大肠癌的检测试剂盒或装置以及检测方法
文献发布时间:2023-06-19 10:25:58
本申请是申请日为2015年6月12日、申请号为201580031244.9、发明名称为“大肠癌的检测试剂盒或装置以及检测方法”的专利申请的分案申请。
技术领域
本发明涉及用于检查受试体有无罹患大肠癌的、包含能够与特定的miRNA特异性结合的核酸的大肠癌的检测用试剂盒或装置、以及包含使用该核酸来测定该miRNA的表达量的大肠癌的检测方法。
背景技术
大肠是积存被消化吸收的残留的肠内容物,吸收水分的同时形成大便的脏器。大肠从盲肠开始,接着连接升结肠、横结肠、降结肠、乙状结肠、直肠、肛道。根据国立研究开发法人国立癌症研究中心癌症对策信息中心所公开的2011年的日本国内的各部位癌症的统计,大肠癌罹患人数为112,772人,即日本人约14人中1人罹患大肠癌,是罹患数为第2位的癌症部位。此外将由大肠癌导致的死亡数男女合并,则上升至45,744人,是死亡数为第3位的癌症部位。此外,据说在美国,以约20人中1人的比例发生大肠癌,美国的2014年的推定大肠癌罹患人数也上升至96,830人,其中认为约40,000人死亡(非专利文献1)。
大肠癌的进行度在非专利文献2中规定,根据肿瘤的扩散(Tis、T1~T4)、淋巴节转移(N0、N1a~c、N2a~b)、远处转移(M0、M1a~b)的程度,分为0期(Tis/N0/M0)、I期(T1~T2/N0/M0)、II期(T3~T4/N0/M0)、IIA期(T3/N0/M0)、IIB期(T4a/N0/M0)、IIC期(T4b/N0/M0)、III期(N1~2/M0)、IIIA期(T1~2/N1/M0和T1/N2a/M0)、IIIB期(T3~T4a/N1/M0和T2~T3/N2a/M0和T1~T2/N2b/M0)、IIIC期(T4a/N2a/M0和T3~T4a/N2b/M0和T4b/N1~2/M0)、IVA期(M1a)、IVB期(M1b)。
大肠癌的生存率根据进行度的不同而不同,非专利文献1中分为结肠癌和直肠癌而报告了下述统计值。报告了结肠癌的5年相对生存率是I期为74%、IIA期为67%、IIB期为59%、IIC期为37%、IIIA期为73%、IIIB期为46%、IIIC期为28%、IV期为6%。此外报告了,直肠癌的5年相对生存率是I期为74%、IIA期为65%、IIB期为52%、IIC期为32%、IIIA期为74%、IIIB期为45%、IIIC期为33%、IV期为6%。以上可知,进行度低的大肠癌的生存率高。因此,如果可以早期发现、治疗大肠癌,则大大有助于生存率的提高。
大肠癌的治疗主要是开腹手术、腹腔镜手术,往往在手术后还并用抗癌剂治疗、放射线治疗(非专利文献1)。特别是对于早期的大肠癌,有时可以应用不开腹就可以治疗的内窥镜手术。
如非专利文献1所记载的那样,大肠癌的检查中,广泛普及了便潜血检查、内窥镜检查。特别是便潜血检查便宜且是非侵袭的,能够在自已家中实施,因此美国癌症协会推荐每年接受便潜血检查诊断。进一步,为了研究存在癌症的部位、扩散,除了大肠内窥镜检查以外,还实施了灌肠造影检查、CT检查、MRI检查等图像检查。此外,对于已经诊断为大肠癌的患者,以预后观察和治疗效果观察为目的,有时实施了CEA、CA19-9等血液肿瘤标志物检查(非专利文献1)。
虽然是研究阶段,但如专利文献1~4所示那样,有下述报告:通过以血液为代表的生物体样品中的微小RNA(miRNA)的表达量、或通过将miRNA的表达量与其它蛋白质标志物的表达量进行组合,从而检测大肠癌。
专利文献1中示出了使用大肠癌组织中的hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-24-3p来检测大肠癌、其它癌症的方法。
专利文献2中示出了使用血浆中的hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-1225-3p来检测大肠癌的方法。
专利文献3中示出了使用大肠组织、便中的hsa-miR-1231、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-1268a等多个miRNA来检测大肠癌的方法。
专利文献4中示出了使用组织中的hsa-miR-150-3p、miR-92a-2-5p等来检测大肠癌的方法。
现有技术文献
专利文献
专利文献1:国际公开第2007/081740号
专利文献2:美国专利申请公开第2013/102487号说明书
专利文献3:美国专利申请公开第2012/088687号说明书
专利文献4:日本特表2009-531019号公报
非专利文献
非专利文献1:American Cancer Society“Colorectal Cancer”,2013年监修,p.5~6,17~28,33~,45~54,67~71
非专利文献2:Sobin,L.等,“TNM Classification of Malignant Tumours第7版”2010年,p.94-99
非专利文献3:Allison,JE.等,1996年,The New England Journal of Medicine,第334(3)卷,p.155-9
非专利文献4:Palmqvist,R.等,2007年,Diseases of colon and rectum,第46(11)卷,p.1538-44
发明内容
发明所要解决的课题
本发明的课题在于发现新的大肠癌肿瘤标志物,提供可以使用能够与该标志物特异性结合的核酸而有效地检测大肠癌的方法。也有作为大肠癌的1次检查而现在广泛普及了的便潜血检查在出于痔等非癌症理由而出血的情况下也会判定为阳性,另一方面,不能检测未出血的早期的大肠癌,错过90%以上的大肠异常(包含癌症)这样的报告(非专利文献1)。具体的便潜血检查的敏感度根据使用的检查试剂盒为37%~79.4%,大幅不同,此外,认为特异度为86.7%~97.7%(非专利文献3)。此外,虽然已知大肠内窥镜检查的检查准确度高,但由于前处置、镇静剂的必要性,价格较高等,因此难以应用于一次筛查(非专利文献1)。此外,CEA、CA19-9等血中肿瘤标志物有时即使大肠癌以外的癌症也上升,因此不能说可以判定大肠癌的有无。如果误诊其它癌症而诊断为大肠癌,则错过了适当的治疗时机,或由于应用错误的医疗而对患者强加不需要的经济上、体力上的负担。因此,CEA、CA19-9往往限于用于已经诊断为大肠癌的患者的预后观察和治疗效果观察(非专利文献1)。根据某报告,CEA检查的特异度为99%,另一方面,敏感度仅为12%,认为缺乏作为大肠癌筛查检查的肿瘤标志物测定的意义(非专利文献4)。
此外,虽然是研究阶段,但使用以血液为代表的生物体样品中的微小RNA(miRNA)的表达量来判别大肠癌这样的报告如下述,但都未实用化。
专利文献1中示出了使用大肠癌组织中的hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-24-3p来检测大肠癌、其它癌症的方法。然而,本检测方法需要通过外科手术来获得大肠癌的组织检体,该工序对患者带来的肉体上的负担重,因此作为检查方法是不优选的。此外,本检测方法没有对于具体的准确度、敏感度、特异度等大肠癌的检测性能的记载,因此缺乏产业的实用性。
专利文献3中示出了使用大肠组织、大便中的hsa-miR-1231、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-1268a等多个miRNA来检测大肠癌的方法。然而,为了获得大肠癌组织而进行外科手术对患者带来的肉体上的负担重,因此作为检查方法是不优选的。此外,大便检体的采集虽然是非侵袭的,但有时被检物质在大便中不均匀地存在,有检查结果易于产生偏差这样的课题。
专利文献4中示出了使用组织中的hsa-miR-150-3p、miR-92a-2-5p等来检测大肠癌的方法,但没有对于准确度、敏感度、特异度等检测性能的记载,此外,由于未记载具体的使用了血液的大肠癌的判别方法,因此缺乏产业的实用性。进一步,上述miRNA标志物未被独立的检体组验证,因此缺乏可靠性。
这样,在大肠癌的检测中,现有的肿瘤标志物其性能低,此外对于研究阶段的标志物,性能、检测的方法也未具体地示出,因此在利用了它们的情况下,有下述可能性:由于将健康体误检测为大肠癌患者而实施无益的追加检查、由于看漏大肠癌患者而丧失治疗机会。此外,测定由数十个~数百个组成的miRNA使检查费用增大,因此难以用于健康诊断那样的大规模的筛查。此外,为了测定肿瘤标志物而采集大肠组织对患者带来的侵袭性高,不优选,因此需要下述大肠癌标志物:能够由可以低侵袭地采集的血液检测,且可以将大肠癌患者正确地判别为大肠癌患者,将健康体正确地判别为健康体的准确度高的大肠癌标志物。大肠癌通过早期发现并治疗,从而可以大幅度提高生存率。此外,如果可以早期发现大肠癌,则能够应用不开腹而治疗的内窥镜手术,因此殷切期望即使进行度低的大肠癌也可以检测的敏感度高的大肠癌标志物。
用于解决课题的方法
本发明人等为了解决上述课题而进行了深入研究,结果发现通过从可以低侵袭性地采集的血液找到能够用于大肠癌的检测标志物的多个基因,使用能够与其特异性结合的核酸,从而可以显著地检测大肠癌,由此完成本发明。
<发明的概要>
即,本发明具有以下特征。
(1)大肠癌的检测用试剂盒,其包含能够与作为大肠癌标志物的选自miR-6726-5p、miR-4257、miR-6787-5p、miR-6780b-5p、miR-3131、miR-7108-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-3679-5p、miR-7641、miR-6746-5p、miR-8072、miR-6741-5p、miR-1908-5p、miR-6857-5p、miR-4746-3p、miR-744-5p、miR-4792、miR-564、miR-6791-5p、miR-6825-5p、miR-6826-5p、miR-4665-3p、miR-4467、miR-3188、miR-6125、miR-6756-5p、miR-1228-3p、miR-8063、miR-8069、miR-6875-5p、miR-3185、miR-4433b-3p、miR-6887-5p、miR-128-1-5p、miR-6724-5p、miR-1914-3p、miR-1225-5p、miR-4419b、miR-7110-5p、miR-187-5p、miR-3184-5p、miR-204-3p、miR-5572、miR-6729-5p、miR-615-5p、miR-6749-5p、miR-6515-3p、miR-3937、miR-6840-3p、miR-6893-5p、miR-4728-5p、miR-6717-5p、miR-7113-3p、miR-4665-5p、miR-642b-3p、miR-7109-5p、miR-6842-5p、miR-4442、miR-4433-3p、miR-4707-5p、miR-6126、miR-4449、miR-4706、miR-1913、miR-602、miR-939-5p、miR-4695-5p、miR-711、miR-6816-5p、miR-4632-5p、miR-6721-5p、miR-7847-3p、miR-6132、miR-887-3p、miR-3679-3p、miR-6784-5p、miR-1249、miR-937-5p、miR-5195-3p、miR-6732-5p、miR-4417、miR-4281、miR-4734、miR-6766-3p、miR-663a、miR-4513、miR-6781-5p、miR-1227-5p、miR-6845-5p、miR-6798-5p、miR-3620-5p、miR-1915-5p、miR-4294、miR-642a-3p、miR-371a-5p、miR-940、miR-4450、miR-4723-5p、miR-1469、miR-6861-5p、miR-7975、miR-6879-5p、miR-6802-5p、miR-1268b、miR-663b、miR-125a-3p、miR-2861、miR-6088、miR-4758-5p、miR-296-3p、miR-6738-5p、miR-671-5p、miR-4454、miR-4516、miR-7845-5p、miR-4741、miR-92b-5p、miR-6795-5p、miR-6805-3p、miR-4725-3p、miR-6782-5p、miR-4688、miR-6850-5p、miR-6777-5p、miR-6785-5p、miR-7106-5p、miR-3663-3p、miR-6131、miR-1915-3p、miR-4532、miR-6820-5p、miR-4689、miR-4638-5p、miR-3656、miR-3621、miR-6769b-5p、miR-149-3p、miR-23b-3p、miR-3135b、miR-6848-5p、miR-6769a-5p、miR-4327、miR-6765-3p、miR-6716-5p、miR-6877-5p、miR-6727-5p、miR-4534、miR-614、miR-1202、miR-575、miR-6870-5p、miR-6722-3p、miR-7977、miR-4649-5p、miR-4675、miR-6075、miR-6779-5p、miR-4271、miR-3196、miR-6803-5p、miR-6789-5p、miR-4648、miR-4508、miR-4749-5p、miR-4505、miR-5698、miR-1199-5p、miR-4763-3p、miR-6836-3p、miR-3195、miR-718、miR-3178、miR-638、miR-4497、miR-6085、miR-6752-5p和miR-135a-3p中的至少1个以上多核苷酸特异性结合的核酸。
(2)根据(1)所述的试剂盒,其中miR-6726-5p为hsa-miR-6726-5p,miR-4257为hsa-miR-4257,miR-6787-5p为hsa-miR-6787-5p,miR-6780b-5p为hsa-miR-6780b-5p,miR-3131为hsa-miR-3131,miR-7108-5p为hsa-miR-7108-5p,miR-1343-3p为hsa-miR-1343-3p,miR-1247-3p为hsa-miR-1247-3p,miR-4651为hsa-miR-4651,miR-6757-5p为hsa-miR-6757-5p,miR-3679-5p为hsa-miR-3679-5p,miR-7641为hsa-miR-7641,miR-6746-5p为hsa-miR-6746-5p,miR-8072为hsa-miR-8072,miR-6741-5p为hsa-miR-6741-5p,miR-1908-5p为hsa-miR-1908-5p,miR-6857-5p为hsa-miR-6857-5p,miR-4746-3p为hsa-miR-4746-3p,miR-744-5p为hsa-miR-744-5p,miR-4792为hsa-miR-4792,miR-564为hsa-miR-564,miR-6791-5p为hsa-miR-6791-5p,miR-6825-5p为hsa-miR-6825-5p,miR-6826-5p为hsa-miR-6826-5p,miR-4665-3p为hsa-miR-4665-3p,miR-4467为hsa-miR-4467,miR-3188为hsa-miR-3188,miR-6125为hsa-miR-6125,miR-6756-5p为hsa-miR-6756-5p,miR-1228-3p为hsa-miR-1228-3p,miR-8063为hsa-miR-8063,miR-8069为hsa-miR-8069,miR-6875-5p为hsa-miR-6875-5p,miR-3185为hsa-miR-3185,miR-4433b-3p为hsa-miR-4433b-3p,miR-6887-5p为hsa-miR-6887-5p,miR-128-1-5p为hsa-miR-128-1-5p,miR-6724-5p为hsa-miR-6724-5p,miR-1914-3p为hsa-miR-1914-3p,miR-1225-5p为hsa-miR-1225-5p,miR-4419b为hsa-miR-4419b,miR-7110-5p为hsa-miR-7110-5p,miR-187-5p为hsa-miR-187-5p,miR-3184-5p为hsa-miR-3184-5p,miR-204-3p为hsa-miR-204-3p,miR-5572为hsa-miR-5572,miR-6729-5p为hsa-miR-6729-5p,miR-615-5p为hsa-miR-615-5p,miR-6749-5p为hsa-miR-6749-5p,miR-6515-3p为hsa-miR-6515-3p,miR-3937为hsa-miR-3937,miR-6840-3p为hsa-miR-6840-3p,miR-6893-5p为hsa-miR-6893-5p,miR-4728-5p为hsa-miR-4728-5p,miR-6717-5p为hsa-miR-6717-5p,miR-7113-3p为hsa-miR-7113-3p,miR-4665-5p为hsa-miR-4665-5p,miR-642b-3p为hsa-miR-642b-3p,miR-7109-5p为hsa-miR-7109-5p,miR-6842-5p为hsa-miR-6842-5p,miR-4442为hsa-miR-4442,miR-4433-3p为hsa-miR-4433-3p,miR-4707-5p为hsa-miR-4707-5p,miR-6126为hsa-miR-6126,miR-4449为hsa-miR-4449,miR-4706为hsa-miR-4706,miR-1913为hsa-miR-1913,miR-602为hsa-miR-602,miR-939-5p为hsa-miR-939-5p,miR-4695-5p为hsa-miR-4695-5p,miR-711为hsa-miR-711,miR-6816-5p为hsa-miR-6816-5p,miR-4632-5p为hsa-miR-4632-5p,miR-6721-5p为hsa-miR-6721-5p,miR-7847-3p为hsa-miR-7847-3p,miR-6132为hsa-miR-6132,miR-887-3p为hsa-miR-887-3p,miR-3679-3p为hsa-miR-3679-3p,miR-6784-5p为hsa-miR-6784-5p,miR-1249为hsa-miR-1249,miR-937-5p为hsa-miR-937-5p,miR-5195-3p为hsa-miR-5195-3p,miR-6732-5p为hsa-miR-6732-5p,miR-4417为hsa-miR-4417,miR-4281为hsa-miR-4281,miR-4734为hsa-miR-4734,miR-6766-3p为hsa-miR-6766-3p,miR-663a为hsa-miR-663a,miR-4513为hsa-miR-4513,miR-6781-5p为hsa-miR-6781-5p,miR-1227-5p为hsa-miR-1227-5p,miR-6845-5p为hsa-miR-6845-5p,miR-6798-5p为hsa-miR-6798-5p,miR-3620-5p为hsa-miR-3620-5p,miR-1915-5p为hsa-miR-1915-5p,miR-4294为hsa-miR-4294,miR-642a-3p为hsa-miR-642a-3p,miR-371a-5p为hsa-miR-371a-5p,miR-940为hsa-miR-940,miR-4450为hsa-miR-4450,miR-4723-5p为hsa-miR-4723-5p,miR-1469为hsa-miR-1469,miR-6861-5p为hsa-miR-6861-5p,miR-7975为hsa-miR-7975,miR-6879-5p为hsa-miR-6879-5p,miR-6802-5p为hsa-miR-6802-5p,miR-1268b为hsa-miR-1268b,miR-663b为hsa-miR-663b,miR-125a-3p为hsa-miR-125a-3p,miR-2861为hsa-miR-2861,miR-6088为hsa-miR-6088,miR-4758-5p为hsa-miR-4758-5p,miR-296-3p为hsa-miR-296-3p,miR-6738-5p为hsa-miR-6738-5p,miR-671-5p为hsa-miR-671-5p,miR-4454为hsa-miR-4454,miR-4516为hsa-miR-4516,miR-7845-5p为hsa-miR-7845-5p,miR-4741为hsa-miR-4741,miR-92b-5p为hsa-miR-92b-5p,miR-6795-5p为hsa-miR-6795-5p,miR-6805-3p为hsa-miR-6805-3p,miR-4725-3p为hsa-miR-4725-3p,miR-6782-5p为hsa-miR-6782-5p,miR-4688为hsa-miR-4688,miR-6850-5p为hsa-miR-6850-5p,miR-6777-5p为hsa-miR-6777-5p,miR-6785-5p为hsa-miR-6785-5p,miR-7106-5p为hsa-miR-7106-5p,miR-3663-3p为hsa-miR-3663-3p,miR-6131为hsa-miR-6131,miR-1915-3p为hsa-miR-1915-3p,miR-4532为hsa-miR-4532,miR-6820-5p为hsa-miR-6820-5p,miR-4689为hsa-miR-4689,miR-4638-5p为hsa-miR-4638-5p,miR-3656为hsa-miR-3656,miR-3621为hsa-miR-3621,miR-6769b-5p为hsa-miR-6769b-5p,miR-149-3p为hsa-miR-149-3p,miR-23b-3p为hsa-miR-23b-3p,miR-3135b为hsa-miR-3135b,miR-6848-5p为hsa-miR-6848-5p,miR-6769a-5p为hsa-miR-6769a-5p,miR-4327为hsa-miR-4327,miR-6765-3p为hsa-miR-6765-3p,miR-6716-5p为hsa-miR-6716-5p,miR-6877-5p为hsa-miR-6877-5p,miR-6727-5p为hsa-miR-6727-5p,miR-4534为hsa-miR-4534,miR-614为hsa-miR-614,miR-1202为hsa-miR-1202,miR-575为hsa-miR-575,miR-6870-5p为hsa-miR-6870-5p,miR-6722-3p为hsa-miR-6722-3p,miR-7977为hsa-miR-7977,miR-4649-5p为hsa-miR-4649-5p,miR-4675为hsa-miR-4675,miR-6075为hsa-miR-6075,miR-6779-5p为hsa-miR-6779-5p,miR-4271为hsa-miR-4271,miR-3196为hsa-miR-3196,miR-6803-5p为hsa-miR-6803-5p,miR-6789-5p为hsa-miR-6789-5p,miR-4648为hsa-miR-4648,miR-4508为hsa-miR-4508,miR-4749-5p为hsa-miR-4749-5p,miR-4505为hsa-miR-4505,miR-5698为hsa-miR-5698,miR-1199-5p为hsa-miR-1199-5p,miR-4763-3p为hsa-miR-4763-3p,miR-6836-3p为hsa-miR-6836-3p,miR-3195为hsa-miR-3195,miR-718为hsa-miR-718,miR-3178为hsa-miR-3178,miR-638为hsa-miR-638,miR-4497为hsa-miR-4497,miR-6085为hsa-miR-6085,miR-6752-5p为hsa-miR-6752-5p和miR-135a-3p为hsa-miR-135a-3p。
(3)根据(1)或(2)所述的试剂盒,其中上述核酸为选自下述(a)~(e)所示的多核苷酸中的多核苷酸,
(a)由序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(b)包含序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(c)由与序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(d)包含与序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(e)与上述(a)~(d)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
(4)根据(1)~(3)的任一项所述的试剂盒,上述试剂盒进一步包含能够与作为其它大肠癌标志物的选自miR-1231、miR-1233-5p、miR-150-3p、miR-1225-3p、miR-92a-2-5p、miR-423-5p、miR-1268a、miR-128-2-5p和miR-24-3p中的至少1个以上多核苷酸特异性结合的核酸。
(5)根据(4)所述的试剂盒,其中miR-1231为hsa-miR-1231,miR-1233-5p为hsa-miR-1233-5p,miR-150-3p为hsa-miR-150-3p,miR-1225-3p为hsa-miR-1225-3p,miR-92a-2-5p为hsa-miR-92a-2-5p,miR-423-5p为hsa-miR-423-5p,miR-1268a为hsa-miR-1268a,miR-128-2-5p为hsa-miR-128-2-5p和miR-24-3p为hsa-miR-24-3p。
(6)根据(4)或(5)所述的试剂盒,其中上述核酸为选自下述(f)~(j)所示的多核苷酸中的多核苷酸,
(f)由序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(g)包含序列号172~180的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(h)由与序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(i)包含与序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(j)与上述(f)~(i)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
(7)根据(1)~(6)的任一项所述的试剂盒,上述试剂盒进一步包含能够与作为其它大肠癌标志物的选自miR-4697-5p、miR-3197、miR-675-5p、miR-4486、miR-7107-5p、miR-23a-3p、miR-4667-5p、miR-451a、miR-3940-5p、miR-8059、miR-6813-5p、miR-4492、miR-4476和miR-6090中的至少1个以上多核苷酸特异性结合的核酸。
(8)根据(7)所述的试剂盒,其中miR-4697-5p为hsa-miR-4697-5p,miR-3197为hsa-miR-3197,miR-675-5p为hsa-miR-675-5p,miR-4486为hsa-miR-4486,miR-7107-5p为hsa-miR-7107-5p,miR-23a-3p为hsa-miR-23a-3p,miR-4667-5p为hsa-miR-4667-5p,miR-451a为hsa-miR-451a,miR-3940-5p为hsa-miR-3940-5p,miR-8059为hsa-miR-8059,miR-6813-5p为hsa-miR-6813-5p,miR-4492为hsa-miR-4492,miR-4476为hsa-miR-4476和miR-6090为hsa-miR-6090。
(9)根据(7)或(8)所述的试剂盒,其中上述核酸为选自下述(k)~(o)所示的多核苷酸中的多核苷酸,
(k)由序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(l)包含序列号181~194的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(m)由与序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(n)包含与序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(o)与上述(k)~(n)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
(10)根据(1)~(9)的任一项所述的试剂盒,上述试剂盒包含能够与选自(1)或(2)记载的全部大肠癌标志物中的至少2个以上多核苷酸分别特异性结合的至少2个以上核酸。
(11)大肠癌的检测用装置,其包含能够与作为大肠癌标志物的选自miR-6726-5p、miR-4257、miR-6787-5p、miR-6780b-5p、miR-3131、miR-7108-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-3679-5p、miR-7641、miR-6746-5p、miR-8072、miR-6741-5p、miR-1908-5p、miR-6857-5p、miR-4746-3p、miR-744-5p、miR-4792、miR-564、miR-6791-5p、miR-6825-5p、miR-6826-5p、miR-4665-3p、miR-4467、miR-3188、miR-6125、miR-6756-5p、miR-1228-3p、miR-8063、miR-8069、miR-6875-5p、miR-3185、miR-4433b-3p、miR-6887-5p、miR-128-1-5p、miR-6724-5p、miR-1914-3p、miR-1225-5p、miR-4419b、miR-7110-5p、miR-187-5p、miR-3184-5p、miR-204-3p、miR-5572、miR-6729-5p、miR-615-5p、miR-6749-5p、miR-6515-3p、miR-3937、miR-6840-3p、miR-6893-5p、miR-4728-5p、miR-6717-5p、miR-7113-3p、miR-4665-5p、miR-642b-3p、miR-7109-5p、miR-6842-5p、miR-4442、miR-4433-3p、miR-4707-5p、miR-6126、miR-4449、miR-4706、miR-1913、miR-602、miR-939-5p、miR-4695-5p、miR-711、miR-6816-5p、miR-4632-5p、miR-6721-5p、miR-7847-3p、miR-6132、miR-887-3p、miR-3679-3p、miR-6784-5p、miR-1249、miR-937-5p、miR-5195-3p、miR-6732-5p、miR-4417、miR-4281、miR-4734、miR-6766-3p、miR-663a、miR-4513、miR-6781-5p、miR-1227-5p、miR-6845-5p、miR-6798-5p、miR-3620-5p、miR-1915-5p、miR-4294、miR-642a-3p、miR-371a-5p、miR-940、miR-4450、miR-4723-5p、miR-1469、miR-6861-5p、miR-7975、miR-6879-5p、miR-6802-5p、miR-1268b、miR-663b、miR-125a-3p、miR-2861、miR-6088、miR-4758-5p、miR-296-3p、miR-6738-5p、miR-671-5p、miR-4454、miR-4516、miR-7845-5p、miR-4741、miR-92b-5p、miR-6795-5p、miR-6805-3p、miR-4725-3p、miR-6782-5p、miR-4688、miR-6850-5p、miR-6777-5p、miR-6785-5p、miR-7106-5p、miR-3663-3p、miR-6131、miR-1915-3p、miR-4532、miR-6820-5p、miR-4689、miR-4638-5p、miR-3656、miR-3621、miR-6769b-5p、miR-149-3p、miR-23b-3p、miR-3135b、miR-6848-5p、miR-6769a-5p、miR-4327、miR-6765-3p、miR-6716-5p、miR-6877-5p、miR-6727-5p、miR-4534、miR-614、miR-1202、miR-575、miR-6870-5p、miR-6722-3p、miR-7977、miR-4649-5p、miR-4675、miR-6075、miR-6779-5p、miR-4271、miR-3196、miR-6803-5p、miR-6789-5p、miR-4648、miR-4508、miR-4749-5p、miR-4505、miR-5698、miR-1199-5p、miR-4763-3p、miR-6836-3p、miR-3195、miR-718、miR-3178、miR-638、miR-4497、miR-6085、miR-6752-5p和miR-135a-3p中的至少1个以上多核苷酸特异性结合的核酸。
(12)根据(11)所述的装置,其中miR-6726-5p为hsa-miR-6726-5p,miR-4257为hsa-miR-4257,miR-6787-5p为hsa-miR-6787-5p,miR-6780b-5p为hsa-miR-6780b-5p,miR-3131为hsa-miR-3131,miR-7108-5p为hsa-miR-7108-5p,miR-1343-3p为hsa-miR-1343-3p,miR-1247-3p为hsa-miR-1247-3p,miR-4651为hsa-miR-4651,miR-6757-5p为hsa-miR-6757-5p,miR-3679-5p为hsa-miR-3679-5p,miR-7641为hsa-miR-7641,miR-6746-5p为hsa-miR-6746-5p,miR-8072为hsa-miR-8072,miR-6741-5p为hsa-miR-6741-5p,miR-1908-5p为hsa-miR-1908-5p,miR-6857-5p为hsa-miR-6857-5p,miR-4746-3p为hsa-miR-4746-3p,miR-744-5p为hsa-miR-744-5p,miR-4792为hsa-miR-4792,miR-564为hsa-miR-564,miR-6791-5p为hsa-miR-6791-5p,miR-6825-5p为hsa-miR-6825-5p,miR-6826-5p为hsa-miR-6826-5p,miR-4665-3p为hsa-miR-4665-3p,miR-4467为hsa-miR-4467,miR-3188为hsa-miR-3188,miR-6125为hsa-miR-6125,miR-6756-5p为hsa-miR-6756-5p,miR-1228-3p为hsa-miR-1228-3p,miR-8063为hsa-miR-8063,miR-8069为hsa-miR-8069,miR-6875-5p为hsa-miR-6875-5p,miR-3185为hsa-miR-3185,miR-4433b-3p为hsa-miR-4433b-3p,miR-6887-5p为hsa-miR-6887-5p,miR-128-1-5p为hsa-miR-128-1-5p,miR-6724-5p为hsa-miR-6724-5p,miR-1914-3p为hsa-miR-1914-3p,miR-1225-5p为hsa-miR-1225-5p,miR-4419b为hsa-miR-4419b,miR-7110-5p为hsa-miR-7110-5p,miR-187-5p为hsa-miR-187-5p,miR-3184-5p为hsa-miR-3184-5p,miR-204-3p为hsa-miR-204-3p,miR-5572为hsa-miR-5572,miR-6729-5p为hsa-miR-6729-5p,miR-615-5p为hsa-miR-615-5p,miR-6749-5p为hsa-miR-6749-5p,miR-6515-3p为hsa-miR-6515-3p,miR-3937为hsa-miR-3937,miR-6840-3p为hsa-miR-6840-3p,miR-6893-5p为hsa-miR-6893-5p,miR-4728-5p为hsa-miR-4728-5p,miR-6717-5p为hsa-miR-6717-5p,miR-7113-3p为hsa-miR-7113-3p,miR-4665-5p为hsa-miR-4665-5p,miR-642b-3p为hsa-miR-642b-3p,miR-7109-5p为hsa-miR-7109-5p,miR-6842-5p为hsa-miR-6842-5p,miR-4442为hsa-miR-4442,miR-4433-3p为hsa-miR-4433-3p,miR-4707-5p为hsa-miR-4707-5p,miR-6126为hsa-miR-6126,miR-4449为hsa-miR-4449,miR-4706为hsa-miR-4706,miR-1913为hsa-miR-1913,miR-602为hsa-miR-602,miR-939-5p为hsa-miR-939-5p,miR-4695-5p为hsa-miR-4695-5p,miR-711为hsa-miR-711,miR-6816-5p为hsa-miR-6816-5p,miR-4632-5p为hsa-miR-4632-5p,miR-6721-5p为hsa-miR-6721-5p,miR-7847-3p为hsa-miR-7847-3p,miR-6132为hsa-miR-6132,miR-887-3p为hsa-miR-887-3p,miR-3679-3p为hsa-miR-3679-3p,miR-6784-5p为hsa-miR-6784-5p,miR-1249为hsa-miR-1249,miR-937-5p为hsa-miR-937-5p,miR-5195-3p为hsa-miR-5195-3p,miR-6732-5p为hsa-miR-6732-5p,miR-4417为hsa-miR-4417,miR-4281为hsa-miR-4281,miR-4734为hsa-miR-4734,miR-6766-3p为hsa-miR-6766-3p,miR-663a为hsa-miR-663a,miR-4513为hsa-miR-4513,miR-6781-5p为hsa-miR-6781-5p,miR-1227-5p为hsa-miR-1227-5p,miR-6845-5p为hsa-miR-6845-5p,miR-6798-5p为hsa-miR-6798-5p,miR-3620-5p为hsa-miR-3620-5p,miR-1915-5p为hsa-miR-1915-5p,miR-4294为hsa-miR-4294,miR-642a-3p为hsa-miR-642a-3p,miR-371a-5p为hsa-miR-371a-5p,miR-940为hsa-miR-940,miR-4450为hsa-miR-4450,miR-4723-5p为hsa-miR-4723-5p,miR-1469为hsa-miR-1469,miR-6861-5p为hsa-miR-6861-5p,miR-7975为hsa-miR-7975,miR-6879-5p为hsa-miR-6879-5p,miR-6802-5p为hsa-miR-6802-5p,miR-1268b为hsa-miR-1268b,miR-663b为hsa-miR-663b,miR-125a-3p为hsa-miR-125a-3p,miR-2861为hsa-miR-2861,miR-6088为hsa-miR-6088,miR-4758-5p为hsa-miR-4758-5p,miR-296-3p为hsa-miR-296-3p,miR-6738-5p为hsa-miR-6738-5p,miR-671-5p为hsa-miR-671-5p,miR-4454为hsa-miR-4454,miR-4516为hsa-miR-4516,miR-7845-5p为hsa-miR-7845-5p,miR-4741为hsa-miR-4741,miR-92b-5p为hsa-miR-92b-5p,miR-6795-5p为hsa-miR-6795-5p,miR-6805-3p为hsa-miR-6805-3p,miR-4725-3p为hsa-miR-4725-3p,miR-6782-5p为hsa-miR-6782-5p,miR-4688为hsa-miR-4688,miR-6850-5p为hsa-miR-6850-5p,miR-6777-5p为hsa-miR-6777-5p,miR-6785-5p为hsa-miR-6785-5p,miR-7106-5p为hsa-miR-7106-5p,miR-3663-3p为hsa-miR-3663-3p,miR-6131为hsa-miR-6131,miR-1915-3p为hsa-miR-1915-3p,miR-4532为hsa-miR-4532,miR-6820-5p为hsa-miR-6820-5p,miR-4689为hsa-miR-4689,miR-4638-5p为hsa-miR-4638-5p,miR-3656为hsa-miR-3656,miR-3621为hsa-miR-3621,miR-6769b-5p为hsa-miR-6769b-5p,miR-149-3p为hsa-miR-149-3p,miR-23b-3p为hsa-miR-23b-3p,miR-3135b为hsa-miR-3135b,miR-6848-5p为hsa-miR-6848-5p,miR-6769a-5p为hsa-miR-6769a-5p,miR-4327为hsa-miR-4327,miR-6765-3p为hsa-miR-6765-3p,miR-6716-5p为hsa-miR-6716-5p,miR-6877-5p为hsa-miR-6877-5p,miR-6727-5p为hsa-miR-6727-5p,miR-4534为hsa-miR-4534,miR-614为hsa-miR-614,miR-1202为hsa-miR-1202,miR-575为hsa-miR-575,miR-6870-5p为hsa-miR-6870-5p,miR-6722-3p为hsa-miR-6722-3p,miR-7977为hsa-miR-7977,miR-4649-5p为hsa-miR-4649-5p,miR-4675为hsa-miR-4675,miR-6075为hsa-miR-6075,miR-6779-5p为hsa-miR-6779-5p,miR-4271为hsa-miR-4271,miR-3196为hsa-miR-3196,miR-6803-5p为hsa-miR-6803-5p,miR-6789-5p为hsa-miR-6789-5p,miR-4648为hsa-miR-4648,miR-4508为hsa-miR-4508,miR-4749-5p为hsa-miR-4749-5p,miR-4505为hsa-miR-4505,miR-5698为hsa-miR-5698,miR-1199-5p为hsa-miR-1199-5p,miR-4763-3p为hsa-miR-4763-3p,miR-6836-3p为hsa-miR-6836-3p,miR-3195为hsa-miR-3195,miR-718为hsa-miR-718,miR-3178为hsa-miR-3178,miR-638为hsa-miR-638,miR-4497为hsa-miR-4497,miR-6085为hsa-miR-6085,miR-6752-5p为hsa-miR-6752-5p和miR-135a-3p为hsa-miR-135a-3p。
(13)根据(11)或(12)所述的装置,其中上述核酸为选自下述(a)~(e)所示的多核苷酸中的多核苷酸,
(a)由序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(b)包含序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(c)由与序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(d)包含与序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(e)与上述(a)~(d)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
(14)根据(11)~(13)的任一项所述的装置,上述装置进一步包含能够与作为其它大肠癌标志物的选自miR-1231、miR-1233-5p、miR-150-3p、miR-1225-3p、miR-92a-2-5p、miR-423-5p、miR-1268a、miR-128-2-5p和miR-24-3p中的至少1个以上多核苷酸特异性结合的核酸。
(15)根据(14)所述的装置,其中miR-1231为hsa-miR-1231,miR-1233-5p为hsa-miR-1233-5p,miR-150-3p为hsa-miR-150-3p,miR-1225-3p为hsa-miR-1225-3p,miR-92a-2-5p为hsa-miR-92a-2-5p,miR-423-5p为hsa-miR-423-5p,miR-1268a为hsa-miR-1268a,miR-128-2-5p为hsa-miR-128-2-5p和miR-24-3p为hsa-miR-24-3p。
(16)根据(14)或(15)所述的装置,其中上述核酸为选自下述(f)~(j)所示的多核苷酸中的多核苷酸,
(f)由序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(g)包含序列号172~180的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(h)由与序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(i)包含与序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(j)与上述(f)~(i)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
(17)根据(11)~(16)的任一项所述的装置,上述装置进一步包含能够与作为其它大肠癌标志物的选自miR-4697-5p、miR-3197、miR-675-5p、miR-4486、miR-7107-5p、miR-23a-3p、miR-4667-5p、miR-451a、miR-3940-5p、miR-8059、miR-6813-5p、miR-4492、miR-4476和miR-6090中的至少1个以上多核苷酸特异性结合的核酸。
(18)根据(17)所述的装置,其中miR-4697-5p为hsa-miR-4697-5p,miR-3197为hsa-miR-3197,miR-675-5p为hsa-miR-675-5p,miR-4486为hsa-miR-4486,miR-7107-5p为hsa-miR-7107-5p,miR-23a-3p为hsa-miR-23a-3p,miR-4667-5p为hsa-miR-4667-5p,miR-451a为hsa-miR-451a,miR-3940-5p为hsa-miR-3940-5p,miR-8059为hsa-miR-8059,miR-6813-5p为hsa-miR-6813-5p,miR-4492为hsa-miR-4492,miR-4476为hsa-miR-4476和miR-6090为hsa-miR-6090。
(19)根据(17)或(18)所述的装置,其中上述核酸为选自下述(k)~(o)所示的多核苷酸中的多核苷酸,
(k)由序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(l)包含序列号181~194的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(m)由与序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(n)包含与序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(o)与上述(k)~(n)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
(20)根据(11)~(19)的任一项所述的装置,上述装置为用于通过杂交技术进行测定的装置。
(21)根据(20)所述的装置,其中上述杂交技术为核酸阵列技术。
(22)根据(11)~(21)的任一项所述的装置,上述装置包含能够与选自(11)或(12)记载的全部大肠癌标志物中的至少2个以上多核苷酸分别特异性结合的至少2个以上核酸。
(23)大肠癌的检测方法,其包括:使用(1)~(10)的任一项所述的试剂盒或(11)~(22)的任一项所述的装置,测定受试体的检体中的靶核酸的表达量,使用该测得的表达量和同样地测得的健康体的对照表达量对受试体罹患大肠癌或未罹患大肠癌进行体外评价。
(24)根据(23)所述的方法,其中上述受试体为人。
(25)根据(23)或(24)所述的方法,其中上述检体为血液、血清或血浆。
<用语的定义>
本说明书中所使用的用语具有以下定义。
核苷酸、多核苷酸、DNA、RNA等缩写的显示,按照“塩基配列又はアミノ酸配列を含む明細書等の作成のためのガイドライン(制作包含碱基序列或氨基酸序列的说明书等的指导原则)”(日本特许厅编)和本技术领域中的惯用。
本说明书中“多核苷酸”,对包含RNA、DNA和RNA/DNA(嵌合体)的任一者的核酸使用。另外,上述DNA中包含cDNA、基因组DNA、和合成DNA的任一种。此外,上述RNA中包含总RNA、mRNA、rRNA、miRNA、siRNA、snoRNA、snRNA、非编码(non-coding)RNA和合成RNA的任一种。本说明书中“合成DNA”和“合成RNA”是指基于规定的碱基序列(可以为天然型序列或非天然型序列的任一种),使用例如自动核酸合成仪,人工地制作的DNA和RNA。本说明书中“非天然型序列”意图以广义的含义使用,包含与天然型序列不同的、例如包含1个以上核苷酸的替换、缺失、插入和/或添加的序列(即,突变序列),包含1个以上修饰核苷酸的序列(即,修饰序列)等。此外,本说明书中,多核苷酸与核酸互换地使用。
本说明书中“片段”,是具有多核苷酸的连续的一部分的碱基序列的多核苷酸,期望具有15个碱基以上,优选为17个碱基以上,更优选为19个碱基以上的长度。
本说明书中“基因”,意图不仅包含RNA和双链DNA,而且包含构成它们的正链(或有义链)或互补链(或反义链)等各单链DNA而使用。此外对其长度不特别限制。
因此,本说明书中“基因”,只要没有特别说明,包含:包含人基因组DNA的双链DNA、单链DNA(正链)、包含cDNA的具有与该正链互补的序列的单链DNA(互补链)、微小RNA(miRNA)、和它们的片段、以及转录产物的任一种。此外,该“基因”不仅是特定的碱基序列(或序列号)所示的“基因”,而且是包含与由该基因编码的RNA生物学功能同等的RNA,例如编码同族体(即,同源物或直向同源物(ortholog))、基因多态性等的突变体、以及衍生物的“核酸”。作为这样的编码同族体、突变体或衍生物的“核酸”,具体而言,可举出具有在后面记载的严格条件下,与序列号1~635的任一项所示的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列的互补序列杂交的碱基序列的“核酸”。另外,“基因”不考虑功能区的差别,可以包含例如表达控制区、编码区、外显子或内含子。此外,“基因”可以包含于细胞,可以释放到细胞外而单独地存在,此外也可以处于内包于被称为外来体的小泡的状态。
本说明书中“外来体”(别称“Exosome”),是被由细胞分泌的脂双层包围的小泡。外来体来源于多泡内体,释放到细胞外环境时有时在内部包含RNA、DNA等“基因”、蛋白质等生物体物质。已知外来体包含于血液、血清、血浆、淋巴液等体液。
本说明书中“转录产物”,是指将基因的DNA序列作为模板而合成的RNA。RNA聚合酶与位于基因上游的被称为启动子的部位结合,以与DNA的碱基序列互补地使3’末端结合核糖核苷酸下去的形式合成RNA。该RNA不仅包含基因本身,而且包含以表达控制区、编码区、外显子或内含子为代表的从转录起始点到多聚A序列的末端的全序列。
此外,本说明书中“微小RNA(miRNA)”只要没有特别说明,则意图作为发夹样结构的RNA前体被转录,被具有RNase III切割活性的dsRNA切割酶切割,被称为RISC的蛋白质复合体包入,参与mRNA的翻译抑制的15~25碱基的非编码RNA来使用。此外,本说明书中使用的“miRNA”不仅包含特定的碱基序列(或序列号)所示的“miRNA”,而且包含该“miRNA”的前体(pre-miRNA、pri-miRNA)、以及与它们生物学功能同等的miRNA,例如同族体(即,同源物或直向同源物)、基因多态性等的突变体、和衍生物。作为这样的前体、同族体、突变体或衍生物,具体而言,可举出能够通过miRBase版本20(http://www.mirbase.org/)来鉴定,具有在后面记载的严格条件下与序列号1~635的任一项所示的任一特定碱基序列的互补序列杂交的碱基序列的“miRNA”。此外,本说明书中使用的“miRNA”可以为miR基因的基因产物,这样的基因产物包含成熟miRNA(例如,上述那样的参与mRNA的翻译抑制的15~25碱基、或19~25碱基的非编码RNA)或miRNA前体(例如,上述那样的pre-miRNA或pri-miRNA)。
本说明书中“探针”,包含用于特异性地检测通过基因表达而产生的RNA或来源于该RNA的多核苷酸的多核苷酸和/或与其互补的多核苷酸。
本说明书中“引物”,包含特异性地识别、扩增通过基因表达而产生的RNA或来源于该RNA的多核苷酸的多核苷酸和/或与其互补的多核苷酸。
这里互补的多核苷酸(互补链、负链),是指对由通过序列号1~635的任一项定义的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸的全长序列、或其部分序列(这里为了方便,将其称为正链),基于A:T(U)、G:C这样的碱基对关系而处于碱基上互补的关系的多核苷酸。然而,这样的互补链不限于与成为对象的正链的碱基序列完全形成互补序列的情况,还可以具有与成为对象的正链在严格条件下能杂交的程度的互补关系。
本说明书中“严格条件”,是指核酸探针与针对其它序列相比,以更大的程度(例如背景测定值的平均+背景测定值的标准误差×2以上的测定值)对其目标序列杂交的条件。严格条件为序列依赖性的,根据杂交环境的不同而不同。通过控制杂交和/或洗涤条件的严格性,从而可以鉴定出对核酸探针为100%互补的目标序列。“严格条件”的具体例见后述。
本说明书中“Tm值”,是指多核苷酸的双链部分变性成单链,双链与单链以1:1的比存在的温度。
本说明书中“突变体”,在核酸的情况下,是指由多态性、突变等引起的天然的突变体,或在序列号1~194和606~614的任一碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列、或其部分序列中包含1个或2个以上碱基的缺失、替换、添加或插入的突变体,或与该各个碱基序列或其部分序列显示约90%以上、约95%以上、约97%以上、约98%以上、约99%以上的%同一性的突变体,或与包含该碱基序列或其部分序列的多核苷酸或寡核苷酸在上述定义的严格条件下杂交的核酸。
本说明书中“多个”,是指约10、9、8、7、6、5、4、3或2个的整数。
本说明书中突变体,能够使用定点诱变法、利用了PCR法的突变引入法等公知的技术来制作。
本说明书中“%同一性”,可以使用上述的利用BLAST、FASTA的蛋白质或基因的检索系统,在导入空位或不导入空位的情况下确定(Zheng Zhang等,2000年,J.Comput.Biol.,7卷,p203-214;Altschul,S.F.等,1990年,Journal of MolecularBiology,第215卷,p403-410;Pearson,W.R.等,1988年,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,第85卷,p2444-2448)。
本说明书中“衍生物”,是指修饰核酸,非限定地包含例如,荧光团等的标记化衍生物、包含修饰核苷酸(例如包含卤素、甲基等烷基、甲氧基等烷氧基、硫代、羧甲基等基团的核苷酸和受到了碱基的重构、双键的饱和、脱氨基化、氧分子向硫分子的替换等的核苷酸等)的衍生物、PNA(肽核酸;Nielsen,P.E.等,1991年,Science,254卷,p1497-500),LNA(锁核酸;Obika,S.等,1998年,Tetrahedron Lett.,39卷,p5401-5404)等。
本说明书中能够与选自上述的作为大肠癌标志物的miRNA中的多核苷酸特异性结合的“核酸”,是合成或调制的核酸,具体而言,包含“核酸探针”或“引物”,为了检测受试体中的大肠癌有无存在、或为了诊断大肠癌的罹患的有无、罹患的程度、大肠癌有无改善、改善的程度、对大肠癌治疗的敏感性,或为了筛选对大肠癌的预防、改善或治疗有用的候选物质,而直接或间接利用。它们中包含可以特异性地识别并结合与大肠癌的罹患相关的活体内特别是血液、尿等体液等检体中的序列号1~635的任一项所示的转录产物或其cDNA合成核酸的核苷酸、寡核苷酸和多核苷酸。这些核苷酸、寡核苷酸和多核苷酸基于上述性质可以作为用于检测活体内、组织、细胞内等表达的上述基因的探针有效地利用,此外作为用于扩增活体内表达的上述基因的引物有效地利用。
本说明书中“能够特异性结合”,是指本发明中使用的核酸探针或引物与特定的靶核酸结合,实质上不能与其它核酸结合。
本说明书中使用的“检测”这样的用语可以用检查、测定、检测或判定支援这样的用语替换。此外,本说明书中“评价”这样的用语以包含基于检查结果或测定结果来支援诊断或评价的含义来使用。
本说明书中使用的“受试体”,是指包含人、黑猩猩的灵长类、犬、猫等宠物动物、牛、马、绵羊、山羊等家畜动物、小鼠、大鼠等啮齿类等哺乳动物。此外,“健康体”是指这样的哺乳动物,其是未罹患要检测的癌症的动物。
本说明书中使用的“P”或“P值”,表示在统计学检验中,在原假设下实际观测到与由数据计算出的统计量相比极端的统计量的概率。因此“P”或“P值”越小,则视为在比较对象间有显著性差异。
本说明书中“敏感度”是指(真阳性的数)/(真阳性的数+假阴性的数)的值。如果敏感度高,则能够早期发现大肠癌,致使完全的癌症部的切除、复发率的降低。
本说明书中“特异度”,是指(真阴性的数)/(真阴性的数+假阳性的数)。如果特异度高,则防止实施由将健康体误判别成大肠癌患者引起的无益的追加检查,致使患者的负担的减轻、医疗费的减少。
本说明书中“准确度”是指(真阳性的数+真阴性的数)/(总病例数)的值。准确度表示对于全部检体的判别结果正确的比例,作为评价检测性能的第一指标。
本说明书中作为判定、检测或诊断的对象的“检体”,是指随着大肠癌的发生、大肠癌的进行和对大肠癌的治疗效果的发挥,本发明的基因表达变化的组织和生物体材料。具体而言,是指大肠组织和其周边的血管、淋巴节和脏器,此外还指怀疑转移的脏器、皮肤、和血液、尿、唾液、汗、组织浸出液等体液,由血液调制的血清、血浆、以及粪便、毛发等。进一步是指由它们提取的生物体试样,具体而言,指RNA、miRNA等基因。
本说明书中使用的“hsa-miR-6726-5p基因”或“hsa-miR-6726-5p”这样的用语包含序列号1所记载的hsa-miR-6726-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027353)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6726-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6726-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6726”(miRBase登录号MI0022571,序列号195)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4257基因”或“hsa-miR-4257”这样的用语包含序列号2所记载的hsa-miR-4257基因(miRBase登录号MIMAT0016878)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4257基因可以通过Goff LA等,2009年,PLoS One,4卷,e7192所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4257”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4257”(miRBase登录号MI0015856,序列号196)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6787-5p基因”或“hsa-miR-6787-5p”这样的用语包含序列号3所记载的hsa-miR-6787-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027474)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6787-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6787-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6787”(miRBase登录号MI0022632,序列号197)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6780b-5p基因”或“hsa-miR-6780b-5p”这样的用语包含序列号4所记载的hsa-miR-6780b-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027572)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6780b-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6780b-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6780b”(miRBase登录号MI0022681,序列号198)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3131基因”或“hsa-miR-3131”这样的用语包含序列号5所记载的hsa-miR-3131基因(miRBase登录号MIMAT0014996)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3131基因可以通过Stark MS等,2010年,PLoS One,5卷,e9685所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3131”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3131”(miRBase登录号MI0014151,序列号199)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7108-5p基因”或“hsa-miR-7108-5p”这样的用语包含序列号6所记载的hsa-miR-7108-5p基因(miRBase登录号MIMAT0028113)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7108-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7108-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7108”(miRBase登录号MI0022959,序列号200)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1343-3p基因”或“hsa-miR-1343-3p”这样的用语包含序列号7所记载的hsa-miR-1343-3p基因(miRBase登录号MIMAT0019776)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1343-3p基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1343-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1343”(miRBase登录号MI0017320,序列号201)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1247-3p基因”或“hsa-miR-1247-3p”这样的用语包含序列号8所记载的hsa-miR-1247-3p基因(miRBase登录号MIMAT0022721)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1247-3p基因可以通过Morin RD等,2008年,Genome Res,18卷,p610-621所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1247-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1247”(miRBase登录号MI0006382,序列号202)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4651基因”或“hsa-miR-4651”这样的用语包含序列号9所记载的hsa-miR-4651基因(miRBase登录号MIMAT0019715)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4651基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4651”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4651”(miRBase登录号MI0017279,序列号203)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6757-5p基因”或“hsa-miR-6757-5p”这样的用语包含序列号10所记载的hsa-miR-6757-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027414)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6757-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6757-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6757”(miRBase登录号MI0022602,序列号204)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3679-5p基因”或“hsa-miR-3679-5p”这样的用语包含序列号11所记载的hsa-miR-3679-5p基因(miRBase登录号MIMAT0018104)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3679-5p基因可以通过Creighton CJ等,2010年,PLoS One,5卷,e9637所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3679-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3679”(miRBase登录号MI0016080,序列号205)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7641基因”或“hsa-miR-7641”这样的用语包含序列号12所记载的hsa-miR-7641基因(miRBase登录号MIMAT0029782)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7641基因可以通过Yoo JK等,2013年,Arch Pharm Res,36卷,p353-358所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7641”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7641-1”,“hsa-mir-7641-2”(miRBase登录号MI0024975,MI0024976,序列号206,207)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6746-5p基因”或“hsa-miR-6746-5p”这样的用语包含序列号13所记载的hsa-miR-6746-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027392)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6746-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6746-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6746”(miRBase登录号MI0022591,序列号208)。
