链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白S27L及其应用

技术领域

本发明涉及链酶亲和突变的突变蛋白，经突变后能够可逆结合生物素，因此能够用于蛋白纯化，再生后并重复利用。

背景技术

链霉亲和素(即Streptavidin)对生物素(Biotin)具有超强的非共价结合力，野生型链霉亲和素结合生物素的解离平衡常数K

Voss等对链霉亲和素的44-47位氨基酸突变得到StrepTactin突变体(44-47位氨基酸具有以下序列：Val-Thr-Ala-Arg，野生型链霉素亲和素在15位至139位的截短序列)，其能特异性结合短肽Strep tagⅡ(肽段序列：Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys)，其结合Strep tagⅡ的解离平衡常数K

由于SBP标签长度较长，因此其应用有限，目前应用最广的是StrepTactin与Strep标签，但是单独的Strep tagⅡ与StrepTactin结合仍然不够强，因此实际使用过程中将两个Strep tagⅡ串联(即Twinstrep标签，肽段序列：Trp-Ser-His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys-(Gly-Gly-Gly-Ser)

发明内容

有鉴于此，本发明的目的之一在于提供链霉亲和素野生型链酶亲和素的44-47位氨基酸为VATR，以及第27位丝氨酸突变的突变蛋白；本发明的目的之二在于提供含有所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白的固定复合物；本发明的目的之三在于提供所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白或所述固定复合物在纯化Strep tagⅡ标签或Twinstrep标签蛋白中的应用；本发明的目的之四在于提供所述链霉亲和素突变蛋白或所述固定复合物在纯化生物素修饰蛋白中的应用；本发明之五在于提供利用所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白纯化Strep tagⅡ标签或Twinstrep标签蛋白的方法。

为达到上述目的，本发明提供如下技术方案：

1、链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白S27L，所述突变蛋白为野生型链酶亲和素第44至47位氨基酸残基为VTAR，以及在野生型链酶亲和素的第27位丝氨酸突变为亮氨酸，记为S27L；氨基酸序列如SEQ ID NO.24所示。

2、所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白与微球的固定复合物。

3、所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白或所述固定复合物在纯化StreptagⅡ标签或Twinstrep标签蛋白中的应用。

4、所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白或所述交联复合物在纯化生物素修饰蛋白中的应用。

5、利用所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白纯化Strep tagⅡ标签或Twinstrep标签蛋白的方法，将表达含Strep tagⅡ标签或Twinstrep标签蛋白的裂解液与所述突变蛋白的固定复合物结合，用缓冲液冲洗，最后用5-10mM Biotin缓冲液洗脱，收集洗脱液。

本发明优选的，所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白纯化Strep tagⅡ标签或Twinstrep标签蛋白的方法，其特征在于：Biotin缓冲液洗脱后还包括再生利用，具体为：向纯化过Strep tagⅡ标签或Twinstrep标签蛋白的固定复合物加入缓冲液洗涤即可再次使用。

本发明的有益效果在于：本发明提供了所述链霉亲和素第27位丝氨酸突变的突变蛋白，将野生型链酶亲和素第27位的丝氨酸(Ser)突变成不同氨基酸的突变体，突变后的蛋白与Strep tagⅡ结合力增加，提高了其对Strep和TwinStrep融合蛋白的纯化能力，同时与Biotin的结合减弱，使得Biotin与其作用变得可逆，洗脱后进行洗涤再生可再次利用，因此能够更好的用于Biotin修饰蛋白和Strep tagⅡ标签蛋白纯化，用Biotin对生物素修饰的蛋白进行洗脱，洗脱后用缓冲液对StrepTactin mut进行洗涤再生即可再次利用。

附图说明

为了使本发明的目的、技术方案和有益效果更加清楚，本发明提供如下附图进行说明：

图1为27位相关突变体富集Twinstrep修饰的蛋白的筛选(A:StepTactin Beads和S27T，S27A，S27G，S27E，S27Q，S27W，S27C，S27H Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果单次对比；B：StepTactin Beads和S27T，S27N，S27V，S27M，S27P，S27L，S27K，Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果单次对比；C：StepTactin Beads和S27T，S27Y，S27I，S27D，S27PR，S27F Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果单次对比)。

