掌桥专利:专业的专利平台
掌桥专利
首页

抗乙型肝炎病毒HBV的6,7-二氢-4H-吡唑并1,5-a吡嗪吲哚-2-甲酰胺活性剂

文献发布时间:2023-06-19 11:27:38



技术领域

本发明总体上涉及新的抗病毒剂。具体来说,本发明涉及可以抑制由乙型肝炎病毒(HBV)编码的蛋白质或干扰HBV复制周期的功能的化合物、包含此类化合物的组合物、抑制HBV病毒复制的方法、治疗或预防HBV感染的方法以及制造所述化合物的方法。

背景技术

慢性HBV感染是严重的全球性健康问题,影响了超过5%的世界人口(全球超过3.5亿人,美国125万人)。尽管可以使用预防性HBV疫苗,但由于在发展中国家的大多数地区未达最佳标准的治疗选择和持续不断的新感染率,慢性HBV感染的负担仍然是重大的尚未解决的世界性医学问题。当前的治疗不提供治愈,并且限于仅仅两类药剂(干扰素α和病毒聚合酶的核苷类似物/抑制剂);耐药性、低效能和耐受性问题限制了它们的影响。

HBV的低治愈率至少部分归因于使用单一抗病毒剂很难实现病毒产生的完全抑制这一事实,以及被感染的肝细胞的细胞核中共价闭合环状DNA(cccDNA)的存在和持久存留。然而,HBV DNA的持久抑制减缓肝脏疾病的进展,并有助于预防肝细胞癌(HCC)。

当前用于HBV感染的患者的疗法的目的在于将血清HBV DNA降低到低的或不可检测的水平,并最终减少或阻止肝硬化和HCC的发生。

HBV是嗜肝DNA病毒科(Hepadnaviridae)的一种有包膜的部分双链DNA(dsDNA)病毒。HBV衣壳蛋白(HBV-CP)在HBV复制中发挥必不可少的作用。HBV-CP的主要生物学功能是充当结构蛋白,以包裹前基因组RNA并形成不成熟的衣壳粒子,所述衣壳粒子自发地从细胞质中许多拷贝的衣壳蛋白二聚体自组装。

HBV-CP还通过其C-端磷酸化位点的不同磷酸化状态来调控病毒DNA合成。另外,HBV-CP还可能利用位于HBV-CP的C-端区的富含精氨酸的结构域中的核定位信号,来促进病毒的松弛的环状基因组的核易位。

在细胞核中,作为病毒cccDNA微型染色体的组分,HBV-CP可以在cccDNA微型染色体的功能中发挥结构和调控作用。HBV-CP还与内质网(ER)中的病毒大包膜蛋白相互作用,并触发完整病毒粒子从肝细胞的释放。

与HBV-CP相关的抗HBV化合物已有报道。例如,已显示包括名为AT-61和AT-130的化合物在内的苯基丙烯酰胺衍生物(Feld J.等,Antiviral Res.2007,76,168)和来自于Valeant的一类的噻唑烷-4-酮(WO2006/033995)抑制前基因组RNA(pgRNA)包装。

F.Hoffmann-La Roche AG已公开了用于HBV疗法的一系列3-取代的四氢-吡唑并[1,5-a]吡嗪(WO2016/113273、WO2017/198744、WO2018/011162、WO2018/011160、WO2018/011163)。

在基于组织培养的筛选中发现了杂芳基二氢嘧啶类化合物(HAP)(Weber等,Antiviral Res.2002,54,69)。这些HAP类似物充当合成的别构活化剂,并且能够诱导导致HBV-CP降解的异常衣壳形成(WO 99/54326、WO 00/58302、WO 01/45712、WO 01/6840)。也已描述了其他HAP类似物(J.Med.Chem.2016,59(16),7651-7666)。

来自于F.Hoffman-La Roche的HAP的一个亚类也显示出对抗HBV的活性(WO2014/184328、WO2015/132276和WO2016/146598)。来自于Sunshine Lake Pharma的相似亚类也显示出对抗HBV的活性(WO2015/144093)。其他HAP也已显示出具有对抗HBV的活性(WO2013/102655,Bioorg.Med.Chem.2017,25(3)pp.1042-1056),并且来自于Enanta Therapeutics的相似亚类显示出类似的活性(WO2017/011552)。来自于Medshine Discovery的另一个亚类显示出类似的活性(WO2017/076286)。另一个亚类(Janssen Pharma)显示出类似的活性(WO2013/102655)。

哒嗪酮和三嗪酮的一个亚类(F.Hoffman-La Roche)也显示出对抗HBV的活性(WO2016/023877),四氢吡啶并吡啶的一个亚类也是如此(WO2016/177655)。来自于Roche的三环4-吡啶酮-3-甲酸衍生物的一个亚类也显示出类似的抗HBV活性(WO2017/013046)。

来自于Novira Therapeutics(现在是Johnson&Johnson Inc.的一部分)的氨磺酰基-芳基酰胺的一个亚类也显示出对抗HBV的活性(WO2013/006394、WO2013/096744、WO2014/165128、WO2014/184365、WO2015/109130、WO2016/089990、WO2016/109663、WO2016/109684、WO2016/109689、WO2017/059059)。硫醚-芳基酰胺的相似亚类(也来自于NoviraTherapeutics)显示出对抗HBV的活性(WO2016/089990)。另外,芳基-氮杂环庚烷的一个亚类(也来自于Novira Therapeutics)显示出对抗HBV的活性(WO2015/073774)。来自于Enanta Therapeutics的芳基酰胺的一个相似亚类显示出对抗HBV的活性(WO2017/015451)。

也已显示来自于Janssen Pharma的氨磺酰基衍生物具有对抗HBV的活性(WO2014/033167,WO2014/033170,WO2017/001655,J.Med.Chem,2018,61(14)6247-6260)。

也来自于Janssen Pharma的乙二酸单酰胺取代的吡咯酰胺衍生物的一个亚类也已被显示具有对抗HBV的活性(WO2015/011281)。也已描述了乙二酸单酰胺取代的吡咯酰胺的一个相似亚类(Gilead Sciences)(WO2018/039531)。

来自于Enanta Therapeutics的氨磺酰基-和草酰基-杂联芳基的一个亚类也显示出对抗HBV的活性(WO2016/161268、WO2016/183266、WO2017/015451、WO2017/136403&US20170253609)。

来自于Assembly Biosciences的苯胺-嘧啶的一个亚类也显示出对抗HBV的活性(WO2015/057945、WO2015/172128)。来自于Assembly Biosciences的稠合三环的一个亚类(二苯并-硫氮杂环庚酮、二苯并-二氮杂环庚酮、二苯并-氧氮杂环庚酮)显示出对抗HBV的活性(WO2015/138895、WO2017/048950)。

Assembly Biosciences已描述了一系列环状磺酰胺作为HBV-CP功能的调节剂(WO2018/160878)。

Arbutus Biopharma已公开了用于HBV疗法的一系列苯甲酰胺(WO2018/052967、WO2018/172852)。

还已显示,小分子双-ANS充当分子“楔”并干扰正常衣壳蛋白的几何形状和衣壳形成(Zlotnick A等,J.Virol.2002,4848)。

直接作用于HBV的抗病毒药可能遇到的问题是毒性、诱变性、缺乏选择性、功效差、生物利用度差、溶解度低和合成困难。因此,对可以克服这些缺点中的至少一个或具有附加的优点例如效力提高或安全窗口增加的用于治疗、改善或预防HBV的其他抑制剂,存在着需求。

将此类治疗剂作为单一疗法或与其他HBV治疗或辅助治疗联合给药到HBV感染的患者,将导致病毒负荷显著降低、预后改善、疾病进展减小和/或血清转化率提高。

发明内容

本文提供了可用于在需要的对象中治疗或预防HBV感染的化合物以及在它们的制备中有用的中间体。本发明的主题内容是一种式I的化合物:

其中

-R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

-R5是H或甲基;

-R6选自H、D、SO

-R8选自C1-C6-烷基、C1-C6-羟基烷基、C1-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R12和R13独立地选自H、C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R12和R13任选地相连以形成C3-C7环烷基环或含有1或2个氮、硫或氧原子的C4-C7-杂环烷基环。

在本发明的一个实施方式中,本发明的主题内容是一种式I的化合物,其中

-R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

-R5是H或甲基;

-R6选自H、D、SO

-R8选自C1-C6-烷基、C1-C6-羟基烷基、C1-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R12和R13独立地选自H、C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R12和R13任选地相连以形成C3-C7环烷基环或含有1或2个氮、硫或氧原子的C4-C7-杂环烷基环。

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R5是H。在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R5是甲基。

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R6选自H、D、SO

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R8选自C1-C6-烷基、C1-C6-羟基烷基、C1-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基、杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R12和R13独立地选自H、C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基、杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R12和R13任选地相连以形成C3-C7环烷基环或含有1或2个氮、硫或氧原子的C4-C7-杂环烷基环。

本发明的一个实施方式是一种根据本发明所述的式I的化合物或其可药用盐,用于在对象中预防或治疗HBV感染。

本发明的一个实施方式是一种药物组合物,其包含根据本发明所述的式I的化合物或其可药用盐以及可药用载体。

本发明的一个实施方式是一种在需要的个体中治疗HBV感染的方法,所述方法包括向所述个体给药治疗有效量的根据本发明所述的式I的化合物或其可药用盐。

本发明的另一个实施方式是一种根据本发明所述的式I的化合物或其可药用盐,其用于在需要的对象中预防或治疗HBV感染,

其中

-R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

-R5是H或甲基;

-R6选自H、D、SO

-R8选自C1-C6-烷基、C1-C6-羟基烷基、C1-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R12和R13独立地选自H、C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R12和R13任选地相连以形成C3-C7环烷基环或含有1或2个氮、硫或氧原子的C4-C7-杂环烷基环。

在本发明的一个实施方式中,本发明的主题内容是一种式I的化合物,其中

-R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

-R5是H或甲基;

-R6选自H、D、SO

-R8选自C1-C6-烷基、C1-C6-羟基烷基、C1-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R12和R13独立地选自H、C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R12和R13任选地相连以形成C3-C7环烷基环或含有1或2个氮、硫或氧原子的C4-C7-杂环烷基环。

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R5选自H和甲基。

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R6选自H、D、SO

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R8选自C1-C6-烷基、C1-C6-羟基烷基、C1-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基、杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R12和R13独立地选自H、C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基、杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式I所述的化合物,其中R12和R13任选地相连以形成C3-C7环烷基环或含有1或2个氮、硫或氧原子的C4-C7-杂环烷基环。

本发明的一个实施方式是一种根据本发明所述的式I的化合物或其可药用盐,其用于在对象中预防或治疗HBV感染。

本发明的一个实施方式是一种药物组合物,其包含根据本发明所述的式I的化合物或其可药用盐以及可药用载体。

本发明的一个实施方式是一种在需要的个体中治疗HBV感染的方法,所述方法包括向所述个体给药治疗有效量的根据本发明所述的式I的化合物或其可药用盐。

本发明的另一个实施方式是一种根据本发明所述的式II的化合物或其可药用盐,其用于在需要的对象中预防或治疗HBV感染,

其中

-R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

-R5是H或甲基;

-R7选自C1-C6-烷基、C2-C6-羟基烷基、C2-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式II所述的化合物,其中R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式II所述的化合物,其中R5选自H和甲基。

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式II所述的化合物,其中R7选自C1-C6-烷基、C2-C6-羟基烷基、C2-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

本发明的一个实施方式是一种根据本发明所述的式II的化合物或其可药用盐,其用于在对象中预防或治疗HBV感染。

本发明的一个实施方式是一种药物组合物,其包含根据本发明所述的式II的化合物或其可药用盐以及可药用载体。

本发明的一个实施方式是一种在需要的个体中治疗HBV感染的方法,所述方法包括向所述个体给药治疗有效量的根据本发明所述的式II的化合物或其可药用盐。

本发明的另一个实施方式是一种根据本发明所述的式III的化合物或其可药用盐,其用于在需要的对象中预防或治疗HBV感染,

其中

-R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

-R5是H或甲基;

-R8选自C1-C6-烷基、C1-C6-羟基烷基、C1-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基、杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式III所述的化合物,其中R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式III所述的化合物,其中R5选自H和甲基。

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式III所述的化合物,其中R8选自C1-C6-烷基、C1-C6-羟基烷基、C1-C6-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C4-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

本发明的一个实施方式是一种根据本发明所述的式III的化合物或其可药用盐,其用于在对象中预防或治疗HBV感染。

本发明的一个实施方式是一种药物组合物,其包含根据本发明所述的式III的化合物或其可药用盐以及可药用载体。

本发明的一个实施方式是一种在需要的个体中治疗HBV感染的方法,所述方法包括向所述个体给药治疗有效量的根据本发明所述的式III的化合物或其可药用盐。

本发明的另一个实施方式是一种根据本发明所述的式IV的化合物或其可药用盐,其用于在需要的对象中预防或治疗HBV感染,

其中

-R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

-R5是H或甲基;

-R9、R10和R11独立地选自H、C1-C5-烷基、C1-C5-羟基烷基、C1-C5-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C3-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其中C1-C5-烷基、C1-C5-羟基烷基、C1-C5-烷基-O-C1-C6-烷基和C1-C3-羧基烷基任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

-R9和R10任选地相连以形成C3-C7环烷基环或含有1或2个氮、硫或氧原子的C4-C7-杂环烷基环。

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式IV所述的化合物,其中R1、R2、R3和R4对于每个位置来说独立地选自H、CF

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式IV所述的化合物,其中R5选自H和甲基。

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式IV所述的化合物,其中R9、R10和R11独立地选自H、C1-C5-烷基、C1-C5-羟基烷基、C1-C5-烷基-O-C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基、C1-C3-羧基烷基、C3-C7-杂环烷基、C6-芳基和杂芳基,其中C1-C5-烷基、C1-C5-羟基烷基、C1-C5-烷基-O-C1-C6-烷基和C1-C3-羧基烷基任选地被各自独立地选自OH、卤素、NH

在一个实施方式中,本发明的主题内容是一种根据式IV所述的化合物,其中R9和R10任选地相连以形成C3-C7环烷基环或含有1或2个氮、硫或氧原子的C4-C7-杂环烷基环。

