一种耐盐蛋白、编码其的基因及应用

技术领域

本发明涉及一种耐盐蛋白。

背景技术

西伯利亚白刺(Nitraria sibirica)隶属蒺藜科白刺属落叶具刺灌木，是典型的稀盐型盐生植物，可在重盐碱地正常生长，对恶劣环境有非常强的适应能力，是防风固沙、保持水土及重盐碱地改良的先锋型植物，不但具有极高的生态应用价值，同时也是研究植物耐盐分子机制和挖掘耐盐抗逆基因资源的重要材料。

发明内容

本发明之一提供了一种蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID No.4所示。

本发明之二提供了编码如本发明之一所述的蛋白的基因。

在一个具体实施方式中，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。

本发明之三提供了根据本发明之一所述的蛋白或本发明之二所述的基因在耐盐中的应用。

本发明的有益效果：

本发明首次发现了西伯利亚白刺中一种耐盐基因，可以将其用于植物的耐盐改良。

附图说明

图1显示了RT-PCR技术克隆得到的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示的耐盐基因全长电泳图，图中M为DL2000 DNA Marker，1为耐盐基因。

图2显示了200mM NaCl处理后根中耐盐基因的RT-qPCR检测结果。

图3显示了200mM NaCl处理后茎中耐盐基因的RT-qPCR检测结果。

图4显示了200mM NaCl处理后叶中耐盐基因的RT-qPCR检测结果。

图5显示了400mM NaCl处理后根中耐盐基因的RT-qPCR检测结果。

图6显示了400mM NaCl处理后茎中耐盐基因的RT-qPCR检测结果。

图7显示了400mM NaCl处理后叶中耐盐基因的RT-qPCR检测结果。

图8为转基因烟草的PCR鉴定图。

图9显示了五株转基因烟草中耐盐基因的RT-qPCR检测结果。

图10显示了超氧化物歧化酶活性在NaCl处理1d、5d、10d的变化。

图11显示了过氧化氢含量在NaCl处理1d、5d、10d的变化。

图12显示了脯氨酸含量在NaCl处理1d、5d、10d的变化。

图13显示了丙二醛含量在NaCl处理1d、5d、10d的变化。

具体实施方式

以下通过优选的实施案例的形式对本发明的上述内容作进一步的详细说明，但其不构成对本发明的限制。

如无特别说明，本发明的实施例中的试剂均可通过商业途径购买。

pEASY-Blunt质粒载体和大肠Trans1-1感受态细胞购自全式金公司。

实施例1

西伯利亚白刺耐盐基因cDNA序列的克隆。

采用擎科生物技术有限公司RNA提取试剂盒从NaCl处理后的西伯利亚白刺全株中提取总RNA。

利用TaKaRa公司反转录试剂盒对所提取的总RNA进行反转录合成得到cDNA，然后以合成的cDNA为模板，以引物Ns-F(SEQ ID No.1)和Ns-R(SEQ ID No.2)为引物进行PCR，得到PCR产物。其中，PCR程序为：(1)94℃，预变性5分钟。(2)PCR扩增，33个循环：94℃，变性45秒；60℃退火45秒；72℃，延伸45秒；(2)72℃，延伸10分钟。利用琼脂糖凝胶电泳对PCR产物进行分离，结果见图1，用OMEG bio-tek试剂盒对PCR产物中的目的片断进行回收；回收产物连接到pEASY-Blunt载体上并转化至大肠杆菌Trans1-1感受态细胞中，挑选转化菌落进行PCR鉴定，然后将扩增出符合预先大小的PCR片段(大小与图1相同)的转化子送至擎科生物技术有限公司测序，得到的测序结果与转录组中的测序片段完全相同，说明克隆所得的基因即为目的基因，将测序正确的质粒命名为pEASY-Blunt-Ns5，测序正确的大肠杆菌菌株命名为pEASY-Blunt-Ns5/Trans1-1。其中，所克隆基因的核苷酸序列如SEQID No.3所示，其编码的氨基酸序列如SEQID No.4所示。