本说明书中使用的“hsa-miR-8072基因”或“hsa-miR-8072”这样的用语包含序列号14所记载的hsa-miR-8072基因(miRBase登录号MIMAT0030999)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-8072基因可以通过Wang HJ等,2013年,Shock,39卷,p480-487所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-8072”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-8072”(miRBase登录号MI0025908,序列号209)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6741-5p基因”或“hsa-miR-6741-5p”这样的用语包含序列号15所记载的hsa-miR-6741-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027383)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6741-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6741-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6741”(miRBase登录号MI0022586,序列号210)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1908-5p基因”或“hsa-miR-1908-5p”这样的用语包含序列号16所记载的hsa-miR-1908-5p基因(miRBase登录号MIMAT0007881)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1908-5p基因可以通过Bar M等,2008年,Stem Cells,26卷,p2496-2505所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1908-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1908”(miRBase登录号MI0008329,序列号211)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6857-5p基因”或“hsa-miR-6857-5p”这样的用语包含序列号17所记载的hsa-miR-6857-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027614)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6857-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6857-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6857”(miRBase登录号MI0022703,序列号212)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4746-3p基因”或“hsa-miR-4746-3p”这样的用语包含序列号18所记载的hsa-miR-4746-3p基因(miRBase登录号MIMAT0019881)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4746-3p基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4746-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4746”(miRBase登录号MI0017385,序列号213)。
本说明书中使用的“hsa-miR-744-5p基因”或“hsa-miR-744-5p”这样的用语包含序列号19所记载的hsa-miR-744-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004945)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-744-5p基因可以通过Berezikov E等,2006年,Genome Res,16卷,p1289-1298所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-744-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-744”(miRBase登录号MI0005559,序列号214)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4792基因”或“hsa-miR-4792”这样的用语包含序列号20所记载的hsa-miR-4792基因(miRBase登录号MIMAT0019964)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4792基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4792”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4792”(miRBase登录号MI0017439,序列号215)。
本说明书中使用的“hsa-miR-564基因”或“hsa-miR-564”这样的用语包含序列号21所记载的hsa-miR-564基因(miRBase登录号MIMAT0003228)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-564基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc Natl Acad Sci U S A,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-564”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-564”(miRBase登录号MI0003570,序列号216)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6791-5p基因”或“hsa-miR-6791-5p”这样的用语包含序列号22所记载的hsa-miR-6791-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027482)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6791-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6791-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6791”(miRBase登录号MI0022636,序列号217)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6825-5p基因”或“hsa-miR-6825-5p”这样的用语包含序列号23所记载的hsa-miR-6825-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027550)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6825-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6825-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6825”(miRBase登录号MI0022670,序列号218)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6826-5p基因”或“hsa-miR-6826-5p”这样的用语包含序列号24所记载的hsa-miR-6826-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027552)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6826-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6826-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6826”(miRBase登录号MI0022671,序列号219)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4665-3p基因”或“hsa-miR-4665-3p”这样的用语包含序列号25所记载的hsa-miR-4665-3p基因(miRBase登录号MIMAT0019740)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4665-3p基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4665-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4665”(miRBase登录号MI0017295,序列号220)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4467基因”或“hsa-miR-4467”这样的用语包含序列号26所记载的hsa-miR-4467基因(miRBase登录号MIMAT0018994)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4467基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4467”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4467”(miRBase登录号MI0016818,序列号221)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3188基因”或“hsa-miR-3188”这样的用语包含序列号27所记载的hsa-miR-3188基因(miRBase登录号MIMAT0015070)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3188基因可以通过Stark MS等,2010年,PLoS One,5卷,e9685所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3188”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3188”(miRBase登录号MI0014232,序列号222)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6125基因”或“hsa-miR-6125”这样的用语包含序列号28所记载的hsa-miR-6125基因(miRBase登录号MIMAT0024598)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6125基因可以通过Smith JL等,2012年,J Virol,86卷,p5278-5287所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6125”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6125”(miRBase登录号MI0021259,序列号223)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6756-5p基因”或“hsa-miR-6756-5p”这样的用语包含序列号29所记载的hsa-miR-6756-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027412)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6756-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6756-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6756”(miRBase登录号MI0022601,序列号224)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1228-3p基因”或“hsa-miR-1228-3p”这样的用语包含序列号30所记载的hsa-miR-1228-3p基因(miRBase登录号MIMAT0005583)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1228-3p基因可以通过Berezikov E等,2007年,Mol Cell,28卷,p328-336所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1228-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1228”(miRBase登录号MI0006318,序列号225)。
本说明书中使用的“hsa-miR-8063基因”或“hsa-miR-8063”这样的用语包含序列号31所记载的hsa-miR-8063基因(miRBase登录号MIMAT0030990)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-8063基因可以通过Wang HJ等,2013年,Shock,39卷,p480-487所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-8063”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-8063”(miRBase登录号MI0025899,序列号226)。
本说明书中使用的“hsa-miR-8069基因”或“hsa-miR-8069”这样的用语包含序列号32所记载的hsa-miR-8069基因(miRBase登录号MIMAT0030996)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-8069基因可以通过Wang HJ等,2013年,Shock,39卷,p480-487所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-8069”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-8069”(miRBase登录号MI0025905,序列号227)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6875-5p基因”或“hsa-miR-6875-5p”这样的用语包含序列号33所记载的hsa-miR-6875-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027650)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6875-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6875-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6875”(miRBase登录号MI0022722,序列号228)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3185基因”或“hsa-miR-3185”这样的用语包含序列号34所记载的hsa-miR-3185基因(miRBase登录号MIMAT0015065)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3185基因可以通过Stark MS等,2010年,PLoS One,5卷,e9685所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3185”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3185”(miRBase登录号MI0014227,序列号229)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4433b-3p基因”或“hsa-miR-4433b-3p”这样的用语包含序列号35所记载的hsa-miR-4433b-3p基因(miRBase登录号MIMAT0030414)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4433b-3p基因可以通过Ple H等,2012年,PLoS One,7卷,e50746所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4433b-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4433b”(miRBase登录号MI0025511,序列号230)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6887-5p基因”或“hsa-miR-6887-5p”这样的用语包含序列号36所记载的hsa-miR-6887-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027674)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6887-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6887-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6887”(miRBase登录号MI0022734,序列号231)。
本说明书中使用的“hsa-miR-128-1-5p基因”或“hsa-miR-128-1-5p”这样的用语包含序列号37所记载的hsa-miR-128-1-5p基因(miRBase登录号MIMAT0026477)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-128-1-5p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2002年,Curr Biol,12卷,p735-739所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-128-1-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-128-1”(miRBase登录号MI0000447,序列号232)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6724-5p基因”或“hsa-miR-6724-5p”这样的用语包含序列号38所记载的hsa-miR-6724-5p基因(miRBase登录号MIMAT0025856)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6724-5p基因可以通过Li Y等,2012年,Gene,497卷,p330-335所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6724-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6724”(miRBase登录号MI0022559,序列号233)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1914-3p基因”或“hsa-miR-1914-3p”这样的用语包含序列号39所记载的hsa-miR-1914-3p基因(miRBase登录号MIMAT0007890)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1914-3p基因可以通过Bar M等,2008年,Stem Cells,26卷,p2496-2505所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1914-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1914”(miRBase登录号MI0008335,序列号234)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1225-5p基因”或“hsa-miR-1225-5p”这样的用语包含序列号40所记载的hsa-miR-1225-5p基因(miRBase登录号MIMAT0005572)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1225-5p基因可以通过Berezikov E等,2007年,Mol Cell,28卷,p328-336所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1225-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1225”(miRBase登录号MI0006311,序列号235)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4419b基因”或“hsa-miR-4419b”这样的用语包含序列号41所记载的hsa-miR-4419b基因(miRBase登录号MIMAT0019034)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4419b基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4419b”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4419b”(miRBase登录号MI0016861,序列号236)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7110-5p基因”或“hsa-miR-7110-5p”这样的用语包含序列号42所记载的hsa-miR-7110-5p基因(miRBase登录号MIMAT0028117)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7110-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7110-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7110”(miRBase登录号MI0022961,序列号237)。
本说明书中使用的“hsa-miR-187-5p基因”或“hsa-miR-187-5p”这样的用语包含序列号43所记载的hsa-miR-187-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004561)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-187-5p基因可以通过Lim LP等,2003年,Science,299卷,p1540所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-187-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-187”(miRBase登录号MI0000274,序列号238)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3184-5p基因”或“hsa-miR-3184-5p”这样的用语包含序列号44所记载的hsa-miR-3184-5p基因(miRBase登录号MIMAT0015064)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3184-5p基因可以通过Stark MS等,2010年,PLoS One,5卷,e9685所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3184-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3184”(miRBase登录号MI0014226,序列号239)。
本说明书中使用的“hsa-miR-204-3p基因”或“hsa-miR-204-3p”这样的用语包含序列号45所记载的hsa-miR-204-3p基因(miRBase登录号MIMAT0022693)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-204-3p基因可以通过Lim LP等,2003年,Science,299卷,p1540所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-204-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-204”(miRBase登录号MI0000284,序列号240)。
本说明书中使用的“hsa-miR-5572基因”或“hsa-miR-5572”这样的用语包含序列号46所记载的hsa-miR-5572基因(miRBase登录号MIMAT0022260)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-5572基因可以通过Tandon M等,2012年,Oral Dis,18卷,p127-131所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-5572”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-5572”(miRBase登录号MI0019117,序列号241)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6729-5p基因”或“hsa-miR-6729-5p”这样的用语包含序列号47所记载的hsa-miR-6729-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027359)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6729-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6729-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6729”(miRBase登录号MI0022574,序列号242)。
本说明书中使用的“hsa-miR-615-5p基因”或“hsa-miR-615-5p”这样的用语包含序列号48所记载的hsa-miR-615-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004804)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-615-5p基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc Natl AcadSci U S A,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-615-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-615”(miRBase登录号MI0003628,序列号243)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6749-5p基因”或“hsa-miR-6749-5p”这样的用语包含序列号49所记载的hsa-miR-6749-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027398)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6749-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6749-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6749”(miRBase登录号MI0022594,序列号244)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6515-3p基因”或“hsa-miR-6515-3p”这样的用语包含序列号50所记载的hsa-miR-6515-3p基因(miRBase登录号MIMAT0025487)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6515-3p基因可以通过Joyce CE等,2011年,Hum MolGenet,20卷,p4025-4040所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6515-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6515”(miRBase登录号MI0022227,序列号245)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3937基因”或“hsa-miR-3937”这样的用语包含序列号51所记载的hsa-miR-3937基因(miRBase登录号MIMAT0018352)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3937基因可以通过Liao JY等,2010年,PLoS One,5卷,e10563所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3937”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3937”(miRBase登录号MI0016593,序列号246)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6840-3p基因”或“hsa-miR-6840-3p”这样的用语包含序列号52所记载的hsa-miR-6840-3p基因(miRBase登录号MIMAT0027583)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6840-3p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6840-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6840”(miRBase登录号MI0022686,序列号247)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6893-5p基因”或“hsa-miR-6893-5p”这样的用语包含序列号53所记载的hsa-miR-6893-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027686)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6893-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6893-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6893”(miRBase登录号MI0022740,序列号248)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4728-5p基因”或“hsa-miR-4728-5p”这样的用语包含序列号54所记载的hsa-miR-4728-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019849)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4728-5p基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4728-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4728”(miRBase登录号MI0017365,序列号249)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6717-5p基因”或“hsa-miR-6717-5p”这样的用语包含序列号55所记载的hsa-miR-6717-5p基因(miRBase登录号MIMAT0025846)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6717-5p基因可以通过Li Y等,2012年,Gene,497卷,p330-335所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6717-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6717”(miRBase登录号MI0022551,序列号250)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7113-3p基因”或“hsa-miR-7113-3p”这样的用语包含序列号56所记载的hsa-miR-7113-3p基因(miRBase登录号MIMAT0028124)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7113-3p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7113-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7113”(miRBase登录号MI0022964,序列号251)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4665-5p基因”或“hsa-miR-4665-5p”这样的用语包含序列号57所记载的hsa-miR-4665-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019739)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4665-5p基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4665-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4665”(miRBase登录号MI0017295,序列号220)。
本说明书中使用的“hsa-miR-642b-3p基因”或“hsa-miR-642b-3p”这样的用语包含序列号58所记载的hsa-miR-642b-3p基因(miRBase登录号MIMAT0018444)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-642b-3p基因可以通过Witten D等,2010年,BMC Biol,8卷,p58所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-642b-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-642b”(miRBase登录号MI0016685,序列号252)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7109-5p基因”或“hsa-miR-7109-5p”这样的用语包含序列号59所记载的hsa-miR-7109-5p基因(miRBase登录号MIMAT0028115)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7109-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7109-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7109”(miRBase登录号MI0022960,序列号253)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6842-5p基因”或“hsa-miR-6842-5p”这样的用语包含序列号60所记载的hsa-miR-6842-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027586)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6842-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6842-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6842”(miRBase登录号MI0022688,序列号254)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4442基因”或“hsa-miR-4442”这样的用语包含序列号61所记载的hsa-miR-4442基因(miRBase登录号MIMAT0018960)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4442基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4442”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4442”(miRBase登录号MI0016785,序列号255)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4433-3p基因”或“hsa-miR-4433-3p”这样的用语包含序列号62所记载的hsa-miR-4433-3p基因(miRBase登录号MIMAT0018949)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4433-3p基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4433-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4433”(miRBase登录号MI0016773,序列号256)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4707-5p基因”或“hsa-miR-4707-5p”这样的用语包含序列号63所记载的hsa-miR-4707-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019807)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4707-5p基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4707-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4707”(miRBase登录号MI0017340,序列号257)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6126基因”或“hsa-miR-6126”这样的用语包含序列号64所记载的hsa-miR-6126基因(miRBase登录号MIMAT0024599)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6126基因可以通过Smith JL等,2012年,J Virol,86卷,p5278-5287所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6126”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6126”(miRBase登录号MI0021260,序列号258)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4449基因”或“hsa-miR-4449”这样的用语包含序列号65所记载的hsa-miR-4449基因(miRBase登录号MIMAT0018968)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4449基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4449”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4449”(miRBase登录号MI0016792,序列号259)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4706基因”或“hsa-miR-4706”这样的用语包含序列号66所记载的hsa-miR-4706基因(miRBase登录号MIMAT0019806)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4706基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4706”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4706”(miRBase登录号MI0017339,序列号260)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1913基因”或“hsa-miR-1913”这样的用语包含序列号67所记载的hsa-miR-1913基因(miRBase登录号MIMAT0007888)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1913基因可以通过Bar M等,2008年,Stem Cells,26卷,p2496-2505所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1913”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1913”(miRBase登录号MI0008334,序列号261)。
本说明书中使用的“hsa-miR-602基因”或“hsa-miR-602”这样的用语包含序列号68所记载的hsa-miR-602基因(miRBase登录号MIMAT0003270)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-602基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc Natl Acad Sci U S A,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-602”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-602”(miRBase登录号MI0003615,序列号262)。
本说明书中使用的“hsa-miR-939-5p基因”或“hsa-miR-939-5p”这样的用语包含序列号69所记载的hsa-miR-939-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004982)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-939-5p基因可以通过Lui WO等,2007年,Cancer Res,67卷,p6031-6043所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-939-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-939”(miRBase登录号MI0005761,序列号263)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4695-5p基因”或“hsa-miR-4695-5p”这样的用语包含序列号70所记载的hsa-miR-4695-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019788)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4695-5p基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4695-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4695”(miRBase登录号MI0017328,序列号264)。
本说明书中使用的“hsa-miR-711基因”或“hsa-miR-711”这样的用语包含序列号71所记载的hsa-miR-711基因(miRBase登录号MIMAT0012734)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-711基因可以通过Artzi S等,2008年,BMC Bioinformatics,9卷,p39所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-711”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-711”(miRBase登录号MI0012488,序列号265)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6816-5p基因”或“hsa-miR-6816-5p”这样的用语包含序列号72所记载的hsa-miR-6816-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027532)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6816-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6816-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6816”(miRBase登录号MI0022661,序列号266)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4632-5p基因”或“hsa-miR-4632-5p”这样的用语包含序列号73所记载的hsa-miR-4632-5p基因(miRBase登录号MIMAT0022977)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4632-5p基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4632-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4632”(miRBase登录号MI0017259,序列号267)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6721-5p基因”或“hsa-miR-6721-5p”这样的用语包含序列号74所记载的hsa-miR-6721-5p基因(miRBase登录号MIMAT0025852)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6721-5p基因可以通过Li Y等,2012年,Gene,497卷,p330-335所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6721-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6721”(miRBase登录号MI0022556,序列号268)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7847-3p基因”或“hsa-miR-7847-3p”这样的用语包含序列号75所记载的hsa-miR-7847-3p基因(miRBase登录号MIMAT0030422)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7847-3p基因可以通过Ple H等,2012年,PLoS One,7卷,e50746所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7847-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7847”(miRBase登录号MI0025517,序列号269)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6132基因”或“hsa-miR-6132”这样的用语包含序列号76所记载的hsa-miR-6132基因(miRBase登录号MIMAT0024616)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6132基因可以通过Dannemann M等,2012年,Genome Biol Evol,4卷,p552-564所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6132”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6132”(miRBase登录号MI0021277,序列号270)。
本说明书中使用的“hsa-miR-887-3p基因”或“hsa-miR-887-3p”这样的用语包含序列号77所记载的hsa-miR-887-3p基因(miRBase登录号MIMAT0004951)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-887-3p基因可以通过Berezikov E等,2006年,Genome Res,16卷,p1289-1298所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-887-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-887”(miRBase登录号MI0005562,序列号271)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3679-3p基因”或“hsa-miR-3679-3p”这样的用语包含序列号78所记载的hsa-miR-3679-3p基因(miRBase登录号MIMAT0018105)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3679-3p基因可以通过Creighton CJ等,2010年,PLoS One,5卷,e9637所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3679-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3679”(miRBase登录号MI0016080,序列号205)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6784-5p基因”或“hsa-miR-6784-5p”这样的用语包含序列号79所记载的hsa-miR-6784-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027468)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6784-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6784-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6784”(miRBase登录号MI0022629,序列号272)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1249基因”或“hsa-miR-1249”这样的用语包含序列号80所记载的hsa-miR-1249基因(miRBase登录号MIMAT0005901)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1249基因可以通过Morin RD等,2008年,Genome Res,18卷,p610-621所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1249”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1249”(miRBase登录号MI0006384,序列号273)。
本说明书中使用的“hsa-miR-937-5p基因”或“hsa-miR-937-5p”这样的用语包含序列号81所记载的hsa-miR-937-5p基因(miRBase登录号MIMAT0022938)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-937-5p基因可以通过Lui WO等,2007年,Cancer Res,67卷,p6031-6043所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-937-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-937”(miRBase登录号MI0005759,序列号274)。
本说明书中使用的“hsa-miR-5195-3p基因”或“hsa-miR-5195-3p”这样的用语包含序列号82所记载的hsa-miR-5195-3p基因(miRBase登录号MIMAT0021127)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-5195-3p基因可以通过Schotte D等,2011年,Leukemia,25卷,p1389-1399所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-5195-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-5195”(miRBase登录号MI0018174,序列号275)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6732-5p基因”或“hsa-miR-6732-5p”这样的用语包含序列号83所记载的hsa-miR-6732-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027365)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6732-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6732-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6732”(miRBase登录号MI0022577,序列号276)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4417基因”或“hsa-miR-4417”这样的用语包含序列号84所记载的hsa-miR-4417基因(miRBase登录号MIMAT0018929)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4417基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4417”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4417”(miRBase登录号MI0016753,序列号277)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4281基因”或“hsa-miR-4281”这样的用语包含序列号85所记载的hsa-miR-4281基因(miRBase登录号MIMAT0016907)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4281基因可以通过Goff LA等,2009年,PLoS One,4卷,e7192所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4281”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4281”(miRBase登录号MI0015885,序列号278)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4734基因”或“hsa-miR-4734”这样的用语包含序列号86所记载的hsa-miR-4734基因(miRBase登录号MIMAT0019859)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4734基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4734”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4734”(miRBase登录号MI0017371,序列号279)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6766-3p基因”或“hsa-miR-6766-3p”这样的用语包含序列号87所记载的hsa-miR-6766-3p基因(miRBase登录号MIMAT0027433)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6766-3p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6766-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6766”(miRBase登录号MI0022611,序列号280)。
本说明书中使用的“hsa-miR-663a基因”或“hsa-miR-663a”这样的用语包含序列号88所记载的hsa-miR-663a基因(miRBase登录号MIMAT0003326)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-663a基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc Natl Acad Sci U SA,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-663a”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-663a”(miRBase登录号MI0003672,序列号281)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4513基因”或“hsa-miR-4513”这样的用语包含序列号89所记载的hsa-miR-4513基因(miRBase登录号MIMAT0019050)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4513基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4513”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4513”(miRBase登录号MI0016879,序列号282)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6781-5p基因”或“hsa-miR-6781-5p”这样的用语包含序列号90所记载的hsa-miR-6781-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027462)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6781-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6781-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6781”(miRBase登录号MI0022626,序列号283)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1227-5p基因”或“hsa-miR-1227-5p”这样的用语包含序列号91所记载的hsa-miR-1227-5p基因(miRBase登录号MIMAT0022941)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1227-5p基因可以通过Berezikov E等,2007年,Mol Cell,28卷,p328-336所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1227-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1227”(miRBase登录号MI0006316,序列号284)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6845-5p基因”或“hsa-miR-6845-5p”这样的用语包含序列号92所记载的hsa-miR-6845-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027590)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6845-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6845-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6845”(miRBase登录号MI0022691,序列号285)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6798-5p基因”或“hsa-miR-6798-5p”这样的用语包含序列号93所记载的hsa-miR-6798-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027496)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6798-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,Genome Res,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6798-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6798”(miRBase登录号MI0022643,序列号286)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3620-5p基因”或“hsa-miR-3620-5p”这样的用语包含序列号94所记载的hsa-miR-3620-5p基因(miRBase登录号MIMAT0022967)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3620-5p基因可以通过Witten D等,2010年,BMC Biol,8卷,p58所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3620-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3620”(miRBase登录号MI0016011,序列号287)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1915-5p基因”或“hsa-miR-1915-5p”这样的用语包含序列号95所记载的hsa-miR-1915-5p基因(miRBase登录号MIMAT0007891)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1915-5p基因可以通过Bar M等,2008年,Stem Cells,26卷,p2496-2505所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1915-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1915”(miRBase登录号MI0008336,序列号288)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4294基因”或“hsa-miR-4294”这样的用语包含序列号96所记载的hsa-miR-4294基因(miRBase登录号MIMAT0016849)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4294基因可以通过Goff LA等,2009年,PLoS One,4卷,e7192所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4294”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4294”(miRBase登录号MI0015827,序列号289)。