图2为27位相关突变体富集Twinstrep修饰的蛋白的重生3次结果(A:S27T Beads和S27A，S27G Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果对比图(S27T 1-3：S27T Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27A 1-3：S27ABeads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27G 1-3：S27G Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验)；B：S27T Beads和S27H，S27Q Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果对比图(S27T 1-3：S27T Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27H 1-3：S27H Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27Q1-3：S27Q Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验)；C：S27T Beads和S27L，S27P Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果对比图(S27T 1-3：S27T Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27L 1-3：S27L Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27P 1-3：S27PBeads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验)；D：S27T Beads和S27M，S27F Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果对比图(S27T 1-3：S27T Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27M 1-3：S27M Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27F 1-3：S27F Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验)；E：S27T Beads和S27N，S27K Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果对比图(S27T1-3：S27T Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27N 1-3：S27N Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27K 1-3：S27K Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验)；F：S27T Beads和S27R，S27I Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果对比图(S27T 1-3：S27T Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27R 1-3：S27R Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27I 1-3：S27I Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验)；G：S27T Beads和S27C Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果对比图(S27T 1-3：S27TBeads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27C 1-3：S27C Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验)；H：S27T Beads和S27V Beads纯化Twinstrep-eGFP的效果对比图(S27T 1-3：S27T Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验；S27 1-3：S27C Beads纯化Twinstrep-eGFP的重生三次实验))。

图3为27位相关突变体富集Twinstrep修饰的蛋白重生六次结果(A:S27A Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27A Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验)；B：S27C Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27C Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验)；C：S27G Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27G Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验)；D：S27Q Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27Q Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验)；E：S27K Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27K Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验)；F：S27L Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27L Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验)；G：S27M Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27M Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验)；H：S27P Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27P Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验)；I：S27V Beads纯化Twinstrep-eGFP重复利用图(1-6：S27V Beads纯化Twinstrep-eGFP，并重生六次实验))。

图4为27位相关突变体纯化Strep-eGFP的效果单次结果(A：S27T，S27A，S27V，S27P，S27L，S27H，S27G Beads纯化Strep-eGFP的效果单次对比；B：S27T，S27I，S27M，S27Q，S27C，S27K Beads纯化Strep-eGFP的效果单次对比)。

图5为27位相关突变体富集Bio-eGFP和Bio-BSA对比图(A：S27T Beads和S27A，S27V，S27L，S27H，S27G Beads纯化富集Bio-eGFP和Bio-BSA对比图(In：加入的蛋白总量；S27T:S27T Beads洗脱下来的蛋白；S27A:S27A Beads洗脱下来的蛋白；S27V:S27V Beads洗脱下来的蛋白；S27L:S27L Beads洗脱下来的蛋白；S27H:S27H Beads洗脱下来的蛋白；S27G:S27G Beads洗脱下来的蛋白)；B：S27T Beads和S27I，S27M，S27Q，S27C，S27K Beads纯化富集Bio-eGFP和Bio-BSA对比图(In：加入的蛋白总量；S27T:S27T Beads洗脱下来的蛋白；S27I:S27I Beads洗脱下来的蛋白；S27M:S27M Beads洗脱下来的蛋白；S27Q:S27QBeads洗脱下来的蛋白；S27C:S27C Beads洗脱下来的蛋白；S27K:S27K Beads洗脱下来的蛋白)。

具体实施方式

下面结合附图和具体实施例对本发明作进一步说明，以使本领域的技术人员可以更好的理解本发明并能予以实施，但所举实施例不作为对本发明的限定。

实施例1、27位相关突变体富集Twinstrep修饰的蛋白的筛选

本发明中为了提升链霉亲和素(Streptavidin)与Strep tagⅡ的结合能力，降低StrepTactin与生物素(Biotin)的结合能力，综合StrepTactin与其配体的结合位点，对StrepTactin与生物素形成氢键的关键氨基酸进行定点突变，目的在于保留原来的产品优点的同时弥补其不足之处，减弱生物素与StrepTactin的结合，来获得可与生物素可逆结合的StrepTactin突变体(StrepTactin muts)。将27位进行了其他各个氨基酸突变，分别为S27T、S27G、S27A、S27C、S27D、S27E、S27F、S27H、S27I、S27K、S27L、S27M、S27N、S27Q、S27R、S27V、S27Y、S27P、S27W，其突变后的蛋白序列分别如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.6、SEQ IDNO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.20、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.32、SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.38和SEQ ID NO.40；基因序列分别如SEQID NO.3、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.13、SEQ IDNO.15、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.25、SEQ IDNO.27、SEQ ID NO.29、SEQ ID NO.31、SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.37和SEQID NO.37。