实施例2

西伯利亚白刺耐盐基因在逆境中的表达特性

对于西伯利亚白刺一年生组培苗进行200mM及400mM浓度的NaCl胁迫，并对每个浓度下培养的组培苗在0h、6h、12h、24h、48h及72h后对根、茎及叶片进行取样，之后迅速放入液氮中速冻，在液氮中研磨后采用与实施例1相同的操作分别提取RNA以及反转录合成cDNA。以NsRT-F(SEQ ID No.5)和NsRT-R(SEQ ID No.6)为引物，以每个样品的反转录合成的cDNA分别为模板进行RT-qPCR(方法参考TransStart Top Green qPCR SuperMix说明书，货号：AQ131-04，购自全式金生物技术有限公司)，并以西伯利亚白刺的肌动蛋白(actin)为内参，内参引物为Actin-F(SEQ ID No.7)和Actin-R(SEQ ID No.8)。RT-qPCR结果如图2至7所示，相较于200mM NaCl浓度，耐盐基因的表达水平对400mM NaCl浓度更加敏感，并在处理6h后该基因的表达量达到最高。

实施例3

1.西伯利亚白刺耐盐基因表达载体的构建

以引物NsXbaI-F(SEQ ID No.9，添加Xba I酶切位点)和NsSepI-R(SEQ ID No.10，添加SepI酶切位点)为引物，以pEASY-Blunt-Ns5质粒为模板进行PCR，获得添加了酶切位点的目的片段，对pBI121载体进行Xba I和Sep I双酶切后，利用SoSoo同源重组酶(SoSoo同源重组酶试剂盒，购自擎科生物技术有限公司，货号：TSV-S2)将回收后的酶切载体与加了酶切位点目的片段进行无缝融合连接。将连接产物转入大肠杆菌Trans1-1，挑选转化菌落进行PCR鉴定，然后将扩增出符合预先大小的PCR片段的转化子送至擎科生物技术有限公司测序，将测序正确的质粒命名为pBI121-Ns5，测序正确的大肠菌菌株命名为pBI121-Ns5/Trans1-1。

2.根癌农杆菌感受态制备

(1)将根癌农杆菌GV3101培养液加入到含50mg/L利福平的固态LB培养基上面并进行划线，28℃连续培养2d；

(2)从固体LB细菌培养基挑选提取一个单克隆菌落接种于液体LB(50mg/L利福平)中进行扩繁，摇床28℃，200rpm持续培养18-24h，直至OD

(3)然后将5μL OD

(4)在超净化工作台里面移取步骤(3)培养的菌液，均匀分装至已经消毒灭菌的1.5ml离心管中，冰水浸泡30min后，4℃、5000rpm离心5min，倒掉菌液上清；

(5)用0.15M NaCl重悬；

(6)5000rpm离心5min，于20mL无菌水重悬，制得根癌农杆菌GV3101的感受态。

3.利用冻融法将pBI121-Ns5质粒转化根癌农杆菌

(1)将10μL pBI121-Ns5质粒加入至100μL的根癌农杆菌GV3101的感受态中，随后进行35min的冰浴；

(2)液氮冷冻1min；

(3)37℃水浴3min；

(4)加入500μL液体LB培养基，28℃，200rpm摇床培养2h，得到转化菌液；

(5)取200μL的转化菌液均匀地涂布在含有50mg/L卡那霉素、25mg/L利福平和50mg/L庆大霉素的培养基上，然后放到28℃恒温箱中，倒置培养2d，然后以NsXbaI-F(SEQID No.9)和NsSepI-R(SEQ ID No.10)为引物进行菌落PCR鉴定，并进行测序验证，将得到的阳性重组菌株命名为pBI121-Ns5/GV3101。

实施例4

根癌农杆菌介导耐盐基因转化烟草方法

(1)农杆菌液活化制备：取pBI121-Ns5/GV3101根癌农杆菌，在含有50mg/L卡那霉素、25mg/L利福平和50mg/L庆大霉素的固体LB的培养基中进行划线倒置在28℃下活化培养2d；挑取单菌落于含50mg/L卡那霉素、25mg/L利福平和50mg/L庆大霉素的LB液体培养基在28℃、200rpm下培养8小时；取2mL的根癌农杆菌培养液，加入至50mL相同的液体培养基中，继续培养直至根癌农杆菌OD

(2)侵染：在无菌条件下，从一月龄烟草组培苗中选取第二片和第三片叶，剪成大约1×1cm的小方块放至侵染菌液中进行10min的侵染，轻轻摇晃使其充分侵染。完成后取出叶片，在共培培养基上共培养48h，得到共培养烟草叶片。