本说明书中使用的“hsa-miR-642a-3p基因”或“hsa-miR-642a-3p”这样的用语包含序列号97所记载的hsa-miR-642a-3p基因(miRBase登录号MIMAT0020924)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-642a-3p基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc NatlAcad Sci U S A,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-642a-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-642a”(miRBase登录号MI0003657,序列号290)。
本说明书中使用的“hsa-miR-371a-5p基因”或“hsa-miR-371a-5p”这样的用语包含序列号98所记载的hsa-miR-371a-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004687)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-371a-5p基因可以通过Suh MR等,2004年,Dev Biol,270卷,p488-498所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-371a-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-371a”(miRBase登录号MI0000779,序列号291)。
本说明书中使用的“hsa-miR-940基因”或“hsa-miR-940”这样的用语包含序列号99所记载的hsa-miR-940基因(miRBase登录号MIMAT0004983)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-940基因可以通过Lui WO等,2007年,Cancer Res,67卷,p6031-6043所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-940”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-940”(miRBase登录号MI0005762,序列号292)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4450基因”或“hsa-miR-4450”这样的用语包含序列号100所记载的hsa-miR-4450基因(miRBase登录号MIMAT0018971)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4450基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4450”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4450”(miRBase登录号MI0016795,序列号293)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4723-5p基因”或“hsa-miR-4723-5p”这样的用语包含序列号101所记载的hsa-miR-4723-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019838)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4723-5p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4723-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4723”(miRBase登录号MI0017359,序列号294)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1469基因”或“hsa-miR-1469”这样的用语包含序列号102所记载的hsa-miR-1469基因(miRBase登录号MIMAT0007347)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1469基因可以通过Kawaji H等,2008年,BMC Genomics,9卷,p157所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1469”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1469”(miRBase登录号MI0007074,序列号295)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6861-5p基因”或“hsa-miR-6861-5p”这样的用语包含序列号103所记载的hsa-miR-6861-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027623)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6861-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6861-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6861”(miRBase登录号MI0022708,序列号296)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7975基因”或“hsa-miR-7975”这样的用语包含序列号104所记载的hsa-miR-7975基因(miRBase登录号MIMAT0031178)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7975基因可以通过Velthut-Meikas A等,2013年,Mol Endocrinol,在线版所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7975”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7975”(miRBase登录号MI0025751,序列号297)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6879-5p基因”或“hsa-miR-6879-5p”这样的用语包含序列号105所记载的hsa-miR-6879-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027658)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6879-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6879-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6879”(miRBase登录号MI0022726,序列号298)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6802-5p基因”或“hsa-miR-6802-5p”这样的用语包含序列号106所记载的hsa-miR-6802-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027504)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6802-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6802-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6802”(miRBase登录号MI0022647,序列号299)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1268b基因”或“hsa-miR-1268b”这样的用语包含序列号107所记载的hsa-miR-1268b基因(miRBase登录号MIMAT0018925)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1268b基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1268b”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1268b”(miRBase登录号MI0016748,序列号300)。
本说明书中使用的“hsa-miR-663b基因”或“hsa-miR-663b”这样的用语包含序列号108所记载的hsa-miR-663b基因(miRBase登录号MIMAT0005867)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-663b基因可以通过Takada S等,2008年,Leukemia,22卷,p1274-1278所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-663b”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-663b”(miRBase登录号MI0006336,序列号301)。
本说明书中使用的“hsa-miR-125a-3p基因”或“hsa-miR-125a-3p”这样的用语包含序列号109所记载的hsa-miR-125a-3p基因(miRBase登录号MIMAT0004602)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-125a-3p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2002年,Curr Biol,12卷,p735-739所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-125a-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-125a”(miRBase登录号MI0000469,序列号302)。
本说明书中使用的“hsa-miR-2861基因”或“hsa-miR-2861”这样的用语包含序列号110所记载的hsa-miR-2861基因(miRBase登录号MIMAT0013802)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-2861基因可以通过Li H等,2009年,J Clin Invest,119卷,p3666-3677所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-2861”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-2861”(miRBase登录号MI0013006,序列号303)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6088基因”或“hsa-miR-6088”这样的用语包含序列号111所记载的hsa-miR-6088基因(miRBase登录号MIMAT0023713)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6088基因可以通过Yoo JK等,2012年,Stem Cells Dev,21卷,p2049-2057所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6088”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6088”(miRBase登录号MI0020365,序列号304)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4758-5p基因”或“hsa-miR-4758-5p”这样的用语包含序列号112所记载的hsa-miR-4758-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019903)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4758-5p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4758-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4758”(miRBase登录号MI0017399,序列号305)。
本说明书中使用的“hsa-miR-296-3p基因”或“hsa-miR-296-3p”这样的用语包含序列号113所记载的hsa-miR-296-3p基因(miRBase登录号MIMAT0004679)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-296-3p基因可以通过Houbaviy HB等,2003年,Dev Cell,5卷,p351-358所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-296-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-296”(miRBase登录号MI0000747,序列号306)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6738-5p基因”或“hsa-miR-6738-5p”这样的用语包含序列号114所记载的hsa-miR-6738-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027377)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6738-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6738-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6738”(miRBase登录号MI0022583,序列号307)。
本说明书中使用的“hsa-miR-671-5p基因”或“hsa-miR-671-5p”这样的用语包含序列号115所记载的hsa-miR-671-5p基因(miRBase登录号MIMAT0003880)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-671-5p基因可以通过Berezikov E等,2006年,Genome Res,16卷,p1289-1298所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-671-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-671”(miRBase登录号MI0003760,序列号308)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4454基因”或“hsa-miR-4454”这样的用语包含序列号116所记载的hsa-miR-4454基因(miRBase登录号MIMAT0018976)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4454基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4454”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4454”(miRBase登录号MI0016800,序列号309)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4516基因”或“hsa-miR-4516”这样的用语包含序列号117所记载的hsa-miR-4516基因(miRBase登录号MIMAT0019053)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4516基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4516”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4516”(miRBase登录号MI0016882,序列号310)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7845-5p基因”或“hsa-miR-7845-5p”这样的用语包含序列号118所记载的hsa-miR-7845-5p基因(miRBase登录号MIMAT0030420)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7845-5p基因可以通过Ple H等,2012年,PLoS One,7卷,e50746所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7845-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7845”(miRBase登录号MI0025515,序列号311)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4741基因”或“hsa-miR-4741”这样的用语包含序列号119所记载的hsa-miR-4741基因(miRBase登录号MIMAT0019871)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4741基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4741”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4741”(miRBase登录号MI0017379,序列号312)。
本说明书中使用的“hsa-miR-92b-5p基因”或“hsa-miR-92b-5p”这样的用语包含序列号120所记载的hsa-miR-92b-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004792)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-92b-5p基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc Natl AcadSci U S A,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-92b-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-92b”(miRBase登录号MI0003560,序列号313)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6795-5p基因”或“hsa-miR-6795-5p”这样的用语包含序列号121所记载的hsa-miR-6795-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027490)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6795-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6795-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6795”(miRBase登录号MI0022640,序列号314)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6805-3p基因”或“hsa-miR-6805-3p”这样的用语包含序列号122所记载的hsa-miR-6805-3p基因(miRBase登录号MIMAT0027511)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6805-3p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6805-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6805”(miRBase登录号MI0022650,序列号315)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4725-3p基因”或“hsa-miR-4725-3p”这样的用语包含序列号123所记载的hsa-miR-4725-3p基因(miRBase登录号MIMAT0019844)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4725-3p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4725-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4725”(miRBase登录号MI0017362,序列号316)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6782-5p基因”或“hsa-miR-6782-5p”这样的用语包含序列号124所记载的hsa-miR-6782-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027464)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6782-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6782-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6782”(miRBase登录号MI0022627,序列号317)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4688基因”或“hsa-miR-4688”这样的用语包含序列号125所记载的hsa-miR-4688基因(miRBase登录号MIMAT0019777)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4688基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4688”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4688”(miRBase登录号MI0017321,序列号318)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6850-5p基因”或“hsa-miR-6850-5p”这样的用语包含序列号126所记载的hsa-miR-6850-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027600)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6850-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6850-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6850”(miRBase登录号MI0022696,序列号319)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6777-5p基因”或“hsa-miR-6777-5p”这样的用语包含序列号127所记载的hsa-miR-6777-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027454)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6777-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6777-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6777”(miRBase登录号MI0022622,序列号320)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6785-5p基因”或“hsa-miR-6785-5p”这样的用语包含序列号128所记载的hsa-miR-6785-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027470)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6785-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6785-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6785”(miRBase登录号MI0022630,序列号321)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7106-5p基因”或“hsa-miR-7106-5p”这样的用语包含序列号129所记载的hsa-miR-7106-5p基因(miRBase登录号MIMAT0028109)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7106-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7106-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7106”(miRBase登录号MI0022957,序列号322)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3663-3p基因”或“hsa-miR-3663-3p”这样的用语包含序列号130所记载的hsa-miR-3663-3p基因(miRBase登录号MIMAT0018085)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3663-3p基因可以通过Liao JY等,2010年,PLoS One,5卷,e10563所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3663-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3663”(miRBase登录号MI0016064,序列号323)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6131基因”或“hsa-miR-6131”这样的用语包含序列号131所记载的hsa-miR-6131基因(miRBase登录号MIMAT0024615)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6131基因可以通过Dannemann M等,2012年,Genome Biol Evol,4卷,p552-564所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6131”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6131”(miRBase登录号MI0021276,序列号324)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1915-3p基因”或“hsa-miR-1915-3p”这样的用语包含序列号132所记载的hsa-miR-1915-3p基因(miRBase登录号MIMAT0007892)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1915-3p基因可以通过Bar M等,2008年,Stem Cells,26卷,p2496-2505所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1915-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1915”(miRBase登录号MI0008336,序列号288)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4532基因”或“hsa-miR-4532”这样的用语包含序列号133所记载的hsa-miR-4532基因(miRBase登录号MIMAT0019071)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4532基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4532”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4532”(miRBase登录号MI0016899,序列号325)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6820-5p基因”或“hsa-miR-6820-5p”这样的用语包含序列号134所记载的hsa-miR-6820-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027540)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6820-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6820-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6820”(miRBase登录号MI0022665,序列号326)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4689基因”或“hsa-miR-4689”这样的用语包含序列号135所记载的hsa-miR-4689基因(miRBase登录号MIMAT0019778)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4689基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4689”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4689”(miRBase登录号MI0017322,序列号327)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4638-5p基因”或“hsa-miR-4638-5p”这样的用语包含序列号136所记载的hsa-miR-4638-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019695)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4638-5p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4638-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4638”(miRBase登录号MI0017265,序列号328)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3656基因”或“hsa-miR-3656”这样的用语包含序列号137所记载的hsa-miR-3656基因(miRBase登录号MIMAT0018076)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3656基因可以通过Meiri E等,2010年,Nucleic Acids Res,38卷,p6234-6246所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3656”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3656”(miRBase登录号MI0016056,序列号329)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3621基因”或“hsa-miR-3621”这样的用语包含序列号138所记载的hsa-miR-3621基因(miRBase登录号MIMAT0018002)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3621基因可以通过Witten D等,2010年,BMC Biol,8卷,p58所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3621”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3621”(miRBase登录号MI0016012,序列号330)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6769b-5p基因”或“hsa-miR-6769b-5p”这样的用语包含序列号139所记载的hsa-miR-6769b-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027620)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6769b-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6769b-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6769b”(miRBase登录号MI0022706,序列号331)。
本说明书中使用的“hsa-miR-149-3p基因”或“hsa-miR-149-3p”这样的用语包含序列号140所记载的hsa-miR-149-3p基因(miRBase登录号MIMAT0004609)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-149-3p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2002年,CurrBiol,12卷,p735-739所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-149-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-149”(miRBase登录号MI0000478,序列号332)。
本说明书中使用的“hsa-miR-23b-3p基因”或“hsa-miR-23b-3p”这样的用语包含序列号141所记载的hsa-miR-23b-3p基因(miRBase登录号MIMAT0000418)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-23b-3p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2002年,CurrBiol,12卷,p735-739所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-23b-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-23b”(miRBase登录号MI0000439,序列号333)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3135b基因”或“hsa-miR-3135b”这样的用语包含序列号142所记载的hsa-miR-3135b基因(miRBase登录号MIMAT0018985)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3135b基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3135b”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3135b”(miRBase登录号MI0016809,序列号334)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6848-5p基因”或“hsa-miR-6848-5p”这样的用语包含序列号143所记载的hsa-miR-6848-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027596)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6848-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6848-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6848”(miRBase登录号MI0022694,序列号335)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6769a-5p基因”或“hsa-miR-6769a-5p”这样的用语包含序列号144所记载的hsa-miR-6769a-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027438)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6769a-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6769a-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6769a”(miRBase登录号MI0022614,序列号336)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4327基因”或“hsa-miR-4327”这样的用语包含序列号145所记载的hsa-miR-4327基因(miRBase登录号MIMAT0016889)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4327基因可以通过Goff LA等,2009年,PLoS One,4卷,e7192所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4327”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4327”(miRBase登录号MI0015867,序列号337)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6765-3p基因”或“hsa-miR-6765-3p”这样的用语包含序列号146所记载的hsa-miR-6765-3p基因(miRBase登录号MIMAT0027431)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6765-3p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6765-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6765”(miRBase登录号MI0022610,序列号338)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6716-5p基因”或“hsa-miR-6716-5p”这样的用语包含序列号147所记载的hsa-miR-6716-5p基因(miRBase登录号MIMAT0025844)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6716-5p基因可以通过Li Y等,2012年,Gene,497卷,p330-335所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6716-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6716”(miRBase登录号MI0022550,序列号339)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6877-5p基因”或“hsa-miR-6877-5p”这样的用语包含序列号148所记载的hsa-miR-6877-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027654)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6877-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6877-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6877”(miRBase登录号MI0022724,序列号340)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6727-5p基因”或“hsa-miR-6727-5p”这样的用语包含序列号149所记载的hsa-miR-6727-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027355)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6727-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6727-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6727”(miRBase登录号MI0022572,序列号341)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4534基因”或“hsa-miR-4534”这样的用语包含序列号150所记载的hsa-miR-4534基因(miRBase登录号MIMAT0019073)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4534基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4534”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4534”(miRBase登录号MI0016901,序列号342)。
本说明书中使用的“hsa-miR-614基因”或“hsa-miR-614”这样的用语包含序列号151所记载的hsa-miR-614基因(miRBase登录号MIMAT0003282)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-614基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc Natl Acad Sci U S A,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-614”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-614”(miRBase登录号MI0003627,序列号343)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1202基因”或“hsa-miR-1202”这样的用语包含序列号152所记载的hsa-miR-1202基因(miRBase登录号MIMAT0005865)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1202基因可以通过Marton S等,2008年,Leukemia,22卷,p330-338所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1202”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1202”(miRBase登录号MI0006334,序列号344)。
本说明书中使用的“hsa-miR-575基因”或“hsa-miR-575”这样的用语包含序列号153所记载的hsa-miR-575基因(miRBase登录号MIMAT0003240)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-575基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc Natl Acad Sci U S A,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-575”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-575”(miRBase登录号MI0003582,序列号345)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6870-5p基因”或“hsa-miR-6870-5p”这样的用语包含序列号154所记载的hsa-miR-6870-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027640)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6870-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6870-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6870”(miRBase登录号MI0022717,序列号346)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6722-3p基因”或“hsa-miR-6722-3p”这样的用语包含序列号155所记载的hsa-miR-6722-3p基因(miRBase登录号MIMAT0025854)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6722-3p基因可以通过Li Y等,2012年,Gene,497卷,p330-335所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6722-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6722”(miRBase登录号MI0022557,序列号347)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7977基因”或“hsa-miR-7977”这样的用语包含序列号156所记载的hsa-miR-7977基因(miRBase登录号MIMAT0031180)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7977基因可以通过Velthut-Meikas A等,2013年,Mol Endocrinol,在线版所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7977”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7977”(miRBase登录号MI0025753,序列号348)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4649-5p基因”或“hsa-miR-4649-5p”这样的用语包含序列号157所记载的hsa-miR-4649-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019711)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4649-5p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4649-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4649”(miRBase登录号MI0017276,序列号349)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4675基因”或“hsa-miR-4675”这样的用语包含序列号158所记载的hsa-miR-4675基因(miRBase登录号MIMAT0019757)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4675基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4675”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4675”(miRBase登录号MI0017306,序列号350)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6075基因”或“hsa-miR-6075”这样的用语包含序列号159所记载的hsa-miR-6075基因(miRBase登录号MIMAT0023700)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6075基因可以通过Voellenkle C等,2012年,RNA,18卷,p472-484所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6075”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6075”(miRBase登录号MI0020352,序列号351)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6779-5p基因”或“hsa-miR-6779-5p”这样的用语包含序列号160所记载的hsa-miR-6779-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027458)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6779-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6779-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6779”(miRBase登录号MI0022624,序列号352)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4271基因”或“hsa-miR-4271”这样的用语包含序列号161所记载的hsa-miR-4271基因(miRBase登录号MIMAT0016901)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4271基因可以通过Goff LA等,2009年,PLoS One,4卷,e7192所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4271”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4271”(miRBase登录号MI0015879,序列号353)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3196基因”或“hsa-miR-3196”这样的用语包含序列号162所记载的hsa-miR-3196基因(miRBase登录号MIMAT0015080)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3196基因可以通过Stark MS等,2010年,PLoS One,5卷,e9685所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3196”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3196”(miRBase登录号MI0014241,序列号354)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6803-5p基因”或“hsa-miR-6803-5p”这样的用语包含序列号163所记载的hsa-miR-6803-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027506)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6803-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6803-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6803”(miRBase登录号MI0022648,序列号355)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6789-5p基因”或“hsa-miR-6789-5p”这样的用语包含序列号164所记载的hsa-miR-6789-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027478)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6789-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6789-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6789”(miRBase登录号MI0022634,序列号356)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4648基因”或“hsa-miR-4648”这样的用语包含序列号165所记载的hsa-miR-4648基因(miRBase登录号MIMAT0019710)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4648基因可以通过Persson H等,2011年,Cancer Res,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4648”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4648”(miRBase登录号MI0017275,序列号357)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4508基因”或“hsa-miR-4508”这样的用语包含序列号166所记载的hsa-miR-4508基因(miRBase登录号MIMAT0019045)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4508基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4508”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4508”(miRBase登录号MI0016872,序列号358)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4749-5p基因”或“hsa-miR-4749-5p”这样的用语包含序列号167所记载的hsa-miR-4749-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019885)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4749-5p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4749-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4749”(miRBase登录号MI0017388,序列号359)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4505基因”或“hsa-miR-4505”这样的用语包含序列号168所记载的hsa-miR-4505基因(miRBase登录号MIMAT0019041)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4505基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4505”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4505”(miRBase登录号MI0016868,序列号360)。
本说明书中使用的“hsa-miR-5698基因”或“hsa-miR-5698”这样的用语包含序列号169所记载的hsa-miR-5698基因(miRBase登录号MIMAT0022491)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-5698基因可以通过Watahiki A等,2011年,PLoS One,6卷,e24950所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-5698”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-5698”(miRBase登录号MI0019305,序列号361)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1199-5p基因”或“hsa-miR-1199-5p”这样的用语包含序列号170所记载的hsa-miR-1199-5p基因(miRBase登录号MIMAT0031119)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1199-5p基因可以通过Salvi A等,2013年,Int J Oncol,42卷,p391-402所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1199-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1199”(miRBase登录号MI0020340,序列号362)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4763-3p基因”或“hsa-miR-4763-3p”这样的用语包含序列号171所记载的hsa-miR-4763-3p基因(miRBase登录号MIMAT0019913)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4763-3p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4763-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4763”(miRBase登录号MI0017404,序列号363)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1231基因”或“hsa-miR-1231”这样的用语包含序列号172所记载的hsa-miR-1231基因(miRBase登录号MIMAT0005586)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1231基因可以通过Berezikov E等,2007年,Mol Cell,28卷,p328-336所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1231”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1231”(miRBase登录号MI0006321,序列号364)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1233-5p基因”或“hsa-miR-1233-5p”这样的用语包含序列号173所记载的hsa-miR-1233-5p基因(miRBase登录号MIMAT0022943)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1233-5p基因可以通过Berezikov E等,2007年,MolCell,28卷,p328-336所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1233-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1233-1,hsa-mir-1233-2”(miRBase登录号MI0006323,MI0015973,序列号365,366)。
本说明书中使用的“hsa-miR-150-3p基因”或“hsa-miR-150-3p”这样的用语包含序列号174所记载的hsa-miR-150-3p基因(miRBase登录号MIMAT0004610)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-150-3p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2002年,CurrBiol,12卷,p735-739所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-150-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-150”(miRBase登录号MI0000479,序列号367)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1225-3p基因”或“hsa-miR-1225-3p”这样的用语包含序列号175所记载的hsa-miR-1225-3p基因(miRBase登录号MIMAT0005573)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1225-3p基因可以通过Berezikov E等,2007年,MolCell,28卷,p328-336所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1225-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1225”(miRBase登录号MI0006311,序列号235)。
本说明书中使用的“hsa-miR-92a-2-5p基因”或“hsa-miR-92a-2-5p”这样的用语包含序列号176所记载的hsa-miR-92a-2-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004508)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-92a-2-5p基因可以通过Mourelatos Z等,2002年,Genes Dev,16卷,p720-728所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-92a-2-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-92a-2”(miRBase登录号MI0000094,序列号368)。
本说明书中使用的“hsa-miR-423-5p基因”或“hsa-miR-423-5p”这样的用语包含序列号177所记载的hsa-miR-423-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004748)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-423-5p基因可以通过Kasashima K等,2004年,BiochemBiophys Res Commun,322卷,p403-410所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-423-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-423”(miRBase登录号MI0001445,序列号369)。
本说明书中使用的“hsa-miR-1268a基因”或“hsa-miR-1268a”这样的用语包含序列号178所记载的hsa-miR-1268a基因(miRBase登录号MIMAT0005922)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-1268a基因可以通过Morin RD等,2008年,Genome Res,18卷,p610-621所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-1268a”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-1268a”(miRBase登录号MI0006405,序列号370)。
本说明书中使用的“hsa-miR-128-2-5p基因”或“hsa-miR-128-2-5p”这样的用语包含序列号179所记载的hsa-miR-128-2-5p基因(miRBase登录号MIMAT0031095)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-128-2-5p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2002年,Curr Biol,12卷,p735-739所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-128-2-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-128-2”(miRBase登录号MI0000727,序列号371)。