实施例2、StrepTactin mut的制备

1)取5μL抽提的含上述设计的含StrepTactin muts的质粒(含StrepTactin mut的质粒是以PIISA-His-StrepTactin为模板，设计引物对其进行定点突变，PIISA-His-StrepTactin是由公司合成而得，PIISA-His-StrepTactin如SEQ ID NO.45)加入至100μL的BL21 codon plus(DE3)感受态细胞中，冰浴30min后42℃热激90s，再在冰上静置2min，加入900μL的LB培养基在37℃、200rpm的摇床内复苏1h，涂布于含100μg/mL的氨苄抗性的平板上，37℃恒温过夜培养；

2)第二天从过夜培养的平板上挑取一个单菌落至10mL含100μg/mL氨苄青霉素的LB培养基中，在37℃、200rpm的摇床中培养12h，将培养后的10mL菌液转接至1L含100μg/mL氨苄青霉素的LB培养基中，在37℃、200rpm的摇床中培养，当OD

3)将重悬的大肠杆菌使用超声破碎仪破碎，低温条件下以40％的功率，超声3s，停7s，超声20min，超声后的菌液在60℃加热15min，加热后的菌液在4℃、15000rpm、离心20min，取上清，并将上清液用0.45μm滤膜抽滤到一个干净50mL离心管内，放置于冰上；

4)用50mL 50mM PBS(pH 7.4)缓冲液平衡处理好的Ni-IDA beads，平衡完毕加入上一步中抽滤好的大肠杆菌上清液，收集从柱内流出的裂解液重复上样一次；

5)上样结束后，用含5mM咪唑的50mM PBS(pH 7.4)冲洗Ni柱，总计冲洗100mL；

6)用含40mM咪唑的50mM PBS(pH 7.4)缓冲液冲洗Ni柱，总计冲洗50mL；

7)用20mL的含250mM咪唑的50mM PBS(pH 7.4)缓冲液洗脱目的蛋白，洗脱结束将洗脱的蛋白放置于冰上；

8)向洗脱后的蛋白加入8.72g硫酸铵，震荡溶解硫酸铵，待硫酸铵溶解后放置于冰上30min沉淀His-StrepTactin mut蛋白；

9)将上一步中的蛋白在4℃、15000rpm、离心10min，离心结束弃上清，沉淀用2mL的含5mM EDTA的10mM NaHCO

实施例3、StrepTactin mut的交联固定

1)取2mL纯化后的His-StrepTactin mut蛋白，将蛋白在2L的200mM NaHCO

2)透析结束的His-StrepTactin mut蛋白测定其在280nm波长的紫外吸收值，按每毫克蛋白吸收值为2.84计算透析后的蛋白浓度和蛋白总质量；

3)按每毫升NHS微球(NHS Beads)交联固定12mg StrepTactin mut蛋白量交联，用5倍Beads体积的1mM HCl溶液活化NHS Beads，活化后用5倍Beads体积的200mM NaHCO

4)交联结束后，用5倍Beads体积的100mM Tris-HCl(pH 8.5)缓冲液冲洗Beads一次，再用5倍Beads体积的100mM Tris-HCl(pH 8.5)缓冲液封闭Beads上未反应的NHS基团，4℃旋转封闭12h；

5)封闭结束后，用5倍Beads体积的50mM Tris-HCl(pH 7.4)、150mM NaCl、1mMEDTA缓冲液冲洗Beads一次，将交联后的StrepTactin mut保存于一倍Beads体积的50mMTris-HCl(pH 7.4)、150mM NaCl、1mM EDTA、0.03％ NaN

实施例4、TwinStrep-eGFP的表达及裂解液制备

1)取5μL抽提的含TwinStrep-eGFP的质粒，TwinStrep-eGFP的核苷酸序列如SEQID NO.13所示(TwinStrep-eGFP的质粒由pIISA-TwinStrep质粒用限制性内切酶BsaI酶切，将eGFP通过BsaI酶切位点用T4连接酶与载体连接，pIISA-TwinStrep质粒由扩增的TwinStrep序列连入pIISA的BsaI酶切位点而得)，分别加入至100μL的BL21 codon plus(DE3)感受态细胞中，冰浴30min后42℃热激90s，再在冰上静置2min，加入900μL的LB培养基在37℃、200rpm的摇床内复苏1h，涂布于含100μg/mL的氨苄抗性的平板上，37℃恒温过夜培养；

