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西洋参环介导等温扩增引物组及鉴定方法

文献发布时间:2023-06-19 19:00:17


西洋参环介导等温扩增引物组及鉴定方法

技术领域

本发明涉及一种西洋参检测方法,更具体涉及西洋参环介导等温扩增的一组引物及其鉴定方法,属于中药材来源品种鉴定技术领域。

背景技术

西洋参为五加科人参属多年生草本植物,是常用的名贵中药,其根、茎、叶、花、果实等均可药用,具有较高的经济价值和药用价值。西洋参大体呈圆柱形、纺锤状,长约3~8cm,直径约0.5~2cm。西洋参表皮细洁,呈淡黄白色,伴有均匀的横向环纹,多见纵皱纹及横向皮孔。质地轻而致密,不易折断,切面光滑平整,粉质,可见放射状纹理及棕黄色的形成层,切片后迎光可见皮部和木部连接处有一似人民币防伪线的亮环。在药理作用方面西洋参具有降血压,改善心肌缺血,提高机体免疫力,治疗糖尿病和增强中枢神经系统的功能。

近年来,西洋参的市场需求量逐年增加,而西洋参的主要生产国包括美国、加拿大和中国,相比之下进口西洋参的价格高于国产西洋参,而西洋参的总体价格要高于园参。在中药市场上西洋参一般被加工成片剂、冲剂或者胶囊的形式进行销售,因此无法利用形态学对市售产品的原材料进行区分。不良厂商常以价格便宜园参冒充西洋参进行售卖,而园参和西洋参的药用价值不尽相同致使无法达到预期的治疗效果,甚至有延误治疗的风险,因此建立准确可靠的西洋参快速检测体系尤为重要。

目前主要依靠传统形态学和化学分析法对人参属植物进行鉴定,但形态学法需要长期经验的积累,受主观因素影响较大。化学分析法主要依赖于高效液相色谱仪器进行鉴别,但其耗时长,价格比较昂贵,且难以对参片及参粉等参类产品进行鉴定。近年来,DNA分子标记广泛应用于中药的鉴定,其中包括以分子杂交为核心的随机扩增多态性DNA标记(RAPD),以PCR为核心的限制性片段长度多态性(RFLP),扩增片段长度多态性(AFLP)和简单重复序列标记(SSR),以直接DNA序列分析为核心的单核苷酸多态性(SNP)。其中RAPD法难以保证结果的稳定性和重复性。RFLP和AFLP标记均需酶的参与且检测周期长,需要不只一次PCR扩增。SSR标记检测依赖聚丙烯酰胺凝胶电泳且难以实现自动化。SNP标记重复性差且难以解决非特异性扩增的问题,虽然上述方法均能对西洋参进行鉴别,但其准确性,灵敏度及检测时长不适合于大批量对市售产品进行鉴定。

目前LAMP方法大多用于病毒和细菌检测,尚无应用此技术进行人参和西洋参鉴别的研究。LAMP技术仅需恒温扩增,对仪器要求低,不用PCR仪;能进行可视化检测,操作简单易行;反应速度快,敏感性高;应用多个引物进行反应,特异性好;价格便宜,适用于基层推广等优点。其检测试剂稳定性强,适于大批量样品且易于自动化检测。目前现行的形态学,化学分析和分子生物学方法检验过程相对复杂,不适于进行高通量检测。本发明涉及一种西洋参环等温扩增检测方法,其应用范围为全国各级质量监督检验部门、药品检验部门、中药的生产、销售、使用单位等,与目前广泛应用的高效液相色谱法相比,检测周期短,应用机器成本低,保证了西洋参的形态,不影响其二次销售。

发明内容

本发明旨在提供一种西洋参环介导等温扩增检测方法,首先设计扩增引物,然后再用环介导等温扩增引物进行扩增,最后通过可视化检测,琼脂糖凝胶电泳和实时荧光曲线(RT-LAMP)来实现西洋参的检测。

本发明根据NCBI中获得的西洋参特异性P450基因,通过PrimerExplorer V5(http://primerexplorer.jp/lampv5e/index.html)设计特异性引物,预计西洋参片段大小为155bp,而其近缘物种人参片段大小为520bp(图1)。环等温介导BstDNA聚合酶的性质使得其最适扩增片段为100-300bp,人参特异性片段无法有效扩增,而西洋参特异性片段155bp能较好的扩增出来。

本发明涉及一种西洋参环介导等温扩增检测方法,具体操作的步骤如下:

首先设计其扩增引物,然后配制检测体系,65℃恒温扩增60分钟后通过可视化检测,琼脂糖凝胶电泳或RT-LAMP来实现西洋参的快速检测。

1)检测体系的配制

所述扩增体系建立是采用水溶液配置,体系总体积25μL,其中包括:

