用于治疗和预防细菌感染的芳基化合物

本发明涉及用于哺乳动物的治疗和/或预防的有机化合物，特别涉及DNA促旋酶和/或拓扑异构酶IV抑制剂用于治疗和/或预防细菌感染的方法。

发明领域

细菌感染引起了持续的医学问题，因为抗菌药物最终会在它们使用的细菌中产生抗性。几乎所有当前的抗生素药物的细菌抗性都在增加。许多形式的抗生素抗性甚至可以跨越国际边界并以惊人的速度传播。因此，迫切需要新型的抗菌化合物。

开发抗菌药物的一个目标是DNA促旋酶和拓扑异构酶IV(细菌型IIA拓扑异构酶)，它们对细胞生命至关重要，它解决了由DNA复制、转录和重组引起的DNA拓扑问题。DNA促旋酶控制DNA超螺旋并缓解拓扑链应力，该应力在DNA链未扭曲时(例如在复制过程中)发生。拓扑异构酶IV主要在DNA复制结束时解析连接的染色体二聚体。两种酶都可以引入双链DNA断裂；将第二条DNA链穿过断裂并重新连接断裂的链。两种酶的活性均由ATP的结合和水解驱动。细菌DNA促旋酶由两个A(GyrA)和两个B(GyrB)亚基组成。DNA的结合和切割与GyrA相关，而ATP被GyrB结合并水解。细菌拓扑异构酶IV也是一种异四聚体，由两个C(ParC)和两个E(ParE)亚基组成。后者的亚基像GyrB一样结合ATP，以提供酶催化转化所需的能量。

DNA促旋酶和拓扑异构酶IV的抑制具有开发广谱抗生素的潜力。这些酶在广泛的革兰氏阳性和革兰氏阴性病原体中高度保守。有两类抗生素证明了这种作用机理。第一种由喹诺酮类很好地代表，通过稳定切割的DNA-酶复合物来抑制GyrA和ParC亚基，从而抑制总的促旋酶功能，导致细胞死亡。新生霉素是第二类中唯一上市的药物，它通过阻断酶的ATP酶性发挥作用。1950年代发现了新生霉素。但是它的使用迅速下降，最终退出市场，这主要是由于其在许多细菌菌株中的低渗透性，自发抗性的提高以及更有效的药物的开发，例如青霉素酶稳定的青霉素和1960年代和1970年代的最早的头孢菌素。

近来，已经公认对DNA促旋酶和/或拓扑异构酶IV的强烈抑制对于通过酶抑制剂处理的细菌菌株中的低抗性发展是重要的。与广泛使用的喹诺酮类相比，具有不同作用机理的细菌DNA促旋酶和/或拓扑异构酶IV抑制剂将表现出最小的交叉抗性，并且可能在对抗近年来显著增加的喹诺酮抗性中可能有用。

发明内容

本发明涉及式(I)的新型化合物，

其中

R

吡唑并[1,5-a]嘧啶基，其未被取代或被氰基取代；

吡啶基，其被2-氧代-3H-1,3,4-噁二唑基、氨基、氨基C

嘧啶基，其未被取代或被氨基、氨基C

R

吡唑基，其被独立地选自卤代C

吡咯并[3,4-c]吡唑基，其未被取代或被氰基或卤代C

噻唑基；

R

R

R

R

或其药用盐。

本发明的目的为新型式(I)化合物、其制造、基于根据本发明所述的化合物的药物和其生产以及式(I)化合物用于治疗或预防细菌感染的用途。式(I)化合物作为DNA促旋酶和/或拓扑异构酶IV抑制剂的用途也是本发明的目的之一。式(I)化合物显示出优异的抗菌活性、良好的溶解性、良好的CC

具体实施方式

除非另外定义，否则本文中使用的所有技术和科学术语所具有的含义与本发明所属领域普通技术人员通常理解的含义相同。此外，阐述以下定义以说明和定义用于描述本发明的各种术语的含义和范围。

定义

术语“C

术语“C

术语“C

术语“卤素”和“卤代”在本文可以互换使用，表示氟、氯、溴或碘。

术语“卤代C

术语“氮杂环丁烷基氧基”表示氮杂环丁烷基-O-。

术语“哌啶基氧基”表示哌啶基-O-。

术语“吡咯烷基氧基”表示吡咯烷基-O-。

术语“药学上可接受的盐”表示在生物学上或其他方面均不是非期望的盐。药学上可接受的盐包括酸加成盐和碱加成盐。

术语“药学上可接受的酸加成盐”表示与无机酸和有机酸形成的那些药学上可接受的盐，所述无机酸诸如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、碳酸、磷酸，所述有机酸选自脂肪族、脂环族、芳族、芳脂族、杂环、羧酸和磺酸类有机酸，诸如甲酸、乙酸、丙酸、乙醇酸、葡萄糖酸、乳酸、丙酮酸、草酸、苹果酸、马来酸、丙二酸、琥珀酸、富马酸、酒石酸、柠檬酸、天冬氨酸、抗坏血酸、谷氨酸、邻氨基苯甲酸、苯甲酸、肉桂酸、扁桃酸、亚甲基双氢萘酸、苯乙酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸和水杨酸。

术语“药学上可接受的碱加成盐”表示与有机或无机碱形成的那些药学上可接受的盐。可接受的无机碱的实例包括钠、钾、铵、钙、镁、铁、锌、铜、锰和铝盐。衍生自药用有机无毒碱的盐包括伯胺、仲胺和叔胺，取代胺(包括天然存在的取代胺)、环胺和碱性离子交换树脂(诸如异丙胺、三甲胺、二乙胺、三乙胺、三丙胺、乙醇胺、2-二乙氨基乙醇、氨丁三醇、二环己胺，赖氨酸、精氨酸、组氨酸、咖啡因、普鲁卡因、哈胺(hydrabamine)、胆碱、甜菜碱、乙二胺、葡糖胺、甲基葡糖胺、可可碱、嘌呤、哌嗪、哌啶、N-乙基哌啶和多胺树脂)的盐。

术语“治疗有效量”是指本发明的化合物或分子施用于受试者时的量：(i)治疗或预防特定疾病、病症或疾患，(ii)减弱、改善或消除特定疾病、病症或疾患的一种或多种症状，或(iii)预防或延迟本文所述的特定疾病、病症或疾患的一种或多种症状的发作。治疗有效量取决于化合物、治疗的疾病状态、治疗疾病的严重程度、受试者的年龄和相对健康状况、施用途径和形式、主治医师或兽医的判断、以及其他因素。

术语“药物组合物”是指包括治疗有效量的活性药物成分以及药学上可接受的赋形剂的混合物或溶液，其将被施用于哺乳动物，例如，对其有需要的人。DNA促旋酶和/或拓扑异构酶IV抑制剂