本发明的一个实施方式是一种根据本发明所述的式IV的化合物或其可药用盐,其用于在对象中预防或治疗HBV感染。

本发明的一个实施方式是一种药物组合物,其包含根据本发明所述的式IV的化合物或其可药用盐以及可药用载体。

本发明的一个实施方式是一种在需要的个体中治疗HBV感染的方法,所述方法包括向所述个体给药治疗有效量的根据本发明所述的式IV的化合物或其可药用盐。

在某些实施方式中,本发明的化合物的剂量为约1mg至约2,500mg。在某些实施方式中,在本文中描述的组合物中使用的本发明的化合物的剂量小于约10,000mg,或小于约8,000mg,或小于约6,000mg,或小于约5,000mg,或小于约3,000mg,或小于约2,000mg,或小于约1,000mg,或小于约500mg,或小于约200mg,或小于约50mg。同样地,在某些实施方式中,本文中所描述的第二化合物(即用于HBV治疗的另一种药物)的剂量小于约1,000mg,或小于约800mg,或小于约600mg,或小于约500mg,或小于约400mg,或小于约300mg,或小于约200mg,或小于约100mg,或小于约50mg,或小于约40mg,或小于约30mg,或小于约25mg,或小于约20mg,或小于约15mg,或小于约10mg,或小于约5mg,或小于约2mg,或小于约1mg,或小于约0.5mg,及其任何和所有的全部或部分增量。所有前述剂量都是指每位患者的每日剂量。

通常,设想了抗病毒有效的每日量为约0.01至约50mg/kg或约0.01至约30mg/kg体重。将所需的剂量在一天内以适当的时间间隔作为2、3、4或更多个分药剂给药,可能是适当的。所述分药剂可以被配制成单位剂型,例如每个单位剂型含有约1至约500mg或约1至约300mg或约1至约100mg或约2至约50mg的活性成分。

本发明的化合物取决于它们的结构,可能作为盐、溶剂化物或水合物存在。因此,本发明也涵盖所述盐、溶剂化物或水合物及其相应的混合物。

本发明的化合物取决于它们的结构,可能以互变异构或立体异构形式(对映异构体、非对映异构体)存在。因此,本发明也涵盖所述互变异构体、对映异构体或非对映异构体及其相应的混合物。立体异构均一的组成成分可以以已知的方式从此类对映异构体和/或非对映异构体的混合物分离。

定义

下面列出的是用于描述本发明的各种不同术语的定义。这些定义适用于在整个本说明书和权利要求书中使用的所述术语,除非在特定情况下单独地或作为较大组的一部分另有限制。

除非另有定义,否则本文中使用的所有技术和科学术语通常具有与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的相同的含义。通常,本文中使用的命名法以及细胞培养、分子遗传学、有机化学和肽化学中的实验室程序是本领域中公知且常用的。

当在本文中使用时,没有具体数目的指称是指一个或超过一个(即至少一个)指称物。例如,“元件”意味着一个元件或超过一个元件。此外,术语“包括”的使用不是限制性的。

当在本文中使用时,术语“衣壳组装调节剂”是指破坏或加速或抑制或阻碍或延迟或减少或修改正常衣壳组装(例如在成熟期间)或正常衣壳解体(例如在侵染期间)或扰乱衣壳稳定性,从而诱导异常衣壳形态或异常衣壳功能的化合物。在一个实施方式中,衣壳组装调节剂加速衣壳组装或解体,从而诱导异常衣壳形态。在另一个实施方式中,衣壳组装调节剂与主要衣壳组装蛋白(HBV-CP)相互作用(例如结合到活性位点处,结合到别构位点处,或修改和/或阻碍折叠等),从而破坏衣壳组装或解体。在又一个实施方式中,衣壳组装调节剂引起HBV-CP的结构或功能的扰乱(例如HBV-CP组装、解体、结合到底物、折叠成适合的构象等的能力,其减弱病毒的侵染性和/或对病毒来说致死)。

当在本文中使用时,术语“治疗”被定义为向患者施用或给药治疗剂、即本发明的化合物(单独地或与另一种药剂相组合),或向从具有HBV感染、HBV感染的症状或发生HBV感染的可能性的患者分离的组织或细胞系施用或给药治疗剂(例如用于诊断或离体应用),其目的在于治愈、愈合、减轻、缓解、改变、补救、改善、改进或影响所述HBV感染、HBV感染的症状或发生HBV感染的可能性。此类治疗可以在从药物基因组学领域获得的知识的基础上具体定制或修改。

当在本文中使用时,术语“预防”意味着在没有障碍或疾病的情况下没有障碍或疾病的发展,或者在已存在障碍或疾病的发展的情况下没有所述障碍或疾病的进一步发展。还考虑到了阻止与所述障碍或疾病相关的某些或所有症状的能力。

当在本文中使用时,术语“患者”、“个体”或“对象”是指人类或非人类哺乳动物。非人类哺乳动物包括例如家畜和宠物例如羊、牛、猪、猫和鼠类哺乳动物。优选地,所述患者、对象或个体是人类。

当在本文中使用时,术语“有效量”、“药物有效量”和“治疗有效量”是指药剂的无毒但足以提供所需生物学结果的量。该结果可能是疾病的体征、症状或病因的减轻和/或缓解,或生物系统的任何其他所需改变。在任何个体病例中适合的治疗量可以由本领域普通技术人员使用常规实验来确定。

当在本文中使用时,术语“可药用的”是指不废除化合物的生物活性或性质,并且相对无毒的材料例如载体或稀释剂,即所述材料可以给药到个体,而不引起不想要的生物效应或不以有害的方式与包含它的组合物中的任何组分相互作用。

当在本文中使用时,术语“可药用盐”是指所公开的化合物的衍生物,其中所述母体化合物通过将已有的酸或碱组成部分转变成其盐形式而被修饰。可药用盐的实例包括但不限于碱性残基例如胺的无机或有机酸盐、酸性残基例如羧酸的碱金属或有机盐等。本发明的可药用盐包括母体化合物的例如从无毒性无机或有机酸形成常规无毒性盐。本发明的可药用盐可以从含有碱性或酸性组成部分的母体化合物通过常规的化学方法来合成。通常,此类盐可以通过将这些化合物的游离酸或碱形式与化学计算量的适合的碱或酸在水或有机溶剂或两者的混合物中反应来制备;通常优选的是非水性介质例如醚、乙酸乙酯、乙醇、异丙醇或乙腈。适合的盐的名单可以在《Remington制药学》(Remington'sPharmaceutical Sciences)第17版,Mack Publishing Company,Easton,Pa.,1985p.1418和Journal of Pharmaceutical Science,66,2(1977)中找到,所述文献各自整体通过参考并入本文。

当在本文中使用时,术语“组合物”或“药物组合物”是指在本发明中有用的至少一种化合物与可药用载体的混合物。所述药物组合物便于所述化合物向患者或对象的给药。本领域中存在多种给药化合物的技术,包括但不限于静脉内、口服、气溶胶、直肠、肠胃外、眼、肺和局部给药。

当在本文中使用时,术语“可药用载体”意味着制药学上可接受的材料、组合物或载体,例如液体或固体填充剂、稳定剂、分散剂、悬浮剂、稀释剂、赋形剂、增稠剂、溶剂或包封材料,它们参与在本发明中有用的化合物在所述患者内或向所述患者的运载或运输,使其可以执行其目标功能。通常,将此类构建物从身体的一个器官或部位运载或运输到身体的另一个器官或部位。每种载体在与包括本发明中使用的化合物在内的剂型的其他成分相容并且对患者无害的意义上必须是“可接受的”。可以充当可药用载体的材料的一些实例包括:糖类,例如乳糖、葡萄糖和蔗糖;淀粉,例如玉米淀粉和马铃薯淀粉;纤维素及其衍生物,例如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素和乙酸纤维素;黄耆胶粉;麦芽、明胶、滑石;赋形剂,例如可可脂和栓剂用蜡;油类,例如花生油、棉籽油、红花油、芝麻油、橄榄油、玉米油和大豆油;二醇,例如丙二醇;多元醇,例如甘油、山梨糖醇、甘露糖醇和聚乙二醇;酯类,例如油酸乙酯和月桂酸乙酯;琼脂;缓冲剂,例如氢氧化镁和氢氧化铝;表面活性剂;藻酸;无热原水;等渗盐水;林格氏溶液;乙醇;磷酸盐缓冲溶液,以及在药物剂型中使用的其他无毒相容性物质。

当在本文中使用时,“可药用载体”还包括与在本发明中有用的化合物的活性相容,并且对患者来说生理上可接受的任何和所有的包衣、抗细菌和抗真菌剂和吸收延迟剂等。补充活性化合物也可并入到所述组合物中。“可药用载体”还可以包括在本发明中有用的化合物的可药用盐。可以包含在本发明的实践中使用的药物组合物中的其他附加成分在本领域中是已知的,并描述在例如通过参考并入本文的《Remington制药学》(Remington'sPharmaceutical Sciences)(Genaro主编,Mack Publishing Company,Easton,Pa.,1985)中。

当在本文中使用时,术语“取代的”意味着用原子或原子团代替氢作为附连到另一个基团的取代基。

当在本文中使用时,术语“包含”也涵盖选项“由……构成”。

当在本文中使用时,除非另有陈述,否则术语“烷基”本身或作为另一个取代基的一部分意味着具有指定碳原子数(即C1-C6-烷基意味着1至6个碳原子)的直链或支链烃类,并包括直链和支链。实例包括甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、叔丁基、戊基、新戊基和己基。此外,术语“烷基”本身或作为另一个取代基的一部分也可以意味着被C3-C5-碳环取代的C1-C3直链烃类。实例包括(环丙基)甲基、(环丁基)甲基和(环戊基)甲基。为避免疑问,在基团中存在两个烷基组成部分的情况下,所述烷基组成部分可以相同或不同。

当在本文中使用时,术语“烯基”是指源自于烃类组成部分的单价基团,其含有至少两个碳原子和至少一个E或Z立体化学的碳-碳双键。所述双键可以是或者可以不是附连到另一个基团的点。烯基(例如C2-C8-烯基)包括但不限于例如乙烯基、丙烯基、丙-1-烯-2-基、丁烯基、甲基-2-丁烯-1-基、庚烯基和辛烯基。为避免疑问,在基团中存在两个烯基组成部分的情况下,所述烷基组成部分可以相同或不同。

当在本文中使用时,C2-C6-炔基或组成部分是含有2至6个碳原子的直链或支链炔基或组成部分,例如含有2至4个碳原子的C2-C4炔基或组成部分。示例性炔基包括–C≡CH或-CH

当在本文中使用时,除非另有陈述,否则单独的或作为另一个取代基的一部分的术语“卤”或“卤素”意味着氟、氯、溴或碘原子,优选为氟、氯或溴,更优选为氟或氯。为避免疑问,在基团中存在两个卤素组成部分的情况下,它们可以相同或不同。

当在本文中使用时,C1-C6-烷氧基或C2-C6-烯基氧基通常是分别附连到氧原子的所述C1-C6-烷基(例如C1-C4烷基)或所述C2-C6-烯基(例如C2-C4烯基)。

当在本文中使用时,除非另有陈述,否则单独地或与其他术语相组合使用的术语“芳基”意味着含有一个或多个环(通常为1、2或3个环)的碳环芳香族系统,其中这些环可以以侧基方式附连在一起,例如联苯,或者可以稠合,例如萘。芳基的实例包括苯基、蒽基和萘基。优选的实例是苯基(例如C6-芳基)和联苯基(例如C12-芳基)。在某些实施方式中,芳基具有6至16个碳原子。在某些实施方式中,芳基具有6至12个碳原子(例如C6-C12-芳基)。在某些实施方式中,芳基具有6个碳原子(例如C6-芳基)。

当在本文中使用时,术语“杂芳基”和“杂芳族”是指具有芳香族特点的含有一个或多个环(通常为1、2或3个环)的杂环。杂芳基取代基可以由碳原子数定义,例如Cl-C9-杂芳基指示了杂芳基中含有的不包括杂原子数的碳原子数。例如,C1-C9-杂芳基将包含另外1至4个杂原子。多环杂芳基可以包括一个或多个部分饱和的环。杂芳基的非限制性实例包括:

杂芳基的其他非限制性实例包括吡啶基、吡嗪基、嘧啶基(包括例如2-和4-嘧啶基)、哒嗪基、噻吩基、呋喃基、吡咯基(包括例如2-吡咯基)、咪唑基、噻唑基、噁唑基、吡唑基(包括例如3-和5-吡唑基)、异噻唑基、1,2,3-三唑基、l,2,4-三唑基、1,3,4-三唑基、四唑基、1,2,3-噻二唑基、1,2,3-噁二唑基、1,3,4-噻二唑和1,3,4-噁二唑基。多环杂环和杂芳基的非限制性实例包括吲哚基(包括3-、4-、5-、6-和7-吲哚基)、吲哚啉基、喹啉基、四氢喹啉基、异喹啉基(包括例如1-和5-异喹啉基)、1,2,3,4-四氢异喹啉基、噌啉基、喹喔啉基(包括例如2-和5-喹喔啉基)、喹唑啉基、酞嗪基、1,8-萘啶基、1,4-苯并二噁烷基、香豆基、二氢香豆基、1,5-萘啶基、苯并呋喃基(包括例如3-、4-、5-、6-和7-苯并呋喃基)、2,3-二氢苯并呋喃基、1,2-苯并异噁唑基、苯并噻吩基(包括例如3-、4-、5-、6-和7-苯并噻吩基)、苯并噁唑基、苯并噻唑基(包括例如2-苯并噻唑基和5-苯并噻唑基)、嘌呤基、苯并咪唑基(包括例如2-苯并咪唑基)、苯并三唑基、硫代黄嘌呤基、咔唑基、咔啉基、吖啶基、吡咯双烷基(pyrrolizidinyl)和喹嗪烷基(quinolizidinyl)。

当在本文中使用时,术语“卤代烷基”通常分别是其中任一个或多个碳原子被一个或多个如上所定义的卤素原子取代的烷基、烯基、烷氧基或烯氧基。卤代烷基包含单卤代烷基、二卤代烷基和多卤代烷基游离基。术语“卤代烷基”包括但不限于氟甲基、1-氟乙基、二氟甲基、2,2-二氟乙基、2,2,2-三氟乙基、三氟甲基、氯甲基、二氯甲基、三氯甲基、五氟乙基、二氟甲氧基和三氟甲氧基。