2)环介导等温扩增的检测方法

所述环介导等温扩增采用可视化检测,琼脂糖凝胶电泳和RT-LAMP三种方法进行检测。可视化检测是65℃反应一小时后在体系中添加0.2μL 100000×GelRed染料,在312nm激发的UV凝胶成像仪中观察结果。琼脂糖凝胶电泳检测是在65℃反应一小时后用2%的凝胶进行电泳检测。RT-LAMP是在反应体系中加入1μL 20×Eva Green荧光染料,于实时荧光PCR仪器上进行反应,一共分为60个循环,每个循环一分钟,每个循环结束时收集荧光信号,若待测样品RT-LAMP扩增曲线出现典型的S型曲线,高分辨率溶解曲线平滑且解链温度为80-81℃即可判断结果。

附图说明

图1西洋参P450基因差异位点及引物设计

图2西洋参环介导等温扩增可视化检测

图3西洋参环介导等温扩增琼脂糖凝胶电泳检测(1-2:西洋参;3-4:人参;5-6:茯苓;6-8:山药;9-10:葛根)

图4西洋参环介导等温扩增RT-LAMP(A:扩增曲线;B:高分辨率溶解曲线)

图5西洋参产品环介导等温扩增检测(A:可视化检测;B:琼脂糖凝胶电泳;C:扩增曲线;D:高分辨率溶解曲线)

具体实施方式

下面结合实施例对本发明作进一步说明,下面实施例仅用于说明本发明而并非对本发明的限制。

实施例1

1.DNA提取

收集人参、西洋参、茯苓、山药和葛根样品,分别取0.1g样品,采用改良CTAB法提取样品的基因组DNA。

表1.样品名称及产地表

2.环介导等温扩增及检测

反应体系总体积25μL:模板DNA2μL(50ng/μL),2×LAMP Master Mix缓冲液12.5μL,内引物FIP和BIP各2μL(10μM),外引物F3和B3各1μL(2.5μM),BstDNA聚合酶0.5μL(8U/μL)。可视化检测在反应体系中加入100000×GelRed染料0.2μL,65℃反应1h后紫外下观察结果(图2)。琼脂糖凝胶电泳检测是在65℃反应一小时后用2%的凝胶进行电泳检测(图3)。RT-LAMP是在反应体系中加入20×Eva Green荧光染料1μL,于实时荧光PCR仪器上进行反应,一共分为60个循环,每个循环一分钟,每个循环结束时收集荧光信号,若待测样品RT-LAMP扩增曲线出现典型的S型曲线,高分辨率溶解曲线平滑且解链温度为80-81℃即可判断结果(图4)。

实施例2

将本发明的环介导等温扩增方法用于西洋参样品的鉴定。

假设现有一批西洋参样品不能确定是否是真正的西洋参,因此,按照如下方法对它进行鉴定。

首先用改良CTAB法提取样品的基因组DNA。用提取的DNA作为模板,用LAMP引物对其进行环介导等温扩增。其扩增产物可以用可视化检测,琼脂糖凝胶电泳或RT-LAMP法对其进行鉴定。

鉴定结果:若待测样品的可视化检测可见明亮橘黄的荧光,这批样品就是真正的西洋参;若待测样品的琼脂糖凝胶电泳目的条带为155bp,这批样品就是真正的西洋参;若待测样品RT-LAMP扩增曲线出现典型的S型曲线,高分辨率溶解曲线平滑且解链温度为80-81℃,这批样品就是真正的西洋参。若与上述结果相反那么这批样品就不是真正的西洋参。

实施例3

将本发明的环介导等温扩增方法用于西洋参产品的快速鉴定。

假设现有一批西洋参产品不能确定其原材料是否是西洋参,因此,按照如下方法对它进行鉴定。

首先用改良CTAB法提取样品的基因组DNA。用提取的DNA作为模板,用LAMP引物对其进行环介导等温扩增。其扩增产物可以用可视化检测,琼脂糖凝胶电泳或RT-LAMP法对其进行鉴定。

鉴定结果:若待测样品的可视化检测可见明亮橘黄的荧光,这批样品就是真正的西洋参(图5A);若待测样品的琼脂糖凝胶电泳目的条带为155bp,这批样品就是真正的西洋参(图5B);若待测样品RT-LAMP扩增曲线出现典型的S型曲线,高分辨率溶解曲线平滑且解链温度为80-81℃,这批样品就是真正的西洋参(图5C和D)。若与上述结果相反那么这批样品就不是真正的西洋参。

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06120115760171