本说明书中使用的“hsa-miR-24-3p基因”或“hsa-miR-24-3p”这样的用语包含序列号180所记载的hsa-miR-24-3p基因(miRBase登录号MIMAT0000080)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-24-3p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2001年,Science,294卷,p853-858所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-24-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-24-1,hsa-mir-24-2”(miRBase登录号MI0000080,MI0000081,序列号372,373)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4697-5p基因”或“hsa-miR-4697-5p”这样的用语包含序列号181所记载的hsa-miR-4697-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019791)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4697-5p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4697-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4697”(miRBase登录号MI0017330,序列号374)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3197基因”或“hsa-miR-3197”这样的用语包含序列号182所记载的hsa-miR-3197基因(miRBase登录号MIMAT0015082)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3197基因可以通过Stark MS等,2010年,PLoS One,5卷,e9685所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3197”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3197”(miRBase登录号MI0014245,序列号375)。
本说明书中使用的“hsa-miR-675-5p基因”或“hsa-miR-675-5p”这样的用语包含序列号183所记载的hsa-miR-675-5p基因(miRBase登录号MIMAT0004284)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-675-5p基因可以通过Cai X等,2007年,RNA,13卷,p313-316所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-675-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-675”(miRBase登录号MI0005416,序列号376)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4486基因”或“hsa-miR-4486”这样的用语包含序列号184所记载的hsa-miR-4486基因(miRBase登录号MIMAT0019020)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4486基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4486”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4486”(miRBase登录号MI0016847,序列号377)。
本说明书中使用的“hsa-miR-7107-5p基因”或“hsa-miR-7107-5p”这样的用语包含序列号185所记载的hsa-miR-7107-5p基因(miRBase登录号MIMAT0028111)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-7107-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-7107-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-7107”(miRBase登录号MI0022958,序列号378)。
本说明书中使用的“hsa-miR-23a-3p基因”或“hsa-miR-23a-3p”这样的用语包含序列号186所记载的hsa-miR-23a-3p基因(miRBase登录号MIMAT0000078)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-23a-3p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2001年,Science,294卷,p853-858所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-23a-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-23a”(miRBase登录号MI0000079,序列号379)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4667-5p基因”或“hsa-miR-4667-5p”这样的用语包含序列号187所记载的hsa-miR-4667-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019743)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4667-5p基因可以通过Persson H等,2011年,CancerRes,71卷,p78-86所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4667-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4667”(miRBase登录号MI0017297,序列号380)。
本说明书中使用的“hsa-miR-451a基因”或“hsa-miR-451a”这样的用语包含序列号188所记载的hsa-miR-451a基因(miRBase登录号MIMAT0001631)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-451a基因可以通过Altuvia Y等,2005年,Nucleic Acids Res,33卷,p2697-2706所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-451a”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-451a”(miRBase登录号MI0001729,序列号381)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3940-5p基因”或“hsa-miR-3940-5p”这样的用语包含序列号189所记载的hsa-miR-3940-5p基因(miRBase登录号MIMAT0019229)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3940-5p基因可以通过Liao JY等,2010年,PLoS One,5卷,e10563所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3940-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3940”(miRBase登录号MI0016597,序列号382)。
本说明书中使用的“hsa-miR-8059基因”或“hsa-miR-8059”这样的用语包含序列号190所记载的hsa-miR-8059基因(miRBase登录号MIMAT0030986)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-8059基因可以通过Wang HJ等,2013年,Shock,39卷,p480-487所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-8059”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-8059”(miRBase登录号MI0025895,序列号383)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6813-5p基因”或“hsa-miR-6813-5p”这样的用语包含序列号191所记载的hsa-miR-6813-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027526)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6813-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6813-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6813”(miRBase登录号MI0022658,序列号384)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4492基因”或“hsa-miR-4492”这样的用语包含序列号192所记载的hsa-miR-4492基因(miRBase登录号MIMAT0019027)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4492基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4492”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4492”(miRBase登录号MI0016854,序列号385)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4476基因”或“hsa-miR-4476”这样的用语包含序列号193所记载的hsa-miR-4476基因(miRBase登录号MIMAT0019003)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4476基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4476”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4476”(miRBase登录号MI0016828,序列号386)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6090基因”或“hsa-miR-6090”这样的用语包含序列号194所记载的hsa-miR-6090基因(miRBase登录号MIMAT0023715)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6090基因可以通过Yoo JK等,2012年,Stem Cells Dev,21卷,p2049-2057所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6090”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6090”(miRBase登录号MI0020367,序列号387)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6836-3p基因”或“hsa-miR-6836-3p”这样的用语包含序列号606所记载的hsa-miR-6836-3p基因(miRBase登录号MIMAT0027575)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6836-3p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6836-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6836”(miRBase登录号MI0022682,序列号615)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3195基因”或“hsa-miR-3195”这样的用语包含序列号607所记载的hsa-miR-3195基因(miRBase登录号MIMAT0015079)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3195基因可以通过Stark MS等,2010年,PLoS One,5卷,e9685所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3195”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3195”(miRBase登录号MI0014240,序列号616)。
本说明书中使用的“hsa-miR-718基因”或“hsa-miR-718”这样的用语包含序列号608所记载的hsa-miR-718基因(miRBase登录号MIMAT0012735)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-718基因可以通过Artzi S等,2008年,BMC Bioinformatics,9卷,p39所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-718”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-718”(miRBase登录号MI0012489,序列号617)。
本说明书中使用的“hsa-miR-3178基因”或“hsa-miR-3178”这样的用语包含序列号609所记载的hsa-miR-3178基因(miRBase登录号MIMAT0015055)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-3178基因可以通过Stark MS等,2010年,PLoS One,5卷,e9685所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-3178”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-3178”(miRBase登录号MI0014212,序列号618)。
本说明书中使用的“hsa-miR-638基因”或“hsa-miR-638”这样的用语包含序列号610所记载的hsa-miR-638基因(miRBase登录号MIMAT0003308)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-638基因可以通过Cummins JM等,2006年,Proc Natl Acad Sci U S A,103卷,p3687-3692所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-638”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-638”(miRBase登录号MI0003653,序列号619)。
本说明书中使用的“hsa-miR-4497基因”或“hsa-miR-4497”这样的用语包含序列号611所记载的hsa-miR-4497基因(miRBase登录号MIMAT0019032)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-4497基因可以通过Jima DD等,2010年,Blood,116卷,e118-e127所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-4497”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-4497”(miRBase登录号MI0016859,序列号620)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6085基因”或“hsa-miR-6085”这样的用语包含序列号612所记载的hsa-miR-6085基因(miRBase登录号MIMAT0023710)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6085基因可以通过Voellenkle C等,2012年,RNA,18卷,p472-484所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6085”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6085”(miRBase登录号MI0020362,序列号621)。
本说明书中使用的“hsa-miR-6752-5p基因”或“hsa-miR-6752-5p”这样的用语包含序列号613所记载的hsa-miR-6752-5p基因(miRBase登录号MIMAT0027404)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-6752-5p基因可以通过Ladewig E等,2012年,GenomeRes,22卷,p1634-1645所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-6752-5p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-6752”(miRBase登录号MI0022597,序列号622)。
本说明书中使用的“hsa-miR-135a-3p基因”或“hsa-miR-135a-3p”这样的用语包含序列号614所记载的hsa-miR-135a-3p基因(miRBase登录号MIMAT0004595)、其它生物种同源物或直向同源物等。hsa-miR-135a-3p基因可以通过Lagos-Quintana M等,2002年,Curr Biol,12卷,p735-739所记载的方法来获得。此外,作为“hsa-miR-135a-3p”的前体,已知形成发夹样结构的“hsa-mir-135a”(miRBase登录号MI0000452,序列号623)。
此外,成熟型的miRNA是从形成发夹样结构的RNA前体作为成熟型miRNA被切出时,有时序列的前后1个~数个碱基被短地切出或被长地切出、发生碱基的替换而成为突变体,被称为isomiR(Morin RD.等,2008年,Genome Res.,第18卷,p.610-621)。miRBase版本20中,除了序列号1~194和606~614的任一项所示的碱基序列以外,还示出多个被称为isomiR的序列号388~605和624~635的任一项所示的碱基序列的突变体和片段。这些突变体还可以作为具有序列号1~194和606~614的任一项所示的碱基序列的miRNA来获得。即,由本发明的序列号5、7、8、9、11、16、19、20、21、26、27、28、30、34、37、38、39、41、43、45、46、48、50、54、55、57、58、61、62、63、64、65、66、67、69、70、71、73、74、76、77、78、80、81、82、84、85、86、88、89、94、95、97、98、99、100、101、104、107、108、109、110、111、112、113、115、116、117、119、120、123、125、131、132、133、135、136、137、140、141、142、147、151、152、157、161、162、165、166、167、168、169、171、173、174、176、177、178、179、180、182、183、184、186、187、188、189、192、193、607、608、609、610、611和614所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸的突变体中,作为例如miRBase版本20中所登录的最长的突变体,分别可举出序列号388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、624、626、628、630、632和634所示的多核苷酸。此外,由本发明的序列号5、7、8、9、11、16、19、20、21、26、27、28、30、34、37、38、39、41、43、45、46、48、50、54、55、57、58、61、62、63、64、65、66、67、69、70、71、73、74、76、77、78、80、81、82、84、85、86、88、89、94、95、97、98、99、100、101、104、107、108、109、110、111、112、113、115、116、117、119、120、123、125、131、132、133、135、136、137、140、141、142、147、151、152、157、161、162、165、166、167、168、169、171、173、174、176、177、178、179、180、182、183、184、186、187、188、189、192、193、607、608、609、610、611和614所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸的突变体中,作为例如miRBase版本20中所登录的最短的突变体,分别可举出序列号389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、625、627、629、631、633和635所示的序列的多核苷酸。此外,除了这些突变体和片段以外,还可举出miRBase中所登录的、序列号1~194和606~614的多个isomiR的多核苷酸。进一步,作为包含序列号1~194和606~614的任一项所示的碱基序列的多核苷酸的例子,分别可举出作为前体的序列号195~387和615~623的任一项所示的多核苷酸。
将序列号1~635所示的基因的名称和miRBase登录号(Accession No.)记载于表1。
[表1]
本说明书包括作为本申请的优先权基础的日本专利申请2014-122686号、2015-070182号的说明书和/或附图中所记载的内容。
发明的效果
通过本发明,能够容易并且以高准确度检测大肠癌。
例如,将可以低侵袭性地采集的患者的血液、血清和或血浆中的几个miRNA表达量的测定值作为指标,可以容易检测出患者是否是大肠癌。
附图说明
图1中示出由作为前体的序列号205所示的hsa-mir-3679生成的序列号11所示的hsa-miR-3679-5p、和序列号78所示的hsa-miR-3679-3p的碱基序列的关系。
图2中左图:以作为学习检体组选择的健康体(100人)和大肠癌患者(34人)的hsa-miR-6726-5p(序列号1)的表达量测定值为纵轴而分别表示的图。图中的水平线表示通过Fisher的判别分析而最优化的、判别两组的阈值(9.43)。右图:以作为测试检体组选择的健康体(50人)和大肠癌患者(16人)的hsa-miR-6726-5p(序列号1)的表达量测定值为纵轴而分别表示的图。图中的水平线表示以学习检体组设定的、判别两组的阈值(9.43)。
图3中左图:以作为学习检体组选择的健康体(100人,圆)和大肠癌患者(34人,三角)的hsa-miR-6726-5p(序列号1)的表达量测定值为横轴,以hsa-miR-4257(序列号2)的表达量测定值为纵轴而分别表示的图。图中的线表示通过Fisher的判别分析而最优化的、判别两组的判别函数(0=1.26x+y-18.06)。右图:以作为测试检体组选择的健康体(50人,圆)和大肠癌患者(16人,三角)的hsa-miR-6726-5p(序列号1)的表达量测定值为横轴,以hsa-miR-4257(序列号2)的表达量测定值为纵轴而分别表示的图。图中的线表示以学习检体组设定的、判别两组的阈值(0=1.26x+y-18.06)。
图4中上图:由作为学习检体组选择的大肠癌患者34人、健康体103人、胰腺癌患者69人、胆道癌患者66人、胃癌患者30人、食道癌患者33人、肝癌患者32人和胰腺胆道良性疾病患者15人的hsa-miR-3131(序列号5)、hsa-miR-204-3p(序列号45)、hsa-miR-4665-5p(序列号57)、hsa-miR-7847-3p(序列号75)、hsa-miR-3196(序列号162)、hsa-miR-3195(序列号607)的表达量测定值,使用Fisher的判别分析来作出判别式(1.49xhsa-miR-3131-0.23xhsa-miR-7847-3p-1.13xhsa-miR-3196+1.11xhsa-miR-3195+2.25xhsa-miR-4665-5p-1.00xhsa-miR-204-3p-11.16),以由该判别式获得的判别得分为纵轴,以检体组为横轴所表示的图。图中的虚线表示判别得分为0的判别两组的判别边界。下图:相对于作为测试检体组选择的大肠癌患者16人、健康体47人、胰腺癌患者30人、胆道癌患者33人、胃癌患者20人、食道癌患者17人、肝癌患者20人和胰腺胆道良性疾病患者6人的hsa-miR-3131(序列号5)、hsa-miR-204-3p(序列号45)、hsa-miR-4665-5p(序列号57)、hsa-miR-7847-3p(序列号75)、hsa-miR-3196(序列号162)、hsa-miR-3195(序列号607)的表达量测定值,以由学习检体组作出的该判别式获得的判别得分为纵轴,以检体组为横轴所表示的图。图中的虚线表示判别得分为0的判别两组的判别边界。
具体实施方式
以下进一步具体地说明本发明。
1.大肠癌的靶核酸
用于使用本发明的上述定义的大肠癌检测用的核酸探针或引物来检测大肠癌或大肠癌细胞的存在和/或不存在的、作为大肠癌标志物的主要靶核酸中,可以使用选自hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-7641、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-6857-5p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-4792、hsa-miR-564、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-4665-3p、hsa-miR-4467、hsa-miR-3188、hsa-miR-6125、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-1228-3p、hsa-miR-8063、hsa-miR-8069、hsa-miR-6875-5p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-5572、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-3937、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-7109-5p、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-4442、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4449、hsa-miR-4706、hsa-miR-1913、hsa-miR-602、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-711、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-6721-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6132、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-3679-3p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-1249、hsa-miR-937-5p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-4281、hsa-miR-4734、hsa-miR-6766-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-4513、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-6845-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-3620-5p、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4450、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-1469、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-7975、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-6802-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-663b、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-2861、hsa-miR-6088、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-671-5p、hsa-miR-4454、hsa-miR-4516、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-6805-3p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-4688、hsa-miR-6850-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-7106-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-6131、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4532、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-3656、hsa-miR-3621、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-149-3p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-6848-5p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-4327、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-6716-5p、hsa-miR-6877-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-614、hsa-miR-1202、hsa-miR-575、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-4675、hsa-miR-6075、hsa-miR-6779-5p、hsa-miR-4271、hsa-miR-3196、hsa-miR-6803-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-4648、hsa-miR-4508、hsa-miR-4749-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-5698、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195、hsa-miR-718、hsa-miR-3178、hsa-miR-638、hsa-miR-4497、hsa-miR-6085、hsa-miR-6752-5p和hsa-miR-135a-3p中的至少1个以上miRNA。进一步可以与这些miRNA组合的其它大肠癌标志物,即,选自hsa-miR-1231、hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-150-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-128-2-5p和hsa-miR-24-3p中的至少1个以上miRNA也可以作为靶核酸优选使用。进一步可以与这些miRNA组合的其它大肠癌标志物,即,选自hsa-miR-4697-5p、hsa-miR-3197、hsa-miR-675-5p、hsa-miR-4486、hsa-miR-7107-5p、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-8059、hsa-miR-6813-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-4476和hsa-miR-6090中的至少1个以上miRNA也可以作为靶核酸优选使用。
上述miRNA中,包含例如,包含序列号1~194和606~614的任一项所示的碱基序列的人基因(即,分别为hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-7641、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-6857-5p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-4792、hsa-miR-564、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-4665-3p、hsa-miR-4467、hsa-miR-3188、hsa-miR-6125、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-1228-3p、hsa-miR-8063、hsa-miR-8069、hsa-miR-6875-5p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-5572、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-3937、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-7109-5p、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-4442、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4449、hsa-miR-4706、hsa-miR-1913、hsa-miR-602、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-711、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-6721-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6132、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-3679-3p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-1249、hsa-miR-937-5p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-4281、hsa-miR-4734、hsa-miR-6766-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-4513、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-6845-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-3620-5p、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4450、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-1469、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-7975、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-6802-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-663b、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-2861、hsa-miR-6088、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-671-5p、hsa-miR-4454、hsa-miR-4516、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-6805-3p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-4688、hsa-miR-6850-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-7106-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-6131、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4532、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-3656、hsa-miR-3621、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-149-3p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-6848-5p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-4327、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-6716-5p、hsa-miR-6877-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-614、hsa-miR-1202、hsa-miR-575、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-4675、hsa-miR-6075、hsa-miR-6779-5p、hsa-miR-4271、hsa-miR-3196、hsa-miR-6803-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-4648、hsa-miR-4508、hsa-miR-4749-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-5698、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-1231、hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-150-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-24-3p、hsa-miR-4697-5p、hsa-miR-3197、hsa-miR-675-5p、hsa-miR-4486、hsa-miR-7107-5p、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-8059、hsa-miR-6813-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-4476、hsa-miR-6090、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195、hsa-miR-718、hsa-miR-3178、hsa-miR-638、hsa-miR-4497、hsa-miR-6085、hsa-miR-6752-5p和hsa-miR-135a-3p)、其同族体、其转录产物、及其突变体或衍生物。这里,基因、同族体、转录产物、突变体和衍生物如上述定义。
优选的靶核酸是包含序列号1~635的任一项所示的碱基序列的人基因、或其转录产物,更优选为该转录产物,即miRNA、作为其前体RNA的pri-miRNA或pre-miRNA。
第1靶基因是hsa-miR-6726-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第2靶基因是hsa-miR-4257基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第3靶基因是hsa-miR-6787-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第4靶基因是hsa-miR-6780b-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第5靶基因是hsa-miR-3131基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第6靶基因是hsa-miR-7108-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第7靶基因是hsa-miR-1343-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第8靶基因是hsa-miR-1247-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第9靶基因是hsa-miR-4651基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第10靶基因是hsa-miR-6757-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第11靶基因是hsa-miR-3679-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第12靶基因是hsa-miR-7641基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第13靶基因是hsa-miR-6746-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第14靶基因是hsa-miR-8072基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第15靶基因是hsa-miR-6741-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第16靶基因是hsa-miR-1908-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第17靶基因是hsa-miR-6857-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第18靶基因是hsa-miR-4746-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第19靶基因是hsa-miR-744-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第20靶基因是hsa-miR-4792基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第21靶基因是hsa-miR-564基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第22靶基因是hsa-miR-6791-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第23靶基因是hsa-miR-6825-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第24靶基因是hsa-miR-6826-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第25靶基因是hsa-miR-4665-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第26靶基因是hsa-miR-4467基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第27靶基因是hsa-miR-3188基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第28靶基因是hsa-miR-6125基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第29靶基因是hsa-miR-6756-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第30靶基因是hsa-miR-1228-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第31靶基因是hsa-miR-8063基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第32靶基因是hsa-miR-8069基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第33靶基因是hsa-miR-6875-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第34靶基因是hsa-miR-3185基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第35靶基因是hsa-miR-4433b-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第36靶基因是hsa-miR-6887-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第37靶基因是hsa-miR-128-1-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第38靶基因是hsa-miR-6724-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第39靶基因是hsa-miR-1914-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第40靶基因是hsa-miR-1225-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第41靶基因是hsa-miR-4419b基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第42靶基因是hsa-miR-7110-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第43靶基因是hsa-miR-187-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第44靶基因是hsa-miR-3184-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第45靶基因是hsa-miR-204-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第46靶基因是hsa-miR-5572基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第47靶基因是hsa-miR-6729-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第48靶基因是hsa-miR-615-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第49靶基因是hsa-miR-6749-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第50靶基因是hsa-miR-6515-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第51靶基因是hsa-miR-3937基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第52靶基因是hsa-miR-6840-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第53靶基因是hsa-miR-6893-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第54靶基因是hsa-miR-4728-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第55靶基因是hsa-miR-6717-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第56靶基因是hsa-miR-7113-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第57靶基因是hsa-miR-4665-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第58靶基因是hsa-miR-642b-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第59靶基因是hsa-miR-7109-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第60靶基因是hsa-miR-6842-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第61靶基因是hsa-miR-4442基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第62靶基因是hsa-miR-4433-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第63靶基因是hsa-miR-4707-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第64靶基因是hsa-miR-6126基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第65靶基因是hsa-miR-4449基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第66靶基因是hsa-miR-4706基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第67靶基因是hsa-miR-1913基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第68靶基因是hsa-miR-602基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第69靶基因是hsa-miR-939-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第70靶基因是hsa-miR-4695-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第71靶基因是hsa-miR-711基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第72靶基因是hsa-miR-6816-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第73靶基因是hsa-miR-4632-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第74靶基因是hsa-miR-6721-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第75靶基因是hsa-miR-7847-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第76靶基因是hsa-miR-6132基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第77靶基因是hsa-miR-887-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第78靶基因是hsa-miR-3679-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第79靶基因是hsa-miR-6784-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第80靶基因是hsa-miR-1249基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第81靶基因是hsa-miR-937-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第82靶基因是hsa-miR-5195-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第83靶基因是hsa-miR-6732-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第84靶基因是hsa-miR-4417基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第85靶基因是hsa-miR-4281基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第86靶基因是hsa-miR-4734基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第87靶基因是hsa-miR-6766-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第88靶基因是hsa-miR-663a基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第89靶基因是hsa-miR-4513基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第90靶基因是hsa-miR-6781-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第91靶基因是hsa-miR-1227-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第92靶基因是hsa-miR-6845-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第93靶基因是hsa-miR-6798-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第94靶基因是hsa-miR-3620-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第95靶基因是hsa-miR-1915-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第96靶基因是hsa-miR-4294基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第97靶基因是hsa-miR-642a-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第98靶基因是hsa-miR-371a-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第99靶基因是hsa-miR-940基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第100靶基因是hsa-miR-4450基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第101靶基因是hsa-miR-4723-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第102靶基因是hsa-miR-1469基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第103靶基因是hsa-miR-6861-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第104靶基因是hsa-miR-7975基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第105靶基因是hsa-miR-6879-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第106靶基因是hsa-miR-6802-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第107靶基因是hsa-miR-1268b基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第108靶基因是hsa-miR-663b基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第109靶基因是hsa-miR-125a-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第110靶基因是hsa-miR-2861基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第111靶基因是hsa-miR-6088基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第112靶基因是hsa-miR-4758-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第113靶基因是hsa-miR-296-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第114靶基因是hsa-miR-6738-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第115靶基因是hsa-miR-671-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第116靶基因是hsa-miR-4454基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第117靶基因是hsa-miR-4516基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第118靶基因是hsa-miR-7845-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第119靶基因是hsa-miR-4741基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第120靶基因是hsa-miR-92b-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第121靶基因是hsa-miR-6795-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第122靶基因是hsa-miR-6805-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第123靶基因是hsa-miR-4725-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第124靶基因是hsa-miR-6782-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第125靶基因是hsa-miR-4688基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第126靶基因是hsa-miR-6850-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第127靶基因是hsa-miR-6777-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第128靶基因是hsa-miR-6785-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第129靶基因是hsa-miR-7106-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第130靶基因是hsa-miR-3663-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第131靶基因是hsa-miR-6131基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第132靶基因是hsa-miR-1915-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第133靶基因是hsa-miR-4532基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第134靶基因是hsa-miR-6820-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第135靶基因是hsa-miR-4689基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第136靶基因是hsa-miR-4638-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第137靶基因是hsa-miR-3656基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第138靶基因是hsa-miR-3621基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第139靶基因是hsa-miR-6769b-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第140靶基因是hsa-miR-149-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第141靶基因是hsa-miR-23b-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第142靶基因是hsa-miR-3135b基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第143靶基因是hsa-miR-6848-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第144靶基因是hsa-miR-6769a-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第145靶基因是hsa-miR-4327基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第146靶基因是hsa-miR-6765-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第147靶基因是hsa-miR-6716-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第148靶基因是hsa-miR-6877-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第149靶基因是hsa-miR-6727-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第150靶基因是hsa-miR-4534基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第151靶基因是hsa-miR-614基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第152靶基因是hsa-miR-1202基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第153靶基因是hsa-miR-575基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第154靶基因是hsa-miR-6870-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第155靶基因是hsa-miR-6722-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第156靶基因是hsa-miR-7977基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第157靶基因是hsa-miR-4649-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第158靶基因是hsa-miR-4675基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第159靶基因是hsa-miR-6075基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第160靶基因是hsa-miR-6779-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第161靶基因是hsa-miR-4271基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第162靶基因是hsa-miR-3196基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第163靶基因是hsa-miR-6803-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第164靶基因是hsa-miR-6789-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第165靶基因是hsa-miR-4648基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第166靶基因是hsa-miR-4508基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第167靶基因是hsa-miR-4749-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第168靶基因是hsa-miR-4505基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第169靶基因是hsa-miR-5698基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第170靶基因是hsa-miR-1199-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第171靶基因是hsa-miR-4763-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第172靶基因是hsa-miR-1231基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献3)。