当在本文中使用时,C1-C6-羟基烷基是被一个或多个羟基取代的所述C1-C6烷基。通常,它被1、2或3个羟基取代。优选地,它被单个羟基取代。

当在本文中使用时,C1-C6-氨基烷基是被一个或多个氨基取代的C1-C6烷基。通常,它被1、2或3个氨基取代。优选地,它被单个氨基取代。

当在本文中使用时,C1-C4-羧基烷基是被羧基取代的所述C1-C4烷基。

当在本文中使用时,C1-C4-甲酰胺基烷基是被取代或未取代的甲酰胺基团取代的所述C1-C4烷基。

当在本文中使用时,C1-C4-酰基磺酰胺基-烷基是被通式为C(=O)NHSO

当在本文中使用时,术语“环烷基”是指其中形成环的每个原子(即骨架原子)是碳原子的单环或多环非芳香基团。在一个实施方式中,所述环烷基是饱和或部分不饱和的。在另一个实施方式中,所述环烷基与芳香环稠合。环烷基包括具有3至10个环原子的基团(C3-C10-环烷基)、具有3至8个环原子的基团(C3-C8-环烷基)、具有3至7个环原子的基团(C3-C7-环烷基)和具有3至6个环原子的基团(C3-C6-环烷基)。环烷基的说明性实例包括但不限于下述组成部分:

单环环烷基包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基和环辛基。二环环烷基包括但不限于四氢萘基、茚满基和四氢并环戊二烯。多环环烷基包括金刚烷和降莰烷。术语环烷基包括“不饱和非芳香碳环基”或“非芳香不饱和碳环基”,两者均是指含有至少一个碳-碳双键或一个碳-碳叁键的本文中所定义的非芳香碳环。

当在本文中使用时,术语“杂环烷基”和“杂环基”是指含有一个或多个环(通常为1、2或3个环)的杂脂环基团,其含有1至4个各自选自氧、硫和氮的环杂原子。在一个实施方式中,每个杂环基在其环系统中具有3至10个原子,前提是所述基团的环不含两个相邻的氧或硫原子。在一个实施方式中,每个杂环基具有稠合的双环环系统,在所述环系统中具有3至10个原子,同样地前提是所述基团的环不含两个相邻的氧或硫原子。在一个实施方式中,每个杂环基具有桥接的双环环系统,在所述环系统中具有3至10个原子,同样地前提是所述基团的环不含两个相邻的氧或硫原子。在一个实施方式中,每个杂环基具有螺双环环系统,在所述环系统中具有3至10个原子,同样地前提是所述基团的环不含两个相邻的氧或硫原子。杂环基取代基也可以由碳原子的数目定义,例如C2-C8-杂环基指示所述杂环基中含有的不包括杂原子数的碳原子数。例如,C2-C8-杂环基将包括另外的1至4个杂原子。在另一个实施方式中,所述杂环烷基与芳香环稠合。在另一个实施方式中,所述杂环烷基与杂芳基环稠合。在一个实施方式中,所述氮和硫杂原子可以任选地被氧化,并且所述氮原子可以任选地被季铵化。除非另有陈述,否则所述杂环系统可以在提供稳定结构的任何杂原子或碳原子处附连。3-员杂环基的实例包括但不限于氮杂环丙烷。4-员杂环烷基的实例包括但不限于氮杂环丁烷和β-内酰胺。5-员杂环基的实例包括但不限于吡咯烷、噁唑烷和噻唑烷二酮。6-员杂环烷基的实例包括但不限于哌啶、吗啉、哌嗪、N-乙酰基哌嗪和N-乙酰基吗啉。杂环基的其他非限制性实例是

杂环的实例包括单环基团例如氮杂环丙烷、氧杂环丙烷、硫杂环丙烷、氮杂环丁烷、氧杂环丁烷、硫杂环丁烷、吡咯烷、吡咯啉、吡唑烷、咪唑啉、二氧杂环戊烷、环丁砜、2,3-二氢呋喃、2,5-二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩烷、哌啶、1,2,3,6-四氢吡啶、1,4-二氢吡啶、哌嗪、吗啉、硫吗啉、吡喃、2,3-二氢吡喃、四氢吡喃、1,4-二氧杂环己烷、1,3-二氧杂环己烷、1,3-二氧杂环戊烷、高哌嗪、高哌啶、1,3-二氧杂环庚烷、47-二氢-l,3-二氧杂环庚烷和氧杂环庚烷。术语“C3-C7-杂环烷基”包括但不限于四氢呋喃-2-基、四氢呋喃-3-基、3-氧杂双环[3.1.0]己-6-基、3-氮杂双环[3.1.0]己-6-基、四氢吡喃-4-基、四氢吡喃-3-基、四氢吡喃-2-基和氮杂环丁-3-基。

当在本文中使用时,术语“芳香”是指具有一个或多个多不饱和环并具有芳香族特点,即具有(4n+2)个离域π(pi)电子的碳环或杂环,其中n是整数。

当在本文中使用时,除非另有陈述,否则单独地或与其他术语相组合使用的术语“酰基”意味着通过羰基连接的烷基、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基。

当在本文中使用时,除非另有陈述,否则单独地或与其他术语相组合使用的术语“氨甲酰基”和“取代的氨甲酰基”意味着连接到氨基的羰基,所述氨基任选地被氢、烷基、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基单或双取代。在某些实施方式中,所述氮取代基被连接以形成如上所定义的杂环基环。

当在本文中使用时,除非另有陈述,否则术语“羧基”本身或作为另一个取代基的一部分意味着式C(=O)OH的基团。

当在本文中使用时,除非另有陈述,否则术语“羧酸酯”本身或作为另一个取代基的一部分意味着式C(=O)OX的基团,其中X选自C1-C6-烷基、C3-C7-环烷基和芳基。

当在本文中使用时,术语“前体药物”表示式I或式II或式III或式IV的化合物的衍生物,其以某种形式给药,使得在给药后其在体内被代谢成也是式I或式II或式III或式IV的活性代谢物。

各种不同形式的前体药物在本领域中是已知的。对于此类前体药物的实例,参见:《前体药物的设计》(Design of Prodrugs),H.Bundgaard主编,(Elsevier,1985);和Methods in Enzymology,Vol.42,p.309-396,K.Widder等主编,(Academic Press,1985);《药物设计和开发教本》(A Textbook of Drug Design and Development),Krogsgaard-Larsen和H.Bundgaard主编,第5章“前体药物的设计和应用”(Design and Application ofProdrugs),H.Bundgaard,p.1l3-191(1991);H.Bundgaard,Advanced Drug DeliveryReviews 8,1-38(1992);H.Bundgaard等,Journal of Pharmaceutical Sciences,77,285(1988);和N.Kakeya等,Chem.Pharm.Bull.,32,692(1984)。

前体药物的实例包括式I、II、III和IV的化合物的可切割的酯类。含有羧基的本发明的化合物的可体内切割的酯是例如在人类或动物体内切割以产生母体酸的可药用酯。对于羧基来说,适合的可药用酯包括C1-C6烷基酯,例如甲基或乙基酯;C1-C6烷氧基甲基酯,例如甲氧基甲基酯;C1-C6酰氧基甲基酯;酞酸酯;C3-C8环烷氧基羰基氧基C1-C6烷基酯,例如1-环己基羰基氧基乙基;1-3-二氧杂环戊烷-2-基甲基酯,例如5-甲基-1,3-二氧杂环戊烷-2-基甲基;C1-C6烷氧基羰基氧基乙基酯,例如1-甲氧基羰基氧基乙基;氨基羰基甲基酯及其单-或二-N-(C1-C6烷基)形式,例如N,N-二甲基氨基羰基甲基酯和N-乙基氨基羰基甲基酯;并且可以在本发明的化合物中的任何羧基处形成。

含有羟基的本发明的化合物的可体内切割的酯是例如在人类或动物体内切割以产生母体羟基的可药用酯。对于羟基来说,适合的可药用酯包括C1-C6-酰基酯,例如乙酰基酯;和苯甲酰基酯,其中苯基可以被氨基甲基或N-取代的单-或二-C1-C6烷基氨基甲基取代,例如4-氨基甲基苯甲酰基酯和4-N,N-二甲基氨基甲基苯甲酰基酯。

本发明的优选前体药物包括乙酰氧基和碳酸酯衍生物。例如,式I、II、III和IV的化合物的羟基可以作为-O-COR

本发明的其他优选前体药物包括氨基酸衍生物。适合的氨基酸包括通过其C(O)OH基团连接到式I、II、III和IV的化合物的α-氨基酸。此类前体药物在体内切割,以产生带有羟基的式I的化合物。因此,此类氨基酸基团优选地使用在式I、II、III和IV的最终需要羟基的位置处。因此,本发明的这个实施方式的示例性前体药物是带有式-OC(O)-CH(NH

本发明的其他优选前体药物包括氨基磷酸酯衍生物。各种不同形式的氨基磷酸酯前体药物在本领域中是已知的。对于此类前体药物的实例,参见Serpi等,Curr.Protoc.Nucleic Acid Chem.2013,第15章第15.5节,和Mehellou等,ChemMedChem,2009,4pp.1779-1791。适合的氨基磷酸酯包括通过其-OH基团连接到式I的化合物的(苯氧基)-α-氨基酸。此类前体药物在体内切割以产生带有羟基的式I的化合物。因此,此类氨基磷酸酯优选地使用在式I、II、III和IV的最终需要羟基的位置处。因此,本发明的这个实施方式的示例性前体药物是带有式-OP(O)(OR

本发明的主题内容还涉及一种制备本发明的化合物的方法。因此,本发明的主题内容是一种制备根据本发明所述的式I的化合物的方法,所述方法包括将式V的化合物

其中R1、R2、R3和R4如上所定义,

与式VI的化合物

其中R5和R6如上所定义,

进行反应。

具体实施方式

实施例

现在,参考下面的实施例来描述本发明。提供这些实施例仅仅是出于说明的目的,本发明不限于这些实施例,而是涵盖了作为本文中提供的教授的结果显而易见的所有变化形式。

所需的取代的吲哚-2-甲酸可以以多种方式制备,主要的路线概述在反应路线1-4中。对于本领域的专业化学家来说,显然存在着也可实现这些中间体的制备的其他方法。

取代的吲哚-2-甲酸可以通过Hemetsberger-Knittel反应来制备(OrganicLetters,2011,13(8)pp.2012-2014;Journal of the American Chemical Society,2007,pp.7500-7501;和Monatshefte für Chemie,103(1),pp.194-204)(反应路线1)。

反应路线1:从乙烯基叠氮化物制备吲哚

取代的吲哚也可以使用Fischer方法来制备(Berichte der DeutschenChemischen Gesellschaft.17(1):559–568)(反应路线2)。

反应路线2:Fischer吲哚合成

制备取代的吲哚的另一种方法是钯催化的炔烃环化反应(Journal of theAmerican Chemical Society,1991,pp.6690-6692)(反应路线3)。

反应路线3:通过炔烃环化制备吲哚

此外,吲哚可以如反应路线4中所示从其他适合地官能化(卤代)的吲哚制备(例如通过钯催化的交叉偶联或亲核取代反应)。

反应路线4:钯催化的卤代吲哚的功能化

本领域的专业化学家将会认识到可用于合成适合地官能化的吲哚-2-甲酸及其活性酯的其他方法。

HBV核心蛋白调节剂可以以多种方式制备。出于本申请的目的,反应路线5-11示出了用于它们的制备的主要路线。对于本领域的专业化学家来说,显然存在着也可实现这些中间体和实施例的制备的其他方法。

在优选实施方式中,式I的化合物可以如下面的反应路线5中所示来制备。

反应路线5:式I的化合物的合成

在步骤1中,将反应路线5中描述的化合物1还原胺化(WO2009147188、WO2014152725),以得到具有通用结构2的化合物。将被画为Boc但不限于此的氮保护基团用例如HCl去保护(A.Isidro-Llobet等,Chem.Rev.,2009,109,2455-2504),给出胺3。在步骤3中,使用文献中已知的方法(A.El-Faham,F.Albericio,Chem.Rev.2011,111,6557-6602)用例如HATU进行酰胺偶联,产生式I的化合物。

在优选实施方式中,式III的化合物可以如下面的反应路线6中所示来制备。

反应路线6:式III的化合物的合成

在步骤1中,将反应路线6中描述的化合物1酰化(P.N.Collier等,J.Med.Chem.,2015,58,5684-5688;WO2016046530),得到具有通用结构6的化合物。在步骤2中,用例如LiAlH

在优选实施方式中,式IV的化合物可以如下面的反应路线7中所示来制备。

反应路线7:式IV的化合物的合成

在步骤1中,将反应路线7中描述的化合物1还原胺化(WO2009147188、WO2014152725),以得到具有通用结构10的化合物。将被画为Boc但不限于此的氮保护基团用例如HCl去保护(A.Isidro-Llobet等,Chem.Rev.,2009,109,2455-2504),给出胺11。在步骤3中,使用文献中已知的方法(A.El-Faham,F.Albericio,Chem.Rev.2011,111,6557-6602)用例如HATU进行酰胺偶联,产生式IV的化合物。

在优选实施方式中,式II的化合物可以如下面的反应路线8中所示来制备。

反应路线8:式II的化合物的合成

在步骤1中,将反应路线8中描述的化合物1磺酰化(Jimenez-Somarribas等,J.Med.Chem.,2017,60,2305-2325),以得到具有通用结构13的化合物。将被画为Boc但不限于此的氮保护基团用例如HCl去保护(A.Isidro-Llobet等,Chem.Rev.,2009,109,2455-2504),给出胺14。在步骤3中,使用文献中已知的方法(A.El-Faham,F.Albericio,Chem.Rev.2011,111,6557-6602)用例如HATU进行酰胺偶联,产生式II的化合物。

在优选实施方式中,式II的化合物可以如下面的反应路线9中所示来制备。

反应路线9:式II的化合物的合成

在步骤1中,将被画为Boc但不限于此的反应路线9中描述的化合物16用例如HCl去保护(A.Isidro-Llobet等,Chem.Rev.,2009,109,2455-2504),给出胺17。然后将17用文献中已知的方法(A.El-Faham,F.Albericio,Chem.Rev.2011,111,6557-6602)用例如HATU酰胺化,给出化合物18。将被画为Cbz但不限于此的氮保护基团用例如H