本发明涉及式(I)化合物，

其中

R

吡唑并[1,5-a]嘧啶基，其未被取代或被氰基取代；

吡啶基，其被2-氧代-3H-1,3,4-噁二唑基、氨基、氨基C

嘧啶基，其未被取代或被氨基、氨基C

R

吡唑基，其被独立地选自卤代C

吡咯并[3,4-c]吡唑基，其未被取代或被氰基或卤代C

噻唑基；

R

R

R

R

或其药用盐。

本发明的另一实施例是(ii)，其为根据(i)所述的式(I)化合物，其中

R

吡唑并[1,5-a]嘧啶基，其未被取代或被氰基取代；

吡啶基，其被2-氧代-3H-1,3,4-噁二唑基、氨基、氨基羰基、氨基羰基甲基、氨基甲基、氰基、氟、羟基乙基、羟基甲基、咪唑基甲基、甲氧基氨基羰基、甲氧基乙基氨基羰基、甲氧基甲基环丙基氨基羰基、甲基、甲基-1,3,4-噁二唑基甲基、甲基氨基羰基、吗啉基或吗啉基甲基取代；或

嘧啶基，其未被取代或被氨基、氨基(二甲基)乙氧基、氨基羰基、氨基甲基、氮杂环丁烷基氧基、羧基(环丙基)甲基氨基、羧基(二甲基)乙氧基、羧基(二甲基)乙基氨基、羧基环丙基、乙氧基、乙基、羟基(甲基)乙基、羟基乙基、羟基甲基、甲氧基、甲氧基氨基羰基环丙基、甲氧基乙基氨基、甲基、甲基氨基、甲基氨基羰基环丙基、吗啉基、哌嗪基、哌啶基氨基、哌啶基氧基、吡咯烷基氨基、吡咯烷基氧基或四氢呋喃基氨基取代；

R

吡唑基，其被独立地选自氨基羰基、氨基甲基、氰基、二氟甲基、乙基、羟基甲基和三氟甲基的取代基取代一次或两次；

吡咯并[3,4-c]吡唑基，其未被取代或被氰基或三氟甲基取代；或

噻唑基；

R

R

R

R

或其药用盐。

本发明的另一实施例是(iii)，其是根据(i)或(ii)所述的式(I)化合物或其药用盐，其中

R

吡唑并[1,5-a]嘧啶基；

吡啶基，其被2-氧代-3H-1,3,4-噁二唑基、氨基、氨基C

嘧啶基，其未被取代或被氨基、氨基C

本发明的另一实施例是(iv)，其是根据(i)至(iii)中任一项所述的式(I)化合物或其药用盐，其中R

本发明的另一实施例是(iv)，其是根据(i)至(iv)中任一项所述的式(I)化合物，其中

R

吡唑并[1,5-a]嘧啶基；

吡啶基，其被2-氧代-3H-1,3,4-噁二唑基、氨基、氨基C

嘧啶基，其未被取代或被氨基、氨基C

R

R

R

R

R

或其药用盐。

本发明的另一实施例是(vi)，其是根据(i)至(v)中任一项所述的式(I)化合物，其中

R

R

R

R

R

R

或其药用盐。

本发明的另一实施例是(vii)，其为选自以下项的式(I)化合物：

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

6-氟-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-N-甲基-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[4-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

N-乙基-6-氟-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[4-(3-氰基吡唑-1-基)-8-(乙基氨基)-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

3-(2-氨基嘧啶-5-基)-N-乙基-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-(6-甲基-3-吡啶基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[6-氟-8-(甲基氨基)-4-[4-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

5-[4-(4-氰基吡唑-1-基)-6-氟-8-(甲基氨基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

N-乙基-6-氟-3-[2-(4-哌啶基氨基)嘧啶-5-基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-(1,5-萘啶-3-基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-嘧啶-5-基-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-[2-(2-甲氧基乙基氨基)嘧啶-5-基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[4-[4-(氨基甲基)-3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-6-氟-8-(甲基氨基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲酰胺；

N-乙基-6-氟-3-(2-吗啉代嘧啶-5-基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-[2-(甲基氨基)嘧啶-5-基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-(5-氟-3-吡啶基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-(2-吡咯烷-3-基氧基嘧啶-5-基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

4-(5,6-二氢-4H-吡咯并[3,4-c]吡唑-1-基)-N-乙基-6-氟-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

3-(2-乙氧基嘧啶-5-基)-N-乙基-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

3-[2-(氮杂环丁烷-3-基氧基)嘧啶-5-基]-N-乙基-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-[2-(吡咯烷-3-基氨基)嘧啶-5-基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-[2-(四氢呋喃-3-基氨基)嘧啶-5-基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[4-[4-(氨基甲基)-3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-8-(乙基氨基)-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

4-[4-(氨基甲基)-3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-N-乙基-6-氟-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[8-(乙基氨基)-5,6-二氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

N-乙基-5,6-二氟-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

3-[2-(2-氨基-2-甲基-丙氧基)嘧啶-5-基]-N-乙基-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

2-[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]嘧啶-2-基]丙-2-醇；

5-[8-(乙基氨基)-4-(3-乙基吡唑-1-基)-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

6-氯-N-乙基-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[3,4-c]吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

N-乙基-6-氟-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-4-[3-(三氟甲基)-5,6-二氢-4H-吡咯并[3,4-c]吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]-3-吡啶基]甲醇；

3-(5-氨基-3-吡啶基)-N-乙基-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

1-[6-氟-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-8-(甲基氨基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-4-基]-5,6-二氢-4H-吡咯并[3,4-c]吡唑-3-甲腈；

1-[8-(乙基氨基)-6-氟-3-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-4-基]-4,5,6,7-四氢吡唑并[3,4-c]吡啶-3-甲腈；

3-(6-氨基-3-吡啶基)-N-乙基-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[4-[3-(二氟甲基)吡唑-1-基]-8-(乙基氨基)-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

N-乙基-6-氟-3-[6-(吗啉代甲基)-3-吡啶基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]-N-甲基-吡啶-3-甲酰胺；

N-乙基-6-氟-3-(5-吗啉代-3-吡啶基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

3-[5-(氨基甲基)-3-吡啶基]-N-乙基-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

3-[2-(氨基甲基)嘧啶-5-基]-N-乙基-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

3-(2-乙基嘧啶-5-基)-6-氟-N-甲基-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]嘧啶-2-基]甲醇；

5-[4-[4-(氨基甲基)-3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-6,7-二氟-8-(甲基氨基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

N-乙基-6-氟-3-(2-甲基嘧啶-5-基)-4-[3-三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-噻唑-5-基-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

N-乙基-6-氟-3-(2-哌嗪-1-基嘧啶-5-基)-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-[2-(4-哌啶基氧基)嘧啶-5-基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