第173靶基因是hsa-miR-1233-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献2)。
第174靶基因是hsa-miR-150-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献4)。
第175靶基因是hsa-miR-1225-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献2)。
第176靶基因是hsa-miR-92a-2-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献1和专利文献4)。
第177靶基因是hsa-miR-423-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献3)。
第178靶基因是hsa-miR-1268a基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献3)。
第179靶基因是hsa-miR-128-2-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献1)。
第180靶基因是hsa-miR-24-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告是已知的(专利文献1)。
第181靶基因是hsa-miR-4697-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第182靶基因是hsa-miR-3197基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第183靶基因是hsa-miR-675-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第184靶基因是hsa-miR-4486基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第185靶基因是hsa-miR-7107-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第186靶基因是hsa-miR-23a-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止有本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告(专利文献2)。
第187靶基因是hsa-miR-4667-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第188靶基因是hsa-miR-451a基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第189靶基因是hsa-miR-3940-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第190靶基因是hsa-miR-8059基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第191靶基因是hsa-miR-6813-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第192靶基因是hsa-miR-4492基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第193靶基因是hsa-miR-4476基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第194靶基因是hsa-miR-6090基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止本基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第195靶基因是hsa-miR-6836-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第196靶基因是hsa-miR-3195基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第197靶基因是hsa-miR-718基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第198靶基因是hsa-miR-3178基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第199靶基因是hsa-miR-638基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第200靶基因是hsa-miR-4497基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第201靶基因是hsa-miR-6085基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第202靶基因是hsa-miR-6752-5p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
第203靶基因是hsa-miR-135a-3p基因、它们的同族体、它们的转录产物、或它们的突变体或衍生物。迄今为止基因或其转录产物的表达的变化可以作为大肠癌的标志物这样的报告还不被知晓。
2.大肠癌的检测用的核酸探针或引物
在本发明中,可以使用能够与上述作为大肠癌标志物的靶核酸特异性结合的核酸作为用于检测或诊断大肠癌的核酸,例如核酸探针或引物。
在本发明中,能够用于检测大肠癌、或能够用于诊断大肠癌的核酸探针或引物能够定性地和/或定量地测定上述作为大肠癌标志物的靶核酸的存在、表达量或存在量,该靶核酸例如为人来源的hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-7641、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-6857-5p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-4792、hsa-miR-564、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-4665-3p、hsa-miR-4467、hsa-miR-3188、hsa-miR-6125、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-1228-3p、hsa-miR-8063、hsa-miR-8069、hsa-miR-6875-5p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-5572、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-3937、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-7109-5p、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-4442、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4449、hsa-miR-4706、hsa-miR-1913、hsa-miR-602、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-711、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-6721-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6132、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-3679-3p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-1249、hsa-miR-937-5p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-4281、hsa-miR-4734、hsa-miR-6766-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-4513、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-6845-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-3620-5p、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4450、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-1469、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-7975、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-6802-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-663b、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-2861、hsa-miR-6088、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-671-5p、hsa-miR-4454、hsa-miR-4516、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-6805-3p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-4688、hsa-miR-6850-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-7106-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-6131、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4532、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-3656、hsa-miR-3621、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-149-3p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-6848-5p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-4327、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-6716-5p、hsa-miR-6877-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-614、hsa-miR-1202、hsa-miR-575、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-4675、hsa-miR-6075、hsa-miR-6779-5p、hsa-miR-4271、hsa-miR-3196、hsa-miR-6803-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-4648、hsa-miR-4508、hsa-miR-4749-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-5698、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195、hsa-miR-718、hsa-miR-3178、hsa-miR-638、hsa-miR-4497、hsa-miR-6085、hsa-miR-6752-5p或hsa-miR-135a-3p或它们的组合、或它们的同族体、它们的转录产物、它们的突变体或衍生物、以及可以根据情况与它们组合的hsa-miR-1231、hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-150-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-128-2-5p或hsa-miR-24-3p、或它们的组合、或它们的同族体、它们的转录产物、它们的突变体或衍生物、以及可以根据情况与它们组合的hsa-miR-4697-5p、hsa-miR-3197、hsa-miR-675-5p、hsa-miR-4486、hsa-miR-7107-5p、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-8059、hsa-miR-6813-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-4476或hsa-miR-6090、或它们的组合、或它们的同族体、它们的转录产物、它们的突变体或衍生物。
关于上述靶核酸,与健康体相比,在罹患大肠癌的受试体中,根据该靶核酸的种类,它们的表达量既有增加的情况,也有降低的情况(以下,称为“增加/降低”)。因此,本发明的核酸可以对怀疑罹患大肠癌的受试体(例如人)来源的体液和健康体来源的体液测定上述靶核酸的表达量,将它们进行比较,有效地用于检测大肠癌。
本发明中能够使用的核酸探针或引物是能够与由序列号1~171和606~614的至少1个所示的碱基序列组成的多核苷酸特异性结合的核酸探针、或用于扩增由序列号1~171和606~614的至少1个所示的碱基序列组成的多核苷酸的引物。
本发明中能够使用的核酸探针或引物可以进一步包含能够与由序列号172~180的至少1个所示的碱基序列组成的多核苷酸特异性结合的核酸探针、或用于扩增由序列号172~180的至少1个所示的碱基序列组成的多核苷酸的引物。
本发明中能够使用的核酸探针或引物可以进一步包含能够与由序列号181~194的至少1个所示的碱基序列组成的多核苷酸特异性结合的核酸探针、或用于扩增由序列号181~194的至少1个所示的碱基序列组成的多核苷酸的引物。
具体而言,上述核酸探针或引物包含选自包含序列号1~635的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列的多核苷酸群及其互补多核苷酸群、与由与该碱基序列互补的碱基序列组成的DNA在严格条件(后述)下分别杂交的多核苷酸群及其互补多核苷酸群、以及包含在这些多核苷酸群的碱基序列中15个以上、优选为17个以上连续碱基的多核苷酸群中的1个或多个多核苷酸的组合。这些多核苷酸可以作为用于检测作为靶核酸的上述大肠癌标志物的核酸探针和引物使用。
进一步具体而言,本发明中能够使用的核酸探针或引物的例子为选自以下的多核苷酸(a)~(e)中的1个或多个多核苷酸。
(a)由序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(b)包含序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(c)由与序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(d)包含与序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(e)与上述(a)~(d)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
本发明中能够使用的核酸探针或引物,除了选自上述多核苷酸(a)~(e)中的至少一个以上多核苷酸以外,可以进一步包含选自下述(f)~(j)所示的多核苷酸中的多核苷酸。
(f)由序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(g)包含序列号172~180的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(h)由与序列号172~180的任一项所示的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(i)包含与序列号172~180的任一项所示的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(j)与上述(f)~(i)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
本发明中能够使用的核酸探针或引物,除了选自上述的多核苷酸(a)~
(j)中的至少一个以上多核苷酸以外,可以进一步包含选自下述(k)~(o)所示的多核苷酸中的多核苷酸。
(k)由序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(l)包含序列号181~194的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(m)由与序列号181~194的任一项所示的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(n)包含与序列号181~194的任一项所示的碱基序列、或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(o)与上述(k)~(n)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
上述多核苷酸中“该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段”可以包含在各多核苷酸的碱基序列中例如连续的15个至小于序列的总碱基数、17个至小于序列的总碱基数、19个至小于序列的总碱基数等范围的碱基数,但不限定于此。
本发明中使用的任一上述多核苷酸类或其片段类均可以是DNA,也可以是RNA。
本发明中能够使用的上述多核苷酸可以使用DNA重组技术、PCR法、利用DNA/RNA自动合成仪的方法等一般的技术来制作。
DNA重组技术和PCR法可以使用例如Ausubel等,Current Protocols inMolecular Biology,John Willey&Sons,US(1993);Sambrook等,Molecular Cloning ALaboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,US(1989)等中记载的技术。
序列号1~194和606~614所示的人来源的hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-7641、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-6857-5p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-4792、hsa-miR-564、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-4665-3p、hsa-miR-4467、hsa-miR-3188、hsa-miR-6125、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-1228-3p、hsa-miR-8063、hsa-miR-8069、hsa-miR-6875-5p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-5572、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-3937、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-7109-5p、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-4442、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4449、hsa-miR-4706、hsa-miR-1913、hsa-miR-602、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-711、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-6721-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6132、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-3679-3p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-1249、hsa-miR-937-5p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-4281、hsa-miR-4734、hsa-miR-6766-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-4513、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-6845-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-3620-5p、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4450、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-1469、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-7975、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-6802-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-663b、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-2861、hsa-miR-6088、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-671-5p、hsa-miR-4454、hsa-miR-4516、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-6805-3p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-4688、hsa-miR-6850-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-7106-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-6131、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4532、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-3656、hsa-miR-3621、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-149-3p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-6848-5p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-4327、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-6716-5p、hsa-miR-6877-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-614、hsa-miR-1202、hsa-miR-575、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-4675、hsa-miR-6075、hsa-miR-6779-5p、hsa-miR-4271、hsa-miR-3196、hsa-miR-6803-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-4648、hsa-miR-4508、hsa-miR-4749-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-5698、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-1231、hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-150-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-24-3p、hsa-miR-4697-5p、hsa-miR-3197、hsa-miR-675-5p、hsa-miR-4486、hsa-miR-7107-5p、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-8059、hsa-miR-6813-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-4476、hsa-miR-6090、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195、hsa-miR-718、hsa-miR-3178、hsa-miR-638、hsa-miR-4497、hsa-miR-6085、hsa-miR-6752-5p和hsa-miR-135a-3p是公知的,如上述那样其取得方法也是已知的。因此,通过将该基因进行克隆,从而可以制作作为本发明中能够使用的核酸探针或引物的多核苷酸。
这样的核酸探针或引物可以使用DNA自动合成装置来化学合成。该合成一般使用亚磷酰胺(phosphoramidite)法,通过该方法可以自动合成直至约100个碱基的单链DNA。DNA自动合成装置由例如Polygen公司、ABI公司、Applied BioSystems公司等市售。
或者,本发明的多核苷酸还可以通过cDNA克隆法来制作。cDNA克隆技术可以利用例如microRNA克隆试剂盒(microRNA Cloning Kit)Wako等。
这里,用于检测由序列号1~194和606~614的任一项所示的碱基序列组成的多核苷酸的核酸探针和引物的序列不作为miRNA或其前体存在于活体内。例如,序列号11和序列号78所示的碱基序列由序列号205所示的前体生成,但该前体具有图1所示那样的发夹样结构,序列号11和序列号78所示的碱基序列彼此具有错配序列。同样地,与序列号11或序列号78所示的碱基序列完全互补的碱基序列不在活体内天然地生成。因此,用于检测序列号1~194和606~614的任一项所示的碱基序列的核酸探针和引物具有活体内不存在的人工碱基序列。
3.大肠癌检测用试剂盒或装置
本发明还提供包含一个或多个用于测定作为大肠癌标志物的靶核酸的、在本发明中能够作为核酸探针或引物使用的多核苷酸(它们中可以包含突变体、片段或衍生物。以下,有时称为检测用多核苷酸)的大肠癌检测用试剂盒或装置。
本发明中的作为大肠癌标志物的靶核酸优选选自以下的群1:
miR-6726-5p、miR-4257、miR-6787-5p、miR-6780b-5p、miR-3131、miR-7108-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-3679-5p、miR-7641、miR-6746-5p、miR-8072、miR-6741-5p、miR-1908-5p、miR-6857-5p、miR-4746-3p、miR-744-5p、miR-4792、miR-564、miR-6791-5p、miR-6825-5p、miR-6826-5p、miR-4665-3p、miR-4467、miR-3188、miR-6125、miR-6756-5p、miR-1228-3p、miR-8063、miR-8069、miR-6875-5p、miR-3185、miR-4433b-3p、miR-6887-5p、miR-128-1-5p、miR-6724-5p、miR-1914-3p、miR-1225-5p、miR-4419b、miR-7110-5p、miR-187-5p、miR-3184-5p、miR-204-3p、miR-5572、miR-6729-5p、miR-615-5p、miR-6749-5p、miR-6515-3p、miR-3937、miR-6840-3p、miR-6893-5p、miR-4728-5p、miR-6717-5p、miR-7113-3p、miR-4665-5p、miR-642b-3p、miR-7109-5p、miR-6842-5p、miR-4442、miR-4433-3p、miR-4707-5p、miR-6126、miR-4449、miR-4706、miR-1913、miR-602、miR-939-5p、miR-4695-5p、miR-711、miR-6816-5p、miR-4632-5p、miR-6721-5p、miR-7847-3p、miR-6132、miR-887-3p、miR-3679-3p、miR-6784-5p、miR-1249、miR-937-5p、miR-5195-3p、miR-6732-5p、miR-4417、miR-4281、miR-4734、miR-6766-3p、miR-663a、miR-4513、miR-6781-5p、miR-1227-5p、miR-6845-5p、miR-6798-5p、miR-3620-5p、miR-1915-5p、miR-4294、miR-642a-3p、miR-371a-5p、miR-940、miR-4450、miR-4723-5p、miR-1469、miR-6861-5p、miR-7975、miR-6879-5p、miR-6802-5p、miR-1268b、miR-663b、miR-125a-3p、miR-2861、miR-6088、miR-4758-5p、miR-296-3p、miR-6738-5p、miR-671-5p、miR-4454、miR-4516、miR-7845-5p、miR-4741、miR-92b-5p、miR-6795-5p、miR-6805-3p、miR-4725-3p、miR-6782-5p、miR-4688、miR-6850-5p、miR-6777-5p、miR-6785-5p、miR-7106-5p、miR-3663-3p、miR-6131、miR-1915-3p、miR-4532、miR-6820-5p、miR-4689、miR-4638-5p、miR-3656、miR-3621、miR-6769b-5p、miR-149-3p、miR-23b-3p、miR-3135b、miR-6848-5p、miR-6769a-5p、miR-4327、miR-6765-3p、miR-6716-5p、miR-6877-5p、miR-6727-5p、miR-4534、miR-614、miR-1202、miR-575、miR-6870-5p、miR-6722-3p、miR-7977、miR-4649-5p、miR-4675、miR-6075、miR-6779-5p、miR-4271、miR-3196、miR-6803-5p、miR-6789-5p、miR-4648、miR-4508、miR-4749-5p、miR-4505、miR-5698、miR-1199-5p、miR-4763-3p、miR-6836-3p、miR-3195、miR-718、miR-3178、miR-638、miR-4497、miR-6085、miR-6752-5p和miR-135a-3p。
根据情况可以用于测定的追加的靶核酸选自以下的群2:miR-1231、miR-1233-5p、miR-150-3p、miR-1225-3p、miR-92a-2-5p、miR-423-5p、miR-1268a、miR-128-2-5p和miR-24-3p。
根据情况进一步可以用于测定的追加的靶核酸选自以下的群3:miR-4697-5p、miR-3197、miR-675-5p、miR-4486、miR-7107-5p、miR-23a-3p、miR-4667-5p、miR-451a、miR-3940-5p、miR-8059、miR-6813-5p、miR-4492、miR-4476、和miR-6090。
本发明的试剂盒或装置包含能够与上述作为大肠癌标志物的靶核酸特异性结合的核酸,优选为上述2所记载的核酸探针或引物,具体为选自上述2所记载的多核苷酸类中的1个或多个多核苷酸或其突变体等。
具体而言,本发明的试剂盒或装置可以包含至少1个以上:包含序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列(或由序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成)的多核苷酸、包含其互补序列(或由其互补序列组成)的多核苷酸、与这些多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸、或这些多核苷酸序列的包含15个以上连续碱基的突变体或片段。
本发明的试剂盒或装置可以进一步包含1个以上:包含序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列(或由序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成)的多核苷酸、包含其互补序列(或由其互补序列组成)的多核苷酸、与这些多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸、或这些多核苷酸序列的包含15个以上连续碱基的突变体或片段。
本发明的试剂盒或装置可以进一步包含1个以上:包含序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列(或由序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成)的多核苷酸、包含其互补序列(或由其互补序列组成)的多核苷酸、与这些多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸、或这些多核苷酸序列的包含15个以上连续碱基的突变体或片段。
本发明的试剂盒或装置可以包含的片段为例如选自下述(1)~(3)中的1个以上,优选为2个以上的多核苷酸。
(1)包含在序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列中u为t的碱基序列或其互补序列中15个以上连续碱基的多核苷酸。
(2)包含在序列号172~180的任一项所示的碱基序列中u为t的碱基序列或其互补序列中15个以上连续碱基的多核苷酸。
(3)包含在序列号181~194的任一项所示的碱基序列中u为t的碱基序列或其互补序列中15个以上连续碱基的多核苷酸。
在优选的实施方式中,上述多核苷酸是由序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸;由其互补序列组成的多核苷酸;与这些多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸;或它们的包含15个以上、优选为17个以上、更优选为19个以上连续碱基的突变体。
此外,在优选的实施方式中,上述多核苷酸是由序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸;由其互补序列组成的多核苷酸;与这些多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸;或它们的包含15个以上、优选为17个以上、更优选为19个以上连续碱基的突变体。
此外,在优选的实施方式中,上述多核苷酸是由序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸;由其互补序列组成的多核苷酸;与这些多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸;或它们的包含15个以上、优选为17个以上、更优选为19个以上连续碱基的突变体。
在优选的实施方式中,上述片段可以是包含15个以上、优选为17个以上、更优选为19个以上连续碱基的多核苷酸。
在本发明中,多核苷酸的片段大小在各多核苷酸的碱基序列中,例如为连续的15个至小于序列的总碱基数、17个至小于序列的总碱基数、19个至小于序列的总碱基数等范围的碱基数。
作为构成本发明的试剂盒或装置的上述多核苷酸的组合,具体而言,可举出将由表1所示的序列号(与表中的miRNA标志物对应的、序列号1~194和606~614)所表示的碱基序列组成的上述多核苷酸以1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或10个以上的个数进行了组合的情况,它们严格地说是例示,其它各种可能组合全部都包含于本发明中。
例如,在本发明中作为构成用于判别大肠癌与健康体的试剂盒或装置的上述组合,期望使由表1所示的序列号所示的碱基序列组成的上述多核苷酸以2个以上组合,通常,2个的组合可以获得充分的性能。
具体而言,作为由用于判别大肠癌与健康体的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的2个的组合,在由序列号1~194和606~614所表示的碱基序列组成的上述多核苷酸构成的2个的组合中,优选为包含至少1个以上新发现的由序列号1~171所示的碱基序列组成的多核苷酸的组合。进一步具体而言,由序列号1~194和606~614所表示的碱基序列组成的多核苷酸的组合中,更优选为包含至少1个由序列号5、15、24、32、38、45、55、64、96、97、162所表示的碱基序列组成的多核苷酸的组合。
此外,作为不仅可以判别大肠癌与健康体而且可以判别大肠癌与其它癌症的具有癌症种类特异性的多核苷酸的组合,优选为例如选自由序列号5、13、15、24、32、38、41、45、55、57、64、72、75、77、96、97、115、162、163、173、189、606、607、608、609、610、611、612、613和614的多核苷酸组成的群(以下,将本群设为“癌症种类特异性多核苷酸群1”)中的至少1个多核苷酸、与其它序列号的多核苷酸的多个的组合。
进一步,作为不仅可以判别大肠癌与健康体而且可以判别大肠癌与其它癌症的具有癌症种类特异性的多核苷酸的组合,更优选为选自癌症种类特异性多核苷酸群1中的多个多核苷酸的组合。
进一步,作为不仅可以判别大肠癌与健康体而且可以判别大肠癌与其它癌症的具有癌症种类特异性的多核苷酸的组合,在选自癌症种类特异性多核苷酸群1中的多个多核苷酸的组合中,更优选为包含至少1个以上选自由癌症种类特异性多核苷酸群1所包含的、序列号5、45、57、96和606的多核苷酸组成的群(以下,将本群设为“癌症种类特异性多核苷酸群2”)中的多核苷酸的组合。
作为上述具有癌症种类特异性的多核苷酸的组合的个数,组合可以为1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或10个以上的个数,更优选为6个以上的组合,通常5个或6个的组合可以获得充分的性能。
以下,非限定地例示由序列号5所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸、与由选自癌症种类特异性多核苷酸群1中的4个或5个多核苷酸的序列号所示的序列号所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的组合。
(1)序列号5、45、57、75、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-3195)的组合
(2)序列号5、45、96、606、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195)的组合
(3)序列号5、45、57、97、115、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-671-5p、hsa-miR-3195)的组合
(4)序列号5、45、57、97、162、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3195)的组合
(5)序列号5、45、57、162、607、613(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3195、hsa-miR-6752-5p)的组合
(6)序列号5、45、57、97、607、612(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-3195、hsa-miR-6085)的组合
(7)序列号5、13、45、57、606、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195)的组合
(8)序列号5、45、96、189、606、608(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-718)的组合
(9)序列号5、45、57、96、189、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p)的组合
(10)序列号5、24、45、57、96、608(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-718)的组合
(11)序列号5、45、57、162、607、610(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3195、hsa-miR-638)的组合
(12)序列号5、45、57、189、606、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195)的组合
进一步,非限定地例示由序列号45所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸、与由选自癌症种类特异性多核苷酸群1中的4个或5个多核苷酸的序列号所示的序列号所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的组合。
(1)序列号5、45、96、606、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195)的组合
(2)序列号5、45、57、75、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-3195)的组合
(3)序列号5、45、57、75、606、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195)的组合
(4)序列号5、45、57、77、607、613(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-3195、hsa-miR-6752-5p)的组合
(5)序列号5、45、57、97、606、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195)的组合
(6)序列号5、45、57、75、77、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-3195)的组合
(7)序列号5、32、45、57、96、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-8069、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p)的组合
(8)序列号5、24、45、57、96、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p)的组合
(9)序列号5、45、57、96、162、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3196、hsa-miR-6836-3p)的组合
(10)序列号5、15、45、75、96、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p)的组合
(11)序列号5、32、45、57、162、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-8069、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3195)的组合
(12)序列号38、45、96、606、608、611(标志物:hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-718、hsa-miR-4497)的组合
进一步,非限定地例示由序列号57所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸、与由选自癌症种类特异性多核苷酸群1中的4个或5个多核苷酸的序列号所示的序列号所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的组合。
(1)序列号24、41、57、45、96(标志物:hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294)的组合
(2)序列号5、45、57、607、612(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-6085)的组合
(3)序列号5、45、57、606、607、608(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-3195、hsa-miR-718)的组合
(4)序列号5、13、45、57、75、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-3195)的组合
(5)序列号5、45、57、64、75、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-3195)的组合
(6)序列号5、45、55、57、607、613(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-6752-5p)的组合
(7)序列号5、45、55、57、75、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-3195)的组合
(8)序列号5、38、45、57、96、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3195)的组合
(9)序列号5、45、57、75、162、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3195)的组合
(10)序列号5、45、57、75、162、609(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3178)的组合
(11)序列号5、45、57、64、96、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4294、hsa-miR-3195)的组合
(12)序列号57、64、96、606、608、611(标志物:hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-718、hsa-miR-4497)的组合
进一步,非限定地例示由序列号96所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸、与由选自癌症种类特异性多核苷酸群1中的4个或5个多核苷酸的序列号所示的序列号所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的组合。
(1)序列号38、96、606、608、611(标志物:hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-718、hsa-miR-4497)的组合
(2)序列号5、45、57、96、607(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3195)的组合
(3)序列号38、72、96、606、608、611(标志物:hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-718、hsa-miR-4497)的组合
(4)序列号32、38、96、606、608、611(标志物:hsa-miR-8069、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-718、hsa-miR-4497)的组合
(5)序列号38、96、163、606、608、611(标志物:hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6803-5p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-718、hsa-miR-4497)的组合
(6)序列号64、72、96、162、609、611(标志物:hsa-miR-6126、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3196、hsa-miR-3178、hsa-miR-4497)的组合
(7)序列号38、64、96、163、606、608(标志物:hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4294、hsa-miR-6803-5p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-718)的组合
(8)序列号5、45、57、75、96、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p)的组合
(9)序列号5、15、45、57、96、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p)的组合
(10)序列号5、41、45、57、96、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-4419b、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p)的组合
(11)序列号5、41、45、96、189、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-4419b、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p)的组合
(12)序列号5、45、75、96、189、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p)的组合
进一步,非限定地例示由序列号606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸、与由选自癌症种类特异性多核苷酸群1中的3个多核苷酸的序列号所示的序列号所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的组合。
(1)序列号5、24、45、96、189、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p)的组合
(2)序列号5、15、45、96、189、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p)的组合
(3)序列号5、45、96、189、606、613(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p、hsa-miR-6752-5p)的组合
(4)序列号5、45、72、96、189、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-6836-3p)的组合
(5)序列号5、15、32、45、96、606(标志物:hsa-miR-3131、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-4294、hsa-miR-6836-3p)的组合
本发明的试剂盒或装置中,除了以上说明的本发明中的多核苷酸(其中可以包含突变体、片段或衍生物)以外,还可以包含能够检测大肠癌的已知的多核苷酸或将来要发现的多核苷酸。
本发明的试剂盒中,除了以上说明的本发明中的上述多核苷酸以外,还可以包含用于测定CEA、CA19-9等公知的大肠癌检查用标志物的抗体。
本发明的试剂盒所包含的上述多核苷酸可以单独或任意地组合而包装于不同的容器。
本发明的试剂盒中,还可以包含用于从体液、细胞或组织提取核酸(例如总RNA)的试剂盒、标记用荧光物质、核酸扩增用酶和培养基、使用说明书等。
本发明的装置是用于测定癌症标志物的装置,其中以上说明的本发明中的多核苷酸等核酸例如测定结合或附着于固相的癌症标志物。固相的材质的例子为塑料、纸、玻璃、硅等,从加工的容易性考虑,优选的固相的材质为塑料。固相的形状是任意的,例如为方形、圆形、长条形、膜形等。本发明的装置包括例如用于通过杂交技术进行测定的装置,具体而言,可以例示印迹装置、核酸阵列(例如微阵列、DNA芯片、RNA芯片等)等。
核酸阵列技术是通过使用下述方法,使上述核酸1个1个结合或附着来制作芯片等阵列,使用该阵列并利用杂交来测定靶核酸的技术,所述方法是:在根据需要实施了L赖氨酸涂布和/或氨基、羧基等官能团导入等表面处理的固相的表面上,使用被称为点样机(spotter)或点样仪(Arrayer)的高密度分注机来点样核酸的方法;使用由喷嘴通过压电元件等喷射微少的液滴的喷墨将核酸喷吹至固相的方法;在固相上依次进行核苷酸合成的方法等。
本发明的试剂盒或装置包含能够与上述群1的作为大肠癌标志物的miRNA的至少1个以上、优选为至少2个以上、进一步优选为至少3个以上、最优选为至少5个以上至全部多核苷酸分别特异性结合的核酸。本发明的试剂盒或装置进一步根据情况可以包含能够与上述群2的作为大肠癌标志物的miRNA的至少1个以上、优选为至少2个以上、进一步优选为至少3个以上、最优选为至少5个以上至全部多核苷酸分别特异性结合的核酸。本发明的试剂盒或装置进一步根据情况可以包含能够与上述群3的作为大肠癌标志物的miRNA的至少1个以上、优选为至少2个以上、进一步优选为至少3个以上、最优选为至少5个以上至全部多核苷酸分别特异性结合的核酸。
本发明的试剂盒或装置可以用于下述4的大肠癌的检测。
4.大肠癌的检测方法
本发明进一步提供大肠癌的检测方法,其包括:使用上述3中说明的本发明的试剂盒或装置(包含本发明中能够使用的上述核酸。),体外测定检体中的选自以下群:miR-6726-5p、miR-4257、miR-6787-5p、miR-6780b-5p、miR-3131、miR-7108-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-3679-5p、miR-7641、miR-6746-5p、miR-8072、miR-6741-5p、miR-1908-5p、miR-6857-5p、miR-4746-3p、miR-744-5p、miR-4792、miR-564、miR-6791-5p、miR-6825-5p、miR-6826-5p、miR-4665-3p、miR-4467、miR-3188、miR-6125、miR-6756-5p、miR-1228-3p、miR-8063、miR-8069、miR-6875-5p、miR-3185、miR-4433b-3p、miR-6887-5p、miR-128-1-5p、miR-6724-5p、miR-1914-3p、miR-1225-5p、miR-4419b、miR-7110-5p、miR-187-5p、miR-3184-5p、miR-204-3p、miR-5572、miR-6729-5p、miR-615-5p、miR-6749-5p、miR-6515-3p、miR-3937、miR-6840-3p、miR-6893-5p、miR-4728-5p、miR-6717-5p、miR-7113-3p、miR-4665-5p、miR-642b-3p、miR-7109-5p、miR-6842-5p、miR-4442、miR-4433-3p、miR-4707-5p、miR-6126、miR-4449、miR-4706、miR-1913、miR-602、miR-939-5p、miR-4695-5p、miR-711、miR-6816-5p、miR-4632-5p、miR-6721-5p、miR-7847-3p、miR-6132、miR-887-3p、miR-3679-3p、miR-6784-5p、miR-1249、miR-937-5p、miR-5195-3p、miR-6732-5p、miR-4417、miR-4281、miR-4734、miR-6766-3p、miR-663a、miR-4513、miR-6781-5p、miR-1227-5p、miR-6845-5p、miR-6798-5p、miR-3620-5p、miR-1915-5p、miR-4294、miR-642a-3p、miR-371a-5p、miR-940、miR-4450、miR-4723-5p、miR-1469、miR-6861-5p、miR-7975、miR-6879-5p、miR-6802-5p、miR-1268b、miR-663b、miR-125a-3p、miR-2861、miR-6088、miR-4758-5p、miR-296-3p、miR-6738-5p、miR-671-5p、miR-4454、miR-4516、miR-7845-5p、miR-4741、miR-92b-5p、miR-6795-5p、miR-6805-3p、miR-4725-3p、miR-6782-5p、miR-4688、miR-6850-5p、miR-6777-5p、miR-6785-5p、miR-7106-5p、miR-3663-3p、miR-6131、miR-1915-3p、miR-4532、miR-6820-5p、miR-4689、miR-4638-5p、miR-3656、miR-3621、miR-6769b-5p、miR-149-3p、miR-23b-3p、miR-3135b、miR-6848-5p、miR-6769a-5p、miR-4327、miR-6765-3p、miR-6716-5p、miR-6877-5p、miR-6727-5p、miR-4534、miR-614、miR-1202、miR-575、miR-6870-5p、miR-6722-3p、miR-7977、miR-4649-5p、miR-4675、miR-6075、miR-6779-5p、miR-4271、miR-3196、miR-6803-5p、miR-6789-5p、miR-4648、miR-4508、miR-4749-5p、miR-4505、miR-5698、miR-1199-5p、miR-4763-3p、miR-6836-3p、miR-3195、miR-718、miR-3178、miR-638、miR-4497、miR-6085、miR-6752-5p和miR-135a-3p中的大肠癌来源的基因的表达量,以及根据情况选自以下群:miR-1231、miR-1233-5p、miR-150-3p、miR-1225-3p、miR-92a-2-5p、miR-423-5p、miR-1268a、miR-128-2-5p和miR-24-3p中的大肠癌来源的基因的表达量,以及根据情况选自以下群:miR-4697-5p、miR-3197、miR-675-5p、miR-4486、miR-7107-5p、miR-23a-3p、miR-4667-5p、miR-451a、miR-3940-5p、miR-8059、miR-6813-5p、miR-4492、miR-4476和miR-6090中的大肠癌来源的基因的表达量、的1个以上所示的大肠癌来源的基因的表达量,进一步对从怀疑罹患大肠癌的受试体与健康体(包含非大肠癌患者)采集的血液、血清、血浆等检体,使用检体中的上述基因的表达量和健康体的对照表达量,例如将两表达量进行比较,在该检体中的靶核酸的表达量具有统计学上显著性差异的情况下,评价为受试体罹患大肠癌。
本发明的上述方法能够低侵袭性地进行敏感度和特异度高的癌症的早期诊断,由此,带来早期的治疗和预后的改善,进一步能够监视疾病憎恶、监视外科治疗、放射线疗法的治疗和化学疗法的治疗的有效性。
对于本发明的从血液、血清、血浆等检体提取大肠癌来源的基因的方法,特别优选为添加3D-Gene(注册商标)来自液体样品的RNA提取用试剂的试剂盒(RNA extractionreagent from liquid sample kit)(东丽株式会社)中的RNA提取用试剂并调制,但也可以使用一般的酸性苯酚法(酸胍酚氯仿(Acid Guanidinium-Phenol-Chloroform;AGPC)法),也可以使用Trizol(注册商标)(Life Technologies公司),也可以添加Trizol(lifetechnologies公司)、Isogen(Nippon Gene公司)等包含酸性苯酚的RNA提取用试剂并调制。进一步可以利用miRNeasy(注册商标)Mini Kit(Qiagen公司)等试剂盒,不限定于这些方法。
本发明此外提供本发明的试剂盒或装置用于受试体来源的检体中的大肠癌来源的miRNA基因的表达产物的体外检测的应用。
本发明的上述方法中,上述试剂盒或装置使用如以上所说明那样的以单一或所有可能组合包含本发明中能够使用的多核苷酸的试剂盒或装置。
本发明的大肠癌的检测或(基因)诊断中,本发明的试剂盒或装置所包含的多核苷酸可以作为探针或引物使用。在作为引物使用的情况下,可以利用Life Technologies公司的TaqMan(注册商标)MicroRNA Assays,Qiagen公司的miScript PCR System等,但不限定于这些方法。
本发明的试剂盒或装置所包含的多核苷酸可以在RNA印迹法、DNA印迹法、原位杂交法、Northern杂交法、Southern杂交法等杂交技术、定量RT-PCR法等定量扩增技术等特异性地检测特定基因的公知的方法中,按照常规方法作为引物或探针来利用。作为测定对象检体,根据使用的检测方法的种类,采集受试体的血液、血清、血浆、尿等体液。或可以使用由这样的体液通过上述方法调制的总RNA,进一步可以使用以该RNA为基础调制的包含cDNA的各种多核苷酸。
本发明的试剂盒或装置对于用于大肠癌的诊断或罹患的有无的检测是有用的。具体而言,使用了该试剂盒或装置的大肠癌的检测可以如下进行:从怀疑罹患大肠癌的受试体,使用血液、血清、血浆、尿等检体,体外检测用该试剂盒或装置所包含的核酸探针或引物检测到的基因的表达量。通过怀疑罹患大肠癌的受试体的血液、血清、血浆、尿等检体中的由序列号1~171和606~614的至少1个以上所示的碱基序列或其互补序列、以及根据情况序列号172~180的1个以上所示的碱基序列或其互补序列、以及根据情况序列号181~194的1个以上所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸(包含其突变体、片段或衍生物)测定的靶miRNA标志物的表达量与健康体的血液、血清、或血浆、尿等检体中的它们的表达量相比在统计学上有显著差异的情况下,可以评价为该受试体罹患大肠癌。
本发明的方法除了便潜血、直肠检查、大肠内窥镜检查以外,还可以与灌肠造影检查、CT检查、MRI检查、骨闪烁扫描法检查等图像诊断法进行组合。本发明的方法能够特异性地检测大肠癌,可以从大肠癌以外的癌症中实质上识别。
利用了本发明的试剂盒或装置的检体中不含大肠癌来源的基因的表达产物、或包含大肠癌来源的基因的表达产物的检测方法包括:通过采集受试体的血液、血清、血浆、尿等体液,使用选自本发明的多核苷酸群中的单个或多个多核苷酸(包含突变体、片段或衍生物)来测定其中所包含的靶基因的表达量,从而评价大肠癌的有无或检测大肠癌。此外,还可以使用本发明的大肠癌的检测方法在例如大肠癌患者中,评价或诊断施与了用于改善该疾病的治疗药的情况下的该疾病有无改善或改善的程度。
本发明的方法可以包含例如以下的(a)、(b)和(c)的步骤:
(a)使受试体来源的检体与本发明的试剂盒或装置中的多核苷酸体外接触的步骤,
(b)使用上述多核苷酸作为核酸探针或引物来测定检体中的靶核酸的表达量的步骤,
(c)基于(b)的结果,评价该受试体中的大肠癌(细胞)的存在或不存在的步骤。
