R

例如，R

例如，R

例如，R

例如，R

例如，R

例如，R

可用于本文所述任何方法中的化合物(即EZH2抑制剂)可具有以下化学式III：

在此化学式中：

R

R

R

R

例如，Q

例如，R

例如，R

例如，R

例如，本发明化合物具有以下化学式IVa或IVb：

例如，R

例如，R

例如，R

本发明化合物可具有以下化学式(V)：

在此化学式中：

R

R

R

R

例如，R

例如，本发明化合物具有以下化学式(VI)：

本发明的化合物可具有以下化学式(VIa)：

R

R

R

例如，R

例如，R

例如，R

例如，R

在实施例中，可用于本文所呈现的任何方法中的化合物是：

在实施例中，可用于本文所呈现的任何方法中的化合物是：

或者，EZH2抑制剂选自下组，该组由以下各项组成：化合物B和C、所述化合物的立体异构体和所述化合物的药学上可接受的盐。

在实施例中，可用于本文所呈现的任何方法中的化合物是化合物F：

在实施例中，适用于本发明方法中的化合物包括具有化学式(VII)化合物：

其中，

V

V

X和Z独立地选自下组，该组由以下各项组成：氢、(C

Y是H或卤素；

R

R

R

R

R

其中任何(C

其中所述芳基、杂芳基、芳基(C

R

或R

或R

R

或其盐。

由具有化学式(I)的一般结构涵盖的化合物的亚组表示如下：

具有化学式(VII)的亚组A

X和Z选自下组，该组由以下各项组成：(C

Y是H或F；

R

R

R

R

R

其中任何(C

R

或R

或R

其中在(1)中，

A是O、NH或S；B是CH或N，并且C是氢或C

其中在(2)中，

D是任选地由氢或C

其中在(3)中，

E是NH或CH

其中在(4)中，

J是O、S或CO；或

其中在(5)中，

Q是CH或N；

M是CH或N；并且

L/(5)是氢、卤素、氨基、氰基、(C

其中任何(C

其中在(6)中，

L/(6)是NH或CH

其中在7中，

M/(7)是氢、卤素、氨基、氰基、(C

其中任何(C

OR

其中在(8)中，

P是CH

其中在(9)中，

S/(9)和T/(9)是C，或S/(9)是C并且T/(9)是N，或S/(9)是N并且T/(9)是C；

R是氢、氨基、甲基、三氟甲基或卤素；

U是氢、卤素、氨基、氰基、硝基、三氟甲基、(C

其中任何(C

具有化学式(VII)的亚组B

X和Z独立地选自下组，该组由以下各项组成：(C

Y是H；

R

R

R

R

R

其中任何(C

R

或R

或R

其中在(1)中，

A是O、NH或S；B是CH或N，并且C是氢或C

其中在(2)中，

D是任选地由氢或C

其中在(3)中，

E是NH或CH

其中在(4)中，

J是O、S或CO；或

其中在(5)中，

Q是CH或N；

M是CH或N；并且

L/(5)是氢、卤素、氨基、氰基、(C

其中任何(C

其中R

其中在(6)中，

L/(6)是NH或CH

其中在(7)中，

M/(7)是氢、卤素、氨基、氰基、(C

其中任何(C

其中在(8)中，

P是CH

其中在(9)中，

S/(9)和T/(9)是C，或S/(9)是C并且T/(9)是N，或S/(9)是N并且T/(9)是C；

R是氢、氨基、甲基、三氟甲基、卤素；

U是氢、卤素、氨基、氰基、硝基、三氟甲基、(C

其中任何(C

在实施例中，EZH2抑制剂是化合物G或GSK-126：

在某些实施例中，可用于本文所呈现任何方法中的EZH2抑制剂是化合物H：

在某些实施例中，可用于本文所呈现任何方法中的EZH2抑制剂是化合物Ga-Gc中的任一个：

在某些实施例中，可用于本文所呈现任何方法中的EZH2抑制剂是CPI-1205或GSK343。

在一个实施例中，本文所披露的化合物(例如，EZH2抑制剂)是化合物自身，即游离碱或“裸”分子。在另一实施例中，化合物是其盐，例如裸分子的单-HCl或三-HCl盐、单-HBr或三-HBr盐。

本文中所述的化合物可根据本领域已知的任何方法来合成。例如，具有化学式(VII)的化合物可根据以下文献中描述的方法来合成：WO 2011/140325；WO 2011/140324；和WO 2012/005805，将其各自通过引用以其全文结合在此。

如本文所用“烷基”、“C

在实施例中，直链或支链烷基具有六个或更少碳原子(例如，对于直链为C

如本文所用术语“环烷基”是指具有3至30个碳原子(例如，C

术语“任选地经取代的烷基”是指未经取代的烷基或具有指定取代基替代烃主链的一个或多个碳上的一个或多个氢原子的烷基。所述取代基可包括例如烷基、烯基、炔基、卤素、羟基、烷基羰氧基、芳基羰氧基、烷氧基羰氧基、芳氧基羰氧基、羧酸根、烷基羰基、芳基羰基、烷氧基羰基、氨基羰基、烷基氨基羰基、二烷基氨基羰基、烷基硫代羰基、烷氧基、磷酸根、膦酸基、次膦酸基、氨基(包括烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、二芳基氨基和烷基芳基氨基)、酰基氨基(包括烷基羰基氨基、芳基羰基氨基、氨基甲酰基和脲基)、脒基、亚氨基、巯基、烷硫基、芳硫基、硫代羧酸根、硫酸根、烷基亚磺酰基、磺酸基、氨磺酰基、磺酰胺基、硝基、三氟甲基、氰基、叠氮基、杂环基、烷基芳基或芳香族或杂芳香族部分。

“芳基烷基”或“芳烷基”部分是经芳基取代的烷基(例如，苯基甲基(苄基))。“烷基芳基”部分是经烷基取代的芳基(例如，甲基苯基)。

如本文所用“烷基接头”旨在包括C

“烯基”包括在长度和可能的取代方面与上述烷基相似但含有至少一个双键的不饱和脂肪族基团。例如，术语“烯基”包括直链烯基(例如，乙烯基、丙烯基、丁烯基、戊烯基、己烯基、庚烯基、辛烯基、壬烯基、癸烯基)和支链烯基。在实施例中，直链或支链烯基在其主链中具有六个或更少碳原子(例如，对于直链为C

术语“任选地经取代的烯基”是指未经取代的烯基或具有指定取代基替代一个或多个烃主链碳原子上的一个或多个氢原子的烯基。所述取代基可包括例如烷基、烯基、炔基、卤素、羟基、烷基羰氧基、芳基羰氧基、烷氧基羰氧基、芳氧基羰氧基、羧酸根、烷基羰基、芳基羰基、烷氧基羰基、氨基羰基、烷基氨基羰基、二烷基氨基羰基、烷基硫代羰基、烷氧基、磷酸根、膦酸基、次膦酸基、氨基(包括烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、二芳基氨基和烷基芳基氨基)、酰基氨基(包括烷基羰基氨基、芳基羰基氨基、氨基甲酰基和脲基)、脒基、亚氨基、巯基、烷硫基、芳硫基、硫代羧酸根、硫酸根、烷基亚磺酰基、磺酸基、氨磺酰基、磺酰胺基、硝基、三氟甲基、氰基、杂环基、烷基芳基或芳香族或杂芳香族部分。

“炔基”包括在长度和可能的取代方面与上述烷基相似但含有至少一个三键的不饱和脂肪族基团。例如，“炔基”包括直链炔基(例如，乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基、庚炔基、辛炔基、壬炔基、癸炔基)和支链炔基。在实施例中，直链或支链炔基在其主链中具有六个或更少碳原子(例如，对于直链为C

术语“任选地经取代的炔基”是指未经取代的炔基或具有指定取代基替代一个或多个烃主链碳原子上的一个或多个氢原子的炔基。所述取代基可包括例如烷基、烯基、炔基、卤素、羟基、烷基羰氧基、芳基羰氧基、烷氧基羰氧基、芳氧基羰氧基、羧酸根、烷基羰基、芳基羰基、烷氧基羰基、氨基羰基、烷基氨基羰基、二烷基氨基羰基、烷基硫代羰基、烷氧基、磷酸根、膦酸基、次膦酸基、氨基(包括烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、二芳基氨基和烷基芳基氨基)、酰基氨基(包括烷基羰基氨基、芳基羰基氨基、氨基甲酰基和脲基)、脒基、亚氨基、巯基、烷硫基、芳硫基、硫代羧酸根、硫酸根、烷基亚磺酰基、磺酸基、氨磺酰基、磺酰胺基、硝基、三氟甲基、氰基、叠氮基、杂环基、烷基芳基或芳香族或杂芳香族部分。

其他任选经取代的部分(例如任选经取代的环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基)包括未经取代的部分和具有指定取代基中的一个或多个的部分二者。例如，经取代的杂环烷基包括经一个或多个烷基取代的杂环烷基，例如2,2,6,6-四甲基-哌啶基和2,2,6,6-四甲基-1,2,3,6-四氢吡啶基。