1-[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]嘧啶-2-基]乙醇；

N-乙基-6-氟-3-[2-[(3R)-吡咯烷-3-基]氧基嘧啶-5-基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

N-乙基-6-氟-3-[2-[(3S)-吡咯烷-3-基]氧基嘧啶-5-基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

(1S)-1-[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]嘧啶-2-基]乙醇；

N-乙基-6-氟-3-[5-[(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基]-3-吡啶基]-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

6-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-甲腈；

4-[4-(氨基甲基)-3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-N-乙基-6-氟-3-吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

1-[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]嘧啶-2-基]环丙烷甲酸；

1-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)嘧啶-2-基)-N-甲基环丙烷甲酰胺；

1-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)嘧啶-2-基)-N-甲氧基环丙烷甲酰胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]-N-甲氧基-吡啶-3-甲酰胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]嘧啶-2-甲酰胺；

2-[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]-3-吡啶基]乙酰胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]-N-(2-甲氧基乙基)吡啶-3-甲酰胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]-N-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡啶-3-甲酰胺；

1-(3-(5-氰基吡啶-3-基)-8-(乙基氨基)-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-4-基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-甲酰胺；

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[4-(羟基甲基)-3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈；

5-[[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]-3-吡啶基]甲基]-3H-1,3,4-噁二唑-2-酮；

2-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙醇；和

3-(5-((1H-咪唑-2-基)甲基)吡啶-3-基)-N-乙基-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺；

或其药用盐。

合成

方案1

X

根据方案1可制备式(I)化合物。用胺R

本发明还涉及制备式(I)化合物的方法，所述方法包括式(Ii)化合物，

与酸的反应，所述酸可以是例如三氟乙酸；

其中R

药物组合物和施用

另一实施例提供含有本发明的化合物以及治疗惰性载体、稀释剂或赋形剂的药物组合物或药物，以及用本发明的化合物制备此类组合物和药物的方法。在一个实例中，式(I)化合物可通过在环境温度下适当的pH和期望的纯度下与生理学上可接受的载体(即在所用剂量和浓度下对接受者无毒的载体)混合而配制为盖伦(galenical)施用形式。制剂的pH主要取决于化合物的具体用途和浓度，但是优选在约3至约8的范围内。在一个实例中，将式(I)化合物在pH 5的乙酸盐缓冲液中配制。在另一实施例中，式(I)化合物是无菌的。化合物可以例如作为固体或无定形组合物、作为冻干制剂或作为水溶液储存。

组合物的配制、剂量和给药均应遵循良好的医疗实践。在这种情况下需要考虑的因素包括所治疗的特定疾患、所治疗的特定哺乳动物、个体患者的临床病症、疾患的原因、药剂的递送部位、施用方法、施用的时间安排，以及执业医师已知的其他因素。要施用的化合物的有效量将由这些因素决定，并且是通过抑制细菌DNA促旋酶和/或拓扑异构酶IV减少细菌负载或改善宿主存活所必需的最小量。例如，该量可以低于对正常细胞或哺乳动物整体有毒的量。

在一个实例中，肠胃外施用的本发明化合物的每剂药学有效量将在约0.1至1000mg/kg的范围内，替代地每天约1至100mg/kg患者体重。在另一个实施例中，口服单位剂型诸如片和胶囊优选含有约5至约5000mg的本发明化合物。

本发明的化合物可通过任何适宜的方式施用，包括口服、局部(包括颊和舌下)、直肠、阴道、经皮、肠胃外、皮下、腹膜内、肺内、皮内、鞘内和硬膜外和鼻内，以及(如果需要用于局部治疗)病灶内施用。肠胃外输注包括肌内、静脉内、动脉内、腹膜内或皮下给药。

本发明化合物可以任何方便的施用形式施用，例如，片剂、粉剂、胶囊剂、溶液剂、分散剂、混悬剂、糖浆剂、喷雾剂、栓剂、凝胶剂、乳剂、贴剂等。此类组合物可以包含药物制剂中常规的组分，例如，稀释剂、载体、pH调节剂、甜味剂、填充剂和其他活性剂。

通过混合本发明的化合物和载体或赋形剂来制备典型的制剂。适宜的载体和赋形剂是本领域技术人员熟知的，并且在例如Ansel,Howard C.等人，

适宜口服剂型的实例是含有约10至500mg的本发明化合物与约40至400mg无水乳糖、约5至50mg交联羧甲基纤维素钠、约5至50mg聚乙烯吡咯烷酮(PVP)K30和约1至10mg硬脂酸镁复合的片。首先将粉状成分混合在一起，然后与PVP溶液混合。所得组合物可使用传统设备干燥、制粒、与硬脂酸镁混合并压制成片形式。可以通过将本发明的化合物(例如5至1000mg)溶解在适宜的缓冲溶液(例如磷酸盐缓冲液)中，如果需要的话添加增渗剂(例如诸如氯化钠的盐)来制备气雾剂制剂的实例。可以例如使用0.2微米的过滤器过滤溶液，以除去杂质和污染物。

因此，一个实施例包括药物组合物，其包含式(I)化合物，或其立体异构体，或其药用盐。另一实施例中包括药物组合物，其包含式(I)化合物，或其立体异构体，或其药用盐以及其药用载体或赋形剂。

另一个实施例包括用于治疗和/或预防细菌感染的包含式(I)化合物的药物组合物。

在一些实施例中，本发明的化合物可以作为单剂量或多剂量方案的一部分，口服、肠胃外、通过吸入喷雾、局部、直肠、鼻、颊、阴道、或通过植入的储库施用。所使用的术语肠胃外包括皮下、皮内、静脉内、肌肉内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、病灶内和颅内注射或输注技术。通常，本发明的药物组合物每天施用约1至5次，或者在患者病情改善后连续输注。

适应症和治疗方法

本发明的化合物可通过向有需要的受试者施用治疗有效量的式(I)化合物，或其药用盐，或其对映体或非对映体，用于治疗和/或预防人或其他动物中的细菌感染。本发明的化合物和方法特别适合于由病原体感染的人类患者，所述病原体包括金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌。也可以由本发明的化合物控制的细菌生物的例子包括但不限于以下革兰氏阳性和革兰氏阴性生物：肺炎链球菌、化脓性链球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肠杆菌属、变形杆菌属、粘质沙雷氏菌、金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌(Coag.Neg.Staphylococci)、流感嗜血杆菌、炭疽杆菌、肺炎支原体、卡他莫拉菌、沙眼衣原体、肺炎衣原体、嗜肺军团菌、结核分枝杆菌、幽门螺杆菌，腐生葡萄球菌、白色葡萄球菌、土拉弗朗西斯菌、鼠疫杆菌、艰难梭菌、拟杆菌属淋病奈瑟菌、脑膜炎奈瑟氏球菌、类鼻疽伯克氏菌、鼻疽伯克霍尔德菌、伯氏疏螺旋体、鸟分枝杆菌复合体、脓肿分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和溃疡分枝杆菌。