在优选实施方式中,式III的化合物可以如下面的反应路线10中所示来制备。

反应路线10:式III的化合物的合成

在步骤1中,将被画为Boc但不限于此的反应路线10中描述的化合物16用例如HCl去保护(A.Isidro-Llobet等,Chem.Rev.,2009,109,2455-2504),给出胺17。然后将17用文献中已知的方法(A.El-Faham,F.Albericio,Chem.Rev.2011,111,6557-6602)用例如HATU酰胺化,给出化合物18。将被画为Cbz但不限于此的氮保护基团用例如H

在优选实施方式中,式I的化合物可以如下面的反应路线11中所示来制备。

反应路线11:式I的化合物的合成

在步骤1中,将反应路线11中描述的化合物22(WO2012/170752)胺化(Yang和Buchwald,Journal of Organometallic Chemistry,1999,pp.125-146),以给出胺23。然后将被画为Boc但不限于此的23用文献中已知的方法(A.Isidro-Llobet等,Chem.Rev.,2009,109,2455-2504)用例如HCl去保护,给出胺24,然后可以将其用文献中已知的方法(A.El-Faham,F.Albericio,Chem.Rev.2011,111,6557-6602)用例如HATU酰化,给出式I的化合物。

下面的实施例说明了本发明的某些特定化合物的制备和性质。

使用下述缩略语:

A-DNA碱基腺嘌呤

ACN–乙腈

Ar-氩气

BODIPY-FL-4,4-二氟-5,7-二甲基-4-硼-3a,4a-二氮杂-对称引达省-3-丙酸(荧光染料)

Boc-叔丁氧基羰基

BnOH–苯甲醇

n-BuLi–正丁基锂

t-BuLi–叔丁基锂

C-DNA碱基胞嘧啶

CC

CO

CuCN-氰化亚铜(I)

DCE-二氯乙烷

DCM-二氯甲烷

Dess-Martin氧化剂-1,1,1-三乙酰氧基-1,1-二氢-1,2-苯并碘氧杂环戊-3(1H)-酮

DIPEA-二异丙基乙胺

DIPE-二异丙基醚

DMAP-4-二甲基氨基吡啶

DMF–N,N-二甲基甲酰胺

DMP-Dess-Martin氧化剂

DMSO-二甲基亚砜

DNA-脱氧核糖核酸

DPPA–二苯基磷酰基叠氮化物

DTT-二硫苏糖醇

EC

EDCI-N-(3-二甲基氨基丙基)-N′-乙基碳二亚胺盐酸盐

Et

EtOAc-乙酸乙酯

EtOH-乙醇

FL--用荧光素标记的5'末端

NEt

ELS-蒸发光散射

g-克

G-DNA碱基鸟嘌呤

HBV-乙型肝炎病毒

HATU-2-(1H-7-氮杂苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基六氟磷酸脲

HCl-盐酸

HEPES-4-(2-羟基乙基)-1-哌嗪乙磺酸

HOAt-1-羟基-7-氮杂苯并三唑

HOBt-1-羟基苯并三唑

HPLC-高效液相色谱

IC

LC640--使用荧光染料

LC/MS-液相色谱/质谱术

LiAlH

LiOH-氢氧化锂

MeOH-甲醇

MeCN-乙腈

MgSO

mg-毫克

min-分钟

mol-摩尔

mmol-毫摩尔

mL-毫升

MTBE-甲基叔丁基醚

N

Na

NaHCO

Na

NdeI-识别CA^TATG位点的限制性酶

NEt

NaH-氢化钠

NaOH-氢氧化钠

NH

NH

NMR-核磁共振

PAGE-聚丙烯酰胺凝胶电泳

PCR-聚合酶链反应

qPCR-定量PCR

Pd/C-碳载钯

-PH-3'末端磷酸修饰

pTSA-4-甲苯磺酸

Rt-保留时间

r.t.-室温

sat.-饱和水溶液

SDS-十二烷基硫酸钠

SI-选择性指数(=CC

STAB-三乙酰氧基硼氢化钠

T-DNA碱基胸腺嘧啶

TBAF-四丁基氟化铵

TFA-三氟乙酸

THF-四氢呋喃

TLC-薄层层析

Tris-三(羟基甲基)-氨基甲烷

XhoI-识别C^TCGAG位点的限制性酶

化合物鉴定-NMR

对于许多化合物来说,使用装备有5mm反向三重共振探头的Bruker DPX400波谱仪记录NMR波谱,对于质子来说在400MHz下运行,对于碳来说在100MHz下运行。氘化溶剂是氯仿-d(氘代氯仿,CDCl

化合物鉴定–HPLC/MS

对于许多化合物来说,使用下述分析方法记录LC-MS波谱。

方法A

柱-反相Waters Xselect CSH C18(50x2.1mm,3.5微米)

流速-0.8mL/min,25摄氏度

洗脱剂A–95%乙腈+5%10mM碳酸铵水溶液(pH 9)

洗脱剂B–10mM碳酸铵水溶液(pH 9)

线性梯度t=0min 5%A,t=3.5min 98%A,t=6min 98%A

方法B

柱-反相Waters Xselect CSH C18(50x2.1mm,3.5微米)

流速-0.8mL/min,35摄氏度

洗脱剂A–0.1%甲酸的乙腈溶液

洗脱剂B–0.1%甲酸水溶液

线性梯度t=0min 5%A,t=3.5min 98%A.t=6min 98%A

方法C

柱-反相Waters Xselect CSH C18(50x2.1mm,3.5微米)

流速-1mL/min,35摄氏度

洗脱剂A–0.1%甲酸的乙腈溶液

洗脱剂B–0.1%甲酸水溶液

线性梯度t=0min 5%A,t=1.6min 98%A.t=3min 98%A

方法D

柱-Phenomenex Gemini NX C18(50x2.0mm,3.0微米)

流速-0.8mL/min,35摄氏度

洗脱剂A–95%乙腈+5%10mM碳酸氢铵水溶液

洗脱剂B–10mM碳酸氢铵水溶液,pH=9.0

线性梯度t=0min 5%A,t=3.5min 98%A.t=6min 98%A

方法E

柱-Phenomenex Gemini NX C18(50x2.0mm,3.0微米)

流速–0.8mL/min,25摄氏度

洗脱剂A–95%乙腈+5%10mM碳酸氢铵水溶液

洗脱剂B–10mM碳酸氢铵水溶液(pH 9)

线性梯度t=0min 5%A,t=3.5min 30%A,t=7min 98%A,t=10min 98%A

方法F

柱-Waters XSelect HSS C18(150x 4.6mm,3.5微米)

流速–1.0mL/min,25摄氏度

洗脱剂A–0.1%TFA的乙腈溶液

洗脱剂B–0.1%TFA水溶液

线性梯度t=0min 2%A,t=1min 2%A,t=15min 60%A,t=20min 60%A

方法G

柱-Zorbax SB-C18 1.8μm 4.6x15mm快速分离柱(PN 821975-932)

流速-3mL/min

洗脱剂A–0.1%甲酸的乙腈溶液

洗脱剂B–0.1%甲酸水溶液

线性梯度t=0min 0%A,t=1.8min 100%A

方法H

柱-Waters Xselect CSH C18(50x2.1mm,2.5微米)

流速–0.6mL/min

洗脱剂A–0.1%甲酸的乙腈溶液

洗脱剂B–0.1%甲酸水溶液

线性梯度t=0min 5%A,t=2.0min 98%A,t=2.7min 98%A

方法J

柱-反相Waters Xselect CSH C18(50x2.1mm,2.5微米)

流速–0.6mL/min

洗脱剂A–100%乙腈

洗脱剂B–10mM碳酸氢铵水溶液(pH 7.9)

线性梯度t=0min 5%A,t=2.0min 98%A,t=2.7min 98%A

4-氯-7-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤A:将化合物1·HCl(17.0g,86.2mmol)、乙酸钠(7.10g,86.6mmol)和丙酮酸乙酯(10.0g,86.1mmol)在乙醇(100mL)中的混合物回流1h,冷却至r.t.,并用水(100mL)稀释。通过过滤收集沉淀的固体并干燥,得到20.0g(77.3mmol,90%)作为顺式和反式异构体的混合物的化合物2。

步骤B:将在前一步骤中得到的化合物2(20.0g,77.3mmol)和BF

步骤C:将化合物3(3.00g,12.4mmol)和NaOH(0.500g,12.5mmol)在乙醇(30mL)中的混合物回流30min,并在减压下蒸发。将残留物与水(30mL)混合并过滤掉不溶性物质。将滤液用浓盐酸(5mL)酸化。通过过滤收集沉淀的固体,用水(3mL)洗涤并干燥,得到2.41g(11.3mmol,91%)4-氯-7-氟-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.24mins,m/z 212[M-H]

7-氟-4-甲基-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤D:在-10℃下向甲醇钠(21.6g,400mmol)在甲醇(300mL)中的溶液逐滴添加化合物4(26.4g,183mmol)和化合物5(59.0g,457mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应物质维持低于5℃的温度搅拌3h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min,过滤并用水洗涤,得到作为白色固体的35.0g(156mmol,72%)化合物6。

步骤E:将在前一步骤中获得的化合物6(35.0g,156mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下蒸发。将残留物从己烷-乙酸乙酯混合物(60:40)重结晶,给出21.0g(103mmol,60%)化合物7。

步骤F:向化合物7(21.0g,101mmol)在乙醇(200mL)中的溶液添加2N氢氧化钠水溶液(47mL)。将所述混合物在60℃搅拌2h。蒸发掉溶剂,并将残留物用盐酸水溶液酸化至pH5-6。过滤出得到的沉淀物,用水洗涤并干燥,得到18.0g(93.2mmol,92%)7-氟-4-甲基-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.12mins,m/z 192[M-H]

6,7-二氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤G:将化合物8(5.00g,34.7mmol)、乙酸(1mL)和丙酮酸乙酯(5.00g,43.1mmol)在乙醇(20mL)中的混合物回流1h,冷却至r.t.,并用水(20mL)稀释。通过过滤收集沉淀的固体并干燥,得到5.50g(22.7mmol,66%)作为顺式和反式异构体的混合物的化合物9。

步骤H:将在前一步骤中获得的化合物9(5.50g,22.7mmol)和BF

步骤I:将化合物10(0.450g,2.00mmol)和NaOH(0.100g,2.50mmol)在乙醇(10mL)中的混合物回流30min,并在减压下蒸发。将残留物与水(10mL)混合并过滤掉不溶性物质。将滤液用浓盐酸(1mL)酸化。通过过滤收集沉淀的固体,用水(3mL)洗涤并干燥,得到0.38g(1.93mmol,95%)6,7-二氟-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.10mins,m/z 196[M-H]

4-氰基-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤J:向化合物11(5.00g,19.7mmol)在DMF(50mL)中的搅拌的溶液添加CuCN(3.00g,33.5mmol)。将混合物在150℃搅拌4h。然后将所述混合物冷却至r.t.并添加水(100mL)。将得到的混合物用乙酸乙酯萃取(4×100mL)。将合并的有机萃取物用水(50mL)和盐水(50mL)洗涤,在Na

步骤K:向化合物12(2.50g,12.5mmol)在乙醇(30mL)中的溶液添加LiOH·H

Rt(方法G)1.00mins,m/z 197[M+H]

4-氰基-7-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤L:向化合物13(5.00g,18.4mmol)在DMF(50mL)中的搅拌的溶液添加CuCN(2.80g,31.2mmol)。将混合物在150℃搅拌4h。然后将所述混合物冷却至r.t.并添加水(100mL)。将得到的混合物用乙酸乙酯萃取(4x 100mL)。将合并的有机萃取物用水(50mL)和盐水(50mL)洗涤,在Na

步骤M:向化合物14(1.50g,6.87mmol)在乙醇(20mL)中的溶液添加LiOH·H

Rt(方法G)1.02mins,m/z 203[M-H]

4-氰基-5-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤N:向化合物15(5.00g,19.4mmol)在DMF(50mL)中的溶液添加NaHCO

步骤O:向化合物16(4.80g,17.6mmol)在DMF(50mL)中的搅拌的溶液添加CuCN(2.70g,30.1mmol)。将混合物在150℃搅拌4h。然后将所述混合物冷却至r.t.,添加水(100mL)。将得到的混合物用乙酸乙酯萃取(4x 100mL)。将合并的有机萃取物用水(50mL)和盐水(50mL)洗涤,在Na

步骤P:向化合物17(1.40g,6.42mmol)在乙醇(20mL)中的溶液添加LiOH·H

Rt(方法G)1.10mins,m/z 203[M-H]

4,5,6-三氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤Q:在-10℃下向甲醇钠(23.0g,426mmol)在甲醇(200mL)中的溶液逐滴添加化合物18(15.0g,93.7mmol)和化合物5(26.0g,201mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应混合物搅拌3h,维持温度低于5℃,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min,并通过过滤收集沉淀物。将固体用水洗涤并干燥,得到12.0g(46.7mmol,72%)作为白色固体的化合物19。

步骤R:将在前一步骤中获得的化合物19(12.0g,46.7mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下蒸发。将残留物从己烷-乙酸乙酯混合物(60:40)重结晶,给出7.00g(30.5mmol,65%)化合物20。

步骤S:向化合物20(7.00g,30.5mmol)在乙醇(50mL)中的溶液添加2N氢氧化钠水溶液(18mL)。将混合物在60℃搅拌2h。蒸发掉溶剂并将残留物用盐酸水溶液酸化至pH 5-6。通过过滤收集得到的沉淀物,用水洗涤并干燥,得到5.00g(23.2mmol,76%)4,5,6-三氟-1H-吲哚-2-甲酸。

4,6,7-三氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤T:在-10℃下向甲醇钠(23.0g,426mmol)在甲醇(200mL)中的溶液逐滴添加化合物21(15.0g,90.3mmol)和化合物5(26.0g,201mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应混合物维持在低于5℃的温度下搅拌3h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到10.0g(38.0mmol,42%)作为白色固体的化合物22。

步骤U:将在前一步骤中获得的化合物22(10.0g,38.0mmol)在二甲苯(200mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物从己烷-乙酸乙酯混合物(60:40)重结晶,给出6.00g(26.2mmol,69%)化合物23。

步骤V:向化合物23(7.00g,30.5mmol)在乙醇(40mL)中的溶液添加2N氢氧化钠水溶液(16mL)。将混合物在60℃搅拌2h。蒸发掉溶剂,并将残留物用盐酸水溶液酸化至pH 5-6。通过过滤收集得到的沉淀物,用水洗涤并干燥,得到4.10g(19.1mmol,62%)4,6,7-三氟-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.16mins,m/z 214[M-H]