“芳基”包括具有芳香性的基团，包括具有至少一个芳香族环的“共轭的”或多环系统并且在环结构中不含任何杂原子。实例包括苯基、苄基、1,2,3,4-四氢萘基等。

“杂芳基”是如上文所定义的芳基，但在环结构中具有一至四个杂原子，并且还可称为“芳基杂环”或“杂芳香族基团”。如本文所用术语“杂芳基”旨在包括由碳原子以及一个或多个独立地选自由氮、氧和硫组成的组的杂原子(例如1或1-2或1-3或1-4或1-5或1-6个杂原子，或例如1、2、3、4、5或6个杂原子)组成的稳定的5元、6元或7元单环或7元、8元、9元、10元、11元或12元二环芳香族杂环。氮原子可经取代或未经取代(即，N或NR，其中R是H或如所定义的其他取代基)。氮和硫杂原子可任选地发生氧化(即，N→O和S(O)

杂芳基的实例包括吡咯、呋喃、噻吩、噻唑、异噻唑、咪唑、三唑、四唑、吡唑、噁唑、异噁唑、吡啶、吡嗪、哒嗪、嘧啶等。

另外，术语“芳基”和“杂芳基”包括多环芳基和杂芳基，例如三环、二环，例如萘、苯并噁唑、苯并二噁唑、苯并噻唑、苯并咪唑、苯并噻吩、亚甲基二氧苯基、喹啉、异喹啉、萘啶、吲哚、苯并呋喃、嘌呤、苯并呋喃、脱氮杂嘌呤、中氮茚。

在多环芳香族环的情况中，仅需要环中的一个是芳香族(例如，2,3-二氢吲哚)，但所有环都可以是芳香族(例如，喹啉)。第二环也可以是稠合或桥接的。

环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基环可在一个或多个环位置经如上文所述的所述取代基取代(例如，成环碳或杂原子，例如N)，所述取代基例如烷基、烯基、炔基、卤素、羟基、烷氧基、烷基羰氧基、芳基羰氧基、烷氧基羰氧基、芳氧基羰氧基、羧酸根、烷基羰基、烷基氨基羰基、芳烷基氨基羰基、烯基氨基羰基、烷基羰基、芳基羰基、芳烷基羰基、烯基羰基、烷氧基羰基、氨基羰基、烷基硫代羰基、磷酸根、膦酸基、次膦酸基、氨基(包括烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、二芳基氨基和烷基芳基氨基)、酰基氨基(包括烷基羰基氨基、芳基羰基氨基、氨基甲酰基和脲基)、脒基、亚氨基、巯基、烷硫基、芳硫基、硫代羧酸根、硫酸根、烷基亚磺酰基、磺酸基、氨磺酰基、磺酰胺基、硝基、三氟甲基、氰基、叠氮基、杂环基、烷基芳基或芳香族或杂芳香族部分。芳基和杂芳基也可以与不是芳香族的脂环族环或杂环稠合或桥接，以形成多环系统(例如，四氢萘、亚甲基二氧苯基)。

如本文所用“碳环”(“carbocycle”或“carbocyclic ring”)旨在包括任何具有指定碳数目的稳定单环、二环或三环，其中任一个可为饱和、不饱和或芳香族的。碳环包括环烷基和芳基。例如，C

如本文所用“杂环”或“杂环基”包括含有至少一个环杂原子(例如，N、O或S)的任何环结构(饱和、不饱和或芳香族)。杂环包括杂环烷基和杂芳基。杂环的实例包括但不限于吗啉、吡咯烷、四氢噻吩、哌啶、哌嗪、氧杂环丁烷、吡喃、四氢吡喃、氮杂环丁烷和四氢呋喃。

杂环基的实例包括但不限于吖啶基、吖辛因基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、苯并硫代呋喃基、苯并苯硫基、苯并噁唑基、苯并噁唑啉基、苯并噻唑基、苯并三唑基、苯并四唑基、苯并异噁唑基、苯并异噻唑基、苯并咪唑啉基、咔唑基、4aH-咔唑基、咔啉基、色烷基、色烯基、噌啉基、十氢喹啉基、2H,6H-1,5,2-二噻嗪基、二氢氟[2,3-b]四氢呋喃、呋喃基、呋咱基、咪唑烷基、咪唑啉基、咪唑基、1H-吲唑基、吲哚烯基、二氢吲哚基、吲嗪基、吲哚基、3H-吲哚基、靛红酰基、异苯并呋喃基、异色烷基、异吲唑基、异吲哚啉基、异吲哚基、异喹啉基、异噻唑基、异噁唑基、亚甲基二氧苯基、吗啉基、萘啶基、八氢异喹啉基、噁二唑基、1,2,3-噁二唑基、1,2,4-噁二唑基、1,2,5-噁二唑基、1,3,4-噁二唑基、1,2,4-噁二唑5(4H)-酮、噁唑烷基、噁唑基、羟吲哚基、嘧啶基、菲啶基、菲咯啉基、吩嗪基、吩噻嗪基、吩噁噻基、吩噁噻嗯基(phenoxathinyl)、吩噁嗪基、酞嗪基、哌嗪基、哌啶基、哌啶酮基、4-哌啶酮基、胡椒基、蝶啶基、嘌呤基、吡喃基、吡嗪基、吡唑烷基、吡唑啉基、吡唑基、哒嗪基、吡啶并噁唑、吡啶并咪唑、吡啶并噻唑、吡啶基(pyridinyl)、吡啶基(pyridyl)、嘧啶基、吡咯烷基、吡咯啉基、2H-吡咯基、吡咯基、喹唑啉基、喹啉基、4H-喹嗪基、喹噁啉基、奎宁环基、四氢呋喃基、四氢异喹啉基、四氢喹啉基、四唑基、6H-1,2,5-噻二嗪基、1,2,3-噻二唑基、1,2,4-噻二唑基、1,2,5-噻二唑基、1,3,4-噻二唑基、噻蒽基、噻唑基、噻吩基、噻吩并噻唑基、噻吩并噁唑基、噻吩并咪唑基、苯硫基、三嗪基、1,2,3-三唑基、1,2,4-三唑基、1,2,5-三唑基、1,3,4-三唑基和呫吨基。

如本文所用术语“经取代”意味着指定原子上的任何一个或多个氢经所选择的所指示基团替代，其条件是不超过指定原子的正常化合价，并且该取代得到稳定化合物。在取代基是氧代基或酮基(即，＝O)时，则该原子上的2个氢原子被替代。酮基取代基不存在于芳香族部分上。如本文所用环双键是在两个相邻环原子之间形成的双键(例如，C＝C、C＝N或N＝N)。“稳定化合物”和“稳定结构”意欲指示足够稳健而可在从反应混合物分离至可用纯度、并且配制为有效治疗剂后幸存的化合物。

在与一取代基的键显示与连接环中两个原子的键交叉时，则这种取代基可键合到环中的任何原子上。在列示取代基但不指明这种取代基通过哪个原子键合到给定化学式的化合物的剩余部分时，则所述取代基可通过这种化学式中的任何原子键合。取代基或变量的组合是允许的(或二者都有)，但仅在此类组合得到稳定化合物时允许。

在任何变量(例如，R

术语“羟基”(“hydroxy”或“hydroxyl”)包括具有-OH或-O

如本文所用“卤代”或“卤素”是指氟、氯、溴和碘。术语“全卤化”通常是指其中所有氢原子都由卤素原子替代的部分。术语“卤代烷基”或“卤代烷氧基”是指经一个或多个卤素原子取代的烷基或烷氧基。

术语“羰基”包括含有以双键连接到氧原子的碳的化合物和部分。含有羰基的部分的实例包括但不限于醛、酮、羧酸、酰胺、酯、酸酐等。

术语“羧基”是指-COOH或其C

“酰基”包括含有酰基(R-C(O)-)或羰基的部分。“经取代的酰基”包括其中氢原子中的一个或多个由例如以下基团替代的酰基：烷基、炔基、卤素、羟基、烷基羰氧基、芳基羰氧基、烷氧基羰氧基、芳氧基羰氧基、羧酸根、烷基羰基、芳基羰基、烷氧基羰基、氨基羰基、烷基氨基羰基、二烷基氨基羰基、烷基硫代羰基、烷氧基、磷酸根、膦酸基、次膦酸基、氨基(包括烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、二芳基氨基和烷基芳基氨基)、酰基氨基(包括烷基羰基氨基、芳基羰基氨基、氨基甲酰基和脲基)、脒基、亚氨基、巯基、烷硫基、芳硫基、硫代羧酸根、硫酸根、烷基亚磺酰基、磺酸基、氨磺酰基、磺酰胺基、硝基、三氟甲基、氰基、叠氮基、杂环基、烷基芳基或芳香族或杂芳香族部分。