细菌感染的实例包括但不限于上呼吸道感染、下呼吸道感染、耳朵感染、胸膜肺和支气管感染、复杂的尿路感染、简单的尿路感染、腹腔内感染、心血管感染、血流感染、脓毒症、菌血症、中枢神经系统感染、皮肤和软组织感染、胃肠道感染、骨骼和关节感染、生殖器感染、眼部感染或肉芽肿感染。特定细菌感染的实例包括但不限于简单的皮肤和皮肤结构感染(uSSSI)、复杂的皮肤和皮肤结构感染(cSSSI)、导管感染、鼻窦炎、咽炎、外耳道炎、中耳炎、支气管炎、脓胸、肺炎，社区获得性细菌性肺炎(CABP)、医院获得性肺炎(HAP)、医院获得性细菌性肺炎、呼吸机相关性肺炎(VAP)、糖尿病足感染、耐万古霉素的肠球菌感染、膀胱炎和肾盂肾炎、肾结石、前列腺炎、腹膜炎、复杂的腹腔内感染(cIAI)和其他腹腔间感染、透析相关的腹膜炎、内脏脓肿、心内膜炎、心肌炎、心包炎，输血相关的败血症、脑膜炎、脑炎、脑脓肿、骨髓炎、关节炎、生殖器溃疡，阴道炎、宫颈炎、牙龈炎、结膜炎、角膜炎、眼内膜炎、囊性纤维化患者的感染或发热性中性粒细胞减少症患者的感染。

此外，本发明涉及式(I)化合物用于治疗和/或预防细菌感染的用途。本发明涉及式(I)化合物在制备治疗和/或预防细菌感染的药物中的用途。另一实施例包括用于治疗或预防细菌感染的方法，所述方法包括施用有效量的式(I)化合物，或其药用盐，或其对映体或非对映体。

参照以下实例将更充分地理解本发明。但是，它们不应被解释为限制本发明的范围。

缩写

本文使用的缩写如下：

ACN或MeCN 乙腈

AcOK 乙酸钾

[α]D

B

BINAP 2,2’-双(二苯基膦基)-1,1-双萘

BOMCl 苄基氯甲基酯

CAN 硝酸铈铵

CAMHB 阳离子调节的Mueller Hinton肉汤

calc’d 计算值

CC

CL 清除

Ct 循环阈值

d 天

DBU 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一-7-烯

DHP 二氢吡喃

DIAD 偶氮二羧酸二异丙酯

DIPEA N,N-二异丙基乙胺

EDTA-k2 乙二胺四乙酸

EtOAc或EA 乙酸乙酯

FA 甲酸

H(s)或hr(s) 小时

HATU: 1-[双(二甲基氨基)亚甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓3-氧化六氟磷酸盐

HPLC: 高效液相色谱法

HPLC-UV： 带紫外线检测器的高效液相色谱仪

IV 静脉注射

LAH 氢化铝锂

LDA 二异丙基氨基锂

MIC 最低抑制浓度

Pd-Ad

PE 石油醚

PBS 磷酸盐缓冲溶液

Precat 预催化剂

制备型HPLC 制备型高效液相色谱

qPCR 定量聚合酶链式反应

qRT-PCR 定量实时聚合酶链式反应

rel 相对的

室温 室温

rpm 每分钟转数

SFC 超临界流体色谱

SM 起始物质

TLC 薄层色谱

UV 紫外检测器

一般实验条件

使用以下一种仪器通过快速色谱法纯化中间体和最终化合物：i)Biotage SP1系统和Quad 12/25Cartridge模块，ii)ISCO combi-flash色谱仪。硅胶品牌和孔径：i)KP-SIL

用X Bridge

使用ChiralPak AD-10μ(200×50mm I.D.)在Thar 350制备型SFC上进行手性分离，流动相A为CO

酸性条件：A：0.1％甲酸和1％乙腈的水溶液；B：0.1％甲酸的乙腈溶液；

碱性条件：A：0.05％NH

质谱(MS)：通常仅报告表示母体质量的离子，并且除非另有说明，否则所引用的质量离子为正质量离子(M+H)

使用Bruker Avance 400MHz获得NMR谱。

所有涉及空气敏感试剂的反应均在氩气气氛下进行。除非另有说明，否则试剂按从商业供应商获得的原样使用，未经进一步纯化。

制备实例

中间体A1

N-(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯

根据以下方案制备标题化合物：

在0℃下于15分钟内将甲胺溶液(355g，2.87mol，在乙醇中25％)逐滴加入2,4-二氟硝基苯(147g，0.92mol)中。添加完成后，将反应混合物在0℃下搅拌2h。将该溶液用乙醇(500mL)稀释并倒入2L冰水中。通过过滤收集所得的沉淀物，并在真空中干燥，得到5-氟-N-甲基-2-硝基-苯胺(143g，63％产率)，为黄色固体。

在0℃，向氢化钠(141g，3.5mol，在矿物油中的60％分散液)在无水四氢呋喃(2L)中的悬浮液分批添加5-氟-N-甲基-2-硝基-苯胺(60g，0.35mol，化合物A1.2)。将该溶液在0℃下搅拌1小时。然后逐滴加入二碳酸二叔丁酯(115g，0.53mol)在四氢呋喃(0.5L)中的溶液，在15℃下再继续反应15h。将反应混合物倒入1.6L冰水中，并用EtOAc(1.6L)萃取两次。将合并的有机物经无水Na

向N-(5-氟-2-硝基-苯基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯(70g，259mmol，化合物A1.3)在MeOH(1L)中的溶液添加碳载钯(5g，10wt.％负载)。将反应混合物在16℃下在H

向N-(2-氨基-5-氟-苯基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯(80g，333mmol，化合物A1.4)和2,3,5-三氯吡啶(66.8g，366mmol，CAS:16063-70-0)在二噁烷(2L)中的溶液添加碳酸铯(217g，666mmol)、乙酸钯(II)(3.74g，16.7mmol)和BINAP(20.7g，33.3mmol，CAS:98327-87-8)。在氮气氛围下，在120℃下继续反应16h。然后将反应混合物冷却至室温，并用EtOAc(800mL)稀释。通过过滤去除沉淀物。将滤液在真空中浓缩并将残余物通过快速色谱纯化(硅胶，在石油醚中的0.2％至5％EtOAc)，得到N-[2-[(3,5-二氯-2-吡啶基)氨基]-5-氟-苯基]-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯(75g，58％产率)。MS(ESI):390.1([{