4-氰基-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤W:在-10℃下向甲醇钠(65.0g,1203mmol)在甲醇(500mL)中的溶液逐滴添加化合物24(60.0g,296mmol)和化合物5(85.0g,658mmol)在甲醇(200mL)中的溶液。将反应混合物维持在低于5℃的温度下搅拌3h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到45.0g(143mmol,48%)化合物25。

步骤X:将在前一步骤中获得的化合物25(35.0g,111mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下蒸发。将残留物从己烷-乙酸乙酯混合物(60:40)重结晶,给出11.0g(38.4mmol,35%)化合物26。

步骤Y:向化合物26(11.0g,38.4mmol)在DMF(20mL)中的搅拌的溶液添加CuCN(6.60g,73.7mmol)。将混合物在150℃搅拌4h。然后将所述混合物冷却至r.t.并添加水(70mL)。将混合物用乙酸乙酯萃取(4x 50mL)。将合并的有机萃取物用水(50mL)和盐水(50mL)洗涤,在Na

步骤Z:向化合物27(2.40g,6.42mmol)在乙醇(30mL)中的溶液添加LiOH·H

Rt(方法G)1.06mins,m/z 203[M-H]

4-乙基-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤AA:将化合物28(70.0g,466mmol)在无水THF(500mL)中的溶液用BH

步骤AB:向化合物29(55.0g,404mmol)在CH

步骤AC:在-10℃下向甲醇钠(107g,1981mmol)在甲醇(600mL)中的溶液逐滴添加在前一步骤中获得的化合物30(51.0g)和化合物5(126g,976mmol)在甲醇(300mL)中的溶液。将反应混合物维持在低于5℃的温度下搅拌4h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min,并通过过滤收集沉淀物。将固体用水洗涤并干燥,得到35.0g(151mmol,经过2个步骤后37%)化合物31。

步骤AD:将在前一步骤中获得的化合物31(35.0g,151mmol)在二甲苯(500mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物从己烷-乙酸乙酯混合物(60:40)重结晶,给出21.0g(103mmol,68%)化合物32。

步骤AE:向化合物32(21.0g,103mmol)在乙醇(200mL)中的溶液添加2N氢氧化钠水溶液(47mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物在减压下浓缩,并将残留物用盐酸水溶液酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到19g(100mmol,97%)4-乙基-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.20mins,m/z 188[M-H]

4-环丙基-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤AF:向化合物33(2.00g,7.80mmol)、环丙基硼酸(0.754g,8.78mmol)、K

步骤AG:将化合物34(1.10g,5.11mmol)在乙醇(40mL)和2N氢氧化钠水溶液(15mL)中的混合物在60℃搅拌2h。将混合物在减压下浓缩,并将残留物用盐酸水溶液酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到1.01g(5.02mmol,92%)4-环丙基-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.17mins,m/z 200[M-H]

4-氯-5-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤AH:在-10℃下向甲醇钠(39.9g,738mmol)在甲醇(300mL)中的溶液逐滴添加化合物36(28.8g,182mmol)和叠氮基乙酸甲酯(52.1g,404mmol)在甲醇(150mL)中的溶液。将反应混合物维持在低于5℃的温度搅拌3h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到20.0g(78.2mmol,43%)化合物37。

步骤AI:将化合物37(19.4g,76.0mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物从己烷-乙酸乙酯(50:50)重结晶,给出9.00g(39.5mmol,52%)化合物38。

步骤AJ:向化合物38(8.98g,39.4mmol)在乙醇(100mL)中的溶液添加2N氢氧化钠水溶液(18mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物在减压下浓缩,并将残留物用盐酸水溶液酸化至pH 5-6。通过过滤收集得到的沉淀物,用水洗涤并干燥,得到7.75g(36.3mmol,92%)4-氯-5-氟-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.15mins,m/z 212[M-H]

5-氟-4-(1-羟基乙基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤AK:在-10℃下向甲醇钠(50.0g,926mmol)在甲醇(300mL)中的溶液逐滴添加化合物39(45.0g,222mmol)和叠氮基乙酸甲酯(59.0g,457mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应混合物维持在低于5℃的温度下搅拌3h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到35.0g(133mmol,60%)作为白色固体的化合物40。

步骤AL:将在前一步骤中获得的化合物40(35.0g,133mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下蒸发。将残留物从己烷-乙酸乙酯(60:40)重结晶,给出21.0g(77.2mmol,58%)化合物41。

步骤AM:在氮气下向化合物41(4.00g,14.7mmol)和三丁基(1-乙氧基乙烯基)锡烷(5.50g,15.2mmol)在甲苯(50mL)中的脱气的溶液添加双(三苯基膦)二氯化钯(II)(1.16g,1.65mmol)。将反应混合物在60℃搅拌20h。将反应混合物冷却至室温并过滤。将滤液在减压下浓缩,并将残留物通过硅胶层析进行纯化,得到2.50g(9.50mmol,65%)作为浅黄色固体的化合物42。

步骤AN:向化合物42(2.40g,9.12mmol)在1,4-二氧杂环己烷(30mL)中的溶液添加2M盐酸(15mL)。将得到的混合物在室温搅拌30min。将混合物在真空下浓缩,并将残留物在乙酸乙酯与水之间分配。将有机萃取物用水和盐水洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤并蒸发。将残留物用异己烷中的5%乙醚研磨并干燥,得到1.80g(7.65mmol,84%)作为白色固体的化合物43。

步骤AO:将化合物43(1.70g,7.23mmol)和NaBH

步骤AP:向化合物44(1.50g,6.32mmol)在甲醇(40mL)中的溶液添加2N NaOH水溶液(10mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物在减压下浓缩,并将残留物用10%盐酸酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤(3×15mL)并干燥,得到1.30g(5.82mmol,92%)5-氟-4-(1-羟基乙基)-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.00mins,m/z 222[M-H]

4-乙基-5-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤AQ:在氮气下向化合物41(4.00g,14.7mmol)在无水DMF(10mL)中的加热(90℃)的溶液添加三正丁基(乙烯基)锡(3.60g,11.4mmol)和Pd(PPh

步骤AR:将化合物45(1.50g,6.84mmol)和Pd/C(0.300g,10%wt.)在甲醇(20mL)中的混合物在氢气气氛下在室温搅拌16h。将混合物过滤,然后在减压下浓缩,给出1.45g(6.55mmol,96%)化合物46。

步骤AS:向化合物46(1.40g,6.33mmol)在甲醇(40mL)中的溶液添加2N NaOH水溶液(10mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物在真空下浓缩,然后将残留物用10%盐酸酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤(3×15mL)并干燥,得到1.20g(5.79mmol,91%)目标化合物4-乙基-5-氟-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.33mins,m/z 206[M-H]

4-乙基-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤AT:在-10℃下向甲醇钠(50.0g,926mmol)在甲醇(300mL)中的溶液逐滴添加化合物47(45.0g,202mmol)和叠氮基乙酸甲酯(59.0g,457mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应混合物维持在低于5℃的温度搅拌3h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到38.5g(128mmol,63%)作为白色固体的化合物48。

步骤AU:将在前一步骤中获得的化合物48(38.5g,128mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物从己烷-乙酸乙酯(60:40)重结晶,给出18.0g(67.3mmol,53%)化合物49。

步骤AV:在氮气下向化合物49(4.00g,14.7mmol)在无水DMF(10mL)中的加热(90℃)的溶液添加三正丁基(乙烯基)锡(3.60g,11.4mmol)和Pd(PPh

步骤AW:将化合物50(1.50g,6.84mmol)和Pd/C(0.300g,10%wt.)在甲醇(20mL)中的混合物在氢气气氛下在室温搅拌16h。将混合物过滤并浓缩,给出1.40g(6.33mmol,93%)化合物51。

步骤AX:向化合物51(1.10g,4.97mmol)在甲醇(40mL)中的溶液添加2N NaOH水溶液(10mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物在减压下浓缩,然后用10%盐酸酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水(3×15mL)洗涤并干燥,得到0.900g(4.34mmol,87%)目标化合物4-乙基-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.29mins,m/z 206[M-H]

6-氟-4-(1-羟基乙基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤AY:在氮气下向化合物49(4.00g,14.7mmol)和三丁基(1-乙氧基乙烯基)锡烷(5.50g,15.2mmol)在甲苯(50mL)中的脱气的溶液添加双(三苯基膦)二氯化钯(II)(1.16g,1.65mmol)。将反应混合物在60℃搅拌20h。将反应混合物冷却至室温并过滤。将滤液在减压下浓缩并将残留物通过硅胶层析进行纯化,给出2.10g(7.98mmol,54%)作为浅黄色固体的化合物52。

步骤AZ:向化合物52(2.10g,7.98mmol)在1,4-二氧杂环己烷(30mL)中的溶液添加2M盐酸(15mL)。将得到的混合物在室温搅拌30min。将混合物在减压下浓缩,并将残留物在乙酸乙酯与水之间分配。将有机萃取物用水和盐水洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤并浓缩。将残留物用异己烷中的5%乙醚研磨并干燥,得到1.70g(7.23mmol,91%)作为白色固体的化合物53。

步骤BA:将化合物53(1.70g,7.23mmol)和NaBH

步骤BB:向化合物54(1.40g,5.90mmol)在甲醇(40mL)中的溶液添加2N NaOH水溶液(10mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物浓缩,并将残留物用10%盐酸酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水(3×15mL)洗涤并干燥,得到1.10g(4.93mmol,48%)目标化合物6-氟-4-(1-羟基乙基)-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.00mins,m/z 222[M-H]

4-乙基-7-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤BC:在-10℃下向甲醇钠(50.0g,926mmol)在甲醇(300mL)中的溶液逐滴添加化合物55(45.0g,222mmol)和叠氮基乙酸甲酯(59.0g,457mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应混合物维持在低于5℃的温度下搅拌3h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到33.0g(110mmol,50%)作为白色固体的化合物56。

步骤BD:将在前一步骤中获得的化合物56(33.0g,110mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物从己烷-乙酸乙酯(60:40)重结晶,给出21.5g(79.0mmol,72%)化合物57。

步骤BE:在氮气下向化合物57(4.00g,14.7mmol)在无水DMF(10mL)中的加热(90℃)的溶液添加三正丁基(乙烯基)锡(3.60g,11.4mmol)和Pd(PPh

步骤BF:将化合物58(1.50g,6.84mmol)和Pd/C(0.300g,10%wt.)在甲醇(20mL)中的混合物在氢气气氛下在室温搅拌16h。将混合物过滤并浓缩,给出1.25g(5.65mmol,83%)化合物59。

步骤BG:向化合物59(1.40g,6.33mmol)在甲醇(40mL)中的溶液添加2N NaOH水溶液(10mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物在减压下浓缩,并将残留物用10%盐酸酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水(3×15mL)洗涤并干燥,得到1.25g(6.03mmol,95%)目标化合物4-乙基-7-氟-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.27mins,m/z 206[M-H]

7-氟-4-(1-羟基乙基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤BH:在氮气下向化合物57(4.00g,14.7mmol)和三丁基(1-乙氧基乙烯基)锡烷(5.50g,15.2mmol)在甲苯(50mL)中的脱气的溶液添加双(三苯基膦)二氯化钯(II)(1.16g,1.65mmol)。将反应混合物在60℃搅拌20h。将混合物冷却至室温并过滤。将滤液在减压下浓缩,并将残留物通过硅胶层析进行纯化,得到2.70g(10.3mmol,70%)作为浅黄色固体的化合物60。

步骤BI:向化合物60(2.40g,9.12mmol)在1,4-二氧杂环己烷(30mL)中的溶液添加2M盐酸(15mL)。将混合物在室温搅拌30min。蒸发掉大部分溶剂,并将残留物在乙酸乙酯与水之间分配。将合并的有机萃取物用水和盐水洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤并蒸发。将残留物用异己烷中的5%乙醚研磨并干燥,得到1.90g(8.08mmol,86%)作为白色固体的化合物61。

步骤BJ:将化合物61(1.70g,7.23mmol)和NaBH

步骤BK:向化合物62(1.50g,6.32mmol)在甲醇(40mL)中的溶液添加2N NaOH水溶液(10mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物在减压下浓缩,并将残留物用10%盐酸酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水(3×15mL)洗涤并干燥,得到1.35g(6.05mmol,96%)目标化合物7-氟-4-(1-羟基乙基)-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)0.90mins,m/z 222[M-H]

4-(羟基甲基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤BL:向化合物33(10.0g,39.4mmol)在二氧杂环己烷(200mL)与水(50mL)的混合物中的溶液添加乙烯基三氟硼酸钾(11.0g,82.1mmol)、三乙胺(30mL,248mmol)和Pd(dppf)Cl

步骤BM:向化合物63(2.50g,12.4mmol)、丙酮(200mL)和水(40mL)的混合物添加OsO

步骤BN:向化合物64(1.50g,7.38mmol)在THF/甲醇混合物(100mL)中的冷却(0℃)的溶液添加NaBH

步骤BO:向在前一步骤中获得的化合物65(1.00g,4.87mmol)在THF(50mL)中的溶液添加1N LiOH水溶液(9mL)。将得到的混合物在室温搅拌48h,然后浓缩并用1N NaHSO

Rt(方法G)0.98mins,m/z 190[M-H]

4-(2-羟基丙-2-基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤BP和BQ:在氩气下向化合物33(1.00g,3.94mmol)和三丁基-(1-乙氧基乙烯基)锡烷(1.58g,4.37mmol)在DMF(25mL)中的脱气的溶液添加双(三苯基膦)二氯化钯(II)(0.100g,0.142mmol)。将反应混合物在室温搅拌,直至TLC揭示出反应完成(大约7天)。将混合物在减压下浓缩,并将残留物在乙酸乙酯与水之间分配。将有机层通过硅胶塞过滤,在MgSO4上干燥并在减压下浓缩。将得到的黑色油状物溶解在甲醇(100mL)中,用5N盐酸(100mL)处理,并在室温搅拌过夜。将混合物浓缩,并将残留物溶解在乙酸乙酯中。将溶液用水洗涤,在Na

步骤BR:向化合物67(1.00g,4.60mmol)在THF(50mL)中的溶液添加1N LiOH水溶液(7mL)。将得到的混合物在室温搅拌48h,然后在减压下浓缩,并用1N NaHSO4水溶液稀释(7mL)。将混合物用乙酸乙酯萃取。将有机萃取物在MgSO