“芳酰基”包括具有结合到羰基的芳基或杂芳香族部分的部分。芳酰基的实例包括苯基羧基、萘基羧基等。

“烷氧基烷基”、“烷基氨基烷基”和“硫代烷氧基烷基”包括如上文所述的烷基，其中氧、氮或硫原子替代一个或多个烃主链碳原子。

术语“烷氧基”(“alkoxy”或“alkoxyl”)包括共价连接到氧原子的经取代和未经取代的烷基、烯基和炔基。烷氧基或烷氧基团的实例包括但不限于甲氧基、乙氧基、异丙氧基、丙氧基、丁氧基和戊氧基。经取代烷氧基的实例包括卤化烷氧基。烷氧基可经例如以下的基团取代：烯基、炔基、卤素、羟基、烷基羰氧基、芳基羰氧基、烷氧基羰氧基、芳氧基羰氧基、羧酸根、烷基羰基、芳基羰基、烷氧基羰基、氨基羰基、烷基氨基羰基、二烷基氨基羰基、烷基硫代羰基、烷氧基、磷酸根、膦酸基、次膦酸基、氨基(包括烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、二芳基氨基和烷基芳基氨基)、酰基氨基(包括烷基羰基氨基、芳基羰基氨基、氨基甲酰基和脲基)、脒基、亚氨基、巯基、烷硫基、芳硫基、硫代羧酸根、硫酸根、烷基亚磺酰基、磺酸基、氨磺酰基、磺酰胺基、硝基、三氟甲基、氰基、叠氮基、杂环基、烷基芳基或芳香族或杂芳香族部分。卤素取代的烷氧基的实例包括但不限于氟甲氧基、二氟甲氧基、三氟甲氧基、氯甲氧基、二氯甲氧基和三氯甲氧基。

术语“醚”或“烷氧基”包括含有键合到两个碳原子或杂原子的氧的化合物或部分。例如，该术语包括“烷氧基烷基”，其是指共价键合到与烷基共价键合的氧原子的烷基、烯基或炔基。

术语“酯”包括含有结合到与羰基碳键合的氧原子的碳或杂原子的化合物或部分。术语“酯”包括烷氧基羧基，例如甲氧基羰基、乙氧基羰基、丙氧基羰基、丁氧基羰基、戊氧基羰基等。

术语“硫代烷基”包括含有与硫原子连接的烷基的化合物或部分。硫代烷基可经例如以下的基团取代：烷基、烯基、炔基、卤素、羟基、烷基羰氧基、芳基羰氧基、烷氧基羰氧基、芳氧基羰氧基、羧酸根、羧酸、烷基羰基、芳基羰基、烷氧基羰基、氨基羰基、烷基氨基羰基、二烷基氨基羰基、烷基硫代羰基、烷氧基、氨基(包括烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、二芳基氨基和烷基芳基氨基)、酰基氨基(包括烷基羰基氨基、芳基羰基氨基、氨基甲酰基和脲基)、脒基、亚氨基、巯基、烷硫基、芳硫基、硫代羧酸根、硫酸根、烷基亚磺酰基、磺酸基、氨磺酰基、磺酰胺基、硝基、三氟甲基、氰基、叠氮基、杂环基、烷基芳基或芳香族或杂芳香族部分。

术语“硫代羰基”或“硫代羧基”包括含有以双键连接到硫原子的碳的化合物和部分。

术语“硫醚”包括含有键合到两个碳原子或杂原子的硫原子的部分。硫醚的实例包括但不限于烷硫代烷基、烷硫代烯基和烷硫代炔基。术语“烷硫代烷基”包括具有键合到与烷基键合的硫原子的烷基、烯基或炔基的部分。类似地，术语“烷硫代烯基”是指其中烷基、烯基或炔基键合到与烯基共价键合的硫原子的部分；并且“烷硫代炔基”是指其中烷基、烯基或炔基键合到与炔基共价键合的硫原子的部分。

如本文所用“胺”或“氨基”是指未经取代或经取代的-NH

术语“酰胺”或“氨基羧基”包括含有结合到羰基或硫代羰基的碳上的氮原子的化合物或部分。该术语包括“烷氨基羧基”，其包括结合到与羰基或硫代羰基的碳结合的氨基上的烷基、烯基或炔基。其还包括“芳基氨基羧基”，其包括结合到与羰基或硫代羰基的碳结合的氨基上的芳基或杂芳基部分。术语“烷基氨基羧基”、“烯基氨基羧基”、“炔基氨基羧基”和“芳基氨基羧基”包括其中烷基、烯基、炔基和芳基部分分别结合到氮原子的部分，该氮原子又结合到羰基碳。酰胺可经例如以下的取代基取代：直链烷基、支链烷基、环烷基、芳基、杂芳基或杂环。酰胺基团上的取代基可进一步经取代。

在本说明书中，为方便起见，在一些情形中，化合物的结构式代表某一异构体，但本发明包括所有异构体，例如几何异构体、基于不对称碳的光学异构体、立体异构体、互变异构体等，应理解，并非所有异构体都可具有相同活性水平。另外，由化学式代表的化合物可存在晶体多晶型物。应注意，任何晶形、晶形混合物或其无水物或水合物包含于本发明的范围内。

“异构现象”意指具有相同分子式但其原子的键合顺序或其原子的空间排列不同的化合物。原子空间排列不同的异构体称为“立体异构体”。并非彼此的镜像的立体异构体称为“非对映异构体”，并且是彼此的不可重叠的镜像的立体异构体称为“对映异构体”或有时称为光学异构体。含有等量的具有相反手性的单独对映异构形式的混合物称为“外消旋混合物”。

键合到四个不相同取代基的碳原子称为“手性中心”。

“手性异构体”意指具有至少一个手性中心的化合物。具有多于一个手性中心的化合物可作为单独非对映异构体或作为非对映异构体的混合物存在，称为“非对映异构混合物”。在存在一个手性中心时，立体异构体可通过该手性中心的绝对构型(R或S)来表征。绝对构型是指附接到手性中心的取代基的空间排列。所考虑的附接到手性中心的取代基是根据卡恩(Cahn)、英戈尔德(Ingold)和普雷洛格(Prelog)的序列规则(Sequence Rule)来排列(卡恩等人，应用化学国际版(Angew.Chem.Inter.Edit.)1966,5,385；勘误表511；卡恩等人，应用化学(Angew.Chem.)1966,78,413；卡恩和英戈尔德,化学学会杂志(J.Chem.Soc.)1951(伦敦),612；卡恩等人,实验(Experientia)1956,12,81；卡恩，化学教育杂志(J.Chem.Educ.)1964,41,116)。

“几何异构体”意指因围绕双键或环烷基接头(例如，1,3-环丁基)的旋转受阻而存在的非对映异构体。这些构型的名称是通过前缀顺式和反式或Z和E来区分，这些前缀指示根据卡恩-英戈尔德-普雷洛格规则，基团位于分子中双键的同侧或对侧。

应理解，本发明的化合物可描述为不同手性异构体或几何异构体。还应理解，在化合物具有手性异构或几何异构形式时，所有异构形式旨在包含于本发明的范围内，并且化合物的命名不排除任何异构形式，应理解，并非所有异构体都可具有相同活性水平。

另外，本发明中讨论的结构和其他化合物包括所有阻转异构体，应理解，并非所有阻转异构体都可具有相同活性水平。“阻转异构体”是其中两个异构体的原子空间排列不同的立体异构体类型。阻转异构体是因大基团围绕中心键的旋转受阻引起的旋转受限而存在。所述阻转异构体通常作为混合物存在，但由于色谱技术的最新发展，已可能在所选情形中分离两种阻转异构体的混合物。

“互变异构体”是两种或更多种结构异构体中的一种，所述异构体存在于平衡中并且易于从一种异构形式转化到另一种异构形式。这种转化导致氢原子的形式迁移，并且伴随相邻共轭双键的转换。互变异构体作为溶液中互变异构体组的混合物而存在。在可能发生互变异构的溶液中，互变异构体将达到化学平衡。互变异构体的确切比率取决于若干种因素，包括温度、溶剂和pH。互变异构体可通过互变异构相互转化的概念称为互变异构现象。

在可能的多种类型的互变异构现象中，有两种类型常被观察到。在酮-烯醇互变异构现象中，电子和氢原子发生同时转移。环-链互变异构现象由于糖链分子中的醛基(-CHO)与同一分子中的一个羟基(-OH)反应使其形成如葡萄糖所展现的环状(环形状)形式而发生。

常见互变异构对为：杂环中(例如，在核碱基中，例如鸟嘌呤、胸腺嘧啶和胞嘧啶)的酮-烯醇、酰胺-腈、内酰胺-内酰亚胺、酰胺-亚胺酸互变异构现象、亚胺-烯胺和烯胺-烯胺。酮-烯醇平衡的实例在吡啶-2(1H)-酮与相应吡啶-2-醇之间，如下文所显示。

在本文所述的化合物中，每次出现的

应该理解的是，本发明的这些化合物可以被描绘为不同互变异构体。还应理解，在化合物具有互变异构形式时，所有互变异构形式都旨在包括于本发明的范围内，并且化合物的命名不排除任何互变异构体形式。应理解，某些互变异构体的活性水平可高于其他互变异构体。