在氮气氛下，向N-[2-[(3,5-二氯-2-吡啶基)氨基]-5-氟-苯基]-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯(5.0g，12.95mmol)和DBU(3.94g，25.9mmol，CAS：6674-22-2)在邻二甲苯(7.5mL)和N,N-二甲基乙酰胺(7.5mL)的混合物中添加乙酸钯(II)(727mg，3.24mmol)和三环己基膦四氟硼酸盐(2.38g，6.48mmol)。将反应混合物在160℃下搅拌6h，然后冷却至室温并倒入水(100mL)中。然后将混合物用EtOAc(200mL)萃取，并收集有机层，并用水(50mL)洗涤两次，用盐水(30mL)洗涤两次，经无水Na

在氮气氛围下，在0℃，向N-(3-氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯(4.8g，13.7mmol，化合物A1.5)在二氯甲烷(200mL)中的溶液添加3-氯过苯甲酸(9.47g，54.9mmol)。在30℃继续反应12h。将反应混合物倒入亚硫酸钠水溶液(10％，150mL)中，搅拌1h，然后用EtOAc(750mL)萃取三次。合并的有机物用碳酸氢钠水溶液(5N，200mL)和盐水(250mL)洗涤，然后经无水Na

在-5℃，向N-(3-氯-6-氟-1-氧化-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-1-鎓-8-基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯(4.8g，13.1mmol)在二甲基甲酰胺(100mL)中的溶液添加三氯氧磷(V)(22.1g，144mmol)。将混合物在-5℃至0℃下搅拌1h，然后在0℃下倒入碳酸氢钠水溶液(饱和的，350mL)中。将混合物用EtOAc(500mL)萃取三次，并将合并的有机物用水(200mL)洗涤三次，盐水(150mL)洗涤两次，经无水Na

中间体A2

N-(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯

类似于中间体A1的制备方法，通过在步骤(a)中用乙胺溶液(在乙醇中30％)代替甲胺溶液，制备N-(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯(中间体A2)。MS(ESI)：402.0([{

中间体A3

N-(3,4-二氯-5,6-二氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯

类似于中间体A1的制备方法，通过在步骤(a)中用2,4,5-三氟硝基苯代替2,4-二氟硝基苯，制备N-(3,4-二氯-5,6-二氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯(中间体A3)。MS(ESI):406.1([{

中间体A4

N-(3,4-二氯-6,7-二氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯

类似于中间体A1的制备方法，通过在步骤(a)中用2,3,4-三氟硝基苯代替2,4-二氟硝基苯，制备(3,4-二氯-6,7-二氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-甲基-氨基甲酸叔丁酯(中间体A4)。MS(ESI):406.2([{

中间体A5

N-(3,4-二氯-5,6二-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯

类似于中间体A1的制备方法，通过在步骤(a)中用2,4,5-三氟硝基苯代替2,4-二氟硝基苯，用乙胺溶液(在EtOH中30％)代替甲胺溶液，制备N-(3,4-二氯-5,6-二氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯(中间体A5)。

中间体A6

N-(3-溴-4,6-二氯-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯

类似于中间体A1的制备方法，通过在步骤(a)中用4-氯-2-氟-1-硝基苯代替2,4-二氟硝基苯，在步骤(a)中用乙胺溶液(在EtOH中30％)代替甲胺溶液，在步骤(d)中用2,3,5-三溴吡啶代替2,3,5-三氯吡啶，制备标题化合物。MS(ESI):463.9([{

中间体B1

[2-[(1-叔丁氧基羰基-4-哌啶基)氨基]嘧啶-5-基]硼酸

根据以下方案制备标题化合物：

向5-溴-2-氯嘧啶(3.0g，15.6mmol，化合物B1.1)和4-氨基-1-Boc-哌啶(4.7g，23.4mmol，化合物B1.2)在THF(5.0mL)中的溶液添加DIPEA(6.0g，48.9mol)。在60℃继续反应12h。将混合物冷却至室温并在真空中浓缩，将残余物通过硅胶色谱纯化(在石油醚中的10％EtOAc)，得到4-[(5-溴嘧啶-2-基)氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(2.2g，39％产率)，为黄色油状物。MS(ESI):359.1([{

向4-[(5-溴嘧啶-2-基)氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(2.0g，5.6mmol，化合物B1.4)、双(频哪醇合)二硼(2.8g，11.2mmol)在二噁烷(8.0mL)中的溶液添加乙酸钾(1.45g，16.8mmol)、Pd

中间体B2

2,2-二甲基-3-[5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)嘧啶-2-基]氧基-丙酸甲酯

根据以下方案制备标题化合物：

向5-溴-2-氯嘧啶(1.9g，10mmol，化合物B2.1)和2,2-二甲基-3-羟基丙酸甲酯(2.6g，20mmol，化合物B2.2)在NMP(10mL)中的溶液添加Cs

向3-(5-溴嘧啶-2-基)氧基-2,2-二甲基-丙酸甲酯(0.40g，1.4mmol，化合物B2.3)、双(频哪醇合)二硼(0.42g，1.7mmol)在二噁烷(2mL)中的溶液添加乙酸钾(0.41g，4.2mmol)和Pd(dppf)Cl

中间体B3

[2-[(1-甲氧基羰基环丙基)甲基氨基]嘧啶-5-基]硼酸

类似于中间体B2的制备方法，通过在步骤(a)中用1-(氨基甲基)环丙烷甲酸甲酯盐酸盐代替2,2-二甲基-3-羟基丙酸甲酯(化合物B2.2)，制备标题化合物。MS(ESI)：252.0([M+H]

中间体B4

[2-[(3-甲氧基-2,2-二甲基-3-氧代-丙基)氨基]嘧啶-5-基]硼酸

类似于中间体B2的制备方法，通过在步骤(a)中用3-氨基-2,2-二甲基-丙酸甲酯代替2,2-二甲基-3-羟基丙酸甲酯(化合物B2.2)，制备标题化合物。MS(ESI)：254.2([M+H]

中间体B5

[2-(1-叔丁氧基羰基吡咯烷-3-基)氧基嘧啶-5-基]硼酸

类似于中间体B2的制备方法，通过在步骤(a)中用1-Boc-3-羟基吡咯烷代替2,2-二甲基-3-羟基丙酸甲酯，制备标题化合物。MS(ESI)：310.1([M+H]