具体而言,本发明提供大肠癌的检测方法,其包括:使用能够与选自miR-6726-5p、miR-4257、miR-6787-5p、miR-6780b-5p、miR-3131、miR-7108-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-3679-5p、miR-7641、miR-6746-5p、miR-8072、miR-6741-5p、miR-1908-5p、miR-6857-5p、miR-4746-3p、miR-744-5p、miR-4792、miR-564、miR-6791-5p、miR-6825-5p、miR-6826-5p、miR-4665-3p、miR-4467、miR-3188、miR-6125、miR-6756-5p、miR-1228-3p、miR-8063、miR-8069、miR-6875-5p、miR-3185、miR-4433b-3p、miR-6887-5p、miR-128-1-5p、miR-6724-5p、miR-1914-3p、miR-1225-5p、miR-4419b、miR-7110-5p、miR-187-5p、miR-3184-5p、miR-204-3p、miR-5572、miR-6729-5p、miR-615-5p、miR-6749-5p、miR-6515-3p、miR-3937、miR-6840-3p、miR-6893-5p、miR-4728-5p、miR-6717-5p、miR-7113-3p、miR-4665-5p、miR-642b-3p、miR-7109-5p、miR-6842-5p、miR-4442、miR-4433-3p、miR-4707-5p、miR-6126、miR-4449、miR-4706、miR-1913、miR-602、miR-939-5p、miR-4695-5p、miR-711、miR-6816-5p、miR-4632-5p、miR-6721-5p、miR-7847-3p、miR-6132、miR-887-3p、miR-3679-3p、miR-6784-5p、miR-1249、miR-937-5p、miR-5195-3p、miR-6732-5p、miR-4417、miR-4281、miR-4734、miR-6766-3p、miR-663a、miR-4513、miR-6781-5p、miR-1227-5p、miR-6845-5p、miR-6798-5p、miR-3620-5p、miR-1915-5p、miR-4294、miR-642a-3p、miR-371a-5p、miR-940、miR-4450、miR-4723-5p、miR-1469、miR-6861-5p、miR-7975、miR-6879-5p、miR-6802-5p、miR-1268b、miR-663b、miR-125a-3p、miR-2861、miR-6088、miR-4758-5p、miR-296-3p、miR-6738-5p、miR-671-5p、miR-4454、miR-4516、miR-7845-5p、miR-4741、miR-92b-5p、miR-6795-5p、miR-6805-3p、miR-4725-3p、miR-6782-5p、miR-4688、miR-6850-5p、miR-6777-5p、miR-6785-5p、miR-7106-5p、miR-3663-3p、miR-6131、miR-1915-3p、miR-4532、miR-6820-5p、miR-4689、miR-4638-5p、miR-3656、miR-3621、miR-6769b-5p、miR-149-3p、miR-23b-3p、miR-3135b、miR-6848-5p、miR-6769a-5p、miR-4327、miR-6765-3p、miR-6716-5p、miR-6877-5p、miR-6727-5p、miR-4534、miR-614、miR-1202、miR-575、miR-6870-5p、miR-6722-3p、miR-7977、miR-4649-5p、miR-4675、miR-6075、miR-6779-5p、miR-4271、miR-3196、miR-6803-5p、miR-6789-5p、miR-4648、miR-4508、miR-4749-5p、miR-4505、miR-5698、miR-1199-5p和miR-4763-3p、miR-6836-3p、miR-3195、miR-718、miR-3178、miR-638、miR-4497、miR-6085、miR-6752-5p和miR-135a-3p中的至少1个以上、优选为至少2个以上多核苷酸特异性结合的核酸,测定受试体的检体中的靶核酸的表达量,使用该测得的表达量和同样地测得的健康体的对照表达量对受试体罹患大肠癌或未罹患大肠癌进行体外评价。
本说明书中“评价”,不是医师的判定,而是基于体外检查的结果的评价支援。
如上述那样,在本发明的优选的实施方式的方法中,关于靶核酸,具体而言,miR-6726-5p为hsa-miR-6726-5p,miR-4257为hsa-miR-4257,miR-6787-5p为hsa-miR-6787-5p,miR-6780b-5p为hsa-miR-6780b-5p,miR-3131为hsa-miR-3131,miR-7108-5p为hsa-miR-7108-5p,miR-1343-3p为hsa-miR-1343-3p,miR-1247-3p为hsa-miR-1247-3p,miR-4651为hsa-miR-4651,miR-6757-5p为hsa-miR-6757-5p,miR-3679-5p为hsa-miR-3679-5p,miR-7641为hsa-miR-7641,miR-6746-5p为hsa-miR-6746-5p,miR-8072为hsa-miR-8072,miR-6741-5p为hsa-miR-6741-5p,miR-1908-5p为hsa-miR-1908-5p,miR-6857-5p为hsa-miR-6857-5p,miR-4746-3p为hsa-miR-4746-3p,miR-744-5p为hsa-miR-744-5p,miR-4792为hsa-miR-4792,miR-564为hsa-miR-564,miR-6791-5p为hsa-miR-6791-5p,miR-6825-5p为hsa-miR-6825-5p,miR-6826-5p为hsa-miR-6826-5p,miR-4665-3p为hsa-miR-4665-3p,miR-4467为hsa-miR-4467,miR-3188为hsa-miR-3188,miR-6125为hsa-miR-6125,miR-6756-5p为hsa-miR-6756-5p,miR-1228-3p为hsa-miR-1228-3p,miR-8063为hsa-miR-8063,miR-8069为hsa-miR-8069,miR-6875-5p为hsa-miR-6875-5p,miR-3185为hsa-miR-3185,miR-4433b-3p为hsa-miR-4433b-3p,miR-6887-5p为hsa-miR-6887-5p,miR-128-1-5p为hsa-miR-128-1-5p,miR-6724-5p为hsa-miR-6724-5p,miR-1914-3p为hsa-miR-1914-3p,miR-1225-5p为hsa-miR-1225-5p,miR-4419b为hsa-miR-4419b,miR-7110-5p为hsa-miR-7110-5p,miR-187-5p为hsa-miR-187-5p,miR-3184-5p为hsa-miR-3184-5p,miR-204-3p为hsa-miR-204-3p,miR-5572为hsa-miR-5572,miR-6729-5p为hsa-miR-6729-5p,miR-615-5p为hsa-miR-615-5p,miR-6749-5p为hsa-miR-6749-5p,miR-6515-3p为hsa-miR-6515-3p,miR-3937为hsa-miR-3937,miR-6840-3p为hsa-miR-6840-3p,miR-6893-5p为hsa-miR-6893-5p,miR-4728-5p为hsa-miR-4728-5p,miR-6717-5p为hsa-miR-6717-5p,miR-7113-3p为hsa-miR-7113-3p,miR-4665-5p为hsa-miR-4665-5p,miR-642b-3p为hsa-miR-642b-3p,miR-7109-5p为hsa-miR-7109-5p,miR-6842-5p为hsa-miR-6842-5p,miR-4442为hsa-miR-4442,miR-4433-3p为hsa-miR-4433-3p,miR-4707-5p为hsa-miR-4707-5p,miR-6126为hsa-miR-6126,miR-4449为hsa-miR-4449,miR-4706为hsa-miR-4706,miR-1913为hsa-miR-1913,miR-602为hsa-miR-602,miR-939-5p为hsa-miR-939-5p,miR-4695-5p为hsa-miR-4695-5p,miR-711为hsa-miR-711,miR-6816-5p为hsa-miR-6816-5p,miR-4632-5p为hsa-miR-4632-5p,miR-6721-5p为hsa-miR-6721-5p,miR-7847-3p为hsa-miR-7847-3p,miR-6132为hsa-miR-6132,miR-887-3p为hsa-miR-887-3p,miR-3679-3p为hsa-miR-3679-3p,miR-6784-5p为hsa-miR-6784-5p,miR-1249为hsa-miR-1249,miR-937-5p为hsa-miR-937-5p,miR-5195-3p为hsa-miR-5195-3p,miR-6732-5p为hsa-miR-6732-5p,miR-4417为hsa-miR-4417,miR-4281为hsa-miR-4281,miR-4734为hsa-miR-4734,miR-6766-3p为hsa-miR-6766-3p,miR-663a为hsa-miR-663a,miR-4513为hsa-miR-4513,miR-6781-5p为hsa-miR-6781-5p,miR-1227-5p为hsa-miR-1227-5p,miR-6845-5p为hsa-miR-6845-5p,miR-6798-5p为hsa-miR-6798-5p,miR-3620-5p为hsa-miR-3620-5p,miR-1915-5p为hsa-miR-1915-5p,miR-4294为hsa-miR-4294,miR-642a-3p为hsa-miR-642a-3p,miR-371a-5p为hsa-miR-371a-5p,miR-940为hsa-miR-940,miR-4450为hsa-miR-4450,miR-4723-5p为hsa-miR-4723-5p,miR-1469为hsa-miR-1469,miR-6861-5p为hsa-miR-6861-5p,miR-7975为hsa-miR-7975,miR-6879-5p为hsa-miR-6879-5p,miR-6802-5p为hsa-miR-6802-5p,miR-1268b为hsa-miR-1268b,miR-663b为hsa-miR-663b,miR-125a-3p为hsa-miR-125a-3p,miR-2861为hsa-miR-2861,miR-6088为hsa-miR-6088,miR-4758-5p为hsa-miR-4758-5p,miR-296-3p为hsa-miR-296-3p,miR-6738-5p为hsa-miR-6738-5p,miR-671-5p为hsa-miR-671-5p,miR-4454为hsa-miR-4454,miR-4516为hsa-miR-4516,miR-7845-5p为hsa-miR-7845-5p,miR-4741为hsa-miR-4741,miR-92b-5p为hsa-miR-92b-5p,miR-6795-5p为hsa-miR-6795-5p,miR-6805-3p为hsa-miR-6805-3p,miR-4725-3p为hsa-miR-4725-3p,miR-6782-5p为hsa-miR-6782-5p,miR-4688为hsa-miR-4688,miR-6850-5p为hsa-miR-6850-5p,miR-6777-5p为hsa-miR-6777-5p,miR-6785-5p为hsa-miR-6785-5p,miR-7106-5p为hsa-miR-7106-5p,miR-3663-3p为hsa-miR-3663-3p,miR-6131为hsa-miR-6131,miR-1915-3p为hsa-miR-1915-3p,miR-4532为hsa-miR-4532,miR-6820-5p为hsa-miR-6820-5p,miR-4689为hsa-miR-4689,miR-4638-5p为hsa-miR-4638-5p,miR-3656为hsa-miR-3656,miR-3621为hsa-miR-3621,miR-6769b-5p为hsa-miR-6769b-5p,miR-149-3p为hsa-miR-149-3p,miR-23b-3p为hsa-miR-23b-3p,miR-3135b为hsa-miR-3135b,miR-6848-5p为hsa-miR-6848-5p,miR-6769a-5p为hsa-miR-6769a-5p,miR-4327为hsa-miR-4327,miR-6765-3p为hsa-miR-6765-3p,miR-6716-5p为hsa-miR-6716-5p,miR-6877-5p为hsa-miR-6877-5p,miR-6727-5p为hsa-miR-6727-5p,miR-4534为hsa-miR-4534,miR-614为hsa-miR-614,miR-1202为hsa-miR-1202,miR-575为hsa-miR-575,miR-6870-5p为hsa-miR-6870-5p,miR-6722-3p为hsa-miR-6722-3p,miR-7977为hsa-miR-7977,miR-4649-5p为hsa-miR-4649-5p,miR-4675为hsa-miR-4675,miR-6075为hsa-miR-6075,miR-6779-5p为hsa-miR-6779-5p,miR-4271为hsa-miR-4271,miR-3196为hsa-miR-3196,miR-6803-5p为hsa-miR-6803-5p,miR-6789-5p为hsa-miR-6789-5p,miR-4648为hsa-miR-4648,miR-4508为hsa-miR-4508,miR-4749-5p为hsa-miR-4749-5p,miR-4505为hsa-miR-4505,miR-5698为hsa-miR-5698,miR-1199-5p为hsa-miR-1199-5p,miR-4763-3p为hsa-miR-4763-3p,miR-6836-3p为hsa-miR-6836-3p,miR-3195为hsa-miR-3195,miR-718为hsa-miR-718,miR-3178为hsa-miR-3178,miR-638为hsa-miR-638,miR-4497为hsa-miR-4497,miR-6085为hsa-miR-6085,miR-6752-5p为hsa-miR-6752-5p和miR-135a-3p为hsa-miR-135a-3p。
此外,本发明的方法的优选的实施方式中,具体而言,核酸(具体而言,探针或引物)选自下述(a)~(e)所示的多核苷酸:
(a)由序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(b)包含序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(c)由与序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(d)包含与序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(e)与上述(a)~(d)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
本发明的方法进一步可以使用能够与选自miR-1231、miR-1233-5p、miR-150-3p、miR-1225-3p、miR-92a-2-5p、miR-423-5p、miR-1268a、miR-128-2-5p和miR-24-3p中的至少1个以上多核苷酸特异性结合的核酸。
这样的核酸,具体而言,miR-1231为hsa-miR-1231,miR-1233-5p为hsa-miR-1233-5p,miR-150-3p为hsa-miR-150-3p,miR-1225-3p为hsa-miR-1225-3p,miR-92a-2-5p为hsa-miR-92a-2-5p,miR-423-5p为hsa-miR-423-5p,miR-1268a为hsa-miR-1268a,miR-128-2-5p为hsa-miR-128-2-5p和miR-24-3p为hsa-miR-24-3p。
进一步,在优选的实施方式中,具体而言,这样的核酸选自下述(f)~(j)所示的多核苷酸:
(f)由序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(g)包含序列号172~180的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(h)由与序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(i)包含与序列号172~180的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(j)与上述(f)~(i)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
本发明的方法中的核酸可以进一步使用能够与选自miR-4697-5p、miR-3197、miR-675-5p、miR-4486、miR-7107-5p、miR-23a-3p、miR-4667-5p、miR-451a、miR-3940-5p、miR-8059、miR-6813-5p、miR-4492、miR-4476和miR-6090中的至少1个以上多核苷酸特异性结合的核酸。
这样的核酸,具体而言,miR-4697-5p为hsa-miR-4697-5p,miR-3197为hsa-miR-3197,miR-675-5p为hsa-miR-675-5p,miR-4486为hsa-miR-4486,miR-7107-5p为hsa-miR-7107-5p,miR-23a-3p为hsa-miR-23a-3p,miR-4667-5p为hsa-miR-4667-5p,miR-451a为hsa-miR-451a,miR-3940-5p为hsa-miR-3940-5p,miR-8059为hsa-miR-8059,miR-6813-5p为hsa-miR-6813-5p,miR-4492为hsa-miR-4492,miR-4476为hsa-miR-4476和miR-6090为hsa-miR-6090。
进一步,在优选的实施方式中,具体而言,这样的核酸为选自下述(k)~(o)所示的多核苷酸中的多核苷酸:
(k)由序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(l)包含序列号181~194的任一项所示的碱基序列的多核苷酸,
(m)由与序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、该多核苷酸的突变体、该多核苷酸的衍生物、或该多核苷酸的包含15个以上连续碱基的片段,
(n)包含与序列号181~194的任一项所示的碱基序列或该碱基序列中u为t的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,和
(o)与上述(k)~(n)的任一多核苷酸在严格条件下杂交的多核苷酸。
作为本发明方法所使用的检体,可举出由受试体的生物体组织(优选为大肠组织)、血液、血清、血浆、尿等体液等调制的检体。具体而言,可以调制:由该组织调制的含有RNA的检体;由其进一步调制的包含多核苷酸的检体;由血液、血清、血浆、尿等体液、将受试体的生物体组织的一部分或全部通过活组织检查等采集或通过手术摘出的生物体组织等,调制的用于测定的检体。
本说明书中受试体,是指哺乳动物,例如非限定性地指人、猴、小鼠、大鼠等,优选为人。
本发明的方法可以根据作为测定对象使用的检体的种类来变更步骤。
在作为测定对象物利用RNA的情况下,大肠癌(细胞)的检测可以包括例如下述步骤(a)、(b)和(c):
(a)使由受试体的检体调制的RNA或由其转录的互补多核苷酸(cDNA)与本发明的试剂盒或装置中的多核苷酸结合的步骤,
(b)通过使用上述多核苷酸作为核酸探针的杂交、或通过使用上述多核苷酸作为引物的定量RT-PCR,来测定与该多核苷酸结合的检体来源的RNA或由该RNA合成的cDNA的步骤,
(c)基于上述(b)的测定结果,评价大肠癌(来源的基因的表达)的存在或不存在的步骤。
为了通过本发明来体外检测、检查、评价或诊断大肠癌(来源的基因的表达),可以使用例如各种杂交法。在这样的杂交法中,可以使用例如RNA印迹法、DNA印迹法、RT-PCR法、DNA芯片解析法、原位杂交法、Northern杂交法、Southern杂交法等。
在利用RNA印迹法的情况下,通过使用本发明中能够使用的上述核酸探针,可以检测、测定RNA中的各基因有无表达、其表达量。具体而言,可以例示下述方法:将核酸探针(互补链)用放射性同位素(
在利用定量RT―PCR法的情况下,通过使用本发明中能够使用的上述引物,可以检测、测定RNA中的基因有无表达、其表达量。具体而言,可以例示下述方法:由被检体的生物体组织来源的RNA按照常规方法调制cDNA,将其作为模板以使目标的各基因区可以扩增的方式,使本发明的1对引物(由与上述cDNA结合的正链和负链组成)与cDNA杂交,通过常规方法进行PCR法,检测所得的双链DNA的方法。另外,作为双链DNA的检测法,可以包括下述方法:使用预先用放射性同位素、荧光物质标记了的引物进行上述PCR的方法;将PCR产物用琼脂糖凝胶进行电泳,用溴化乙锭等将双链DNA进行染色并检测的方法;使产生的双链DNA按照常规方法转印至尼龙膜等,使其与标记了的核酸探针杂交来检测的方法。
在利用核酸阵列解析的情况下,使用将本发明的核酸探针(单链或双链)粘附于基板(固相)的RNA芯片或DNA芯片。将粘附有核酸探针的区域称为探针点(probe spot),将未粘附核酸探针的区域称为空白点(blank spot)。将基因群固相化于基板而得的物质中,一般而言有核酸芯片、核酸阵列、微阵列等这样的名称,DNA或RNA阵列包含DNA或RNA宏阵列与DNA或RNA微阵列,但在本说明书中提到芯片的情况下,包含这些全部阵列。作为DNA芯片,可以使用3D-Gene(注册商标)Human miRNA Oligo芯片(东丽株式会社),但不限于此。
DNA芯片的测定不受限定,例如可以例示将核酸探针的标记物来源的信号用图像检测器(可以例示Typhoon 9410(GE HealthCare公司),3D-Gene(注册商标)扫描仪(东丽株式会社)等)进行检测、测定的方法。
本说明书中使用的“严格条件”,是如上述那样核酸探针与针对其它序列相比,以更大的程度(例如背景测定值的平均+背景测定值的标准误差×2以上的测定值),对该目标序列杂交的条件。
严格条件根据杂交和之后的洗涤的条件来规定。其杂交的条件不受限定,例如为在30℃~60℃,在包含SSC、表面活性剂、甲酰胺、葡聚糖硫酸盐、封闭剂等的溶液中1~24小时的条件。这里,1×SSC是包含150mM氯化钠和15mM柠檬酸钠的水溶液(pH7.0),表面活性剂包含SDS(十二烷基硫酸钠)、Triton、或Tween等。作为杂交条件,更优选包含3~10×SSC、0.1~1%SDS。作为规定严格条件的另一条件的、杂交后的洗涤条件,可举出例如,利用30℃的包含0.5×SSC和0.1%SDS的溶液、和30℃的包含0.2×SSC和0.1%SDS的溶液、以及30℃的0.05×SSC溶液的连续洗涤等条件。互补链优选是即使在这样的条件下洗涤也与作为对象的正链维持杂交状态的互补链。具体而言,作为这样的互补链,可以例示由与对象的正链的碱基序列处于完全互补的关系的碱基序列组成的链,以及与该链具有至少80%、优选为至少85%、更优选为至少90%或至少95%、例如至少98%或至少99%的同一性的碱基序列组成的链。
关于这些杂交中的“严格条件”的其它例子,例如记载于Sambrook,J.&Russel,D.著,Molecular Cloning,A LABORATORY MANUAL,Cold Spring Harbor Laboratory Press,2001年1月15日发行的第1卷7.42~7.45,第2卷8.9~8.17等,在本发明中可以利用。
作为将本发明的试剂盒中的多核苷酸片段作为引物来实施PCR时的条件的例子,可举出例如使用10mM Tris-HCL(pH8.3)、50mM KCL、1~2mM MgCl
此外,在使用定量RT-PCR法的情况下,可以使用TaqMan(注册商标)MicroRNAAssays(Life Technologies公司):LNA(注册商标)-based MicroRNA PCR(Exiqon公司):Ncode(注册商标)miRNA qRT-PCT试剂盒(invitrogen公司)等为了定量地测定miRNA而特别地研究的市售的测定用试剂盒。
基因表达量的算出不受限定,在本发明中可以利用例如Statistical analysisof gene expression microarray data(Speed T.著,Chapman and Hall/CRC),和Abeginner’s guide Microarray gene expression data analysis(Causton H.C.等著,Blackwell publishing)等所记载的统计学处理。例如可以在DNA芯片上的空白点的测定值的平均值上加上空白点的测定值的标准偏差的2倍、优选为3倍、更优选为6倍,将具有该值以上的信号值的探针点视为检测点。进一步,可以将空白点的测定值的平均值视为背景,从探针点的测定值减去,作为基因表达量。对于基因表达量的缺失值,可以从解析对象中除去,或者优选用各DNA芯片中的基因表达量的最小值替换,或者更优选用从基因表达量的最小值的对数值中减去0.1后的值替换。进一步,为了除去低信号的基因,可以仅仅选择测定样品数的20%以上、优选为50%以上、更优选为80%以上具有2的6次方、优选为2的8次方、更优选为2的10次方以上的基因表达量的基因作为解析对象。作为基因表达量的归一化(normalization),不受限定,可举出例如整体归一化(global normalization)、分位数归一化(quantile normalization)(Bolstad,B.M.等,2003年,Bioinformatics,19卷,p185-193),等。
本发明此外提供下述方法:使用本发明的检测用多核苷酸、试剂盒、装置(例如,芯片)、或它们的组合,测定受试体来源的检体中靶基因或基因的表达量,将大肠癌患者来源的检体和健康体来源的检体的基因表达量作为教师样品来作出判别式(判别函数),确定或评价检体包含和/或不含大肠癌来源的基因。
即,本发明进一步提供下述方法,其包括下述步骤:使用本发明的检测用多核苷酸、试剂盒、装置(例如芯片)、或它们的组合,对确定或评价检体包含大肠癌来源的基因/或不含大肠癌来源的基因已知的多个检体中靶基因(靶核酸)的表达量进行体外测定的第1步骤;作出将由上述第1步骤获得的该靶基因的表达量的测定值作为教师样品的判别式的第2步骤;与第1步骤同样地体外测定受试体来源的检体中的该靶基因的表达量的第3步骤;在由上述第2步骤获得的判别式中代入由第3步骤获得的该靶基因的表达量的测定值,基于由该判别式获得的结果,确定或评价检体包含大肠癌来源的基因/或不含大肠癌来源的基因的第4步骤,这里,能够通过该多核苷酸、试剂盒或装置(例如芯片)所包含的检测用多核苷酸检测该靶基因。这里,可以使用Fisher的判别分析、利用马氏距离的非线性判别分析、神经网络、支持向量机(Support Vector Machine(SVM))等来作出判别式,但不限定于此。
线性判别分析在分组的边界为直线或超平面的情况下是使用式1作为判别式来判别组的所属的方法。这里,x为说明变量,w为说明变量的系数,w0为常数项。
[数1]
可以将由判别式获得的值称为判别得分,将新给予的数据集的测定值作为说明变量代入该判别式,以判别得分的符号判别分组。
作为线性判别分析的一种的Fisher的判别分析是用于选择适于进行类别判别(class discrimination)的维度的维度减少法,着眼于复合变量的方差,通过将具有相同标签的数据的方差最小化从而构成判别力高的复合变量(Venables,W.N.等著,ModernApplied Statistics with S.Fourth edition.Springer.,2002年)。Fisher的判别分析中求出使式2为最大那样的投影方向w。这里,μ为输入的平均,ng为属于类别g的数据数,μg为属于类别g的数据的输入的平均。分子、分母分别为将数据投影到向量w的方向时的组间方差、组内方差,通过将该比最大化而求出判别式系数wi(金森敬文等著,“パターン認識”,共立出版(2009年),Richard O.等著,Pattern Classification Second Edition.,Wiley-Interscience,2000年)。
[数2]
其中,使满足
马氏距离由考虑了数据相关的式3算出,可以用作将各组的马氏距离近的组作为所属组进行判别的非线性判别分析。这里,μ为各组的中心向量,S-1为该组的方差协方差矩阵的逆矩阵。中心向量由说明变量x算出,可以使用均值向量、中心值向量等。
[数3]
所谓SVM,是V.Vapnik考察了的判别分析法(The Nature of StatisticalLeaning Theory,Springer,1995年)。将要分类的分组已知的数据集的特定的数据项目作为说明变量,将要分类的分组作为目标变量,确定用于将该数据集正确地分类于已知的分组的被称为超平面的边界面,确定使用该边界面分类数据的判别式。而且该判别式通过将新给予的数据集的测定值作为说明变量代入该判别式,从而可以判别分组。此外,此时的判别结果可以为要分类的组,也可以为可分类于要分类的组的概率,也可以为距超平面的距离。对于SVM,作为用于应对非线性的问题的方法,已知将特征向量向高维度非线性变换,在该空间进行线性判别的方法。将非线性映射的空间中的二个要素的内积仅通过各自原来空间的输入来表现那样的算式称为核(kernel),作为核的一例,可举出线性核、RBF(径向基函数,Radial Basis Function)核、高斯核。通过核来映射到高维度,并且实际上避开被映射的空间的特征的计算而仅通过核的计算来构成最佳的判别式,即判别式(例如,麻生英树等著,統計科学のフロンテイア6“パターン認識と学習の統計学新しい概念と手法”,岩波书店(2004年),Nello Cristianini等著,SVM入门,共立出版(2008年))。
作为SVM法的一种的C-支持向量分类(C-support vector classification(C-SVC))是以2组的说明变量进行学习来制作超平面,判别未知的数据集分类于哪个组(C.Cortes等,1995年,Machine Learning,20卷,p273-297)。
以下示出本发明的方法中能够使用的C-SVC的判别式的算出例。首先,将全部受试体分组成大肠癌患者和健康体这2组。为了判断受试体为大肠癌患者或为健康体,可以使用例如大肠组织检查。
接下来,准备由分开的2组的血清来源的检体的全基因表达量组成的数据集(以下,学习检体组),确定将在该2组之间基因表达量可见明确差异的基因设为说明变量、将该分组设为目标变量(例如-1和+1)的C-SVC的判别式。式4为最优化的目标函数,这里,e表示全部的输入向量,y表示目标变量,a表示Lagrange未定乘数向量,Q表示正定值矩阵,C表示调整限制条件的参数。
[数4]
其中,使满足y
式5为最终获得的判别式,可以由通过判别式获得的值的符号确定所属的组。这里,x为支持向量,y为显示组的所属的标签,a为对应的系数,b为常数项,K为核函数。
[数5]
作为核函数,可以使用例如由式6定义的RBF核。这里,x表示支持向量,γ表示调整超平面的复杂度的核参数。
[数6]
K(x
除了这些以外,作为确定或评价受试体来源的检体包含和/或不含大肠癌来源的靶基因的表达、或将其表达量与健康体来源的对照进行比较并评价的方法,可以选择神经网络、k-近邻法、决策树、逻辑回归分析等方法。
本发明的方法可以包括例如下述步骤(a)、(b)和(c):
(a)使用本发明的检测用多核苷酸、试剂盒或装置(例如DNA芯片)测定作为大肠癌患者来源的包含大肠癌来源基因的组织和/或健康体来源的不含大肠癌来源基因的组织已经知晓的检体中的靶基因的表达量的步骤,
(b)由通过(a)测得的表达量的测定值,作出上述式1~3、5和6的判别式的步骤,
(c)使用本发明的检测用多核苷酸、试剂盒或装置(例如,DNA芯片)测定受试体来源的检体中的该靶基因的表达量,在由(b)作出的判别式中代入测定值,基于所得的结果来确定或评价检体包含和/或不含大肠癌来源的靶基因、或将其表达量与健康体来源的对照进行比较并评价的步骤。
这里,式1~3、5和6的式中的x为说明变量,包含通过测定选自上述2节所记载的多核苷酸类中的多核苷酸或其片段等而得的值,具体而言用于判别本发明的大肠癌患者和健康体的说明变量是由例如下述(1)~(3)选择的基因表达量。
(1)通过包含在序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或其互补序列中15个以上连续碱基的DNA的任一者测定的大肠癌患者或健康体的血清中的基因表达量。
(2)通过包含在序列号172~180的任一项所示的碱基序列或其互补序列中15个以上连续碱基的DNA的任一者测定的大肠癌患者或健康体的血清中的基因表达量。
(3)通过包含在序列号181~194的任一项所示的碱基序列或其互补序列中15个以上连续碱基的DNA的任一者测定的大肠癌患者或健康体的血清中的基因表达量。
如以上所示,作为确定或评价受试体来源的检体包含和/或不含大肠癌来源的基因的方法,判别式的作出需要由学习检体组作出的判别式,为了提高该判别式的判别准确度,需要将在学习检体组中的2组间具有明确差异的基因用于判别式。
此外,判别式的说明变量所使用的基因的确定优选如下进行。首先,将作为学习检体组的大肠癌患者组的全基因表达量和健康体组的全基因表达量作为数据集,利用作为参数分析的t检验的P值、作为非参数分析的Mann-Whitney的U检验的P值、或Wilcoxon检验的P值等,求出该2组间的各基因的表达量的差的大小。
在通过检验获得的P值的危险度(显著性水平)为例如小于5%、1%或0.01%的情况下可以视为统计学上显著。
为了校正起因于重复进行检验的第一类错误的概率的增大,可以通过公知的方法,例如Bonferroni、Holm等的方法进行校正(例如,永田靖等著,“統計的多重比較法の基礎”,Scientist公司(2007年))。如果例示Bonferroni校正,则例如将通过检验而得的P值乘以检验的重复次数即解析所用的基因数,与所期望的显著性水平进行比较,从而可以抑制检验整体中的发生第一类错误的概率。
此外,不是检验,而是在大肠癌患者组的基因表达量与健康体组的基因表达量之间,算出各自的基因表达量的中值的表达比的绝对值(Fold change),可以选择判别式的说明变量所使用的基因。此外,可以使用大肠癌患者组和健康体组的基因表达量来作出ROC曲线,将AUROC值作为基准选择判别式的说明变量所使用的基因。
接下来,使用这里所求出的基因表达量的差大的任意个数的基因,作出可以通过上述各种方法算出的判别式。作为构建获得最大判别准确度的判别式的方法,例如有下述方法:以满足P值的显著性水平的基因的所有组合构建判别式的方法;将为了作出判别式所使用的基因以基因表达量的差大的顺序一个一个增加的同时重复进行评价的方法等(Furey TS.等,2000年,Bioinformatics.,16卷,p906-14)。对于该判别式,将其它独立的大肠癌患者或健康体的基因表达量代入说明变量,对该独立的大肠癌患者或健康体算出所属的组的判别结果。即,通过以独立的检体组对找到的诊断用基因集(gene set)和使用诊断用基因集而构建的判别式进行评价,可以找到更普遍的可以检测大肠癌的诊断用基因集和判别大肠癌的方法。
此外,该判别式的判别性能(泛化性)的评价中优选使用分割样品(Split-sample)法。即,将数据集分成学习检体组和测试检体组,在学习检体组中通过统计学检验进行基因的选择和判别式作出,使用利用该判别式判别了测试检体组的结果和测试检体组所属的真的组算出准确度、敏感度、特异度,评价判别性能。另一方面,还可以不分割数据集,使用全部检体通过统计学检验进行基因的选择和判别式作出,将新准备的检体用该判别式判别来算出准确度、敏感度、特异度,评价判别性能。
本发明提供大肠癌的诊断和治疗中有用的检测用或疾病诊断用多核苷酸、使用了该多核苷酸的大肠癌的检测方法、以及包含该多核苷酸的大肠癌的检测试剂盒以及装置。特别是,为了实施显示超过利用现有肿瘤标志物CEA的大肠癌诊断法的准确度的诊断用基因的选定和判别式的作出,在本发明的方法中,例如,将虽然通过CEA判断为阴性但是通过使用了造影剂的计算机断层扫描等精密检查而最终明确了大肠癌存在的患者来源的血清中的表达基因、与大肠癌不存在的患者来源的血清中的表达基因进行比较,可以构建显示超过CEA的准确度的诊断用基因集和判别式。
例如,将上面所记载那样的基于序列号1~171和606~614的任一项所示的碱基序列或其互补序列的1个或2个以上的上述多核苷酸、以及根据情况基于序列号172~180的任一项所示的碱基序列或其互补序列的1个或2个以上的上述多核苷酸、以及根据情况基于序列号181~194的任一项所示的碱基序列或其互补序列的1个或2个以上的上述多核苷酸、的任意组合设为诊断用基因集。进一步,使用组织诊断的诊断结果为I级的大肠癌患者来源的检体、组织诊断的诊断结果为II级的健康体来源的检体中的该诊断用基因集的表达量来构建判别式。其结果是通过测定未知的检体的该诊断用基因集的表达量,从而可以以最高100%的准确度区分未知的检体包含大肠癌来源基因或不含大肠癌来源基因。
实施例
通过以下的实施例来进一步具体地说明本发明。然而,本发明的范围不受该实施例的限制。
[参考例1]
<大肠癌患者与健康体的检体的采集>
由获得了知情同意的健康体100人和确认不到大肠癌以外的原发癌症的大肠癌患者34人(I期为15例、IIA期为6例、IIIA期为4例、IIIB期为6例、IIIC期为2例、IV期为1例),使用Venoject II真空采血管VP-AS109K60(Terumo株式会社)分别采集血清,作为学习检体组。同样地,由获得了知情同意的健康体50人和确认不到大肠癌以外的原发癌症的大肠癌患者16人(I期为3例、IIA期为4例、IIB期为1例、IIIB期为2例、IIIC期为2例、IV期为4例),使用Venoject II真空采血管VP-AS109K60(Terumo株式会社)分别采集血清,作为测试检体组。
<总RNA的提取>
从使作为检体的上述学习检体组、测试检体组合并而由健康体150人和大肠癌患者50人的合计200人分别获得的血清300μL,使用3D-Gene(注册商标)来自液体样品的RNA提取用试剂的试剂盒(RNA extraction reagent from liquid sample kit)(东丽株式会社)中的RNA提取用试剂,按照该公司制定的说明书方案(protocol)获得了总RNA。
<基因表达量的测定>
相对于使作为检体的上述学习检体组、测试检体组合并而由健康体150人和大肠癌患者50人的合计200人的血清获得的总RNA,使用3D-Gene(注册商标)miRNA Labelingkit(东丽株式会社),基于该公司制定的说明书方案(ver2.20),将miRNA进行了荧光标记。作为寡DNA芯片,使用搭载了具有与miRBase版本20所登录的miRNA中的2,555种miRNA互补的序列的探针的3D-Gene(注册商标)Human miRNA Oligo芯片(东丽株式会社),基于该公司制定的说明书方案在严格条件下,进行了总RNA中的miRNA与DNA芯片上的探针的杂交和杂交后的洗涤。使用3D-Gene(注册商标)扫描仪(东丽株式会社)来扫描DNA芯片,取得图像,利用3D-Gene(注册商标)Extraction(东丽株式会社)将荧光强度进行了数值化。将数值化了的荧光强度转换为底为2的对数值而设为基因表达量,减去空白值,缺失值用从各DNA芯片中的基因表达量的最小值的对数值减去了0.1后的值替换。其结果是获得了对大肠癌患者50人的血清和健康体150人的血清的、全miRNA的基因表达量。使用了数值化了的miRNA的基因表达量的计算和统计分析使用R语言3.0.2(R Development Core Team(2013).R:Alanguage and environment for statistical computing.R Foundation forStatistical Computing,URL http://www.R-project.org/)和MASS package7.3-30(Venables,W.N.&Ripley,B.D.(2002)Modern Applied Statistics with S.FourthEdition.Springer,New York.ISBN 0-387-95457-0)来实施。
[参考例2]
<大肠癌以外的癌症的检体的采集>
由获得了知情同意的其它脏器确认不到癌症的胰腺癌患者69人、胆道癌患者66人、胃癌患者30人、食道癌患者33人、肝癌患者32人和胰腺胆道良性疾病患者15人,使用Venoject II真空采血管VP-AS109K60(Terumo株式会社)分别采集血清,与参考例1的大肠癌患者34人和健康体103人合并,作为学习检体组。同样地,由获得了知情同意的其它脏器确认不到癌症的胰腺癌患者30人、胆道癌患者33人、胃癌患者20人、食道癌患者17人、肝癌患者20人和胰腺胆道良性疾病患者6人,使用Venoject II真空采血管VP-AS109K60(Terumo株式会社)分别采集血清,与参考例1的大肠以外的脏器确认不到癌症的大肠癌患者16人、健康体47人合并,作为测试检体组。以下的操作与参考例1同样地进行。
[实施例1]
<使用了学习检体组的检体的基因标志物的选定和使用了测试检体组的检体的单独的基因标志物的大肠癌判别性能的评价方法>
本实施例研究了,由学习检体组选定用于将大肠癌与健康体进行判别的基因标志物,在与学习检体组独立的测试检体组的检体中对选定的基因标志物,分别评价单独的大肠癌判别性能的方法。
具体而言,首先,使由上述参考例获得的学习检体组和测试检体组的miRNA表达量合并,以分位数归一化(quantile normalization)进行了归一化。
接下来,使用学习检体组进行诊断用基因的选定。这里,为了获得可靠性更高的诊断标志物,仅选择在学习检体组的大肠癌患者组或学习检体组的健康体组的任一组中,50%以上的检体具有2的6次方以上的基因表达量的基因。进一步作为用于判别大肠癌患者组和健康体组的具有统计显著性的基因,对各自的基因表达量将通过假设等方差的双侧t检验获得的P值进行Bonferroni校正,获得满足p<0.01的基因作为判别式的说明变量所使用的基因标志物,记载于表2。
这样操作,发现了hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-3131、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-7641、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-6857-5p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-4792、hsa-miR-564、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-4665-3p、hsa-miR-4467、hsa-miR-3188、hsa-miR-6125、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-1228-3p、hsa-miR-8063、hsa-miR-8069、hsa-miR-6875-5p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-5572、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-6515-3p、hsa-miR-3937、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-7109-5p、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-4442、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-4449、hsa-miR-4706、hsa-miR-1913、hsa-miR-602、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-711、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-6721-5p、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6132、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-3679-3p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-1249、hsa-miR-937-5p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-4281、hsa-miR-4734、hsa-miR-6766-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-4513、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-6845-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-3620-5p、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-940、hsa-miR-4450、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-1469、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-7975、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-6802-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-663b、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-2861、hsa-miR-6088、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-671-5p、hsa-miR-4454、hsa-miR-4516、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-6805-3p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-4688、hsa-miR-6850-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-7106-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-6131、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4532、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-3656、hsa-miR-3621、hsa-miR-6769b-5p、hsa-miR-149-3p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-6848-5p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-4327、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-6716-5p、hsa-miR-6877-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-614、hsa-miR-1202、hsa-miR-575、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-4675、hsa-miR-6075、hsa-miR-6779-5p、hsa-miR-4271、hsa-miR-3196、hsa-miR-6803-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-4648、hsa-miR-4508、hsa-miR-4749-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-5698、hsa-miR-1199-5p和hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-1231、hsa-miR-1233-5p、hsa-miR-150-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-128-2-5p和hsa-miR-24-3p基因、和与它们相关的由序列号1~180的碱基序列组成的多核苷酸。
其中,作为检查大肠癌的有无的标志物而新发现的基因是由序列号1~171所表示的碱基序列组成的多核苷酸。
进一步,将这些基因的表达量作为指标,通过Fisher的判别分析作出判别大肠癌的有无的判别式。即,将学习检体组中发现的由序列号1~180的任一项所示的碱基序列组成的多核苷酸输入到式2作出判别式,将算出的准确度、敏感度、特异度示于表3。此外将此时的判别式系数和常数项示于表4。
使用由上述作出的判别式算出测试检体组中的准确度、敏感度、特异度,将选定的多核苷酸的判别性能用独立的检体进行了验证(表3)。例如,将序列号1所示的碱基序列的表达量测定值在学习检体组的健康体(100人)和大肠癌患者(34人)中进行了比较的情况下,显示大肠癌患者组相对于健康体组的基因表达量的测定值显著低(参照图2左),进一步该结果即使是在测试检体组的健康体(50人)和大肠癌患者(16人)中也可以再现(参照图2右)。同样地在序列号2~180所示的其它多核苷酸中,也获得了大肠癌患者组相对于健康体组的基因表达量的测定值显著低(-)或高(+)的结果(表2),这些结果可以在测试检体组中进行验证。此外,例如关于该序列号1所示的碱基序列,使用学习检体组中设定的判别两组的阈值(9.43)算出测试检体组中的大肠癌检测的命中率,结果真阳性16例、真阴性50例、假阳性0例、假阴性0例,由这些值作为检测性能,获得了准确度100%、敏感度100%、特异度100%。这样算出序列号1~180所示的全部多核苷酸的检测性能,记载于表3。
例如,由序列号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、49、50、51、52、53、55、56、57、58、59、60、61、62、63、65、66、67、68、69、71、72、73、74、76、77、78、79、80、81、83、84、86、87、88、90、92、93、95、96、97、99、100、101、102、107、109、110、111、113、114、115、118、120、122、124、126、134、136、142、153、172、173和175所示的碱基序列组成的110个多核苷酸在测试检体组中分别显示敏感度100%、100%、100%、75%、93.8%、75%、87.5%、75%、93.8%、68.8%、81.2%、100%、75%、50%、75%、75%、68.8%、75%、81.2%、81.2%、75%、62.5%、75%、56.2%、75%、68.8%、56.2%、62.5%、68.8%、75%、68.8%、68.8%、56.2%、68.8%、62.5%、68.8%、62.5%、50%、56.2%、56.2%、56.2%、75%、50%、68.8%、68.8%、68.8%、50%、56.2%、62.5%、62.5%、50%、62.5%、68.8%、56.2%、56.2%、43.8%、75%、62.5%、62.5%、56.2%、62.5%、62.5%、56.2%、62.5%、56.2%、56.2%、56.2%、56.2%、43.8%、43.8%、50%、68.8%、56.2%、62.5%、62.5%、43.8%、62.5%、56.2%、62.5%、62.5%、50%、56.2%、43.8%、50%、43.8%、50%、43.8%、56.2%、43.8%、50%、50%、50%、50%、50%、50%、43.8%、50%、43.8%、50%、50%、50%、43.8%、43.8%、50%、43.8%、43.8%、50%、81.2%、68.8%和56.2%(表3)。这里,根据后述的比较例,测试检体组中的现有标志物CEA的敏感度为43.75%(表5-1、5-2),因此可以证明,在测试检体组中,由序列号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、49、50、51、52、53、55、56、57、58、59、60、61、62、63、65、66、67、68、69、71、72、73、74、76、77、78、79、80、81、83、84、86、87、88、90、92、93、95、96、97、99、100、101、102、107、109、110、111、113、114、115、118、120、122、124、126、134、136、142、153、172、173和175所示的碱基序列组成的110个多核苷酸单独以高于CEA的敏感度来判别大肠癌。
此外,由例如序列号1、2、3、10、14、17、21、23、32、36、47、59、65、101所示的碱基序列组成的14个多核苷酸可以将测试检体组所包含的1期的大肠癌3检体全部正确地判别为大肠癌。因此这些多核苷酸还可以检测早期的大肠癌,对于大肠癌的早期诊断有贡献。
进一步,由例如序列号1、2、3、5、7、10、14、39、46、73、81、148所示的碱基序列组成的12个多核苷酸可以将便潜血检查中被认为难以检测的大肠上部的癌症,即测试检体组中的盲肠癌1例、升结肠癌3例全部正确地判别为大肠癌。因此这些多核苷酸可以不限定于发生大肠癌的部位而检测大肠癌。
[实施例2]
<使用了测试检体组检体的多个基因标志物的组合的大肠癌判别性能的评价方法>
本实施例研究了,使实施例1中选定的基因标志物组合来评价大肠癌判别性能的方法。具体而言,对于包含至少1个以上在实施例1中选出的由序列号1~180所示的碱基序列组成的多核苷酸中的新发现的由序列号1~171所示的碱基序列组成的多核苷酸的任一表达量测定值的2个多核苷酸的16,074种组合,进行Fisher的判别分析,构建判别大肠癌有无存在的判别式。接下来,使用由上述作出的判别式来算出测试检体组中的准确度、敏感度、特异度,将选定的多核苷酸的判别性能用独立的检体进行了验证。
例如,将序列号1和序列号2所示的碱基序列的表达量测定值在学习检体组的健康体(100人)和大肠癌患者(34人)中进行了比较的情况下,获得健康体组和大肠癌患者组的基因表达量的测定值显著分离的散点图(参照图3左),进一步该结果在测试检体组的健康体(50人)和大肠癌患者(16人)中也可以再现(参照图3右)。同样地,包含至少1个以上由序列号1~180所示的碱基序列组成的多核苷酸中的新发现的由序列号1~171所示的碱基序列组成的多核苷酸的任一表达量测定值的2个的其它组合中,也获得了将健康体组和大肠癌患者组的基因表达量的测定值显著分离的散点图,这些结果可以在测试检体组中进行验证。此外,例如关于该序列号1和序列号2所示的碱基序列,使用学习检体组中设定的判别两组的函数(0=1.26x+y-18.06)来算出大肠癌检测的命中率,结果真阳性16例、真阴性50例、假阳性0例、假阴性0例,由这些值获得了作为检测性能的准确度100%、敏感度100%、特异度100%。这样操作,算出包含至少1个以上由序列号1~180所示的碱基序列组成的多核苷酸中的新发现的由序列号1~171所示的碱基序列组成的多核苷酸的任一表达量测定值的2个的全部组合种类的检测性能。其中,作为例子,对于包含由序列号1所示的碱基序列组成的多核苷酸的表达量测定值的179种组合及其检测性能,记载于表6。例如,对于由序列号1与序列号2、序列号1与序列号3、序列号1与序列号4以及序列号1与序列号5所示的碱基序列组成的多核苷酸的表达量测定值的组合,在测试检体组中全部显示敏感度为100%(表6)。进一步,作为例子,将由序列号1以外的碱基序列组成的2个多核苷酸的组合记载于表7。例如,作为具体的2个多核苷酸的组合,序列号5与6、序列号5与11、序列号5与38、序列号15与16、序列号15与21、序列号15与64、序列号24与25、序列号24与30、序列号24与32、序列号2与32、序列号32与36、序列号15与32、序列号3与38、序列号38与39、序列号38与64、序列号3与45、序列号45与58、序列号45与64、序列号2与55、序列号6与55、序列号55与64、序列号2与64、序列号4与64、序列号2与96、序列号7与96、序列号96与97、序列号2与97、序列号3与97、序列号5与97、序列号2与162、序列号3与162、序列号5与162所示的组合在学习检体组和验证检体组的两检体组中显示出判别大肠癌患者和健康体的准确度75%以上。这样高于作为现有标志物的CEA的敏感度(根据表5-2为43.8%)的2个多核苷酸的表达量测定值的组合在测试检体组中获得了14,598种组合,在该组合中,在实施例1中获得的表2所记载的碱基序列1~180的全部使用了至少1次。即,可以证明在由序列号1~180所示的碱基序列组成的多核苷酸2个组合使用的情况下,也能够以比现有标志物优异的性能进行大肠癌的判别。
通过将由序列号1~180所示的碱基序列组成的多核苷酸的表达量测定值3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或10个以上的个数进行组合,从而获得以进一步优异的敏感度检测大肠癌的标志物。例如,对于在实施例1中选出的由序列号1~180所示的碱基序列组成的多核苷酸中的新发现的由序列号1~171所示的碱基序列组成的多核苷酸,获得测试检体组中的健康体组与大肠癌群之间测得的表达量值,以显示组间差的统计显著性的Student t检验(Student’s t-test)中的P值的降顺对全部多核苷酸进行排序(P值最低的作为1位),从上位的多核苷酸开始1个1个加到组合中,从而评价1个~多个多核苷酸的组合的大肠癌检测敏感度。即,该评价中的多核苷酸的组合的顺序如果以序列号表示,则为从表2所示的序列号171开始以170、169的顺序依次回溯的顺序。其结果是测试检体组中的敏感度在1个多核苷酸(序列号171)时为12.5%,2个多核苷酸(序列号170和171)时为18.8%,4个多核苷酸(序列号168~171)时为25.0%,5个多核苷酸(序列号167~171)时为31.2%,7个多核苷酸(序列号165~171)时为37.5%,10个多核苷酸(序列号序列号162~171)时为87.5%,20个多核苷酸(序列号152~171)时为100%,30个多核苷酸(序列号142~171)时为100%,80个多核苷酸(序列号92~171)时为100%,170个多核苷酸(序列号2~171)时为100%,171个多核苷酸(序列号1~171)时为100%。
即显示,与单独的多核苷酸或更少数的多核苷酸相比,使多个多核苷酸组合的情况能够获得更高的大肠癌判别性能。这里,多个多核苷酸的组合不限定于如上述那样以统计显著性差异的顺序组合的情况,无论使用怎样的多个多核苷酸的组合,都可以用于大肠癌的检测。
由这些结果可以说,由序列号1~180所示的碱基序列组成的全部多核苷酸是优异的大肠癌的检测用标志物。
[表2]
[表3]
[表4]
[表5-1]
学习检体组
[表5-2]
测试检体组
[表6]
[表7]
[实施例3]
<使用了全部检体的情况下的基因标志物的选定以及获得的基因标志物的大肠癌判别性能的评价方法>
本实施例中,将上述实施例1和实施例2中使用的学习检体组和测试检体组的检体集中而使用全部检体,进行基因标志物的选定以及其大肠癌判别性能评价。
具体而言,对于对上述参考例中获得的大肠癌患者50人的血清和健康体150人的血清的miRNA表达量,以分位数归一化(quantile normalization)进行了规一化。为了获得可靠性更高的诊断标志物,基因标志物的选定时仅选择在大肠癌患者组或健康体组的任一者中50%以上的检体具有2的6次方以上的基因表达量的基因。进一步为了获得用于判别大肠癌患者组与健康体组的统计显著性,对各自的基因表达量将通过假设等方差的双侧t检验获得的P值进行Bonferroni校正,选择满足p<0.01的基因作为判别式的说明变量所使用的基因标志物记载于表8。这样,除了表2所记载的基因以外,还发现了hsa-miR-4697-5p、hsa-miR-3197、hsa-miR-675-5p、hsa-miR-4486、hsa-miR-7107-5p、hsa-miR-23a-3p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-8059、hsa-miR-6813-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-4476和hsa-miR-6090基因、与它们相关的序列号181~194的碱基序列。与序列号1~180的碱基序列同样地,在序列号181~194所示的多核苷酸中,也获得了大肠癌患者组相对于健康体组的基因测定值显著低(-)或高(+)的结果(表8),这些结果可以在测试检体组中进行验证。因此,通过将表8所记载的基因表达量的测定值单独使用或与表2所记载的基因表达量的测定值组合使用,从而可以通过实施例1和实施例2所记载的方法判别新获得的检体。
[表8]
[实施例4]
<使用了测试检体组检体的多个基因标志物的组合的大肠癌特异性的判别性能的评价方法>
本实施例中,使用实施例1中选定的基因标志物,将参考例2所记载的检体组的学习检体组作为对象,通过与实施例1所记载的方法同样的方法,将大肠癌患者与由健康体、胰腺癌患者、胆道癌患者、胃癌患者、食道癌患者、肝癌患者和胰腺胆道良性疾病患者组成的对照组的血清中的miRNA的基因表达量进行比较,选择诊断用基因。其结果是研究出将选择出的由序列号606~614所示的碱基序列组成的多核苷酸进一步组合来评价大肠癌特异性的判别性能的方法。
具体而言,首先,使由上述参考例2获得的学习检体组和测试检体组的miRNA表达量合并,以分位数归一化(quantile normalization)进行了规一化。接下来,对于包含至少1个以上由序列号1~171、606~614所示的碱基序列组成的多核苷酸的任一表达量测定值的1~6个的组合,进行Fisher的判别分析,构建判别大肠癌有无存在的判别式。接下来,将大肠癌患者组作为阳性检体组,另一方面,将健康体组、胰腺癌患者组、胆道癌患者组、胃癌患者组、食道癌患者组、肝癌患者组和胰腺胆道良性疾病患者组作为阴性检体组,使用由上述作出的判别式算出测试检体组中的准确度、敏感度、特异度,将选定的多核苷酸的判别性能用独立的检体进行了验证。
由上述序列号(与表1的miRNA标志物对应的、序列号1~194和606~614)所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸大多数在大肠癌有无存在的判别中可以提供比较高的准确度、敏感度、特异度,而且能够将大肠癌与其它癌症特异性地识别。作为能够与靶标志物特异性结合的多核苷酸,例如,选自由序列号5、13、15、24、32、38、41、45、55、57、64、72、75、77、96、97、115、162、163、173、189、606、607、608、609、610、611、612、613和614所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸构成的群(癌症种类特异性多核苷酸群1)中的多个多核苷酸的组合中,包含至少1个以上选自由癌症种类特异性多核苷酸群1所包含的、序列号5、45、57、96和606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸构成的群(癌症种类特异性多核苷酸群2)中的多核苷酸的组合能够高准确度地将大肠癌与其它癌症特异性地识别。
作为上述具有癌症种类特异性的多核苷酸的组合的个数,能够组合1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或10个以上的个数,在6个以上的组合中可以显示判别准确度90%以上。
具体而言,将使用由序列号5所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸来测定的情况下的判别准确度示于表9-1。在使用包含至少1个由序列号5所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的1个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为90.1%,测试检体组中显示准确度为87.6%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号5所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的2个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为91.7%,测试检体组中显示准确度为88.8%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号5所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的3个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为94.0%,测试检体组中显示准确度为91.2%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号5所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的4个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为95.6%,测试检体组中显示准确度为93.6%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号5所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的5个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为96.4%,测试检体组中显示准确度为94.8%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号5所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的6个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为96.9%,测试检体组中显示准确度为94.7%。
此外进一步,将使用由序列号45所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸来测定的情况下的判别准确度示于表9-2。在使用包含至少1个由序列号45所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的1个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为56.7%,测试检体组中显示准确度为55.4%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号45所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的2个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为90.7%,测试检体组中显示准确度为88.4%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号45所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的3个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为94.0%,测试检体组中显示准确度为89.6%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号45所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的4个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为95.2%,测试检体组中显示准确度为91.6%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号45所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的5个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为96.4%,测试检体组中显示准确度为94.4%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号45所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的6个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为97.6%,测试检体组中显示准确度为92.6%。