术语“晶体多晶型物”、“多晶型物”或“晶形”意指其中化合物(或其盐或溶剂合物)可以不同晶体堆积排列结晶的晶体结构，所有这些晶体结构都具有相同元素组成。不同晶形通常具有不同X射线衍射图案、红外光谱、熔点、密度、硬度、晶体形状、光学和电学特性、稳定性和溶解性。重结晶溶剂、结晶速率、储存温度和其他因素可使一种晶形占优势。化合物的晶体多晶型物可通过在不同条件下结晶来制备。

本文所披露的任何式的化合物包括化合物自身，以及其盐或其溶剂合物(若适用)。例如，盐可在阴离子与芳基-或杂芳基-取代的苯化合物上的带正电基团(例如，氨基)之间形成。适宜阴离子包括氯离子、溴离子、碘离子、硫酸根、硫酸氢根、氨基磺酸根、硝酸根、磷酸根、柠檬酸根、甲磺酸根、三氟乙酸根、谷氨酸根、葡糖醛酸根、戊二酸根、苹果酸根、马来酸根、琥珀酸根、延胡索酸根、酒石酸根、甲苯磺酸根、水杨酸根、乳酸根、萘磺酸根和乙酸根(例如，三氟乙酸根)。术语“药学上可接受的阴离子”是指适于形成药学上可接受的盐的阴离子。同样，盐也可在阳离子与芳基-或杂芳基-取代的苯化合物上的带负电基团(例如，羧酸根)之间形成。适宜阳离子包括钠离子、钾离子、镁离子、钙离子和铵阳离子，例如四甲基铵离子。芳基-或杂芳基-取代的苯化合物还包括那些含有季氮原子的盐。

另外，本发明化合物(例如化合物的盐)可以水合或非水合(无水)形式或作为与其他溶剂分子的溶剂合物而存在。水合物的非限制性实例包括一水合物、二水合物等。溶剂合物的非限制性实例包括乙醇溶剂合物、丙酮溶剂合物等。

“溶剂合物”意指含有化学计量量或非化学计量量的溶剂的溶剂加成形式。一些化合物倾向于以结晶固态捕获固定摩尔比率的溶剂分子，从而形成溶剂合物。如果溶剂是水，那么所形成的溶剂合物是水合物；并且如果溶剂是醇，那么所形成的溶剂合物是醇合物。水合物是通过一个或多个水分子与该物质的一个分子组合形成，其中水保留其作为H

术语“生物电子等排体”是指通过原子或原子团由大概相似的另一原子或原子团交换所得的化合物。生物电子等排置换的目标是产生具有与母体化合物相似的生物学特性的新化合物。生物电子等排置换可基于物理化学或拓扑学。羧酸生物电子等排体的实例包括但不限于酰基磺酰亚胺、四唑、磺酸酯和膦酸酯。例如，参见帕塔尼(Patani)和拉夫尔(LaVoie)，化学评论(Chem.Rev.)96,3147-3176,1996。

本发明旨在包括本发明化合物中存在的原子的所有同位素。同位素包括那些原子数相同但质量数不同的原子。借助一般实例且不受限制的，氢同位素包括氚和氘，并且碳同位素包括C-13和C-14。

本发明提供合成本文所披露的任何化学式的化合物的方法。本发明还提供根据下文如实例中所示的方案合成本发明所披露的多种化合物的详细方法。

在通篇说明中，如果组合物被描述为具有、包括或包括特定组分，那么预期组合物也基本上由所列举组分组成，或由所列举组分组成。类似地，如果方法或工艺被描述为具有、包含或包括特定工艺步骤，那么这些工艺也基本上由所列举工艺步骤组成，或由所列举工艺步骤组成。另外，应理解，只要本发明保持可操作，步骤的顺序或进行某些动作的顺序是不重要的。此外，两个或更多个步骤或动作可同时进行。

本发明的合成工艺可容忍众多种官能团，因此可使用多种经取代的起始物质。所述工艺通常在整体工艺结束时或接近结束时提供所需最终化合物，但在某些情况下可能需要将所述化合物进一步转化为其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物。

本发明化合物可以多种方式使用可商购的起始物质、文献中已知的化合物或来自易于制备的中间体的化合物，通过采用本领域技术人员已知的或熟练技术人员可根据本文中的传授内容了解的标准合成方法和程序来制备。用于有机分子制备和官能团转换和操作的标准合成方法和程序可从本领域的相关科学文献或从标准教材中获得。尽管不限于任何一种或若干种来源，但例如以下的经典文件是本领域技术人员已知的有用并且公认的有机合成的参考教材：史密斯,M.B.(Smith,M.B.)、马奇,J.(March,J.)，马奇高级有机化学：反应、机制和结构(March’s Advanced Organic Chemistry:Reactions,Mechanisms,andStructure)，第5版，约翰威利父子公司(John Wiley&Sons)：纽约,2001；格林,T.W.(Greene,T.W.)、伍兹,P.G.M.(Wuts,P.G.M.)，有机合成中的保护基团(Protective Groupsin Organic Synthesis)，第3版，约翰威利父子公司：纽约，1999；R.拉洛克(R.Larock)，综合有机转换(Comprehensive Organic Transformations)，VCH出版社(VCH Publishers)(1989)；L.费瑟(L.Fieser)和M.费瑟(M.Fieser)，费瑟与费瑟的有机合成试剂(Fieser andFieser’s Reagents for Organic Synthesis)，约翰威利父子公司(1994)；和L.帕奎特(L.Paquette)编辑，有机合成试剂百科全书(Encyclopedia of Reagents for OrganicSynthesis)，约翰威利父子公司(1995)，将这些文献是通过引用结合在此。下文关于合成方法的说明设计为阐释但不限制制备本发明化合物的一般程序。

本发明的化合物可方便地通过本领域技术人员熟悉的多种方法来制备。具有本文所披露的任何化学式的本发明化合物可根据下文方案1-10中说明的程序从可商购起始物质或可使用文献程序制备的起始物质来制备。除非另外指明，否则方案1-10中的Z和R基团(例如R

本领域技术人员将注意到，在本文所述的反应顺序和合成方案期间，某些步骤的顺序可变，例如保护基团的引入和去除。

本领域技术人员将认识到，某些基团可能需要通过使用保护基团来保护以抵抗反应条件。保护基团还可用于区分分子中的相似官能团。保护基团的清单以及如何引入和去除这些基团可参见格林,T.W.、伍兹,P.G.M.，有机合成中的保护基团，第3版，约翰威利父子公司：纽约，1999。

优选的保护基团包括但不限于：

对于羟基部分：TBS、苄基、THP、Ac

对于羧酸：苄基酯、甲基酯、乙基酯、烯丙基酯

对于胺：Cbz、BOC、DMB

对于二醇：Ac(x2)TBS(x2)，或在一起使用时，缩丙酮

对于硫醇：Ac

对于苯并咪唑：SEM、苄基、PMB、DMB

对于醛：二-烷基乙缩醛，例如二甲氧基乙缩醛或二乙基乙酰基。

在本文所述的反应方案中，可产生多种立体异构体。在未指示具体立体异构体时，其理解为意味着可从反应产生所有可能的立体异构体。本领域技术人员将认识到，可使反应最优化以优先得到一种异构体，或可设计新方案以产生单一异构体。如果产生混合物，那么可使用例如以下技术来分离异构体：制备型薄层色谱、制备型HPLC、制备型手性HPLC或制备型SFC。

以下缩写在本说明书通篇中使用并且定义如下：

Ac 乙酰基

AcOH 乙酸

aq. 水性

BID或b.i.d. 每日两次(一天两次)

BOC 叔丁氧基羰基

Cbz 苄氧基羰基

CDCl

CH

DCM 二氯甲烷

DMB 2,4-二甲氧基苄基

DMF N,N-二甲基甲酰胺

DMSO 二甲亚砜

EA或EtOAc 乙酸乙酯

EDC或EDCI N-(3-二甲基氨基丙基)-N′-乙基碳二亚胺

ESI- 电喷雾负离子模式

ESI+ 电喷雾正离子模式

EtOH 乙醇

h 小时

H

HOBt 1-羟基苯并三唑

HCl 氯化氢或盐酸

HPLC 高效液相色谱

K

LC/MS或LC-MS 液相色谱质谱

M 摩尔浓度

MeCN 乙腈

min 分钟

Na

Na

NaHCO

NaHMDs 六甲基二硅氮烷钠

NaOH 氢氧化钠

NaHCO

Na

NMR 核磁共振

Pd(OH)

PMB 对甲氧基苄基

p.o. 经口(口服给药)

ppm 百万分率

prep HPLC 制备型高效液相色谱

PYBOP (苯并三唑-1-基氧基)三吡咯烷基鏻六氟磷酸盐

Rt或RT 室温

TBME 叔丁基甲基醚

TFA 三氟乙酸

THF 四氢呋喃

THP 四氢吡喃

有效量的本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物对正常细胞无显著细胞毒性。如果给予治疗有效量的化合物不会引起正常细胞大于10％的细胞死亡，那么治疗有效量的化合物对正常细胞没有显著的细胞毒性。如果给予治疗有效量的化合物不会引起正常细胞大于10％的细胞死亡，那么治疗有效量的化合物不会显著地影响正常细胞的活力。在某一方面中，细胞死亡是通过细胞凋亡来进行。