中间体B6

[2-(1-叔丁氧基羰基氮杂环丁烷-3-基)氧基嘧啶-5-基]硼酸

类似于中间体B2的制备方法，通过在步骤(a)中用1-Boc-3-羟基氮杂环丁烷代替2,2-二甲基-3-羟基丙酸甲酯，用NaH代替Cs

中间体B7

[2-[(1-叔丁氧基羰基吡咯烷-3-基)氨基]嘧啶-5-基]硼酸

类似于中间体B2的制备方法，通过在步骤(a)中用1-Boc-3-氨基吡咯烷代替2,2-二甲基-3-羟基丙酸甲酯，用DIPEA代替Cs

中间体B8

[2-(四氢呋喃-3-基氨基)嘧啶-5-基]硼酸

类似于中间体B2的制备方法，通过在步骤(a)中用3-氨基四氢呋喃代替2,2-二甲基-3-羟基丙酸甲酯，用DIPEA代替Cs

中间体B9

[2-[2-(叔丁氧基羰基氨基)-2-甲基-丙氧基]嘧啶-5-基]硼酸

类似于中间体B2的制备方法，通过在步骤(a)中用N-Boc-2-氨基-2-甲基-1-丙醇代替2,2-二甲基-3-羟基丙酸甲酯，制备标题化合物。MS(ESI)：312.2([M+H]

中间体B10

[2-[(叔丁氧基羰基氨基)甲基]嘧啶-5-基]硼酸

类似于中间体B4的制备方法，通过用N-Boc-5-溴-2-嘧啶甲胺(Bepharm，目录号：B220284)替换1-(5-溴嘧啶-2-基)环丙烷甲酸乙酯(化合物B4.1)，制备标题化合物。MS(ESI)：254.1([M+H]

中间体B11

[2-(甲氧基甲氧基甲基)嘧啶-5-基]硼酸

根据以下方案制备标题化合物：

将DIPEA(1mL)、(5-溴嘧啶-2-基)甲醇(化合物B11.1，125mg，661μmol)和溴(甲氧基)甲烷(413mg，3.31mmol)在10mL DCM中的混合物在室温搅拌过夜。将反应混合物用EtOAc(50mL)稀释，并用水(50mL)洗涤。将有机层经Na

类似于中间体B4的制备方法，通过用5-溴-2-(甲氧基甲氧基甲基)嘧啶(粗品，由步骤(a)制备)代替1-(5-溴嘧啶-2-基)环丙烷甲酸乙酯(化合物B4.1)，制备标题化合物。MS(ESI)：199.1([M+H]

中间体C1

N-[[3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯

根据以下方案制备标题化合物：

在0℃，向3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-甲酸乙酯(4g，19.2mmol，化合物C1.1)在DMF(50mL)中的溶液添加NaH(1.5g，38.5mmol)。将混合物搅拌1h，然后添加PMBCl溶液(3.6g，23.1mmol)。在室温下继续反应3h后，将反应物倒入水(100mL)中，并用EtOAc(200mL)萃取两次。将合并的有机物经无水Na

将1-[(4-甲氧基苯基)甲基]-3-(三氟甲基)吡唑-4-甲酸乙酯(3.8g，11.3mmol)和NaOH(9g，225mmol)在EtOH(30mL)和水(15mL)中的溶液在60℃搅拌2h。将溶液冷却至室温后，添加HCl溶液(在水中28％)以将pH值调节至约为3。然后将混合物在真空中浓缩并将残余物重新溶于EtOAc(100mL)，并用水(100mL)洗涤。将有机层经Na

将1-[(4-甲氧基苯基)甲基]-3-(三氟甲基)吡唑-4-甲酸(3.2g，10.7mmol)、NH

在0℃，向1-[(4-甲氧基苯基)甲基]-3-(三氟甲基)吡唑-4-甲酰胺(2.9g，9.7mmol)在THF(25mL)中的溶液添加LAH(1.84g，48.5mmol)。将反应在N

向[1-[(4-甲氧基苯基)甲基]-3-(三氟甲基)吡唑-4-基]甲胺(2.5g，8.8mmol)在MeCN(40mL)和水(10mL)中的溶液添加硝酸铈铵(19.2g，35.0mmol)。将反应在室温搅拌2h。用NaOH固体将混合物碱化至pH约为9，然后用MeOH(400mL)稀释。将混合物过滤并将滤液在真空中浓缩，得到粗制[3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-基]甲胺(1.5g)，为黄色固体。

将粗制[3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-基]甲胺(1.5g，8.5mmol)、Boc

中间体C2

3-(三氟甲基)-4,6-二氢-1H-吡咯并[3,4-c]吡唑-5-甲酸叔丁酯

根据以下方案制备标题化合物：

在-78℃，向N-Boc-3-吡咯烷酮(1.0g，5.4mmol)在THF(20mL)中的溶液中添加LDA(6.5mL，在THF/己烷中的1M溶液，6.5mmol)和三氟乙酸乙酯(1.0g，7.0mmol)。使反应温热至室温，并在室温搅拌12h。然后将混合物倒入水(100mL)中，并用EtOAc(100mL)萃取三次。合并的有机物用盐水(100mL)洗涤，经无水Na

将3-氧代-4-(2,2,2-三氟乙酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.7g，5.4mmol，由步骤(a)制得)和一水合肼(0.35g，7.0mmol)在EtOH(20mL)中的溶液在60℃搅拌12h。然后将混合物冷却至室温，在真空中浓缩，然后溶于EtOAc(100mL)。将溶液用盐水(100mL)洗涤两次，经无水Na

中间体C3

3-氰基-4,6-二氢-1H-吡咯并[3,4-c]吡唑-5-甲酸叔丁酯

根据以下方案制备标题化合物：

在室温，向4,6-二氢吡咯并[3,4-c]吡唑-5(1H)-甲酸叔丁酯(1g，4.8mmol)、K

在0℃，向3-碘-4,6-二氢-1H-吡咯并[3,4-c]吡唑-5-甲酸叔丁酯(700mg，2.1mmol)在DMF(20mL)中的溶液添加NaH(125mg，3.1mmol)和PMBCl(391mg，2.5mmol)。继续在室温反应18h。将溶液通过饱和NH

在室温，向3-碘-1-[(4-甲氧基苯基)甲基]-4,6-二氢吡咯并[3,4-c]吡唑-5-甲酸叔丁酯(900mg，1.98mmol)、Zn(CN)

在室温，向3-氰基-1-[(4-甲氧基苯基)甲基]-4,6-二氢吡咯并[3,4-c]吡唑-5-甲酸叔丁酯(500mg，1.4mmol)在MeCN(20mL)和水(4mL)的混合物中的溶液，添加CAN(3.8g，7.0mmol)。将溶液搅拌4h，然后用水(50mL)稀释，并用EtOAc(50mL)萃取三次。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经Na

中间体C4

3-氰基-1,4,5,7-四氢吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯

类似于中间体C3的制备方法，通过在步骤(a)中用4,5-二氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6(7H)-甲酸-6(7H)-甲酸叔丁酯代替4,6-二氢吡咯并[3,4-c]吡唑-5(1H)-甲酸叔丁酯，合成标题化合物。MS(ESI)：249.1([M+H]