此外进一步,将使用由序列号57所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸来测定的情况下的判别准确度示于表9-3。在使用包含至少1个由序列号57所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的1个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为60.2%,测试检体组中显示准确度为60.6%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号57所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的2个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为86.7%,测试检体组中显示准确度为83.7%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号57所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的3个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为92.4%,测试检体组中显示准确度为90.0%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号57所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的4个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为95.2%,测试检体组中显示准确度为91.2%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号57所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的5个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为96.2%,测试检体组中显示准确度为94.8%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号57所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的6个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为96.9%,测试检体组中显示准确度为93.6%。
此外进一步,将使用由序列号96所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸来测定的情况下的判别准确度示于表9-4。在使用包含至少1个由序列号96所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的1个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为57.9%,测试检体组中显示准确度为59.4%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号96所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的2个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为85.9%,测试检体组中显示准确度为83.7%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号96所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的3个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为92.6%,测试检体组中显示准确度为90.4%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号96所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的4个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为94.4%,测试检体组中显示准确度为91.2%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号96所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的5个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为96.0%,测试检体组中显示准确度为94.0%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号96所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的6个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为96.3%,测试检体组中显示准确度为93.6%。
此外进一步,将使用由序列号606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸来测定的情况下的判别准确度示于表9-5。在使用包含至少1个由序列号606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的1个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为59.4%,测试检体组中显示准确度为58.6%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的2个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为86.6%,测试检体组中显示准确度为82.9%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的3个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为92.6%,测试检体组中显示准确度为91.2%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的4个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为94.8%,测试检体组中显示准确度为90.0%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的5个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为96.0%,测试检体组中显示准确度为93.6%。此外,例如,在使用包含至少1个由序列号606所示的碱基序列或其互补序列组成的多核苷酸的6个的组合来测定的情况下,学习检体组中显示准确度最高为95.3%,测试检体组中显示准确度为93.6%。
进一步此外,使用序列号5、45、57、75、162、607所示的碱基序列的表达量测定值,将学习检体组的大肠癌患者34人、健康体103人、胰腺癌患者69人、胆道癌患者66人、胃癌患者30人、食道癌患者33人、肝癌患者32人和胰腺胆道良性疾病患者15人进行了比较的情况下,学习检体组中,获得了大肠癌患者组与其它组的判别得分显著分离的散点图(参照图4上图),进一步该结果在测试检体组中也可以再现(参照图4下图)。
[表9-1]
[表9-2]
[表9-3]
[表9-4]
[表9-5]
[比较例1]
<现有血中肿瘤标志物的大肠癌判别性能>
对于上述参考例中获得的学习检体组和测试检体组,测定现有的肿瘤标志物CEA的血中浓度。这些肿瘤标志物原则上如果血中浓度比非专利文献4所记载的基准值(CEA为5ng/mL)高,则认为有癌症的嫌疑。因此,对每一个检体都确认CEA的血中浓度是否超过基准值,其结果是断定是否将大肠癌患者判定为癌症,算出学习检体组和测试检体组中的各现有标志物的敏感度。将该结果示于表5-1、5-2。CEA的敏感度在学习检体组中为26.5%,在测试检体组中仅为43.8%,可知在大肠癌的检测中不是有用的(表5-1、5-2)。
另一方面,如上述实施例1和实施例2的表3和表6所示那样,由序列号1~180所示的碱基序列组成的全部多核苷酸存在显示现有大肠癌标志物以上的敏感度的1个或2个的组合,可以说是优异的诊断标志物。
如以上的实施例、比较例所示那样,根据本发明的试剂盒等和方法,可以与现有肿瘤标志物相比敏感度良好地检测大肠癌,因此能够早期发现大肠癌并进行治疗,其结果是还能够提供生存率的提高、对患者负担少的内窥镜手术这样的治疗选择。
产业可利用性
通过本发明,能够以简易并且便宜的方法,有效地检测大肠癌,因此能够进行大肠癌的早期发现、诊断和治疗。此外,通过本发明的方法,可以使用患者血液来低侵袭性地检测大肠癌,因此能够简便并且迅速地检测大肠癌。
将本说明书中引用的全部出版物、专利和专利申请直接作为参考并入本说明书中。
序列表
<110> 东丽株式会社
国立研究开发法人国立癌症研究中心
<120> 大肠癌的检测试剂盒或装置以及检测方法
<130> PH-6235-PCT
<150> JP 2014-122686
<151> 2014-06-13
<150> JP 2015-070182
<151> 2015-03-30
<160> 635
<170> PatentIn 版本 3.5
<210> 1
<211> 21
<212> RNA
<213> 人(Homo sapiens)
<400> 1
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ccccgggaac gucgagacug gagc 24
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ucacaccugc cucgcccccc 20
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ugagggaccc aggacaggag a 21
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<212> RNA
<213> 人
<400> 124
uagggguggg ggaauucagg ggugu 25
<210> 125
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 125
uaggggcagc agaggaccug gg 22
<210> 126
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 126
gugcggaacg cuggccgggg cg 22
<210> 127
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 127
acggggaguc aggcaguggu gga 23
<210> 128
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 128
ugggagggcg uggaugaugg ug 22
<210> 129
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 129
ugggaggagg ggaucuuggg 20
<210> 130
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 130
ugagcaccac acaggccggg cgc 23
<210> 131
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 131
ggcuggucag augggagug 19
<210> 132
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 132
ccccagggcg acgcggcggg 20
<210> 133
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 133
ccccggggag cccggcg 17
<210> 134
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 134
ugcggcagag cugggguca 19
<210> 135
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 135
uugaggagac augguggggg cc 22
<210> 136
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 136
acucggcugc gguggacaag u 21
<210> 137
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 137
ggcgggugcg ggggugg 17
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<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 138
cgcgggucgg ggucugcagg 20
<210> 139
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 139
uggugggugg ggaggagaag ugc 23
<210> 140
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 140
agggagggac gggggcugug c 21
<210> 141
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 141
aucacauugc cagggauuac c 21
<210> 142
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 142
ggcuggagcg agugcagugg ug 22
<210> 143
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 143
ugggggcugg gaugggccau ggu 23
<210> 144
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 144
agguggguau ggaggagccc u 21
<210> 145
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 145
ggcuugcaug ggggacugg 19
<210> 146
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 146
ucaccuggcu ggcccgccca g 21
<210> 147
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 147
ugggaauggg gguaagggcc 20
<210> 148
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 148
agggccgaag gguggaagcu gc 22
<210> 149
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 149
cucggggcag gcggcuggga gcg 23
<210> 150
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 150
ggauggagga ggggucu 17
<210> 151
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 151
gaacgccugu ucuugccagg ugg 23
<210> 152
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 152
gugccagcug caguggggga g 21
<210> 153
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 153
gagccaguug gacaggagc 19
<210> 154
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 154
ugggggagau ggggguuga 19
<210> 155
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 155
ugcagggguc gggugggcca gg 22
<210> 156
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 156
uucccagcca acgcacca 18
<210> 157
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 157
ugggcgaggg gugggcucuc agag 24
<210> 158
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 158
ggggcuguga uugaccagca gg 22
<210> 159
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 159
acggcccagg cggcauuggu g 21
<210> 160
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 160
cugggagggg cuggguuugg c 21
<210> 161
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 161
gggggaagaa aaggugggg 19
<210> 162
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 162
cggggcggca ggggccuc 18
<210> 163
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 163
cugggggugg ggggcugggc gu 22
<210> 164
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 164
guaggggcgu cccgggcgcg cggg 24
<210> 165
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 165
ugugggacug caaaugggag 20
<210> 166
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 166
gcggggcugg gcgcgcg 17
<210> 167
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 167
ugcggggaca ggccagggca uc 22
<210> 168
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 168
aggcugggcu gggacgga 18
<210> 169
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 169
ugggggagug cagugauugu gg 22
<210> 170
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 170
ccugagcccg ggccgcgcag 20
<210> 171
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 171
aggcaggggc uggugcuggg cggg 24
<210> 172
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 172
gugucugggc ggacagcugc 20
<210> 173
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 173
agugggaggc cagggcacgg ca 22
<210> 174
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 174
cugguacagg ccugggggac ag 22
<210> 175
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 175
ugagccccug ugccgccccc ag 22
<210> 176
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 176
ggguggggau uuguugcauu ac 22
<210> 177
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 177
ugaggggcag agagcgagac uuu 23
<210> 178
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 178
cgggcguggu gguggggg 18
<210> 179
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 179
gggggccgau acacuguacg aga 23
<210> 180
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 180
uggcucaguu cagcaggaac ag 22
<210> 181
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 181
agggggcgca gucacugacg ug 22
<210> 182
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 182
ggaggcgcag gcucggaaag gcg 23
<210> 183
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 183
uggugcggag agggcccaca gug 23
<210> 184
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 184
gcugggcgag gcuggca 17
<210> 185
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 185
ucggccuggg gaggaggaag gg 22
<210> 186
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 186
aucacauugc cagggauuuc c 21
<210> 187
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 187
acuggggagc agaaggagaa cc 22
<210> 188
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 188
aaaccguuac cauuacugag uu 22
<210> 189
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 189
guggguuggg gcgggcucug 20
<210> 190
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 190
ggggaacugu agaugaaaag gc 22
<210> 191
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 191
caggggcugg gguuucaggu ucu 23
<210> 192
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 192
ggggcugggc gcgcgcc 17
<210> 193
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 193
caggaaggau uuagggacag gc 22
<210> 194
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 194
ggggagcgag gggcggggc 19
<210> 195
<211> 61
<212> RNA
<213> 人
<400> 195
gggggcggga gcuggggucu gcagguucgc acugaugccu gcucgcccug ucucccgcua 60
g 61
<210> 196
<211> 86
<212> RNA
<213> 人
<400> 196
ggcuuagaaa cagucccuag guaggauuug gggaggagcu aagaagcccc uacagggccc 60
agaggugggg acugagccuu aguugg 86
<210> 197
<211> 61
<212> RNA
<213> 人
<400> 197
ucggcuggcg gggguagagc uggcugcagg cccggccccu cucagcugcu gcccucucca 60
g 61
<210> 198
<211> 79
<212> RNA
<213> 人
<400> 198
cagccugggg aaggcuuggc agggaagaca caugagcagu gccuccacuu cacgccucuc 60
ccuugucucc uuucccuag 79
<210> 199
<211> 63
<212> RNA
<213> 人
<400> 199
gagucgagga cugguggaag ggccuuuccc cucagaccaa ggcccuggcc ccagcuucuu 60
cuc 63
<210> 200
<211> 87
<212> RNA
<213> 人
<400> 200
guguggccgg caggcgggug ggcgggggcg gccgguggga accccgcccc gccccgcgcc 60
cgcacucacc cgcccgucuc cccacag 87
<210> 201
<211> 84
<212> RNA
<213> 人
<400> 201
gcuggcgucg gugcugggga gcggcccccg ggugggccuc ugcucuggcc ccuccugggg 60
cccgcacucu cgcucugggc ccgc 84
<210> 202
<211> 136
<212> RNA
<213> 人
<400> 202
ccgcuugccu cgcccagcgc agccccggcc gcugggcgca cccgucccgu ucguccccgg 60
acguugcucu cuaccccggg aacgucgaga cuggagcgcc cgaacugagc caccuucgcg 120
gaccccgaga gcggcg 136
<210> 203
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 203
cggcgacggc ggggugggug aggucgggcc ccaagacucg ggguuugccg ggcgccucag 60
uucaccgcgg ccg 73
<210> 204
<211> 69
<212> RNA
<213> 人
<400> 204
gggcuuaggg augggaggcc aggaugaaga uuaaucccua auccccaaca cuggccuugc 60
uauccccag 69
<210> 205
<211> 68
<212> RNA
<213> 人
<400> 205
cguggugagg auauggcagg gaaggggagu uucccucuau ucccuucccc ccaguaaucu 60
ucaucaug 68
<210> 206
<211> 61
<212> RNA
<213> 人
<400> 206
ucucguuuga ucucggaagc uaagcagggu ugggccuggu uaguacuugg augggaaacu 60
u 61
<210> 207
<211> 53
<212> RNA
<213> 人
<400> 207
guuugaucuc ggaagcuaag cagggucggg ccugguuagu acuuggaugg gag 53
<210> 208
<211> 63
<212> RNA
<213> 人
<400> 208
cuugcccggg agaaggaggu ggccuggaga gcugcugucu ccagccgccg ccugucucca 60
cag 63
<210> 209
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 209
gcgucaagau ggcggcgggg agguaggcag agcaggacgc cgcugcugcc gccgccaccg 60
ccgccuccgc uccagucgcc 80
<210> 210
<211> 63
<212> RNA
<213> 人
<400> 210
aauggguggg ugcugguggg agccgugccc uggccacuca uucggcucuc ucccucaccc 60
uag 63
<210> 211
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 211
cgggaaugcc gcggcgggga cggcgauugg uccguaugug uggugccacc ggccgccggc 60
uccgccccgg cccccgcccc 80
<210> 212
<211> 93
<212> RNA
<213> 人
<400> 212
gcuuguuggg gauuggguca ggccaguguu caagggcccc uccucuagua cucccuguuu 60
guguucugcc acugacugag cuucucccca cag 93
<210> 213
<211> 71
<212> RNA
<213> 人
<400> 213
gugucugugc cggucccagg agaaccugca gaggcaucgg gucagcggug cuccugcggg 60
ccgacacuca c 71
<210> 214
<211> 98
<212> RNA
<213> 人
<400> 214
uugggcaagg ugcggggcua gggcuaacag cagucuuacu gaagguuucc uggaaaccac 60
gcacaugcug uugccacuaa ccucaaccuu acucgguc 98
<210> 215
<211> 74
<212> RNA
<213> 人
<400> 215
gcagcccggu gagcgcucgc uggccuggca gugcgucgga agaacagggc ggguggggcc 60
gcgcacaucu cugc 74
<210> 216
<211> 94
<212> RNA
<213> 人
<400> 216
cgggcagcgg gugccaggca cggugucagc aggcaacaug gccgagaggc cggggccucc 60
gggcggcgcc guguccgcga ccgcguaccc ugac 94
<210> 217
<211> 67
<212> RNA
<213> 人
<400> 217
ccagaccccu ggggcugggc aggcggaaag aggucugaac ugccucugcc uccuuggucu 60
ccggcag 67
<210> 218
<211> 66
<212> RNA
<213> 人
<400> 218
gggcaugggg agguguggag ucagcauggg gcuaggaggc cccgcgcuga cccgccuucu 60
ccgcag 66
<210> 219
<211> 98
<212> RNA
<213> 人
<400> 219
cuuggucaau aggaaagagg ugggaccucc uggcuuuucc ucugcagcau ggcucggacc 60
uagugcaaug uuuaagcucc ccucucuuuc cuguucag 98
<210> 220
<211> 79
<212> RNA
<213> 人
<400> 220
cucgaggugc ugggggacgc gugagcgcga gccgcuuccu cacggcucgg ccgcggcgcg 60
uagcccccgc cacaucggg 79
<210> 221
<211> 63
<212> RNA
<213> 人
<400> 221
ugguggcggc gguaguuaug ggcuucucuu ucucaccagc agccccuggg ccgccgccuc 60
ccu 63
<210> 222
<211> 85
<212> RNA
<213> 人
<400> 222
ggcgccuccu gcucugcugu gccgccaggg ccuccccuag cgcgccuucu ggagaggcuu 60
ugugcggaua cggggcugga ggccu 85
<210> 223
<211> 96
<212> RNA
<213> 人
<400> 223
gcucuggggc gugccgccgc cgucgcugcc accuccccua ccgcuagugg aagaagaugg 60
cggaaggcgg agcggcggau cuggacaccc agcggu 96
<210> 224
<211> 63
<212> RNA
<213> 人
<400> 224
acccuagggu ggggcuggag guggggcuga ggcugagucu uccuccccuu ccucccugcc 60
cag 63
<210> 225
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 225
gugggcgggg gcaggugugu gguggguggu ggccugcggu gagcagggcc cucacaccug 60
ccucgccccc cag 73
<210> 226
<211> 81
<212> RNA
<213> 人
<400> 226
uagaggcagu uucaacagau guguagacuu uugauaugag aaauugguuu caaaaucagg 60
agucggggcu uuacugcuuu u 81
<210> 227
<211> 86
<212> RNA
<213> 人
<400> 227
cgccugagcg ugcagcagga caucuuccug accugguaau aauuagguga gaaggauggu 60
ugggggcggu cggcguaacu caggga 86
<210> 228
<211> 72
<212> RNA
<213> 人
<400> 228
gagucugagg gacccaggac aggagaaggc cuauggugau uugcauucuu ccugcccugg 60
cuccauccuc ag 72
<210> 229
<211> 68
<212> RNA
<213> 人
<400> 229
gaauggaaga agaaggcggu cggucugcgg gagccaggcc gcagagccau ccgccuucug 60
uccauguc 68
<210> 230
<211> 102
<212> RNA
<213> 人
<400> 230
uguguucccu auccuccuua ugucccaccc ccacuccugu uugaauauuu caccagaaac 60
aggagugggg ggugggacgu aaggaggaug ggggaaagaa ca 102
<210> 231
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 231
gagaaugggg ggacagaugg agaggacaca ggcuggcacu gagguccccu ccacuuuccu 60
ccuag 65
<210> 232
<211> 82
<212> RNA
<213> 人
<400> 232
ugagcuguug gauucggggc cguagcacug ucugagaggu uuacauuucu cacagugaac 60
cggucucuuu uucagcugcu uc 82
<210> 233
<211> 92
<212> RNA
<213> 人
<400> 233
cgcugcgcuu cugggcccgc ggcgggcgug gggcugcccg ggccggucga ccagcgcgcc 60
guagcucccg aggcccgagc cgcgacccgc gg 92
<210> 234
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 234
cgugugagcc cgcccugugc ccggcccacu ucugcuuccu cuuagcgcag gagggguccc 60
gcacugggag gggcccucac 80
<210> 235
<211> 90
<212> RNA
<213> 人
<400> 235
guggguacgg cccagugggg gggagaggga cacgcccugg gcucugccca gggugcagcc 60
ggacugacug agccccugug ccgcccccag 90
<210> 236
<211> 68
<212> RNA
<213> 人
<400> 236
cucaggcuca guggugcaug cuuauagucc cagccacucu ggaggcugaa ggaagauggc 60
uugagccu 68
<210> 237
<211> 86
<212> RNA
<213> 人
<400> 237
ggggcugggg guguggggag agagagugca cagccagcuc agggauuaaa gcucuuucuc 60
ucucucucuc ucccacuucc cugcag 86
<210> 238
<211> 109
<212> RNA
<213> 人
<400> 238
ggucgggcuc accaugacac agugugagac cucgggcuac aacacaggac ccgggcgcug 60
cucugacccc ucgugucuug uguugcagcc ggagggacgc agguccgca 109
<210> 239
<211> 75
<212> RNA
<213> 人
<400> 239
aagcaagacu gaggggccuc agaccgagcu uuuggaaaau agaaaagucu cgcucucugc 60
cccucagccu aacuu 75
<210> 240
<211> 110
<212> RNA
<213> 人
<400> 240
ggcuacaguc uuucuucaug ugacucgugg acuucccuuu gucauccuau gccugagaau 60
auaugaagga ggcugggaag gcaaagggac guucaauugu caucacuggc 110
<210> 241
<211> 137
<212> RNA
<213> 人
<400> 241
agccagacaa gagggucaug gggagucacu gucaacccag agcaggcacu gccccugcga 60
ccagccuggg gcaucgguug gggugcaggg gucugcuggu gaugcuuucc aucucuuugc 120
uuuguccuga uuguagc 137
<210> 242
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 242
gagggugggc gagggcggcu gagcggcucc aucccccggc cugcucaucc cccucgcccu 60
cucag 65
<210> 243
<211> 96
<212> RNA
<213> 人
<400> 243
cucgggaggg gcgggagggg gguccccggu gcucggaucu cgagggugcu uauuguucgg 60
uccgagccug ggucucccuc uuccccccaa cccccc 96
<210> 244
<211> 69
<212> RNA
<213> 人
<400> 244
ggcccucggg ccugggguug ggggagcucu guccugucuc acucauugcu ccuccccugc 60
cuggcccag 69
<210> 245
<211> 57
<212> RNA
<213> 人
<400> 245
cauuggaggg uguggaagac aucugggcca acucugaucu cuucaucuac cccccag 57
<210> 246
<211> 106
<212> RNA
<213> 人
<400> 246
agaagaaugc ccaaccagcc cucaguugcu acaguucccu guuguuucag cucgacaaca 60
acaggcggcu guagcaaugg ggggcuggau gggcaucuca augugc 106
<210> 247
<211> 71
<212> RNA
<213> 人
<400> 247
ugaccacccc cgggcaaaga ccugcagauc cccuguuaga gacgggccca ggacuuugug 60
cggggugccc a 71
<210> 248
<211> 69
<212> RNA
<213> 人
<400> 248
ccgggcaggc agguguaggg uggagcccac uguggcuccu gacucagccc ugcugccuuc 60
accugccag 69
<210> 249
<211> 67
<212> RNA
<213> 人
<400> 249
gugggagggg agaggcagca agcacacagg gccugggacu agcaugcuga ccucccuccu 60
gccccag 67
<210> 250
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 250
cugguguuug aggcgaugug gggauguaga gacaacuucc cagucucauu uccucauccu 60
gccaggccac cau 73
<210> 251
<211> 59
<212> RNA
<213> 人
<400> 251
cuccagggag acagugugug aggccucuug ccauggccuc ccugcccgcc ucucugcag 59
<210> 252
<211> 77
<212> RNA
<213> 人
<400> 252
gaguugggag guucccucuc caaauguguc uugauccccc accccaagac acauuuggag 60
agggacccuc ccaacuc 77
<210> 253
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 253
gucuccuggg gggaggagac ccugcucucc cuggcagcaa gccucuccug cccuuccaga 60
uuagc 65
<210> 254
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 254
agcccugggg guggucucua gccaaggcuc uggggucuca cccuuggcug gucucugcuc 60
cgcag 65
<210> 255
<211> 67
<212> RNA
<213> 人
<400> 255
gcgcccuccc ucucuccccg gugugcaaau gugugugugc gguguuaugc cggacaagag 60
ggaggug 67
<210> 256
<211> 81
<212> RNA
<213> 人
<400> 256
cauccuccuu acgucccacc ccccacuccu guuucuggug aaauauucaa acaggagugg 60
gggugggaca uaaggaggau a 81
<210> 257
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 257
gguuccggag ccccggcgcg ggcggguucu gggguguaga cgcugcuggc cagcccgccc 60
cagccgaggu ucucggcacc 80
<210> 258
<211> 89
<212> RNA
<213> 人
<400> 258
agccuguggg aaagagaaga gcagggcagg gugaaggccc ggcggagaca cucugcccac 60
cccacacccu gccuaugggc cacacagcu 89
<210> 259
<211> 66
<212> RNA
<213> 人
<400> 259
agcagcccuc ggcggcccgg ggggcgggcg gcggugcccg ucccggggcu gcgcgaggca 60
caggcg 66
<210> 260
<211> 82
<212> RNA
<213> 人
<400> 260
gcuacgggga gcggggagga agugggcgcu gcuucugcgu uaucuggaag gagcagccca 60
cuccuguccu gggcucugug gu 82
<210> 261
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 261
accucuaccu cccggcagag gaggcugcag aggcuggcuu uccaaaacuc ugcccccucc 60
gcugcugcca aguggcuggu 80
<210> 262
<211> 98
<212> RNA
<213> 人
<400> 262
uucucacccc cgccugacac gggcgacagc ugcggcccgc uguguucacu cgggccgagu 60
gcgucuccug ucaggcaagg gagagcagag ccccccug 98
<210> 263
<211> 82
<212> RNA
<213> 人
<400> 263
ugugggcagg gcccugggga gcugaggcuc uggggguggc cggggcugac ccugggccuc 60
ugcuccccag ugucugaccg cg 82
<210> 264
<211> 74
<212> RNA
<213> 人
<400> 264
ccugcaggag gcagugggcg agcaggcggg gcagcccaau gccaugggcc ugaucucacc 60
gcugccuccu uccc 74
<210> 265
<211> 76
<212> RNA
<213> 人
<400> 265
acugacuuug agucucuccu cagggugcug caggcaaagc uggggaccca gggagagacg 60
uaagugaggg gagaug 76
<210> 266
<211> 66
<212> RNA
<213> 人
<400> 266
ccgagugggg cggggcaggu cccugcaggg acugugacac ugaaggaccu gcaccuucgc 60
ccacag 66
<210> 267
<211> 61
<212> RNA
<213> 人
<400> 267
gagggcagcg uggguguggc ggaggcaggc gugaccguuu gccgcccucu cgcugcucua 60
g 61
<210> 268
<211> 87
<212> RNA
<213> 人
<400> 268
cccucaucuc ugggcagggg cuuauuguag gagucucuga agagagcugu ggacugaccu 60
gcuuuaaccc uuccccaggu ucccauu 87
<210> 269
<211> 103
<212> RNA
<213> 人
<400> 269
gugucggcug uggcgugacu gucccucugu gucccccacu aggcccacug cucaguggag 60
cguggaggac gaggaggagg ccguccacga gcaaugccag cau 103
<210> 270
<211> 109
<212> RNA
<213> 人
<400> 270
ugcuauuguc uuacugcuac agcagggcug gggauugcag uauccgcugu ugcugcugcu 60
cccaguccug ccccugcugc uaccuagucc agccucaccg caucccaga 109
<210> 271
<211> 79
<212> RNA
<213> 人
<400> 271
gugcagaucc uugggagccc uguuagacuc uggauuuuac acuuggagug aacgggcgcc 60
aucccgaggc uuugcacag 79
<210> 272
<211> 67
<212> RNA
<213> 人
<400> 272
uacaggccgg ggcuuugggu gagggacccc cggagucugu cacggucuca ccccaacucu 60
gccccag 67
<210> 273
<211> 66
<212> RNA
<213> 人
<400> 273
gggaggaggg aggagauggg ccaaguuccc ucuggcugga acgcccuucc cccccuucuu 60
caccug 66
<210> 274
<211> 86
<212> RNA
<213> 人
<400> 274
agcacugccc ccggugaguc aggguggggc uggcccccug cuucgugccc auccgcgcuc 60
ugacucucug cccaccugca ggagcu 86
<210> 275
<211> 115
<212> RNA
<213> 人
<400> 275
gagcaaaaac cagagaacaa caugggagcg uuccuaaccc cuaaggcaac uggaugggag 60
accugaccca uccaguucuc ugagggggcu cuuguguguu cuacaagguu guuca 115
<210> 276
<211> 60
<212> RNA
<213> 人
<400> 276
aggccuaggg gguggcaggc uggccaucag ugugggcuaa cccuguccuc ucccucccag 60
<210> 277
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 277
gaaaacaacc aggugggcuu cccggagggc ggaacaccca gccccagcau ccagggcuca 60
ccuaccacgu uug 73
<210> 278
<211> 62
<212> RNA
<213> 人
<400> 278
gcuggggguc ccccgacagu guggagcugg ggccgggucc cggggagggg gguucugggc 60
ag 62
<210> 279
<211> 70
<212> RNA
<213> 人
<400> 279
cucgggcccg accgcgccgg cccgcaccuc ccggcccgga gcugcgggcu gcggucaggg 60
cgaucccggg 70
<210> 280
<211> 72
<212> RNA
<213> 人
<400> 280
augagcgggu gggagcagau cuuauugaga guuccuucuc cugcuccuga uugucuuccc 60
ccacccucac ag 72
<210> 281
<211> 93
<212> RNA
<213> 人
<400> 281
ccuuccggcg ucccaggcgg ggcgccgcgg gaccgcccuc gugucugugg cggugggauc 60
ccgcggccgu guuuuccugg uggcccggcc aug 93
<210> 282
<211> 86
<212> RNA
<213> 人
<400> 282
auucuaggug gggagacuga cggcuggagg cccauaagcu gucuaaaacu ucggccccca 60
gauuucuggu cuccccacuu cagaac 86
<210> 283
<211> 64
<212> RNA
<213> 人
<400> 283
aaccccgggc cggaggucaa gggcgucgcu ucucccuaau guugccucuu uuccacggcc 60
ucag 64
<210> 284
<211> 88
<212> RNA
<213> 人
<400> 284
guggggccag gcgguggugg gcacugcugg ggugggcaca gcagccaugc agagcgggca 60
uuugaccccg ugccacccuu uuccccag 88
<210> 285
<211> 61
<212> RNA
<213> 人
<400> 285
aacugcgggg ccagagcaga gagcccuugc acaccaccag ccucuccucc cugugcccca 60
g 61
<210> 286
<211> 67
<212> RNA
<213> 人
<400> 286
ggcagccagg gggaugggcg agcuugggcc cauuccuuuc cuuacccuac cccccauccc 60
ccuguag 67
<210> 287
<211> 79
<212> RNA
<213> 人
<400> 287
gugagguggg ggccagcagg gagugggcug ggcugggcug ggccaaggua caaggccuca 60
cccugcaucc cgcacccag 79
<210> 288
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 288
ugagaggccg caccuugccu ugcugcccgg gccgugcacc cgugggcccc agggcgacgc 60
ggcgggggcg gcccuagcga 80
<210> 289
<211> 76
<212> RNA
<213> 人
<400> 289
ccgaugccuc gggagucuac agcagggcca ugucugugag ggcccaaggg ugcauguguc 60
ucccagguuu cggugc 76
<210> 290
<211> 97
<212> RNA
<213> 人
<400> 290
aucugaguug ggaggguccc ucuccaaaug ugucuugggg ugggggauca agacacauuu 60
ggagagggaa ccucccaacu cggccucugc caucauu 97
<210> 291
<211> 67
<212> RNA
<213> 人
<400> 291
guggcacuca aacugugggg gcacuuucug cucucuggug aaagugccgc caucuuuuga 60
guguuac 67
<210> 292
<211> 94
<212> RNA
<213> 人
<400> 292
gugaggugug ggcccggccc caggagcggg gccugggcag ccccgugugu ugaggaagga 60
aggcagggcc cccgcucccc gggccugacc ccac 94
<210> 293
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 293
ugucugggga uuuggagaag uggugagcgc aggucuuugg caccaucucc ccuggucccu 60
uggcu 65
<210> 294
<211> 81
<212> RNA
<213> 人
<400> 294
aguugguggg ggagccauga gauaagagca ccuccuagag aauguugaac uaaaggugcc 60
cucucuggcu ccuccccaaa g 81
<210> 295
<211> 47
<212> RNA
<213> 人
<400> 295
cucggcgcgg ggcgcgggcu ccggguuggg gcgagccaac gccgggg 47
<210> 296
<211> 64
<212> RNA
<213> 人
<400> 296
gaggcacugg guaggugggg cuccagggcu ccugacaccu ggaccucucc uccccaggcc 60
caca 64
<210> 297
<211> 68
<212> RNA
<213> 人
<400> 297
gugcaaagag caggaggaca ggggauuuau cucccaaggg agguccccug auccuaguca 60
cggcacca 68
<210> 298
<211> 66
<212> RNA
<213> 人
<400> 298
cagagcaggg cagggaaggu gggagagggg cccagcugac ccuccuguca cccgcuccuu 60
gcccag 66
<210> 299
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 299
gagggcuagg uggggggcuu gaagccccga gaugccucac gucuucaccc cucucaccua 60
agcag 65
<210> 300
<211> 50
<212> RNA
<213> 人
<400> 300
acccgggcgu gguggugggg gugggugccu guaauuccag cuaguuggga 50
<210> 301
<211> 115
<212> RNA
<213> 人
<400> 301
ggugccgagg gccguccggc auccuaggcg ggucgcugcg guaccucccu ccugucugug 60
gcggugggau cccguggccg uguuuuccug guggcccggc cgugccugag guuuc 115
<210> 302
<211> 86
<212> RNA
<213> 人
<400> 302
ugccagucuc uaggucccug agacccuuua accugugagg acauccaggg ucacagguga 60
gguucuuggg agccuggcgu cuggcc 86
<210> 303
<211> 90
<212> RNA
<213> 人
<400> 303
ggcgccucug cagcuccggc ucccccuggc cucucgggaa cuacaagucc cagggggccu 60
ggcggugggc ggcgggcgga agaggcgggg 90
<210> 304
<211> 51
<212> RNA
<213> 人
<400> 304
agagaugaag cgggggggcg gggucuugcu cuauugccua cgcugaucuc a 51
<210> 305
<211> 71
<212> RNA
<213> 人
<400> 305
ggugaguggg agccgguggg gcuggaguaa gggcacgccc ggggcugccc caccugcuga 60
ccacccuccc c 71
<210> 306
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 306
aggacccuuc cagagggccc ccccucaauc cuguugugcc uaauucagag gguugggugg 60
aggcucuccu gaagggcucu 80
<210> 307
<211> 64
<212> RNA
<213> 人
<400> 307
gaaggcgagg gguagaagag cacagggguu cugauaaacc cuucugccug cauucuacuc 60
ccag 64
<210> 308
<211> 118
<212> RNA
<213> 人
<400> 308
gcaggugaac uggcaggcca ggaagaggag gaagcccugg aggggcugga ggugauggau 60
guuuuccucc gguucucagg gcuccaccuc uuucgggccg uagagccagg gcuggugc 118
<210> 309
<211> 55
<212> RNA
<213> 人
<400> 309
ccggauccga gucacggcac caaauuucau gcguguccgu gugaagagac cacca 55
<210> 310
<211> 86
<212> RNA
<213> 人
<400> 310
agggagaagg gucggggcag ggagggcagg gcaggcucug gggugggggg ucugugaguc 60
agccacggcu cugcccacgu cucccc 86
<210> 311
<211> 99
<212> RNA
<213> 人
<400> 311
gcaagggaca gggagggucg uggcgacacu cgcgccagcu cccgggacgg cugggcucgg 60
gcuggucgcc gaccuccgac ccuccacuag augccuggc 99
<210> 312
<211> 90
<212> RNA
<213> 人
<400> 312
cgggcggggc ggguccggcc gccuccgagc ccggccggca gcccccggcc uuaaagcgcg 60
ggcuguccgg aggggucggc uuucccaccg 90
<210> 313
<211> 96
<212> RNA
<213> 人
<400> 313
cgggccccgg gcgggcggga gggacgggac gcggugcagu guuguuuuuu cccccgccaa 60
uauugcacuc gucccggccu ccggcccccc cggccc 96
<210> 314
<211> 68
<212> RNA
<213> 人
<400> 314
aggguugggg ggacaggaug agaggcuguc uucauucccu cuugaccacc ccucguuucu 60
ucccccag 68
<210> 315
<211> 62
<212> RNA
<213> 人
<400> 315
uggccuaggg ggcggcuugu ggaguguaug ggcugagccu ugcucugcuc ccccgccccc 60
ag 62
<210> 316
<211> 90
<212> RNA
<213> 人
<400> 316
gugucucucu ggagacccug cagccuuccc acccaccagg gagcuuucca ugggcugugg 60
ggaaggcguc agugucgggu gagggaacac 90
<210> 317
<211> 69
<212> RNA
<213> 人
<400> 317
ugggguaggg gugggggaau ucaggggugu cgaacucaug gcugccaccu uugugucccc 60
auccugcag 69
<210> 318
<211> 83
<212> RNA
<213> 人
<400> 318
gucuacuccc agggugccaa gcuguuucgu guucccuccc uaggggaucc cagguagggg 60
cagcagagga ccugggccug gac 83
<210> 319
<211> 61
<212> RNA
<213> 人
<400> 319
gugcggaacg cuggccgggg cgggagggga agggacgccc ggccggaacg ccgcacucac 60
g 61
<210> 320
<211> 66
<212> RNA
<213> 人
<400> 320
ucaagacggg gagucaggca gugguggaga uggagagccc ugagccucca cucuccuggc 60
ccccag 66
<210> 321
<211> 81
<212> RNA
<213> 人
<400> 321
cucccuggga gggcguggau gaugguggga gaggagcccc acuguggaag ucugaccccc 60
acaucgcccc accuucccca g 81
<210> 322
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 322
gcuucuggga ggaggggauc uugggaguga ucccaacagc ugagcucccu gaaucccugu 60
cccag 65
<210> 323
<211> 97
<212> RNA
<213> 人
<400> 323
cccgggaccu ugguccaggc gcuggucugc guggugcucg gguggauaag ucugaucuga 60
gcaccacaca ggccgggcgc cgggaccaag ggggcuc 97
<210> 324
<211> 109
<212> RNA
<213> 人
<400> 324
ucccgcauuc ccucugcuuu ggucaggugg ugcccuccuu ccauggguag agccagagau 60
gguggguucu ggcuggucag augggagugg acagagaccc gggguccuc 109
<210> 325
<211> 51
<212> RNA
<213> 人
<400> 325
acagaccccg gggagcccgg cggugaagcu ccugguaucc ugggugucug a 51
<210> 326
<211> 62
<212> RNA
<213> 人
<400> 326
ccuucugcgg cagagcuggg gucaccagcc cucauguacu ugugacuucu ccccugccac 60
ag 62
<210> 327
<211> 70
<212> RNA
<213> 人
<400> 327
gguuucuccu ugaggagaca uggugggggc cggucaggca gcccaugcca uguguccuca 60
uggagaggcc 70
<210> 328
<211> 68
<212> RNA
<213> 人
<400> 328
gacucggcug cgguggacaa guccggcucc agaaccugga caccgcucag ccggccgcgg 60
cagggguc 68
<210> 329
<211> 69
<212> RNA
<213> 人
<400> 329
cuuucggcca gcgggacggc auccgaggug ggcuaggcuc gggcccgugg cgggugcggg 60
ggugggagg 69
<210> 330
<211> 85
<212> RNA
<213> 人
<400> 330
gugagcugcu ggggacgcgg gucggggucu gcagggcggu gcggcagccg ccaccugacg 60
ccgcgccuuu gucugugucc cacag 85
<210> 331
<211> 62
<212> RNA
<213> 人
<400> 331
cuuccuggug gguggggagg agaagugccg uccucaugag ccccucucug ucccacccau 60
ag 62
<210> 332
<211> 89
<212> RNA
<213> 人
<400> 332
gccggcgccc gagcucuggc uccgugucuu cacucccgug cuuguccgag gagggaggga 60
gggacggggg cugugcuggg gcagcugga 89
<210> 333
<211> 97
<212> RNA
<213> 人
<400> 333
cucaggugcu cuggcugcuu ggguuccugg caugcugauu ugugacuuaa gauuaaaauc 60
acauugccag ggauuaccac gcaaccacga ccuuggc 97