使细胞与本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物接触可在癌细胞中选择性地诱导或激活细胞死亡。向有需要的受试者给予本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物可在癌细胞中选择性地诱导或激活细胞死亡。使细胞与本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物接触可在一种或多种受细胞增殖性病症影响的细胞中选择性地诱导细胞死亡。优选地，向有需要的受试者给予本发明化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物在一种或多种受细胞增殖性病症影响的细胞中选择性地诱导细胞死亡。

关于本文中所讨论的已知技术或等效技术的详细说明，本领域技术人员可参考一般参考文献。这些文献包括奥苏贝尔(Ausubel)等人,当前分子生物学方案(CurrentProtocols in Molecular Biology)，约翰威利父子公司(2005)；萨布鲁克(Sambrook)等人,分子克隆，实验室手册(Molecular Cloning,A Laboratory Manual)(第3版)，冷泉港出版社(Cold Spring Harbor Press)，冷泉港，纽约(2000)；克里根(Coligan)等人,当前免疫学方案(Current Protocols in Immunology),约翰威利父子公司,纽约；恩纳(Enna)等人,当前药理学方案(Current Protocols in Pharmacology),约翰威利父子公司,纽约；芬戈尔(Fingl)等人,治疗的药理学基础(The Pharmacological Basis of Therapeutics)(1975),雷明顿制药科学(Remington's Pharmaceutical Sciences),麦克出版公司(MackPublishing Co.)，伊斯顿，宾夕法尼亚州，第18版(1990)。当然，在制备或使用本发明的方面中可参考这些文献。

本发明还可提供药物组合物，其包括本发明的化合物(例如化合物A、B、C或D)与至少一种药学上可接受的赋形剂或载体的组合。

“药物组合物”是呈适合给予受试者的形式的含有本发明化合物的配制品。在一个实施例中，药物组合物呈整块或呈单位剂型。单位剂型是多种形式中的任一种，包括例如胶囊、IV袋、片剂、气溶胶吸入器上的单泵或小瓶。单位剂量组合物中活性成分的量是有效量并且根据所涉及的具体治疗而变化。本领域的技术人员应了解，有时候有必要根据患者的年龄和病状对剂量进行常规变化。剂量还将取决于给药途径。考虑多种途径，包括经口、肺、直肠、肠胃外、经皮、皮下、静脉注射、肌内、腹腔内、吸入、颊、舌下、胸膜腔内、鞘内、鼻内等。用于局部或经皮给予本发明的化合物的剂型包括粉剂、喷雾剂、软膏、糊剂、乳膏、洗剂、凝胶、溶液、贴剂以及吸入剂。在一个实施例中，活性成分在无菌条件下与药学上可接受的载体，以及与任何需要的防腐剂、缓冲剂或推进剂混合。

如本文所用词组“药学上可接受的”是指在合理医学判断的范围内适用于与人类和动物的组织接触而无过度毒性、刺激、过敏反应或其他问题或并发症，与合理益处/风险比相称的那些化合物、材料、组合物、载体或剂型。

“药学上可接受的赋形剂”意指用于制备药物组合物的赋形剂，它们通常是安全的、无毒性的并且不是生物学上或其他方面不期望的，并且包括兽医使用以及人类药学使用可接受的赋形剂。本说明书和权利要求使用的“药学上可接受的赋形剂””包括一种和多于一种这样的赋形剂。

本发明的药物组合物被配制成与其预期的给予途径相容。给药途径的实例包括包括(例如)肠胃外、静脉内、皮内、皮下、口腔(例如，吸入)、经皮(局部)、和经粘膜给药。用于肠胃外、真皮内或皮下施用的溶液或悬浮液可包括以下组分：无菌稀释剂，例如注射用水、盐水溶液、不挥发性油、聚乙二醇、甘油、丙二醇或其他合成溶剂；抗细菌剂，例如苄基醇或对羟苯甲酸甲酯；抗氧化剂，例如抗坏血酸或亚硫酸氢钠；螯合剂，例如乙二胺四乙酸；缓冲剂，例如乙酸盐、柠檬酸盐或磷酸盐，及用于调节张力的试剂，例如氯化钠或右旋糖。可以用酸或碱如盐酸或氢氧化钠调节pH。肠胃外制剂可以被封装在由玻璃或塑料制成的安瓿、一次性注射器或多剂量小瓶中。

本发明的化合物或药物组合物可以当前用于化学治疗性治疗的多种熟知方法给予受试者。例如，对于一种或多种癌症的治疗，可将本发明的化合物直接注射至肿瘤中，注射至血流或体腔中，或经口服用，或用贴剂通过皮肤施用。所选剂量应足以构造有效治疗，但未高至可引起不可接受的副作用。疾病病状状态(例如，癌症、癌前病变等)和患者的健康状况在治疗期间和治疗后的合理期限内应优选地被密切监测。

本文使用的术语“治疗有效量”是指药学试剂用以治疗、改善或预防所鉴别疾病或病状或展现可检测的治疗或抑制作用的量。该作用可以通过本领域已知的任何测定方法来检测。用于受试者的精确有效量取决于受试者的体重、身材和健康状况；病状的性质和程度；以及所选用于给予的治疗剂。治疗有效量对于给定的情况下可通过临床医师的技术和判断范围内的常规实验来确定。在一个优选方面中，待治疗的疾病或病状是癌症。在另一个方面中，待治疗的疾病或病状是细胞增殖性病症。

对于任何化合物，最初治疗有效量可以在细胞培养分析(如肿瘤细胞的细胞培养分析)中或者在动物模型(通常大鼠、小鼠、兔、狗、或猪)中估算。动物模型还可以用于确定给药的适当浓度范围和途径。然后这类信息可以用于确定对于在人中给药的适用剂量和途径。

在本发明的实施例中，EZH2抑制剂是以100-1600mg/kg的剂量给予。在实施例中，剂量为100mg/kg、或200mg/kg、或400mg/kg、或800mg/kg或1600mg/kg。在某些实施例中，剂量是一天一次或一天两次给予。在实施例中，EZH2抑制剂是化合物A并且剂量是一天两次的100mg/kg、或200mg/kg、或400mg/kg、或800mg/kg或1600mg/kg。在优选实施例中，EZH2抑制剂是化合物A并且剂量为800mg/kg一天两次。

调整剂量和给药以提供一种或多种活性药剂的足够水平或维持期望的效果。可考虑的因素包括疾病状态的严重性、受试者的一般健康状况、受试者的年龄、体重和性别、饮食、给药的时间和频率、一种或多种药物相互作用、反应敏感性以及对疗法的耐受性/反应。长效药物组合物可根据特定配制品的半衰期和清除率每3至4天、每周、或每两周一次给予。

包括本发明的活性化合物的药物组合物可以通过本领域公知的方法制备，例如通过常规混合、溶解、制粒、制糖衣、磨粉、乳化、胶囊化、包埋、或冻干工艺的方式。药物组合物可以常规方式使用一种或多种有助于将活性化合物加工为可在药学上使用的制剂的药学上可接受的载体(包括赋形剂或助剂(或二者))来配制。当然，合适的配制品取决于所选择的给药途径。

适合于可注射使用的药物组合物包括无菌水溶液(在水溶性的情况下)或分散液以及用于临时制备无菌可注射溶液或分散液的无菌粉末。对于静脉内给药，适合的载体包括生理盐水、抑菌水、克列莫佛(Cremophor)EL

按照需要，可以通过将活性化合物以需要的量加入具有以上列举的组分中的一种或多种组合的适当溶剂中，随后进行无菌过滤来制备无菌注射液。通常，通过将活性化合物加入无菌载体中来制备分散液，该无菌载体包含基础分散介质以及来自以上列举的其他所需成分。在用于制备无菌可注射溶液的无菌粉末的情况下，制备方法为真空干燥和冷冻干燥，其产生活性成分的粉末以及来自其先前经无菌过滤溶液的任何其他所需成分。

口服组合物通常包括惰性稀释剂或可食用的药学上可接受的载体。它们可以被封装在明胶胶囊中或被压成片剂。出于口服治疗性给药的目的，可以将活性化合物随赋形剂一起加入并且以片剂、锭剂或胶囊剂的形式使用。可以使用用以口腔清洗的流体载体来制备口服组合物，其中流体载体中的化合物经口服、漱、咳出或咽下。可包括药学上相容的粘合剂或佐剂物质或二者作为组合物的部分。片剂、丸剂、胶囊、锭剂等可含有以下成分中的任一者或具有类似性质的化合物：粘合剂，例如微晶纤维素、黄蓍胶或明胶；赋形剂，例如淀粉或乳糖；崩解剂，例如海藻酸、普拉莫胶(Primogel)或玉米淀粉；润滑剂，如硬脂酸镁或氢化植物油；助流剂，例如胶体二氧化硅；甜味剂，例如蔗糖或糖精；或调味剂，例如薄荷、水杨酸甲酯或橙味剂。