实例1.01

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈

向N-(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯(中间体A2，80mg，0.2mmol，作为表1中的“核心”)在DMSO(1mL)中的溶液，添加3-(三氟甲基)吡唑(54.4mg，0.40mmol，作为表1中的“亲核试剂”)和K

将N-[3-氯-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基]-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯(60mg，0.12mmol)、3-氰基吡啶-5-硼酸频哪醇酯(55.7mg，0.24mmol，作为表1中的“硼试剂”)，Pd

向N-[3-(5-氰基-3-吡啶基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基]-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯(45mg，0.08mmol)在DCM(3mL)中的溶液添加TFA(2mL)。将溶液在室温搅拌2h，然后在真空中浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到5-[4-[(3R)-3-氨基吡咯烷-1-基]-6-氟-8-(甲基氨基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈(30mg，81％产率)，为黄色固体。

类似于实例1.01的制备方法，分别使用表1所示的试剂代替步骤(a)中作为“核心”的N-(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯(中间体A2)，步骤(a)中作为“亲核试剂”的3-(三氟甲基)吡唑，步骤(b)中作为“硼试剂”的3-氰基吡啶-5-硼酸频哪醇酯，步骤(b)中作为“催化剂”的Pd

表1.化合物合成与表征

实例2.01

1-[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]嘧啶-2-基]环丙烷甲酸

将(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(1.1g，2.77mmol，作为表2中的“核心”)、3-(三氟甲基)-1H-吡唑(753.6mg，5.54mmol，作为表2中的“亲核试剂”)和K

将(3-氯-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(100mg，0.2mmol)、(2-(1-(乙氧基羰基)环丙基)嘧啶-5-基)硼酸(94.8mg，0.4mmol，作为表2中的“硼试剂”)和K

将

向1-(5-(8-((叔丁氧基羰基(乙基)氨基)-6-氟-4-(3-三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)嘧啶-2-基)环丙烷甲酸(0.08mmol)在DCM(3mL)中的溶液添加TFA(2mL)，并将溶液在室温搅拌2h，然后将其在真空中浓缩。将残余物通过制备型HPLC纯化，得到1-[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]嘧啶-2-基]环丙烷甲酸(30mg，75％产率)，为黄色固体。

类似于实例2.01的制备方法，分别使用表2所示的试剂代替步骤(a)中作为“核心”的N-(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)-N-乙基-氨基甲酸叔丁酯(中间体A2)、步骤(a)中作为“亲核试剂”的3-(三氟甲基)吡唑、步骤(b)中作为“硼试剂”的(2-(1-(乙氧基羰基)环丙基)嘧啶-5-基)硼酸和步骤(b)中作为“催化剂”的Pd-Ad

表2.化合物合成与表征

实例3.01

1-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)嘧啶-2-基)-N-甲基环丙烷甲酰胺

将1-(5-(8-((叔丁氧基羰基(乙基)氨基)-6-氟-4-(3-三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)嘧啶-2-基)环丙烷甲酸(40mg，0.06mmol，实例2.01/步骤c)、盐酸甲胺(21.4mg，0.32mmol，作为表3中的“胺”)、HATU(29.2mg，0.08mmol)和DIPEA(24.7mg，0.19mmol)在DMF(3mL)中的溶液在20℃搅拌12h。LC-MS显示原料已耗尽后，将混合物倒入水(50mL)中，并用EtOAc(100mL)萃取三次。将合并的有机层经Na

向乙基(6-氟-3-(2-(1-(甲基氨基甲酰基)环丙基)嘧啶-5-基)-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶[2,3-b]吲哚-8-基)氨基甲酸叔丁酯(30mg，0.05mmol)在DCM(2mL)中的溶液添加TFA(1mL)，并将反应混合物在20℃搅拌1h。LC-MS显示原料已耗尽后，将混合物在真空中浓缩，得到粗产物，将其通过制备型HPLC(在水中的0.5％TFA)纯化，得到1-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)嘧啶-2-基)-N-甲基环丙烷甲酰胺(12mg，47.4％产率)，为黄色固体。MS(ESI)：539.2([M+H]

类似于实例3.01的制备方法，用表3中所示的试剂代替步骤(a)中作为“胺”的甲胺，制备以下实施例。

表3.化合物合成与表征

实例4.01

1-(3-(5-氰基吡啶-3-基)-8-(乙基氨基)-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-4-基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-甲酰胺

根据以下方案制备标题化合物：

向(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(440mg，1.1mmol，中间体A2)和K

将1-(8-((叔丁氧基羰基)(乙基)氨基)-3-氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-4-基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-甲酸(化合物4.01b)(200mg，0.369mmol)、5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)烟腈(化合物4.01c)(170mg，0.738mmol)和CsF(224mg，1.476mmol)在二噁烷/H

在N

向(4-(4-氨基甲酰基-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-3-(5-氰基吡啶-3-基)-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(80.0mg，0.131mmol，化合物4.01e)在DCM(3mL)中的溶液添加TFA(1.5mL)，并将所得溶液在25℃搅拌1h。将反应混合物在真空中浓缩，得到粗产物，将其通过制备型HPLC(在水中的0.5％TFA)纯化，得到1-(3-(5-氰基吡啶-3-基)-8-(乙基氨基)-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-4-基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-甲酰胺。(50mg，74.8％产率)，为黄色固体。

实例5.01

5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[4-(羟基甲基)-3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]吡啶-3-甲腈

根据以下方案制备标题化合物：

向(3,4-二氯-6-氟-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(440mg，1.1mmol，中间体A2)和K

在N

将(3-氯-6-氟-4-(4-(羟基甲基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(130mg，0.246mmol，化合物5.01b)、5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)烟腈(113mg，0.493mmol)和CsF(150mg，0.986mmol)在二噁烷/H

向(3-(5-氰基吡啶-3-基)-6-氟-4-(4-(羟基甲基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(110mg，0.185mmol，化合物5.01c)在DCM(3mL)中的溶液添加TFA(1.5mL)。将反应混合物在28℃搅拌1h，然后在真空中浓缩，得到粗产物，将其通过制备型HPLC(在水中的0.5％TFA)纯化，得到5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(4-(羟基甲基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)烟腈(77mg，84.2％产率)，为黄色固体。

实例6.01

5-[[5-[8-(乙基氨基)-6-氟-4-[3-(三氟甲基)吡唑-1-基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基]-3-吡啶基]甲基]-3H-1,3,4-噁二唑-2-酮

根据以下方案制备标题化合物：

向(3-氯-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(100mg，0.2mmol)、2-(5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)吡啶-3-基)乙酸乙酯(83.56mg，0.4mmol)在THF(2mL)和水(0.2mL)中的混合物添加K

向2-(5-(8-((叔丁氧基羰基(乙基)氨基)-6-氟-4-(3-三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙酸乙酯(100mg，0.160mmol)在EtOH(5mL)中的溶液添加NaOH水溶液(1mL，1N，1mmol)。在20℃搅拌1h后，用HCl水溶液(1N)将混合物调节至pH＝4-5，然后用EtOAc(20mL)萃取三次。将合并的有机层经Na