步骤BS:在氩气下向化合物68(0.900g,4.43mmol)在THF(50mL)中的冷却(0℃)的溶液添加1N MeMgCl在己烷中的溶液(16mL)。将得到的混合物在室温搅拌48h。将混合物小心地用1N NaHSO

Rt(方法G)0.99mins,m/z 202[M-H]

4-(1-羟基乙基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤BS:向化合物66(1.00g,4.60mmol)在THF/甲醇混合物(50mL)中的冷却(0℃)的溶液添加NaBH

步骤BT:向在前一步骤中获得的化合物69(0.800g,3.65mmol)在THF(50mL)中的溶液添加1N LiOH水溶液(6mL)。将得到的混合物在室温搅拌48h,然后浓缩并用1N NaHSO

Rt(方法G)0.82mins,m/z 204[M-H]

4-(丙-2-基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤BU:在-10℃下向甲醇钠(10.0g,185mmol)在甲醇(150mL)中的溶液逐滴添加化合物70(15.0g,101mmol)和叠氮基乙酸甲酯(12.0g,104mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应混合物维持在低于5℃的温度搅拌3h,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min。然后通过过滤收集沉淀物,用水洗涤并干燥,得到7.00g(23.3mmol,23%)作为白色固体的化合物71。

步骤BV:将在前一步骤中获得的化合物71(7.00g,23.3mmol)在二甲苯(200mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物从己烷-乙酸乙酯(60:40)重结晶,给出3.50g(16.1mmol,69%)化合物72。

步骤BW:向化合物72(3.50g,16.1mmol)在甲醇(100mL)中的溶液添加2N NaOH水溶液(40mL)。将混合物在60℃搅拌2h。将混合物在减压下浓缩,然后将残留物用10%盐酸酸化至pH 5-6。通过过滤收集沉淀物,用水(3×50mL)洗涤并干燥,得到2.70g(13.3mmol,83%)目标化合物4-(丙-2-基)-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.32mins,m/z 202[M-H]

4-乙烯基-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤BX:向化合物63(0.900g,4.47mmol)在THF(50mL)中的溶液添加1N LiOH水溶液(8mL)。将得到的混合物在室温搅拌48h,然后在减压下浓缩,并用1N NaHSO

Rt(方法G)1.14mins,m/z 186[M-H]

4-乙炔基-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤BY:在氩气下向化合物33(1.00g,3.94mmol)在THF(50mL)中的溶液添加TMS-乙炔(0.68mL,4.80mmol)、CuI(0.076g,0.399mmol)、三乙胺(2.80mL,20.0mmol)和Pd(dppf)Cl

步骤BZ:向化合物73(0.840g,3.10mmol)在THF(50mL)中的溶液添加1N LiOH水溶液(7mL)。将得到的混合物在室温搅拌48h,然后在减压下浓缩,并用1N NaHSO

Rt(方法G)1.12mins,m/z 184[M-H]

4-(1,1-二氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤CA:向2-溴乙酰苯(63.0g,317mmol)、水(0.5mL)和二氯甲烷(100mL)的混合物添加Morph-DAST(121mL,992mmol)。将得到的混合物在室温搅拌28天。然后将反应混合物倾倒在NaHCO

步骤CB:在Ar下在30min内向化合物74(16.8g,76.0mmol)在THF(300mL)中的冷却(-85℃)的溶液添加2.5M n-BuLi在己烷中的溶液(36.5mL,91.5mmol)。将得到的混合物在-85℃搅拌1h。然后添加DMF(8.80mL,114mmol)(维持温度低于-80℃),并将反应继续搅拌45min。将反应用NH

步骤CC:在Ar下向化合物75(12.5g,73.5mmol)、乙醇(500mL)和叠氮基乙酸乙酯(28.5g,221mmol)的冷却(-30℃)的混合物分部添加新鲜制备的甲醇钠溶液(通过将Na(5.00g,217mmol)与甲醇(100mL)混合来来制备)(维持温度低于-25℃)。将反应混合物升温至15℃并搅拌12h。将得到的混合物倾倒在NH

步骤CD:将化合物76(10.0g,35.6mmol)在二甲苯(500mL)中的溶液回流,直至气体产生停止(大约2h),然后在减压下浓缩。将得到的橙色油状物用己烷/乙酸乙酯(5:1)研磨,通过过滤收集并干燥,得到1.53g(6.04mmol,17%)化合物77。

步骤CE:向化合物77(1.53g,6.04mmol)在THF水的9:1混合物(100mL)中的溶液添加LiOH·H

Rt(方法G)1.16mins,m/z 224[M-H]

4-(三甲基甲硅烷基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤CF:在Ar下向4-溴-1H-吲哚(5.00g,25.5mmol)在THF(100mL)中的冷却(-78℃)的溶液添加2.5M n-BuLi在己烷中的溶液(23mL,57.5mmol)。将得到的混合物搅拌30min。添加TMSCl(16mL,126mmol),并将反应混合物升温至室温。在1h后,将混合物用MTBE(250mL)稀释,用水(2x 200mL)和盐水(200mL)洗涤,然后在Na

步骤CG:在Ar下向化合物78(1.50g,7.92mmol)在THF(50mL)中的冷却(-78℃)的溶液添加2.5M n-BuLi在己烷中的溶液(3.8mL,9.5mmol)。将得到的混合物搅拌20min。然后将CO

Rt(方法G)1.47mins,m/z 232[M-H]

6-氯-5-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤CH:向(3-氯-4-氟苯基)肼(80.0g,498mmol)在乙醇(200mL)中的溶液添加丙酮酸乙酯(58.0g,499mmol)。将混合物回流1h,然后在减压下浓缩,并用水(300mL)稀释。通过过滤收集固体,然后干燥,得到122g(472mmol,95%)化合物79。

步骤CI:将化合物79(122g,472mmol)和pTSA(81.5g,473mmol)在甲苯(500mL)中的悬液回流48h,然后冷却至室温。通过过滤收集沉淀物,并通过从甲苯分步结晶进行纯化,得到4.00g(16.6mmol,4%)化合物80。

步骤CJ:向化合物80(4.00g,16.6mmol)在乙醇(30mL)中的回流的溶液添加NaOH(0.660g,16.5mmol)。将混合物回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物用温水(80℃,50mL)研磨,并将溶液用浓盐酸酸化(pH 2)。通过过滤收集沉淀物,用水(2x 10mL)洗涤并干燥,得到3.18g(14.9mmol,90%)目标化合物6-氯-5-氟-1H-吲哚-2-甲酸。

Rt(方法G)1.23mins,m/z 212[M-H]

4-(二氟甲基)-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤CK:在-10℃下向甲醇钠(50.0g,926mmol)在甲醇(300mL)中的溶液逐滴添加2-溴-4-氟苯甲醛(222mmol)和叠氮基乙酸甲酯(59.0g,457mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应混合物搅拌3h,维持温度低于5℃,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min,并通过过滤收集固体。将固体用水洗涤,得到作为白色固体的化合物81(62%得率)。

步骤CL:将化合物81(133mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物从己烷-乙酸乙酯混合物(60:40)重结晶,给出化合物82(58%得率)。

步骤CM:在氮气下向化合物82(14.7mmol)在无水DMF(10mL)中的加热(90℃)的溶液添加三正丁基(乙烯基)锡(3.60g,11.4mmol)和Pd(PPh3)2Cl2(0.301g,0.757mmol),并将得到的混合物在90℃搅拌1h。将混合物冷却至室温,并通过硅胶柱层析进行纯化(己烷中的60-80%乙酸乙酯)。将合并的产物级分浓缩,用水(3x 100mL)洗涤,在Na

步骤CN:向化合物83(12.4mmol)、丙酮(200mL)和水(40mL)的混合物添加OsO

步骤CO:向化合物84(11.0mmol)在二氯甲烷(50mL)中的溶液添加Morph-DAST(4.10mL,33.6mmol)。将得到的混合物搅拌,直至等分试样的NMR揭示出反应完成(2-5天)。将反应混合物逐滴添加到冷的NaHCO

步骤CP:向化合物85(4.50mmol)在THF(50mL)中的溶液添加1N LiOH水溶液(8mL)。将得到的混合物在室温搅拌48h,然后在减压下浓缩并用1N NaHSO

Rt(方法G)1.22mins,m/z 228[M-H]

4-(二氟甲基)-7-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

如为4-(二氟甲基)-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸所述,从2-溴-5-氟苯甲醛开始来制备(总得率2.5%)。

Rt(方法G)1.13mins,m/z 228[M-H]

4-(二氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备

如为4-(二氟甲基)-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸所述,从4-溴-1H-吲哚-2-甲酸开始来制备(总得率11%)。

Rt(方法G)1.17mins,m/z 210[M-H]

4-(1,1-二氟乙基)-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

步骤CQ:在氮气下向2-溴-5 -氟苯甲腈(10.0g,48.5mmol)在无水四氢呋喃(100mL)中的溶液添加甲基溴化镁(3.2M,在乙醚中,19mL,60.0mmol)。将得到的混合物加热回流4h。然后将反应混合物冷却,倾倒在2N盐酸(100mL)中,并用甲醇(100mL)稀释。除去有机溶剂,并沉淀出粗产物。将反应混合物用乙酸乙酯萃取,在MgSO

步骤CR:在室温下向化合物86(110mmol)在二氯甲烷(50mL)中的溶液添加Morph-DAST(41mL,336mmol)和几滴水。将得到的混合物在室温搅拌48条;每7天添加额外部分的Morph-DAST(41mL,336mmol)。在反应完成后,将混合物小心地逐滴添加到冷的饱和NaHCO

步骤CS:向化合物87(21.0mmol)在THF(150mL)中的冷却(-80℃)的溶液缓慢添加2.5M n-BuLi在己烷中的溶液(10.0mL,25.0mmol n-BuLi)。将混合物搅拌1h,然后添加DMF(2.62mL,33.8mmol),并将混合物继续搅拌1h。将反应用饱和NH

步骤CT:在-10℃下向甲醇钠(50.0g,926mmol)在甲醇(300mL)中的溶液逐滴添加化合物88(222mmol)和叠氮基乙酸甲酯(59.0g,457mmol)在甲醇(100mL)中的溶液。将反应混合物搅拌3h,维持温度低于5℃,然后用冰水淬灭。将得到的混合物搅拌10min。通过过滤收集得到的固体,并用水洗涤,得到作为白色固体的化合物89(66%得率)。

步骤CU:将化合物89(120mmol)在二甲苯(250mL)中的溶液在氩气气氛下回流1h,然后在减压下浓缩。将残留物从己烷-乙酸乙酯重结晶,给出化合物90(70%得率)。

步骤CV:向化合物90(4.40mmol)在THF(50mL)中的溶液添加1N LiOH水溶液(8mL)。将得到的混合物在室温搅拌48h,然后在减压下浓缩并用1N NaHSO

Rt(方法G)1.26mins,m/z 242[M-H]

4-(1,1-二氟乙基)-7-氟-1H-吲哚-2-甲酸的制备

如为4-(1,1-二氟乙基)-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸所述,从2-溴-4-氟乙酰苯开始来制备(总得率3.6%)。

Rt(方法G)1.23mins,m/z 242[M-H]

2-氨基-6-甲基-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-5-甲酸叔丁酯的制备

步骤A:向5-[(叔丁氧基)羰基]-6-甲基-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-甲酸(3.64g,12.9mmol)、DIPEA(2.01g,15.6mmol)和苯甲醇(4.20g,38.8mmol)在二氧杂环己烷(30mL)中的加热(50℃)的混合物逐滴添加DPPA(3.56g,12.9mmol)。然后将反应混合物在90℃搅拌3h。然后将溶液冷却至r.t.并在真空中浓缩。将残留物在乙酸乙酯与水之间分配。将有机层用水和盐水洗涤,在Na

步骤B:向2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-6-甲基-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-5-甲酸叔丁酯(2.60g,6.73mmol)在甲醇(30mL)中的溶液添加Pd/C(358mg,10%wt.)。将悬液在氢气气氛下在45℃搅拌。通过过滤除去催化剂,并将溶液在减压下蒸发至干,得到1.68g(6.66mmol,99%)目标化合物2-氨基-6-甲基-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-5-甲酸叔丁酯。

Rt(方法G)1.07mins,m/z 253[M+H]

实施例1

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-(氧杂环戊烷-3-基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)2.75mins,m/z 352[M+H]+

实施例2

(1r,4r)-4-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}环己-1-醇

Rt(方法A)2.74mins,m/z 380[M+H]+

实施例3

4-{[5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}环己-1-醇

步骤1

向4-羟基环己-1-酮(71.9mg,0.629mmol)添加2-氨基-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-5(4H)-甲酸叔丁酯(100mg,0.420mmol)和无水THF(1mL)。然后添加乙醇钛(IV)(0.262mL,0.839mmol),并将混合物在100℃搅拌2h。将混合物冷却,并添加氰基硼氢化钠(52.7mg,0.839mmol)。然后将混合物在100℃继续搅拌1小时。将反应混合物冷却并倾倒在2M NH

步骤2

向步骤1的产物在THF(3mL)中的冷却(0℃)的溶液添加1MHCl(3mL)。在室温下15min后,将反应混合物升温至60℃并搅拌过夜。将混合物冷却,然后浓缩,给出4-((4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基)氨基)环己-1-醇二盐酸盐,其不需进一步纯化用于下一步骤中。

步骤3

将(4-((4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基)氨基)环己-1-醇二盐酸盐(50mg,0.162mmol)和DABCO(181mg,1.617mmol)溶解在无水N,N-二甲基甲酰胺(3mL)中。向4-氯-1H-吲哚-2-甲酸(31.6mg,0.162mmol)在无水N,N-二甲基甲酰胺(1mL)中的溶液添加HATU(73.8mg,0.194mmol)。将混合物搅拌10分钟,然后合并并搅拌1h,然后浓缩。将残留物悬浮在DMSO中。将悬液过滤,并将滤液用DMSO洗涤,给出~2mL溶液。将该残留物通过反相柱层析进行纯化,给出作为白色固体的4-{[5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}环己-1-醇(31.4mg,47%得率)。