对于通过吸入给药，化合物从加压容器或分配器(其中包含合适的推进剂，例如气体(如二氧化碳))、或喷雾器以气溶胶喷雾形式递送。

系统给药也可以通过经粘膜或经皮的方式。对于经粘膜或经皮给药，在该配制品中使用适合有待渗透的障碍的渗透剂。这样的渗透剂通常是本技术领域所熟知的，并且对于经粘膜给药包括，例如洗涤剂、胆汁盐和夫西地酸衍生物。经粘膜给药可以通过使用鼻喷雾剂或栓剂来实现。对于经皮给药，如本领域中公知的，将活性化合物配制成软膏剂、油膏剂、凝胶剂、或乳膏。

将这些活性化合物与保护这些化合物免于从体内快速消除的药学上可接受的载体一起制备，如控制释放配制品，包括植入物和微囊化的递送系统。可以使用可生物降解、生物相容的聚合物，如乙烯乙酸乙烯酯、聚酐类、聚乙醇酸、胶原、聚原酸酯类、以及聚乳酸。用于制备此类配制品的方法对本领域的普通技术人员而言应是清楚的。材料也可以从Alza公司和Nova制药公司购买得到从，脂质体悬浮液(包括靶向受感染细胞的具有针对病毒抗原的单克隆抗体的脂质体)也可以用作药学上可接受的载体。这些可以根据本领域的普通技术人员已知的方法制备，如例如描述在美国专利号4,522,811)中的。

特别有利的是以单位剂型配制口服或肠胃外组合物以便给药和剂量统一。如本文所用的单位剂型是指适合作为用于待治疗受试者的单一剂量的物理离散单位；每一单位含有经计算以产生所需治疗效应的预定量的活性化合物与所需药物载体的结合。对于本发明的单位剂型的规格被指示为并且直接取决于活性化合物的独特特征和有待实现的特定治疗效果。

在治疗性应用中，在影响所选剂量的因素中，根据本发明使用的药物组合物的剂量尤其根据药剂、接受患者的年龄、体重和临床病状以及给予治疗的临床医师或执业医师的经验和判断而变化。通常，剂量应足以导致肿瘤生长的减慢、和优选是消退，并且还优选是使肿瘤完全消退。剂量的范围可以是从每天大约0.01mg/kg至每天大约5000mg/kg。在优选方面中，剂量的范围可以是从每天大约1mg/kg至每天大约1000mg/kg。在某一方面中，剂量范围将为约0.1mg/天至约50g/天；约0.1mg/天至约25g/天；约0.1mg/天至约10g/天；约0.1mg至约3g/天；或约0.1mg至约1g/天，呈单一、分开或连续剂量(该剂量可针对患者的体重(kg)、体表面积(m

药物组合物可以与给药的说明书一起包括在容器、包装、或分配器中。

本发明的化合物能进一步形成盐。

如本文所用“药学上可接受的盐”是指本发明的化合物的盐，其中母体化合物通过制造其酸性盐或碱性盐而改性。药学上可接受的盐的实例包括但不限于碱性残基(如胺)的矿物盐或有机酸盐、酸性残基(如羧酸等)的碱盐或有机盐。药学上可接受的盐包括例如从无毒的无机酸或有机酸形成的母体化合物的常规的无毒盐或季铵盐。例如，这样的常规无毒盐包括但不限于来自于无机酸和有机酸的那些，所述无机酸和有机酸选自以下项：2-乙酰氧基苯甲酸、2-羟基乙磺酸、乙酸、抗坏血酸、苯磺酸、苯甲酸、重碳酸、碳酸、柠檬酸、依地、乙烷二磺酸、1,2-乙烷磺酸、富马酸、葡庚糖酸、葡糖酸、谷氨酸、乙醇酸、乙二醇阿散酸、间苯二酚酸、水巴米克酸(hydrabamic)、氢溴酸、盐酸、氢碘酸、羟基马来酸、羟萘甲酸、羟乙磺酸、乳酸、乳糖酸、月桂基磺酸、马来酸、苹果酸、扁桃酸、甲烷磺酸、萘磺酸、硝酸、草酸、扑酸、泛酸、苯乙酸、磷酸、聚半乳糖醛酸、丙酸、水杨酸、硬脂酸、亚醋酸、琥珀酸、氨基磺酸、对氨基苯磺酸、硫酸、鞣酸、酒石酸、甲苯磺酸，和通常出现的氨基酸，例如，甘氨酸、丙氨酸、苯丙氨酸、精氨酸等。

药学上可接受的盐的其他实例包括己酸、环戊烷丙酸、丙酮酸、丙二酸、3-(4-羟基苯甲酰)苯甲酸、肉桂酸、4-氯苯磺酸、2-萘磺酸、4-甲苯磺酸、樟脑磺酸、4-甲基二环-[2,2,2]-辛-2-烯-1-甲酸、3-苯基丙酸、三甲基乙酸、叔丁基乙酸、粘康酸等。本发明还涵盖在以下发生时形成的盐：母体化合物中存在的酸性质子被金属离子(例如碱金属离子、碱土金属离子或铵离子)替代；或与有机碱(例如乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、氨丁三醇、N-甲基葡萄糖胺等)配位。

化合物或其药学上可接受的盐、溶剂合物或多晶型物是经口、经鼻、经皮、经肺、以吸入方式、经颊、舌下、腹膜内、皮下、肌内、静脉内、经直肠、胸膜内、鞘内和肠胃外给予。在一个实施例中，该化合物是口服给药。本领域技术人员将认识到某些给药途径的优点。

利用这些化合物的剂量方案是根据多种因素来选择，包括患者的类型、物种、年龄、体重、性别和医学病状；待治疗病状的严重性；给予途径；患者的肾功能和肝功能；以及所采用的具体化合物或其盐。一个普通技术的医师或兽医可以容易地确定并开出所需药物的有效量以预防、对抗病状、或阻止病状的进展。

本发明披露的化合物的配制和给药技术可见于雷明顿：药学科学与实践(Remington:the Science and Practice of Pharmacy)，第19版，麦克出版公司，伊斯顿，宾夕法尼亚州(1995)。在一个实施例中，本文所述的化合物和其药学上可接受的盐与药学上可接受的载体或稀释剂组合用于药物制备中。合适的药学上可接受的载体包括惰性固体填充剂或稀释剂和无菌水溶液或有机溶液。这些化合物将以足以提供在本文所述范围内的所需剂量的量存在于这样的药物组合物中。

除非另行说明，本文所用的所有百分比和比率均以重量计。本发明的其他特征和优势将从不同实例变得清楚。所提供的实例说明在实施本发明中有用的不同组分和方法。所述实例不限制要求保护的发明。基于本披露，本领域技术人员可以识别和使用对实施本发明有用的其他组分和方法。

在本文所述的合成方案中，为简单起见，可以一种特定构型绘制化合物。所述特定构型不应视为将本发明限制于一种或另一种异构体、互变异构体、区域异构体或立体异构体，所述特定构型也不排除异构体、互变异构体、区域异构体或立体异构体的混合物。

适于本发明方法的另外的化合物、以及药物组合物和其用途阐述于WO 12/142504和WO 12/142513中，将各自的内容通过引用以其全文特此结合。

组蛋白的翻译后修饰和ATP依赖性染色质重塑是调节正常基因表达的保真度的决定性过程。这些过程中所涉及的蛋白质(例如PRC2和SWI/SNF复合体)在癌症中通常发生遗传改变。重要地，这两种复合体通常彼此竞争结合至并影响染色质；遗传变化可使这种拮抗失衡。例如，INI1是SWI/SNF复合体的亚单元，所述亚单元在几乎所有横纹肌样瘤中丧失，从而产生对PRC2-EZH2甲基转移酶的致癌依赖性，并且横纹肌样瘤模型对EZH2小分子抑制剂是敏感的。在滑膜肉瘤(另一种INI1缺陷肿瘤类型)中，复发性染色体易位将18号染色体上的SS18基因(SWI/SNF染色质重塑复合体的亚单元)融合至X染色体上的三个相关基因(SSX1、SSX2和罕见地SSX4)中的一个。这导致致癌的SS18-SSX融合蛋白的表达，该融合蛋白结合到SWI/SNF复合体，该复合体逐出野生型SS18和肿瘤抑制物INI1二者，该二者随后被降解。这导致异常基因表达并最终导致癌症的发展。

本文中所述数据显示，化合物A(本文中也称为E7438或EPZ-6438)是EZH2酶活性的早期临床阶段的选择性口服生物可用的小分子抑制剂，该化合物A在滑膜肉瘤的临床前模型中既作为单一药剂又与化学疗法组合地诱导抗增殖活性。在体外，该化合物在滑膜肉瘤细胞系(其为SS18-SSX1融合阳性)中特异性地诱导剂量依赖性细胞生长抑制和细胞死亡。对负载任一细胞系异种移植或两种患者来源的异种移植(PDX)模型的小鼠的处理导致剂量依赖性肿瘤生长抑制以及对EZH2特异性底物(即组蛋白H3上的赖氨酸27)的三甲基化水平的相关抑制。这些数据证实了在异种移植模型中SS18-SSX1阳性滑膜肉瘤对EZH2酶活性的依赖性，并且用适当生物标记物表明靶向EZH2的药物在这些一种或多种遗传限定癌症中的潜在效用。