将2-(5-(8-((叔丁氧基羰基(乙基)氨基)-6-氟-4-(3-三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙酸(90mg，0.15mmol)、HATU(68.61mg，0.180mmol)和DIPEA(0.08mL，0.450mmol)在DMF(3mL)中的溶液在20℃搅拌0.5h，然后添加肼基甲酸叔丁酯(23.85mg，0.180mmol)，并将所得混合物在20℃再搅拌16h。添加EtOAc(30mL)，并将混合物用盐水(20mL)、饱和NaHCO

向2-(2-(5-(8-((叔丁氧基羰基)(乙基)氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙酰基)肼-甲酸叔丁酯(100mg，0.14mmol)在EtOAc(5mL)中的混合物添加在EtOAc中的HCl溶液(1.0mL，4N，4mmol)。将混合物在20℃搅拌1h，然后在真空中浓缩，得到2-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙酰肼(100mg，65.2％产率)的粗产物，为黄色固体。MS(ESI)：513.1[(M+H)

将2-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙酰肼(100mg，0.2mmol)在THF(5mL)中的溶液添加DIPEA(0.1mL，0.590mmol)，然后将混合物在20℃搅拌0.5h。然后添加CDI(63mg，0.39mmol)，并将混合物在20℃再搅拌16h。添加EtOAc(20mL)，并将混合物用盐水(20mL)、饱和NH

实例7.01

2-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙醇

根据以下方案制备标题化合物：

向2-(5-(8-((叔丁氧基羰基)(乙基)氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙酸乙酯(50mg，0.08mmol)在EtOAc(2mL)中的溶液中添加在EtOAc中的HCl溶液(1.0mL，4N，4mmol)，并将混合物在20℃搅拌2h，然后在真空中浓缩，得到2-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙酸乙酯(40mg)的粗产物，为黄色固体。

在20℃，向2-(5-(8-(乙基氨基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-3-基)吡啶-3-基)乙酸乙酯(40mg，0.08mmol)在THF(2mL)中的溶液添加LAH(2.88mg，0.08mmol)，然后将混合物在20℃搅拌16h。加入水(10mL)以淬灭反应，并将混合物用EtOAc(10mL)萃取三次。将合并的有机层经Na

实例8.01

3-(5-((1H-咪唑-2-基)甲基)吡啶-3-基)-N-乙基-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-胺

根据以下方案制备标题化合物：

向(3-氯-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(250mg，0.5mmol)和(5-(氰基甲基)吡啶-3-基)硼酸(110mg，0.68mmol)在THF/H

向(3-(5-(氰基甲基)吡啶-3-基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(80mg，0.138mmol)在MeOH(5mL)中的溶液添加NaOMe(10mg，0.185mmol)。将反应混合物在N

向(3-(5-(2-氨基-2-亚氨基乙基)吡啶-3-基)-6-氟-4-(3-(三氟甲基)-1H-吡唑-1-基)-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-8-基)(乙基)氨基甲酸叔丁酯(76mg，0.051mmol)在MeOH(5mL)中的溶液，添加2,2-二甲氧基乙胺(15mg，0.143mmol)。在70℃搅拌18h后，将反应混合物在真空中浓缩，得到粗固体，将其溶于草酸水溶液(1N，5mL)，并将所得混合物在80℃下再搅拌3h。将反应混合物冷却至室温，用水(30mL)稀释，并用饱和Na

生物学实例

实例9

50％生长抑制浓度(IC

根据以下过程确定化合物对大肠杆菌(BW25113，获自Coli Genetic StockCenter，#7636)和肺炎克雷伯菌(ATCC10031)的体外抗菌活性：

该测定法使用10点Iso-Sensitest肉汤培养基来定量测量化合物对大肠杆菌BW25113和肺炎克雷伯菌ATCC 10031的体外活性。

将DMSO中的储备化合物在384孔微量滴定板中连续稀释两倍(终浓度为50至0.097μM)，并用49μL Iso-Sensitest肉汤培养基中的细菌悬液接种，使最终体积/孔为50μL/孔的最终细胞浓度约为5×10

细菌细胞生长是通过在16小时的时间内每20分钟在λ＝600nm处测量光密度来确定的。

在细菌细胞对数生长期间计算生长抑制，确定抑制50％(IC

表5-10中使用GP-6(WO 2012/125746 A1中公开的实例4.131)作为参考化合物。

测试本发明化合物抑制50％(IC

表4：本发明化合物对大肠杆菌和肺炎克雷伯菌的IC

*检测限

实例10

最小抑菌浓度实验方案(MIC)测定：

通过MIC(最小抑制浓度)测定来评估化合物抑制大肠杆菌(ATCC 25922)生长的体外效力。从10mM DMSO储备溶液中制备样品。在主板(Greiner，目录号：651201)中的DMSO中连续2倍稀释后，将180μL无菌蒸馏水加到20μL样品的等分试样中。然后将10μL稀释的化合物转移到新的测定板中(Costar，3599)。

通过将20mg/L CaCl

将每种测试微生物的小瓶在液氮冷冻机的蒸气相中保持冷冻。从液氮冷冻机中取出细菌大肠杆菌ATCC 25922(KWIKSTIK，0335K)，在室温解冻，并在CAMHB培养基中稀释细菌，以使最终接种物达到5×105CFU/mL，将90μL带有细菌的CAMHB分散到测定板上并吸取5次。

然后将测定板在35℃在环境空气中温育20小时。孵育后，通过显微镜读取并记录MIC(μg/mL)，该浓度是抑制微生物可见生长的最低药物浓度。

表5：本发明化合物对大肠杆菌的MIC值

实例11

冻干溶解度测定(LYSA)：

通过LYSA测定法评估本发明化合物的溶解度。从稀释在30μL纯DMSO中的10mMDMSO储备溶液(20μL)中一式两份制备样品。用离心真空蒸发仪蒸发DMSO后，将残留物溶于0.05M磷酸盐缓冲液(150μL,pH6.5)中，将其搅拌一小时并摇晃两小时。一夜后，使用微量滴定板过滤溶液。然后通过HPLC-UV分析滤液及其1/10稀释度。此外，从10mM储备溶液中制备四点校准曲线，并将其用于化合物的溶解度测定。结果以μg/mL为单位，并汇总在表6中。发现本发明的特定化合物的LYSA＞10μg/mL，与GP-6相比溶解度大幅提高。

表6：实例的溶解度数据

*检测限

实例12

细胞毒性测定：

通过HepG2测定评估本发明化合物的细胞毒性。将HepG2细胞(ATCC HB-8065

表7：实例的CC

*检测限