(3)筛选分化：将共培养烟草叶片放入含250mg/L头孢的去离子水中轻晃5min，捞入无菌水水中清洗4至5次，直至水清澈透明。用灭菌滤纸吸干大部分水分，放在含有100mg/L卡那霉素、100mg/L利福平和100mg/L庆大霉素的无菌分化培养基(蔗糖：20g/L、琼脂：5.5g/L、6-BA：0.03mg/L，PH：6.0)上进行无菌培养。每9-10天更换一次培养基，直至共培养烟草叶片分化出绿芽。(4)分化生根培养：在绿芽生长到2cm左右时，将其从培养基中切下并转移至含有50mg/L卡那霉素、50mg/L利福平和50mg/L庆大霉素无菌生根培养基(蔗糖：20g/L、琼脂：5.5g/L、IBA：0.25mg/L，PH：6.0)上进行培养，直至生根。

(5)转基因烟草阳性株的筛选：将经转基因操作生长的T0代烟草和野生生长的烟草在组培瓶中种植生长一个月时分别提取基因组总DNA，其中以野生烟草的基因组总DNA为模板进行PCR以作为阴性对照，以pBI121-Ns5质粒为模板进行PCR以作为阳性对照，以Nt-F(SEQ ID No.11)和Nt-R(SEQ ID No.12)为引物进行PCR检测(由于使用的通用引物设计在pBI121多克隆位点两侧的载体序列，且pBI121-Ns5两端添加了酶切位点及保护碱基，因而进行阳性鉴定的片段长于基因全长及pBI121-Ns5)。PCR结果如图8所示，WT为野生型烟草(阴性对照)，1为pBI121-Ns5质粒(阳性对照)，2-6为转基因烟草。结果显示，从五株T0代转基因烟草株中均可以扩增出目的条带，而阴性对照无目的片段，测序结果证明五株转基因烟草株均已成功地转入耐盐基因，将五株T0代转基因烟草株编号为OE-1至5。

以NsRT-F(SEQ ID No.5)和NsRT-R(SEQ ID No.6)为引物，肌动蛋白(actin)为内参，对五株转基因烟草株生长一个月的样本进行RT-qPCR分析，获得耐盐基因在T0代转基因植株中的表达情况，结果如图9所示，选取表达最高的OE-3与OE-4结籽后播种，获得T1子代，在对T1子代进行阳性筛选，并将两株植株的子代分别命名为N-OE-3和N-OE-4以用于后续实验。

实施例5

转基因烟草株系在盐胁迫下的生长情况

以野生型为阴性对照，选取培养的株系OE-3和OE-4中长势一致的转基因T1代植株，放置于室温为23±1℃的培养室培养，土壤成分为蛭石：珍珠岩：东北黑土＝1:3:5，培养光周期：16h光照/8h黑暗；在组培苗长至高10-15cm时，用175mM的氯化钠处理，在处理之后观察植株的长势，观察结果显示，在经过175mM的氯化钠处理的10天时，野生型对照植株的叶片出现明显卷曲，生长受到阻碍；而转基因烟草植株的叶片肥大，几乎不受影响。

同时，在用175mM的氯化钠处理之后的第1天、第5天和第10天剪去叶片以用于超氧化物歧化酶(SOD)活性、脯氨酸(PRO)含量、过氧化氢(H

从超氧化物歧化酶活性、脯氨酸、过氧化氢及丙二醛四个指标的结果可以看出，相比于野生型烟草，转基因烟草在盐胁迫下能够保持较高的SOD活性及脯氨酸含量且在处理初期显著高于野生型(阴性对照)，而过氧化氢及丙二醛含量显著低于野生型。具体地，转基因烟草在盐胁迫下持续保持较高SOD活性，故认为有较高的耐盐性，但由于SOD作业时会产生的过氧化氢并可穿透大部分细胞膜，造成氧化胁迫，因此对盐处理后第1天、第5天和第10天的各植株中H