在本说明书中所引用的所有公开以及专利文件都通过引用以其全部内容结合在此，就像这样的公开或文件被确切地并且个别地指出通过引用被结合一样。公开和专利文件的引用不旨在为承认任何这些是相关的现有技术，也不构成对关于相同内容或日期的任何承认。本发明现在已经通过书面描述的方式进行了描述，本领域的技术人员将认识到本发明可以以各种实施例的方式来实施，并且在前面的描述和下面的实例是为了说明的目的，而不是限制后面的权利要求。

实例

实例1：各种细胞系中的EZH2、INI1、SS18-SSX1和加样对照β-肌动蛋白的蛋白质水平

用含有1×蛋白酶抑制剂混合剂(赛默飞世尔科技(Thermo Scientific)，罗克福德，伊利诺伊州)的1×细胞裂解缓冲液(9803号，细胞信号传导技术(Cell SignalingTechnology)，丹弗斯，马萨诸塞州)裂解HS-SY-II和SW982人类滑膜肉瘤细胞、RD人类横纹肌肉瘤细胞、G401人类横纹肌样瘤细胞和HEK293人类胚肾细胞。将样品超声波处理并通过在4℃下以10,000×g离心10分钟来澄清。通过使用BCA蛋白质分析试剂盒(赛默飞世尔科技)测定裂解产物的蛋白质含量。通过混合2×加样缓冲液(用于Tris SDS的β-ME样品处理，科斯莫生物，东京，日本)和水与细胞裂解产物来制备样品溶液，并在95℃下孵育5分钟。如下进行蛋白质印迹分析。将样品溶液在还原性条件下在2％-15％梯度聚丙烯酰胺凝胶(对于SS18和EZH2)或4％-20％梯度聚丙烯酰胺凝胶(对于INI1和β-肌动蛋白)上分离，并将其转移至硝酸纤维素膜(GE医疗，沃基肖，威斯康辛州)上。将印迹用以下封闭溶液在室温下封闭1小时：1×封闭Ace溶液(雪印，札幌，日本)用于EZH2、INI1和SS18，并且含有0.5％Tween20和5％脱脂乳的TBS用于β-肌动蛋白。用以下稀释条件将印迹与一级抗体一起在4℃下孵育过夜：EZH2抗体(07-689，密理博(Millipore)，比尔里卡，马萨诸塞州)，1:1000稀释度，在含有0.5％Tween 20和0.1×封闭Ace溶液的TBS中；INI1抗体(8745号，细胞信号传导技术)，1:1000稀释度，在含有0.5％Tween 20和0.1×封闭Ace溶液的TBS中；SS18抗体(sc-365170，圣克鲁兹，圣克鲁兹，加利福尼亚州)，1:500稀释度，在含有0.5％Tween 20和0.1×封闭Ace溶液的TBS中；和β-肌动蛋白抗体(A5441，西格玛-奥德里奇(Sigma-Aldrich)，圣路易斯，密苏里州)，1:2000稀释度，在含有0.5％Tween 20和5％脱脂乳的TBS中。在用含有0.5％Tween20的TBS洗涤后，用以下稀释条件将印迹与辣根过氧化物酶偶联的抗兔IgG(细胞信号传导技术)或抗小鼠IgG(细胞信号传导技术)在室温下进一步一起孵育60分钟：在含有0.5％Tween 20和0.1×封闭Ace溶液的TBS中的1:1000稀释度的抗兔IgG用于EZH2、INI1和SS18，并且在含有0.5％Tween 20和5％脱脂乳的TBS中的1:2000稀释度的抗小鼠IgG用于β-肌动蛋白。在通过含有0.5％Tween 20的TBS充分洗涤后，用西方稳定素(Immobilon Western)化学发光HRP底物(密理博)将印迹显影。用发光图像分析仪LAS-3000(富士胶片(Fuji Film)，东京，日本)通过化学发光使免疫反应性条带可视化。蛋白质印迹的代表性图像显示于图1中。在HS-SY-II细胞中证实SS18-SSX1表达。在该细胞系中还观察到INI1下调。另一方面，另一滑膜肉瘤系SW982不表达该融合蛋白并且具有与RD和HEK293细胞相当的INI1表达。

实例2：各种细胞系中H3K27的三甲基化和二甲基化水平

将HS-SY-II和SW982人类滑膜肉瘤细胞、RD人类横纹肌肉瘤细胞、G401人类横纹肌样瘤细胞、WSU-DLCL2和OCI-LY19人类弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞和HEK293人类胚肾细胞悬浮于500μL裂解缓冲液(10mmol/L MgCl

实例3：粘附性细胞系长期增殖分析

方案：

用于7天分析的96孔铺板：对于每种粘附性细胞系，在晚上(用于第二天用化合物处理)或在早上(用于在晚上用化合物处理)将细胞以100μL的体积铺板于要按一式三份处理的96孔板中，以允许细胞在化合物处理前附着到板上。

要被分开用于7-14天分析的6孔板：将2mL细胞以正确密度铺板于6孔板的每个孔中。从96孔板生长曲线通过将96孔密度乘以30计算正确密度。因子30来自6孔板的生长面积除以96孔板的生长面积(9.5cm

第0天：通过去除介质并添加回100μL(用于96孔板)或2mL(用于6孔板)具有化合物/DMSO的正确稀释度的介质来用化合物或DMSO处理。表1包括96孔板图谱的实例。将板孵育96小时。

表1：

用CellTiter-

第4天：用CellTiter-

第7天：用CellTiter-

计数6孔板的单独孔，并将细胞在96孔板中重新铺板到初始铺板接种密度，如上文所述。

在增殖分析的第7-14天重复第0-7天的步骤。

具体地，在化合物处理前约12小时，在6孔板中分别以24,000个细胞/孔和7,500个细胞/孔的密度将HS-SY-II或SW982细胞进行铺板。在第0天，用DMSO或化合物处理细胞，以10μmol/L开始并以4倍稀释度递减。在第7天，将6孔板中的细胞用胰蛋白酶消化，通过TC10自动化细胞计数器(伯乐(Bio-Rad)，里士满，加利福尼亚州)计数，并且对于HS-SY-II和SW982在96孔板中按一式三份分别以800个细胞/孔和250个细胞/孔的密度重新铺板。使细胞粘附到板过夜并如在第0天一样用DMSO或化合物处理。在第0天、第7天、第11天和第14天，通过CellTiter-

实例4：体外和体内的化合物A处理

在体外，HS-SY-II细胞对化合物A是高度敏感的并显示以剂量依赖性方式对细胞增殖的抑制。另一方面，SW982细胞对化合物A不敏感(图5A和5B)。

通过用EZH2抑制剂(图6A)处理在两个细胞系中都观察到H3K27me3减少，并且IC

在HS-SY-II异种移植小鼠模型中分析PK值和PD变化。测定化合物A在最后一次剂量之前5分钟和之后3小时的血浆浓度。观察到剂量依赖性暴露(图7A)。同时，还观察到肿瘤组织中H3K27me3水平的剂量依赖性降低(图7B)。表2和3提供关于图7B中所示数据的统计学分析。

表2：

表3：

在HS-SY-II和SW982的体外培养中分析通过用化合物A或EPZ-011989(即，化合物C)处理导致的基因表达变化。已报道，PRC2复合体被TLE1募集到SS18-SSX融合蛋白并且抑制ATF2靶基因(EGR1、ATF3、MEIS2和CDKN2A)(癌细胞(Cancer Cell)21，333-347，2012)。此处检查EGR1、ATF3和CDKN2A的表达水平。在HS-SY-II中观察到剂量和时间依赖性CDKN2A上调，而已知CDKN2A基因座在SW982中纯合地缺失(图8)。在HS-SY-II中但并非在SW982中，ATF3和EGR1通过用化合物A和EPZ-011989处理而发生上调。因此，化合物A诱导滑膜肉瘤发病机制中所涉及基因的表达的变化。

表4提供关于图8中所示数据的统计学分析。

表4：

0uM 对比 第2天 第4天 第7天

星号意指与0μM处理组的水平相比的显著变化。

同样在HS-SY-II异种移植模型中分析通过用化合物A处理导致的基因表达变化。CDKN2A在给予500mg/kg化合物A的小鼠中显著上调(图9)。同样，化合物A诱导滑膜肉瘤发病机制中所涉及基因的表达的变化。

图10A至10C显示负载HS-SY-II异种移植物的无胸腺裸鼠的体内肿瘤体积均值。在第一研究中，给予小鼠运载体(经口28天或在第1天和第22天iv)、化合物A(经口：125mg/kg、250mg/kg或500mg/kg持续28天)或多柔比星(iv：10mg/kg，第1天和第22天)；一周两次测量肿瘤体积(图10A和10B)。在第二研究中，给予小鼠运载体(经口28天)、化合物A(经口：250mg/kg或500mg/kg持续28天)、多柔比星(iv：10mg/kg，在第1天和第22天)或多柔比星(iv：10mg/kg，在第1天和第22天)与化合物A(经口：250mg/kg持续28天)的组合(图10C)。来自第二研究的动物的肿瘤是在第28天(最后一次剂量后3h)收获并通过ELISA(图10D)或用于增殖标记物Ki67的IHC(图10E)进行H3K27me3分析。