2)第二天从过夜培养的平板上挑取一个单菌落至10mL含100μg/mL氨苄青霉素的LB培养基中，在37℃、200rpm的摇床中培养12h，从培养后的10mL菌液取1mL菌液转接至100mL含100μg/mL氨苄青霉素的LB培养基中，在37℃、200rpm的摇床中培养，当OD

3)将重悬的大肠杆菌使用超声破碎仪破碎，低温条件下以40％的功率，超声3s，停7s，超声5min，超声后的菌液在4℃、15000rpm、离心20min，取上清，并将上清液用0.45μm滤膜抽滤到一个干净15mL离心管内，放置于冰上；得到TwinStrep-eGFP裂解液。

实施例4、StrepTactin mut Beads对TwinStrep-eGFP的纯化

1)取15μL StrepTactin mut Beads，用200μL 20mM Tris-HCl(pH 7.4)、150mMNaCl、1mM PMSF缓冲液平衡beads，4℃、3000rpm离心1min，弃上清；

2)取100μL上述制备的TwinStrep-eGFP裂解液加入至StrepTactin mut交联固定的Beads中，4℃旋转结合30min；

3)结合结束，用200μL 20mM Tris-HCl(pH 8.0)、150mM NaCl、1mM EDTA、0.5％Triton-X100缓冲液洗涤beads 3次，再用200μL 20mM Tris-HCl(pH 7.4)、150mM NaCl、1mMEDTA缓冲液洗涤beads 2次，每次洗涤5min，然后在4℃、3000rpm离心1min，弃上清；

4)用20μL 50mM Tris-HCl(pH 7.4)、150mM NaCl、5mM Biotin缓冲液洗脱beads上的蛋白，洗脱液加入至beads中后，先静置5min，然后4℃、3000rpm离心1min，收集离出的液体，洗脱3次；

5)纯化结束对每一步中的样品取样，加入5×SDS Loading Buffer(含DTT)，95℃加热5min后进行16.5％聚丙烯凝胶电泳，经考马斯亮蓝染色，结果如图1所示。结果显示S27T、S27G、S27A、S27C、S27F、S27H、S27I、S27K、S27L、S27M、S27N、S27Q、S27R、S27V、S27P对Twinstrep单次结富集能力相当。本实施例中用含5-10mM Biotin的缓冲液洗脱均可。

2、StrepTactin mut Beads纯化TwinStrep-eGFP后再生利用

1)向纯化过TwinStrep-eGFP的15μL StrepTactin mut Beads中加入200μL 20mMTris-HCl(pH 7.4)、150mM NaCl、1mM EDTA缓冲液洗涤beads 3次，每次洗涤5min，然后在4℃、3000rpm离心1min，弃上清，经过3次洗涤后StrepTactin mut Beads即可再次使用；

2)按StrepTactin mut Beads对TwinStrep-eGFP的纯化步骤测试再生后的StrepTactin mut Beads的纯化效果，纯化结束按再生步骤进行再生，如此重复3次，结束后对每一次纯化的样品取样，加入5×SDS Loading Buffer(含DTT)，95℃加热5min后进行16.5％聚丙烯凝胶电泳，经考马斯亮蓝染色，结果如图2所示。按照上述方法将S27T和W120H再生6次以上，结束后对每一次纯化的样品取样，加入5×SDS Loading Buffer(含DTT)，95℃加热5min后进行16.5％聚丙烯凝胶电泳，经考马斯亮蓝染色，结果如图3所示。并且本实施例中，PBS缓冲液或TE缓冲液等洗涤均可再次使用，因此适应缓冲液范围广。