综合以上分析，说明在转入了本发明的耐盐基于后的转基因植株耐盐性显著增强。

序列表

<110> 中国林业科学研究院

中国林业科学研究院黄河三角洲综合试验中心

<120> 一种耐盐蛋白、编码其的基因及应用

<130> LHA2160329

<160> 12

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 1

atgaacattc agctaacacg ttgt 24

<210> 2

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 2

ctagactcga gcttgggaat ca 22

<210> 3

<211> 681

<212> DNA

<213> 西伯利亚白刺(Nitraria sibirica)

<400> 3

atgaacattc agctaacacg ttgttgtact gaagtcatgg atgctcttac gggctgcttg 60

tgcatgaaga attacagaca aagacgtggc tatgagaagc cttcgcgcct tgcttctgag 120

acgccattta ctgttaatga ggtagaagca ttgtatgatt tgttcaagaa gatcagtggc 180

tctatatgtg atgatggtct tattaacaag gaagaattcc agcttgcact atttaggaac 240

agcaagaaga agaatctttt tgcggacagg gtatttgacc tgtttgacgt caagcacaat 300

ggggtaattg aattcggaga atttgttcgg gcactaagtg tcttccatcc taatactccc 360

gtggaagaca aaattgcctt cgcatttaga ttgtacgatc ttcggcagac tggcttcatt 420

gagcataatg aggtgaagga gatggtggtg gctctattgt gtgaatcaga actagaactt 480

tctgatgatg tcatcgaatc aattgtagac aagaccatgt cggaggcaga tttaactgga 540

gatagaaaaa ttgatatgga agaatggaag cagtatgtgg cacagaatcc aactatcatt 600

aaaaacatga cacttccata tctaaaggaa ataaccatgg catttccaag cttcttactt 660

gattcccaag ctcgagtcta g 681

<210> 4

<211> 226

<212> PRT

<213> 西伯利亚白刺(Nitraria sibirica)

<400> 4

Met Asn Ile Gln Leu Thr Arg Cys Cys Thr Glu Val Met Asp Ala Leu

1 5 10 15

Thr Gly Cys Leu Cys Met Lys Asn Tyr Arg Gln Arg Arg Gly Tyr Glu

20 25 30

Lys Pro Ser Arg Leu Ala Ser Glu Thr Pro Phe Thr Val Asn Glu Val

35 40 45

Glu Ala Leu Tyr Asp Leu Phe Lys Lys Ile Ser Gly Ser Ile Cys Asp

50 55 60

Asp Gly Leu Ile Asn Lys Glu Glu Phe Gln Leu Ala Leu Phe Arg Asn

65 70 75 80

Ser Lys Lys Lys Asn Leu Phe Ala Asp Arg Val Phe Asp Leu Phe Asp

85 90 95

Val Lys His Asn Gly Val Ile Glu Phe Gly Glu Phe Val Arg Ala Leu

100 105 110

Ser Val Phe His Pro Asn Thr Pro Val Glu Asp Lys Ile Ala Phe Ala

115 120 125

Phe Arg Leu Tyr Asp Leu Arg Gln Thr Gly Phe Ile Glu His Asn Glu

130 135 140

Val Lys Glu Met Val Val Ala Leu Leu Cys Glu Ser Glu Leu Glu Leu

145 150 155 160

Ser Asp Asp Val Ile Glu Ser Ile Val Asp Lys Thr Met Ser Glu Ala

165 170 175

Asp Leu Thr Gly Asp Arg Lys Ile Asp Met Glu Glu Trp Lys Gln Tyr

180 185 190

Val Ala Gln Asn Pro Thr Ile Ile Lys Asn Met Thr Leu Pro Tyr Leu

195 200 205

Lys Glu Ile Thr Met Ala Phe Pro Ser Phe Leu Leu Asp Ser Gln Ala

210 215 220

Arg Val

225

<210> 5

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 5

atcctaccgt tcttgctgct gt 22

<210> 6

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 6

ttcttccttg tgaatgagcc c 21

<210> 7

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 7

ggaatccacg agaccaccta ca 22

<210> 8

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 8

gattgatcct ccgatccaga ca 22

<210> 9

<211> 49

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 9

tggagagaac acgggggact ctagaatgaa cattcagcta acacgttgt 49

<210> 10

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 10

cctcgccctt gctcaccata ctagtgactc gagcttggga atca 44

<210> 11

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 11

ggccatcgtt gaagatgcct ctg 23

<210> 12

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 12

gaacttcagg gtcagcttgc 20