<210> 334
<211> 68
<212> RNA
<213> 人
<400> 334
ugcccaggcu ggagcgagug caguggugca gucaguccua gcucacugca gccucgaacu 60
ccugggcu 68
<210> 335
<211> 70
<212> RNA
<213> 人
<400> 335
gucccugggg gcugggaugg gccauggugu gcucugaucc cccugugguc ucuuggcccc 60
caggaacucc 70
<210> 336
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 336
aggccaggug gguauggagg agcccucaua uggcaguugg cgagggccca gugagccccu 60
cucugcucuc cag 73
<210> 337
<211> 85
<212> RNA
<213> 人
<400> 337
ggccugggua ggcuugcaug ggggacuggg aagagaccau gaacagguua guccagggag 60
uucucaucaa gccuuuacuc aguag 85
<210> 338
<211> 87
<212> RNA
<213> 人
<400> 338
gugaggcggg gccaggaggg uguguggcgu gggugcugcg gggccgucag ggugccugcg 60
ggacgcucac cuggcuggcc cgcccag 87
<210> 339
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 339
gagaggccaa gaccuuggga auggggguaa gggccuucug agcccagguc cgaacucucc 60
auuccucugc agagcgcucu 80
<210> 340
<211> 64
<212> RNA
<213> 人
<400> 340
aguucagggc cgaagggugg aagcugcugg ugcucaucuc agccucugcc cuuggccucc 60
ccag 64
<210> 341
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 341
gggugcucgg ggcaggcggc ugggagcggc ccucacauug auggcuccug ccaccuccuc 60
cgcag 65
<210> 342
<211> 60
<212> RNA
<213> 人
<400> 342
ugugaaugac ccccuuccag agccaaaauc accagggaug gaggaggggu cuuggguacu 60
<210> 343
<211> 90
<212> RNA
<213> 人
<400> 343
ucuaagaaac gcaguggucu cugaagccug caggggcagg ccagcccugc acugaacgcc 60
uguucuugcc agguggcaga agguugcugc 90
<210> 344
<211> 83
<212> RNA
<213> 人
<400> 344
ccugcugcag aggugccagc ugcagugggg gaggcacugc cagggcugcc cacucugcuu 60
agccagcagg ugccaagaac agg 83
<210> 345
<211> 94
<212> RNA
<213> 人
<400> 345
aauucagccc ugccacuggc uuaugucaug accuugggcu acucaggcug ucugcacaau 60
gagccaguug gacaggagca gugccacuca acuc 94
<210> 346
<211> 60
<212> RNA
<213> 人
<400> 346
caaggugggg gagauggggg uugaacuuca uuucucaugc ucauccccau cuccuuucag 60
<210> 347
<211> 78
<212> RNA
<213> 人
<400> 347
ggccucaggc aggcgcaccc gaccacaugc auggcuggug gcggcgugca ggggucgggu 60
gggccaggcu guggggcg 78
<210> 348
<211> 49
<212> RNA
<213> 人
<400> 348
uucccagcca acgcaccaaa aaugauaugg gucuguuguc uggagaaac 49
<210> 349
<211> 64
<212> RNA
<213> 人
<400> 349
ucugggcgag gggugggcuc ucagaggggc uggcaguacu gcucugaggc cugccucucc 60
ccag 64
<210> 350
<211> 77
<212> RNA
<213> 人
<400> 350
caugagaaau ccugcugguc aaccauagcc cuggucagac ucuccggggc ugugauugac 60
cagcaggacu ucucaug 77
<210> 351
<211> 95
<212> RNA
<213> 人
<400> 351
gacaccacau gcuccuccag gccugccugc ccuccagguc auguuccagu gucccacaga 60
ugcagcacca cggcccaggc ggcauuggug ucacc 95
<210> 352
<211> 64
<212> RNA
<213> 人
<400> 352
gagcucuggg aggggcuggg uuuggcagga caguuuccaa gcccugucuc cucccaucuu 60
ccag 64
<210> 353
<211> 67
<212> RNA
<213> 人
<400> 353
aaaucucucu ccauaucuuu ccugcagccc ccaggugggg gggaagaaaa gguggggaau 60
uagauuc 67
<210> 354
<211> 64
<212> RNA
<213> 人
<400> 354
gggugggggc ggggcggcag gggccucccc cagugccagg ccccauucug cuucucuccc 60
agcu 64
<210> 355
<211> 65
<212> RNA
<213> 人
<400> 355
cuccucuggg gguggggggc ugggcguggu ggacagcgau gcaucccucg ccuucucacc 60
cucag 65
<210> 356
<211> 98
<212> RNA
<213> 人
<400> 356
cgagguaggg gcgucccggg cgcgcgggcg ggucccaggc ugggccccuc ggaggccggg 60
ugcucacugc cccgucccgg cgcccguguc uccuccag 98
<210> 357
<211> 72
<212> RNA
<213> 人
<400> 357
ugugggacug caaaugggag cucagcaccu gccugccacc cacgcagacc agccccugcu 60
cuguucccac ag 72
<210> 358
<211> 70
<212> RNA
<213> 人
<400> 358
aggacccagc ggggcugggc gcgcggagca gcgcugggug cagcgccugc gccggcagcu 60
gcaagggccg 70
<210> 359
<211> 61
<212> RNA
<213> 人
<400> 359
ccugcgggga caggccaggg caucuaggcu gugcacagug acgccccucc ugcccccaca 60
g 61
<210> 360
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 360
ggaggcuggg cugggacgga cacccggccu ccacuuucug uggcagguac cuccuccaug 60
ucggcccgcc uug 73
<210> 361
<211> 72
<212> RNA
<213> 人
<400> 361
cugugcaccu gggggagugc agugauugug gaaugcaaag ucccacaauc acuguacucc 60
ccaggugcac ag 72
<210> 362
<211> 119
<212> RNA
<213> 人
<400> 362
agccugcgcc ggagccgggg ccugagcccg ggccgcgcag gccgugaacu cgucgagcug 60
cgcgugcggc cggugcucaa ccugccgggu ccuggccccg cgcucccgcg cgcccugga 119
<210> 363
<211> 92
<212> RNA
<213> 人
<400> 363
ccugucccuc cugcccugcg ccugcccagc ccuccugcuc uggugacuga ggaccgccag 60
gcaggggcug gugcugggcg gggggcggcg gg 92
<210> 364
<211> 92
<212> RNA
<213> 人
<400> 364
gucagugucu gggcggacag cugcaggaaa gggaagacca aggcuugcug ucuguccagu 60
cugccacccu acccugucug uucuugccac ag 92
<210> 365
<211> 82
<212> RNA
<213> 人
<400> 365
gugaguggga ggccagggca cggcaggggg agcugcaggg cuaugggagg ggccccagcg 60
ucugagcccu guccucccgc ag 82
<210> 366
<211> 82
<212> RNA
<213> 人
<400> 366
gugaguggga ggccagggca cggcaggggg agcugcaggg cuaugggagg ggccccagcg 60
ucugagcccu guccucccgc ag 82
<210> 367
<211> 84
<212> RNA
<213> 人
<400> 367
cuccccaugg cccugucucc caacccuugu accagugcug ggcucagacc cugguacagg 60
ccugggggac agggaccugg ggac 84
<210> 368
<211> 75
<212> RNA
<213> 人
<400> 368
ucaucccugg guggggauuu guugcauuac uuguguucua uauaaaguau ugcacuuguc 60
ccggccugug gaaga 75
<210> 369
<211> 94
<212> RNA
<213> 人
<400> 369
auaaaggaag uuaggcugag gggcagagag cgagacuuuu cuauuuucca aaagcucggu 60
cugaggcccc ucagucuugc uuccuaaccc gcgc 94
<210> 370
<211> 52
<212> RNA
<213> 人
<400> 370
uagccgggcg uggugguggg ggccuguggu cccagcuacu uuggaggcug ag 52
<210> 371
<211> 84
<212> RNA
<213> 人
<400> 371
ugugcagugg gaaggggggc cgauacacug uacgagagug aguagcaggu cucacaguga 60
accggucucu uucccuacug uguc 84
<210> 372
<211> 68
<212> RNA
<213> 人
<400> 372
cuccggugcc uacugagcug auaucaguuc ucauuuuaca cacuggcuca guucagcagg 60
aacaggag 68
<210> 373
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 373
cucugccucc cgugccuacu gagcugaaac acaguugguu uguguacacu ggcucaguuc 60
agcaggaaca ggg 73
<210> 374
<211> 78
<212> RNA
<213> 人
<400> 374
gggcccagaa gggggcgcag ucacugacgu gaagggacca caucccgcuu caugucagug 60
acuccugccc cuuggucu 78
<210> 375
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 375
ggcgagggga ggcgcaggcu cggaaaggcg cgcgaggcuc caggcuccuu cccgauccac 60
cgcucuccuc gcu 73
<210> 376
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 376
cccagggucu ggugcggaga gggcccacag uggacuuggu gacgcuguau gcccucaccg 60
cucagccccu ggg 73
<210> 377
<211> 63
<212> RNA
<213> 人
<400> 377
gcaugcuggg cgaggcuggc aucuagcaca ggcgguagau gcuugcucuu gccauugcaa 60
uga 63
<210> 378
<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 378
ugccgucggc cuggggagga ggaagggcaa guccaaaggu auacaguugg ucuguucauu 60
cucucuuuuu ggccuacaag 80
<210> 379
<211> 73
<212> RNA
<213> 人
<400> 379
ggccggcugg gguuccuggg gaugggauuu gcuuccuguc acaaaucaca uugccaggga 60
uuuccaaccg acc 73
<210> 380
<211> 66
<212> RNA
<213> 人
<400> 380
ugacugggga gcagaaggag aacccaagaa aagcugacuu ggaggucccu ccuucugucc 60
ccacag 66
<210> 381
<211> 72
<212> RNA
<213> 人
<400> 381
cuugggaaug gcaaggaaac cguuaccauu acugaguuua guaaugguaa ugguucucuu 60
gcuauaccca ga 72
<210> 382
<211> 102
<212> RNA
<213> 人
<400> 382
gcuuaucgag gaaaagaucg agguggguug gggcgggcuc uggggauuug gucucacagc 60
ccggauccca gcccacuuac cuugguuacu cuccuuccuu cu 102
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<211> 81
<212> RNA
<213> 人
<400> 383
uacaggugca ggggaacugu agaugaaaag gcuuggcacu ugagggaaag ccucaguuca 60
uucucauuuu gcucaccugu u 81
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<213> 人
<400> 384
guaggcaggg gcugggguuu cagguucuca gucagaaccu uggccccucu ccccag 56
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<211> 80
<212> RNA
<213> 人
<400> 385
cugcagcgug cuucuccagg ccccgcgcgc ggacagacac acggacaagu cccgccaggg 60
gcugggcgcg cgccagccgg 80
<210> 386
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<212> RNA
<213> 人
<400> 386
aaaagccugu cccuaagucc cucccagccu uccagaguug gugccaggaa ggauuuaggg 60
acaggcuuug 70
<210> 387
<211> 60
<212> RNA
<213> 人
<400> 387
cgcugggucc gcgcgcccug ggccgggcga uguccgcuug ggggagcgag gggcggggcg 60
<210> 388
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 388
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<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 389
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<210> 390
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<212> RNA
<213> 人
<400> 390
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<212> RNA
<213> 人
<400> 391
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<212> RNA
<213> 人
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<212> RNA
<213> 人
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<212> RNA
<213> 人
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<212> RNA
<213> 人
<400> 395
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<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 396
ugaggauaug gcagggaagg gga 23
<210> 397
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 397
ugaggauaug gcagggaag 19
<210> 398
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 398
cgcggcgggg acggcgauug gu 22
<210> 399
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 399
cggcggggac ggcgauu 17
<210> 400
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 400
ugcggggcua gggcuaacag caguc 25
<210> 401
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 401
ugcggggcua gggcu 15
<210> 402
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 402
ggugagcgcu cgcuggc 17
<210> 403
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 403
cggugagcgc ucgcu 15
<210> 404
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 404
cuccgggcgg cgccgugu 18
<210> 405
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 405
cuccgggcgg cgccgugu 18
<210> 406
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 406
uggcggcggu aguuaugggc uucuc 25
<210> 407
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 407
uggcggcggu aguuaugggc uucuc 25
<210> 408
<211> 26
<212> RNA
<213> 人
<400> 408
ccuucuggag aggcuuugug cggaua 26
<210> 409
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 409
ccuucuggag aggcu 15
<210> 410
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 410
cuaguggaag aagauggcgg aag 23
<210> 411
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 411
uaguggaaga agaug 15
<210> 412
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 412
ccucacaccu gccucgcccc cc 22
<210> 413
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 413
ucacaccugc cucgc 15
<210> 414
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 414
agaagaaggc ggucggucug cgg 23
<210> 415
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 415
aagaaggcgg ucggucugcg g 21
<210> 416
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 416
cggggccgua gcacugucug aga 23
<210> 417
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 417
cggggccgua gcacugucug 20
<210> 418
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 418
uucugggccc gcggcgggcg ugggg 25
<210> 419
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 419
cgcggcgggc guggg 15
<210> 420
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 420
aggagggguc ccgcacuggg agg 23
<210> 421
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 421
ugggaggggc ccuca 15
<210> 422
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 422
gaggcugaag gaagaugg 18
<210> 423
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 423
gaggcugaag gaaga 15
<210> 424
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 424
ggcuacaaca caggacccgg gcg 23
<210> 425
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 425
ggcuacaaca caggacccgg g 21
<210> 426
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 426
gaggcuggga aggcaaaggg acgu 24
<210> 427
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 427
gaaggaggcu gggaa 15
<210> 428
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 428
ugcuggugau gcuuuc 16
<210> 429
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 429
ugcuggugau gcuuuc 16
<210> 430
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 430
gggggucccc ggugcucgga ucu 23
<210> 431
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 431
ucgggagggg cgggag 16
<210> 432
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 432
caacucugau cucuucaucu a 21
<210> 433
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 433
ucucuucauc uaccccccag 20
<210> 434
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 434
ugggagggga gaggcagcaa gc 22
<210> 435
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 435
ugggagggga gaggcagcaa gc 22
<210> 436
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 436
gaggcgaugu ggggauguag a 21
<210> 437
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 437
cccagucuca uuuccucauc 20
<210> 438
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 438
cugggggacg cgugagcgcg agc 23
<210> 439
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 439
cugggggacg cgugagcgcg a 21
<210> 440
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 440
aagacacauu uggagaggga 20
<210> 441
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 441
agacacauuu ggagag 16
<210> 442
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 442
cuccccggug ugcaaaugug 20
<210> 443
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 443
gugugcggug uuaug 15
<210> 444
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 444
acaggagugg gggugggaca uaa 23
<210> 445
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 445
acaggagugg gggugggaca 20
<210> 446
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 446
gccccggcgc gggcggguuc ugg 23
<210> 447
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 447
ggagccccgg cgcggg 16
<210> 448
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 448
gugaaggccc ggcgga 16
<210> 449
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 449
gugaaggccc ggcgg 15
<210> 450
<211> 26
<212> RNA
<213> 人
<400> 450
gucccggggc ugcgcgaggc acaggc 26
<210> 451
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 451
ggcccggggg gcggg 15
<210> 452
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 452
agcggggagg aagugggcgc ugcuu 25
<210> 453
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 453
agcggggagg aagugggcgc u 21
<210> 454
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 454
ccggcagagg aggcugcaga gg 22
<210> 455
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 455
ccggcagagg aggcugcag 19
<210> 456
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 456
uggggagcug aggcucuggg ggug 24
<210> 457
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 457
ggcccugggg agcug 15
<210> 458
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 458
aggaggcagu gggcgagcag g 21
<210> 459
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 459
aggaggcagu gggcgagcag g 21
<210> 460
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 460
ggacccaggg agagac 16
<210> 461
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 461
ggacccaggg agagac 16
<210> 462
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 462
gagggcagcg uggguguggc g 21
<210> 463
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 463
gagggcagcg uggguguggc g 21
<210> 464
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 464
ugggcagggg cuuauuguag gaguc 25
<210> 465
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 465
ugggcagggg cuuauugua 19
<210> 466
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 466
acagcagggc uggggauugc agu 23
<210> 467
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 467
ugcugcuccc aguccugcc 19
<210> 468
<211> 27
<212> RNA
<213> 人
<400> 468
gugaacgggc gccaucccga ggcuuug 27
<210> 469
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 469
gugaacgggc gccauc 16
<210> 470
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 470
cuucccccca guaaucuuca u 21
<210> 471
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 471
cuucccccca guaaucuuca u 21
<210> 472
<211> 26
<212> RNA
<213> 人
<400> 472
aggagggagg agaugggcca aguucc 26
<210> 473
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 473
gggaggaggg aggag 15
<210> 474
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 474
gugagucagg guggggcugg c 21
<210> 475
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 475
gugagucagg guggggcugg c 21
<210> 476
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 476
auccaguucu cugagggggc u 21
<210> 477
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 477
auccaguucu cugagggggc u 21
<210> 478
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 478
ggugggcuuc ccggaggg 18
<210> 479
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 479
ggugggcuuc ccgga 15
<210> 480
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 480
cugggggucc cccgac 16
<210> 481
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 481
guguggagcu ggggc 15
<210> 482
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 482
gcugcgggcu gcggucaggg cgau 24
<210> 483
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 483
gcugcgggcu gcggucaggg 20
<210> 484
<211> 26
<212> RNA
<213> 人
<400> 484
cggugggauc ccgcggccgu guuuuc 26
<210> 485
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 485
ggggcgccgc gggac 15
<210> 486
<211> 18
<212> RNA
<213> 人
<400> 486
ucuagguggg gagacuga 18
<210> 487
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 487
guggggagac ugacgg 16
<210> 488
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 488
gugggcuggg cugggcuggg cca 23
<210> 489
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 489
gggcugggcu gggcu 15
<210> 490
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 490
caccuugccu ugcugcccgg gcc 23
<210> 491
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 491
caccuugccu ugcugcccgg gc 22
<210> 492
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 492
agacacauuu ggagagggaa ccuc 24
<210> 493
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 493
agacacauuu ggagag 16
<210> 494
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 494
acucaaacug ugggggcacu uu 22
<210> 495
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 495
acucaaacug ugggggcac 19
<210> 496
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 496
aaggcagggc ccccgcuccc cgggc 25
<210> 497
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 497
guguguugag gaagg 15
<210> 498
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 498
uggggauuug gagaaguggu ga 22
<210> 499
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 499
uggggauuug gagaaguggu ga 22
<210> 500
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 500
gggggagcca ugagauaaga gcacc 25
<210> 501
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 501
ugggggagcc augagauaag 20
<210> 502
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 502
uccuagucac ggcacca 17
<210> 503
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 503
uccuagucac ggcacca 17
<210> 504
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 504
cgggcguggu ggugggggug ggug 24
<210> 505
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 505
cgggcguggu ggugg 15
<210> 506
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 506
ggcccggccg ugccugaggu uuc 23
<210> 507
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 507
ggcgguggga ucccg 15
<210> 508
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 508
cacaggugag guucuuggga gcc 23
<210> 509
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 509
acaggugagg uucuu 15
<210> 510
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 510
ggcggugggc ggcggg 16
<210> 511
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 511
ggccucucgg gaacu 15
<210> 512
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 512
ugaagcgggg gggcg 15
<210> 513
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 513
ugaagcgggg gggcg 15
<210> 514
<211> 24
<212> RNA
<213> 人
<400> 514
gugaguggga gccggugggg cugg 24
<210> 515
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 515
ggggcuggag uaagg 15
<210> 516
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 516
gaggguuggg uggaggcucu cc 22
<210> 517
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 517
gaggguuggg uggag 15
<210> 518
<211> 25
<212> RNA
<213> 人
<400> 518
aggaagcccu ggaggggcug gaggu 25
<210> 519
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 519
aggaagagga ggaag 15
<210> 520
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 520
cggauccgag ucacggcacc a 21
<210> 521
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 521
ggauccgagu cacgg 15
<210> 522
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 522
agggucgggg cagggagggc agg 23
<210> 523
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 523
gggagaaggg ucggg 15
<210> 524
<211> 26
<212> RNA
<213> 人
<400> 524
gcgggcuguc cggagggguc ggcuuu 26
<210> 525
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 525
gcuguccgga gggguc 16
<210> 526
<211> 26
<212> RNA
<213> 人
<400> 526
agggacggga cgcggugcag uguugu 26
<210> 527
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 527
ggcgggcggg aggga 15
<210> 528
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 528
uggggaaggc gucagugucg ggu 23
<210> 529
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 529
uggggaaggc gucagu 16
<210> 530
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 530
uaggggcagc agaggaccug ggc 23
<210> 531
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 531
uaggggcagc agaggaccug 20
<210> 532
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 532
ggcuggucag augggagugg 20
<210> 533
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 533
ggcuggucag augggagugg 20
<210> 534
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 534
ccccagggcg acgcggcggg 20
<210> 535
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 535
cgcggcgggg gcggc 15
<210> 536
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 536
ccccggggag cccggcggug 20
<210> 537
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 537
accccgggga gcccg 15
<210> 538
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 538
uugaggagac augguggggg c 21
<210> 539
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 539
uugaggagac auggu 15
<210> 540
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 540
acucggcugc gguggacaag uc 22
<210> 541
<211> 20
<212> RNA
<213> 人
<400> 541
acucggcugc gguggacaag 20
<210> 542
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 542
uggcgggugc ggggguggg 19
<210> 543
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 543
uggcgggugc ggggg 15
<210> 544
<211> 23
<212> RNA
<213> 人
<400> 544
gagggaggga cgggggcugu gcu 23
<210> 545
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 545
gaggagggag ggagg 15
<210> 546
<211> 26
<212> RNA
<213> 人
<400> 546
aaaaucacau ugccagggau uaccac 26
<210> 547
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 547
aaucacauug ccagg 15
<210> 548
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 548
cccaggcugg agcgagugca g 21
<210> 549
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 549
agcucacugc agccu 15
<210> 550
<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 550
ugggaauggg gguaagggcc u 21
<210> 551
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 551
cuucugagcc caggu 15
<210> 552
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 552
ugcaggggca ggccagc 17
<210> 553
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 553
ugcaggggca ggccagc 17
<210> 554
<211> 16
<212> RNA
<213> 人
<400> 554
agcugcagug ggggag 16
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<212> RNA
<213> 人
<400> 555
gcugcagugg gggag 15
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<213> 人
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<213> 人
<400> 557
ucugggcgag gggug 15
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<213> 人
<400> 558
ugggggggaa gaaaag 16
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<213> 人
<400> 559
ugggggggaa gaaaag 16
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<213> 人
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gcggggcggc aggggcc 17
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<213> 人
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gggggcgggg cggca 15
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<213> 人
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<213> 人
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ugugggacug caaaugggag cu 22
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<213> 人
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<213> 人
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<213> 人
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cugcggggac aggccagggc aucu 24
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<213> 人
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cugcggggac aggccagggc 20
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<213> 人
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<400> 570
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ugggggagug cagugauug 19
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aggcaggggc uggugcuggg cggg 24
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agggggagcu gcagg 15
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<213> 人
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cugguacagg ccugggggac aggg 24
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<213> 人
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cugguacagg ccuggggg 18
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<213> 人
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<213> 人
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<213> 人
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<213> 人
<400> 584
gggggccgau acacuguacg aga 23
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<211> 20
<212> RNA
<213> 人
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gggggccgau acacuguacg 20
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<212> RNA
<213> 人
<400> 586
acuggcucag uucagcagga acag 24
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<213> 人
<400> 587
uggcucaguu cagca 15
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<213> 人
<400> 588
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<213> 人
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uggugcggag agggcccaca gug 23
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gggucuggug cggag 15
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<400> 593
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<213> 人
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aucacauugc cagggauuuc caaccga 27
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<213> 人
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<213> 人
<400> 596
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<213> 人
<400> 597
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<213> 人
<400> 598
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<213> 人
<400> 599
gaaaccguua ccauu 15
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<213> 人
<400> 600
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<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 601
guggguuggg gcgggcucu 19
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<212> RNA
<213> 人
<400> 602
aggggcuggg cgcgcgc 17
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<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 603
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<212> RNA
<213> 人
<400> 604
caggaaggau uuagggacag gcuuu 25
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<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 605
caggaaggau uuagggaca 19
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<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 606
augccucccc cggccccgca g 21
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<212> RNA
<213> 人
<400> 607
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<211> 21
<212> RNA
<213> 人
<400> 608
cuuccgcccc gccgggcguc g 21
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<211> 17
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<213> 人
<400> 609
ggggcgcggc cggaucg 17
<210> 610
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<212> RNA
<213> 人
<400> 610
agggaucgcg ggcggguggc ggccu 25
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<212> RNA
<213> 人
<400> 611
cuccgggacg gcugggc 17
<210> 612
<211> 19
<212> RNA
<213> 人
<400> 612
aaggggcugg gggagcaca 19
<210> 613
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 613
ggggggugug gagccagggg gc 22
<210> 614
<211> 22
<212> RNA
<213> 人
<400> 614
uauagggauu ggagccgugg cg 22
<210> 615
<211> 63
<212> RNA
<213> 人
<400> 615
ggcuccgcag ggcccuggcg caggcaucca gacagcgggc gaaugccucc cccggccccg 60
cag 63
<210> 616
<211> 84
<212> RNA
<213> 人
<400> 616
ccgcagccgc cgcgccgggc ccggguuggc cgcugacccc cgcggggccc ccggcggccg 60
gggcgggggc gggggcugcc ccgg 84
<210> 617
<211> 70
<212> RNA
<213> 人
<400> 617
ggccgcggcg cgcaagaugg cggcgggccc gggcaccgcc ccuuccgccc cgccgggcgu 60
cgcacgaggc 70
<210> 618
<211> 84
<212> RNA
<213> 人
<400> 618
gaggcugggc ggggcgcggc cggaucgguc gagagcgucc uggcugauga cggucucccg 60
ugcccacgcc ccaaacgcag ucuc 84
<210> 619
<211> 100
<212> RNA
<213> 人
<400> 619
gugagcgggc gcggcaggga ucgcgggcgg guggcggccu agggcgcgga gggcggaccg 60
ggaauggcgc gccgugcgcc gccggcguaa cugcggcgcu 100
<210> 620
<211> 89
<212> RNA
<213> 人
<400> 620
accuccggga cggcugggcg ccggcggccg ggagauccgc gcuuccugaa ucccggccgg 60
cccgcccggc gcccguccgc ccgcggguc 89
<210> 621
<211> 110
<212> RNA
<213> 人
<400> 621
gucuaccagg ugugggccca gcuuuacaua guucaugcug aggccgggau uucaugcaga 60
aaacugguug caaaaggugc ugaaggggcu gggggagcac aagggagaag 110
<210> 622
<211> 71
<212> RNA
<213> 人
<400> 622
auggaggggg guguggagcc agggggccca ggucuacagc uucuccccgc ucccugcccc 60
cauacuccca g 71
<210> 623
<211> 90
<212> RNA
<213> 人
<400> 623
aggccucgcu guucucuaug gcuuuuuauu ccuaugugau ucuacugcuc acucauauag 60
ggauuggagc cguggcgcac ggcggggaca 90
<210> 624
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 624
ggggcggggg cgggggc 17
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<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 625
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<211> 15
<212> RNA
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<400> 626
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<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 627
ggcggcgggc ccggg 15
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<212> RNA
<213> 人
<400> 628
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<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 629
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<212> RNA
<213> 人
<400> 630
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<211> 15
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<213> 人
<400> 631
ggcgcggagg gcgga 15
<210> 632
<211> 17
<212> RNA
<213> 人
<400> 632
ccuccgggac ggcuggg 17
<210> 633
<211> 15
<212> RNA
<213> 人
<400> 633
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<212> RNA
<213> 人
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<211> 20
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<213> 人
<400> 635
auauagggau uggagccgug 20
- 大肠癌的检测试剂盒或装置以及检测方法
- 大肠癌的检测试剂盒或装置以及检测方法