Rt(方法A)2,93/2,99mins,m/z 414,1/416,1[M+H]+

实施例4

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氮杂环丁烷-3-甲酰胺盐酸盐

Rt(方法B)2.16mins,m/z 365[M+H]+

实施例5

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]环丙烷磺酰胺

Rt(方法A)2.74mins,m/z 386[M+H]+

实施例6

4-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨甲酰基}哌啶-1-甲酸叔丁酯

Rt(方法A)3.4mins,m/z 491[M+H]+

实施例7

3-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨甲酰基}氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯

Rt(方法A)3.31mins,m/z 463[M+H]+

实施例8

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]甲烷磺酰胺

Rt(方法A)2.44mins,m/z 360[M+H]+

实施例9

5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-6-甲基-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)2.99mins,m/z 330/332[M+H]+

实施例10

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-6-甲基-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

Rt(方法A)2.92mins,m/z 394[M+H]+

实施例11

N-[5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-6-甲基-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

Rt(方法A)3.13mins,m/z 428/430[M+H]+

实施例12

5-(1H-吲哚-2-羰基)-6-甲基-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.00mins,m/z 380[M+H]+

实施例13

5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-6-甲基-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.22mins,m/z 414/416[M+H]+

实施例14

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]乙酰胺

Rt(方法A)2.72mins,m/z 324[M+H]+

实施例15

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环己烷-4-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)2.98mins,m/z 380[M+H]+

实施例16

5-(1H-吲哚-2-羰基)-6-甲基-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)2.76mins,m/z 296[M+H]+

实施例17

5-(4-乙基-1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.16mins,m/z 394[M+H]+

实施例18

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环己烷-4-甲酰胺

Rt(方法A)2.84mins,m/z 392[M+H]+

实施例19

N-[5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

步骤1

向2-氨基-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-5(4H)-甲酸叔丁酯(500mg,2.098mmol)在二氯甲烷(14mL)中的冷却(0℃)的溶液添加DMAP(25.6mg,0.210mmol)和TEA(0.379mL,2.73mmol)。然后添加氧杂环戊烷-3-羰基氯(296mg,2.203mmol)在二氯甲烷(2mL)中的溶液。1h后,通过添加sat.aq.NaHCO

步骤2

向2-(四氢呋喃-3-甲酰胺基)-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-5(4H)-甲酸叔丁酯(180mg,0.535mmol)添加二氧杂环己烷中的4M HCl(3mL,12mmol)。将混合物在r.t.搅拌1h。将反应混合物在减压下浓缩,并用DCM气体汽提两次,然后不需进一步纯化用于下一步骤中。

步骤3

向4-氯-1H-吲哚-2-甲酸(17.44mg,0.089mmol)在无水N,N-二甲基甲酰胺(0.5mL)中的溶液添加HATU(44.1mg,0.116mmol)。在分开的小瓶中,将N-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基)四氢呋喃-3-甲酰胺盐酸盐(24.32mg,0.089mmol)悬浮在无水N,N-二甲基甲酰胺(0.5mL)中,向其添加TEA(0.062mL,0.446mmol)。5min后将反应混合物合并并搅拌过夜。然后添加几滴水,将混合物过滤,然后通过层析进行纯化,给出作为白色粉末的N-[5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺(25mg,67%得率)。

Rt(方法A)3.01mins,m/z 414/416[M+H]+

实施例20

N-[5-(4-氯-5-氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

向4-氯-5-氟-1H-吲哚-2-甲酸(19.05mg,0.089mmol)在无水N,N-二甲基甲酰胺(0.5mL)中的溶液添加HATU(44.1mg,0.116mmol)。在分开的小瓶中,将N-(4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基)四氢呋喃-3-甲酰胺盐酸盐(24.32mg,0.089mmol)悬浮在无水N,N-二甲基甲酰胺(0.5mL)中,向其添加TEA(0.062mL,0.446mmol)。5min后,将反应混合物合并并搅拌过夜。添加几滴水,将混合物过滤,然后通过层析进行纯化,给出作为白色粉末的N-[5-(4-氯-5-氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺(21mg,54%得率)。

Rt(方法A)3.05mins,m/z 432/434[M+H]+

实施例21

N-[5-(4-氯-6-氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

Rt(方法A)3.1mins,m/z 432/434[M+H]+

实施例22

N-[5-(4,6-二氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

Rt(方法A)2.9mins,m/z 416[M+H]+

1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.11(s,1H),10.51(s,1H),7.10-7.02(m,2H),6.92(td,J=10.4,2.1Hz,1H),6.43(s,1H),5.29-4.73(m,2H),4.36-4.09(m,4H),3.89(t,J=8.2Hz,1H),3.79-3.71(m,1H),3.71-3.61(m,2H),3.14(p,J=7.7Hz,1H),2.07-1.97(m,2H)。

实施例23

N-[5-(4-乙基-6-氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

Rt(方法A)3.15mins,m/z 426[M+H]+

实施例24

N-[5-(4-乙基-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

Rt(方法A)3.08mins,m/z 408[M+H]+

实施例25

5-(4-氯-5-氟-1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环戊烷3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.13mins,m/z 418/420[M+H]+

实施例26

5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.1mins,m/z 400/402[M+H]+

实施例27

5-(4-氯-6-氟-1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.19mins,m/z 418/420[M+H]+

实施例28

5-(4,6-二氟-1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.06mins,m/z 402[M+H]+

实施例29

5-(4-乙基-6-氟-1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

步骤1

向2-(四氢呋喃-3-甲酰胺基)-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-5(4H)-甲酸叔丁酯(345mg,1.026mmol)在无水THF(7mL)中的溶液添加硼烷-THF络合物(THF中的1M溶液,5.13mL,5.13mmol)。将混合物加热到60℃并搅拌48h。将混合物冷却至0℃并添加1M aq.HCl(3mL)。将混合物在室温搅拌15分钟,然后重新冷却至0℃。添加NaHCO

步骤2

向2-(((四氢呋喃-3-基)甲基)氨基)-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-5(4H)-甲酸叔丁酯(279mg,0.865mmol)添加HCl(4M,在二氧杂环己烷中,3mL,12mmol)。将混合物搅拌1H,然后在减压下浓缩,并且不需进一步纯化直接使用。

步骤3

向4-乙基-6-氟-1H-吲哚-2-甲酸(25.5mg,0.123mmol)在无水N,N-二甲基甲酰胺(0.5mL)中的溶液添加HATU(60.9mg,0.160mmol)。在分开的小瓶中,向N-((四氢呋喃-3-基)甲基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺二盐酸盐(36.4mg,0.123mmol)在无水N,N-二甲基甲酰胺(0.5mL)中的溶液添加TEA(0.086mL,0.617mmol)。5mins后,将所述两个反应混合物合并并搅拌48h。添加几滴水,将溶液过滤,然后通过层析进行纯化,给出作为白色固体的5-(4-乙基-6-氟-1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺(18mg,35%得率)。

Rt(方法A)3.23mins,m/z 412[M+H]+

实施例30

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环戊烷-3-甲酰胺

Rt(方法A)2.8mins,m/z 380[M+H]+

实施例31

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

步骤1:向2-(四氢呋喃-3-甲酰胺基)-6,7-二氢噻唑并[5,4-c]吡啶-5(4H)-甲酸叔丁酯(0.085g,0.253mmol)在DCM(2mL)中的溶液添加LiAlH4溶液(THF中的2.4M溶液)。将混合物搅拌30分钟,然后通过小心地添加水进行淬灭。将产物用DCM萃取,将合并的有机萃取物干燥,浓缩,并且不需进一步纯化用于下一步骤中。

步骤2:向步骤1的产物的DCM(1mL)溶液添加TFA。将混合物搅拌1h,然后在真空下浓缩。通过与另外的DCM共蒸发(两次)除去过量的TFA。产物不需进一步纯化用于下一步骤中。

步骤3:向吲哚-2-甲酸(0.0203g,0.126mmol)在无水DMF(1.0mL)中的溶液添加HATU(0.0575g,0.151mmol)。将反应混合物搅拌5分钟,然后添加步骤2的产物(N-((四氢呋喃-3-基)甲基)-4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺双(2,2,2-三氟乙酸盐),56.7mg,0.126mmol)和三乙胺(0.088mL,0.630mmol)在无水DMF(1.0mL)中的溶液。将混合物搅拌1h,然后添加几滴水,并将得到的溶液通过反相HPLC直接进行纯化,给出所需产物(0.0210g,52%得率)。

Rt(方法A)2.89mins,m/z 366[M+H]+

实施例32

5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

向4-氯-1H-吲哚-2-甲酸(0.0246g,0.126mmol)在无水DMF(0.65mL)中的溶液添加HATU(0.0575g,0.151mmol)。将反应混合物搅拌5分钟,然后添加4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺二盐酸盐(0.0266g,0.126mmol)和三乙胺(0.088mL,0.630mmol)在无水DMF(0.650mL)中的溶液。将混合物搅拌1h,然后添加几滴水,并将得到的溶液通过反相HPLC直接进行纯化,给出所需产物(0.0210g,52%得率)。

Rt(方法A)2.88mins,m/z 316/318[M+H]+

实施例33

5-(4,6-二氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

向4,6-二氟-1H-吲哚-2-甲酸(0.0248g,0.126mmol)在无水DMF(0.65mL)中的溶液添加HATU(0.0575g,0.151mmol)。将反应混合物搅拌5分钟,然后添加4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺二盐酸盐(0.0266g,0.126mmol)和三乙胺(0.088mL,0.630mmol)在无水DMF(0.650mL)中的溶液。将混合物搅拌1h,然后添加几滴水,并将得到的溶液通过反相HPLC直接进行纯化,给出所需产物(0.0217g,54%得率)。

Rt(方法A)2.84mins,m/z 318[M+H]+

实施例34

5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

向吲哚-2-甲酸(0.020g,0.126mmol)在无水DMF(0.65mL)中的溶液添加HATU(0.057g,0.151mmol)。将混合物搅拌5分钟,然后添加4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺二盐酸盐(0.026g,0.126mmol)和三乙胺(0.088mL,0.63mmol)在无水DMF(0.650mL)中的溶液。将所述混合物搅拌1h,添加水直至悬液变成溶液,并将混合物通过反相HPLC直接进行纯化,得到所需产物(0.025g,70%得率)。

Rt(方法A)2.64mins,m/z 282[M+H]+

实施例35

N-[5-(4,6-二氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]环丙烷磺酰胺

Rt(方法A)2.78mins,m/z 422[M+H]+

实施例36

N-[5-(4-氯-5-氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]环丙烷磺酰胺

Rt(方法A)2.87mins,m/z 438/440[M+H]+

实施例37

N-[5-(4-氯-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]环丙烷磺酰胺

Rt(方法A)2.82mins,m/z 420/422[M+H]+

实施例38

N-[5-(4-氯-6-氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]环丙烷磺酰胺

Rt(方法A)2.93mins,m/z 438/440[M+H]+

实施例39

N-[5-(4-乙基-6-氟-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]环丙烷磺酰胺

Rt(方法A)2.99mins,m/z 432[M+H]+

实施例40

N-[5-(4-乙基-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]环丙烷磺酰胺

Rt(方法A)2.91mins,m/z 414[M+H]+

实施例41

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]哌啶-4-甲酰胺盐酸盐

Rt(方法A)2.73mins,m/z 393[M+H]+

实施例42

1-乙酰基-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法A)2.69mins,m/z 435[M+H]+

实施例43

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-苯基甲烷磺酰胺

Rt(方法B)3.21mins,m/z 436[M+H]+

实施例44

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-甲基环丙烷-1-磺酰胺

步骤1

向2-氨基-6,7-二氢吡唑并[1,5-a]吡嗪-5(4H)-甲酸叔丁酯(1.009g,4.23mmol)在二氯甲烷(25mL)中的搅拌的溶液添加1,4-二氧杂环己烷中的4M盐酸(16mL,64.0mmol)。将得到的悬液在r.t.搅拌过夜。将混合物浓缩,给出作为作为白色固体的4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺二盐酸盐,其不需进一步纯化用于下一步骤中。

步骤2

将吲哚-2-甲酸(459mg,2.85mmol)和HATU(1.084g,2.85mmol)溶解在无水N,N-二甲基甲酰胺(20mL)中,并将混合物搅拌10分钟。然后添加4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺二盐酸盐(599mg)和TEA(1.3mL,9.35mmol)在无水N,N-二甲基甲酰胺(30mL)中的悬液,并将得到的反应混合物在N

步骤3

将5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺在吡啶中的溶液(0.8mL,0.21M溶液,0.168mmol)添加到1-甲基环丙烷-1-磺酰氯(55μL,0.252mmol)。将得到的溶液在r.t.搅拌2天。向所述混合物添加KHSO

Rt(方法A)2.86mins,m/z 400[M+H]+

实施例45

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]乙烷-1-磺酰胺

Rt(方法A)2.55mins,m/z 374[M+H]+

实施例46

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-3,5-二甲基-1,2-噁唑-4-磺酰胺

Rt(方法A)2.5mins,m/z 441[M+H]+

实施例47

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]丙烷-2-磺酰胺

Rt(方法A)2.78mins,m/z 388[M+H]+

实施例48

-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1,2-二甲基-1H-咪唑-4-磺酰胺

Rt(方法A)2.4mins,m/z 440[M+H]+

实施例49

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-甲基-1H-吡唑-4-磺酰胺

Rt(方法A)2.35mins,m/z 426[M+H]+

实施例50

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]吡啶-3-磺酰胺

Rt(方法A)2.35mins,m/z 423[M+H]+

实施例51

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]环己烷磺酰胺

Rt(方法B)3.23mins,m/z 428[M+H]+

实施例52

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-(甲氧基甲基)环丙烷-1-磺酰胺

Rt(方法A)2.84mins,m/z 430[M+H]+

实施例53

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氧杂环己烷-4-磺酰胺

Rt(方法B)2.89mins,m/z 430[M+H]+

实施例54

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-{[1-(甲氧基甲基)环丙基]甲基}-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.07mins,m/z 380[M+H]+

实施例55

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-[(氧杂环己烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)2.91mins,m/z 380[M+H]+

实施例56

N-苯甲基-5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法B)3.3mins,m/z 372[M+H]+

实施例57

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-(吡啶-4-基)哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.51mins,m/z 470[M+H]+

实施例58

4-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨甲酰基}哌啶-1-甲酸甲酯

Rt(方法B)3.09mins,m/z 451[M+H]+

实施例59

3-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}-2,2-二甲基丙-1-醇

Rt(方法A)2.97mins,m/z 368[M+H]+

实施例60

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-[(1-甲氧基环丁基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法B)3.21mins,m/z 380[M+H]+