上述结果表明，其中丝氨酸(Ser)突变为苏氨酸(Thr)(S27T)，丙氨酸(Ala)(S27A)，缬氨酸(Val)(S27V)，天冬酰胺(Asn)(S27N)，甲硫氨酸(Met)(S27M)，脯氨酸(Pro)(S27P)，赖氨酸(Lys)(S27K)，半胱氨酸(Cys)(S27C)，异亮氨酸(Ile)(S27I)等对Twinstrep的结富集能力相当；将27位突变为甘氨酸(Gly)(S27G)时，首次用于富集Twinstrep标签的蛋白载量较高，重生后载量降低但重复性仍然优于StrepTactin。将27位突变为苯丙氨酸(Phe)(S27F)，谷氨酰胺(Gln)(S27Q)，组氨酸(His)(S27H)，精氨酸(Arg)(S27R)，亮氨酸(Leu)(S27L)时，富集Twinstrep的载量相对降低，但是相对重生利用性好，洗脱后用Tri-HCl缓冲液、PBS缓冲液或TE对突变体进行洗涤再生即可再次利用，而StrepTactin如果只简单用Tri-HCl(pH 7.4)缓冲液重生后对Twinstrep融合蛋白几乎无富集能力。

将27位突变为酸性氨基酸天冬氨酸(Asp)(S27D)和谷氨酸(Glu)(S27E)以及酪氨酸(Tyr)(S27Y)，色氨酸(Trp)(S27W)，对Twinstrep与Biotin的结合效果明显减弱，特别是突变为D和E对Twinstrep则削弱为无富集效果。

实施例5、27位相关突变体富集Strep修饰的蛋白的筛选

将以上筛选出的对带Twinstrep标签的蛋白富集效果较好的几个突变体进行对带Strep标签的蛋白富集测试。Strep标签的蛋白氨基酸序列如SEQ ID NO.41所示，制备方法与TwinStrep-eGFP相同，区别是连入Strep-eGFP如SEQ ID NO.42所示的核苷酸序列。结果如图4所示。结果显示，S27A对带Strep标签的蛋白富集的载量较高，S27T，S27C，S27P，S27H，S27I，S27K，S27V对带Strep标签的蛋白富集效果也相对明显。

实施例6、27位相关突变体富集生物素修饰的蛋白的筛选

1、生物素修饰的eGFP(Bio-eGFP)的表达及裂解液制备

生物素可以在生物素连接酶(BirA)的作用下特异性的修饰于Avi标签中的赖氨酸残基上即生成生物素化的Avi标签。

1)取5μL抽提的含CBD-BirA质粒，CBD-BirA基因序列如SEQ ID NO.43所示(含CBD-BirA质粒由限制性内切酶XhoI和NcoI酶切PET28a-CBD，将BirA通过XhoI酶切位点用T4连接酶连接，PET28a-CBD由BSAI酶切位点将CBD与PET28a载体链接)和含Avi-eGFP的质粒，Avi-eGFP基因序列如SEQ ID NO.44所示(含Avi-eGFP的质粒由限制性内切酶BamHI和XhoI酶切PET22b-avi质粒，将eGFP通过BamHI和XhoI酶切位点用T4连接酶连接，PET22b-avi质粒通过重组将avi与PET22b连接)，然后加入至100μL的BL21 codon plus(DE3)感受态细胞中，冰浴30min后42℃热激90s，再在冰上静置2min，加入900μL的LB培养基在37℃、200rpm的摇床内复苏1h，涂布于含100μg/mL的氨苄和50μg/mL的卡那霉素抗性的平板上，37℃恒温过夜培养；

2)第二天从过夜培养的平板上挑取一个单菌落至10mL含100μg/mL氨苄青霉素和50μg/mL的卡那霉素的LB培养基中，在37℃、200rpm的摇床中培养12h，从培养后的10mL转接至1L含100μg/mL氨苄青霉素和50μg/mL的卡那霉素的LB培养基中，在37℃、200rpm的摇床中培养，当OD

3)将重悬的大肠杆菌使用超声破碎仪破碎，低温条件下以40％的功率，超声3s，停7s，超声20min，超声后的菌液在4℃、15000rpm、离心20min，取上清，并将上清液用0.45μm滤膜抽滤到一个干净50mL离心管内，放置于冰上，即得Bio-eGFP裂解液。

制备Bio-BSA，称取664.5mg BSA蛋白用缓冲液溶解，称取34.1mg Biotin-NHS至溶解后的BSA中，25℃过夜反应后透析到200mM NaHCO

以上所述实施例仅是为充分说明本发明而所举的较佳的实施例，本发明的保护范围不限于此。本技术领域的技术人员在本发明基础上所作的等同替代或变换，均在本发明的保护范围之内。本发明的保护范围以权利要求书为准。