尽管在2D细胞培养中对化合物A敏感，但HS-SY-II细胞系异种移植物在小鼠异种移植模型中展现剂量相关的肿瘤体积增加；这个观察结果的潜在机制正在研究中。

图11A和11C显示负载滑膜肉瘤的两种不同PDX中的一种的无胸腺裸鼠的体内肿瘤体积均值。图11B和11D显示负载PDX的小鼠的存活％。给予小鼠运载体(经口35天)、化合物A(经口：125mg/kg、250mg/kg或500/400mg/kg持续35天)或多柔比星(iv：3mg/kg，一周一次持续3周)。图11A和11B显示来自负载来自患有高级纺锤体细胞肉瘤的57岁男性的PDX的小鼠的数据。图11C和11D显示来自负载来自16岁女性的PDX的小鼠的数据。与HS-SY-II细胞系异种移植物相比，PDX小鼠展现剂量相关的体内肿瘤体积减小。

图12A和12B显示来自多个小鼠亚组的滑膜肉瘤PDX肿瘤的阵列数据，所述肿瘤是在第35天收获并通过RNA-seq分析加以分析。图12A是来自负载来自57岁男性的PDX的小鼠的数据；图2B是来自负载来自16岁女性的PDX的小鼠的数据。HLA基因Fas和KLRD1的表达在经400mg/kg化合物A处理的小鼠中相对于经运载体处理的小鼠有所增加。在该图中，蓝色是低表达并且红色是高表达。

材料与方法

细胞培养

使HS-SY-II(RCB2231，日本理研生物资源中心(RIKEN BioResource Center))和SW982(HTB-93，ATCC)在37℃和5％CO

通过化合物A诱导的H3K27甲基化变化

用DMSO或化合物A处理HS-SY-II和SW982细胞，以40nmol/L开始并以4倍稀释度递减，持续96小时。用冰冷PBS洗涤细胞，用细胞刮棒收集细胞，并用100μl核提取缓冲液(10mMTris-HCl、10mM MgCl

图6A显示代表图。通过GraphPad Prism(格拉夫帕德软件(GraphPad Software))测定图6B中显示的IC

HS-SY-II异种移植模型中的PK值和PD变化

HS-SY-II细胞在对数中期生长期间收获，并再悬浮于含有50％基质胶(BD生物科技(BD Biosciences))的汉克(Hank)平衡盐溶液中。Balb/C-nu小鼠(日本查尔斯河实验室(Charles River Laboratories Japan))在右侧腹皮下接受1x10

在最后一次剂量后约3小时从用于PK值和PD变化的分析中的小鼠收集肿瘤样品。使用RNAlater(AM7020，生命技术(Life technologies))储存肿瘤样品。通过RNeasy微型试剂盒(74104，凯杰(Qiagen))和大容量cDNA逆转录试剂盒(4368814，生命技术)根据制造商说明书进行总RNA分离和逆转录。如上文所述使用cDNA样品进行实时PCR。相对于GAPDH调节表达水平并表达为相对于运载体对照的倍数变化(图9)。

对于图10D，将肿瘤在液氮中快速冷冻。将冷冻肿瘤样品切成20mg切片并置于500μL冰冷核提取缓冲液(10mM Tris-HCl、10mM MgCl2、25mM KCl、1％Triton X-100、8.6％蔗糖，加上1x Halt蛋白酶抑制剂混合剂(1861281，赛默飞世尔科技))中并用手动微型匀浆器匀浆。通过在4℃下以600g离心5分钟来收集细胞核，并用冰冷PBS洗涤一次。取出上清液并经1小时用100μL 0.4N冷硫酸提取组蛋白。通过在4℃下以10,000g离心10分钟使提取物澄清，并将其转移到含有1mL冰冷丙酮的新微量离心管中。使组蛋白在-20℃下沉淀过夜，通过以10,000g离心10分钟粒化，并将其再悬浮于100μl水中。使用BCA蛋白质分析(23225，皮尔斯)对组蛋白定量。将稀释组蛋白涂布于Immulon 4HBX板(3855，赛默飞世尔科技)上过夜并进行ELISA。简单来说，在用含有0.05％Tween 20和2％牛血清白蛋白(BSA)的PBS封闭后，将板与H3K27me3抗体(9733号，细胞信号传导技术)或总组蛋白H3抗体(AB1791，艾博抗)一起孵育。将板与辣根过氧化物酶偶联的抗兔IgG(7074号，细胞信号传导技术)进一步一起孵育，之后与TMB底物(TMBS-0100-01，BioFx实验室(BioFx Laboratories))一起孵育。之后，使用板分光光度计(SpectraMax 250，分子装置(Molecular Devices))在450nm下(参考波长650nm)测量孔中的显影颜色。相对于总组蛋白H3调节H3K27me3水平，并表达为相对于运载体对照的倍数变化。将所述值绘图(n＝6)于图10D中。每个条形代表每组中的值的均值。在从给予化合物A的小鼠得到的肿瘤中观察到显著降低的H3K27me3水平。提取组蛋白并定量，并如上文所述分析H3K27me3的水平。将肿瘤中H3K27的三甲基化水平绘图(n＝5)于图7B中。每个条形代表每组中的三甲基化水平的均值±SEM。

在化合物A处理后的体外基因表达变化

用EZH2抑制剂(化合物A或EPZ-011989)处理HS-SY-II和SW982细胞并在所指示时间点收集。使用TaqMan基因表达Cells-to-CT试剂盒(4399002，生命技术)根据制造商的方案进行总RNA分离和cDNA合成。通过使用TaqMan基因表达分析(生命技术，4331182)和TaqMan探针(分别为Hs00231069_m1、Hs00152928_m1、Hs00233365_m1和Hs99999905_m1)分析ATF3、EGR1、CDKN2A和GAPDH表达。相对于GAPDH调节表达水平并表达为相对于DMSO对照的倍数变化(图8)。

在化合物A处理后的体内基因表达变化

在最后一次剂量后约3小时从用于PK值和PD变化的分析中的小鼠收集肿瘤样品。使用RNAlater(AM7020，生命技术(Life technologies))储存肿瘤样品。通过RNeasy微型试剂盒(74104，凯杰(Qiagen))和大容量cDNA逆转录试剂盒(4368814，生命技术)根据制造商说明书进行总RNA分离和逆转录。如上文所述使用cDNA样品进行实时PCR。相对于GAPDH调节表达水平并表达为相对于运载体对照的倍数变化(图9)。另外或可替代地，从冷冻肿瘤样品分离总RNA。使用TruSeq

RNAseq数据处理

将呈FASTQ格式的原始测序读数与人类基因组hg19以及小鼠基因组mm10比对。用RSEM v1.1.13程序使用USCS KnownGene转录组作为参考进行转录组定量。用针对伊鲁米那50x 50配对末端测序最优化的参数运行RSEM表达计算。

用于生物学解释的RNAseq转录组数据的分析

关于两种PDX模型(每种模型用5个重复处理)使用GSEA Java启用的桌面软件(2.0.13版，在万维网(World Wide Web，www)broadinstitute.org/gsea/index.jsp)对化合物A相对于DMSO处理的两个样品比较进行基因集合富集分析(GSEA)。使用标准化后RSEM生成的基因水平计数进行GSEA输入。针对基因集合而非表型进行排列，以适应小的样本大小。使用来自MSigDB(4.0版，万维网(www)broadinstitute.org/gsea/msigdb/index.jsp)的已策划KEGG路径以及转录因子结合基序基因集合用于所有GSEA分析。

对于图10E，对所收集肿瘤进行福尔马林固定，包埋于石蜡中。遵循通用工艺根据聚合物基方法(远景(EnVision)，达克(DAKO)，日本)制备石蜡切片，脱石蜡并加工用于IHC。通过在121℃下在2个大气压下在靶修复溶液(达克，稀释到10％的最终浓度)中高压灭菌20分钟处理脱石蜡切片用于抗原修复，并用3％过氧化氢溶液处理5分钟以阻断内源性过氧化物酶活性。使可商购的一级抗体与Ki-67在室温下反应约1小时(抗人类Ki-67小鼠单克隆抗体，达克，日本，具有1:50稀释度)。后续步骤使用远景(EnVision)系统遵循制造商说明书进行，包括在室温下用二级抗体处理30分钟；使用3,3'-二氨基联苯胺作为色原体并使用苏木精作为复染剂。对于图10E，使用Aperio XT

滑膜肉瘤RNA测序方法

源自患者的异种移植(PDX)模型CTG-0331和CTG-0771是代表人类滑膜肉瘤的低传代Champions TumorGraft

出于所有目的，本文中所提到的每个专利文件和科学论文的全部披露内容都是通过引用并入。

在不背离本发明的精神或本质特征的情况下，本发明可体现为其他具体形式。因此前述实施例应当在所有方面视为是说明性的而不是限制在此所述的发明。因此，本发明的范围是由所附的权利要求书而不是通过上述的说明书来指明的，并且在该权利要求书的等效性的含义和范围之内的所有变化均旨在被包括在其中。