实施例61

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-2-(三氟甲基)哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.54mins,m/z 461[M+H]+

实施例62

1-(2-羟基乙基)-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.39mins,m/z 437[M+H]+

实施例63

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.95mins,m/z 475[M+H]+

实施例64

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-甲磺酰基哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)3.09mins,m/z 471[M+H]+

实施例65

N4-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]哌啶-1,4-二甲酰胺

Rt(方法B)2.85mins,m/z 436[M+H]+

实施例66

1-乙酰基-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氮杂环丁烷-3-甲酰胺

Rt(方法B)3.18mins,m/z 407[M+H]+

实施例67

1-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-3-甲基脲

Rt(方法A)2.69mins,m/z 339[M+H]+

实施例68

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-5H,6H,7H,8H-咪唑并[1,2-a]吡啶-7-甲酰胺

Rt(方法B)2.4mins,m/z 430[M+H]+

实施例69

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-(氧杂环己烷-4-基)哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法A)2.81mins,m/z 477[M+H]+

实施例70

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-甲基氮杂环丁烷-3-甲酰胺

Rt(方法B)2.31mins,m/z 397[M+H]+

实施例71

1-({[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}甲基)环丁-1-醇

Rt(方法B)3.19mins,m/z 366[M+H]+

实施例72

3-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}-2-甲基丙-1-醇

Rt(方法A)2.78mins,m/z 354[M+H]+

实施例73

3,3-二氟-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.28mins,m/z 429[M+H]+

实施例74

1-环丙基-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.31mins,m/z 433.2[M+H]+

实施例75

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-[(3-甲基氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)2.92mins,m/z 380.1[M+H]+

实施例76

(1r,3r)-3-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}环丁-1-醇

Rt(方法A)2.62mins,m/z 352[M+H]+

实施例77

(1R,3S)-3-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}环己-1-醇

Rt(方法A)2.76mins,m/z 380[M+H]+

实施例78

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-{[1-(丙-2-基氧基)环丁基]甲基}-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.37mins,m/z 408[M+H]+

实施例79

[1-({[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}甲基)环丁基]甲醇

Rt(方法A)2.99mins,m/z 380[M+H]+

实施例80

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-(4-甲氧基环己基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法A)3.04mins,m/z 394[M+H]+

实施例81

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-甲基-2-(三氟甲基)哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.51mins,m/z 457[M+H]+

实施例82

N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-2-氮杂双环[2.2.1]庚烷-5-甲酰胺二盐酸盐

Rt(方法B)2.29mins,m/z 405[M+H]+

实施例83

3,3-二氟-1-({[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}甲基)环丁-1-醇

Rt(方法B)3mins,m/z 402[M+H]+

实施例84

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-(1-苯基环丙基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法B)3.4mins,m/z 398[M+H]+

实施例85

3-氟-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]哌啶-4-甲酰胺三盐酸盐

Rt(方法B)2,29&2,33mins,m/z 411[M+H]+

实施例86

(3R,4R)-3-氟-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]哌啶-4-甲酰胺二盐酸盐

Rt(方法B)2.28mins,m/z 411[M+H]+

实施例87

3,3-二氟-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-甲基哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.31mins,m/z 443[M+H]+

实施例88

3-氟-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-甲基哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2,21&2,26mins,m/z 425[M+H]+

实施例89

(3R,4R)-3-氟-N-[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]-1-甲基哌啶-4-甲酰胺

Rt(方法B)2.24mins,m/z 425[M+H]+

实施例90

(1-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}环丁基)甲醇

Rt(方法B)2.72mins,m/z 366[M+H]+

实施例91

(1s,3s)-3-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}环丁-1-醇

Rt(方法B)2.49mins,m/z 352[M+H]+

实施例92

(1-{[5-(1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}环丙基)甲醇

Rt(方法B)2.58mins,m/z 352[M+H]+

实施例93

1-({[5-(4-乙基-1H-吲哚-2-羰基)-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-基]氨基}甲基)环丁-1-醇

Rt(方法A)3.08mins,m/z 394[M+H]+

实施例94

5-(1H-吲哚-2-羰基)-N-[(3-甲氧基氧杂环戊烷-3-基)甲基]-4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡嗪-2-胺

Rt(方法B)2.79mins,m/z 396[M+H]+

将本发明的所选化合物在如下所述的衣壳组装和HBV复制测定法中进行测定,并且这些活性化合物的代表性组示出在表1中。

生物化学衣壳组装测定法

组装效应物活性的筛选在由Zlotnick等(2007)发表的荧光淬灭测定法的基础上进行。将含有融合到第150位处的独一无二的半胱氨酸残基的149个氨基酸的N-端组装结构域的C-端截短的核心蛋白,使用pET表达系统(Merck Chemicals,Darmstadt)在大肠杆菌中表达。核心二聚体蛋白的纯化使用一系列孔径排阻层析步骤来进行。简单来说,将来自于表达通过NdeI/XhoI克隆到表达质粒pET21b中的核心蛋白的编码序列的1L BL21(DE3)Rosetta2培养物的细胞团块,用本源裂解缓冲液(Qproteome细菌蛋白质制备试剂盒;Qiagen,Hilden)在冰上处理1h。在离心步骤后,将上清液在冰上搅拌2h期间用0.23g/ml的固体硫酸铵沉淀。在进一步离心后,将得到的沉淀溶解在缓冲液A(100mM Tris,pH 7.5;100mM NaCl;2mM DTT)中,随后装载到缓冲液A平衡的CaptoCore 700柱(GE HealthCare,Frankfurt)上。将含有组装的HBV衣壳的柱流过液针对缓冲液N(50mM NaHCO3 pH 9.6;5mMDTT)进行透析,然后添加尿素至终浓度为3M,在冰上1.5h,以将衣壳解离成核心二聚体。然后将所述蛋白质溶液装载到1LSephacryl S300柱上。在用缓冲液N洗脱后,含有核心二聚体的级分通过SDS-PAGE来鉴定,随后合并并针对50mM HEPES pH 7.5,5mM DTT进行透析。为了提高纯化的核心二聚体的组装能力,进行了第二轮组装和解体,其从添加5M NaCl开始,并包括上述孔径排阻层析步骤。从最后一个层析步骤,将含有核心二聚体的级分合并,并分成等分试样以1.5至2.0mg/ml之间的浓度储存在-80℃下。

在即将标记之前,通过以20mM的终浓度添加新鲜制备的DTT将所述核心蛋白还原。在冰上温育40min后,使用Sephadex G-25柱(GE HealthCare,Frankfurt)和50mM HEPES,pH7.5来除去储存缓冲液和DTT。为了进行标记,将1.6mg/ml核心蛋白在在4℃和暗处与终浓度为1mM的BODIPY-FL马来酰亚胺(Invitrogen,Karlsruhe)温育过夜。在标记后,通过使用Sephadex G-25柱的另一个脱盐步骤除去游离的染料。将标记的核心二聚体分成等分试样储存在4℃下。在二聚体状态下,标记的核心蛋白的荧光信号高,并且在核心二聚体组装成高分子衣壳结构期间被淬灭。所述筛选测定法在黑色384孔微量滴定板中,在10μl总测定体积中,使用50mM HEPES pH 7.5和1.0至2.0μM标记的核心蛋白来进行。每种筛选化合物从100μM、31.6μM或10μM的终浓度开始,使用0.5对数单位的连续稀释以8种不同浓度添加。在任何情况下,整个微量滴定板上的DMSO浓度为0.5%。组装反应通过注入NaCl至终浓度为300μM来开始,这将组装过程诱导到最大淬灭信号的大约25%。在反应开始后6min,使用Clariostar读板器(BMG Labtech,Ortenberg),使用477nm的激发和525nm的发射来测量荧光信号。作为100%和0%的组装对照,使用含有2.5M和0M NaCl的HEPES缓冲液。实验进行三次,每次三份平行样。EC

从HepAD38细胞的上清液确定HBV DNA

在稳定转染的细胞系HepAD38中分析了抗HBV活性,所述细胞系已被描述分泌高水平的HBV病毒粒子(Ladner等,1997)。简单来说,将HepAD38细胞在37℃、5%CO

细胞存活率测定法

使用AlamarBlue存活率测定法,在0.3μg/ml四环素(其阻断HBV基因组的表达)存在下评估HepAD38细胞中的细胞毒性。测定法条件和板布局与抗HBV测定法类似,但使用其他对照。在每块测定板上将含有未处理的HepAD38细胞的6个孔用作100%存活率对照,并将只装填有测定培养基的6个孔用作0%存活率对照。此外,在每个实验中使用从60μM的最终测定法浓度开始的环己酰亚胺的几何浓度系列作为阳性对照。在6天的温育期后,以1/11的稀释度向测定板的每个孔添加Alamar Blue Presto细胞存活率试剂(ThermoFisher,Dreieich)。在37℃温育30至45min后,使用Tecan Spectrafluor Plus读板器,分别使用550nm的激发滤光片和595nm的发射滤光片读取与活细胞的数目成正比的荧光信号。将数据归一化成未处理的对照(100%存活率)和测定培养基(0%存活率)的百分率,然后使用非线性回归和GraphPad Prism 6.0(GraphPad Software,La Jolla,USA)计算CC50值。使用平均EC

体内功效模型

HBV研究和抗病毒剂的临床前试验受限于所述病毒的狭窄物种和组织嗜性、缺少可用的感染模型以及由黑猩猩这种对HBV完全易感的唯一动物的使用带来的限制。可选的动物模型是基于使用与HBV相关的嗜肝DNA病毒,并且已在土拨鼠肝炎病毒(WHV)感染的土拨鼠或鸭乙型肝炎病毒(DHBV)感染的鸭或绒毛猴HBV(WM-HBV)感染的树鼩中测试了各种不同的抗病毒化合物(概述在Dandri等,2017,Best Pract Res Clin Gastroenterol 31,273-279中)。然而,代用病毒的使用具有几个限制。例如,亲缘关系最远的DHBV与HBV之间的序列同源性仅为约40%,这是HAP家族的核心蛋白组装修饰剂显得对DHBV和WHV无活性,但高效抑制HBV的原因(Campagna等,2013,J.Virol.87,6931-6942)。小鼠不被HBV感染,但主要工作聚焦于HBV复制和感染的小鼠模型的开发,例如人类HBV转基因的小鼠的产生(HBVtg小鼠)、小鼠中HBV基因组的流体动力学注射(HDI)或具有人源化肝脏和/或人源化免疫系统的小鼠的产生,以及将基于含有HBV基因组的腺病毒(Ad-HBV)或腺相关病毒(AAV-HBV)的病毒载体静脉内注射到具有免疫能力的小鼠中(综述在Dandri等,2017,Best Pract ResClin Gastroenterol 31,273-279中)。使用完整HBV基因组转基因小鼠,可以证实鼠类肝细胞产生感染性HBV毒粒的能力(Guidotti等,1995,J.Virol.,69:6158-6169)。由于转基因小鼠对病毒蛋白具有免疫耐受性,并且在产HBV的小鼠中未观察到肝损伤,因此这些研究证实HBV本身不引起细胞病变。HBV转基因小鼠已被用于测试几种抗HBV药剂例如聚合酶抑制剂和核心蛋白组装修饰剂的功效(Weber等,2002,Antiviral Research 54 69–78;Julander等,2003,Antivir.Res.,59:155-161),从而证明了HBV转基因小鼠非常适合于多种类型的体内临床前抗病毒测试。

正如在Paulsen等,2015,PLOSone,10:e0144383中所述,在2916/2917位置处带有移码突变(GC)的HBV转基因小鼠(Tg[HBV1.3fsX

在多项研究中已显示,不仅转基因小鼠是证明新的化学实体的体内抗病毒活性的适合模型,而且HBV基因组在小鼠中的流体动力学注射的使用以及用HBV阳性患者血清感染的免疫缺陷的人类肝脏嵌合小鼠的使用,也已频繁地用于剖测靶向HBV的药物(Li等,2016,Hepat.Mon.16:e34420;Qiu等,2016,J.Med.Chem.59:7651-7666;Lutgehetmann等,2011,Gastroenterology,140:2074-2083)。此外,通过接种低剂量的含有HBV基因组的腺病毒(Huang等,2012,Gastroenterology 142:1447-1450)或腺相关病毒(AAV)载体(Dion等,2013,J Virol.87:5554-5563),已在具有免疫能力的小鼠中成功地建立起慢性HBV感染。这个模型也可用于证实新的抗HBV药剂的体内抗病毒活性。

表1:生物化学和抗病毒活性

在表1中,“+++”表示EC

在表1中,“A”表示IC

序列表

<110> 艾库里斯有限及两合公司(AiCuris GmbH & Co. KG)

<120> 抗乙型肝炎病毒HBV的6,7-二氢-4H-吡唑并[1,5-a]吡嗪吲哚-2-甲酰胺活性剂

<130> SCT211769-60

<160> 7

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 21

<212> DNA

<213> 乙型肝炎病毒()

<400> 1

ctgtaccaaa ccttcggacg g 21

<210> 2

<211> 18

<212> DNA

<213> 乙型肝炎病毒()

<400> 2

aggagaaacg ggctgagg 18

<210> 3

<211> 26

<212> DNA

<213> 乙型肝炎病毒()

<400> 3

ccatcatcct gggctttcgg aaaatt 26

<210> 4

<211> 24

<212> DNA

<213> 乙型肝炎病毒()

<400> 4

tgcagaggtg aagcgaagtg caca 24

<210> 5

<211> 24

<212> DNA

<213> 乙型肝炎病毒()

<400> 5

gacgtccttt gtttacgtcc cgtc 24

<210> 6

<211> 25

<212> DNA

<213> 乙型肝炎病毒()

<400> 6

acggggcgca cctctcttta cgcgg 25

<210> 7

<211> 26

<212> DNA

<213> 乙型肝炎病毒()

<400> 7

ctccccgtct gtgccttctc atctgc 26

相关技术
  • 抗乙型肝炎病毒HBV的6,7-二氢-4H-吡唑并1,5-a吡嗪吲哚-2-甲酰胺活性剂
  • 抗乙型肝炎病毒HBV的脲6,7-二氢-4H-吡唑并1,5-a吡嗪活性剂
技术分类

06120112933758